MicroRNAs研究進(jìn)展(mRNA及其靶標(biāo)的生物信息學(xué)鑒定)_圖文

1、 萬方數(shù)據(jù):18絲:現(xiàn)岱生物醫(yī)堂進(jìn)展她叢壘墮曼壅!塾壁!堡壁魚婪蟄堡鯉魚鰱鯉量嬰翻壘巫量煎墮塑壘魚魚Z盟!壘b!窒準(zhǔn),反復(fù)檢測和改進(jìn)這套運(yùn)算法則,可以得到這部分microRNAs的準(zhǔn)確的分?jǐn)?shù),再將另一批已知的lnicroI喇As作為未知序列,輸人計算機(jī)為其打分,這兩批已知的InicroIAs的分?jǐn)?shù)可用來評估這套運(yùn)算法則的敏感性和特異性。大多數(shù)預(yù)測程序的依據(jù)是不同物種間IIlicro鼢蛆s的高度保守性,計算機(jī)檢測到的lnicroRNAs具有同源性。這種方法可以濾除假陽性的序列,但在檢測保守的microIAs時有其局限性。MicroI州As的計算機(jī)鑒定對研究人員來說是一個巨大的挑戰(zhàn)。Micro砌q

2、As并沒有足夠的特征可以進(jìn)行精確的鑒定,多數(shù)情況下嚴(yán)格的檢測標(biāo)準(zhǔn)設(shè)置會降低方法的敏感性。要得到更令人滿意的準(zhǔn)確度,適宜的方法是將nlicmI冰As多個特征結(jié)合起來,并給予每個特征不同的權(quán)重。這需要反復(fù)的精細(xì)的調(diào)節(jié),通過反復(fù)測定方法的精確度,將不同特征的權(quán)重調(diào)整到合適的大小。通過運(yùn)算獲得高分的序列需要驗證其在不同組織和細(xì)胞中的表達(dá)。預(yù)測的microRNAs如果用生化方法檢測不到,并不代表生物信息學(xué)的預(yù)測方法是錯誤的。導(dǎo)致這種結(jié)果的原因可能是microI斟As在被檢測的組織中不表達(dá),或僅在細(xì)胞周期的某個階段表達(dá),或者micmRNAs的表達(dá)量很低。后者很難解決,因為低豐度tIlicroRNA通常與另

3、一個高表達(dá)的rnicroRNA很相似。高豐度IIlicro鼢她的表達(dá)會掩蓋相似的低豐度micro心忱的表達(dá),特別是用PcR進(jìn)行擴(kuò)增時。1.2MicmRNA預(yù)測的運(yùn)算程序幾種優(yōu)秀的計算機(jī)化micfoRNA預(yù)測方法已被建立和應(yīng)用“。研究人員使用mi黜eeker(計算機(jī)化的micmRNA預(yù)測程序辨認(rèn)48個果蠅序列,確認(rèn)24個序列為microRNA?！癕old”是在兩種果蠅中發(fā)現(xiàn)的高度保守的一種發(fā)夾結(jié)構(gòu),111i黜eeker 利用“Mfold”評估與已知的IIlicroRNAs的核苷酸序列有差別的RNA折疊片段是否為micmRNA【”】。另一種程序Mirscan鑒定出30個線蟲microRNAs,38

4、個Berezikov et a1.發(fā)現(xiàn)micro鼢慵發(fā)夾環(huán)莖部的核苷酸序列具有更高的保守性。利用這個特征與IIlicroRNA其它已知的特征相結(jié)合,Berezikov et a1.確認(rèn)了16個新的人類micmIAs。最近,一種新的lIlicroI斟A檢測技術(shù)被建立。研究人員利用該技術(shù)確認(rèn)了89個人類microRNA,其中54個為靈長類特有的商croRNA。新發(fā)現(xiàn)的lllicroRNAs是屬于靈長類特有的兩個大基因簇,不同于此前已知的其他人類rnjcroRNA基因簇那些簇在所有哺乳動物都有。兩大基因簇的其中一個簇定位在19號染色體上,并且只在胎盤中表達(dá)。它是目前為止報道過的最大的nlicroRN

5、A簇,包括54個新的micmRNA。第二個基因簇定位在x染色體,包括10個rnicmRNA,它們只在睪丸中表達(dá)。這種技術(shù)與上述的方法并不相同,它不依賴于mi. croRNA的序列保守性,因此可以發(fā)現(xiàn)靈長類特有的商croR-NA。其原理是先采用“RNAFold掃描整個基因組非編碼區(qū),篩選出的發(fā)夾結(jié)構(gòu)通過微陣列技術(shù)和測序技術(shù)進(jìn)行鑒定。它可以發(fā)現(xiàn)基因組中大量的成簇存在的rnicroRNAs舊。1.3Micr0RNA的鑒定技術(shù)由于micmRNAs一類很小的分子,表達(dá)量也很低,多數(shù)情況下與其它的IIlicroRNAs序列高度相似,檢測它的表達(dá)非常困難。傳統(tǒng)的基因表達(dá)技術(shù)的敏感性和特異性都達(dá)不到檢測mic

6、roRNA的水平。過去的幾年里,幾種鑒定方法取得了重大的進(jìn)展,已經(jīng)能夠解決這個問題?？寺『蜏y序?qū)︻A(yù)測的micmRNA是一種最有效的鑒定方法。下面是所使用的幾種克隆方法的簡要描述。隨機(jī)克隆和測序在最初是主要的檢測方法,現(xiàn)在作為間接的方法和microR-NA的生物信息學(xué)預(yù)測相結(jié)合以鑒定microRNA。預(yù)測的micfoRNA平行的隨機(jī)克隆和測序,再將結(jié)果加以比較。這種方法不能鑒定出低表達(dá)量的IIlicmRNA【10】。部分?jǐn)U增測序是一種PcR擴(kuò)增技術(shù)。它使用一條部分覆蓋lllicroRNA序列的引物,另一條引物為cDNA克隆的適配體,現(xiàn)已成為預(yù)測的microRNA主要的測序方法。隨機(jī)克隆和測序無法

7、鑒定的microRNA 也能被其檢測。但該方法有一缺點,它與預(yù)測的111icroI斟A配對的引物有幾個核苷酸是游離的,這可能無法區(qū)分序列高度相似的111icmRNA【Iq。序列特異性克隆和測序是新被建立的方法,克服了上述的缺點。它首先根據(jù)預(yù)測的microRNA設(shè)計一段生物素標(biāo)記的寡聚核苷酸,再用這段核苷酸去捕獲cDNA文庫(來源于小鼢叮A中同源的micmRNA,用被捕獲的cDNA進(jìn)行擴(kuò)增和測序”。不同的雜交實驗可間接的鑒定預(yù)測的micmRNA。Nonllem bl吣被視為鑒定預(yù)測的IIlicmRNA的金標(biāo)準(zhǔn),然而Nonhem blots已被證明在鑒定少見的IIlicroRNA時并不總是有效閽。

8、幾種依賴于雜交技術(shù)的高通量的鑒定方法正被應(yīng)用。這些方法包括:膜陣列,這種方法利用放射性標(biāo)記的探針檢測互補(bǔ)的micmRNA,是一種廉價、有效的方法,但對大量的檢測并不合適;微陣列,是一種敏感和特異的方法,可以高通量的檢測microRNA,多種micro心隊可被同時鑒定。2Micro鼢認(rèn)靶標(biāo)的預(yù)測和鑒定2.1Micro對妊靶標(biāo)的預(yù)測與新的刪A的頻頻發(fā)現(xiàn)相比,miRNA的功能研究相對緩慢。到目前為止,在發(fā)現(xiàn)的1300多個miRNA中,確定功能的miRNA僅有十個。導(dǎo)致lIliRNA功能研究進(jìn)展緩慢的非常重要的原因是mjRNA的作用靶標(biāo)難以確定。早期觚cr0RNA靶標(biāo)的識別主要通過篩查micmRNA的

9、互補(bǔ)序列。這種方法更有利于植物lIlicr0RNA靶標(biāo)的識別,因為植物microRNA與其靶標(biāo)的互補(bǔ)性比動物micmRNA的互補(bǔ)性高。當(dāng)前,通過實驗方法確定IIliRNA的作用靶標(biāo)非常耗時,尚無高通量的靶標(biāo)鑒定方法,因此,通過理論方法預(yù)測miRNA的作用靶標(biāo)成為當(dāng)前識別miI礬A作用靶標(biāo)的較為理想的途徑。MicroRNA靶標(biāo)的計算機(jī)預(yù)測比micmRNA的預(yù)測更困難。首先,缺乏足夠的已知111icroRNA靶標(biāo)作標(biāo)準(zhǔn),其次,mi-croRNA靶標(biāo)的鑒定更復(fù)雜,沒有高通量的鑒定方法,實際上僅有一小部分預(yù)測的lllicr0鼢峨靶標(biāo)被鑒定【21】。常用的的預(yù)測程序有Targetscan aIld Ta

10、瑪etscaIls,m派anda,DIANA-microT,RN舳,b耐,Pic.I打等等。雖然現(xiàn)有的幾種預(yù)測程序在技術(shù)細(xì)節(jié)上有所不同,但它們都建立在相同的原理上,即micr0RNA與靶標(biāo)的結(jié)合機(jī)制。這種機(jī)制包括: MicroRNA靶標(biāo)的5末端6.8個保守核苷酸,下游的保守萬方數(shù)據(jù)巫叢生物醫(yī)堂進(jìn)屋里圈旦!墜i魚坐壁照:墜曼!壁塾里!鰓艘璺璺魚§魚亟壁嬰壁i鯉皇蚴皇星QQZ!盟Q:!星:18竺§:腺苷酸19】。研究幾種已知的IIlicroRNAs的單核苷酸突變與其靶標(biāo)的結(jié)合模式,研究人員發(fā)現(xiàn)micmIA 5末端68個核苷酸是microRNA與靶標(biāo)結(jié)合的關(guān)鍵,對microRNA

11、抑制其靶標(biāo)的表達(dá)是必需的。MicmI斟A靶標(biāo)的5末端不完全與IIlicroRNA 配對,計算機(jī)分析指出通常與之相連的下游核苷酸為腺苷酸口嘲。代償性的3末端。3末端作為5末端不完全配對的代償?，F(xiàn)已發(fā)現(xiàn)兩種類型的microRNA結(jié)合位點:5優(yōu)勢位點,IIli.croRNA通過該位點與靶標(biāo)的5末端配對,需要或不需要3端的結(jié)合;3代償位點,需要3端的結(jié)合以支持5端不完全的配對嗍。多個結(jié)合位點及其上下游序列。核苷酸突變研究揭示多個micmRNA與靶標(biāo)的位點相結(jié)合,以協(xié)同、聯(lián)合的形式發(fā)揮功能瞄】。mIA靶標(biāo)的結(jié)構(gòu)。最近的研究發(fā)現(xiàn)111】黼A靶標(biāo)結(jié)合位點的二維結(jié)構(gòu)是不穩(wěn)定的,其相鄰結(jié)構(gòu)也是不穩(wěn)定的,5結(jié)合位

12、點至少有3個核苷酸不參與結(jié)合。這種結(jié)構(gòu)有利于micmR.NA的接近和結(jié)合陽。2.2MicmRNA靶標(biāo)的鑒定目前,尚無簡單、高通量的方法鑒定rIlicmRNA靶標(biāo),通過程序預(yù)測到的IIlicroRNA靶標(biāo)一般用生物學(xué)和信息學(xué)方法相聯(lián)合進(jìn)行鑒定。常用的生物學(xué)鑒定方法包括:報告基因構(gòu)建,突變研究,基因沉默技術(shù)【4】,經(jīng)典的遺傳學(xué)技術(shù)【2。大約30個動物microRNA靶標(biāo)使用這些方法進(jìn)行了鑒定。雖然生物學(xué)方法只鑒定了很小一部分的micr0RNA靶標(biāo),但證實了預(yù)測程序可有效識別microRNA靶標(biāo)。3結(jié)論最近幾年,microRNAs的預(yù)測獲得了巨大的進(jìn)展。而.cmIA的預(yù)測程序和microIA鑒定技術(shù)

13、的結(jié)合,為我們打開了通向基因調(diào)節(jié)世界的大門。敏感的生物學(xué)鑒定技術(shù)可以指導(dǎo)預(yù)測程序的微調(diào),而這些技術(shù)的發(fā)展又依賴于有效的預(yù)測程序。計算機(jī)預(yù)測程序和高通量生物學(xué)鑒定技術(shù)的整和將是最有效的micmRNA探測技術(shù)。從2003年33個人類IIlicr0RNAs被發(fā)現(xiàn),到最近680個microRNAs等待鑒定【18】,人們對IllicroRNA的研究不斷深入,高效的microRNA預(yù)測和鑒定技術(shù)將是了解和探索micmR-NAs功能的關(guān)鍵。參考文獻(xiàn)(References1JOHNSTON RJ aIld HoBEI汀O.A micmRNA commlling le削rightneumnalasmme缸y i

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15、ll,1993,75:8438545】REINHART BtJ,sLAcK FJ,BAsSON M,eta1.The 2l-nucleotidelet7RNAregulatesdeVelopmentaltiminginCaenorhabditiselegansJ】.NatIlre,2000,403:901-9066BRENNECKE J,HIPFNER DR,sTARK A,eta1.Bantarnencodesadevelopmentally rcgulated microRNA that contmls cellprolifbration and regulatestheproapopto

16、tic genehid inDmsophila【J】.Cell,2003,l】3:25.367】(U P,VERNooY SY,GU0M,et a1.The Dros叩hila microI心漁LP,、礬sTEIN EG,eta1.An abundant class oftinyRNAs麗th pmbable regIllatory mles in Caenorhabditis eleg髓sJ】Science,2001,294:858862【9】LEE RC and AMBROS V.An extensive classof sman RNAs inCaenorhabditiselegaIls

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21、】LES BP,BURGE CB and BARTEL DP.conserved seed pairing,often nall:ked byad即osiIles,砌cates thatthousands of humangenesa|.emicroI心漁targetsJ】.Cell,2005,120:1520【20GI己FTHS-JoNES S.1k microRNA regis時【J】.Nucleic Acids Res,2004.32:D109-1l l21UwIS BP,SHm,JoNEs-RHoADES Mw,et a1.Prediction ofmammalian micmRNA

22、targets【J】.Cell,2003,115:78779822】KL00STERMAN wP,w1勘呵HOLDs E,KETT礬G RF.et a1.sub.straterequircments for 1ct-7如nction in me developing zebmfish embrroJ】.Nucleic Acids R船,2004,32:6284629l23】BRENNEcKE J,STARK氏RusSELLRB,eta1.Principles of Micm砌妊target reco髓itionJ】.PLoS.Biol,2005,3:e8524】KIAK017M,NELSoN

23、PT,K01IIcANoV A,et a1.A combinedcompu詛tional experimental approach prcdicts humall micmRNAt辨gets【J.Genes Dcv.2004,18:11651178【2習(xí)DoENCH JG and SHARP PA.Specifjcityo矗nicroRNAtarget selection in仃=anslationalr印ressionJ.GenesDcv,2004,18:504-51126LEWIS BP,BURGE CB and BARTEl DP.Conseed seed pairing,often

24、naIlked by adenosiIIes,indicates tllatthousands of humangenesareMicroRNAta】苫ets【J.cell.2005,120:152027ROB烈SH,LI Y aIld PADGETTRW.Incorporating smlcture to prcdictmicroI心mtargetsJ.PNAS,2005,102:4006.4009萬方數(shù)據(jù) MicroRNAs研究進(jìn)展作者:李廣平, 邱長春, LI Guang-ping, QIU Chang-chun作者單位:中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所分子生物學(xué)重點實驗室,北京,10000

25、5刊名:現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展英文刊名:PROGRESS IN MODERN BIOMEDICINE年,卷(期:2007,7(12引用次數(shù):0次參考文獻(xiàn)(27條1.JOHNSTON RJ.HOBERT O A microRNA controlling left/right neuronal asymmetry in Caenorhabditis elegans 20032.LIM LP.GLASNER ME.YEKTA S Vertebrate microRNA genes 20033.POY M.N A pancreatic islet-specific microRNA regulates in

26、sulin secretion 20044.LEE RC.FEINBAUM RL.AMBROS V The C.elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14 19936.BRENNECKE J.HIPFNER DR.STARK A Bantam encodes a developmentally regulated microRNA that controls cell proliferation and regulates the proapoptoti

27、c gene hid in Drosophila 20037.XU P.VERNOOY SY.GUO M The Drosophila microRNA Mir-14 suppresses cell death and is required for normal fat metabolism 20038.LAU NC.LIM LP.WEINSTEIN EG An abundant class of tiny RNAs with probable regulatory roles in Caenorhabditis elegans 20019.LEE RC.AMBROS V An extens

28、ive class of small RNAs in Caenorhabditis elegans 200110.LAGOS-QUINTANA M.RAUHUT R.LENDECKEL W Identification of novel genes coding for small expressed RNAs 200111.LAGOS-QUINTANA M.RAUHUT R.YALCIN A Identification of tissue-specific MicroRNAs from mouse 200212.LAI EC.TOMANCAK P.WILLIAMS RW Computati

29、onal identification of Drosophila microRNA genes 200313.MATHEWS DH.SABINA J.ZUKER M Expanded sequence dependence of thermodynamic parameters improves prediction of RNA secondary structure 199914.GRAD Y.AACH J.HAYES GD Computational and experimental identification of C.elegans microRNAs 200315.BARAD

30、O MicroRNA expression detected by oligonucleotide microarrays:system establishment and expression profiling in human tissues 200416.BEREZIKOV E.GURYEV V.VAN DE BJ Phylogenetic shadowing and computational identification of human microRNA genes 200517.SEMPERE LF.FREEMANTLE S.PITHA-ROWE I Expression pr

31、ofiling of mammalian microRNAs uncovers a subset of brain-expressed microRNAs with possible roles in murine and human neuronal differentiation 200418.BENTWICH I Identification of hundreds of conserved and nonconserved human microRNAs 200519.LEWIS BP.BURGE CB.BARTEL DP Conserved seed pairing,often fl

32、anked by adenosines,indicates thatthousands of human genes are microRNA targets 200520.GRIFFTHS-JONES S The microRNA registry 200421.LEWIS BP.SHIH IH.JONES-RHOADES MW Prediction of mammalian microRNA targets 200322.KLOOSTERMAN WP.WIENHOLDS E.KETTING RF Substrate requirements for let-7 function in th

33、e developing zebrafish embryo 200423.BRENNECKE J.STARK A.RUSSELL RB Principles of MicroRNA-target recognition 200524.KIRIAKIDOU M.NELSON PT.KOURANOV A A combined computational experimental approach predicts human microRNA targets 200425.DOENCH JG.SHARP PA SpecificityofmicroRNAtarget selection intran

34、slational repression 200426.LEWIS BP.BURGE CB.BARTEl DP Conserved seed pairing,often flanked by adenosines,indicates that thousands of human genes are MicroRNA targets 200527.ROBINS H.LI Y.PADGETT RW Incorporating structure to predict microRNA targets 2005相似文獻(xiàn)(10條1.學(xué)位論文屠康哺乳動物microRNA的靶基因預(yù)測新方法2008mic

35、roRNA是一類重要的非編碼RNA,通過在轉(zhuǎn)錄后水平上抑制靶基因的mRNA翻譯或降解靶基因mRNA來發(fā)揮作用。microRNA數(shù)目眾多,根據(jù)miRBase數(shù)據(jù)庫,到目前為止,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了678個人類的microRNA基因,并且新的microRNA還在不斷的發(fā)現(xiàn)中。microRNA的功能重要,目前認(rèn)為microRNA參與很多重要的生物學(xué)過程,如轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò),發(fā)育過程中的時序控制,神經(jīng)突觸形成,細(xì)胞增殖,細(xì)胞死亡,細(xì)胞分化等。microRNA是近年來分子生物學(xué)上的研究熱點之一。 microRNA的功能通過作用到靶基因?qū)崿F(xiàn),發(fā)現(xiàn)microRNA的靶基因?qū)O大地促進(jìn)microRNA的功能研究。但是,

36、目前盡管發(fā)現(xiàn)了很多microRNA,但是尋找microRNA靶基因相對困難,雖然目前有多種計算生物學(xué)的工具用來預(yù)測哺乳動物中microRNA的靶基因,比如miRanda,TargetScan,PicTar,但得到實驗驗證的靶基因數(shù)目遠(yuǎn)遠(yuǎn)小于通過計算方法預(yù)測的數(shù)目,因此提高目前microRNA靶基因預(yù)測方法的預(yù)測準(zhǔn)確性是非常重要的。 本文在現(xiàn)有的研究基礎(chǔ)上,原創(chuàng)性的提出了3種不同類型的microRNA靶基因識別方法,它們分別是根據(jù)序列特征提高識別microRNA的靶基因方法的準(zhǔn)確率的機(jī)器學(xué)習(xí)方法,基于MIGE數(shù)據(jù)集識別microRNA的降解靶基因以及構(gòu)造microRNA的一、二級調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的統(tǒng)計模

37、型和用正向和反向工程結(jié)合的方法構(gòu)建人類轉(zhuǎn)錄因子和microRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的數(shù)學(xué)模型。這三類方法基于不同的原理,使用不同來源和類型的數(shù)據(jù),分別預(yù)測出了microRNA的靶基因。實驗結(jié)果說明三種預(yù)測方法都是有效可信的。2.學(xué)位論文華友佳microRNA芯片相關(guān)研究及microRNA功能預(yù)測2008microRNA(miRNA是現(xiàn)今生物學(xué)研究的熱門方向,涉及到腫瘤、發(fā)育、免疫凋亡等多個領(lǐng)域。miRNA芯片是檢測miRNA最重要的高通量手段,但是在標(biāo)準(zhǔn)化等過程的方法學(xué)上還存在一些問題。miRNA兩種功能的機(jī)制正在初步闡明,但目前尚缺乏預(yù)測區(qū)分兩者的方法。 本文基于miRNA表達(dá)的信號檢測原理,構(gòu)建了m

38、iRNA寡核苷酸芯片實驗平臺,并在建立整套實驗操作流程的同時,完善了芯片雜交的若干關(guān)鍵實驗條件,如雜交時間、雜交溫度、總RNA上樣量和mRNA對芯片的影響等。通過量化比較各種標(biāo)準(zhǔn)化方法,來確立最適于處理miRNA芯片的方法。利用大鼠14個正常組織的miRNA表達(dá)譜數(shù)據(jù),進(jìn)行組織分類、特異性miRNA的識別、miRNA靶基因功能通路富集、miRNA家族保守性等方面的分析。使用機(jī)器學(xué)習(xí)的方法,通過對己知功能的miRNA靶位點特征的訓(xùn)練,對未知功能的miRNA靶位點進(jìn)行功能學(xué)上的預(yù)測分類。 本研究使用兩套miRNA芯片數(shù)據(jù)集,衡量15種標(biāo)準(zhǔn)化方法處理的效果,確定print tip-loess是對于m

39、iRNA芯片最優(yōu)的標(biāo)準(zhǔn)化方法。miRNA表達(dá)譜可以正確地區(qū)分神經(jīng)組織和非神經(jīng)組織。識別了26個神經(jīng)組織特異性表達(dá)的miRNA,其中有7個是單個神經(jīng)組織特異性的;這26個miRNA共預(yù)測出3282個靶基因,這些靶基因分別被注釋到GO功能和KEGG通路上。 在機(jī)器學(xué)習(xí)預(yù)測miRNA功能的部分,通過設(shè)計好的特征在訓(xùn)練集上的學(xué)習(xí)過程,發(fā)現(xiàn)采用“多層感知”分類器和“信息增益”特征選擇策略,在10個特征的水平上的訓(xùn)練效果最好。使用這套方法總共預(yù)測出了17767個抑制功能的靶位點和2501個降解功能的靶位點,并通過6個miRNA在細(xì)胞內(nèi)的過表達(dá)(細(xì)胞轉(zhuǎn)染實驗,來檢測下游預(yù)測靶基因BCL2的表達(dá)變化,以驗證機(jī)器學(xué)習(xí)預(yù)測方法的可靠性:實驗與預(yù)測相符的占50%。chun生物信息學(xué)中的MicroRNA預(yù)測研究-吉林大學(xué)學(xué)報(信息科學(xué)版2008,26(3為microRNA預(yù)測的研究提供參考,討論了生物信息學(xué)中有關(guān)MicroRNA預(yù)測研究的若干問題.根據(jù)最新的研究成果,由MicroRNA預(yù)測的特征信息和數(shù)據(jù)源,從結(jié)構(gòu)序列分析方法、比較基因組方法和機(jī)器學(xué)習(xí)方法等方面對MicroRNA