文摘索引型數(shù)據(jù)庫

李春英北京大學(xué)醫(yī)學(xué)圖書館2017年1月文摘索引型數(shù)據(jù)庫檢索與利用內(nèi)容提要文摘庫概述PubMed文摘索引型數(shù)據(jù)庫概述報(bào)道和揭示文獻(xiàn)的外部特征（題名、著者、出處、卷期、頁碼、時(shí)間、文獻(xiàn)類型、語種），同時(shí)對(duì)文獻(xiàn)的內(nèi)容進(jìn)行摘要性描述的檢索工具。文摘報(bào)道和揭示的一般是單篇文章生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中外文摘索引數(shù)據(jù)庫美國(guó)全科醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(Medline)荷蘭醫(yī)學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫(Embase)美國(guó)生物學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫(BIOSISPreviews)美國(guó)化學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫(SciFinder)美國(guó)科學(xué)引文索引數(shù)據(jù)庫（SCI）中國(guó)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫（CBM）中文生物醫(yī)學(xué)期刊文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫（CMCC）文摘索引數(shù)據(jù)庫特點(diǎn)提供原文的摘要信息摘要信息包括：題目、作者、刊名，或同論文相關(guān)信息數(shù)據(jù)量大，文獻(xiàn)類型多、信息量大收錄文獻(xiàn)回溯年代長(zhǎng)收錄文獻(xiàn)期刊種類多出版形式多樣文摘索引數(shù)據(jù)庫使用情況文摘數(shù)據(jù)庫的作用

1.可了解和把握某課題領(lǐng)域研究動(dòng)態(tài)和研究現(xiàn)狀2.找到全文的重要和必要線索3.判斷自己課題的新穎性對(duì)不熟悉的語種文章，看英文摘要即可科研評(píng)價(jià)（學(xué)位）論文選題、開題、課題查新時(shí)文獻(xiàn)調(diào)研的重要途徑文摘索引數(shù)據(jù)庫掌握要領(lǐng)1.數(shù)據(jù)庫的概況2.數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)3.數(shù)據(jù)庫的檢索界面4.數(shù)據(jù)庫的檢索技巧與方法PubMed數(shù)據(jù)庫主要內(nèi)容1.數(shù)據(jù)庫概況2.數(shù)據(jù)庫檢索機(jī)制3.數(shù)據(jù)庫的組成結(jié)構(gòu)4.檢索界面5.檢索方法與技巧PubMed概況1.創(chuàng)建機(jī)構(gòu)：美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館下設(shè)的美國(guó)生物技術(shù)信息中心(NCBI)2.類型：Web數(shù)據(jù)庫3.網(wǎng)址：/pubmed4.特色：具有收錄范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備等特點(diǎn)，部分文獻(xiàn)還可在網(wǎng)上直接免費(fèi)獲得全文。5.學(xué)科范圍：生物醫(yī)學(xué)、生命科學(xué)、行為科學(xué)、生物工程、化學(xué)等學(xué)科。6.與Medline光盤數(shù)據(jù)庫的區(qū)別：檢索機(jī)制、檢索界面、檢索方法以及收錄文獻(xiàn)數(shù)量不同。PubMed數(shù)據(jù)來源1.MEDLINE：包括OLDMEDLINE

2.InProcessCitations：每天收錄，尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)。3.Publisher-SuppliedCitations：由出版商提供的電子文獻(xiàn)，每條記錄標(biāo)有[PubMed-assuppliedbyPublisher]。PubMed檢索機(jī)制1．自動(dòng)截詞轉(zhuǎn)換匹配功能(AutomaticTermMapping)對(duì)于輸入的檢索詞，PubMed先按一定的詞表順序進(jìn)行對(duì)照匹配和轉(zhuǎn)換，再進(jìn)行檢索。詞表匹配轉(zhuǎn)換順序是：MeSH表(MeSHtranslationtable)、期刊刊名表(Journaltranslationtable)、全體作者表(Fullauthortranslationtable)、作者索引(AuthorIndex)、全體調(diào)查者表(Fullinvestigatortranslationtable)、調(diào)查者索引(InvestigatorIndex)。如果在以上6個(gè)表中都找不到相匹配的詞，PubMed將把短語分開，以單詞為單位，分別重復(fù)以上的過程，檢索時(shí)各個(gè)詞之間是AND邏輯關(guān)系。2．短語檢索(PhraseSearching)也可稱為強(qiáng)迫詞組檢索，即，如果要將短語作為一個(gè)詞組進(jìn)行檢索，可用雙引號(hào)“”將其引起來。如：“drugtherapy”作為詞組進(jìn)行檢索的詞，系統(tǒng)不進(jìn)行自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配，也不進(jìn)行MeSH詞的擴(kuò)檢。1.邏輯運(yùn)算符：邏輯與：AND，邏輯或：OR，邏輯非：NOT。當(dāng)一個(gè)檢索表達(dá)式中同時(shí)含有三個(gè)運(yùn)算符時(shí)，運(yùn)算順序從左至右，括號(hào)可以改變運(yùn)算順序。2.截詞符：*，一個(gè)詞或字拼寫出部分字母后面加上一個(gè)截詞符，chem*表示用詞根進(jìn)行檢索。Heartattack*會(huì)關(guān)閉自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配檢索詞，myocardial

infarction,

myocardialstunning,

shock等詞3.雙引號(hào)：“”，表示對(duì)引號(hào)中的短語進(jìn)行檢索。4.檢索字段標(biāo)識(shí)符：[tag]，tag為字段名稱。[ti]，[au]，[ta]，[so]，[la]，[pt]。PubMed檢索運(yùn)算符常用字段組成標(biāo)識(shí)符字段名稱TITitleAUAuthorADAffiliationABAbstractDPPublicationDateEDATEntrezDateSOSourceTAJournalTitleAbbreviationMHMeSHTermsPTPublicationType

檢索界面基本檢索高級(jí)檢索MeSH

Database檢索限定檢索期刊查詢(JournalsDatabases)引文匹配器(CitationMatcher)臨床查詢(ClinicalQueries)打開搜狗瀏覽器用戶名：jf20120001 密碼：123456PubMed檢索方法1.基本檢索：在基本檢索界面下完成的檢索方法2.高級(jí)檢索：高級(jí)檢索界面下進(jìn)行的檢索方法3.MeSHDatabase檢索：MeSH主題詞界面下進(jìn)行的檢索方法基本檢索基本檢索1.關(guān)鍵詞、詞(詞組)或短語：2.作者：SmithJS或Smith[au]3.期刊刊名：GENETHERAPY[TA]，JAMA[TA]4.截詞：CHEMO*5.復(fù)雜表達(dá)式：CANCERANDTHERAPY6.#1AND#2

艾滋病的藥物治療AidsdrugtherapySearchdetails檢索過程("acquiredimmunodeficiencysyndrome"[MeSHTerms]OR("acquired"[AllFields]AND"immunodeficiency"[AllFields]AND"syndrome"[AllFields])OR"acquiredimmunodeficiencysyndrome"[AllFields]OR"aids"[AllFields])

("drugtherapy"[Subheading]OR("drug"[AllFields]AND"therapy"[AllFields])OR"drugtherapy"[AllFields]OR"drugtherapy"[MeSHTerms]OR("drug"[AllFields]AND"therapy"[AllFields]))修改后的檢索結(jié)果高級(jí)檢索高級(jí)檢索MeSHDatabase檢索輸入查找的主題詞Aidsdrugtherapy主題詞注釋樹狀結(jié)構(gòu)表款目詞檢索步驟查看檢索歷史限定檢索1.限制檢索或條件檢索：Limits(1)日期：①Dateofpublication[DP]原始文獻(xiàn)出版日期；②EntrezDate[EDAT]文獻(xiàn)首次錄入PubMed日期；③MeSHDate[MHDA]文獻(xiàn)被MeSH詞條標(biāo)引日期。(2)地址：?jiǎn)蝹€(gè)詞加標(biāo)識(shí)符[ad](3)帶有摘要文獻(xiàn)的檢索：CANCERANDhasabstract(4)數(shù)據(jù)庫子集的限定：特殊主題的檢索AMERICANANDhistory[sb]2.限定檢索結(jié)束后，及時(shí)取消限定條件

限定檢索限定檢索點(diǎn)擊取消PubMed幾種檢索方法的選擇基本檢索高級(jí)檢索MeSH

Database檢索舉例：兒童哮喘的藥物治療方面文獻(xiàn)基本檢索1.檢索表達(dá)式：

childrenasthmadrugtherapy2.直接輸入檢索框中，進(jìn)行檢索檢索過程（Search

details）

("child"[MeSHTerms]OR"child"[AllFields]OR"children"[AllFields])

AND

("asthma"[MeSHTerms]OR"asthma"[AllFields])AND

("drugtherapy"[Subheading]OR("drug"[AllFields]AND"therapy"[AllFields])OR"drugtherapy"[AllFields]OR"drugtherapy"[MeSHTerms]OR("drug"[AllFields]AND"therapy"[AllFields]))修改檢索式：

child[MeSH

Terms]ANDasthma[MeSH

Terms]AND"drugtherapy"[Subheading]舉例：兒童哮喘的藥物治療方面文獻(xiàn)MeSH

Database檢索1.確定主題詞：childasthma

drugtherapy(副主題詞)2.查找主題詞舉例：兒童哮喘的藥物治療方面文獻(xiàn)高級(jí)檢索1.確定檢索詞：childasthmadrugtherapy2.選擇檢索字段3.輸入檢索詞JournalsDatabases主題、刊名全稱或縮寫、ISSN單篇文獻(xiàn)匹配器臨床咨詢特殊專題咨詢檢索結(jié)果顯示保存打印顯示格式Summary(簡(jiǎn)要格式)Abstract（文摘格式）MEDLINE保存格式1.File(文件)2.Format（格式）檢索策略的存儲(chǔ)和調(diào)用使用MyNCBI(Cubby)首先要登記注冊(cè)保存檢索策略定期瀏覽新的檢索結(jié)果注冊(cè)或登錄個(gè)人帳號(hào)注冊(cè)后的功能保存、修改、刪除檢索式其它功能全文鏈接相關(guān)文獻(xiàn)鏈接相關(guān)數(shù)據(jù)庫的鏈接RSS閱讀器的使用全文鏈接全文鏈接檢索練習(xí)1.檢索有關(guān)“禽流感(birdflu)預(yù)防控制方面”的文獻(xiàn)2.檢索微量元素缺乏(traceelements)與皮膚病(skindiseases)關(guān)系的文獻(xiàn)（限英文綜述）3.利巴韋林（ribavirin）治療SARS方面的綜述文獻(xiàn)4.眼結(jié)核(oculartuberculosis)引起失明(blindness)的文獻(xiàn)5.北京大學(xué)韓濟(jì)生教授發(fā)表的英文文獻(xiàn)6.CANCERLETTERS期刊上查找有關(guān)基因治療方面的文獻(xiàn)1.檢索過程和步驟2023/2/575（1）分析課題，提煉出兩個(gè)主題概念，并明確概念之間的相互關(guān)系如下：預(yù)防控制禽流感事物與特征的關(guān)系2023/2/576（2）選擇檢索方式為敘詞檢索，在PUBMED數(shù)據(jù)庫中即為選擇MeSH入口進(jìn)行檢索。（3）編制檢索策略。

InfluenzainBirds/preventionandcontrol

（禽流感/預(yù)防控制）

其中主題詞為：InfluenzainBirds（禽流感）副主題詞為：preventionandcontrol（預(yù)防控制）2.檢索過程和步驟2023/2/577（1）分析課題，提煉出兩個(gè)主題概念，并明確概念之間的相互關(guān)系如下；皮膚病微量元素缺乏因果關(guān)系此外，課題還要求只要英文綜述文獻(xiàn)。綜述英文+2023/2/578（2）選擇檢索方式為敘詞檢索，在PUBMED數(shù)據(jù)庫中即為選擇MeSH入口進(jìn)行檢索。此外，PUBMED數(shù)據(jù)庫提供有檢索結(jié)果濾鏡（ResultFilters），可對(duì)檢索結(jié)果按照不同分面進(jìn)行顯示，其中有按照文獻(xiàn)語種、文獻(xiàn)類型等分面的顯示。2023/2/5782023/2/579（3）編制檢索策略。

TraceElements/deficiency（