標準解讀
《GB/T 27538-2011 動物流感檢測 A型H1N1流感病毒中HA、NA的焦磷酸測序檢測方法》是一項國家標準,旨在規(guī)范A型H1N1流感病毒血凝素(Hemagglutinin, HA)和神經氨酸酶(Neuraminidase, NA)基因片段的檢測流程。該標準適用于動物流感病毒樣本中的A型H1N1亞型鑒定及HA、NA基因序列分析。
根據此標準,首先需要從疑似感染A型H1N1流感病毒的動物體內采集適當的生物樣本,如呼吸道分泌物或組織樣本等。接著,利用RT-PCR技術對這些樣本進行處理,以擴增目標區(qū)域——即HA與NA基因的部分序列。擴增產物隨后通過特定的方法純化,并作為模板用于后續(xù)的焦磷酸測序步驟。
焦磷酸測序是一種高通量DNA測序技術,能夠快速準確地讀取短鏈DNA片段的信息。在本標準中,它被用來測定經過RT-PCR擴增后的HA與NA基因片段的具體序列。通過對獲得的序列信息進行比對分析,可以確定待測樣品是否含有A型H1N1流感病毒特有的HA與NA基因特征,并進一步了解其遺傳變異情況。
整個過程包括了樣本準備、核酸提取、RT-PCR擴增、產物純化以及最終的焦磷酸測序等多個環(huán)節(jié),每個步驟都有詳細的操作指南和技術要求,確保實驗結果的準確性與可重復性。此外,該標準還提供了質量控制措施,比如使用已知序列的標準品作為對照,以驗證整個檢測系統(tǒng)的有效性。
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....
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- 現行
- 正在執(zhí)行有效
- 2011-11-21 頒布
- 2012-03-01 實施
文檔簡介
ICS11220
B41.
中華人民共和國國家標準
GB/T27538—2011
動物流感檢測A型H1N1流感病毒中
HANA的焦磷酸測序檢測方法
、
Animalinfluenzadetection—MethodofpyrosequencingforHAandNAin
influenzavirusAH1N1
()
2011-11-21發(fā)布2012-03-01實施
中華人民共和國國家質量監(jiān)督檢驗檢疫總局發(fā)布
中國國家標準化管理委員會
GB/T27538—2011
前言
本標準按照給出的規(guī)則起草
GB/T1.1—2009。
本標準由中華人民共和國農業(yè)部提出
。
本標準由全國動物防疫標準化技術委員會歸口
(SAC/TC181)。
本標準起草單位中華人民共和國山東出入境檢驗檢疫局中國檢驗檢疫科學研究院
:、。
本標準主要起草人徐彪梁成珠凌宗帥張?zhí)柙乐厩鄹吆陚O濤方紹慶林祥梅韓雪清
:、、、、、、、、、、
朱來華張鶴曉單虎
、、。
Ⅰ
GB/T27538—2011
動物流感檢測A型H1N1流感病毒中
HANA的焦磷酸測序檢測方法
、
1范圍
本標準規(guī)定了焦磷酸測序技術用于型流感病毒及其墨西哥變異株中的和核酸
AH1N1HANA
序列檢測方法
。
本標準適用于型流感病毒通用及型流感病毒墨西哥變異株的核酸檢測
AH1N1AH1N1。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對于本文件的應用是必不可少的凡是注日期的引用文件僅注日期的版本適用于本文
。,
件凡是不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改單適用于本文件
。,()。
分析實驗室用水規(guī)格和試驗方法
GB/T6682
出入境動物檢疫采樣
GB/T18088
實驗室生物安全通用要求
GB19489
動物疫病實驗室檢驗采樣方法
NY/T541
基因檢驗實驗室技術要求
SN/T1193
3縮略語
下列縮略語適用于本文件
。
三磷酸腺苷
ATP:(adenosinetriphosphate)
脫氧核糖核酸
DNA:(deoxyribonucleicacid)
焦碳酸二乙酯
DEPC:(diethylpyrocarbonate)
磷酸鹽緩沖生理鹽水
PBS:(phosphatebelancedsolution)
焦磷酸測序
Pyrosequencing:
反轉錄聚合酶鏈式反應
RT-PCR:(reversetranscriptionpolymerasechainreaction)
核糖核酸
RNA:(ribonucleicacid)
Taq酶Taq聚合酶
:DNA
4原理
焦磷酸測序是通過測序引物和擴增單鏈模板雜交與聚合酶硫酸化酶熒
PCRDNA,DNA、ATP、
光素酶三磷酸腺苷雙磷酸酶和底物熒光素孵育逐一加入四種
、(APS)、,dNTPs(dATP,dTTP,dCTP,
如與模板配對此與引物的末端形成共價鍵釋放焦磷酸基團硫酸化酶在
dGTP),,dNTP,(PPi);ATP
存在的情況下催化焦磷酸形成驅動熒光素酶介導的熒光素向氧化熒光素轉化氧化熒
APSATP,ATP,
光素發(fā)出與量成正比的可見光信號光信號由電荷耦合檢測器收集并由軟件轉化為峰
ATP;(CCD)。
每個光信號的峰高與反應中摻入的核苷酸數目成正比和未摻入的由三磷酸腺苷雙磷酸
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