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文檔簡介
1、生物分類學(xué) 生物分類學(xué)是研究生物分類的方法和原理的生物學(xué)分支。分類就是遵循分類學(xué)原理和方法,對生物的各種類群進(jìn)行命名和等級劃分。 歷史人類在很早以前就能識別物類,給以名稱。漢初的爾雅把動物分為蟲、魚、鳥、獸4類:蟲包括大部分無脊椎動物;魚包括魚類、兩棲類、爬行類等低級脊椎動物及鯨和蝦、蟹、貝類等,鳥是鳥類;獸是哺乳動物。這是中國古代最早的動物分類,四類名稱的產(chǎn)生時期看來不晚于西周。這個分類,和林奈的六綱系統(tǒng)比較,只少了兩棲和蠕蟲兩個綱。 生物分類古希臘哲學(xué)家亞里士多德采取性狀對比的方法區(qū)分物類,如把熱血動物歸為一類,以與冷血動物相區(qū)別。他把動物按構(gòu)造的完善程度依次排列,給人以自然階梯的概念。
2、17世紀(jì)末,英國植物學(xué)者雷曾把當(dāng)時所知的植物種類,作了屬和種的描述,所著植物研究的新方法是林奈以前的一本最全面的植物分類總結(jié),雷還提出“雜交不育”作為區(qū)分物種的標(biāo)準(zhǔn)。 近代分類學(xué)誕生于18世紀(jì),它的奠基人是瑞典植物學(xué)者林奈。林奈為分類學(xué)解決了兩個關(guān)鍵問題:第一是建立了雙名制,每一物種都給以一個學(xué)名,由兩個拉丁化名詞所組成,第一個代表屬名,第二個代表種名。第二是確立了階元系統(tǒng),林奈把自然界分為植物、動物和礦物三界,在動植物界下,又設(shè)有綱、目、屬、種四個級別,從而確立了分類的階元系統(tǒng)。 每一物種都隸屬于一定的分類系統(tǒng),占有一定的分類地位,可以按階元查對檢索。林奈在1753年印行的植物種志和1758
3、年第10版自然系統(tǒng)中首次將階元系統(tǒng)應(yīng)用于植物和動物。這兩部經(jīng)典著作,標(biāo)志著近代分類學(xué)的誕生。 林奈相信物種不變,他的自然系統(tǒng)沒有親緣概念,其中六個動物綱是按哺乳類、鳥類、兩棲類、魚類、昆蟲、蠕蟲的順序排列的。拉馬克把這個顛倒了的系統(tǒng)撥正過來,從低級到高級列成進(jìn)化系統(tǒng)。他還把動物區(qū)分為脊椎動物和無脊椎動物兩類,并沿用至今。 由于林奈的進(jìn)化觀點在當(dāng)時沒有得到公認(rèn),因而對分類學(xué)影響不大。直到1859年,達(dá)爾文的物種起源出版以后,進(jìn)化思想才在分類學(xué)中得到貫徹,明確了分類研究在于探索生物之間的親緣關(guān)系,使分類系統(tǒng)成為生物系譜系統(tǒng)分類學(xué)由此誕生。 基本內(nèi)容分類系統(tǒng)是階元系統(tǒng),通常包括七個主要級別:種、屬、
4、科、目、綱、門、界。種(物種)是基本單元,近緣的種歸合為屬,近緣的屬歸合為科,科隸于目,目隸于綱,綱隸于門,門隸于界。 隨著研究的進(jìn)展,分類層次不斷增加,單元上下可以附加次生單元,如總綱(超綱)、亞綱、次綱、總目(超目)、亞目、次日、總科(超科)、亞科等等。此外,還可增設(shè)新的單元,如股、群、族、組等等,其中最常設(shè)的是族,介于亞科和屬之間。 生物分類列入階元系統(tǒng)中的各級單元都有一個科學(xué)名稱。分類工作的基本程序就是把研究對象歸入一定的系統(tǒng)和級別,成為物類單元。所以分類和命名是分不開的。 種和屬的學(xué)名后常附命名人姓氏,以標(biāo)明來源,便于查找文獻(xiàn)。變種學(xué)名亦采取三名制,分類名稱要求穩(wěn)定,一個屬或種(包括
5、種下單元)只能有一個學(xué)名。一個學(xué)名只能用于一個對象(或種),如果有兩個或多個對象者,便是“異物同名”,必須于其中核定最早的命名對象,而其他的同名對象則另取新名。這叫做“優(yōu)先律”,動物和植物分類學(xué)界各自制訂了命名法規(guī),所以在動物界和植物界間不存在異物同名問題。“優(yōu)先律”是穩(wěn)定學(xué)名的重要措施。優(yōu)先律的起始日期,動物是1758年,植物是1820年,細(xì)菌則起始于1980年1月1日。 鑒定學(xué)名是取得物種有關(guān)資料的手段,即使是前所未知的新種類,只要鑒定出其分類隸屬,亦可預(yù)見其一定特征。分類系統(tǒng)是檢索系統(tǒng),也是信息存取系統(tǒng)。許多分類著作,如基于區(qū)系調(diào)查的動植物志,記述某一國家或地區(qū)的動植物種類情況,作為基本
6、資料,都是為鑒定、查考服務(wù)的。 物種指一個動物或植物群,其所有成員在形態(tài)上極為相似,以至可以認(rèn)為他們是一些變異很小的相同的有機(jī)體,它們中的各個成員間可以正常交配并繁育出有生殖能力的后代,物種是生物分類的基本單元,也是生物繁殖的基本單元。 物種概念反映時代思潮。在林奈時代,人們相信物種是不變的,同種個體符合于同一“模式”。模式概念淵源于古希臘哲學(xué)的古老的概念,應(yīng)用到整個分類系統(tǒng),概念假定所有階元系統(tǒng)中的各級物類單元,都各自符合于一個模式。 物種的變與不變曾經(jīng)是進(jìn)化論和特創(chuàng)論的斗爭焦點,是勢不兩立的觀點。但是,分類學(xué)的事實說明,每一物種各有自己的特征,沒有兩個物種完全相同;而每個物種又保持一系列祖
7、傳的特征,據(jù)之可以決定其界、門、綱目、科、屬的分類地位,并反映其進(jìn)化歷史。 分類工作的基本內(nèi)容是區(qū)分物種和歸合物種,前者是種級和種下分類,后者是種上分類。種群概念提高了種級分類水平,改進(jìn)了種下分類,其要點是以亞種代替變種。亞種一般是指地理亞種,是種群的地理分化,具有一定的區(qū)別特征和分布范圍。亞種分類反映物種分化突出了物種的空間概念。 變種這一術(shù)語過去用得很雜,有的指個體變異,有的指群體類型,意義很不明確,在動物分類中已廢除不用。在植物分類中,一般用以區(qū)分居群內(nèi)部的不連續(xù)變體。生態(tài)型是生活在一定生境而具有一定生態(tài)特征的種內(nèi)類型,常用于植物分類。人工選育的動植物種下單元稱為品種。 由于種內(nèi)、種間變
8、異錯綜復(fù)雜,分類學(xué)者對種的劃分有時分歧很大。根據(jù)外部形態(tài)的異同程度作為劃分物種依據(jù)而劃分的稱為形態(tài)種,由于對各種形態(tài)特征的重要性認(rèn)識不一,使劃分的種因人而異,尤其是分類學(xué)者對某些特征的“加權(quán)”常使它們比其他特征更具重要性,而造成主觀偏見。 一個物種或物類,以至整個植物界和動物界,都有自己的歷史。研究系統(tǒng)發(fā)育就是探索種類之間歷史淵源,以闡明親緣關(guān)系,為分類提供理論依據(jù)。盡管在分類學(xué)派中有綜合(進(jìn)化)分類學(xué)、分支系統(tǒng)學(xué)和數(shù)值分類學(xué)三大流派,但在其基本原理上都有許多共同之處,不過各自強(qiáng)調(diào)不同的方面而已。 特征對比是分類的基本方法。所謂對比是異同的對比:“異”是區(qū)分種類的根據(jù),“同”是合并種類的根據(jù)。
9、分析分類特征,首先要考慮反映共同起源的共同特征。但有同源和非同源的不同。例如鳥類的翼和獸類的前肢是同源器管,可以追溯到共同的祖先,是“同源特征”。恒溫在鳥獸是各別起源,并非來自共同祖先,是“非同源特征”。系統(tǒng)分類采用同源特征,不取非同源性狀。 林奈把生物分為兩大類群:固著的植物和行動的動物。兩百多年來,隨著科學(xué)的發(fā)展,人們逐漸發(fā)現(xiàn),這個兩界系統(tǒng)存在著不少問題,但直到20世紀(jì)50年代,仍為一般教本所遵從,基本沒有變動。 最初的問題產(chǎn)生于中間類型,如眼蟲綜合了動植物兩界的雙重特征,既有葉綠體而營光合作用,又能行動而攝取食物。植物學(xué)者把它們列為藻類,稱為裸藻;動物學(xué)者把它們列為原生動物,稱為眼蟲。中
10、間類型是進(jìn)化的證據(jù),卻成為分類的難題。 為了解決這個難題,在19世紀(jì)60年代,人們建議成立一個由低等生物所組成的第三界,取名為原生生物界,包括細(xì)菌、藻類、真菌和原生動物。這個三界系統(tǒng)解決了動植物界限難分的問題,但未被接受,整整100年后,直到20世紀(jì)50年代,才開始流行了一段時間,為不少教科書所采用。 生命的歷史經(jīng)歷了幾個重要階段,最初的生命應(yīng)是非細(xì)胞形態(tài)的生命,當(dāng)然,在細(xì)胞出現(xiàn)之前,必須有個“非細(xì)胞”或“前細(xì)胞”的階段。病毒就是一類非細(xì)胞生物,只是關(guān)于它們的來歷,是原始類型,還是次生類型,仍未定論。 從非細(xì)胞到細(xì)胞是生物發(fā)展的第二個重要階段。早期的細(xì)胞是原核細(xì)胞,早期的生物稱為原核生物(細(xì)苗
11、、藍(lán)藻)。原核細(xì)胞構(gòu)造簡單;沒有核膜,沒有復(fù)雜的細(xì)胞器。 從原核到真核是生物發(fā)展的第三個重要階段。真核細(xì)胞具有核膜,整個細(xì)胞分化為細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)兩個部分:細(xì)胞核內(nèi)具有復(fù)雜的染色體裝置,成為遺傳中心;細(xì)胞質(zhì)內(nèi)具有復(fù)雜的細(xì)胞器結(jié)構(gòu),成為代謝中心。由核質(zhì)分化的真核細(xì)胞,其機(jī)體水平遠(yuǎn)遠(yuǎn)高出于原核細(xì)胞。 從單細(xì)胞真核生物到多細(xì)胞生物是生命史上的第四個重要階段。隨著多細(xì)胞體形的出現(xiàn),發(fā)展了復(fù)雜的組織結(jié)構(gòu)和器官系統(tǒng),最后產(chǎn)生了高級的被子植物和哺乳動物。 植物、菌類和動物組成為生態(tài)系統(tǒng)的三個環(huán)節(jié)。綠色植物是自養(yǎng)生物,是自然界的生產(chǎn)者。它們通過葉綠素進(jìn)行光合作用,把無機(jī)物質(zhì)合成有機(jī)養(yǎng)料,供應(yīng)自己,又供應(yīng)異養(yǎng)生物
12、。菌類是異養(yǎng)生物,是自然界的分解者。它們從植物得到食料,又把有機(jī)食料分解為無機(jī)物質(zhì),反過來為植物供應(yīng)生產(chǎn)原料。動物亦是異養(yǎng)生物,它們是消費者,是地球上最后出現(xiàn)的一類生物。 即使沒有動物,植物和菌類仍可以存在,因為它們已經(jīng)具備了自然界物質(zhì)循環(huán)的兩個基本環(huán)節(jié),能夠完成循環(huán)過程中合成與分解的統(tǒng)。但是,如果沒有動物,生物界不可能這樣豐富多彩,更不可能產(chǎn)生人類。植物、菌類和動物代表生物進(jìn)化的三條路線或三大方向。 當(dāng)前最流行的分類是一種五界系統(tǒng)。五界系統(tǒng)反映了生物進(jìn)化的三個階段和多細(xì)胞階段的三個分支,是有縱有橫的分類。它沒有包括非細(xì)胞形態(tài)的病毒在內(nèi),也許是因為病毒系統(tǒng)地位不明之故。它的原生生物界內(nèi)容龐雜,
13、包括全部原生動物和紅藻、褐藻、綠藻以外的其他真核藻類,包括了不同的動物和植物。 研究領(lǐng)域生物分類學(xué)是研究生物分類理論和方法的學(xué)科。 它包括分類、命名和鑒定三個領(lǐng)域。分類是根據(jù)生物的相似性和親緣關(guān)系,將生物歸入不同的類群(分類單元);命名是根據(jù)國際生物命名法給生物分類單元以科學(xué)的名稱;鑒定則是確定一種生物屬于已經(jīng)命名的分類單元的過程。因此,概括來說,生物分類學(xué)是對各類生物進(jìn)行鑒定、分群歸類,按分類學(xué)準(zhǔn)則排列成分類系統(tǒng),并對已確定的分類單元進(jìn)行科學(xué)命名的學(xué)科。其目的是探索生物的系統(tǒng)發(fā)育及其進(jìn)化歷史,揭示生物的多樣性及其親緣關(guān)系,并以此為基礎(chǔ)建立多層次的、能反映生物界親緣關(guān)系和進(jìn)化發(fā)展的“自然分類系
14、統(tǒng)”。這樣就有利于人們認(rèn)識生物,了解各個生物類群之間的親緣關(guān)系,從而掌握生物的生存和發(fā)展規(guī)律,為更廣泛、更有效地保護(hù)和利用自然界豐富的生物資源提供方便。 生物分類學(xué)研究生物類群間的異同以及異同程度,闡明生物間的親緣關(guān)系、進(jìn)化過程和發(fā)展規(guī)律。 分類理論知識存在于比較分類之間。對生物的分類叫做系統(tǒng)學(xué)(systematics)或分類學(xué)(taxonomy),這種分類應(yīng)該反映不同生物體間的進(jìn)化樹關(guān)系(evolutionary tree)。分類學(xué)把生物劃分為不同的群,而系統(tǒng)學(xué)試圖尋找生物之間的關(guān)系。占主導(dǎo)地位的分類法是林奈氏分類系統(tǒng)(linnaean),它包括一個屬名和種加詞。關(guān)于如何為生物命名的原則有很
15、多國際協(xié)議,例如國際植物命名法規(guī)(international code of botanical nomenclature,簡稱icbn)、國際動物命名法規(guī)(international code of zoological nomenclature,簡稱iczn)以及國際細(xì)菌命名法規(guī)(international code of nomenclature of bacteria,簡稱icnb)。第四版的生物命名法規(guī)(biocode)草案在1997年出版,它試圖在三個領(lǐng)域標(biāo)準(zhǔn)化命名,但現(xiàn)在還沒有被正式采納。國際病毒命名和分類法規(guī)(international code of virus classi
16、fication and nomenclature,簡稱icvcn)是不屬于生物命名法規(guī)的。 生物分類學(xué) 傳統(tǒng)上,生物被劃分為五界,它是由sahn等于1949年提出的: 原核生物界原生生物界真菌界植物界動物界 copeland提出過四界說: 菌界(細(xì)菌和藍(lán)藻)原生生物界植物界動物界 也有人使用三域說。這種分類方法反映了細(xì)胞是否有核以及細(xì)胞膜和細(xì)胞壁的差異。 古細(xì)菌真性細(xì)菌真核生物 區(qū)別生物和非生物是困難的,因為存在一些細(xì)胞內(nèi)的"寄生蟲"(即"病毒"),而它們在細(xì)胞外并不表現(xiàn)出活躍的生命形式。 病毒類病毒朊病毒 在生物學(xué)中,雙名法是為生物命名的標(biāo)準(zhǔn)。正如&
17、quot;雙"所說的,為每個物中命名的名字有兩部分構(gòu)成:屬名和種加詞。屬名通常大寫,種加詞則不用。在印刷時使用斜體。例如:homo sapiens。通常屬名可以縮寫,例如e. coli。屬名通常使用拉丁文名詞,如果引用其它語言的名詞,則必須拉丁化。種加詞大多為形容詞,也可以為名詞的所有格或為同位名詞。當(dāng)形容詞作種加詞時,要求其性、數(shù)、格與屬名一致。例如板栗castanes millissima bl., castanes 栗屬(陰性、單數(shù)、第一格)。 這個命名法的好處是,即使在不同的語言中一個物種有很多不同的命名,但是它們在科學(xué)上的命名都是唯一一致的。最理想的情況是,科學(xué)家在向其他科
18、學(xué)家描述他們的工作時可以準(zhǔn)確明白的表達(dá)他們想表達(dá)的物種。命名法試圖穩(wěn)定物種的命名,但是事實上并不是這樣的:一些物種根據(jù)不同的分類法的不同分類和位置存在有幾個名字,這取決于不同的看法。傳統(tǒng)的可以根據(jù)命名法,新的發(fā)現(xiàn)可以根據(jù)分子系統(tǒng)發(fā)生。 林奈發(fā)明了這種分類,但是一個普遍的誤解是他發(fā)明了雙名法。事實上這個命名法可以上溯到bauhins。林奈只是把它普及開來。 生物主要分類等級是門(phylum)、綱(class)、目(order)、科(family)、屬(genus)、種(species)。種以下還有亞種(subspecies,縮寫成subsp.),植物還有變種(variety,縮寫成var.)。
19、有時還有一些輔助等級,實在主要分類等級術(shù)語前加前綴超(super-)、亞(sub-).在亞綱、亞目之下有時還分別設(shè)置次綱(infraclass)和次目(infraorder)等。 以大家熟知的felis domesticus(家貓)這一種的名稱為例,其分類系統(tǒng)和名稱如下: 界 animalia 動物界 門 chordata 脊索動物門 亞門 vertebrata 脊椎動物亞門 綱 mammalia 哺乳綱 目 carnivora 食肉目 科 felidae 貓科 屬 felis 貓 種 felis domesticus 家貓 具體分類簡介域 (生物)生物科學(xué)分類法中最高的類別。所有生物原分為兩
20、域:沒有細(xì)胞核的生物(細(xì)菌和古細(xì)菌)被分入原核生物域,其他為真核生物域。1970年代carl woese發(fā)現(xiàn)細(xì)菌和古細(xì)菌應(yīng)分為兩域,因在以下方面很不相同: 細(xì)胞墻結(jié)構(gòu)和化學(xué)性質(zhì) 細(xì)胞膜結(jié)構(gòu) 新陳代謝功能原核生物 原核生物 (原核生物域)原核生物是一些由無細(xì)胞核的細(xì)胞組成的單細(xì)胞或多細(xì)胞的低等生物。主要包括細(xì)菌、支原體和植物中的藍(lán)藻門。一般沒有細(xì)胞內(nèi)膜,沒有染色體和細(xì)胞核膜。 原核生物一般以為地球上最早的生命是原核生物,和現(xiàn)存的古細(xì)菌相似。原核生物化石已經(jīng)在很老的巖石里發(fā)現(xiàn)了。也曾有人說在一個火星來的隕石里也發(fā)現(xiàn)了原核生物的化石,但是不很可信。 原核細(xì)胞基本上沒有膜包細(xì)胞器。 原核生物和真核生物
21、的細(xì)胞壁: 1.細(xì)菌細(xì)胞的質(zhì)膜外有細(xì)胞壁,重量約占細(xì)胞干重的10%20%。其主要成分是肽聚糖。此外,有的細(xì)菌的細(xì)胞壁還有胞壁酸和特殊的脂類化合物。 細(xì)菌的細(xì)胞壁有以下功能: (1)保護(hù)細(xì)胞,能承受相當(dāng)大的壓力,如革蘭氏陽性菌,可承受2 kpa的壓力。還能使細(xì)菌細(xì)胞不會由于細(xì)胞質(zhì)濃度較高而破裂。 (2)保持細(xì)胞的固有形態(tài)。 (3)有過濾作用,如相對分子質(zhì)量大于10 000的物質(zhì)就不能通過。 (4)可為某些細(xì)菌的鞭毛運動提供可靠的支點。 2.藍(lán)藻的細(xì)胞壁的主要成分也是肽聚糖等,此外還含有氨基酸和胞壁肽氨基酸。 3.真核生物植物細(xì)胞的細(xì)胞壁是具有一定硬度和彈性的固體結(jié)構(gòu)。其主要成分是纖維素(在初生壁
22、上還有半纖維素和果膠質(zhì)),它形成了細(xì)胞壁的網(wǎng)狀框架。在電子顯微鏡下可以看到這種框架是由微纖絲系統(tǒng)組成。在完整的壁上,在微纖絲之間的空間,可以由其他物質(zhì)所填充。 纖維素分子是由8 00015 000個葡萄糖基(c6h10o5)通過糖苷鍵相互連接而成的多聚鏈,鏈間葡萄糖的羥基之間極易形成氫鍵。纖維素分子束聚集成為較大的單位微纖絲,進(jìn)而再聚集成較粗的纖絲大纖絲。使得完整的纖維具有高度不溶于水的性質(zhì)。使細(xì)胞壁牢固并具有一定形狀。 在細(xì)胞的生長分化過程中,細(xì)胞壁不僅可以擴(kuò)展和加厚,并且可以由原生質(zhì)(對植物細(xì)胞來說稱原生質(zhì)體)合成一些物質(zhì)滲入到纖維素的細(xì)胞壁框架內(nèi),因而改變細(xì)胞壁的性質(zhì),使細(xì)胞壁完成一定的
23、功能。例如,纖維素細(xì)胞壁的框架中添加了木質(zhì)素而木質(zhì)化,就增加細(xì)胞壁的硬度,增強(qiáng)細(xì)胞的支持力量。又如,在表面細(xì)胞壁中添加了角質(zhì)(脂類化合物),使角質(zhì)化的細(xì)胞壁透水性降低,增強(qiáng)了細(xì)胞壁防止水分損失的作用。栓質(zhì)化(栓質(zhì)為脂類物質(zhì))的細(xì)胞壁,增強(qiáng)了不透水、不透氣的性能,增強(qiáng)了保護(hù)作用。水稻、小麥、玉米等作物的莖、葉表皮細(xì)胞發(fā)生硅質(zhì)化(滲入了二氧化硅),使細(xì)胞壁硬度增加,加強(qiáng)了作物莖桿的支持作用,等等。細(xì)胞壁上有胞間連絲,這些胞間連絲較多地出現(xiàn)在細(xì)胞壁沒有加厚的位置上,這有利于細(xì)胞間的物質(zhì)交換。 真核生物(真核生物域)真核生物是所有單細(xì)胞或多細(xì)胞的、其細(xì)胞具有細(xì)胞核的生物的總稱,它包括所有動、植物、真菌和被規(guī)入原生生物的單細(xì)胞生物。這些生物的共同點是它們的細(xì)胞內(nèi)含有細(xì)胞核以及其它細(xì)胞器。此外它們的細(xì)胞具有細(xì)胞骨架來維持其形狀和大小。所有的真核生物都是從一個類似于細(xì)胞核的細(xì)胞(胚胎、胞子等)發(fā)育出來的。其它細(xì)胞中沒有細(xì)胞核的生物被通稱為原核生物。 生物分類學(xué)真核生物的另一個特點是它們的細(xì)胞在制造蛋白質(zhì)時可以用同一段染色體制造不同的蛋白質(zhì)。這個功能在術(shù)語中被稱為alternatives s
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