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1、實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀比較表StratageneMx3000PStratageneMx3005PABI,Prism7500ABIStepOne/PlusBio-RadCFX96Eppendorf:2/4ColorSystemsRotorGene6000RocheLightCycler1.5/2.0RocheLC480簡(jiǎn)評(píng)光源石英鹵鎢燈石英鹵鎢燈鹵鎢燈藍(lán)光LED6個(gè)LED96個(gè)藍(lán)光LEDLED1個(gè)LED氙燈石英鹵燈激發(fā)范圍寬廣,光強(qiáng)強(qiáng),非常適合做多通道的定量PCR,LED的激發(fā)光源是冷光源相對(duì)壽命相對(duì)也要長(zhǎng),但是光強(qiáng)度低,光的激發(fā)范圍受限制。通道4通道5通道5通道其中一個(gè)為校正染料通道3通道52/
2、4通道2、4、5、6不等3塊檢測(cè)濾光片/6塊檢測(cè)濾光片五通道多通道是定量PCR發(fā)展的趨勢(shì),現(xiàn)在多通道的熒光定量實(shí)驗(yàn)也越來(lái)越多,主流的是4通道檢測(cè)器PMTPMT冷CCD光電二極管6個(gè)光電二極管1/2個(gè)PMTPMT光電二極管CCD采用CCD檢測(cè)器具有邊緣效應(yīng),做實(shí)驗(yàn)時(shí)必須加入校正染料。采用PMT檢測(cè)器,能將光信號(hào)放大,檢測(cè)靈敏度高,無(wú)需校正染料。發(fā)光二極管的檢測(cè)靈敏度低。濾光系統(tǒng)4個(gè)激發(fā)光濾鏡與4個(gè)發(fā)射光濾鏡5個(gè)激發(fā)光濾鏡與5個(gè)發(fā)射光濾鏡5個(gè)激發(fā)光濾鏡與5個(gè)發(fā)射光濾鏡帶有3個(gè)/4個(gè)檢測(cè)端濾光片6個(gè)激發(fā)與6個(gè)檢測(cè)激發(fā)端沒(méi)有濾光片發(fā)射端有2/4個(gè)濾光片檢測(cè)濾鏡片3個(gè)/6個(gè)發(fā)射光檢測(cè)濾光鏡5個(gè)激發(fā)端濾光
3、片和6個(gè)檢測(cè)斷濾光片激發(fā)光與發(fā)射光的雙重過(guò)濾能排除雜光的影響,從而提高檢測(cè)的準(zhǔn)確性樣品通量96孔96孔96孔48孔/96孔96孔96孔36/72/1003296/38496孔通量高,可以采用多孔板方便操作。激發(fā)光范圍350-750nm350-750nm400-660nm470nm450-730nm470nm365nm/470nm/530nm/585nm/625nm/680nm/460nm470nm430-630nmStratagene擴(kuò)大了光譜的檢測(cè)范圍,從350-750nm。目前市場(chǎng)上所有的熒光探針都適用。優(yōu)化的4通道能減少各通道光譜之間的相互干擾。StratageneMx3000PStra
4、tageneMx3005PABI,Prism7500ABIStepOne/PlusBio-RadCFX96Eppendorf:2/4ColorSystemsRotorGene6000RocheLightCycler1.5/2.0RocheLC480簡(jiǎn)評(píng)檢測(cè)光范圍350-700nm350-700nm500-660nm450-730nm460nm/510nm/555nm/610nm/660nm530,640,705nm/530,560,610,640,670,705nm430-630nmStratagene檢測(cè)光范圍最寬廣可用熒光染料ALEXAFluor350(350nm-440nm),FAM/S
5、YBRGreenI(492nm-516nm),TET(517nm-538nm),HEX/JOE/VIC(535nm-555nm),Cy3(545nm-568nm),TAMRA(556nm-580nm),ROXTM/TexasRed(585nm-610nm),andCy5(635nm-665nm).ALEXAFluor350(350nm-440nm),FAM/SYBRGreenI(492nm-516nm),TET(517nm-538nm),HEX/JOE/VIC(535nm-555nm),Cy3(545nm-568nm),TAMRA(556nm-580nm),ROX/TexasRed(585nm
6、-610nm),andCy5(635nm-665nm).FAM/SYBRGreenI,VIC/JOE,NED/TAMRA/CY,和ROXCY5FAM/SYBRGreen,VIC/JOE,andROX沒(méi)有明確注明可用染料,yrreel可用SYBRGreen,FAM,VIC,TET,HEX,ROX,JOE,TAMRAFAM/SYBRGreenI,TET,HEXVIC/JOE,/TAMRA/CY,TexasRed和ROXCY5FAM/SYB,LC610.LC710(2.0增加HEX,JOE,640,670)rCyan500/Yreen/CrRed610/rRed640/Cy5CyeR/CS/rata
7、gene的可用染料最多,開放性最好CyeCyeStratageneMx3000PStratageneMx3005PABI,Prism7500ABIStepOne/PlusBio-RadCFX96Eppendorf:2/4ColorSystemsRotorGene6000RocheLightCycler1.5/2.0RocheLC480簡(jiǎn)評(píng)檢測(cè)動(dòng)態(tài)范圍10個(gè)10個(gè)9個(gè)9個(gè)9個(gè)910個(gè)9個(gè)10寬廣的動(dòng)態(tài)范圍有利于摸索實(shí)驗(yàn)條件溫度均一性(+/-)0.25(+/-)0.25(+/-)0.5土0.5C0.490.4+/-0.01+/)0.4(+/-)0.35Stratagene改進(jìn)了傳統(tǒng)的模塊加熱方式,
8、使得溫度非常均勻,實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性更好升降溫速度2.5度/秒2.5度/秒樣品:1.6度/秒,模塊:2.5度/秒模塊最高4.6度/秒,樣品快速功能下2.2度/秒、普通功能下1.6度/秒最高5度/秒,平均3.3度/秒鋁質(zhì):升4度/秒,降3度/秒;銀質(zhì):升6度/秒,降4.5度/秒15度/秒0.1-20度/秒升4.8度/秒,降2.5度/秒相比同類型產(chǎn)品,Stratagene的升降溫速度快檢測(cè)靈敏度(準(zhǔn)確性)單拷貝(區(qū)別5000個(gè)拷貝與10000個(gè)拷貝的可信度為99.7%)單拷貝(區(qū)別5000個(gè)拷貝與10000個(gè)拷貝的可信度為99.7%)單拷貝(區(qū)別5000個(gè)拷貝與10000個(gè)拷貝的可信度為99.7%)10
9、拷貝(區(qū)別5000個(gè)拷貝與10000個(gè)拷貝的可信度為99.7%)單個(gè)拷貝的基因組DNA50fMfluorescein單拷貝單拷貝單拷貝升降溫方式Peltier半導(dǎo)體Peltier半導(dǎo)體Peltier半導(dǎo)體Peltier半導(dǎo)體/steponeplus使用VeriFlex技術(shù)分為6個(gè)獨(dú)立控制區(qū)域Peltier半導(dǎo)體Peltier半導(dǎo)體空氣加熱制冷空氣加熱制冷Peltier半導(dǎo)體半導(dǎo)體加熱制冷控溫更加精確??諝饧訜嶂评潆m然快速,但是控溫不精確。StratageneMx3000PStratageneMx3005PABI,Prism7500ABIStepOne/PlusBio-RadCFX96Eppen
10、dorf:2/4ColorSystemsRotorGene6000RocheLightCycler1.5/2.0RocheLC480簡(jiǎn)評(píng)反應(yīng)體積10100uL10100uL20100uL10-30uL150uL5-100ul(通常20ul)20ul-100ul的毛細(xì)管(反應(yīng)體積可最少到5ul)10uL-100uL(96well)and5uL-20uL(384well)PCR反應(yīng)的一般體積都是20-50ul試劑和耗材開放開放(支持FRET)專門為Taqman設(shè)計(jì)ABI專用耗材(0.ImL)低緣管開放36孔可使用0.2ml的單管,其余為專用耗材特制耗材,專用試劑封閉Stratagene試劑和耗材完
11、全開放快速PCR功能與FullVelocity配合使用可以快速至50分鐘完成與FullVelocity配合使用可以快速至50分鐘完成無(wú)有,快速功能40分鐘內(nèi)完成有有本身升降溫速度比較快。反應(yīng)時(shí)間45min1.5不等本身升降溫速度比較快。35個(gè)循環(huán)反應(yīng)20ul要30min,100ul要60min406分鐘之內(nèi)完成40個(gè)PCR循環(huán)快速PCR功能有利于縮短反應(yīng)時(shí)間,提高實(shí)驗(yàn)效率。StratageneMx3000PStratageneMx3005PABI,Prism7500ABIStepOne/PlusBio-RadCFX96Eppendorf:2/4ColorSystemsRotorGene6000
12、RocheLightCycler1.5/2.0RocheLC480簡(jiǎn)評(píng)軟件易用性軟件功能強(qiáng)大,支持絕對(duì)定量分析、基因表達(dá)差異分析、SNP分析等不同應(yīng)用模式、操作非常方便簡(jiǎn)單,界面直觀。軟件功能強(qiáng)大,支持絕對(duì)定量分析、基因表達(dá)差異分析、SNP分析等不同應(yīng)用模式、操作非常方便簡(jiǎn)單,界面直觀。支持激發(fā)光濾光片與發(fā)射光濾光片的單獨(dú)控制,能形成濾光片的錯(cuò)配,從而來(lái)滿足FRET應(yīng)用。軟件操作復(fù)雜、單個(gè)軟件功能薄弱。絕對(duì)定量(標(biāo)準(zhǔn)曲線)、CT進(jìn)行相對(duì)定量分析、基因分型、融解曲線分析標(biāo)準(zhǔn)曲線分析,CT與CT進(jìn)行相對(duì)定量分析,基因分型、讀板實(shí)驗(yàn)。數(shù)據(jù)輸出方便。具有e-mail提醒功能。軟件功能比較強(qiáng)大。Stra
13、tagene定量軟件的操作簡(jiǎn)單,有口皆碑!StratageneMx3000PStratageneMx3005PABI,Prism7500ABIStepOne/PlusBio-RadCFX96Eppendorf:2/4ColorSystemsRotorGene6000RocheLightCycler1.5/2.0RocheLC480簡(jiǎn)評(píng)主體評(píng)價(jià)i開放的系統(tǒng),寬廣的波長(zhǎng)范圍,能采用所有可用的探針染料2孔間溫差小,實(shí)驗(yàn)重復(fù)性好。3.米用PMT檢測(cè),減少激發(fā)光、檢測(cè)光交叉干擾,提高靈敏度4軟件功能強(qiáng)大,但非常簡(jiǎn)單易用5,機(jī)器內(nèi)置芯片能保存數(shù)據(jù),電腦死機(jī)等情況不會(huì)丟失數(shù)據(jù)。6,完全的熒光定量PCR培訓(xùn)項(xiàng)
14、目。7,個(gè)人化的熒光定量PCR儀i開放的系統(tǒng),寬廣的波長(zhǎng)范圍,能采用所有的定量探針染料2孔間溫差小,實(shí)驗(yàn)重復(fù)性好。3.米用PMT檢測(cè),減少激發(fā)光、檢測(cè)光交叉干擾,提高靈敏度4軟件功能強(qiáng)大,但非常簡(jiǎn)單易用5,機(jī)器內(nèi)置芯片能保存數(shù)據(jù),電腦死機(jī)等情況不會(huì)丟失數(shù)據(jù)。6,5通道配置,支持FRET應(yīng)用。7,完全的熒光定量PCR培訓(xùn)項(xiàng)目。8,個(gè)人化的熒光定量PCR儀5通道,能與Taqman探針很好的匹配,軟件使用麻煩,需要校正染料。儀器搬動(dòng)后需要校正光路。有引物探針設(shè)計(jì)軟件,但只能設(shè)計(jì)引物與Taqman探針。有單獨(dú)的相對(duì)定量軟件。目前StepOne系列的光學(xué)系統(tǒng)沒(méi)有詳細(xì)信息。只是知道LED激發(fā)所有的孔。具有梯度和快速功能LED+光電二極管(檢測(cè)靈敏度值得懷疑);逐孔掃描(光源移動(dòng));操作溫度30-100C有梯度功能;采用LED作為光源,光強(qiáng)弱。陣列光源有個(gè)體差異,影響檢測(cè)的重復(fù)性;是普通PCR的升級(jí)產(chǎn)品,穩(wěn)定性有待考查RG6000有5種型號(hào):2Plex,2Plex+HRM,5Plex,5Plex+HRM,6Plex。空氣加熱制冷,升降溫速度快,溫度均一性好。但
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