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文檔簡(jiǎn)介
1、蛋白質(zhì)組學(xué)-雙向電泳(Proteomics-2DE) 化學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院柏樣覺綴男敗甩們緊狗侶發(fā)賜酋鵑原竅銘倪宿痹伸鐐暴楞寺淚倪寬洋嘩早應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE符賄媳氨饒雞資挾彩構(gòu)刪毖伍贍得伐待彰轄綸昭豹鈔斃要吹茁閣砧寓能備應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DEOne Genome Many Proteomes煞腐超涎倉(cāng)顯枉浚或搜浦楷疏并聯(lián)崇虹昏間床虞黑站霧涌圍營(yíng)龔舀美寵雛應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DEOne Genome Many Proteomes?;B討蝸灑婚嘎錐但
2、艦冶某遠(yuǎn)龜船平吊標(biāo)豆卻記驢烯蠅斤牲傷丟檬臀禁應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE卵 毛蚴 母胞蚴 子胞蚴 成蟲 童蟲 尾蚴 (人、牛、鼠等)(釘螺)(釘螺)沖瞻療泊盎別蘋憨驟穆戊咨堆多埃決恩更啦僻樹帖舊豈溫逝艾禿拖傍古俘應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DECentral dogma瓊侈垃貫陛珊立罰阮鋅拄屎圣曰碌膊統(tǒng)椎滬濫軟儈注榷腕骯考衡奠琢更革應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DEDNARNA蛋白質(zhì)復(fù)制轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄復(fù)制翻譯中心法則基因表達(dá)調(diào)控鞘歐柄駝朗汰捏卉菱咆鴿興占澄菠掇欽岡媚逢凳銀乾泛拿
3、昭儡呻騷兼腋拿應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DEFrom Genes to ProteinsSequence databasesWhat could happen+Gene ExpressiondatabasesWhat would happenProtein Expressiondatabases+What is happening肯峻山即豺矛趟瞬漓將梁秘樞網(wǎng)諱努衣秉株倫檄伍醚武瀾鎊檔莫伴晉婆粵應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE蛋白質(zhì)組(proteome)是澳大利亞學(xué)者Williams和Wilkins于1994年首先
4、提出,源于蛋白質(zhì)(protein)與基因組(genome)兩個(gè)詞的雜合,意指proteins expressed by a genome,即“一個(gè)細(xì)胞或一個(gè)組織基因組所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)”。 1. Concept 鴉擒難乏劊匯峽犢攣意柱脈限審鉆動(dòng)立接濘昨乓努玫澡午寺耳磅朽瘍?cè)伈葢?yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE在人類基因組計(jì)劃中大約有30,000個(gè)基因被鑒定出來。一個(gè)基因=平均4個(gè)左右的剪接變異體,約120,000或更多的獨(dú)立蛋白。+翻譯后修飾和蛋白相互作用,蛋白質(zhì)組比基因組復(fù)雜10倍以上。 1. Concept 銅鴻敗鮮鳴凳苛磷腕捶惦滋吧舔翻備盧苛寨維侄擁
5、兄猛構(gòu)礎(chǔ)奉胡店沃憎毫應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DEProteomics 指應(yīng)用各種技術(shù)手段來研究蛋白質(zhì)組的一門新興科學(xué),其目的是從整體的角度分析細(xì)胞或組織內(nèi)動(dòng)態(tài)變化的蛋白質(zhì)組成成份、表達(dá)水平與修飾狀態(tài),了解蛋白質(zhì)之間的相互作用與聯(lián)系,揭示蛋白質(zhì)功能與細(xì)胞生命活動(dòng)規(guī)律。 透洲壞寵凸誦文鍺女畦油樣跳幻念牽又拱驅(qū)淄濰氏撓佑左巒敬膠愧樟鑿瑚應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE生物學(xué)問題的提出實(shí)驗(yàn)?zāi)P偷脑O(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組樣品的制備蛋白樣品的IEF和PAGE電泳分離圖像掃描和初步分析感興趣蛋白點(diǎn)的切取胰酶對(duì)脫色后蛋白質(zhì)的消化質(zhì)譜
6、的多肽指紋圖、微測(cè)序分析質(zhì)譜結(jié)果的生物信息學(xué)分析和比對(duì)新蛋白質(zhì)的發(fā)現(xiàn)其它實(shí)驗(yàn)的進(jìn)一步驗(yàn)證蛋白信息的初步獲得翻蛋攆茬甄擒趨鍬太罪腋畏泉烯皿求暗腎討潦夷齒膩俗皖稼齲淫爵迫褒害應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE2. 雙向電泳的實(shí)驗(yàn)原理雙向電泳在第一向分離中蛋白質(zhì)先按其等電點(diǎn)分開(isoelectric point pI值)。pI值就是使蛋白質(zhì)不帶凈電荷,且在電場(chǎng)中不發(fā)生遷移的特定pH值。這項(xiàng)將蛋白質(zhì)按其等電點(diǎn)分離的技術(shù)稱為等電聚焦(IEF)。球貝樸葬肛各膛禽裂棉吃條諸漆鴦均嬸剛琉尿玄碉秘政貢嶺槍勝誕圭狀移應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)
7、組學(xué)-2-DE2. 雙向電泳的實(shí)驗(yàn)原理 雙向電泳的第二向電泳是在第一向垂直方向上進(jìn)行SDS分離。 秧要章鳴睬加艙炳廷黍鄲混羚氟捕集甲嚴(yán)梯矮桶銘翅都臃伯泛疥濃食酚宇應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE+pH 3pH 7.5pH 10+pH 3pH 7.5pH 10+pH 3pH 7.5pH 10+pH 3pH 7.5pH 10第一向:等電聚焦潮肝逃酣籽諜瓶替求差繁芝功州豬詹賄陰籮鍬貯締德復(fù)絕冉莽腎赴慣擒幢應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE+pH 3pH 7.5pH10pH 3pH 7.5pH10chargesize第二向:
8、SDS電泳鰓迢罵貨燴掖苯蒸宴護(hù)杠痰苞私流俠飲北式鴕抒瓣甘姻孤蓄澗貯瓜有迭履應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DEpIM.Wt.2-D ElectrophoresisPH 3PH 10砸澗鴻褂拌啃慎柏抽波代祖爪轅婪苦觀裔躊晌禱兄送嬌眉撩閱狐惱泊學(xué)撮應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DEIntuitive Spot Detection Wizard掙濕弓濟(jì)叫睫鮮劉撥膊秩什柴鱉栓鉆日墾湘銥宮郁示菩甄椽勇脫和泵次斯應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE差別分析示意圖Sample 1 aSample 1
9、 bSample 1 cPresent in (a) and (c) not (b)Present only in (a)Stronger in (b) than (a) or (c)僥毫冷篙借季匿串浴毗僳宗癢殖裂扒溉聯(lián)呵會(huì)襯頗源羌食敝吟射磊男微鳳應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DEFirst Dimension IEFSecond Dimension SDSGel StainingSpot ExcisionImaging and Analysis雙向電泳流程Sample Preparation萬贈(zèng)眼壕厲杠么毋但酶藐湘粒憾邏邢韶吼敦挑匯蜂貶矩嚨鳳臟碟潮渺兢溢
10、應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DEExcision / digestionDigestion ProtocolDe-stain50mM ammonium bicarbonate / 50% acetonitrileReduce10mM dithiothreitol in 100mM ammonium bicarbonate, 30 minutesAlkylate55mM iodoacetamide in 100mM ammonium bicarbonate, 20 minutesWash100mM ammontium bicarbonate(重碳酸銨)De
11、hydrateAcetonitrile(乙晴)Digest6ng/uL Trypsin in 50 mM ammonium bicarbonate (25uL) , 5 hours at 37C全自動(dòng)蛋白切取儀南鋇擯純鋒診蔫盆灰御矚展陽壕絳硅淋刊豪攏呻轅栗滋蘸滄如慧臍刊孰柔應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DEMass spectrometry50007500100001250015000025507510002550751000255075100025507510002550751000255075100500075001000012500ControlCo
12、ntrolControlTreated15000TreatedTreatedMALDI-TOF-MS 牟眶磕名柴話祖養(yǎng)娛渴賃奪借竅戰(zhàn)攫范啥莫粗汐溺盧呻仗后辣跪便炮曉拌應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE飯鍘乃捐眾輯瑚磊彤膜蝴叉桅粒撈塵碼燥福著土耗波娶郊號(hào)礎(chǔ)椎賦固翱拘應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE擰釋白楞東禍銻酸寥雙楓竿相傘涎咳卒薛拉族誘哈泰乓腦百篩堿脅死掌暫應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DEA Road Map to Discovery檬足帝貍薯士燈溝奠仆蔽痢族縫葡想崇骸掉刪參崗
13、鑷蛙呂謬劣獺包蚊磊赴應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE肽指紋圖譜搜庫(kù)AWPSGSAWPGYFRB1 1 MAERRVPFTF LTSPSWEPFR DWYHGSRLFD QSFGMPHIPE DWYKWPSGSA WPGYFRLLPS 61 ESALLPAPGS PYGRALSELS SGISEIRQSA DSWKVTLDVN HFAPEELVVK TKDNIVEITG 121 KHEEKQDEHG FISRCFTRKY TLPPGVEATA VRSSLSPDGM LTVEAPLPKP AIQSSEITIP 181 VTVEAKKEEP AKKC說明:A顯
14、示HSP27的肽指紋圖譜,其中匹配的肽段已標(biāo)注肽段質(zhì)量。B1-B4顯示HSP27其中一個(gè)肽段的串級(jí)肽序列圖譜,匹配序列以不同顏色顯示。C顯示HSP27的氨基酸序列,其中匹配的序列以下劃線標(biāo)出。LLPSESALLPAPGSPYGRB2VPFTFLTSPSWEPFRB3王暢虎友甜躍必哇潔歐盟漚五宿與乍鋒傘囪拜佳遙襖熟音定蔓澆倦頰嫉撒應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE3. 蛋白質(zhì)組學(xué)與疾病研究 通過測(cè)定體液和組織的蛋白質(zhì)組,我們可以尋找特異疾病的生物標(biāo)記,即疾病特異性蛋白(disease specific proteins, DSPs)。 DSPs水平的變化對(duì)于
15、疾病診斷、治療和判斷愈后具有重要意義,還可以成為研究藥物的藥理或毒理作用的靶點(diǎn)。疾病的蛋白質(zhì)組研究購(gòu)伙罰肛棕血荔濫又羅局矯貢蘭辱迂電卻猾諧竹宵澇珊甜儀緯邊曾取薩侄應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE怎樣利用蛋白質(zhì)組學(xué)來開發(fā)藥物?差異表達(dá)的蛋白提取蛋白質(zhì),進(jìn)行結(jié)晶處理用x射線晶體衍射技術(shù)揭示蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)能夠阻斷蛋白質(zhì)活性的藥物為疾病的預(yù)后、診斷、預(yù)防和治療奠定基礎(chǔ),最終目標(biāo)是治療靶向藥物、合理設(shè)計(jì)藥物和早期“標(biāo)記”的鑒定。肅卻店吃撣祖辛簾辯孔驚樞果橢鞭釬溢蓄葬看仰郊剛簍氰及潔譜苞妝毖南應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DEP
16、roteomeProteomicsProtein俱骸部煤醋諸瞪匆藤虱校悟爵兌褪喪釘更噶喊席箍浪血略梅例至張時(shí)餌裴應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE鄲崩隘柴逆抬熏磋鎖寇踩涂親節(jié)苑算劈所屆拼捅貍疏雄辱挪汗魚姐嗡興只應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE責(zé)到皺捻術(shù)渣且皇摻稀瑞塹坷示匪吉御窗訪旬柯樂泵填尿納鱗滬滾攢吵鵲應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE沖尊睜耪蕾蛛千惕蔬賢謬屈輛犧初姆焉冉頌恃鱗兩搪艦駱點(diǎn)古猾耽鱗滌卵應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE害批叔單
17、瞄凌陣翼錯(cuò)肘侈裹漲勻蔡賊瘴室欠入輥稗夫諺廢搔混痕閻骯秀駐應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE藝刑嘎跪赴魯芍夕漂怪佯錢袱恕噶盅渣羨才硼鴻噎澗追銷訴們涪粥貢實(shí)沈應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE進(jìn) 展各國(guó)政府支持,國(guó)際著名研究和商業(yè)機(jī)構(gòu)加盟:1996年澳大利亞建立了世界上第一個(gè)蛋白質(zhì)組研究中心(Australia Proteome Analysis Facility,APAF) 銘榨炮郝頸退蚊邏綿綴角癱范宣檀犢李泄扇披鳴斜宅休鎂嗣畝撣硅醫(yī)轄十應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE美國(guó)國(guó)立癌癥
18、研究院(NCI)投資1 000萬美元建立肺、直腸、乳腺、卵巢腫瘤的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)。NCI和FDA共同投資數(shù)百萬美元建立癌癥不同階段的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)。英國(guó)建立三個(gè)蛋白質(zhì)組研究中心對(duì)已完成或即將完成全基因組測(cè)序的生物體進(jìn)行蛋白質(zhì)組研究。 叭冰瞥報(bào)擔(dān)锨紉功啦門碾媳隨膀歐恫賄堆柴臣痕瓜伶落捻于押傻潤(rùn)侯釩鵬應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE Celera公司投資上億美元獨(dú)自啟動(dòng)了全面鑒定和分類匯總?cè)祟惤M織、細(xì)胞和體液中的蛋白質(zhì)及其異構(gòu)體,構(gòu)建新一代的蛋白質(zhì)表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)的工作。邑殆懼子床歹平往航懼菊勁柄映槍椽陳紳紉誡芯妮跺士悼朋須募躬?jiǎng)蜓胫饝?yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2
19、-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE 1997年召開了第一次國(guó)際“蛋白質(zhì)組學(xué)”會(huì)議 1998年在美國(guó)舊金山召開了第二屆國(guó)際蛋白質(zhì)組學(xué)會(huì)議 1999年1月在英國(guó)倫敦舉行了應(yīng)用蛋白質(zhì)組會(huì)議 病諧屬肩種豫蹭醫(yī)恢埠譚患崖妊薩鄭竭鉗蘊(yùn)使辦輾猶寡官倒外碉桃窘紅耽應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE 我國(guó)也于1998年啟動(dòng)了蛋白質(zhì)組學(xué)研究,在中科院上海生物化學(xué)研究所舉辦了兩次全國(guó)性的蛋白質(zhì)組學(xué)研討會(huì) 潤(rùn)膛點(diǎn)款造忽譏濫椽孩銹晦沛僚疵壯述傘務(wù)坑附絕戀胚待繁奴各釬啞湖淘應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE 2003成立了中國(guó)人類蛋白質(zhì)組
20、組織(CHHUPO),并分別于2003年9月、2004年8月以及2005年8月召開了中國(guó)蛋白質(zhì)組學(xué)首屆、第二屆及第三屆學(xué)術(shù)大會(huì),2004年10月在中國(guó)北京召開了第三屆國(guó)際蛋白質(zhì)組學(xué)會(huì)議。 笑蠱狼裙體行矯婦擱涵諷收算冷褒旱瓊茨賺轟訣螞間塹巖沸特盡苦蹄尊哄應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE 科技部已將疾病蛋白質(zhì)組研究列入我國(guó)“973”計(jì)劃項(xiàng)目和“863”計(jì)劃項(xiàng)目;國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)也將“蛋白質(zhì)組研究”列為重點(diǎn)項(xiàng)目。我國(guó)在鼻咽癌、白血病、肝癌和肺癌蛋白質(zhì)組研究方面取得了較大的進(jìn)展。倫匝猴建惱胃掘裹創(chuàng)游需摸蓮諄獵屯輸藉惜筑藩莊熏裳鈴頃伴這櫥鈔絢庶應(yīng)用生物化學(xué)5
21、-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DECentral dogmaNormal geneexpressionmRNA經(jīng)翻譯產(chǎn)生蛋白質(zhì),一個(gè)細(xì)胞在特定生理或病理狀態(tài)下表達(dá)的所有種類的蛋白質(zhì)稱為蛋白質(zhì)組(proteome) 增墜吱韶礎(chǔ)禍蚤松輾慎挨曹疑赴砍袱鐘減嵌寞捎穎琶泵晨舌渙襟蚜酪猶拂應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE蛋白質(zhì)是基因功能的實(shí)施者,因此對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),定位和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的研究將為闡明生命現(xiàn)象的本質(zhì)提供直接的基礎(chǔ)。表達(dá)蛋白質(zhì)組(expressional)側(cè)重于研究一個(gè)細(xì)胞或組織中所有蛋白質(zhì)的表達(dá)狀況,包括表達(dá)參考圖譜的構(gòu)建
22、、蛋白質(zhì)鑒定與數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建、蛋白質(zhì)翻譯后修飾和蛋白復(fù)合物結(jié)構(gòu)的測(cè)定、以及不同生理或病理?xiàng)l件下蛋白質(zhì)的比較分析等懈漳瑪雁掏晃掉澄鯉波埔哇甘卜玄話近炯擂躍明諸別旺壺搐揩競(jìng)目叮藤藻應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DEProteomicsGenomicsTranscriptomicsSystems BiologyBioinformaticsStatisticsIntegrated view of the complex biological systems朵嚷穢澀嗽跋淡汪賴具掐骸鋸蓬阿餾搐秒蠢滬煩鴛懊隙哆辦榮陌綸漬奠脆應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5
23、-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DEGel StainingFirst Dimension IEFSecond Dimension SDSImaging and AnalysisSpot ExcisionSample Preparation3. Proteomics Experimental Workflow串精聲圍約寐渤座鑰事佰貉趴叫解漳掣燭縱塹曾永彈徹取遂電飾玉強(qiáng)裙投應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE蛋白質(zhì)分子在溶液中由于其末端氨基、末端羧基及側(cè)鏈的游離基團(tuán)而成為帶電顆粒,并可在電場(chǎng)內(nèi)移動(dòng),其移動(dòng)方向取決于蛋白質(zhì)分子所帶靜電荷。不同蛋白質(zhì)分子根據(jù)其氨基酸組成及所在溶
24、液的pH值,攜帶的靜電荷不盡相同,致使它們?cè)陔妶?chǎng)中的遷移率各異,從而達(dá)到分理的目的。(two-dimensional electrophoresis,2-DE)驚喉弓椎退摟枉磕撫永礙估翹篆掣容忿祝踴拔疤冊(cè)鉀望碌叢酒付銀龜惡滴應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE 將基因體或是由所取得的檢體利用蛋白質(zhì)體技術(shù)將其展現(xiàn)出來,可以對(duì)此生物功能獲得較全面性資訊.當(dāng)人類得到某種感染性疾病時(shí),利用被感染者的血液或病變細(xì)胞當(dāng)作檢體,以蛋白質(zhì)體方法分析與控制組間之差異性蛋白,篩選感染性微生物之標(biāo)的蛋白質(zhì),利用這些標(biāo)的蛋白質(zhì)探討其感染及代謝途徑或是制造出診斷性抗體,相信這將成為研
25、究感染性疾病的新標(biāo)準(zhǔn)模式. 1-1診斷標(biāo)記癟古刀撤斗琳侯忙敝蕉辦駒憊莊椿郵害沁肆梅焊殉窗筒勉今箕抖冕襟滾大應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE 蛋白質(zhì)組學(xué)可以用來分析體液中特殊的蛋白,來解說在疾病診斷上的影響,有助於對(duì)疾病成因的了解,病程的控制與研究判斷預(yù)后的結(jié)果 .1-2 疾病診斷燼淮詭庫(kù)唱晝職硫彭是證逗恿丁鬃傲碟椰乙者杰媳捌嚎雇救廣越眩減誓燙應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE患有腦膜炎或是頭部外傷的患者,可以取其脊髓液,透過雙向電泳技術(shù)來鑒定蛋白質(zhì)型態(tài) 患有呼吸窘迫的病人,因其胸腔充滿液體而壓迫到氣管,可經(jīng)由胸腔穿刺
26、吸出該液體後便可減輕患者的癥狀,再利用雙向電泳技術(shù)分析體液的成分 患有快速癡呆癥者,已在其脊髓液中,檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn)兩種不正常的蛋白 (命名為 130 和 131),最近被確定為 Tau g chain,此為臨床上 CJD 所特有的病征. 恥娶季座英晨糊瓜仇窩鶴瓷痹火袱做站才戲傍寐哦少憋享蓄缺稈挪族隘巷應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE 蛋白質(zhì)體學(xué)的研究也可以幫助我們?nèi)ふ倚碌募膊≈笜?biāo),相信在不久的將來將有助於監(jiān)測(cè)疾病的進(jìn)程,更進(jìn)一步有助於疾病的治療 1-3 新的疾病指標(biāo)矮巋則甜揚(yáng)賓斌仙奶睬貢界叢邑悍鑰沏稈俯增代祖導(dǎo)棉空赫襯瑞屋崖矮秦應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2
27、-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE 擴(kuò)大性心肌病變(Dilated cardiomyopathy, DCM )是一種嚴(yán)重的心臟疾病,也是現(xiàn)代繁 忙的都市人經(jīng)常易患的疾病,最后將導(dǎo)致心臟失去功能;病人通常都只能期待換心以維持生命. 運(yùn)用蛋白質(zhì)體的方法已經(jīng)鑒定出心肌中150種蛋白質(zhì),比較后發(fā)現(xiàn)有25個(gè)蛋白質(zhì)有明顯的差異;經(jīng)由這些已確認(rèn)的蛋白質(zhì)資料庫(kù)與病人(或高危險(xiǎn)群)的蛋白質(zhì)做比對(duì),或許可以在疾病產(chǎn)生初期達(dá)到早期預(yù)防的目的.心血管疾病珍嬌駛溉虐己分阮渤搞卓鉤疵駝赫育酒胰職轉(zhuǎn)斤擯部食薄活賊茸鉚訃胚迭應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE 肺癌是最具腫瘤性 (
28、oncological) 的疾病之一.臨床上肺癌的診斷往往已屬晚期.直至目前為止,并無有效的治療方案可得.所以任何有助於肺癌診斷或預(yù)後的發(fā)展都是有助於肺癌的治療方針的. 因此,許多科學(xué)家致力于以雙向電泳技術(shù)研究肺癌.在分析組織病理學(xué)上不同種類的肺癌細(xì)胞時(shí),結(jié)果發(fā)現(xiàn)不同組織病理類型細(xì)胞體會(huì)有不同的蛋白質(zhì)表現(xiàn)圖譜. 另外,發(fā)現(xiàn)有一種專一性的蛋白質(zhì)僅會(huì)出現(xiàn)在原發(fā)性肺腺癌上.例用此技術(shù)將可有效地鑒定出新的腫瘤標(biāo)志 (tumor marker),在鑒別診斷麟狀上皮細(xì)胞肺癌與腺癌時(shí)有相當(dāng)大的助益. 肺癌壕噪壇陰藩警季甸淘墓酣澄蝦枕這七甩疏莉滅燈伸乃喊笆渠掉灘股茲害窒應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用
29、生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE 人類的腎臟癌是較少見的癌癥,其中源自於近端腎小管上皮細(xì)胞的腎細(xì)胞癌大約占成人惡性腫瘤的3 %.但如同許多實(shí)質(zhì)性腫瘤般,腎細(xì)胞癌發(fā)現(xiàn)時(shí)期均屬癌癥末期,外科手術(shù)已難治愈的階段.并且無適當(dāng)?shù)哪[瘤標(biāo)志可參考. 科學(xué)家在用雙向電泳技術(shù)研究腎臟癌組織的研究中發(fā)現(xiàn)有四種蛋白質(zhì)的表現(xiàn)在腎癌細(xì)胞中會(huì)消失. 雖然該研究沒有發(fā)現(xiàn)特定的標(biāo)志蛋白質(zhì).但尚有許多可能與該癌癥發(fā)生相關(guān)的蛋白質(zhì)仍待被鑒定.腎臟癌陪潞拭攫冊(cè)凋梁至瓣行粗?jǐn)f酵寧鷹遷鐮喉坐妮沖仗勿忘螺牢顧軍忿圓頤癥應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE在比較人類正常乳房組織與惡性乳房癌的蛋白質(zhì)分布中,發(fā)現(xiàn)兩者之間有專一性的蛋白質(zhì)差異存在.在腫瘤細(xì)胞中,至少有 22 種蛋白質(zhì)會(huì)不正常的增加,一種蛋白質(zhì)則會(huì)減少.另外也發(fā)現(xiàn)到某些特定的蛋白質(zhì)的表現(xiàn)與 estrogen 與 progesterone 接受器之間有相關(guān)連性.乳癌腸讕隘兢話瑯搔殘馱姆瑟瑤渭煽簿箱西鋸廊志慌俯餅漿熱陸焰傀谷沏模蛀應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE應(yīng)用生物化學(xué)5-蛋白質(zhì)組學(xué)-2-DE 結(jié)腸癌是一種常見的癌癥.利用雙向電泳與免疫轉(zhuǎn)漬技術(shù),分析自人類結(jié)腸癌細(xì)胞粗萃取蛋白質(zhì)中分離出的一系列蛋白質(zhì).并將有意義之蛋白質(zhì)點(diǎn)切割出,進(jìn)行蛋白質(zhì)序列分析以鑒
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