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文檔簡(jiǎn)介
1、實(shí)驗(yàn)十一 植物組織總DNA的提取及DNA的濃度測(cè)定 掌握用CTAB法提取植物總DNA的方法和根本原理。學(xué)習(xí)利用紫外分光光度法測(cè)定DNA溶液的濃度。一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康亩?、?shí)驗(yàn)原理 通常采用機(jī)械研磨的方法破碎植物的組織和細(xì)胞,由于植物細(xì)胞勻漿含有多種酶類(尤其是氧化酶類)對(duì)DNA的抽提產(chǎn)生不利的影響,在抽提緩沖液中需參與抗氧化劑或強(qiáng)復(fù)原劑(如巰基乙醇)以降低這些酶類的活性。在液氮中研磨,資料易于破碎,并減少研磨過程中各種酶類的作用。 CTAB, SDS等離子型外表活性劑,能溶解細(xì)胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,從而使DNA得以游離出來。 再參與苯酚和氯仿等有機(jī)溶劑,能使蛋白量變性,并使抽提液分相,因核酸(
2、DNA、RNA)水溶性很強(qiáng),經(jīng)離心后即可從抽提液中除去細(xì)胞碎片和大部分蛋白質(zhì)。上清液中參與異丙醇或乙醇使DNA沉淀,沉淀DNA溶于雙蒸水或TE溶液中,即得植物總DNA溶液。之后可參與RNA酶降解其中的RNA,再用氯仿除去RNA酶,得到較純的DNA制劑。 DNA的吸收光譜峰在260 nm處,據(jù)計(jì)算,測(cè)定此波長(zhǎng)下DNA溶液的OD值,當(dāng)OD260=1時(shí),雙鏈DNA含量約為50 g/ml,據(jù)此可用紫外分光光度計(jì)測(cè)定溶液中DNA含量。 由于蛋白質(zhì)的吸收峰在280 nm處,在測(cè)定DNA含量時(shí),還常計(jì)算OD260/OD280之值,如該值為1.8-2.0時(shí),以為已到達(dá)較高的純度,如低于此值,闡明其內(nèi)含雜質(zhì)較多
3、,能夠影響酶切反響。水稻種類的幼苗葉片三、實(shí)驗(yàn)資料四、實(shí)驗(yàn)器具、藥品試劑 水浴鍋,研缽,微量移液器,槍頭,離心管,臺(tái)式離心機(jī),液氮,恒溫箱,標(biāo)簽紙,紫外分光光度計(jì),磁力攪拌機(jī),剪刀等。 2% CTAB抽提緩沖溶液,異丙醇, 氯仿-異戊醇等 CTAB法流程圖植物資料裂解液上層溶液液氮研磨抽提細(xì)胞裂解枯燥溶解離心洗滌異丙醇沉淀DNA溶液五、實(shí)驗(yàn)方法(1) 2%CTAB抽提緩沖液在65水浴中預(yù)熱。(2)取少量葉片約0.2 g置于研缽中,用液氮磨至粉狀;(3) 在液氮揮發(fā)將盡而植物組織尚未解凍時(shí)迅即參與700 l的2%CTAB抽提緩沖液,悄然攪動(dòng);(4) 將磨碎液分倒入1.5 ml的滅菌離心管中,磨碎
4、液的高度約占管的三分之二;(5) 置于65的水浴槽或恒溫箱中,每隔10 min悄然搖動(dòng),40 min后取出;1. DNA的提取 6冷卻2 min后,參與氯仿-異戊醇24:1至滿管,猛烈振蕩23 min,使兩者混合均勻;7放入離心機(jī)中10 000 rpm離心10 min,與此同時(shí),將600 l的異丙醇參與另一新的滅菌離心管中;8 用移液器悄然地汲取上清夜,轉(zhuǎn)入含有異丙醇的離心管內(nèi),將離心管漸漸上下?lián)u動(dòng)30 sec,使異丙醇與水層充分混合至能見到DNA絮狀物;910000 rpm離心1 min后,立刻倒掉液體,留意勿將白色DNA沉淀倒出,將離心管倒立于鋪開的紙巾上;1060 sec后,直立離心管,
5、參與720 l的75%乙醇及80 l 5 M的醋酸鈉,悄然轉(zhuǎn)動(dòng),用手指彈管尖,使沉淀與管底的DNA塊狀物浮游于液體中;11放置30 min,使DNA塊狀物的不純物溶解;12 10000 rpm離心1 min后,倒掉液體,再參與800 l 75%的乙醇,將DNA再洗 30 min;1310000 rpm離心30 sec后,立刻倒掉液體,將離心管倒立于鋪開的紙巾上;數(shù)分鐘后,直立離心管,枯燥DNA自然風(fēng)干或用風(fēng)筒吹干;14參與50 l 0.5 TE(含RNase)緩沖液,使DNA溶解,置于37恒溫箱約15 h,使RNA消解;15置于-20保管、備用。稱取樣品,液氮研磨,參與預(yù)熱的(65 ) CTA
6、B及-巰基乙醇 保溫1h,期間不停的搖均汲取上清液,移至新的離心管中,參與等體積氯仿:異戊醇24:1,輕緩顛倒混勻,10000rpm,10min 取上清液,移至新的離心管中,加等體積氯仿:異戊醇,顛倒混勻, 10000rpm,10min取上清液,參與0.6-0.7V的異丙醇預(yù)冷,后4 /-20 保溫沉淀10000rpm,10min離心取沉淀,70%乙醇清洗兩次,吹干用TE溶解DNA,然后低溫保管 取提取的DNA溶液2 l(約100-200 ng)至一干凈的離心管,參與198 l蒸餾水稀釋。先200 l蒸餾水至比色杯,進(jìn)展紫外光空白測(cè)定,然后倒掉蒸餾水,參與200 l已稀釋的DNA溶液,測(cè)定260 nm及280 nm的光吸收值OD260及OD280,計(jì)算DNA濃度及OD260/OD280比值。計(jì)算公式如下: dsDNA=50(OD260) 稀釋倍數(shù)以上濃度單位為g /ml2. DNA濃度的測(cè)定1葉片磨得越細(xì)越好。2移液器的運(yùn)用。3由于植物細(xì)胞中含有大量的DNA酶,因此,除在抽提液中參與EDTA抑制酶的活性外,第一步的操作應(yīng)迅速,以免組織解凍,導(dǎo)致細(xì)胞裂解,釋放出DNA酶,使DNA降解。六、本卷須知七、作業(yè)(1)本實(shí)驗(yàn)所
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