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文檔簡(jiǎn)介
同學(xué)們上午好主講葉輝單位溫州醫(yī)學(xué)院生化教研室上節(jié)課的重點(diǎn)內(nèi)容1.掌握真核基因表達(dá)調(diào)控的特點(diǎn);2.掌握順式作用元件、反式作用因子的概念及組成和轉(zhuǎn)錄因子的分類.復(fù)習(xí)與鞏固
是指利用重組DNA技術(shù)將目的基因和載體重組,再導(dǎo)入受體細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行擴(kuò)增和表達(dá)的過(guò)程。一.基因工程(geneticengineering)第一節(jié)基因工程基因工程相當(dāng)于目的基因的無(wú)性繁殖過(guò)程,也稱其為基因克隆(geneclone)或分子克?。╩olecularclone)。
第14章基因工程及其在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用重組DNA技術(shù)中常用的工具酶工具酶功能限制性核酸內(nèi)切酶識(shí)別特異序列,切割DNAT4DNA連接酶催化DNA中相鄰的5′磷酸基和3′羥基末端之間形成磷酸二酯鍵,使DNA切口封合或使兩個(gè)DNA分子或片段連接DNA聚合酶Ⅰ合成雙鏈cDNA分子或片段連接缺口平移、制作高比活探針DNA序列分析填補(bǔ)3′末端Klenow片段又名DNA聚合酶I大片段,具有完整DNA聚合酶I的53聚合、35外切活性,而無(wú)53外切活性。常用于cDNA第二鏈合成,雙鏈DNA3末端標(biāo)記等逆轉(zhuǎn)錄酶合成cDNA替代DNA聚合酶I進(jìn)行填補(bǔ),標(biāo)記或DNA序列分析多聚核苷酸激酶催化多聚核苷酸5′羥基末端磷酸化(連),或標(biāo)記探針末端轉(zhuǎn)移酶在3′羥基末端進(jìn)行同質(zhì)多聚物加尾堿性磷酸酶切除5‘末端磷酸基,防止載體自身連接。二、基因工程操作中常用的工具
(一)工具酶
限制性內(nèi)切酶(restrictionendonuclease)
定義:是一類能識(shí)別和切割雙鏈DNA分子中特定堿基序列的核酸水解酶GGATCCCCTAGGGCCTAGGATCCG+BamHⅠ
Ⅱ型限制酶識(shí)別序列特點(diǎn)—回文結(jié)構(gòu)
GGATCCCCTAGG
一般識(shí)別雙鏈DNA的4~8個(gè)核苷酸順序,其中以6個(gè)核苷酸順序最為常見(jiàn)。EcoRⅠGTTCAAGCTTAAAATTCG+GAATTCCTTAAGHpaⅡGTTAACCAATTGAACTTG+平端切口粘端切口(5’和3‘突出端)切口:黏性切口和平端切口(二)載體1.定義:是攜帶目的DNA片段進(jìn)入受體細(xì)胞進(jìn)行擴(kuò)增和表達(dá)的工具。2.分類:(1)克隆載體(cloningvector):使插入的外源DNA序列被擴(kuò)增而特意設(shè)計(jì)的載體稱為克隆載體。(2)表達(dá)載體(expressionvector):使插入的外源DNA序列轉(zhuǎn)錄翻譯成多肽鏈而特意設(shè)計(jì)的載體稱為表達(dá)載體。質(zhì)粒
(plasmid)特點(diǎn)存在于細(xì)菌等細(xì)胞質(zhì)中雙鏈環(huán)狀DNA分子大約1-200Kb具有自主復(fù)制和轉(zhuǎn)錄能力不能獨(dú)立存活
在子細(xì)胞中保持恒定的拷貝數(shù)并表達(dá)其遺傳信息常用載體:細(xì)菌質(zhì)粒噬菌體黏粒病毒特點(diǎn):多克隆位點(diǎn)篩選標(biāo)記三、基因工程的操作過(guò)程基本過(guò)程目的基因的獲取重組DNA分子導(dǎo)入受體細(xì)菌目的基因與載體的連接克隆(或表達(dá))載體的選擇和構(gòu)建重組體的篩選與鑒定克隆基因的表達(dá)
和表達(dá)產(chǎn)物純化以質(zhì)粒為載體的DNA克隆過(guò)程目錄(一)目的基因的獲得1.化學(xué)合成法要求:已知目的基因的核苷酸序列或其產(chǎn)物的氨基酸序列。2.基因組DNA文庫(kù)(genomicDNAlibrary)3.cDNA文庫(kù)(cDNAlibrary)4.聚合酶鏈反應(yīng)(polymerasechainreaction,PCR)組織或細(xì)胞染色體DNA基因片斷克隆載體重組DNA分子含重組分子的轉(zhuǎn)化菌限制性內(nèi)切酶受體菌基因組DNA文庫(kù)存在于轉(zhuǎn)化細(xì)胞內(nèi)由克隆載體所攜帶的所有基因組DNA的集合*從基因組DNA文庫(kù)獲取目的基因目錄mRNAcDNA雙鏈cDNA重組DNA分子cDNA文庫(kù)反轉(zhuǎn)錄酶載體受體菌復(fù)制*從cDNA文庫(kù)獲取目的基因逆轉(zhuǎn)錄酶AAAA
TTTTAAAASI核酸酶
DNA聚合酶Ⅰ堿水解
TTTT目錄基因組DNA文庫(kù)cDNA文庫(kù)粘性末端連接
(二)目的基因與載體的連接BamHⅠ切割反應(yīng)
GGATCCCCTAGGT4
DNA連接酶15oCGATCCGGCCTAG+目的基因用BamHⅠ切割載體DNA用BamHⅠ切割重組體載體自連目的基因自連2.平端連接適用于:限制性內(nèi)切酶切割產(chǎn)生的平端粘端補(bǔ)齊或切平形成的平端導(dǎo)入種類載體宿主轉(zhuǎn)化質(zhì)粒細(xì)菌轉(zhuǎn)染噬菌體或病毒真核細(xì)胞轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體細(xì)菌轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)染和轉(zhuǎn)導(dǎo)的區(qū)別(三)重組體導(dǎo)入受體細(xì)胞BamHⅠ切割反應(yīng)
GGATCCCCTAGGT4
DNA連接酶15oCGATCCGGCCTAG+目的基因用BamHⅠ切割載體DNA用BamHⅠ切割重組體目的基因自連載體自連(四)基因工程菌的篩選直接選擇法:
抗藥性標(biāo)記選擇藍(lán)白斑篩選法
菌落或噬菌體的原位雜交非直接選擇法:免疫學(xué)方法(插入失活法)抗藥性標(biāo)記選擇目錄重組DNA技術(shù)操作過(guò)程可形象歸納為
小結(jié)分分離目的基因切限制酶切目的基因與載體接拼接重組體轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)入受體菌篩篩選重組體重組DNA技術(shù)操作的主要步驟載體質(zhì)粒噬菌體病毒目的基因(外源基因)基因組DNAcDNA人工合成PCR產(chǎn)物限制酶消化開(kāi)環(huán)載體DNA目的基因連接酶重組體轉(zhuǎn)化體外包裝,轉(zhuǎn)染帶重組體的宿主篩選表型篩選酶切電泳鑒定菌落原位雜交(五)外源基因的表達(dá)種類功能所含特異序列克隆載體外源基因擴(kuò)增復(fù)制子多克隆位點(diǎn)篩選標(biāo)志表達(dá)載體外源基因表達(dá)復(fù)制子多克隆位點(diǎn)篩選標(biāo)志基因表達(dá)的調(diào)控序列克隆載體和表達(dá)載體的比較
分子雜交以DNA的變性和復(fù)性為理論基礎(chǔ)。DNA變性:DNA在某些理化因素的作用下堿基對(duì)間氫鍵破壞,由雙鏈變成單鏈的過(guò)程。DNA的復(fù)性:變性DNA的單鏈重新合成雙鏈的過(guò)程。分子雜交:不同來(lái)源的單鏈核酸通過(guò)堿基互補(bǔ)形成雜合雙鏈的過(guò)程。分子雜交
第二節(jié)常見(jiàn)分子生物學(xué)技術(shù)
一、分子雜交(molecularhybridization)
復(fù)性RNADNA(一)核酸探針(probe)
1、定義:
是分子雜交的技術(shù)基礎(chǔ),它是一段與被檢測(cè)核酸序列互補(bǔ)的帶有標(biāo)記的核苷酸片段,長(zhǎng)度一般為十幾到幾千個(gè)堿基不等。
2、探針標(biāo)記方法:(1)放射性同位素標(biāo)記(2)光敏生物素標(biāo)記(3)地高辛標(biāo)志物(4)分子信標(biāo)(二)分子雜交的方法斑點(diǎn)雜交(dotblothybridization)
DNA點(diǎn)陣(DNAarray)
基因芯片
(genechips)
原位雜交(insituhybridization)
轉(zhuǎn)移印跡技術(shù)變性DNA或RNA探針雜交液NC硅片(三)印跡技術(shù)的類別及應(yīng)用1、DNA印跡技術(shù)
(Southernblotting)
用于基因組DNA、重組質(zhì)粒和噬菌體的分析。2、RNA印跡技術(shù)
(Northernblotting)
用于RNA的定性定量分析。3、蛋白質(zhì)的印跡分析
(Westernblotting)
用于蛋白質(zhì)定性定量及相互作用研究。
分子雜交實(shí)驗(yàn)①②③
二、聚合酶鏈反應(yīng)(polymerasechainreaction,PCR)PCR的基本反應(yīng)步驟變性95?C延伸72?C退火Tm-5?C95?C55?C72?CPCR的主要用途(一)目的基因的克隆(二)基因的體外突變(三)DNA和RNA的微量分析(四)DNA序列測(cè)定(五)測(cè)定基因的表達(dá)水平三、DNA的序列分析放射自顯影凝膠電泳堿性專一性裂解反應(yīng)A/GGC/TC5’GTCGTAA5’GTCGTA5’GTCGT5’GTCG5’GTC5’GT5’G--+硫酸二甲酯——G甲酸——A/G肼——C/T肼(NaCl)——C(一)化學(xué)裂解法(Maxam-Gillbert法)(二)DNA鏈末端合成終止法四、轉(zhuǎn)基因動(dòng)物、克隆動(dòng)物和基因剔除技術(shù)
(一)轉(zhuǎn)基因動(dòng)物定義
是利用基因工程和胚胎工程技術(shù),改變動(dòng)物遺傳性狀的新方法,是將外源基因?qū)雱?dòng)物受精卵,再將受精卵植入到代孕動(dòng)物的輸卵管或子宮中培育的動(dòng)物。目錄(二)克隆動(dòng)物
核轉(zhuǎn)移技術(shù)
將動(dòng)物體細(xì)胞核全部導(dǎo)入另一個(gè)體的去胞核的受精卵內(nèi),使之發(fā)育成個(gè)體,即克隆(clone)。多利誕生過(guò)程
(三)基因剔除技術(shù)也稱基因靶向(genetargeting)滅活,有目的去除動(dòng)物體內(nèi)某種基因的技術(shù)。又稱基因敲除(geneknockout)?;蚯萌耄╣eneknockin)定義:是指利用分子生物學(xué)和分子遺傳學(xué)的技術(shù)方法通過(guò)直接檢測(cè)基因結(jié)構(gòu)是否改變、基因表達(dá)有否異常,對(duì)疾病作出診斷?;蛟\斷的概念和特點(diǎn)特點(diǎn):
針對(duì)性強(qiáng);靈敏度高;適用范圍廣;早期診斷第三節(jié)基因工程在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用
(一)基因診斷(genediagnosis)
甲型血友病基因組的限制性酶切分析×BclⅠ酶切位點(diǎn)5′5′3′突變基因99bp142bp43bp正?;?/p>
基因治療的概念早期將通過(guò)基因轉(zhuǎn)移技術(shù)用正常基因原位置換有缺陷的基因治療單
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