單晶結(jié)構(gòu)分析用程序進(jìn)行晶體

1、單晶結(jié)構(gòu)分析用程序進(jìn)行晶體第1頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二new open copy archive deleteexit edit edit .res edit .ins edit .cif edit .prp edit .lst copy .res.ins XlXH第2頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二第3頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二一、SHELXTL文件 1. 文件名 一般，同一結(jié)構(gòu)，所有文件都用相同的名（不能超過(guò)個(gè)字符），只是擴(kuò)展名不同 2. 兩個(gè)必要文件(由XPREP程序產(chǎn)生) *.hkl文件: 所有的衍射

2、點(diǎn)，每一點(diǎn)一行。 格式為：h k l F2 (F2) -4 2 -2 21.189 3.050 4 -2 2 19.539 2.120 -4 -2 -2 17.129 2.710 -4 -2 -2 20.459 3.120 .第4頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二*.ins 文件：組成上可分成五部分TITL 041203e in P2(1)/c CELL 0.71073 11.5870 19.3080 17.2144 90.000 108.471 90.000 ZERR 4.00 0.0069 0.0112 0.0102 0.000 0.009 0.000 LATT 1

3、SYMM -X, 0.5+Y, 0.5-Z SFAC C H N O Co S UNIT 108 104 40 20 8 16信息區(qū)SIZE 0.47 0.43 0.35HTAB 2 L.S. 8ACTABOND FMAP 2PLAN 20晶胞參數(shù) X光波長(zhǎng)標(biāo)題空間群?jiǎn)伟蟹肿訑?shù)目晶胞參數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差 晶格類型對(duì)稱操作碼原子類型 單胞中原子數(shù)目命令區(qū)可輸入各種讓XS和XL執(zhí)行的命令 第5頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二DFIX 1.43 0.02 o5 c27 WGHT 0.074900 1.631200 FVAR 0.169240TEMP 25 Co1 5 0.6394

4、36 0.182296 0.778299 11.000000 0.037950 = 0.043120 0.052330 -0.002120 0.007180 -0.002370Co2 5 0.132299 0.088237 0.782543 11.000000 0.061270 = 0.080610 0.082660 -0.004140 0.011300 0.005080N1 3 0.816545 0.181404 0.857527 11.000000 0.048210= 0.044720 0.042580 -0.001460 0.010450 -0.001390N2 3 0.641818 0

5、.098803 0.864065 11.000000 0.055810 = 0.050870 0.070080 0.000700 0.013560 -0.009990.命令區(qū)HKLF 4END原子表坐標(biāo)、占有率、溫度因子衍射點(diǎn)文件類型 文件結(jié)束命令 第6頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二3.其它文件 reslstpltciffcfpcftex xs、xl、refine產(chǎn)生的文件 記錄xs、xl、refine過(guò)程和結(jié)果的文件 XP中做的圖形文件 晶體學(xué)信息文件 結(jié)構(gòu)因子文件 晶體結(jié)構(gòu)報(bào)表文件 記錄儀器型號(hào)、晶體外觀等的文件 4.INS文件的建立和更新 結(jié)構(gòu)解析和精修的過(guò)程，

6、是ins文件建立和不斷更新的過(guò)程，這主要是下列過(guò)程實(shí)現(xiàn)的： xprep、xshellrefine、xl、xp、edit、copy 第7頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二SHELXTL的主要子程序和文件第8頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二二、常用的XS和XL指令 指 令含 義ACTA產(chǎn)生cif文件AFIX將原子坐標(biāo)強(qiáng)制性地固定在指定位置上，或在指定位置上產(chǎn)生原子ANIS將各向同性換成各向異性精修BOND計(jì)算鍵長(zhǎng)、鍵角(加$H包括H的鍵長(zhǎng)、鍵角)BIND計(jì)算指定原子對(duì)的鍵長(zhǎng)、鍵角CONF計(jì)算扭轉(zhuǎn)角DELU限制指定原子具有相似的位移參數(shù)DFIX限定指定原

7、子對(duì)間的距離EADP給兩個(gè)或多個(gè)原子指定相同的位移參數(shù)第9頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二指 令含 義END指令輸入結(jié)束EQIV提供分子內(nèi)或分子間鍵合原子的對(duì)稱操作碼ESEL限制E值的下、上限EXTI對(duì)晶體消光效應(yīng)參數(shù)進(jìn)行精修EXYZ讓兩個(gè)或多個(gè)原子具有相同的坐標(biāo)FLAT限制指定原子在相同的平面上FMAP所計(jì)算Fourier圖的類型FREE不計(jì)算指定原子對(duì)的鍵長(zhǎng)、鍵角FVAR全比例系數(shù)HFIX限制H原子在理想位置上HKLF衍射數(shù)據(jù)的格式HTAB計(jì)算氫鍵第10頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二指 令含 義ISOR限制指定原子的位移參數(shù)類似于各向同性L

8、.S.指定XL中用最小二乘法進(jìn)行精修的輪數(shù)LATT晶格的類型.依次為:P I R F A B C,無(wú)心為負(fù)值MOVE移動(dòng)或轉(zhuǎn)換坐標(biāo)MPLA計(jì)算平面OMIT忽略指定的衍射點(diǎn)或限定theta角范圍PART劃分成鍵原子的范圍（用于無(wú)序結(jié)構(gòu)）PLAN計(jì)算和列出Q峰的數(shù)目SFAC晶體中存在的原子的種類SIMU限制指定范圍內(nèi)的原子有相同的位移參數(shù)SIZE晶體的大小 第11頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二指 令含 義SYMM所屬空間群的對(duì)稱操作TEMP衍射數(shù)據(jù)收集的溫度TITL樣品的編號(hào)（或名稱）和空間群UNIT晶胞中每種原子的總個(gè)數(shù)WGHT指定所用權(quán)重ZERR晶胞中分子個(gè)數(shù)和晶胞參

9、數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差三、 SHELXTL結(jié)構(gòu)分析的步驟 1.項(xiàng)目的設(shè)立 打開(kāi)SHELXTL程序：點(diǎn)project new，輸入文件名，查找到hkl 文件并打開(kāi)第12頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二第13頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二第14頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二2. 結(jié)構(gòu)的解析1) 結(jié)構(gòu)解析的基本原理 XS用直接法或Patterson法解決相角問(wèn)題，試驗(yàn)性找出部分原子或重原子的位置（坐標(biāo)） * 所謂直接法（direct methods），就是運(yùn)用數(shù)學(xué)的方法，利用不同衍射點(diǎn)的關(guān)系，從大量強(qiáng)度數(shù)據(jù)中，直接找出各個(gè)衍射點(diǎn)的相角

10、，從而達(dá)到解析晶體結(jié)構(gòu)的目的。其過(guò)程概括如下： a 將|Fo|轉(zhuǎn)化為歸一化結(jié)構(gòu)因子|Eo| b 建立可以利用正切公式的三相角及四相角關(guān)系 c 賦于起始相角 d 利用正切公式精修相角 第15頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二e 計(jì)算診斷指標(biāo)，判斷各套相角的質(zhì)量 f 采用診斷指標(biāo)最佳的相角數(shù)據(jù)計(jì)算解析電子密度圖，即E圖 * Patterson法是其本人1934年提出，通常只用來(lái)解析含有重原子的結(jié)構(gòu) 用這種方法時(shí)，首先利用重原子的特征峰，即Harker峰，求出重原子坐標(biāo)，再通過(guò)Fourier合成獲得其它原子的坐標(biāo) Harker峰，或Harker截面，就是同一套等效的原子組成的P

11、atterson峰，由于平方效應(yīng)，重原子的Harker峰會(huì)顯得十分突出，尋找起來(lái)一般比較容易。因此，可以輕松地從分析重原子的Harker峰，得到重原子的坐標(biāo) 第16頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二2) 用XS和XSHELL程序定出結(jié)構(gòu)雛形（初始套） 一般先試直接法，再試Pattson法，用什么方法是通過(guò)改變Edit .ins文件中的指令來(lái)實(shí)現(xiàn)的直接法：TITL 020908b in C2/c CELL 0.710730 30.1927 8.5175 13.9108 90.0000 95.1300 90.0000 ZERR 8.00 0.0146 0.0042 0.007

12、1 0.0000 0.0100 0.0000LATT 7 SYMM -X, Y, 0.5-Z SFAC C H N O Cr UNIT 144 112 24 56 8TEMP 25TREFHKLF 4END第17頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Patterson法：TITL 020908b in C2/c CELL 0.710730 30.1927 8.5175 13.9108 90.0000 95.1300 90.0000 ZERR 8.00 0.0146 0.0042 0.0071 0.0000 0.0100 0.0000LATT 7 SYMM -X, Y, 0.5

13、-Z SFAC C H N O Cr UNIT 144 112 24 56 8TEMP 25PATTHKLF 4END第18頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二繼續(xù)嘗試直接法：TITL 020908b in C2/c CELL 0.710730 30.1927 8.5175 13.9108 90.0000 95.1300 90.0000 ZERR 8.00 0.0146 0.0042 0.0071 0.0000 0.0100 0.0000LATT 7 SYMM -X, Y, 0.5-Z SFAC C H N O Cr UNIT 144 112 24 56 8TEMP 25E

14、SEL 1.5 3.5TREFHKLF 4END歸一化結(jié)構(gòu)因子E的 下、上限值，可試探性設(shè)置 設(shè)置好ins文件 ，點(diǎn)擊XS，就可自動(dòng)進(jìn)行計(jì)算第19頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二XS計(jì)算結(jié)果的評(píng)估 # 直接法，RE越小越好，一般大于0.3，就預(yù)示著不成功第20頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 # 打開(kāi)Xshell，檢查計(jì)算出的原子或（Q) 峰位置是否構(gòu)成合理的化學(xué)結(jié)構(gòu)第21頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二第22頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二第23頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星

15、期二第24頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 # 精修（refint）一次后，R1值是否大小于0.5；或繼續(xù)精修R1值是否很快降低第25頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二第26頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二第27頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 * 如果得到的原子或峰的位置能夠構(gòu)成合理的化學(xué)結(jié)構(gòu)，就要通過(guò)刪除不合理的原子或（Q）峰，并把Q 峰選擇后定為相應(yīng)的原子。操作方法是：選擇原子或（Q）峰的方法： a 光標(biāo)指在欲選擇位置，點(diǎn)S 鍵?？梢来芜x擇所有的要選擇的原子或Q 峰 c 用Select菜單（或背

16、景右手鍵點(diǎn)“Select”）可選擇部分和所有的原子或Q 峰，順序與原順序相同 b 光標(biāo)指在欲選擇位置，右手鍵點(diǎn)“Select”，可依次選擇原子 d 按住“Shift”鍵，左手鍵拖出一個(gè)選擇框并同時(shí)輕開(kāi)，可選擇一個(gè)或多個(gè)原子第28頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二刪除原子或（Q）峰的方法： a 光標(biāo)指在欲刪除位置（原子或鍵） ，點(diǎn)K 鍵 b 光標(biāo)指在欲刪除位置，右手鍵點(diǎn)Bonds and Angles，再在對(duì)話框中點(diǎn)“Delete” e 點(diǎn)refine菜單，系統(tǒng)會(huì)提示有Q 峰沒(méi)命名，并選擇所有Q 峰，順序與原來(lái)順序相同e 在ins文件刪除 c 光標(biāo)指在欲刪除位置，右手鍵點(diǎn)“

17、Delete” d 先選擇，再點(diǎn)Select菜單中的Kill selected第29頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 恢復(fù)刪錯(cuò)的原子或（Q）峰的方法： a 先選擇，再用Lablels菜單中的Group label 命名（標(biāo)記）原子或（Q）峰的方法： 點(diǎn)“EditRestore Killed Atom”，先選擇要恢復(fù)的原子（或Q峰），再點(diǎn)“Restore” b 光標(biāo)指在要命名的位置，用右手鍵的Edit c 光標(biāo)指在欲命名位置，右手鍵點(diǎn)Bonds and Angles，再在對(duì)話框中點(diǎn)“Rename”第30頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 * 如果仍得

18、不到較為合理的初始結(jié)構(gòu)，則應(yīng)試驗(yàn)用三種方法中的另一法，或試驗(yàn)用不同的ESEL值 * 如果試驗(yàn)用各種方法，仍不行，那就要考慮是不是出現(xiàn)了如下的問(wèn)題：常用 的小技巧： a 解析和精修結(jié)構(gòu) 的初期，可把C、O、N都定為C b 如果獨(dú)立單元中分子較多，可光標(biāo)指在 一個(gè)分子中的某一原子上，再用右手鍵菜單中的UNIQ指令把其分離出來(lái)處理 c 如果獨(dú)立單元只是分子的一部分，原子不好取舍，可用右手鍵菜單中的GROW指令把分子長(zhǎng)全處理第31頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二結(jié)構(gòu)的解析中的若干問(wèn)題A 晶胞的錯(cuò)誤確定 用CCD探測(cè)器，儀器可以自動(dòng)確定晶胞（分別在matrix、sadabs和xp

19、rep中），但有時(shí)會(huì)不正確，因而晶系和空間群會(huì)因之錯(cuò)誤 解決方法：在xprep中重新確定晶胞；實(shí)在不行，需用收集數(shù)據(jù)重新做晶胞B 空間群的錯(cuò)誤指認(rèn) 主要的三種情況： a 晶胞的錯(cuò)誤確定引起的 b 儀器只根據(jù)Rint和CFOM（診斷因子）值 來(lái)確定，有時(shí)會(huì)降低晶體的對(duì)稱性 第32頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二c 由系統(tǒng)消光規(guī)律的錯(cuò)誤判斷引起 解決方法：在xprep中重新確定空間群；重新做晶胞* XPREP的主要功能和應(yīng)用單擊進(jìn)入XPREP程序根據(jù)程序的提示輸入晶胞參數(shù)選擇可能的晶格程序則顯示以下菜單：D Read,Modify or Merge DATDSETSP Co

20、ntour PATTERSON SecionsH Search for HIGHER mertric symmetryS Determine or input SPACE GROUP讀入、更改、合并衍射數(shù)據(jù)計(jì)算顯示Patterson截面尋找更高的對(duì)稱性確定或輸入已知的空間群第33頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二A Apply ABSORPTION correctionsM Test for MEROHEDRAL TWINNINGL Reset LATTICE type of Original CellC Define unit-cell CONTENTSF Setup

21、SHELXTL FILESR RECIPROCAL Space DisplaysU UNIT-CELL transformationsT Change TOLERANCESO Self-rotaion functionQ Quit Program吸收校正重設(shè)原始晶胞的晶格類型孿晶缺面試驗(yàn)定義單胞的化學(xué)組成建立計(jì)算指令文件顯示倒易空間轉(zhuǎn)換晶胞改變一些變量的容忍值自旋函數(shù)退出程序第34頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二第35頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Select option H： 程序顯示目前的晶胞參數(shù)和其它的可能選擇，可認(rèn)同程序的選擇，但有時(shí)

22、需自行選擇第36頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Select option A： 認(rèn)同程序的選擇后，程序會(huì)提示下一選項(xiàng)S第37頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Select option S：可直接輸入已知空間群，也可測(cè)定第38頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Select option S：則還要進(jìn)一步選擇晶系第39頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Select option M：Select option P： 進(jìn)一步選擇晶格類型第40頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 程序顯示

23、目前的空間群和其它的可能選擇，可認(rèn)同程序的選擇，但有時(shí)需自行選擇第41頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 認(rèn)同程序的選擇后，程序會(huì)提示下一選項(xiàng)DSelect option A：第42頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Select option D：程序讓顯示統(tǒng)計(jì)強(qiáng)度的選項(xiàng)S程序讓顯示合并等效點(diǎn)的選項(xiàng)ASelect option S：第43頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Select option A： 程序顯示出退出主菜單的選項(xiàng)E第44頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Select option E： 認(rèn)

24、同程序的選擇后，程序會(huì)提示下一個(gè)定義單胞的化學(xué)組成選項(xiàng)C第45頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Select option C： 認(rèn)同原有的或更改或重新輸入后，程序又顯示出退出主菜單的選項(xiàng)E第46頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Select option E： 認(rèn)同程序的選擇后，程序會(huì)提示下一個(gè)建立SHELXTL計(jì)算指令文件選項(xiàng)F第47頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Select option F：第48頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 認(rèn)同程序的選擇后，程序會(huì)提示輸入文件名，輸入并回車后，程序會(huì)問(wèn)是

25、否寫hkl文件，同意后，程序又提示下一個(gè)選項(xiàng)Q文件名，可任意取第49頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Select option Q：D第50頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二程序又顯示出退出主菜單的選項(xiàng)ESelect option E：H第51頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 輸入0.84以使為25程序又顯示出退出主菜單的選項(xiàng)E這里也可不限制，解或精修結(jié)構(gòu)時(shí)用OMIT指令限制第52頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Select option E：W 再輸入文件名后，兩個(gè)回車后又顯示如下選項(xiàng)：應(yīng)與前面的文

26、件名相同！第53頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Select option E：M 便 會(huì)顯示如下選項(xiàng)第54頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二Select option A：I 就可一直回車選項(xiàng)退出XPREP程序第55頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二C 嚴(yán)重給錯(cuò)分子式 不同的原子對(duì)X-射線散射能力不同，如果給錯(cuò)了分子式 ，尤其是重原子錯(cuò)，一般都 會(huì)導(dǎo)致解析不了結(jié)構(gòu)（需仔細(xì)核實(shí)分子式）D 贗對(duì)稱結(jié)構(gòu) 就是晶體結(jié)構(gòu)中含有某些較重的原子，它們處于特殊位置時(shí)，使得自身的對(duì)稱性高于輕原子及整體的對(duì)稱性（如具有額外的平移和中心對(duì)稱性），

27、這時(shí)就會(huì)造成在電子密度圖上輕原子的多解，即輕原子除了在正確位置出現(xiàn)個(gè)，還在一個(gè)或多個(gè)錯(cuò)誤位置出現(xiàn)（要仔細(xì)的重解，仔細(xì)地確定原子） 第56頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二E 衍射數(shù)據(jù)質(zhì)量差 在沒(méi)有以上錯(cuò)誤，仍解不出結(jié)構(gòu)時(shí)，可能是數(shù)據(jù)質(zhì)量太差,是由以下原因造成的： 其一、衍射強(qiáng)度數(shù)據(jù)太弱；數(shù)據(jù)還原程序統(tǒng)計(jì)得到的平均信噪比I/(I)太小,而解結(jié)構(gòu)程序統(tǒng)計(jì)的平均信噪比的參數(shù)Rsigma太大 其二、吸收校正沒(méi)做好，所有等效點(diǎn)的平均差別Rint較大 解決方法：重新培養(yǎng)較大的單晶；重收數(shù)據(jù)解決方法：重新用其它方法做吸收校正 如果沒(méi)有以上問(wèn)題，還是解不出結(jié)構(gòu)，還可試用先將有心改為無(wú)心空

28、間群的方法，解出初始結(jié)構(gòu)，再轉(zhuǎn)換成有心空間群第57頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二3. 結(jié)構(gòu)精修的基本過(guò)程 在得到初始結(jié)構(gòu)后，所有的Refine（或XL）計(jì)算都 是由計(jì)算機(jī)完成的，對(duì)于非晶體學(xué)專家，該過(guò)程有如：“暗箱操作”，但差值Fourier電子云密度圖的分析和結(jié)構(gòu)模型的逐步完善必須人工參與完成A 讀入晶胞參數(shù)、空間群、分子式、衍射數(shù)據(jù)等B 程序利用已知的部分原子的坐標(biāo)和種類，計(jì)算 出結(jié)構(gòu)的部分正確的相角C 程序結(jié)合計(jì)算出結(jié)構(gòu)的的部分正確的相角和測(cè) 的衍射強(qiáng)度，模擬出“觀察”到的電子云密度圖D 程序把已經(jīng)確認(rèn)的原子從“觀察”到的電子云密 度中扣除，計(jì)算出差值Fouri

29、er電子云密度圖第58頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二E 在差值Fourier圖中，找出分子中其它原子的位置F 程序根據(jù)衍射強(qiáng)度，對(duì)原子坐標(biāo)和位移參數(shù)等結(jié) 構(gòu)參數(shù)進(jìn)行精修G 重復(fù)CF步驟至分子中所有原子都被指認(rèn)、精修 收斂* 結(jié)構(gòu)精修的典型步驟 A 在XSHELL中用Refine精修各向同性的非氫原子 定出基本正確的結(jié)構(gòu)模型后，在前幾輪精修（各向同性）中，可以通過(guò)檢查R1和U值，來(lái)檢查原子確定的是否正確，并逐步指認(rèn)出非氫原子 R1應(yīng)小于0.4（wR2為0.50.7），越小越好U應(yīng)在0.1以下 第59頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二第60頁(yè)，共98

30、頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二第61頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 如果在精修過(guò)程中，U值急劇增大，說(shuō)明該原子并非存在 如果U偏大，該位置可能是一個(gè)更輕的原子 如果U偏小，則可能是一個(gè)更重的原子 還要注意殘余峰的大小，如果其大于1就應(yīng)考慮是不是還有未發(fā)現(xiàn)的非氫原子 在Refine中選擇Aniso則可進(jìn)行各向異性精修(也可在Edit.ins文件中加ANIS指令,用XL進(jìn)行),這樣可更確切地表達(dá)電子云的真實(shí)分布情況，所以R1值會(huì)明顯下降 B 對(duì)所有的非氫原子進(jìn)行各向異性精修 這時(shí)如果是非中心對(duì)稱的空間群，應(yīng)檢查Flack參數(shù)是否接近于0，否則要進(jìn)行絕對(duì)構(gòu)型

31、轉(zhuǎn)換，指令：MOVE 1 1 1 -1第62頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二第63頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 對(duì)于具有確定立體結(jié)構(gòu)的有機(jī)基團(tuán)，可采用理論加氫；對(duì)于無(wú)法理論加氫的，如水分子，可從差值Fourier圖中找出氫原子，參加精修的情況視 數(shù)據(jù)的質(zhì)量而定 C 計(jì)算/指認(rèn)并精修氫原子理論加氫的方法退出XSHELL，在Edit-.ins文件的命令區(qū)，添加指令：HFIX mn 需加氫原子名（產(chǎn)生AFIX固定）m 是一或兩位數(shù)，指定氫的類型： =1 叔-H， =2 仲-H， =3（或13） 伯-H， =4 芳-H， =8（或14） X-O-H，

32、 =9 X=CH2或X-NH2， =15 籠狀B-H第64頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二n 是一位數(shù)，指定固定的類型： =1 坐標(biāo)、占有率、位移因子固定， =2 占有率、位移因子固定， =3（或7） 坐標(biāo)固定， =4 同3，但允許修正X-H的鍵長(zhǎng)（方向固定）然后進(jìn)行XL精修，完成后進(jìn)入XSHELL繼續(xù)精修 也可在XSHELL中先點(diǎn)Atoms-Hybridize All 再點(diǎn)Atoms-Calculate Hydrogens 然后檢查H加的是否合理，如不合理，可打開(kāi)Edit-Edit Current File修改不合理的部分，再用Refine繼續(xù)精修 還可在XSHELL

33、中先選擇同類原子，再用Select Atoms Set HFIX分別進(jìn)行加氫第65頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二D 進(jìn)一步精修更多的晶體學(xué)參數(shù)先在ins文件中寫入要精修的參數(shù)指令，再進(jìn)行精修例如：SIZE 0.38 0.32 0.24HTAB 2CONFCONF X1 X2 X3 X4BOND $HBIND X1 X2 X3 X4_$1MPLA n X1 X8EQIV $1 X-1,Y+1/2,-ZOMIT 1 -2 4輸入晶體的尺寸計(jì)算氫鍵并寫入lst文件計(jì)算所有的扭轉(zhuǎn)角計(jì)算這四個(gè)原子間的扭轉(zhuǎn)角加上$H，可計(jì)算包括H在內(nèi)的各種健長(zhǎng)和鍵角計(jì)算輸入的原子對(duì)的健長(zhǎng)和鍵角計(jì)

34、算輸入的前n個(gè)原子的平面，并給出所有輸入原子偏離該平面的距離，還能給出與前一個(gè)平面間的夾角提供所鍵合原子的對(duì)稱操作碼MOVE xi yi zi刪除h、k、l 分別為1、-2、4的壞點(diǎn)移動(dòng)坐標(biāo)EXTI x精修消光效應(yīng)，x 是程序自動(dòng)產(chǎn)生的這些計(jì)算一般在作數(shù)據(jù)表時(shí)進(jìn)行 OMIT -2 50.02限制sigam和2theta第66頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二找出對(duì)稱操作碼的方法： 而用ENVI命令會(huì)得到有關(guān)的用四位數(shù)字表示的對(duì)稱操作碼(如：2746、 3654、 4545等)，可表示為：SXYZ 其中，S為對(duì)稱操作序號(hào)， 如S=2(等價(jià)于2555)，就是-x，-y，0.5

35、+z；X-5、 Y-5、 Z-5則代表x、y、z三個(gè)軸向在555(即-x，-y，0.5+z)基礎(chǔ)上的位移量 在XP中采用SYMM命令，此時(shí)會(huì)給出所有的對(duì)稱操作碼及序列號(hào)，如對(duì)于某晶系為：1555.= +x, +y, +z 2555.=-x, -y, 0.5+z3555.=0.5+x, 0.5-y, z 4555.=0.5-x, 0.5+y, 0.5+z如：2746的對(duì)稱操作為：2-x，-1-y，1.5+z 3654的對(duì)稱操作為：1.5+x，0.5-y，-1+z 4545的對(duì)稱操作為：0.5-x，-0.5+y，0.5+z第67頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二第68頁(yè)，共9

36、8頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二TITL 020908a in C2/cL.S. 8ACTABOND $HFMAP 2PLAN 20mpla 7 n1 c2 c6 c1 o1 co1mpla n1 c2 c6size 0.28 0.25 0.18eqiv $1 x, -y, z-1/2htab O7 O5_$1htab O7 O4htab 2exti 0.00023conf c8 n2 n3 c14bind c1 c10_$1dfix 0.88 0.02 o7 h13 o7 h14實(shí)例：第69頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二（指精修結(jié)果收斂）E 收斂 即

37、精修到原子坐標(biāo)、位移參數(shù)、占有率等參數(shù)至目標(biāo)值范圍內(nèi) 被精修的參數(shù)的最大絕對(duì)漂移(maximum absolute value of the shift)的值不再變化，并且在0.01（甚至0.001）以下 平均漂移值(Mean shift)幾乎為零 一套好的數(shù)據(jù)精修出正確結(jié)構(gòu)之后，wR20.15，R10.05。 GOOF值接近于1（可通過(guò)調(diào)整WGHT值來(lái)實(shí)現(xiàn)） 如果精修很難收斂，或某些參數(shù)不好，可用刪除一些壞點(diǎn)的方法來(lái)解決。第70頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二第71頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二第72頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)

38、24分，星期二刪除壞點(diǎn)的方法： 每次精修完后，程序都 會(huì)自動(dòng)產(chǎn)生50個(gè)壞點(diǎn)，寫在lst文件中，查到后可把它們的h、k、l 值加上OMIT指令寫在ins文件中，繼續(xù)精修即可，如：Most Disagreeable Reflections (* if suppressed or used for Rfree) h k l Fo2 Fc2 Delta(F2)/esd Fc/Fc(max) Resolution(A) 0 3 4 69.18 13.30 5.03 0.013 2.36 1 0 1 22003.93 25827.84 4.65 0.580 11.57 -4 3 3 195.94 122.

39、96 4.31 0.040 2.16 -6 4 6 -1.27 60.32 4.31 0.028 1.48 -16 5 2 -31.82 514.28 3.99 0.082 0.85 -2 4 14 0.16 81.20 3.68 0.033 1.12 2 0 0 2576.75 2229.44 3.67 0.171 7.93 -8 3 11 755.49 954.47 3.64 0.112 1.22.lst第73頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二TITL 040518b in P2(1)/n .SFAC C H N S Sn Cl UNIT 80 92 8 8 4 12

40、 omit 0 3 4 omit 1 0 1omit -4 3 3omit -6 4 6omit -16 5 2L.S. 8EXTI 0.00224ACTABOND FMAP 2PLAN 20WGHT 0.028000 1.235100 FVAR 0.412890.ins第74頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二A 受限制的精修 在一些結(jié)構(gòu)中，個(gè)別獨(dú)立的原子給不出化學(xué)上合理的鍵長(zhǎng)和鍵角。由于它們平均分布在整個(gè)分子中，有明顯的相關(guān)性，因此有關(guān)參數(shù)不能獨(dú)立修正 須進(jìn)行“強(qiáng)制性精修（constrained refinement)”和“限制性精修(restrained refine

41、ment)”，方法有：* 強(qiáng)制性精修（固定）不同原子在同一位置的固定 * 結(jié)構(gòu)精修技巧 第75頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二TEMP 25EADP N1 O1EXYZ N1 O1WGHT 0.000000FVAR 0.09096 0.5CR1 5 0.113174 0.216284 0.628141 11.00 0.03132 0.04649 = 0.03455 0.00095 0.00183 0.00118N1 3 0.118366 0.241830 0.483154 21.00 0.02696 0.03867 = 0.03287 -0.00084 0.00065

42、0.00346O1 4 0.118366 0.241830 0.483154 -21.00 0.02696 0.03867 = 0.03287 -0.00084 0.00065 0.00346N2 3 0.168039 0.075553 0.657411 11.00 0.02977 0.04142 = 0.03256 -0.00586 0.00380 0.00086第76頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二剛性基團(tuán)的固定 C5 1 0.783982 0.389310 0.472723 11.00 0.056310AFIX 66C6 1 0.670845 0.385330 0

43、.475554 11.00 0.037930C7 1 0.623140 0.384059 0.522099 11.00 0.038030C8 1 0.132871 0.107389 0.616281 11.00 0.070930C9 1 0.187310 0.112700 0.566092 11.00 0.052710C10 1 0.301438 0.113657 0.561510 11.00 0.036590C11 1 0.350699 0.112192 0.515138 11.00 0.035930AFIX 0C12 1 0.284100 0.110708 0.472513 11.00 0

44、.043900苯環(huán)的固定第77頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二茂環(huán)的固定C5 1 0.783982 0.389310 0.472723 11.000000 0.056310AFIX 59C6 1 0.670845 0.385330 0.475554 11.000000 0.037930C7 1 0.623140 0.384059 0.522099 11.000000 0.038030C8 1 0 0 0 11 0.05C9 1 0 0 0 11 0.05C10 1 0.301438 0.113657 0.561510 11.000000 0.036590AFIX 0C1

45、1 1 0.350699 0.112192 0.515138 11.000000 0.035930C12 1 0.284100 0.110708 0.472513 11.000000 0.043900 以上剛性基團(tuán)的固定，通常在精修收斂后，就撒去，并繼續(xù)精修至收斂，以產(chǎn)生標(biāo)準(zhǔn)偏差，必要時(shí)需再用限定（dfix） 第78頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二C1 1 0.697009 0.863049 0.286498 11.00 0.09392 0.11666 = 0.06085 -0.01849 0.03812 -0.03708AFIX 23H1C 2 0.689245 0.

46、825673 0.259836 11.00000 -1.20000H1D 2 0.764920 0.886884 0.289928 11.00000 -1.20000AFIX 0C2 1 0.626282 0.947919 0.285436 11.00 0.07319 0.12011 = 0.05684 0.02597 -0.01000 -0.02830AFIX 23H2C 2 0.642567 0.994865 0.263310 11.00000 -1.20000H2D 2 0.558899 0.924628 0.279065 11.00000 -1.20000AFIX 0H的固定(由HFI

47、X mn C1 C2指令產(chǎn)生)第79頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二限制性精修 FMAP 2PLAN 20dfix 0.85 0.02 o1 h1 o1 h2 o2 h3 o2 h4 o3 h5 o3 h6dfix 1.38 0.02 h1 h2 h3 h4 h5 h6 h7 h8TEMP 25鍵長(zhǎng)的限制鍵長(zhǎng)估計(jì)標(biāo)準(zhǔn)偏差同類鍵鍵長(zhǎng)相近的限制FMAP 2PLAN 20SADI 0.02 o1 h1 o1 h2 o2 h3 o2 h4 o3 h5 o3 h6SADI 0.02 h1 h2 h3 h4 h5 h6 h7 h8TEMP 25估計(jì)標(biāo)準(zhǔn)偏差第80頁(yè)，共98頁(yè)，202

48、2年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二限制指定原子具有相近的位移參數(shù)PLAN 20LIST 4DELU 0.02 0.01 c2 c3 c4 c5 c6 c7 c8 c9 c10 WGHT 0.083400 0.000000 估計(jì)標(biāo)準(zhǔn)偏差共平面限制PLAN 20LIST 4FLAT 0.1 c11 c12 c13 c14 c15 WGHT 0.083400 0.000000 估計(jì)標(biāo)準(zhǔn)偏差至少四個(gè)原子或PLAN 20LIST 4SIMU 0.04 0.08 1.7 c2 c3 c4 c5 c6 c7 c8 c9 c10 WGHT 0.083400 0.000000 估計(jì)標(biāo)準(zhǔn)偏差原子間的最大距離第8

49、1頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二B 阻尼控制 當(dāng)結(jié)構(gòu)難以進(jìn)行最小二乘精修，特別是當(dāng)結(jié)構(gòu)模型明顯偏離最優(yōu)化結(jié)構(gòu)時(shí)，易發(fā)生精修參數(shù)的大幅度移動(dòng)(shift)，造成最小二乘精修不收斂 可用阻尼因子加以控制。在SHELXL中，可賦予阻尼參數(shù)DAMP一個(gè)2002000之間的數(shù)值 限制各向異性位移參數(shù)具有類似各向同性位移參數(shù)的性質(zhì)PLAN 20LIST 4ISOR 0.01 c3 c4 c13 c14 WGHT 0.083400 0.000000 估計(jì)標(biāo)準(zhǔn)偏差第82頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二C 對(duì)稱性限制 如果某些原子處于特殊位置，如對(duì)稱中心、面、軸

50、上時(shí)，原子坐標(biāo)和各向位移參數(shù)不能被精修。需進(jìn)行對(duì)稱性限制 現(xiàn)在很多程序已經(jīng)能自動(dòng)對(duì)特殊位置的原子坐標(biāo)和各向異性參數(shù)自動(dòng)進(jìn)行限制 D 殘余電子密度 殘余峰如果大于1應(yīng)考慮是不是還有未發(fā)現(xiàn)的非氫原子 ；距重原子（原子序數(shù)為Z）較近(1.2A)的峰和谷，允許更大的值（0.1Z）第83頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二* 結(jié)構(gòu)精修中的若干問(wèn)題 在晶體結(jié)構(gòu)精修的過(guò)程中，涉及晶體學(xué)理論及一些計(jì)算數(shù)學(xué)的理論和技術(shù)，與簡(jiǎn)單的數(shù)據(jù)擬合相比，具有變量多，計(jì)算量大等特點(diǎn)，特別是晶體結(jié)構(gòu)精修參與的參數(shù)種類和數(shù)量會(huì)因晶體不同而不同，結(jié)構(gòu)精修結(jié)果的好壞又牽涉到對(duì)晶體學(xué)理論和方法的理解 A 原子的錯(cuò)誤

51、指認(rèn) 一個(gè)原子對(duì)X射線的散射能力（即散射因子fi）大致正比于其原子序數(shù)。這意味著如果嚴(yán)重給錯(cuò)分子式可能導(dǎo)致無(wú)法解出結(jié)構(gòu) 但原子序數(shù)相鄰的原子對(duì)X射線的散射能力稍有不同，指認(rèn)錯(cuò)誤并不會(huì)明顯影響解析過(guò)程，因此，在進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析前最好有準(zhǔn)確的元素分析、NMR、IR等數(shù)據(jù)，以便正確指認(rèn)原子 第84頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 數(shù)據(jù)質(zhì)量好，指認(rèn)正確，可較明顯的降低R值。但數(shù)據(jù)質(zhì)量差時(shí)，就很難根據(jù)R的變化來(lái)指認(rèn)原子 對(duì)于金屬原子的指認(rèn)，難度會(huì)更大一些，一般來(lái)說(shuō)只有知道晶體中確實(shí)的金屬種類，才能正確指認(rèn)B 原子位移參數(shù) 不合理的原子位移參數(shù)的出現(xiàn)，經(jīng)常是結(jié)構(gòu)模型錯(cuò)誤的一個(gè)信號(hào)，對(duì)判

52、斷晶體結(jié)構(gòu)正確性的靈敏度比R或標(biāo)準(zhǔn)偏差更高 造成不正確原子位移參數(shù)的原因可能是： a) 原子位移橢球的取向出現(xiàn)平行現(xiàn)象，暗示晶體可能具有各向異性、吸收系數(shù)大且吸收校正沒(méi)做好 第85頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 b) 原子位移參數(shù)非常小，暗示更重的原子占據(jù)這一位置 c) 原子位移參數(shù)非常大，暗示更輕的原子占據(jù)這個(gè)位置，或者因無(wú)序，該位置僅被原子部分占據(jù) d） 原子位移參數(shù)在物理上不合理，如橢球的形狀盤子或長(zhǎng)條形或沒(méi)有體積，暗示數(shù)據(jù)差，數(shù)據(jù)參數(shù)比不夠，這時(shí)應(yīng)對(duì)部分原子進(jìn)行各向同性修正，或做無(wú)序處理，或讓相似化學(xué)環(huán)境的原子取相同的位移參數(shù)，或使用一個(gè)合理的固定值（1.5倍

53、） 反常的原子位移參數(shù)的出現(xiàn)，還暗示可能發(fā)生更為根本性的錯(cuò)誤，如定錯(cuò)晶胞或空間群 第86頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二C 無(wú)序結(jié)構(gòu) 當(dāng)一物質(zhì)大部分結(jié)構(gòu)大部分有序，僅小部分無(wú)序時(shí)，可用通常的方法解析。但無(wú)序部分可能出現(xiàn)原子位移參數(shù)太大，其結(jié)構(gòu)在化學(xué)上不合理的情況 無(wú)序的種類有多種，常見(jiàn)的有： a 位置占有率無(wú)序 即同一位置被兩種或多種原子占據(jù)(看“固定”) b 位置無(wú)序和取向無(wú)序 晶體中分子的部分基團(tuán)，甚至整個(gè)分子按統(tǒng)計(jì)方式分布在兩個(gè)或多個(gè)位置上的現(xiàn)象，叫位置無(wú)序。如果部分基團(tuán)，甚至整個(gè)分子位于旋轉(zhuǎn)軸、鏡面、對(duì)稱中心上，分布在兩個(gè)相互聯(lián)系的方向上的現(xiàn)象，稱為取向無(wú)序，球

54、形基團(tuán)常發(fā)生這種現(xiàn)象 第87頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 對(duì)于這一問(wèn)題，有的結(jié)構(gòu)，可直接由差值Fourier電子密度圖定出不同方向的排列。例如，ClO4-經(jīng)常是這樣處理的（O和O的占有率都改為0.5)。 很多結(jié)構(gòu)卻無(wú)法這樣處理。則對(duì)于無(wú)序程度輕的，可用限定（即用ISOR指令）的方法。也可把無(wú)序原子裂分為兩個(gè)原子，方法是： 先在Edit-.lst文件中找到裂分的原子坐標(biāo)然后在Edit-.ins文件中做如下處理：第88頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 0.0862 0.0389 0.0343 N1 0.1283 0.0659 0.0400 N2

55、0.3904 0.1447 0.0431 O1 may be split into 0.6986 0.4252 0.6507 and 0.6922 0.3560 0.6522 0.0879 0.0723 0.0349 O2 WGHT 0.045200 0.000000 FVAR 0.286910 0.5N1 3 0.338342 0.110671 0.424071 11.00 0.072990 0.046510 = 0.040170 0.003320 0.008270 0.021590part 1O1 4 0.6986 0.4252 0.6507 21.00 0.05part 2O1 4 0.

56、6922 0.3560 0.6522 -21.00 0.05part 0O2 4 0.529357 0.400370 0.615937 11.00 0.053290 0.087650 = 0.054980 -0.001990 0.019860 0.002700.lst.ins第89頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二C 多種可能空間群之間的選擇 確定空間群的基本原則是就高不就低。因此，定低了對(duì)稱性就是錯(cuò)誤的，必須糾正！最易犯的錯(cuò)誤是將有心定為無(wú)心 E 反常散射與絕對(duì)結(jié)構(gòu) a 反常散射 不同原子對(duì)電子的束縛能力不同，導(dǎo)致了其散射能力與自由電子有所不同，散射相角也發(fā)生一定漂移，

57、這種現(xiàn)象與X-射線的波長(zhǎng)有關(guān)，稱為反常散射 第90頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 如果晶體屬于中心對(duì)稱空間群或在忽略了反常散射的條件下，衍射點(diǎn)的強(qiáng)度嚴(yán)格遵守Friedel定律： |Fhkl| = |Fhkl| 對(duì)于中心對(duì)稱結(jié)構(gòu)，反常散射效應(yīng)相互抵消，因此嚴(yán)格服從Friedel定律 非中心對(duì)稱的結(jié)構(gòu)則不同，由于不同絕對(duì)結(jié)構(gòu)的反常散射效應(yīng)有一定差別，相應(yīng)的Friedel衍射對(duì)的強(qiáng)度也有區(qū)別,兩者之間差別盡管細(xì)微，卻十分明顯并有規(guī)律 b 手性和極性空間群 非中心對(duì)稱的空間群即極性空間群，其不含對(duì)稱中心；手性空間群不僅不含對(duì)稱中心，而且不含鏡面和滑移面 第91頁(yè)，共98頁(yè)，2022年，5月20日，2點(diǎn)24分，星期二 在絕對(duì)構(gòu)型可以清楚區(qū)分的情況下，使用錯(cuò)誤的絕對(duì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行精修將導(dǎo)致原子參數(shù)、鍵長(zhǎng)、和鍵角等的系統(tǒng)誤差，所以，正確確定絕對(duì)結(jié)構(gòu)是非常重要的 可用Flack參數(shù)（cif文件中）來(lái)確定絕對(duì)結(jié)構(gòu)