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實(shí)驗(yàn)三質(zhì)粒提取與電泳【實(shí)驗(yàn)?zāi)康摹?/p>
通過本實(shí)驗(yàn)學(xué)習(xí)和掌握堿裂解法提取質(zhì)粒的方法?!緦?shí)驗(yàn)原理】
堿裂解法提取質(zhì)粒是根據(jù)共價(jià)閉合環(huán)狀質(zhì)粒DNA與線性染色體DNA在拓?fù)鋵W(xué)上的差異來分離它們。在pH值介于12.0-12.5這個(gè)狹窄的范圍內(nèi),線性的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)解開而被變性,盡管在這樣的條件下,共價(jià)閉環(huán)質(zhì)粒DNA的氫鍵會(huì)被斷裂,但兩條互補(bǔ)鏈彼此相互盤繞,仍會(huì)緊密地結(jié)合在一起。當(dāng)加入pH值4.8的乙酸鉀高鹽緩沖液恢復(fù)pH至中性時(shí),共價(jià)閉合環(huán)狀的質(zhì)粒DNA的兩條互補(bǔ)鏈仍保持在一起,因此,復(fù)性迅速而準(zhǔn)確,而線性的染色體DNA的兩條互補(bǔ)鏈彼此己完全分開,復(fù)性就不會(huì)那么迅速而準(zhǔn)確,它們纏繞形成網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),通過離心,染色體DNA分子與不穩(wěn)定的大分子RNA,蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物等一起沉淀下來而被除去。(二)材料1.葡萄糖2.三羥甲基氨基甲烷(Tris)3.乙二胺四乙酸(EDTA)4.氫氧化鈉5.十二烷基硫酸鈉(SDS)6.乙酸鉀7.冰乙酸8.氯仿9.乙醇10.胰RNA酶11.氨芐青霉素12.蔗糖13.溴酚藍(lán)14.酚15.含pUC19質(zhì)粒的大腸桿菌16.吸頭、小指管(三)試劑1.溶液I50mmol/L葡萄糖
25mmol/L三羥甲基氨基甲烷(Tris)Tris·HCl(pH8.0)10mmol/L乙二胺四乙酸(EDTA)(pH8.0)2.溶液II0.4mol/LNaOH,2%SDS,用前等體積混合3.溶液III5mol/L乙酸鉀60mL
冰乙酸11.5mL
水28.5mL4.TE緩沖液
10mmoL/LTris·HCl(pH8.0)1mmoL/LEDTA(pH8.0)5.70%乙醇(放-20℃冰箱中,用后即放回)6.胰RNA酶將RNA酶溶于10mmoL/LTris·HCl(pH7.5)、15mmoL/LNaCl中,配成10mg/mL的濃度,于100℃加熱15min,緩慢冷卻至室溫,保存于-20℃。7.凝膠加樣緩沖液(6X):40%蔗糖、0.25%溴酚蘭。5.加200μL溶液Ⅱ(新鮮配制),蓋緊管蓋,混勻內(nèi)溶物,將離心管放冰上5min。6.加入150μL溶液Ⅲ(冰上預(yù)冷),蓋緊管口,顛倒數(shù)次使混勻,冰上放置15min。7.12000r/min離心15min,將上清轉(zhuǎn)至另一離心管中。8.向上清中加入等體積酚:氯仿(1:1)或氯仿:異戊醇(24:1)(去蛋白),反復(fù)混勻,12000r/min離心5min,將上清轉(zhuǎn)移到另一離心管中。9.向上清中加入2倍體積無水乙醇,混勻后,室溫放置5~10min。12000r/min離心5min。倒去上清液,把離心管倒扣在吸水紙上,吸干液體。10.用1mL70%乙醇洗滌質(zhì)粒DNA沉淀,振蕩并離心,倒去上清液,真空抽干或空氣中干燥。11.加50μLTE緩沖液,(其中含有20μg/mL的胰RNA酶),使DNA完全溶解,-20℃保存。12.紫外分光光度計(jì)測(cè)定DNA樣品濃度(1μLDNA+49μL
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