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文檔簡介
1、方差分析一、方差分析的基本思想 根據(jù)資料的設計類型和研究目的,把全部觀察值的變異(總變異)分解為兩個或多個部分,每部分可以用某因素的作用來解釋,將某因素解釋的變異和誤差變異進行比較,作出某因素是否有統(tǒng)計學意義的結論。完全隨機設計的方差分析表變異來源SSdfMSF組間(處理組間) SS組間k-1SS組間/v組間MS組間/ MS組內(nèi)組內(nèi)(誤差) SS組內(nèi)N-kSS組內(nèi)/v組內(nèi)總SS總N-1二、 應用條件獨立性: 各樣本是相互獨立的隨機樣本;正態(tài)性: 各樣本來自正態(tài)總體;方差齊性: 各總體方差相等。三、常用兩兩比較方法:SNK法Bonfferoni法 Dunnett法四、方差齊性檢驗 F檢驗:適用于
2、正態(tài)分布資料 兩個總體方差的齊性檢驗Bartlett 2檢驗 :適用于正態(tài)分布資料Levene檢驗:適用于任何分布資料五、方差分析所用的過程ANOVA過程(Analysis Of Variance)GLM過程(General Linear Model)PROC ANOVA的過程格式 PROC ANOVA; CLASS 變量表; MODEL 因變量表效應; MEANS 效應/選擇項; PROC GLM的過程格式 PROC GLM; CLASS 變量表; MODEL 因變量表效應; MEANS 效應/選擇項; 例1: 以小鼠研究正常肝核糖核酸(RNA)對癌細胞的生物學作用,試驗分為對照組(生理鹽水
3、)、水層 RNA組和酚層RNA組,分別用此三種不同處理誘導肝細胞的FDP酶活力,得數(shù)據(jù)如下。該三組資料均服從正態(tài)分布,試比較三組均數(shù)有無差別?數(shù)據(jù)步data aa1;input x g ;cards;2.79 1 3.83 2 5.41 32.69 1 3.15 2 3.47 33.11 1 4.70 2 4.92 33.47 1 3.97 2 4.07 31.77 1 2.03 2 2.18 32.44 1 2.87 2 3.13 32.83 1 3.65 2 3.77 32.52 1 5.09 2 4.26 3 ;過程步1-正態(tài)性檢驗proc univariate normal;class
4、 g;var x;run;proc anova;class g;model x=g;means g/ hovtest snk bon ;/*homogeneity of variance*/run;過程步2方差分析同時進行方差齊性檢驗和兩兩比較proc glm; /*方差分析*/class g; model x=g;means g/ hovtest snk ;run;過程步glm過程 The UNIVARIATE Procedure Variable: x g = 1 Tests for NormalityTest -Statistic- -p Value-Shapiro-Wilk W 0.9
5、65872 Pr W 0.8638 g = 2 Tests for NormalityTest -Statistic- -p Value-Shapiro-Wilk W 0.983036 Pr W 0.9763 g = 3Test -Statistic- -p Value-Shapiro-Wilk W 0.990027 Pr F g 2 2.3190 1.1595 1.45 0.2567 Error 21 16.7729 0.7987F=1.45,P=0.2567 0.05,方差齊 The ANOVA ProcedureDependent Variable: x Sum ofSource DF
6、Squares Mean Square F Value Pr F Model 2 6.43680833 3.21840417 4.28 0.0275 Error 21 15.77572500 0.75122500Corrected Total 23 22.21253333 R-Square Coeff Var Root MSE x Mean 0.289783 25.33071 0.866732 3.421667Source DF Anova SS Mean Square F Value Pr F g 2 6.43680833 3.21840417 4.28 0.0275F=4.28,P=0.0
7、275,拒絕H0,差別有統(tǒng)計學意義,三組小鼠FDP酶活力不全相等。 Student-Newman-Keuls Test for x Means with the same letter are not significantly different. SNK Grouping Mean N g A 3.9013 8 3 A A 3.6613 8 2 B 2.7025 8 12和3相同1和2不同1和3不同 Bonferroni (Dunn) t Tests for x Means with the same letter are not significantly different. Bon
8、Grouping Mean N g A 3.9013 8 3 A B A 3.6613 8 2 B B 2.7025 8 1結果解釋: 1、三組數(shù)據(jù)正態(tài)性檢驗作出判斷2、方差齊性檢驗:F=1.45,P=0.2567 0.05,方差齊;3、方差分析:F=4.28,P=0.0275,拒絕H0,差別有統(tǒng)計學意義,三組小鼠FDP酶活力不全相等。4 、SNK兩兩比較:可以認為對照與水層RNA組間,對照組與酚層RNA組間均有差別,而還不能認為水層RNA組與酚層RNA組間有差別。ANOVA適合處理均衡數(shù)據(jù)ANOVA過程是SAS系統(tǒng)中用于方差分析的幾個程序步之一,它適用于均衡的數(shù)據(jù)。這意味著如果按所分析的變量將觀測值分類,則每個格子內(nèi)的觀測值數(shù)目應相同。如果數(shù)據(jù)不滿足這一要求,則ANOVA過程的分析結果并不可靠,分析者應改用GLM過程來處理數(shù)據(jù)。 GLM過程即廣義線形模型(General Liner Model)過程,它使用最小二乘法對數(shù)據(jù)擬合廣義線形模型。GLM過程中可以進行回歸分析、方差分析、協(xié)方差分析、劑量反應模型分析、多元方差分析和偏相關分析等等。 在
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