部分中國鯉科(鲃亞科及野鯪亞科)的DNA條形碼分析

1、部分中國鯉科(鯉亞科及野鰻亞科)的DN粽形碼分析鯉科 (Cyprinidae) 隸屬于硬骨魚綱 (Osteichthyes) 輻鰭亞綱(Actinopterygii) 鯉形目 (Cypriniformes) 鯉亞目 (Cyprinoidei), 廣泛分布于亞歐大陸、日本、東印度群島、非洲以及北美洲 , 在全球淡水捕撈業(yè)及養(yǎng)殖業(yè)中均占著較大比重, 具有可觀的經(jīng)濟價值。 近年內(nèi) , 受環(huán)境污染、 生境破壞和不適當?shù)聂~類資源利用等因素影響 , 中國鯉科魚類面臨著低齡化、個體小型化及種群規(guī)模減少等問題 , 亟待相關(guān)的種質(zhì)資源保護工作的開展。其中 , 作為鯉科的 2 類代表魚類, 鲃亞科 (Barbin

2、ae) 及野鯪亞科(Labeoninae)的部分物種種間形態(tài)相似, 缺乏明顯的分類特征, 其物種鑒定容易發(fā)生錯誤。 為探討中國鲃亞科、 野鯪亞科魚類的分類地位, 本研究測定了采自 13省46種共計 377尾樣本的COI序列并結(jié)合從Genbank數(shù)據(jù)庫下載的6屬8種共計27條序列進行 相關(guān)的DN爍形碼分析,結(jié)果如下。鲃亞科在基于 k2p 模型的鄰接樹上形成31 個明顯分支, 分支間平均遺傳距離(14.20%) 約為分支內(nèi)平均遺傳距離(0.5%) 的 28.40 倍。其中 , 北江光唇魚(Acrossocheilus beijiangensis) 、側(cè)條光唇魚(Acrossocheilus par

3、allens) 、帶光唇魚 (Acrossocheilus cinctus) 、光唇魚 (Acrossocheilus fasciatus) 、溫 州光唇魚 (Acrossocheilus wenchowensis) 、吉首光唇魚(Acrossocheilusjishouensis) 、南方白甲魚(Onychostoma gerlachi) 、細尾白甲魚(Onychostomalepturum) 、白甲魚 (Onychostoma simaum) 、高體白甲魚(Onychostomaalticorpus) 、卵形白甲魚(Onychostoma ovalis) 、云南光唇魚(Acrossoche

4、ilusyunnanensis) 、中華倒刺鲃(Spinibarbus sinensis) 、云南倒刺鲃(Spinibarbus yunnanensis) 、 倒刺鲃 (Spinibarbus denticulatus) 、 鱸鯉 (Percocypris pingi) 、少鱗舟齒魚(Scaphiodonichthys acanthopterus) 、金線鲃 (Sinocyclocheilusgrahami) 、黑脊倒刺鲃(Spinibarbus caldwelli) 、光倒刺鲃(Spinibarbushollandi) 、大鱗四須鲃(Barbodes vernayi) 、細尾長臀鲃(Myst

5、acoleucuslepturus) 、 長臀鲃 (Mystacoleucus marginatus) 、 斑尾小鲃 (Puntius sophore) 、中國結(jié)魚 (Tor sinensis) 、異斑小鲃(Puntius ticto) 、史尼氏小鲃(Puntiussnyderi) 等 27 種魚類均獨立形成單個分支, 支持其分類有效性。其余種類出現(xiàn)混雜分布, 推測長鰭光唇魚 (Acrossocheilus longipinnis) 和虹彩光唇魚(Acrossocheilus iridescens) 屬同種異名 , 細身光唇魚(Acrossocheilus elongatus) 和細長白甲魚(

6、Onychostoma elongatum) 屬同種異名,從Genban椒據(jù)庫下載的后鰭吻孔鯉(Poropuntius opisthopterus) 序列和云南吻孔鲃 (Poropuntius huangchuchieni) 則存在以下可能:1) 屬于同一物種。 2)屬于不同物種，從Genbank下載的疏斑小鯉(Puntius paucimaculatus) 序列 PunpauYunNK能隸屬條紋小鯉(Puntius semifasciolatus) 。此外 , 中國結(jié)魚進一步分成2 組 , 組間的遺傳距離達到 5.50%,高于一般物種的種內(nèi)遺傳距離(2%), 表明其中存在隱藏的多樣性。野鯪亞

7、科在基于 k2p 模型的鄰接樹上形成了 18個明顯分支, 分支間的平均遺傳距離(12.29%) 約為分支內(nèi)平均遺傳距離(0.29%) 的 42.38 倍。其中卷口魚(Ptychidio jordani) 、泉水魚 (Semilabeo prochilus) 、巖鯪(Semilabeo notabilis) 、直口鯪 (Rectoris posehensis) 、巴馬纓魚(Pseudocrossocheilus bamaensis) 、 雙珠盤蒯(Discogobio bismargaritus) 、 長I盤蒯(Discogobio macrophysallidos) 、云南盤蒯(Discogobio yunnanensis)、 洞庭華鯪 (Bangana tungting) 、 華鯪 (Sinilabeo rendahl) 、 紋唇魚 (Osteochilussalsburyi) 、 鯪魚 (Cirrhinus molitorella) 、 條紋墨頭魚(Garra fasciacauda) 、印度墨頭魚(Garra salweenica) 、缺須盆唇魚(Placocheilus cryptonemus) 、東方墨頭魚 (Garra orientalis) 均獨立形成單個分支, 支持其分類有效性。無須墨頭魚 (Garra imberba) 和墨頭魚 (Garra pingi pin