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1、第七章 細(xì)菌和噬菌體的重組和連鎖根本知識(shí)細(xì)菌是單細(xì)胞,它的遺傳物質(zhì)是一個(gè)大型的環(huán)狀核酸分子,稱之為基因帶,也可稱為染色體。假設(shè)細(xì)菌喪失產(chǎn)生某種營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)如氨基酸的才干就稱為營(yíng)養(yǎng)缺陷型,相對(duì)于缺陷型的野生菌株叫原養(yǎng)型。病毒的構(gòu)造是由蛋白質(zhì)外殼和包裹在中間的一個(gè)單一的核酸分子可稱基因帶或染色體組成。例如:細(xì)菌的基因組One circular chromosome (4-5Mb) 原養(yǎng)型及營(yíng)養(yǎng)缺陷型鑒別: 基因型的表示:用它們不能合成的物質(zhì)的前三個(gè)字母7.1 細(xì)菌的遺傳分析細(xì)菌的雜交 以大腸桿菌為例,大腸桿菌K12中兩個(gè)菌株A和B,菌株A是供體,含有F因子F質(zhì)粒,記作F+,菌株B是受體,沒有F因子,記
2、作F-。F因子又稱性因子或致育因子,它是能獨(dú)立增殖的環(huán)狀DNA分子。 F+細(xì)菌的外表有稱作性傘毛的細(xì)長(zhǎng)纖毛。當(dāng)F+細(xì)菌與F-細(xì)菌結(jié)合時(shí),F(xiàn)因子經(jīng)過(guò)性傘毛從F+細(xì)菌轉(zhuǎn)移到F-細(xì)菌,原來(lái)的細(xì)菌還仍為F+。不過(guò)染色體很少經(jīng)過(guò)結(jié)合而轉(zhuǎn)移到F-細(xì)菌,所以染色體上的基因的重組頻率很低。細(xì)菌接合雜交實(shí)驗(yàn)Lederberg 和 Tatum 1946ABABAB回復(fù)突變or重組?細(xì)菌接合雜交實(shí)驗(yàn)Lederberg 和 Tatum 1946AB CD AB CDABCD A品系:met bio thi leu thrthi:硫胺素B1 B品系:met bio thi leu thr A A+B B 根本培 養(yǎng)基
3、met bio thi leu thr出現(xiàn)頻率:1/107細(xì)菌接合示:雜交實(shí)驗(yàn)達(dá)爾夫Davis U型管實(shí)驗(yàn)細(xì)菌接合遺傳物質(zhì)的一方向轉(zhuǎn)移Hayes實(shí)驗(yàn)A: met- thr+ leu+ thi+B: met+ thr- leu- thi-Donor: AReceptor:B 大劑量鏈霉素 A品系 無(wú)影響 大劑量鏈霉素 B品系 阻止了重組F 因子F 質(zhì)粒F 質(zhì)粒與細(xì)菌接合F因子特點(diǎn)F細(xì)菌可以把F因子傳給后代。F細(xì)菌經(jīng)吖啶橙處置F因子喪失,喪失后不再出現(xiàn)。F可以和F雜交,而不能和F雜交。F和F雜交后代皆為F,而且可以以107頻率獲得重組體后代。Hfr菌株 由于F因子和細(xì)菌的DNA分子都是環(huán)狀的,在環(huán)
4、狀的細(xì)菌染色體和環(huán)狀的F因子間經(jīng)過(guò)一個(gè)交換,環(huán)狀F因子就整合到環(huán)狀的細(xì)菌染色體上。 F因子整合到細(xì)菌染色體上的菌株就是高頻重組菌株,稱為Hfr菌株。高頻重組菌株Hfr菌株跟菌株BF-雜交時(shí),細(xì)菌染色體上基因的重組頻率很高,即出現(xiàn)重組子的頻率很高。High frequence recombination圖示 F因子整合到細(xì)菌染色體的過(guò)程Hfr與F-的接合示:細(xì)菌的交換過(guò)程Hfr品系與F菌株的區(qū)別一樣1、都能和F雜交。2、雜交都要經(jīng)過(guò)接合管和受體菌相聯(lián)接。3、高劑量鏈霉素處置后都不影響雜交,闡明它們都是作為一種供體。不同1、產(chǎn)生重組子頻率不同,HfrF為104,F(xiàn)F為107。2、 FF后代F, H
5、frF后代F。3、 F細(xì)菌經(jīng)吖啶橙處置變成F,Hfr經(jīng)吖啶橙處置仍為Hfr。中斷雜交技術(shù):把Hfr細(xì)菌與F-細(xì)菌混合培育,每隔一定時(shí)間取樣,將試樣攪拌并稀釋后在選擇培育基上培育,使其只需重組子類型可以生長(zhǎng),分析Hfr染色體上基因進(jìn)入受體細(xì)胞F-細(xì)菌的順序各所需時(shí)間分鐘,這種根據(jù)供體基因進(jìn)入受體細(xì)胞的順序和時(shí)間繪制連鎖圖的技術(shù),稱為中斷雜交技術(shù)。中斷雜交實(shí)驗(yàn)巴斯德實(shí)驗(yàn)室,Elie Wolliman和Francois Jacob1.Wollman和Jacob的實(shí)驗(yàn)要處理的問題是:Hfr細(xì)菌在交配中,什么時(shí)候把基因轉(zhuǎn)移給F細(xì)菌。方法:把兩個(gè)菌株混在一同,進(jìn)展雜交將二菌株在培育液中通氣培育,Hfr細(xì)菌
6、與F細(xì)菌開場(chǎng)接觸,構(gòu)成接合管。每隔一定時(shí)間取樣攪拌,斷開結(jié)合管,使配對(duì)的細(xì)菌分開。然后稀釋菌液,防止再度配對(duì)。將上述菌液涂布在含有鏈霉素,但不含有蘇氨酸和亮氨酸的培育基上。這樣,帶thr+和leu+的Hfr菌株對(duì)鏈霉素敏感;而帶有strr的F菌不能合成蘇氨酸和亮氨酸,都不能生長(zhǎng)。只需帶thr+和leu+的Hfr菌和帶有strr的F菌的重組子可以生長(zhǎng)。把中斷雜交的細(xì)菌放在完全培育基上培育,顯然供體、受體菌都能生長(zhǎng)。影響檢測(cè)。我們只需求把發(fā)生重組的重組子檢出。這就必需有一個(gè)可供選擇用的供體標(biāo)志基因。這樣可以認(rèn)出重組子,如在根本培育基中培育選擇thr+leu+重組子。這時(shí)thr+leu+為標(biāo)志基因,
7、可排除受體菌株,但供體菌還能繼續(xù)存在。為了不選擇供體細(xì)胞本身,供體細(xì)菌也應(yīng)該帶有一個(gè)特殊的標(biāo)志,能使本人不被選擇。例如供體菌對(duì)鏈霉素敏感,這樣當(dāng)結(jié)合體在含有鏈霉素的培育基上生長(zhǎng)時(shí),供體菌株就被殺死了。 如何檢出某一基因的重組子?把中斷雜交的細(xì)菌稀釋接種到含有鏈霉素的根本培育基上,如能構(gòu)成菌落,它的基因型必定是thr+leu+strr。由于只需這種重組子才干生長(zhǎng)。并闡明供體thr+和leu+已進(jìn)入受體并發(fā)生重組。我們稱在供體菌中被選擇的基因thr+和leu+為選擇標(biāo)志基因,而一直不被選擇的strs為反選擇標(biāo)志基因,而那些還沒有進(jìn)展選擇檢定的基由于非選擇標(biāo)志。 對(duì)每一時(shí)辰的重組 thr+leu+s
8、trr的菌落影印培育接種到不同的培育基上如乳糖lae+ 伊紅+美蘭紅色,反之那么是粉紅色的。記錄重組子中每一非選擇標(biāo)志出現(xiàn)的時(shí)間、出現(xiàn)的頻率和繼續(xù)時(shí)間,得圖Hfr的非選擇標(biāo)志基因進(jìn)入F-所需的時(shí)間,以及根據(jù)非選擇標(biāo)志在各個(gè)時(shí)間出現(xiàn)的頻率作圖。在發(fā)生重組的菌落中,如何檢別非選擇標(biāo)志基因各培育基分別具有不同的營(yíng)養(yǎng)缺陷或某種抑制性物質(zhì)存在。Wollman和Jacob對(duì)重組子thr+leu+strr進(jìn)展菌落影印培育實(shí)驗(yàn)。分析Hfr染色體上其它非選擇性標(biāo)志基因進(jìn)入F細(xì)菌的順序和所需時(shí)間分鐘,繪制連鎖圖。2. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析9從Hfr菌株某基因在F細(xì)菌中出現(xiàn)開場(chǎng),隨著時(shí)間的推移,具有該基因的菌落逐漸添加,
9、直到某一百分?jǐn)?shù)為止。而且某一基因出現(xiàn)的時(shí)間愈早,它到達(dá)的頻率愈高。 如疊氮化鈉抗性基因出現(xiàn)最早,在24分鐘時(shí)就到達(dá)大約90的F-菌落;半乳糖發(fā)酵基因出現(xiàn)最遲,即使在混和后60分鐘也只需30的菌落屬于能利用型。3.結(jié)論染色體從一端開場(chǎng),這一端稱為原點(diǎn)origin或O,以線性方式進(jìn)入F-細(xì)胞中。基因離原點(diǎn)越遠(yuǎn),進(jìn)入F細(xì)胞越遲。分開原點(diǎn)較遠(yuǎn)的基因,能夠在轉(zhuǎn)移過(guò)程停頓以前,仍未轉(zhuǎn)移,因而斜率較低,到達(dá)的最高值也較小。假設(shè)讓Hfr F雜交繼續(xù)進(jìn)行,長(zhǎng)達(dá)二小時(shí),然后使之中斷,這樣發(fā)現(xiàn)某些F受體轉(zhuǎn)變?yōu)镠fr。致育因子是最后轉(zhuǎn)移到受體的,并使它們成為供體其效率很低,是由于致育因子是線性染色體最后一個(gè)單位,它最
10、晚進(jìn)入F細(xì)胞。4. 作圖 Wollman和Jacob以為,根據(jù)中斷雜交技術(shù),用雜交后Hfr基因最初在受體細(xì)菌中出現(xiàn)的時(shí)間作為目的,可以作連鎖圖。遺傳間隔用時(shí)間分鐘為單位,譬如,ton在azi開場(chǎng)進(jìn)入F細(xì)胞后2分鐘進(jìn)入,那么azi和ton間的遺傳間隔為2單位,其它依此類推。細(xì)菌的交換過(guò)程 重組子(即重組類型)的產(chǎn)生是由于不同的DNA分子之間發(fā)生交換的結(jié)果。細(xì)菌重組子的產(chǎn)生是由于細(xì)菌染色體F-染色體與供體DNA分子部分Hfr染色體之間發(fā)生交換的結(jié)果。但發(fā)生單交換是沒有用的,只需發(fā)生偶數(shù)的交換才干產(chǎn)生有活性的重組子。 根據(jù)重組子頻率來(lái)確定兩基因之間的間隔并繪制出連鎖圖,這種根據(jù)重組頻率作圖的方法稱之
11、為重組作圖。ABbabaABABbaABba+ABba部分二倍體圖示:細(xì)菌基因的交換Hfr lac+ade+(strs) F- lac-ade-(strr)完全培育基混合培育根本培育基F-ade+ 菌落無(wú)腺嘌呤、加鏈霉素)EMB培育基影印培育F-ade+lac-基因間發(fā)生交換F-ade+lac+基因間未發(fā)生交換加乳糖實(shí)驗(yàn)方法: 將重組子菌落影印培育在加有曙紅和美藍(lán)的培育基上:以檢驗(yàn)?zāi)芊窭萌樘?。如能發(fā)酵乳糖lac+,菌落是紫紅色的。如不能利用lac-,菌落是粉紅色的。實(shí)驗(yàn)結(jié)果:親組合 52 重組合 15計(jì)算重組頻率: 重組菌落數(shù)/總菌落數(shù)100 % =(lac- ade+)/(lac+ ade
12、+ )+(lac- ade+) 100% = 15/(52+15) 100% 20% 知中斷雜交實(shí)驗(yàn)該兩個(gè)基因相距1分鐘, 重組作圖與中斷雜交作圖的圖距關(guān)系: 1分鐘圖距 20% 重組值前面提到,時(shí)間單位接近2分鐘時(shí),測(cè)得的基因間的間隔,不太可靠,故應(yīng)采用比較穩(wěn)定的重組作圖法。 Ecoli染色體全長(zhǎng):90分鐘;含有:3.6X106bp 20 90 1800 cM三點(diǎn)測(cè)交繪制基因圖譜F 因子 F 質(zhì)粒是帶有部分細(xì)菌染色體的F因子。Hfr經(jīng)過(guò)交換,可以構(gòu)成帶有部分細(xì)菌染色體的F 因子,而F 因子又可經(jīng)過(guò)交換整合到細(xì)菌染色體上的原來(lái)位置,回復(fù)到以前的Hfr形狀。F 因子連同它所帶有的部分細(xì)菌染色體可
13、一同轉(zhuǎn)移到F-細(xì)胞,并構(gòu)成部分二倍體。這一特性叫做性導(dǎo)。F 因子轉(zhuǎn)移到F-細(xì)胞的轉(zhuǎn)移速率近于F因子。但它把細(xì)菌染色體轉(zhuǎn)移過(guò)去的效率比Hfr低得多。不過(guò)Hfr的致育因子F因子極少進(jìn)入F-細(xì)胞。F 質(zhì)粒F 和F因子F 品系轉(zhuǎn)變成Hfr品系的頻率要高于F品系。F 變成Hfr時(shí)F 因子整合到一樣位點(diǎn)上,而F變成Hfr時(shí)可整合到不同位點(diǎn)。F F 高頻傳送特定的基因,構(gòu)成部分二倍體,而FF產(chǎn)生F但不轉(zhuǎn)移任何基因,或以107將宿主的基因轉(zhuǎn)移,所轉(zhuǎn)移的基因是不同的。 Hfr F將宿主的基因按順序轉(zhuǎn)入受體,產(chǎn)生重組子頻率較高,為10。但受體仍為F?。性別細(xì)菌狀態(tài)F因子狀態(tài)F-無(wú)F因子F+F因子為游離狀態(tài)HfrF
14、因子整合到宿主染色體上F帶有部分宿主染色體的F因子,為游離狀態(tài)小結(jié):1、細(xì)菌細(xì)胞的兩種性別、四種形狀: F+F-喪失雜交 F+Hfr整合到E.coli 染色體規(guī)那么脫離E.coli 染色體 FHfr 回復(fù)到Hfr 染色體不規(guī)那么脫離E.coli 染色體2、F+、 F-、Hfr、F的關(guān)系轉(zhuǎn)變關(guān)系F+F- 低頻重組HfrF- 高頻重組FF- 普通為低頻重組,但對(duì)所攜 帶的基因是高頻重組。重組頻率區(qū)別F,Hfr,F(xiàn)的接合對(duì)照 利用Hfr菌株,根據(jù)中斷雜交實(shí)驗(yàn)和基因重組實(shí)驗(yàn)及其它基因定位實(shí)驗(yàn)的結(jié)果,已繪制出的E.coli K12的環(huán)狀染色體圖。7.2 噬菌體的遺傳分析烈性噬菌體:噬菌體侵染細(xì)菌后,把宿
15、主菌的生物合成安裝接納過(guò)來(lái),合成更多的噬菌體,最后使細(xì)菌細(xì)胞烈解并釋放出很多子代噬菌體。這種使宿主菌烈解的噬菌體叫烈性噬菌體。如T2噬菌體。溫暖噬菌體:噬菌體侵染細(xì)菌后,細(xì)菌好象未被感染一樣能繼續(xù)增殖。如不經(jīng)誘導(dǎo)宿主菌不發(fā)生烈解,這種噬菌體叫溫暖噬菌體。這種景象叫溶源性,這樣的細(xì)菌叫溶源性細(xì)菌或溶源菌。如P22、P1和噬菌體。 噬菌體的繁衍噬菌斑的鑒定噬菌體遺傳特性的鑒定 一個(gè)噬菌斑中的噬菌體在遺傳上是均一的,相當(dāng)于一個(gè)克隆。由于噬菌體的基因型不同,噬菌斑可以是大的或小的,邊緣明晰的或模糊的;另外噬菌體的宿主范圍host range也能夠不同,有些噬菌體可以侵染和裂解某些細(xì)菌但不能侵染和裂解另
16、外一些細(xì)菌,根據(jù)這些就可以鑒定噬菌體遺傳特性。T2突變型的兩點(diǎn)測(cè)交T2突變型r-:快速溶菌,大界限清楚噬菌斑野生型r+:緩慢溶菌,小溶菌斑寄主范圍突變型h-:能感染E. Coil品系1、品系2。感染E. Coil品系1、品系2共培育,透明噬菌斑野生型h+:只能感染E. Coil品系1。感染E. Coil品系1、品系2共培育,半透明噬菌斑 T2突變型的兩點(diǎn)測(cè)交重組值(h+ r+)+(h- r-)/噬菌斑總數(shù)100 h+ r-h- r+感染品系1子代檢測(cè)重組感染品系1、2r-:大界限清楚,r+:??;h-:透明,h+:半透明溶源性的遺傳根底 細(xì)菌的溶源性可以一代代傳下去,是由于細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)含有無(wú)感染才干的噬菌體稱之為原噬菌體,prophage。溶源菌中的原噬菌體可以以游離方式存在細(xì)菌細(xì)胞中,也可以整合到細(xì)菌染色體上,究竟以哪一種方式存在,要視噬菌體的種類而定,P1以游離形狀存在,而以及80,等以整合形狀存在。但只需細(xì)菌細(xì)胞中侵入了噬菌體,就再也不會(huì)遭到同一種噬菌體的侵染,即對(duì)這種噬菌體有了免
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