信息及文獻的基本知識課件

1、醫(yī)學(xué)信息檢索與利用Medical Information Retrieval And Application 2005.2一、信息與信息類型 二、信息檢索技術(shù)及其發(fā)展 三、信息檢索的基本概念及原理 四、信息檢索的基本步驟 一、信息的基本概念信息知識文獻情報信息（information)廣義：信息是指事物存在方式及其運動規(guī)律、特點的外在表現(xiàn)形式，以及信息活動中各種要素的總稱包括了信息本體、與信息有關(guān)的人員、設(shè)備、技術(shù)和資金等各種資源。狹義：信息是指文獻資源或數(shù)據(jù)資源，包括任何媒體中的片段、文章、圖書、情報、觀念等。文獻（literature）：記錄有知識的一切載體情報（information）：

2、解決特定問題所需要的知識信息的主要類型1.按載體類型分： 傳統(tǒng)、電子文獻2.按出版類型分： 圖書、期刊、特種文獻3.按揭示內(nèi)容程度級別分： 一次文獻 二次文獻 三次文獻 零次文獻1.載體分類中的電子文獻 光盤 (全世界近2000種數(shù)據(jù)庫，覆蓋所有學(xué)科） 網(wǎng)絡(luò)（近100種搜索引擎可搜索幾千萬-上億網(wǎng)頁，基于internet檢索系統(tǒng)，各種文本、超媒體、虛擬平臺、網(wǎng)格） 以上兩種為主要存儲和傳輸文獻的載體電子文獻的文件類型 文本型: Txt，DOC ,PDF( Acrobat reader )超文本/超媒體型(hypertext/ multimedia): HTML, XHTML (eXtensib

3、le Hypertext Markup Language) JPG,流媒體視頻點播VOD網(wǎng)格： 21世紀(jì)出現(xiàn)的第三代因特網(wǎng)。即把整個因特網(wǎng)整合成一臺巨大的超級計算機，實現(xiàn)計算、存儲、數(shù)據(jù)、信息、知識、專家資源共享。 地區(qū)性、家庭性、個人網(wǎng)格。2.按學(xué)術(shù)信息資源發(fā)布的類型：圖書：是指一些記錄的知識比較系統(tǒng).成熟的文獻，比如教科書.專著.工具書等。期刊：是指一些記錄的知識比較新穎.所含信息比較大的連續(xù)出版物，一般都有固定的期刊名稱。如：中國科學(xué)、中華醫(yī)學(xué)雜志等。特種文獻：無法歸入圖書或期刊的文獻，比如科技報告，學(xué)位論文，會議文獻、專利文獻等。一次信息源（原始學(xué)術(shù)信息）： 是指原始的創(chuàng)造，首次記錄科

4、研成果，新技術(shù)，新知識，新發(fā)明，新見解。 如期刊論文、學(xué)位論文、科研報告、專利文獻、會議文獻等。 一次文獻示例：前置部分正文參考文獻正文三次信息源在閱讀一次文獻的基礎(chǔ)上，分析綜合歸納信息后，組織形成具有資料性、查考性、閱讀性的文獻（如教科書、綜述、工具書、進展、調(diào)查報告等）綜述(Survey , Review)是指綜合分析和描述一定時間范圍內(nèi)，某一學(xué)科或?qū)I(yè)科研發(fā)展、現(xiàn)狀、并預(yù)測未來的一類文獻。綜述示例：內(nèi)容豐富、結(jié)構(gòu)靈活的綜述文獻現(xiàn)代三次文獻事實數(shù)據(jù)庫二、信息檢索技術(shù)及其發(fā)展 現(xiàn)代信息技術(shù)以計算機技術(shù)、通信技術(shù)和傳感技術(shù)為核心，進行信息輸入、信息存貯、信息輸出、信息傳遞等。脫機檢索聯(lián)機檢索光

5、盤檢索網(wǎng)絡(luò)檢索計算機磁帶數(shù)據(jù)庫終端計算機磁盤、磁帶數(shù)據(jù)庫通訊系統(tǒng)（衛(wèi)星）光盤數(shù)據(jù)庫（單驅(qū)、塔網(wǎng)、鏡像）終端用戶網(wǎng)絡(luò)計算機（聯(lián)機、光盤多媒體、超媒體）數(shù)據(jù)庫 通訊系統(tǒng)終端終端終端（二）檢索技術(shù)的發(fā)展 巴伊贊.耶茨（Ricardo Baeza yates） 2004現(xiàn)代信息檢索書目Table of Contants: 4000年歷史 , 索引Index : 目前仍是現(xiàn)代信息系統(tǒng)的核心現(xiàn)代發(fā)布Modern Issue:引擎、全文檢索、多媒體、跨語種檢索等（采用的技術(shù) 包括 Scanning掃描 , optical character recognized光點識別等）。用戶輸入檢索需求分析轉(zhuǎn)換處理需求

6、數(shù)據(jù)庫概念詞典控制詞表信息源篩選錄入分類索引文檔預(yù)處理 信息檢索的基本原理概念詞相關(guān)匹配運算數(shù)據(jù)庫及其結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫由計算機進行處理的一定數(shù)量同類信息的有序集合，是用來存儲和查找文獻信息的電子化檢索工具。數(shù)據(jù)庫的種類書目數(shù)據(jù)庫 (Bibliographic database)事實數(shù)據(jù)庫 (Fact database)數(shù)值數(shù)據(jù)庫 (Numeric database)全文數(shù)據(jù)庫 (Full text database)超文本/超媒體系統(tǒng)（Hypertext/ Multimedia system)書目數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)文檔 順排文檔（記錄）倒排文檔（索引）記錄(Record)字段(Field)字段舉例TI:

7、New antibiotics miyakamides produced by a fungus.AU: Shiomi,-K; Hatae,-K; Yamaguchi,-Y; SO: J-Antibiot-(Tokyo). 2002 Nov; 55(11): 952-61IS: 0021-8820PY: 2002LA: EnglishAB: New antibiotics MESH: *Antibiotics-biosynthesis; *Aspergillus- flavus-metabolismPT: Journal-Article四、信息檢索步驟分析檢索課題，明確檢索要求選擇檢索工具，確

8、定檢索途徑確定檢索標(biāo)識，確定檢索運算構(gòu)筑檢索提問，獲取初步結(jié)果調(diào)整檢索策略，獲取所需信息1. 科研課題常見信息需求： 數(shù)據(jù)挖掘 發(fā)現(xiàn)知識 之類型查找某概念的確切含義：如“什么是端粒酶” 查找某概念的背景知識如：“誰最先發(fā)現(xiàn)了傳染性蛋白”查找某些事物的數(shù)值及量化指標(biāo):如“2003-2004我國肺癌的發(fā)病率”如“阿司匹林的中毒劑量”查找某一類學(xué)科一般知識：如“有關(guān)分子生物學(xué)有哪些專著”查找學(xué)科專業(yè)領(lǐng)域的新進展:“有關(guān)端粒酶與白血病相關(guān)性研究的綜述文獻”查找專業(yè)課題相關(guān)的研究文獻；“端粒酶在診斷白血病方面的價值評估”特征型知識（事實、數(shù)值類數(shù)據(jù)庫、搜索引擎）關(guān)聯(lián)型知識（文獻數(shù)據(jù)庫）2. 選擇檢索工具

9、：書目、文摘數(shù)據(jù)庫： 廣泛獲取檢索課題相關(guān)的學(xué)術(shù)文獻概況 全文及網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)平臺：檢索重要研究論文或綜述學(xué)術(shù)全文 網(wǎng)絡(luò)檢索引擎、事實、數(shù)值數(shù)據(jù)庫：檢索具體數(shù)值、特征、事實信息（如名詞解釋、統(tǒng)計數(shù)據(jù)等）或廣泛的信息概況 楓林校區(qū)數(shù)據(jù)庫查詢環(huán)境圖書館各閱覽室、院系教研室、宿舍有免費查詢校園網(wǎng)大部分數(shù)據(jù)庫（全文、文摘、網(wǎng)絡(luò)、光盤）的計算機。4樓電子閱覽室有200臺計算機，其中14臺為免費區(qū)，上機不收費，但須辦證才能上機。校外代理服務(wù)器3.確定檢索途徑及檢索標(biāo)識分類檢索：分類名、分類號主題檢索：自由詞、規(guī)范詞著者檢索：姓名刊名：縮寫引文：著者、關(guān)鍵詞機構(gòu)檢索：縮寫與全稱分類檢索瀏覽學(xué)科、專業(yè)信息中圖法中國

10、圖書館分類法 Q 生物學(xué)R 醫(yī)藥衛(wèi)生 R1 預(yù)防醫(yī)學(xué)與衛(wèi)生學(xué) R1 R6 外科學(xué)分類號分類名規(guī)范詞（規(guī)范主題詞subject headings)檢索 系統(tǒng)規(guī)范詞表控制的統(tǒng)一檢索用詞 文章A 著者用詞renal failure 規(guī)范詞：kidney failure 文章B著者用詞kidney failure規(guī)范詞：kidney failure詞表中：renal failure see kidney failure 自由詞檢索 任意詞檢索自由詞著者寫文章時所用的自然詞語, 在title, keyword, abstract,full text中檢索。無系統(tǒng)規(guī)范詞表情況下使用： (計算機，電腦，微機

11、）查最新的文獻時使用： （禽流感）一體化醫(yī)學(xué)語言系統(tǒng)（UMLS）Unified Medical Language System1.元敘詞表：提供95多個生物醫(yī)學(xué)辭典和分類法、詞表，210多萬詞匯。2.語義網(wǎng)絡(luò)：提供語義分類、語義關(guān)系、語義結(jié)構(gòu)等。3.專家辭典：提供不同構(gòu)詞和句法信息應(yīng)用：PubMed, MWS，CliniWeb International機構(gòu)檢索 機構(gòu)檢索以機構(gòu)名稱為檢索詞，來查該機構(gòu)學(xué)者發(fā)表的文獻。常見字段名稱：address，address word，institution，organization?？麢z索刊名檢索檢索指定刊物上發(fā)表的文獻刊名全稱 New England

12、Journal of Medicine刊名縮寫 N Engl J Med引文檢索法引文回溯：是指通過文獻原文后附有的參考文獻（被引用文獻）來查找文獻的一種方法，它有助于研究課題的前期工作基礎(chǔ)、相關(guān)文獻，經(jīng)典著者，重要期刊等。引文檢索：是指通過被引用文獻，來檢索文獻的相互引證關(guān)系的情況，包括：某一著者的文獻被什么人、什么文章引用？引用的頻率？某些期刊被文獻引用的頻率？某些文獻的主題被引用的頻率等。【參考文獻】1.張嗣芳，汪晶瑩，柳秋云，等 干擾素2b 短療程治療98例腎綜合癥出血熱J 中華傳染病雜志，2000, 18: 572.楊為松，黃長形. 腎綜合癥出血熱研究的現(xiàn)狀與未來J 中華傳染病雜志，

13、1996,14:1913.4.王耀宗，徐偉，李莉，等W 腎綜合癥出血熱抗病毒治療的實驗研究JW 中華傳染病雜志，1994,12:69引文回溯例：馮智霖，徐邦強. 干擾素-1b治療腎綜合癥出血熱的臨床療效. 中國臨床藥學(xué)雜志. 2003，12(1)：9-10參考文獻引文檢索從“被引用文獻”（cited paper）檢索到“引用文獻”(citing paper)例：1994年至2003年華羅庚教授的著作被別人引用的情況，并按相關(guān)度排序 最后一頁引文數(shù)據(jù)庫Web of science中國科學(xué)引文數(shù)據(jù)庫全文數(shù)據(jù)庫、文摘數(shù)據(jù)庫中的引文（參考文獻）字段檢索 專業(yè)引文數(shù)據(jù)庫默認檢索 默認檢索又稱 缺省檢索、

14、隱含檢索，在檢索系統(tǒng)預(yù)先設(shè)定的多個字段中進行檢索。 Medline默認在標(biāo)題、著者、出處、文摘、主題詞等字段中檢索。 CBMDisc默認在標(biāo)題、關(guān)鍵詞、主題詞、特征詞、出處、文摘字段中檢索。數(shù)據(jù)庫中的各種檢索方式分類瀏覽 Category browse簡單檢索 Simple search, Basic search高級檢索 advancedDetailedFocus search 專家檢索 Expert search全文數(shù)據(jù)庫檢索方式界面例：確定檢索標(biāo)識課題：序列分析研究工具和方法的相關(guān)文獻檢索標(biāo)識： 序列分析（sequence analysis) 工具（instrument , tool)

15、方法（method, plan, technique, way)4.確定檢索運算符 （operator）布爾算符： and，*（邏輯與） or， +（邏輯或） not，-（邏輯非）位置算符：有near, N, W, adj等形式字段限定符：常用的有 in . =截詞符：*，？布爾算符A B A and BB A or BA B A not B運算次序：not and orA序列分析 and 方法工具 or 方法序列分析 not 綜述布爾算符應(yīng)用舉例 課題：序列分析的工具和方法 序列分析 and (工具 or 方法) sequence analysis and (instrument* or t

16、ool* or method*) 位置算符應(yīng)用舉例序列分析更具體的概念詞檢索：Sequence near3 analysisNear ：檢索詞出現(xiàn)在同一句子中，near3表示兩個檢索詞中間最多允許插2個詞。Sequence Amino Acid Analysis；Sequence Protein Analysis；Sequence DNA Analysis；Sequence Peptide Analysis；Sequence RNA Analysis；字段限定檢索舉例 hepatoma in ti標(biāo)題中檢索smith-b in au著者字段檢索anemia in ti,mesh標(biāo)題或MeSH字

17、段檢索nature in so檢索期刊Nature上的文章review in pt檢索綜述文獻綜述 in pt同上la=english檢索語種為英語的記錄 截詞符檢索舉例 用computer*可檢索到含有以下詞的記錄computerscomputeredcomputerizeComputerization Computer?能多檢索到computers的記錄5.構(gòu)筑檢索提問（式）檢索式又稱檢索提問式，是情報用戶向檢索系統(tǒng)表達文獻需求的句式。 簡單檢索式含一個檢索詞復(fù)合檢索式含有布爾算符和至少兩個檢索詞檢索式舉例：課題1：人類序列分析的方法自由詞檢索：(Sequence near3 analys

18、is) in ti and (method* or tool* or instrument*) and human自由詞檢索限在ti 字段中，可提高提高檢索準(zhǔn)確度規(guī)范詞檢索：Explode sequence analysis / methods , instrumentation in mjme and human Explode 為規(guī)范詞檢索的系統(tǒng)擴展指令，可檢索所有Sequence analysis的下位概念。mjme 為主要規(guī)范詞檢索指令。 methods , instrumentation為副主題詞副主題詞(subheading)：限定規(guī)范主題詞某一方面內(nèi)容的規(guī)范詞:MEDLINE數(shù)據(jù)庫82個：如：診斷：diagnosis, radiography,治療: drug therapy, radiotherapy, surgery病因: etiology, pathology, chemically induced藥物作用： therapeutic use, adverse effects課題腎結(jié)石的手術(shù)治療（renal calculi or kidney calculi or