外文數(shù)據(jù)庫pubmed研

外文數(shù)據(jù)庫認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研日期時間地點(diǎn)批次內(nèi)容1．3（星期五）第3-5節(jié)圖書館（三四樓電子閱覽室）12013010001～2013020079外文數(shù)據(jù)庫實(shí)習(xí)1．3（星期五）第6-8節(jié)圖書館（三四樓電子閱覽室）22013020080～2013040154外文數(shù)據(jù)庫實(shí)習(xí)1.5（星期日）8:30-11:00圖書館（三四樓電子閱覽室）3

2013040155～2013060241外文數(shù)據(jù)庫實(shí)習(xí)1.5（星期日）15:00-17:30圖書館（三四樓電子閱覽室）42013060242～2013060325外文數(shù)據(jù)庫實(shí)習(xí)郵箱：gdmcwxjs@126.com密碼：wxjs123456聯(lián)系QQ：1580123718電話：2388565一、

認(rèn)識PubMed二、PubMed

檢索入門三、PubMed高級檢索四、PubMed醫(yī)學(xué)主題詞表檢索五、PubMed其他功能六、PubMed個性化服務(wù)認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研標(biāo)引質(zhì)量高更新速度快信息量大使用方便選擇PubMed的n個理由一、認(rèn)識PubMed網(wǎng)址：/pubmed

或/pubmed

或(com;org;net)由美國國立醫(yī)學(xué)圖書館（NationalLibraryofMedicine-

NLM）國家生物技術(shù)信息中心（NationalCenterforBiotechnologyInformation-NCBI）向因特網(wǎng)用戶提供免費(fèi)MEDLINE檢索服務(wù)一、認(rèn)識PubMed一、認(rèn)識PubMed收錄從1946年至今80多個國家和地區(qū)37種文字的5400多種生物醫(yī)學(xué)期刊上的文獻(xiàn)2000多萬條。每日更新（周二到周六），每天增加2000－4000

條完整記錄。PUBMED中90%的原文為英文文獻(xiàn)，79%有英文摘要。PubMedABDCMedlineOldMedlineIn

Process

CitationsRecordsuppliedbypublisher一、認(rèn)識PubMedPUBMED收錄的文獻(xiàn)包括4個數(shù)據(jù)庫：

概況

A:Medline

是NLM最主要的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫，覆蓋了醫(yī)學(xué)、獸醫(yī)、衛(wèi)生等各個學(xué)科。收錄1966年以來生物醫(yī)學(xué)期刊上的文獻(xiàn)。該數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)的標(biāo)識為：[PubMed-indexedforMEDLINE]。

認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研

B:OldMedline

收錄1946年至1965年期間發(fā)表的200萬篇生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)，標(biāo)識為[PubMed-OldMedline]。

認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研目前通過PubMed可查到的最早文獻(xiàn)為1809年出版的Medico-chirurgicaltransactions上的文獻(xiàn)，且為免費(fèi)全文。/pmc/articles/PMC2128800/?page=1

C：InProcessCitationsPubMED中每天增加的數(shù)據(jù)先放在此庫，新記錄只提供基本的題錄信息和文摘，沒有標(biāo)引主題詞，其標(biāo)識為：[PubMed-inprocess]。

InProcessCitations中的數(shù)據(jù)經(jīng)標(biāo)引部門標(biāo)引后再加入到Medline數(shù)據(jù)庫之中。標(biāo)識改為：[PubMed-indexedforMEDLINE]。D:Publisher-SuppliedCitations此外，出版商在印刷版期刊出版之前向PUBMED傳送的電子版內(nèi)容將顯示[Epubaheadofprint]標(biāo)識。由出版商以電子版形式直接傳送到PubMed，標(biāo)識為：[PubMed-assuppliedbypublisher]，大部分出版商提供的文獻(xiàn)處于正在加工狀態(tài)，經(jīng)標(biāo)引后加入到MEDLINE中。此外，還有少部分出版商提供的文獻(xiàn)不進(jìn)行標(biāo)引，保持[PubMed-assuppliedbypublisher]標(biāo)識或[PubMed]標(biāo)識。認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研PMID（PubMed唯一標(biāo)識碼，PubMedUniqueIdentifier）PUBMED收錄的文獻(xiàn)均有PMID，作為PUBMED與其他數(shù)據(jù)庫聯(lián)系的標(biāo)識及查找全文的標(biāo)記。檢索提問區(qū)文獻(xiàn)匹配臨床咨詢特定主題咨詢期刊檢索主題檢索高級檢索一、認(rèn)識PubMed二、PubMed檢索入門1.檢索字段及標(biāo)識符2.邏輯運(yùn)算3.自動匹配功能4.截詞檢索和禁用詞5.限定字段檢索6.短語檢索7.檢索結(jié)果二、PubMed檢索入門1.檢索字段及標(biāo)識符21電子出版日期文獻(xiàn)出版日期數(shù)據(jù)加入PubMed日期文獻(xiàn)勘誤參考文獻(xiàn)勘誤全部著者姓名全部調(diào)研者姓名作為文章主題的著者全稱文獻(xiàn)相關(guān)注釋基金編號基因符號期編號資助調(diào)研者資助調(diào)研單位國際標(biāo)準(zhǔn)期刊號美國立醫(yī)學(xué)圖書館識別號期刊全稱22最后修訂日期主題詞表詞規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘版權(quán)擁有者題錄提供機(jī)構(gòu)的識別號病史相關(guān)與原始記錄其他關(guān)鍵詞提供其他關(guān)鍵詞的機(jī)構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機(jī)構(gòu)文章總頁數(shù)出版商提供數(shù)據(jù)時間期刊出版國數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)編號23作為主題詞的個人姓名出版狀態(tài)文獻(xiàn)類型出版模式（紙張或電子）參考文獻(xiàn)數(shù)已撤回的文獻(xiàn)酶或化學(xué)物質(zhì)代碼正在撤消中的文章初版文獻(xiàn)修訂和再版的文章子專題文檔太空署提供的數(shù)據(jù)二次文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫以及文章討論的分子序列訪問號原文來源引用了病例的文獻(xiàn)內(nèi)部處理代碼標(biāo)準(zhǔn)期刊縮寫文獻(xiàn)標(biāo)題翻譯標(biāo)題更新文獻(xiàn)文獻(xiàn)正在更新期刊卷號2.邏輯運(yùn)算多個檢索詞間需用邏輯運(yùn)算符號組配。

邏輯運(yùn)算符AND、OR、NOT必須大寫系統(tǒng)將“空格”默認(rèn)為ANDVitaminc

coldVitamincANDcold在多個檢索詞間可使用布爾邏輯運(yùn)算符“AND”、“OR”、“NOT”，需注意的是，邏輯運(yùn)算符的優(yōu)先順序為從左向右，可通過加括號提高運(yùn)算的優(yōu)先級。維生素C或維生素E與癌癥的關(guān)系1.VitaminCORvitaminEANDcancer2.(VitaminCORvitaminE)ANDcancer3.CancerAND(VitaminCORvitaminE)4.CancerANDVitaminCORvitaminE3.自動匹配功能(AutomaticTermMapping,ATM)對于輸入檢索框中未加標(biāo)識的檢索詞，PubMed依次在下列詞表中查找匹配的內(nèi)容：MeSHtranslationtableMeSH轉(zhuǎn)換表Journalstranslationtable刊名轉(zhuǎn)換表

Phraselist短語詞表

Authorindex作者及合作者索引當(dāng)用戶在基本檢索界面輸入檢索詞時，PubMed在后臺將檢索詞依次到上面轉(zhuǎn)換表中進(jìn)行詞語的核對，如果在第一個表中查不到相應(yīng)的詞，則到第二個表中檢索，至到找到為止。

如果在上述幾個表中都找不到匹配的短語，系統(tǒng)將短語拆開，繼續(xù)到這四個表中搜索，短語斷開部分為AND關(guān)系。

如果拆到的單詞在上述幾個表中還是找不到匹配詞，將到所有字段中去搜索這些單詞，單詞之間的邏輯關(guān)系也是AND

Searchdetails:"ascorbicacid"[MeSHTerms]OR("ascorbic"[AllFields]AND"acid"[AllFields])OR"ascorbicacid"[AllFields]OR"vitaminc"[AllFields]如不滿意，可修改再search二、PubMed檢索入門4.截詞檢索和禁用詞截詞符：*一般只作“后截斷”使用，表示0-N個字符。

如：輸入treat*

檢出treatment、treats、treated、treating等截詞符：？一般只作“后截斷”使用，表示0-1個字符。

備注：-

不執(zhí)行自動匹配功能；

-截詞檢索只限于單詞，對詞組無效.PubMed在檢索時忽略一些常用的英語詞匯，下表為禁用詞列表二、PubMed檢索入門5.限定字段檢索檢索詞[字段名]

例：著者檢索(authors)：-姓全稱在前，名首字母在后

JohnSmithSmithJ-以AU作為限定字段 如：CooperSL[au]，”CopperSL”[au]

YaoKT[au]（姓在前，名縮寫在后）二、PubMed檢索入門期刊檢索（journals）：-刊名全稱檢索 例：NewEnglandJournalofMedicine[so]-MEDLINE認(rèn)可的標(biāo)準(zhǔn)刊名縮寫檢索 例：NEnglJMed[so]-國際標(biāo)準(zhǔn)期刊號檢索 例：0028-4793[so]二、PubMed檢索入門例：檢索JosephLeventhal研究干細(xì)胞移植的文獻(xiàn)直接輸入檢索式：Stemcelltransplantation

ANDLeventhalJ[AU]二、PubMed檢索入門6.短語檢索對于輸入PubMed的多詞詞組，由于英文單詞間存在“空格”，PubMed會默認(rèn)運(yùn)算“AND”，則將其拆分成單個詞，分別進(jìn)行檢索并以AND進(jìn)行組配，如：singlecell相當(dāng)于檢索singleANDcell。若不想進(jìn)行邏輯組配，可通過加“”強(qiáng)制將其作為一個詞組進(jìn)行檢索：如：“singlecell”

使用“”后，系統(tǒng)不進(jìn)行自動轉(zhuǎn)換匹配和擴(kuò)展檢索。二、PubMed檢索入門二、PubMed檢索入門7.檢索結(jié)果文獻(xiàn)類型分類顯示設(shè)置FreeArticle:提供免費(fèi)全文的鏈接。FreePMCArticle:PUBMED提供的完全免費(fèi)的全文鏈接。二、PubMed檢索入門PMC(PubMedCentral，公共醫(yī)學(xué)中心)生命科學(xué)期刊資源中心免費(fèi)提供約1199種期刊的200多萬篇全文/pmc/二、PubMed檢索入門認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研二、PubMed檢索入門三、PubMed高級檢索三、PubMed高級檢索限定字段檢索Searchingbyaspecificfield三、PubMed高級檢索Searchingbyaspecificfield三、PubMed高級檢索可選擇邏輯運(yùn)算符增加一行或減少一行系統(tǒng)會根據(jù)輸入，生成檢索式，通過edit修改。檢索歷史History-Combiningsearchesusinghistory檢索史按檢索式運(yùn)行的順序列出各檢索式，包括檢索式序號、檢索策略、檢索時間、檢索到的文獻(xiàn)條數(shù)。檢索史最多保存100條檢索式，檢索史將在離開PubMed或其他Entrez數(shù)據(jù)庫8小時后消失。

三、PubMed高級檢索三、PubMed高級檢索History-Combiningsearchesusinghistory

點(diǎn)擊檢索式序號將彈出一選項菜單，提供的選項包括布爾邏輯操作符AND,OR,NOT,點(diǎn)擊相應(yīng)的操作符菜單，將把該條檢索策略加入到檢索框中，并與檢索框中現(xiàn)有的檢索式進(jìn)行選中的邏輯組配。

三、PubMed高級檢索History-Combiningsearchesusinghistory認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研文獻(xiàn)太多，如何保證查全和查準(zhǔn)？四、PubMed醫(yī)學(xué)主題詞表檢索何為MeSH？MeSH是MedicalSubjectHeadings的縮略詞，即醫(yī)學(xué)主題詞，是用規(guī)范化的醫(yī)學(xué)術(shù)語來描述生物醫(yī)學(xué)概念。論述文獻(xiàn)中心的主題詞稱主要主題詞論述主題某一方面的內(nèi)容的詞稱為副主題詞

4.1MeSHDatabase的運(yùn)用四、PubMed醫(yī)學(xué)主題詞表檢索詞義解釋四、PubMed醫(yī)學(xué)主題詞表檢索副主題詞四、PubMed醫(yī)學(xué)主題詞表檢索組建檢索式：1.先addtosearchbuilder2.Searchpubmed認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研五、PubMed其他功能實(shí)現(xiàn)單篇文章的一對一檢索實(shí)現(xiàn)多篇文章的一次性檢索一次最多可檢索PubMed中100條文獻(xiàn)紀(jì)錄,獲得文獻(xiàn)的PMID認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研

選擇相應(yīng)類別選擇檢索范圍檢索結(jié)果更加貼近臨床的需要五、PubMed其他功能認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研限定于各類不同的醫(yī)學(xué)臨床主題進(jìn)行檢索五、PubMed其他功能認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研實(shí)現(xiàn)PubMed與核酸和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫、基因組數(shù)據(jù)庫、分類學(xué)數(shù)據(jù)、圖書等數(shù)據(jù)庫之間的多向鏈接,多向查詢五、PubMed其他功能認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研與PubMed建立聯(lián)系的網(wǎng)站，如某篇文獻(xiàn)所對應(yīng)期刊的出版商，文獻(xiàn)全文、相關(guān)數(shù)據(jù)庫及網(wǎng)站等。五、PubMed其他功能認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研五、PubMed其他功能認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研eUtils(EntrezProgrammingUtilities)

通過eUtils這個程序設(shè)計模塊,可以通過我們自己設(shè)計的應(yīng)用程序平臺,獲取NCBI數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù),從而實(shí)現(xiàn)這些數(shù)據(jù)資源的深度開發(fā)使用。實(shí)現(xiàn)自動化的大批量的從Entrez數(shù)據(jù)庫下載數(shù)據(jù)。并且提供了幾種常用的語言以供選擇，像Perl,Python,Java,和C++等。五、PubMed其他功能認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研免費(fèi)期刊的獲取PubMed提供了免費(fèi)全文期刊網(wǎng)址

PubmedCentral

/pmc/journals/向作者索要作者主頁

五、PubMed其他功能認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研六、PubMed的個性化服務(wù)認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研保存檢索式(生成URL或HTML實(shí)現(xiàn)共享)檢索結(jié)果的分類過濾特定功能的參數(shù)設(shè)置六、PubMed的個性化服務(wù)認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研經(jīng)由2000多位專家學(xué)者的評價推薦，提供目前世界上最重要的生物學(xué)論文資訊及研究趨勢。特色是收錄每篇具有科學(xué)價值的文獻(xiàn)，而不考慮這些文獻(xiàn)在哪在些期刊里發(fā)表PubMed里檢索出最核心的文獻(xiàn)——Facultyof1000與pubmed的完美結(jié)合六、PubMed的個性化服務(wù)認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研PubMed快速檢索功能的實(shí)現(xiàn)NCBISearchToolkit安裝NCBISearchToolkit劃詞右擊直接進(jìn)行pubmed檢索六、PubMed的個