實驗一瓊脂糖凝膠電泳

1、33實驗一瓊脂糖凝膠電泳一、實驗?zāi)康呐c要求學(xué)習(xí)與掌握DNA電泳的概念、分類以及技術(shù)方法，利用瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA純度、含量以及分子量，及分離不同大小DNA片段。二、實驗原理帶電顆粒在電場作用下，向著與其相反的電極移動，稱為電泳。DNA分子是兩性電解質(zhì)，在高于其等電點的溶液（）中，堿基幾乎不解離，磷酸基團(tuán)全部解離，DNA分子帶負(fù)電荷，在電場中向正極移動。核酸分子在瓊脂糖凝膠中泳動時，具有電荷效應(yīng)和分子篩效應(yīng)，但主要為分子篩效應(yīng)。因此，核酸分子的遷移率由下列幾種因素決定：（1）DNA的分子大小線狀雙鏈DNA分子在一定濃度瓊脂糖凝膠中的遷移速率與DNA分子量對數(shù)成反比，分子越大則所受阻力越大，也

2、越難于在凝膠孔隙中移動，因而遷移得越慢。（2）DNA分子的構(gòu)象。當(dāng)DNA分子處于不同構(gòu)象時,它在電場中移動距離不僅和分子量有關(guān),還和它本身構(gòu)象有關(guān)。相同分子量的線狀、開環(huán)和超螺旋質(zhì)粒DNA在瓊脂糖凝膠中移動的速度是不一樣的，超螺旋DNA移動得最快，而開環(huán)狀DNA移動最慢。如在電泳鑒定質(zhì)粒純度時發(fā)現(xiàn)凝膠上有數(shù)條DNA帶難以確定是質(zhì)粒DNA不同構(gòu)象引起還是因為含有其他DNA引起時，可從瓊脂糖凝膠上將DNA帶逐個回收，用同一種限制性內(nèi)切酶分別水解，然后電泳，如在凝膠上出現(xiàn)相同的DNA圖譜，則為同一種DNA。（3）電源電壓。在低電壓時，線狀DNA片段的遷移速率與所加電壓成正比。但是隨著電場強(qiáng)度的增加，

3、不同分子量的DNA片段的遷移率將以不同的幅度增長，片段越大，因場強(qiáng)升高引起的遷移率升高幅度也越大，因此電壓增加，瓊脂糖凝膠的有效分離范圍將縮小。要使大于2kb的DNA片段的分辨率達(dá)到最大，所加電壓不得超過5v/cm。（4）離子強(qiáng)度影響。電泳緩沖液的組成及其離子強(qiáng)度影響DNA的電泳遷移率。在沒有離子存在時（如誤用蒸餾水配制凝膠），電導(dǎo)率最小，DNA幾乎不移動；在高離子強(qiáng)度的緩沖液中（如誤加10 x電泳緩沖液），則電導(dǎo)很高并明顯產(chǎn)熱，嚴(yán)重時會引起凝膠熔化或DNA變性。溴化乙啶（Ethidiumbromide,EB）溴化乙淀（EB）是核酸的染色劑，DNA分子中形成熒光結(jié)合物，EB在紫外線照射下的發(fā)射

4、熒光。熒光的強(qiáng)度與DNA的含量成正比,從而可以確定DNA片段在凝膠中的位置及估計出待測樣品的濃度。三、實驗試劑與器材（一）材料電泳儀，電泳槽，樣品梳子、瓊脂糖等（二）試劑及藥品TAE試劑、瓊脂糖、GoldView四、實驗步驟1、瓊脂糖凝膠的制備：稱取lg瓊脂糖，置于三角瓶中，加入100mlTAE緩沖液中，將該三角瓶置于微波爐中加熱使瓊脂糖溶解，冷卻至5060C時，加入5口lGoldView，充分混勻。2、膠板的制備：取有機(jī)玻璃內(nèi)槽，洗凈、晾干。將有機(jī)玻璃內(nèi)槽置于一水平位置模具上，安好擋板。將溫?zé)岘傊侨芤旱谷肽z膜中，使膠液緩慢地展開，直到在整個有機(jī)玻璃板表面形成均勻的膠層。在凝膠槽中放入梳子，

5、注意調(diào)節(jié)好數(shù)字之間的距離。凝膠的厚度在35mm之間。室溫下靜置30min左右，待凝固完全后，輕輕拔出梳子，在膠板上即形成相互隔開的上樣孔。制好膠后將鋪膠的有機(jī)玻璃內(nèi)槽放在含有1XTAE（Tris-乙酸）工作液的電泳槽中使用，沒過膠面1mm以上。3、點樣：用移液槍取5ul待測DNA樣品，與loadingbuffer液混合均勻，小心地加入到凝膠上樣孔中。4、打開電泳儀，插好導(dǎo)線，電壓110V，電泳30min。也可根據(jù)指示染料移動的位置，確定電泳是否終止。5、電泳完成后切斷電泳，取出凝膠，置于紫外透射儀上觀察電泳結(jié)果，并照相記錄。五、實驗結(jié)果12345678910111213141516171819M圖.DNA瓊脂糖凝膠電泳圖圖中，1.泳道代表的是Marker泳道是本組的實驗結(jié)果。六、討論由圖可知，本組D