生物化學(xué)——蛋白質(zhì)化學(xué)

1、RH|C|COOHNH2SidechainAminogroupCarboxylic acid非極性中性非極性中性-脂肪族脂肪族R基團基團甘氨酸，甘氨酸，Gly(G)唯一無唯一無手性碳原子手性碳原子的氨基酸的氨基酸 丙氨酸，丙氨酸，Alanine,Ala(A) R基團基團-甲基甲基accounting for 7.8% of the primary structure in a sample of 1,150 proteins.脯氨酸，脯氨酸，proline，Pro（P) 亞氨基酸亞氨基酸側(cè)鏈側(cè)鏈R同時與同時與Ca原子原子及及氨基氨基相連相連it is often found in turns

2、of proteins-吡咯烷基吡咯烷基-a-羧酸）羧酸） 纈氨酸，纈氨酸，Valine，Val（V）branched-chain amino acidessential amino acid 亮氨酸，亮氨酸，Leucine，Leu（L）異丁基（異丁基（isobutylbranched-chain amino acidessential amino acid 異亮氨酸，異亮氨酸，Isoleucine,Ile（I）有兩個手性碳原子有兩個手性碳原子branched-chain amino acidessential amino acid 蛋氨酸（甲硫氨酸），蛋氨酸（甲硫氨酸），Methionine

3、 ,Met Methionine ,Met （M M）側(cè)鏈含甲硫基（甲基硫醚基側(cè)鏈含甲硫基（甲基硫醚基 )essential amino acidan intermediate in the biosynthesis 芳香族芳香族R基團氨基酸基團氨基酸芳香族芳香族R基團氨基酸基團氨基酸苯丙氨酸，苯丙氨酸，Phenylalanine,Phe(F)a-氨基氨基-苯丙酸苯丙酸 苯甲基（苯甲基（benzyl芳香族芳香族R基團氨基酸基團氨基酸酪氨酸酪氨酸t(yī)yrosineTyr（Y),EAAas a receiver of phosphate groupsa-氨基氨基-對羥基苯丙酸對羥基苯丙酸 中性極性中

4、性極性AA羥基是活性基團羥基是活性基團- OH-as a receiver of phosphate groups芳香族芳香族R基團氨基酸基團氨基酸色氨酸，色氨酸，TryptophanTrp（W),亞甲基與吲哚環(huán)相連亞甲基與吲哚環(huán)相連EAA極性中性極性中性R基團基團極性中性極性中性R基團基團絲氨酸，絲氨酸，Serine，Ser（S）羥甲基羥甲基蘇氨酸，蘇氨酸，Threonine，Thr（T），），有兩個手性碳原子有兩個手性碳原子EAAIt is susceptible to numerous posttranslational modifications極性中性極性中性R基團基團羥基為活性基團

5、羥基為活性基團半胱氨酸，半胱氨酸，Cysteine,Cys(C)極性中性極性中性R基團基團亞甲基連接一個巰基亞甲基連接一個巰基強還原性強還原性極性非帶電極性非帶電R基團基團天冬酰胺天冬酰胺Asparagine, Asn (N)甲酰胺基（甲酰胺基（carboxamide極性非帶電極性非帶電R基團基團谷氨酰胺，谷氨酰胺，Glutamine，Gln（Q)堿性氨基酸堿性氨基酸(帶正電帶正電R基團基團)+賴氨酸，賴氨酸，Lysine，Lys（K)側(cè)鏈連接一個氨基，為堿性側(cè)鏈連接一個氨基，為堿性氨基酸氨基酸EAA堿性氨基酸堿性氨基酸精氨酸，精氨酸，Arg（R)含胍基，含胍基，堿性氨基酸堿性氨基酸堿性氨基酸

6、堿性氨基酸組氨酸，組氨酸，His（H)含咪唑基含咪唑基，堿性氨基酸堿性氨基酸EAA+堿性氨基酸堿性氨基酸酸性氨基酸酸性氨基酸- -帶負電帶負電R R基團基團天冬氨酸，天冬氨酸，Asp(D)酸性氨基酸酸性氨基酸谷氨酸，谷氨酸，Glu(E)酸性氨基酸酸性氨基酸 硒代半胱氨酸，硒代半胱氨酸， Selenocysteine, Sec(U)(R)-2-胺基-3-氫硒基丙酸吡咯吡咯賴氨酸，賴氨酸，Pyrrolysine，Pyl膠原蛋白中膠原蛋白中膠原蛋白中膠原蛋白中肌球蛋白肌球蛋白凝血酶原凝血酶原弱酸（共熱）弱酸（共熱）谷胱甘肽谷胱甘肽(glutathione, GSH)結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu): :Glu、Cys和和G

7、ly組成的三肽組成的三肽Glu的的 -羧基羧基參與形成肽鍵參與形成肽鍵SH為活性基團為活性基團GSH過氧過氧化物酶化物酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH還原酶還原酶NADPH+H+ NADP+ 主要功能主要功能: :是體內(nèi)重要的是體內(nèi)重要的還原劑還原劑610771920（一）分子伴侶（一）分子伴侶 (chaperone)定義：定義：一類一類在序列上沒有相關(guān)性但有共同功在序列上沒有相關(guān)性但有共同功能，在細胞中能夠幫助其他多肽鏈（或核酸）折能，在細胞中能夠幫助其他多肽鏈（或核酸）折疊或解折疊、組裝或分解的疊或解折疊、組裝或分解的蛋白蛋白稱為分子伴侶。稱為分子伴侶。如熱休克蛋白如熱休克

8、蛋白* * 可逆地與未折疊肽段的疏水部分結(jié)合隨后松開，可逆地與未折疊肽段的疏水部分結(jié)合隨后松開，使新生肽鏈正確折疊。使新生肽鏈正確折疊。* * 與錯誤聚集的肽段結(jié)合，誘導(dǎo)其正確折疊。與錯誤聚集的肽段結(jié)合，誘導(dǎo)其正確折疊。 * * 對蛋白質(zhì)分子中二硫鍵的正確形成起重要的作用。對蛋白質(zhì)分子中二硫鍵的正確形成起重要的作用。 作用：作用：例：鐮刀形紅細胞貧血例：鐮刀形紅細胞貧血N-Val His Leu Thr Pro Glu Glu C(146) HbS 肽鏈肽鏈HbA 肽肽 鏈鏈N-Val His Leu Thr Pro Val Glu C(146) 這種由蛋白質(zhì)分子發(fā)生變異所導(dǎo)致的疾病，這種由蛋

9、白質(zhì)分子發(fā)生變異所導(dǎo)致的疾病，稱為稱為“分子病分子病”。肌紅蛋白肌紅蛋白(Mb)和血紅蛋白和血紅蛋白(Hb)的的氧解離曲線氧解離曲線瘋牛病瘋牛病朊病毒蛋白朊病毒蛋白(prion protein, PrP)構(gòu)象改變引起的神構(gòu)象改變引起的神經(jīng)退行性病變。經(jīng)退行性病變。正常的正常的PrP （PrPc ）富含）富含-螺旋（螺旋（ 42%， 片層片層僅占僅占3% ）。）。瘋牛病瘋牛病的的PrP PrPsc ）-片層占片層占45%， -螺旋螺旋30%。 PrPsc相互聚集，形成相互聚集，形成淀粉樣纖維沉淀淀粉樣纖維沉淀而致病。而致病。PrPc-螺旋螺旋PrPsc-折疊折疊正常正常瘋牛病瘋牛病朊病毒的復(fù)制朊

10、病毒的復(fù)制模式A：傳染型和散發(fā)型的朊病毒復(fù)制模式；B：遺傳型的朊病毒復(fù)制模式。 應(yīng)用舉例應(yīng)用舉例消毒及滅菌。消毒及滅菌。蛋白質(zhì)制劑（如疫苗等）的有效地保存。蛋白質(zhì)制劑（如疫苗等）的有效地保存。 透析1.凝膠過濾層析（分子篩）原理：分子大小和形狀不同 固定相：多孔的凝膠珠 2.離子交換層析 3.親和層析原理：蛋白質(zhì)與配體間特異的相互作用固定相：共價連接有配體的惰性基質(zhì)如：抗體-抗原激素-受體酶-底物1.SDS-PAGE電泳 原理：基于蛋白質(zhì)分子大小以及形狀不同載體：聚丙烯酰胺凝膠2.等電聚焦（等電聚焦（Isoelectric focusing)3.雙向電泳(two-dimensional gel electrophoresis)等電聚焦等電聚焦：pI不同不同基質(zhì)基質(zhì)：pH不同不同的的凝膠柱凝膠