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文檔簡介
生物大分子相互作用分析技術(shù)基礎醫(yī)學與醫(yī)學實驗技術(shù)演示文稿現(xiàn)在是1頁\一共有90頁\編輯于星期三
第一節(jié)生物大分子相互作用分析的意義第二節(jié)常見的生物大分子相互作用分析方法第三節(jié)生物大分子相互作用分析新進展(FRET、SPR)主要內(nèi)容現(xiàn)在是2頁\一共有90頁\編輯于星期三真核生物細胞
eukaryoticcell原核生物細胞prokaryoticcell細胞結(jié)構(gòu)cell引言現(xiàn)在是3頁\一共有90頁\編輯于星期三原核生物細胞結(jié)構(gòu)肽聚糖被膜質(zhì)膜引言現(xiàn)在是4頁\一共有90頁\編輯于星期三動物細胞植物細胞細胞壁、細胞膜、細胞質(zhì)和細胞核真核生物細胞結(jié)構(gòu)引言現(xiàn)在是5頁\一共有90頁\編輯于星期三細胞中的大分子
MacromoleculesinCellsTheapproximatecompositionofabacterialcell.引言現(xiàn)在是6頁\一共有90頁\編輯于星期三分子水平DNAsequenceProteinsStructureFunction?AllCell
第一節(jié)生物大分子相互作用分析的意義現(xiàn)在是7頁\一共有90頁\編輯于星期三DNAPrimarytranscriptmRNAmRNAInactivemRNAproteinnucleuscytoplasmTranscriptionalcontrolPost-transcriptionalcontrolmRNAdegradationcontroltranslationcontrolactiveproteinPost-translationcontrol基因表達的調(diào)控層次現(xiàn)在是8頁\一共有90頁\編輯于星期三ProteincomplexSignalingnetwork生命機制現(xiàn)在是9頁\一共有90頁\編輯于星期三蛋白質(zhì)組學的分類
表達蛋白質(zhì)組學Quantitativestudyofproteinexpressionbetweensamplesthatdifferbysomevariable
結(jié)構(gòu)基因組學Goalistomapoutthe3-Dstructureofproteinsandproteincomplexes
功能蛋白質(zhì)組學Tostudyprotein-proteininteraction,3-Dstructures,cellularlocalizationandPTMsinordertounderstandthephysiologicalfunctionofthewholesetofproteome.現(xiàn)在是10頁\一共有90頁\編輯于星期三蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和序列特點蛋白質(zhì)進化過程和保守序列蛋白質(zhì)表達譜蛋白在細胞內(nèi)的定位及其相關聯(lián)的細胞器或結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)翻譯后修飾情況了解與其相關聯(lián)的其他細胞蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)信息的不同層次現(xiàn)在是11頁\一共有90頁\編輯于星期三蛋白質(zhì)同源二聚體(homodimer)蛋白質(zhì)異源二聚體(heterodimer)蛋白質(zhì)多聚體(polymer)蛋白質(zhì)-DNA復合物(protein-DNAcomplex)蛋白質(zhì)-脂質(zhì)復合物(protein-lipidcomplex)蛋白質(zhì)-RNA復合物(protein-RNAcomplex)DNA-DNA復合物(DNA-DNAcomplex)……生物大分子復合物的類型現(xiàn)在是12頁\一共有90頁\編輯于星期三第二節(jié)生物大分子相互作用分析技術(shù)
1.研究思路2.分類3.技術(shù)介紹現(xiàn)在是13頁\一共有90頁\編輯于星期三生物大分子相互作用分析研究思路鑒定與目標分子相互作用的所有可能大分子詳細描述其生物功能及相互作用對其功能的影響鑒定出相互作用且在生理狀態(tài)下得到了驗證和合理的解釋現(xiàn)在是14頁\一共有90頁\編輯于星期三現(xiàn)在是15頁\一共有90頁\編輯于星期三GST融合蛋白技術(shù)(GSTpull-down)免疫共沉淀(Immunoprecipitation,Co-IP
)串聯(lián)親和純化(TandemAffinityPurification,TAP)酵母雙雜交系統(tǒng)(Yeasttwo-hybrid)噬菌體展示(Phagedisplay)細胞內(nèi)蛋白質(zhì)共定位(Co-localization)熒光共振能量轉(zhuǎn)移(fluorescenceresonanceenergytransfer,F(xiàn)RET)表面等離子共振(surfaceplasmonresonance,SPR)……生物大分子相互作用分析技術(shù)現(xiàn)在是16頁\一共有90頁\編輯于星期三1.GST融合蛋白技術(shù)(GSTpull-downassay)——基于重組蛋白表達純化技術(shù)的體外分析系統(tǒng)基本原理:是將靶蛋白-GST融合蛋白親和固化在谷胱甘肽親和樹脂上,作為與目的蛋白親和的支撐物,充當一種“誘餌蛋白”,目的蛋白溶液過柱,可從中捕獲與之相互作用的“捕獲蛋白”(目的蛋白),洗脫結(jié)合物后通過SDS電泳分析,從而證實兩種蛋白間的相互作用或篩選相應的目的蛋白,“誘餌蛋白”和“捕獲蛋白”均可通過細胞裂解物、純化的蛋白、表達系統(tǒng)以及體外轉(zhuǎn)錄翻譯系統(tǒng)等方法獲得。GST:谷胱甘肽巰基轉(zhuǎn)移酶(glutathioneS-transferase)現(xiàn)在是17頁\一共有90頁\編輯于星期三GSTpull-downassayPurificationofproteinGlutathionecolumnGlutathionebeadGSTfusionprotein現(xiàn)在是18頁\一共有90頁\編輯于星期三TagsPull-Down
方法的組成RtagbaitpreyResin——樹脂Bait——誘餌蛋白Prey——捕獲蛋白Tags——標簽(GST,His,Flag,HA,MBP)現(xiàn)在是19頁\一共有90頁\編輯于星期三RPull-downexperimentRWashRRAddpreyWashElutionAnalysisBaitPreyControlsRAddpreyWashRRElutionAnalysisSCSDSgel實驗設計思路現(xiàn)在是20頁\一共有90頁\編輯于星期三GSTXY谷胱甘肽-瓊脂糖微珠細胞裂解物tube4℃下孵育2h
GST融合蛋白GSTXY+實驗流程現(xiàn)在是21頁\一共有90頁\編輯于星期三GSTpull-down
應用鑒定未知相互作用的蛋白鑒定預測的或已知的相互作用現(xiàn)在是22頁\一共有90頁\編輯于星期三GSTpulldown驗證兩種已知蛋白質(zhì)(X-Y)的相互作用舉例inputGSTY-GFP+++X-GSTY-GFP105kDAnti-GFPX-GFP+++GSTinputAnti-GFPY-GSTX-GFP現(xiàn)在是23頁\一共有90頁\編輯于星期三2.免疫共沉淀(immunoprecipitation,Co-IP)——非常有效地用于鑒定細胞內(nèi)生理上的蛋白質(zhì)相互作用的分析技術(shù)
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation):是以抗體和抗原之間的專一性作用為基礎的用于研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法。是確定兩種蛋白質(zhì)在完整細胞內(nèi)生理性相互作用的有效方法。現(xiàn)在是24頁\一共有90頁\編輯于星期三
基本原理:當細胞在非變性條件下被裂解時,完整細胞內(nèi)存在的許多蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)間的相互作用被保留了下來。如果用蛋白質(zhì)X的抗體免疫沉淀X,那么與X在體內(nèi)結(jié)合的蛋白質(zhì)Y也能沉淀下來。
GagaroseGagaroseXYGagarose現(xiàn)在是25頁\一共有90頁\編輯于星期三實驗設計思路現(xiàn)在是26頁\一共有90頁\編輯于星期三實驗流程SDSProteinA/GSepharose++誘餌蛋白質(zhì)抗體離心誘餌蛋白質(zhì)ProteinA/GSepharose離心傳統(tǒng)方法交聯(lián)方法現(xiàn)在是27頁\一共有90頁\編輯于星期三基礎:細胞在非變性條件下裂解時,完整細胞內(nèi)許多蛋白質(zhì)之間的結(jié)合保持下來。要求:在一系列操作過程中保持蛋白質(zhì)復合體不變?nèi)秉c:可能檢測不到細胞內(nèi)處于動態(tài)平衡中的低親和與瞬間的相互作用,存在著免疫球蛋白的污染,需要培養(yǎng)大量的細胞局限:僅應用于從細胞中溶解出來仍存在于生理復合物中的蛋白質(zhì)現(xiàn)在是28頁\一共有90頁\編輯于星期三Co-IP
應用鑒定已知蛋白質(zhì)相互作用的檢測鑒定新蛋白質(zhì)間的相互作用現(xiàn)在是29頁\一共有90頁\編輯于星期三免疫共沉淀驗證兩種已知蛋白質(zhì)的相互作用Y-GFPY-GFP+X-HAIP:HAcontrolIgGAnti-GFPAnti-GFPAnti-HAY-GFPinput舉例現(xiàn)在是30頁\一共有90頁\編輯于星期三3.串聯(lián)親和純化(TandemAffinityPurification,TAP)a.One-stepaffinitypurificationb.Two-stepaffinitypurification(tandemaffinitypurification)Affinitypurification(immunopurification)——融合了標準生化純化和免疫共沉淀策略的極為有效的快速純化蛋白質(zhì)復合物的方法現(xiàn)在是31頁\一共有90頁\編輯于星期三串聯(lián)親和純化技術(shù)的優(yōu)勢與傳統(tǒng)的生化純化方法相比與免疫共沉淀方法相比使用恒定的標簽和標準純化條件避免了每次都要設計新純化方案的問題多步驟純化降低了細胞高豐度蛋白質(zhì)以及免疫球蛋白的背景污染現(xiàn)在是32頁\一共有90頁\編輯于星期三雙親和標簽:ProA(葡萄球菌蛋白A的兩個免疫球蛋白IgG結(jié)合單位)
CBP(鈣調(diào)蛋白結(jié)合肽)實驗設計思路現(xiàn)在是33頁\一共有90頁\編輯于星期三實驗流程鈣調(diào)素結(jié)合肽TEV酶切位點在Ca2+
離子下結(jié)合TEV酶切用EGTA洗脫靶蛋白結(jié)合于IgG珠子充分洗滌后,在TEV蛋白酶作用下洗脫結(jié)合物鈣離子存在下,將首次洗脫物中的蛋白質(zhì)結(jié)合于鈣調(diào)蛋白包被的珠子上充分洗滌后,加入EGTA洗脫結(jié)合物現(xiàn)在是34頁\一共有90頁\編輯于星期三4.酵母雙雜交(yeasttwo-hybridsystem)——基于在轉(zhuǎn)錄水平上的直接在酵母細胞內(nèi)檢測蛋白質(zhì)之間相互作用的遺傳學方法現(xiàn)在是35頁\一共有90頁\編輯于星期三基本原理:基于對真核生物調(diào)控轉(zhuǎn)錄起始過程的認識。
前者可識別DNA上的特異序列,并使轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域定位于所調(diào)節(jié)的基因的上游,轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域可同轉(zhuǎn)錄復合體的其他成分作用,啟動它所調(diào)節(jié)的基因的轉(zhuǎn)錄。二個結(jié)構(gòu)域不但可在其連接區(qū)適當部位打開,仍具有各自的功能。而且不同兩結(jié)構(gòu)域可重建發(fā)揮轉(zhuǎn)錄激活作用。酵母雙雜交系統(tǒng)利用雜交基因通過激活報道基因的表達探測蛋白-蛋白的相互作用。
典型的真核生長轉(zhuǎn)錄因子,如GAL4都含有二個不同的結(jié)構(gòu)域:DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(DNA-bindingdomain,BD)和轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域(transcription-activatingdomain,AD)。現(xiàn)在是36頁\一共有90頁\編輯于星期三酵母雙雜交(yeasttwo-hybridsystem)三個基本組成部分表達誘餌蛋白的載體,誘餌即我們感興趣的蛋白,它和DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域融合。2.表達靶蛋白的載體,靶蛋白可以是一個已知的蛋白,也可以是cDNA或基因組文庫編碼的蛋白。靶蛋白和轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域融合。3.一個或多個報告基因(如控制氨基酸合成的基因、大腸桿菌的lacZ基因等),位于DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域識別的調(diào)控區(qū)的下游。ADDBDgene+reporterMeasurableproduct+DBDbaitADpreyDBDAD現(xiàn)在是37頁\一共有90頁\編輯于星期三實驗設計思路Target:未知蛋白或?qū)⒀芯繉ο?DNAbindingdomainBait:已知蛋白+activationdomainTarget與Bait可互換轉(zhuǎn)入同一個酵母菌中ConstructtargetplasmidandbaitplasmidTransformationScreeningDNAextractionDNAsequencing現(xiàn)在是38頁\一共有90頁\編輯于星期三YeastTwo-HybridAssaynucleushis-leu-trp-MeasurableproductDBDbaittrpADfishleureporterDBDADhisHISlacZ現(xiàn)在是39頁\一共有90頁\編輯于星期三優(yōu)勢:酵母雙雜交方法的優(yōu)勢及缺陷
采用酵母菌株敏感度高蛋白折疊易于篩選應用范圍廣缺陷:
核內(nèi)作用假陽性假陰性轉(zhuǎn)化率現(xiàn)在是40頁\一共有90頁\編輯于星期三酵母雙雜交方法的應用高靈敏度地檢測蛋白-蛋白的相互作用確定蛋白相互作用的結(jié)構(gòu)域或重要活性位點尋找與靶蛋白相互作用的新蛋白尋找具有藥物治療作用的小分子肽尋找控制蛋白相互作用的化合物蛋白相互作用圖譜的繪制現(xiàn)在是41頁\一共有90頁\編輯于星期三舉例酵母雙雜交前準備工作雙酶切驗證21kb5kb3.5kb2kb1.5kbM1M:marker1:pGBKT7-BD-X構(gòu)建誘餌質(zhì)粒誘餌蛋白的表達X-BDGal4-BD檢測誘餌蛋白是否有毒性123Westernblot1.Yeast2.BD-yeast3.X-BD-yeast酵母生長曲線1.未轉(zhuǎn)化酵母2.BD-酵母3.X-BD-酵母現(xiàn)在是42頁\一共有90頁\編輯于星期三酵母雙雜交結(jié)果SD/-Trp/-Leu-Trp/-Leu/-His/-Ade+3-AT(20mM)舉例SD/-Trp/-LeuGal4-BD+Y-ADX-BD+Y-ADGal4-BD+Gal4-ADX-BD+Gal4-AD現(xiàn)在是43頁\一共有90頁\編輯于星期三
X-β-半乳糖苷酶藍白斑顯色分析舉例X-BD+Y-ADX-BD+gal4-ADGal4-BD+Y-ADgal4-BD+gal4-AD現(xiàn)在是44頁\一共有90頁\編輯于星期三酵母雙雜交測序結(jié)果酵母雙雜交得到的陽性克隆子質(zhì)粒經(jīng)過DNA測序,由NCBI數(shù)據(jù)庫的BLAST檢索cDNA編碼的蛋白質(zhì)舉例現(xiàn)在是45頁\一共有90頁\編輯于星期三5.噬菌體展示技術(shù)(Phagedisplay)——基于將某個蛋白與其遺傳信息之間直接聯(lián)系的篩選方法
噬菌體展示技術(shù)是將外源蛋白或多肽的DNA序列插入到噬菌體外殼蛋白結(jié)構(gòu)基因的適當位置,使外源基因隨外殼蛋白的表達而表達,同時,外源蛋白隨噬菌體的重新組裝而展示到噬菌體表面的生物技術(shù)。到目前為止,人們已開發(fā)出了單鏈絲狀噬菌體展示系統(tǒng)、λ噬菌體展示系統(tǒng)、T4噬菌體展示系統(tǒng)等數(shù)種噬菌體展示系統(tǒng)?,F(xiàn)在是46頁\一共有90頁\編輯于星期三特點
該技術(shù)的主要特點是將特定分子的基因型和表型統(tǒng)一在同一病毒顆粒內(nèi),即在噬菌體表面展示特定蛋白質(zhì),而在噬菌體核心DNA中則含有該蛋白的結(jié)構(gòu)基因。另外,這項技術(shù)把基因表達產(chǎn)物與親和篩選結(jié)合起來,可以利用適當?shù)陌械鞍讓⒛康牡鞍谆蚨嚯奶暨x出來。現(xiàn)在是47頁\一共有90頁\編輯于星期三UsedforcloningforeigngenesamongotherapplicationsProteinsandpeptidesarefusedtotheCapsid(surface)ofthephageThecombinationofthephageandpeptideisknownasaFusionProtein實驗設計思路現(xiàn)在是48頁\一共有90頁\編輯于星期三phagesFilamentousphagesM13FdF1OthersT4λ現(xiàn)在是49頁\一共有90頁\編輯于星期三FilamentousphagesInfectmanygram-negativebacteriaCircularsinglestrandedDNAgenomeAbout6.4kb.p.Long,flexibletubestructureabout1μmlongand6.5nmindiameterReproducedandsecretedfrominfectedbacteriawithoutcellkillingorlysis(lysogenicphage)現(xiàn)在是50頁\一共有90頁\編輯于星期三(a)Adenovirus.(b)Rotavirus.(c)Influenzavirus(courtesyofGeorgeLeser).(d)Vesicularstomatitisvirus.(e)Tobaccomosaicvirus.(f)Alfalfamosaicvirus.(g)T4bacteriophage.(h)M13bacteriophage.M13噬菌體顆粒結(jié)構(gòu)現(xiàn)在是51頁\一共有90頁\編輯于星期三M13噬菌體的生活史其裂解周期為:1)吸附(adsorption)2)侵入(entory)3)復制(生物合成biosynthesis)4)成熟(maturation)5)裝配(assembly)6)釋放(release)現(xiàn)在是52頁\一共有90頁\編輯于星期三絲狀噬菌體的基因及蛋白結(jié)構(gòu)
pIII(406aa,5~8copies)pVIII(50aa,~2700copies)pVI(112aa,5~8copies)現(xiàn)在是53頁\一共有90頁\編輯于星期三載體的插入位點
現(xiàn)在是54頁\一共有90頁\編輯于星期三pIII和pVIII噬菌體展示系統(tǒng)pIII系統(tǒng)pVIII系統(tǒng)拷貝數(shù)少多多肽片段大小大<10個氨基酸親和力高低適用范圍常用于展示由cDNA和基因組序列編碼的多肽,范圍較廣展示小肽,范圍較窄現(xiàn)在是55頁\一共有90頁\編輯于星期三T7噬菌體展示篩選系統(tǒng)測序分析插入序列將噬菌體文庫鋪在固定的靶蛋白上洗脫未結(jié)合的噬菌體加入大腸桿菌,擴增和富集洗脫的噬菌體鋪富集文庫鋪盤分離單個克隆3~4輪篩選驗證實驗:結(jié)合實驗實驗流程現(xiàn)在是56頁\一共有90頁\編輯于星期三
優(yōu)點:
A.高通量的淘選:將靶標分子(抗體)固定在固相載體上,加入噬菌體展示肽庫(噬菌體的數(shù)量可達1011PFU),利用抗原-抗體的特異性親和力將與抗體結(jié)合的噬菌體吸附在固相載體上,不能結(jié)合的噬菌體仍在溶液中,可以通過洗滌去除,再將特異結(jié)合的噬菌體洗脫下來,如此反復數(shù)輪擴增、淘選,即可將有用的基因從多達百萬以上的噬菌體克隆中分離出來。
B.可用于模擬表位的篩選:利用噬菌體展示技術(shù)得到模擬表位的報道較多模擬表位同樣可誘發(fā)與天然表位相似的特異性免疫反應,例如利用乙肝病毒的模擬表位免疫小鼠可誘導產(chǎn)生高滴度的乙肝病毒抗體。
C.易于純化重組噬菌體的純化步驟簡單、不要求昂貴的試劑與設備,在一般的實驗室條件下就可以完成。缺點:首先,目前所建的肽庫容量只能達到109,要想構(gòu)建大片段的肽庫很困難。其次,需要解決肽庫的多樣性問題。第三,少數(shù)多肽由于疏水性過強,或由于影響外膜蛋白的折疊而不能展示在噬菌體表面。噬菌體展示系統(tǒng)的應用及優(yōu)缺點現(xiàn)在是57頁\一共有90頁\編輯于星期三6、細胞內(nèi)蛋白質(zhì)共定位(cellularco-localization)——基于細胞內(nèi)綠色蛋白示蹤技術(shù)的蛋白質(zhì)間相互的研究方法現(xiàn)在是58頁\一共有90頁\編輯于星期三綠色熒光羅丹明染色重疊相差舉例細胞內(nèi)蛋白質(zhì)共定位研究兩種已知蛋白質(zhì)時空表達關系現(xiàn)在是59頁\一共有90頁\編輯于星期三舉例現(xiàn)在是60頁\一共有90頁\編輯于星期三第三節(jié)
生物大分子相互作用分析新技術(shù)
現(xiàn)在是61頁\一共有90頁\編輯于星期三1、熒光共振能量轉(zhuǎn)移技術(shù)(fluorescenceresonanceenergytransfer,F(xiàn)RET)——能夠?qū)τ诩毎械牡鞍踪|(zhì)間相互作用或?qū)ψ饔眠M行實時原位分析的檢測方法供體熒光素受體熒光素現(xiàn)在是62頁\一共有90頁\編輯于星期三FRET現(xiàn)象
Binding
NOBindingFRET:TheSize
當一個熒光分子(又稱為供體分子)的熒光光譜與另一個熒光分子(又稱為受體分子)的激發(fā)光譜相重疊時,供體熒光分子的激發(fā)能誘發(fā)受體分子發(fā)出熒光,同時供體熒光分子自身的熒光強度衰減。FRET程度與供、受體分子的空間距離緊密相關,一般為7~10nm時即可發(fā)生FRET;隨著距離延長,F(xiàn)RET呈顯著減弱.現(xiàn)在是63頁\一共有90頁\編輯于星期三實驗設計InteractionXCFPYYFPUVlaserFRETYellowlightemissionYYFPXCFPUVlaserCyanlightemissionDonorAcceptor現(xiàn)在是64頁\一共有90頁\編輯于星期三FRET的能量供體和受體滿足條件:
供體受體的激發(fā)光譜要分得足夠開;供體的發(fā)射光譜與受體的激發(fā)光譜要重疊;供受體的發(fā)射光譜要足夠分開。現(xiàn)在是65頁\一共有90頁\編輯于星期三CFPYFPWavelength(nm)Normalizedintensity(%)GFP綠色熒光蛋白CFP(青色熒光蛋白)(第66位Tyr→Trp)(第203位Thr→Tyr)YFP(黃色熒光蛋白)CFP(λ433nm/λ476nm)YFP(λ513nm/λ527nm)FRET的能量供體和受體現(xiàn)在是66頁\一共有90頁\編輯于星期三
均相檢測(無分離和洗滌步驟)實時連續(xù)地觀察活細胞的動態(tài)變化FRET技術(shù)的優(yōu)勢FluorescenceIntensityTime
LigandCy3Cy5現(xiàn)在是67頁\一共有90頁\編輯于星期三ABCIntermolecularDirectIndirectKinaseStep2Step1FRET應用的類型現(xiàn)在是68頁\一共有90頁\編輯于星期三現(xiàn)在是69頁\一共有90頁\編輯于星期三FRET應用范圍酵母雙雜交系統(tǒng)、噬菌體展示系統(tǒng)所篩選克隆的復證蛋白質(zhì)—核酸相互作用酶活性分析 蛋白酶、磷酸激酶鈣流檢測、離子通道研究蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)研究現(xiàn)在是70頁\一共有90頁\編輯于星期三FRET應用的局限性
信噪比經(jīng)常不佳,通常為1:1
背景主要來自受體被直接激發(fā)的信號
檢測儀器的靈敏度、分辨率以及計算機影像采集和分析軟件的能力現(xiàn)在是71頁\一共有90頁\編輯于星期三2、表面等離子共振技術(shù)(surfaceplasmonresonance,SPR)——適合于多種類型分子并且無需借助標記物可以實現(xiàn)對復合物直接實時測定的方法
SPRimager?II
現(xiàn)在是72頁\一共有90頁\編輯于星期三
基本原理:基于表面等離子共振(SPR)技術(shù)來實時跟蹤生物分子間的相互作用,而不用任何標記物。實驗時先將一種生物分子固定在傳感器芯片表面,將與之相互作用的分子溶于溶液流過芯片表面。檢測器能跟蹤檢測溶液中的分子與芯片表面的分子結(jié)合、解離整個過程的變化。
現(xiàn)在是73頁\一共有90頁\編輯于星期三SPR現(xiàn)象SPRangle450?goldlayerp-Polarized
Light
表面等離子共振(SPR)是一種物理現(xiàn)象,當入射光以臨界角入射到兩種不同折射率的介質(zhì)界面(比如玻璃表面的金或銀鍍層)時,可引起金屬自由電子的共振,由于電子吸收了光能量,從而使反射光在一定角度內(nèi)大大減弱。其中,使反射光在一定角度內(nèi)完全消失的入射角稱為SPR角。SPR隨表面折射率的變化而變化,而折射率的變化又和結(jié)合在金屬表面的生物分子質(zhì)量成正比。因此可以通過獲取生物反應過程中SPR角的動態(tài)變化,得到生物分子之間相互作用的特異性信號。
現(xiàn)在是74頁\一共有90頁\編輯于星期三SPR角度——掃描曲線SPRangle現(xiàn)在是75頁\一共有90頁\編輯于星期三傳統(tǒng)檢測原理SPRangleshiftasbasisofmeasurement現(xiàn)在是76頁\一共有90頁\編輯于星期三SPRimaging
檢測原理Fixedangle,fixedwavelengthD%RReflectivitychangeasbasisofmeasurement現(xiàn)在是77頁\一共有90頁\編輯于星期三SPRimager系統(tǒng)RotatingStage流動相(含待分析物)Gold-coatedglassSPRchip?p-pollight棱鏡分子探針陣列現(xiàn)在是78頁\一共有90頁\編輯于星期三GWC’s“SPRImaging”
技術(shù)現(xiàn)在是79頁\一共有90頁\編輯于星期三BioarrayTerminologySPRchip?glassgoldattachmentchemistryBiosensorAnalyteProbe現(xiàn)在是80頁\一共有90頁\編輯于星期三MonitoringChanges:DifferenceImages=SA+Bim-PEGn-PEGSASAProbeArrayProbeArray+BiotinT7DifferenceImage:signalduetobindingofBiotinT7toStreptavidinABAB-現(xiàn)在是81頁\一共有90頁\編輯于星期三MonitoringChanges:Image+Chart現(xiàn)在是82頁\一共有90頁\編輯于星期三ValueofReal-TimeMonitoringProteinArray,
EndofExperimentAgSAConAddBiotinylatedAntibodyD%RminEnd-pointmeasurementsmissalltheaction現(xiàn)在是83頁\一共有90頁\編輯于
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