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1、第第6 6章章 細(xì)菌的分類(lèi)與命名細(xì)菌的分類(lèi)與命名上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院韓立中韓立中概 述 細(xì)菌分類(lèi)學(xué)(Bacterial taxonomy)是微生物分類(lèi)學(xué)的一個(gè)分支,是對(duì)細(xì)菌進(jìn)行分類(lèi)分類(lèi)(classification)鑒定鑒定(identification)、命名命名(nomenclature)的一門(mén)科學(xué)1.分類(lèi)分類(lèi) 分類(lèi)的任務(wù)是通過(guò)收集大量的個(gè)體資料,經(jīng) 過(guò)科學(xué)的歸納、整理,使之形成一個(gè)完整的 分類(lèi)系統(tǒng)。 基本概念分類(lèi)理論和方法:(1)表型與系統(tǒng)進(jìn)化學(xué)分類(lèi)(phenetic and phylogenetic classifications)理論:在表型與系統(tǒng)進(jìn)化學(xué)分類(lèi)理論中,表
2、型分類(lèi)突出菌株間的相互聯(lián)系,不包含菌株間的進(jìn)化關(guān)系及與祖細(xì)胞的聯(lián)系,系統(tǒng)進(jìn)化分類(lèi)則突出菌株與祖細(xì)胞的關(guān)系。表型與系統(tǒng)進(jìn)化學(xué)分類(lèi)理論具有方法穩(wěn)定、客觀(guān)、可預(yù)見(jiàn)性,且適用于所有細(xì)菌的特點(diǎn),在分類(lèi)實(shí)踐中,將表型與系統(tǒng)進(jìn)化學(xué)分類(lèi)的優(yōu)點(diǎn)相結(jié)合的分類(lèi)方法也稱(chēng)為多相分類(lèi)學(xué)(polyphasic taxonomy)。分類(lèi)理論和方法:(2)分類(lèi)方法:基因分型方法,如DNA雜交法、rRNA寡核苷酸分析和鳥(niǎo)嘌呤加胞嘧啶堿基比例的測(cè)定;表型分類(lèi)法,如傳統(tǒng)分類(lèi)法數(shù)值分類(lèi)法及自動(dòng)細(xì)菌鑒定法等;化學(xué)分類(lèi)學(xué)法等。分類(lèi)等級(jí):界(Kingdom )門(mén)(Division)綱(class )目(Order )科(Family )屬(
3、Genus )種(Species )2.命名命名 在分類(lèi)基礎(chǔ)上,給予每種細(xì)菌一個(gè)科學(xué)名稱(chēng),使之在生產(chǎn)實(shí)踐、臨床實(shí)踐和科學(xué)研究工作中相互交流成為可能。按照細(xì)菌命名的法規(guī),能保證所有的科研工作者以同樣方式給予細(xì)菌命名。命名法命名法 細(xì)菌科學(xué)名稱(chēng)(學(xué)名)的命名法采用生物雙名法(binominal nomenclature)。具備拉丁化文字的形式和明確的分類(lèi)等級(jí)兩個(gè)特點(diǎn),即由一個(gè)屬名和一個(gè)種名構(gòu)成。 細(xì)菌學(xué)名的中文譯名:種名在前,屬名在后。如:Mycobecterium tuberculosis(結(jié)核分枝桿菌)Salmonella typhi(沙寒沙門(mén)菌) 細(xì)菌鑒定細(xì)菌鑒定(1)定義:將未知細(xì)菌按分類(lèi)原則放入系統(tǒng)中某一適當(dāng)位置和已知細(xì)菌比較其相似性,用對(duì)比分析方法確定細(xì)菌的分類(lèi)地位。若與已知細(xì)
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