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質(zhì)粒DNA的提取與酶切電泳鑒定質(zhì)粒提取關(guān)鍵:基因組DNA與質(zhì)粒DNA的有效分離(堿裂解法)
高pH使質(zhì)粒DNA和染色體DNA變性,同時(shí)沉淀蛋白質(zhì)。再將pH值調(diào)至中性,質(zhì)粒DNA較小,很容易復(fù)性成雙鏈。而染色體DNA較大,不會(huì)復(fù)性,纏結(jié)成網(wǎng)狀不溶物質(zhì),從而可以通過(guò)離心除去。注意事項(xiàng):實(shí)驗(yàn)方法
堿裂解法
1、挑取攜帶目標(biāo)DH5α單菌落于3-5mlLB(含Amp100μg/ml),37℃振蕩培養(yǎng)過(guò)夜(12-16h);2、取2ml培養(yǎng)液倒入1.5mlEP管中(分次加入,離心),4℃12000rpm離心30s-1min,棄去上清;3、用渦旋混勻器使菌體沉淀重懸浮于250μl冰預(yù)冷的溶液Ⅰ。4、加入新配制的溶液Ⅱ250μl,蓋緊管口,快速溫和顛倒離心管5次,菌液變得透亮,以混勻內(nèi)容物(千萬(wàn)不要振蕩)。5、加入350μl預(yù)冷的溶液Ⅲ,蓋緊管口,反復(fù)顛倒離心管5次,出現(xiàn)白色沉淀,使沉淀混勻,4℃
12000rpm離心10分鐘。
6、上清液移入干凈離心管中,加入等體積的酚/氯仿(1:1),振蕩混勻,4℃下12000rpm離心2分鐘。7、將上層水相移入干凈離心管中,加入2倍體積的無(wú)水乙醇,振蕩混勻后室溫放置2分鐘,然后4℃下12000rpm離心5分鐘。8、徹底棄上清,將管口敞開(kāi)倒置于衛(wèi)生紙上使所有液體流出,加入1ml70%乙醇洗沉淀一次,4℃下12000rpm離心2分鐘。9、吸除上清液,將管倒置于衛(wèi)生紙上使液體流盡,室溫開(kāi)蓋放置10-15min,使乙醇揮發(fā)殆盡。10、將沉淀溶于30-50μlTE緩沖液(pH8.0,含20μg/mlRNaseA)中,儲(chǔ)于-20℃冰箱中。11、酶切鑒定并將沒(méi)有酶切的質(zhì)粒與酶切的質(zhì)粒進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳。(酶切體系一般1-2ul提取
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