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高級(jí)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)第1頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四種瓜得瓜種豆得豆第2頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四內(nèi)容
概述研究設(shè)計(jì)方法統(tǒng)計(jì)分析方法
第3頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四概述第4頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四按遺傳與環(huán)境因素的相對(duì)作用由遺傳因素決定的疾?。ㄑ巡、白化?。┗旧嫌蛇z傳因素決定的疾病(蠶豆?。┒嘁蜃舆z傳病(高血壓、冠心?。┗旧嫌森h(huán)境因素決定的疾病(中毒)疾病的分類第5頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四疾病的分類隨著人類基因組計(jì)劃的完成和后基因組計(jì)劃的開展,人們對(duì)于疾病的認(rèn)識(shí)也越來(lái)越深入。已有的研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)人類疾病都與基因受損有關(guān),因此提出了基因病-人類疾病的新概念。由此提出將人類疾病分為三種類型。
第一類是單基因病。僅由單個(gè)基因DNA序列某個(gè)堿基對(duì)的改變就造成疾病,并且可以把這樣的改變傳遞給后代。如血友病A、白化病等。第6頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四
第二類是多基因病(復(fù)雜性疾?。?。這類疾病的發(fā)生涉及兩個(gè)以上基因的結(jié)構(gòu)或表達(dá)調(diào)控的改變,主要指慢性非傳染性疾病,如腫瘤、高血壓、冠心病、糖尿病、哮喘病、骨質(zhì)疏松癥、神經(jīng)性疾病、原發(fā)性癲癇等。
第三類為獲得性基因病。主要是傳染病由病原微生物通過(guò)感染將其基因入侵到宿主基因引起。如HIV。第7頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四復(fù)雜性疾病的特征GeneticHeterogeneity(遺傳異質(zhì)性)Gene-GeneandGene-EnvironmentInteraction(基因-基因,基因-環(huán)境的交互作用)IncompletePenetrance(不完全外顯性)Phenocopy(表型拷貝)Pleiotropy(多效性)第8頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四研究設(shè)計(jì)方法第9頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四患病家系成員設(shè)計(jì)第10頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四優(yōu)點(diǎn):具有明顯的孟德?tīng)栠z傳特點(diǎn)。遺傳方式確定(常顯、常隱或X連鎖)。缺點(diǎn):如果指定的遺傳方式不正確,可能導(dǎo)致錯(cuò)誤的結(jié)論。難以收集到家系全部人員?;疾〖蚁党蓡T設(shè)計(jì)第11頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四患病同胞對(duì)設(shè)計(jì)患病同胞對(duì)表型不一致同胞對(duì)第12頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四患病同胞對(duì)設(shè)計(jì)優(yōu)點(diǎn):可以進(jìn)行非參數(shù)統(tǒng)計(jì)分析。研究對(duì)象相對(duì)容易收集。缺點(diǎn):檢驗(yàn)效能相對(duì)較低樣本量要求較大第13頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四患病先證者核心家系設(shè)計(jì)第14頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四優(yōu)點(diǎn):可以進(jìn)行非參數(shù)統(tǒng)計(jì)分析。研究對(duì)象相對(duì)容易收集。缺點(diǎn):統(tǒng)計(jì)分析時(shí)僅僅雜合子的雙親可以有效利用。對(duì)于遲發(fā)性疾病難以收集到雙親資料。患病先證者核心家系設(shè)計(jì)第15頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四雙生子研究設(shè)計(jì)通過(guò)比較在相似或不同環(huán)境中成長(zhǎng)起來(lái)的同卵雙生子及異卵雙生子某一疾病或性狀發(fā)生的一致性,來(lái)判斷遺傳與環(huán)境因素的作用。養(yǎng)子研究設(shè)計(jì)通過(guò)比較、分析養(yǎng)子與其同胞及生身父母某疾病或性狀的相似性和與其寄養(yǎng)同胞或養(yǎng)父母的相似性,研究在某種疾病或性狀發(fā)生中遺傳因素與環(huán)境因素相對(duì)作用的大小。家系研究中其它研究設(shè)計(jì)方法第16頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四半同胞研究設(shè)計(jì)是指同父異母或同母異父的兄弟姐妹。根據(jù)半同胞中所研究疾病的患病情況,可分析疾病或遺傳性狀來(lái)自父方或母方。第17頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四病例對(duì)照研究設(shè)計(jì)第18頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四優(yōu)點(diǎn):相對(duì)容易收集到資料。投入少,產(chǎn)出高。缺點(diǎn):由于存在連鎖不平衡和種群分層,容易導(dǎo)致假陽(yáng)性或假陰性。病例對(duì)照研究設(shè)計(jì)第19頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四衍生的研究類型
巢式病例對(duì)照研究單純病例研究病例時(shí)間對(duì)照設(shè)計(jì)病例對(duì)照與隊(duì)列研究作為病因研究的主要方法,有其各自的優(yōu)勢(shì)與不足,而且這些優(yōu)勢(shì)與不足可以相互補(bǔ)充,因此,在實(shí)踐過(guò)程中產(chǎn)生了一些新的研究類型,結(jié)合使用這兩種方法,可以揚(yáng)長(zhǎng)避短。病例-隊(duì)列研究病例交叉研究第20頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四timeExposureStudystartsDiseaseoccurrenceExposureDiseaseoccurrencetimeStudystartsExposuretimeDiseaseoccurrenceStudystarts歷史性隊(duì)列雙向性隊(duì)列前瞻性隊(duì)列第21頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四巢式病例對(duì)照研究(nestedcasecontrolstudy)
基本原理
按隊(duì)列研究方式進(jìn)行選擇一隊(duì)列,收集基線資料,采集所研究的生物學(xué)標(biāo)志的組織或體液標(biāo)本儲(chǔ)存?zhèn)溆秒S訪隨訪到出現(xiàn)能滿足病例對(duì)照研究樣本量的病例數(shù)為止第22頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四匹配
按病例進(jìn)入隊(duì)列的時(shí)間、疾病出現(xiàn)時(shí)間與性別、年齡等匹配條件,從同一隊(duì)列選擇1個(gè)或數(shù)個(gè)非病例作對(duì)照,抽取病例與對(duì)照的基線資料并檢測(cè)收集的標(biāo)本資料處理
按匹配病例對(duì)照研究方法處理資料第23頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四
1992年Ross用巢式病例對(duì)照研究:①上海地區(qū)肝癌與尿中黃曲霉素生物學(xué)標(biāo)志關(guān)系②18244名中年男性隊(duì)列中發(fā)現(xiàn)22例肝癌③每例配5或10個(gè)對(duì)照檢測(cè)研究開始時(shí)的尿樣:發(fā)現(xiàn)黃曲霉素B1及其代謝產(chǎn)物和DNA加合物的OR值經(jīng)調(diào)整混雜因素后,為3.8(1.2~12.2)。
黃曲霉素作為肝癌致病因素最直接的證據(jù)第24頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四病例-隊(duì)列研究(case-cohortstudy)基本原理
研究開始時(shí),在隊(duì)列中隨機(jī)選取一組樣本作為對(duì)照組觀察結(jié)束時(shí),隊(duì)列中出現(xiàn)被研究疾病所有病例作病例組與隨機(jī)對(duì)照組進(jìn)行比較
這種研究模式,可同時(shí)研究幾種疾病,不同疾病有不同病例組,但對(duì)照組都是同一組隨機(jī)樣本第25頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四病例--隊(duì)列與巢式病例對(duì)照研究的區(qū)別對(duì)照是隨機(jī)選取,不與病例進(jìn)行匹配隨機(jī)對(duì)照組中成員如發(fā)生被研究疾病,既為對(duì)照,又同時(shí)為病例1個(gè)隨機(jī)對(duì)照組可以同時(shí)和幾個(gè)病例組比較分析第26頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四病例--隊(duì)列與巢式病例對(duì)照研究的優(yōu)點(diǎn)
因果關(guān)系清楚資料可靠論證強(qiáng)度高省時(shí)省力省錢適合于分子流行病學(xué)研究第27頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四背景1994年P(guān)iegorseh、Begs等提出
遺傳與環(huán)境的關(guān)系交互作用病例對(duì)照研究和隊(duì)列研究的效率費(fèi)用
病例病例研究(casecasestudy)應(yīng)用前提條件
在正常人群中基因型與環(huán)境暴露各自獨(dú)立發(fā)生所研究疾病為罕見(jiàn)病(此時(shí)可用OR來(lái)估計(jì)RR值)第28頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四基本原理第29頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四研究示意圖單純病例研究環(huán)境暴露基因型病人+-+-+-第30頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四解決問(wèn)題
1991年美國(guó)Maclure提出病例交叉設(shè)計(jì)日常生活中一些突發(fā)事件之后,常會(huì)伴隨某些結(jié)果的發(fā)生。究竟是這些突發(fā)事件導(dǎo)致了結(jié)果的發(fā)生,還是僅僅由于機(jī)會(huì)所致?
病例交叉研究(case-crossoverdesign)第31頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四暴露與某急性事件有關(guān)
比較相同研究對(duì)象暴露情況在急性事件發(fā)生前一段時(shí)間與未發(fā)生事件的某段時(shí)間基本原理
如果暴露與少見(jiàn)的事件(或疾病)有關(guān),那么剛好在事件發(fā)生前一段時(shí)間內(nèi)的暴露頻率應(yīng)該高于更早時(shí)間內(nèi)的暴露頻率。第32頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四
研究對(duì)象
病例和對(duì)照,兩部分的信息均來(lái)自于同一個(gè)體,
“病例部分“危險(xiǎn)期,疾病或事件發(fā)生前的一段時(shí)間。
“對(duì)照部分”對(duì)照期,危險(xiǎn)期外特定的一段時(shí)間。研究是對(duì)個(gè)體危險(xiǎn)期和對(duì)照期內(nèi)的暴露信息進(jìn)行比較第33頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四
例如
據(jù)報(bào)道某種藥物可以引發(fā)猝死,如果該報(bào)道正確,則應(yīng)該可以觀察到服用此藥物后一段時(shí)間內(nèi)猝死增多,或者說(shuō)在猝死前幾天或幾周內(nèi)應(yīng)有服藥增多的報(bào)道。第34頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四統(tǒng)計(jì)分析方法
第35頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四家族聚集性分析
比較患病率或發(fā)病率患者親屬>一般人群患者親屬>對(duì)照親屬隨親緣系數(shù)的降低而降低比較某些數(shù)量性狀(血壓水平等)親屬對(duì)之間的相關(guān)>非親屬對(duì)第36頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四同病率雙生子中某疾病(或性狀)的一致性稱為同病率。
C-共同罹患所研究疾病或表現(xiàn)所研究性狀的雙生子對(duì)子數(shù)
D-雙方表現(xiàn)不一致的雙生子對(duì)子數(shù)第37頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四同卵雙生子
異卵雙生子
腭裂33.3%4.5%先心病7.2%3.3%多指(趾)48.2%5.3%表1
幾種疾病雙生子的同病率第38頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四系譜分析
目的通過(guò)系譜分析初步判斷某病為單基因遺傳病還是多基因遺傳病。
分析方法將家系調(diào)查所獲得的資料按一定方式繪成系譜圖(pedigreechart),根據(jù)發(fā)病情況,按遺傳規(guī)律分析其表型及基因型。結(jié)果
符合孟德?tīng)栠z傳方式,提示屬單基因遺傳??;不符合孟德?tīng)栠z傳方式,但與遺傳因素密切相關(guān),可能為多基因遺傳病。第39頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四系譜分析中僅包括父母及其子代的小家系,稱為核心家系。所謂指示者,是指在一個(gè)家系中表現(xiàn)型極端者,大多為患者或某性狀的表現(xiàn)者。一個(gè)核心家系加上三位指示者,即組成一個(gè)系譜分析單位。附有指示者的核心家系是對(duì)多基因遺傳病進(jìn)行系譜分析的理想單位。
第40頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四易患性與發(fā)病閾值在多因子遺傳病中,遺傳基礎(chǔ)和環(huán)境因素的共同作用決定了一個(gè)個(gè)體是否易于患某種疾病,這種易于或不易于患病的屬性變量稱為易患性(liability)?;颊哂H屬中的現(xiàn)患率大于一般人群,患者親屬的易患性平均值比一般人群的易患性平均值更接近閾值。此即所謂的閾值模型(thresholdmodel)。
第41頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四圖1一般人群和患者親屬易患性分布圖
G:一般人群;R:患者親屬;T:閾值;Xg:一般人群易患性均值至閾值的正態(tài)離差;Xra:患者親屬易患性均值至閾值的正態(tài)離差;A:患者易患性平均值;ag:一般人群易患性均值與患者易患性均值的正態(tài)離差;qg:一般人群患病率;qra:患者親屬患病率。
第42頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四遺傳度及其估計(jì)
在多因子遺傳病中,遺傳對(duì)易患性所起作用的大小程度稱為遺傳度(heritability,h2)。第43頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四表3一些常見(jiàn)多因子遺傳病的發(fā)病率和遺傳度
疾病或畸形群體發(fā)病率(%)患者一級(jí)親屬發(fā)病率(%)遺傳度(%)哮喘4.02080精神分裂癥1.01080原發(fā)性高血壓4-820-3062消化性潰瘍4.0837冠心病2.5765脊柱裂0.17476唇裂±腭裂0.04276第44頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四在研究中若通過(guò)匹配等方法給先證者選取可比的對(duì)照組,進(jìn)行病例對(duì)照研究時(shí),可用以下方法估計(jì)遺傳度:
式中PC為對(duì)照組親屬的不發(fā)病概率,PC=1-qc;qc為對(duì)照組親屬的發(fā)病率;XC為對(duì)照親屬易患性均值至閾值的正態(tài)離差;ac為對(duì)照親屬中患者的易患性均值至對(duì)照親屬易患性均值的正態(tài)離差;A為病例數(shù);其余同前。病例對(duì)照研究第45頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四
實(shí)例
謝宗孟等(1983)調(diào)查克汀病時(shí)發(fā)現(xiàn)患者一級(jí)親屬1217人中有49人發(fā)病,qra=0.0400,對(duì)照組一級(jí)親屬45076人中有263人發(fā)病qc=0.0058,由qra得Xra=1.751,ara=2.154,pra=1-qra=0.9600;由qc得XC=2.524,ac=2.845,pc=1-qc=0.9942;本例r=1/2,代入以上公式得:
因此,地方性克汀病的遺傳度為54±4.54%。第46頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四對(duì)質(zhì)量性狀的多因子遺傳病可用以下方法估計(jì)。
CMZ和CDZ分別為同卵雙生子和異卵雙生子的同病率;n1和n2分別為同卵雙生子對(duì)子數(shù)和異卵雙生子對(duì)子數(shù)。雙生子法第47頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四實(shí)例
303對(duì)雙生子中,同卵雙生子201對(duì)中近視一致者156對(duì);異卵雙生子102對(duì)中近視一致者47對(duì)。
本例近視的遺傳度為59±6.57%。=0.0657
第48頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四單基因疾病的分析方法第49頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四分離分析檢驗(yàn)實(shí)際觀察的子代同胞分離比與某特定遺傳方式?jīng)Q定的理論分離比差異是否有顯著性,判斷所研究疾病是否符合假定的遺傳方式。分離比是指患者在同胞總數(shù)中的比值。此種分析的基礎(chǔ)是假設(shè)患者均為雜合體,若群體中患者是純合體發(fā)病,以上方法可造成較大偏差。第50頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四實(shí)例一疑為軟骨發(fā)育不全的100個(gè)家庭父母一方患病的家庭共有子女235人,其中127人患?。ㄓ^察值)。試求證本病是否為常染色體顯性遺傳。第51頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四表1分離分析χ2檢驗(yàn)整理表χ2=1.536df=1P>0.05第52頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四遺傳平衡定律在一個(gè)大的、隨機(jī)婚配的群體中,如果沒(méi)有遷移、選擇的影響,突變率保持不變,各種基因型的頻率也將代代保持不變,成為遺傳平衡的群體,此即遺傳平衡定律,亦稱Hardy-Weinberg定律。在以群體為研究對(duì)象進(jìn)行單基因遺傳病分析時(shí)可以用遺傳平衡定律來(lái)估計(jì)群體中所研究疾病的基因頻率和基因型頻率。第53頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四設(shè)一對(duì)等位基因A和a(A為顯性基因,a為隱性基因),群體中的頻率各為p與q,p+q=1,隨機(jī)婚配時(shí)子代基因型及其頻率為:
精子
A(p)a(q)
卵
A(p)AAAa(pp)(pq)
子
a(q)Aaaa(pq)(qq)
基因型頻率的分布為:(p(A)+q(a))2第54頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四實(shí)例二
黑酸尿癥發(fā)病率為1/100萬(wàn)該病為常染色體隱性遺傳病,因此基因型均為純合子aa(q2)。根據(jù)Hardy-Weinberg定律:因?yàn)閤=q2=0.000001,q=
正常顯性基因頻率p=1-q=1-0.001=0.999≈1
雜合子頻率2pq=2×1×0.001=0.002
該病發(fā)病率雖然僅為1/100萬(wàn),但在群體中雜合子即隱性基因攜帶者的頻率達(dá)1/500。第55頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四多基因疾病的分析方法第56頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四表型與基因型一般統(tǒng)計(jì)分析病例-父母三結(jié)構(gòu)資料的TDT分析病例-父母三結(jié)構(gòu)資料對(duì)數(shù)線性模型分析同胞數(shù)據(jù)SDT分析以家系為基礎(chǔ)的關(guān)聯(lián)分析(FBAT)基因-環(huán)境(基因)交互作用分析連鎖分析多位點(diǎn)基因的單倍體型構(gòu)建分析全基因組關(guān)聯(lián)分析……統(tǒng)計(jì)分析方法第57頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四分析基因型與表型的關(guān)系,也就是比較不同基因型的研究對(duì)象的表型是否存在差異,如基因型不同,表型也顯著不同,則表示兩者有關(guān)。表型為連續(xù)型變量的基因型之間比較可用t-檢驗(yàn)、方差分析、線性回歸等統(tǒng)計(jì)方法。表型為分類型變量的基因型之間比較可用卡方檢驗(yàn)、LOGISTIC回歸等統(tǒng)計(jì)方法。
表型與基因型一般統(tǒng)計(jì)分析第58頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四
原理:理論上,父母親的兩個(gè)等位基因傳遞子女的概率均各為50%,如某一等位基因從父母?jìng)鬟f給患病的子女的概率大于50%,表示傳遞不平衡。傳遞不平衡檢驗(yàn)(TDT)能發(fā)現(xiàn)與疾病直接有關(guān)的基因,或與疾病基因相連鎖的基因。特點(diǎn):它主要用于分析定性性狀(如是否患病),不適用于定量性狀(如血糖、胰島素等表型資料)的分析。
病例-父母三結(jié)構(gòu)資料的TDT分析第59頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四原理:它比較患病的同胞與非患病的同胞某等位基因出現(xiàn)的平均數(shù)。理論上,這兩種家系數(shù)相等,如兩種家系數(shù)顯著不等,表示該基因與患病與否有關(guān),該基因可能是與疾病直接有關(guān)的基因,也可能是與疾病基因相連鎖的基因。特點(diǎn):主要用于分析定性性狀(如是否患?。?,不適用于定量性狀(如血糖、胰島素等表型資料)的分析。同胞數(shù)據(jù)SDT分析第60頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四原理:FBAT以核心家系為單位計(jì)算每個(gè)核心家系數(shù)的基因型(X)的分布概率與統(tǒng)計(jì)量“S”(統(tǒng)計(jì)量S是表型T與基因型X的乘積),然后累加各核心家系的統(tǒng)計(jì)量S及S的方差與協(xié)方差,進(jìn)行卡方檢驗(yàn)。特點(diǎn):FBAT既適應(yīng)于定性資料又適應(yīng)于定量資料,并且可以先對(duì)表型變量經(jīng)有關(guān)混雜因素進(jìn)行調(diào)整,將調(diào)整后的殘差值或校正值放入FBAT程序中進(jìn)行分析,這樣得到的結(jié)果就是經(jīng)過(guò)混雜因素調(diào)整后的關(guān)聯(lián)分析的結(jié)果。FBAT適用于各種類型的家系結(jié)構(gòu)。有父母雙親、只有單親、雙親均無(wú)、一個(gè)同胞、多個(gè)同胞的家系都可混合在一起應(yīng)用。FBAT分析第61頁(yè),共68頁(yè),2022年,5月20日,21點(diǎn)46分,星期四原理:?jiǎn)伪扼w型分析通常采用置換法,通過(guò)對(duì)病例與對(duì)照兩組分別構(gòu)建單倍體型并計(jì)算各型頻率進(jìn)行的卡方檢驗(yàn),得出P值;隨機(jī)分配每個(gè)研究對(duì)象是病例還是對(duì)照,用假定的病例對(duì)照數(shù)據(jù)重復(fù)上述的單倍體型構(gòu)建及兩組單倍體型頻率,重復(fù)置換1000次,得出1000個(gè)P值,觀察從假定的病例對(duì)照數(shù)據(jù)得來(lái)的P值小于從實(shí)際的病例對(duì)照分組樣本得來(lái)的P值的比例(百分率),該比例即為兩組比較的P值。特點(diǎn):?jiǎn)伪扼w型(Haplotype)是指同一條染色體上緊密相連的一些位點(diǎn)(或基因)的組合。不同位點(diǎn)間排列距離越近,在減數(shù)分裂時(shí)發(fā)生重組的可能性就越小,以同一單倍體型整體傳遞給子代的可能性也就越大。單倍體型分析的可以幫助研究者進(jìn)一步驗(yàn)證在連鎖分析中所取得的數(shù)據(jù),排除假陽(yáng)性;通過(guò)多個(gè)位點(diǎn)的單倍體型排列,還可以使某些多態(tài)性不夠
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