凝膠成像軟件使用說明書

1、目 錄一 樣品拍攝指南1 拍攝界面簡(jiǎn)介 4 2 瓊脂糖電泳凝膠拍攝方法 93 蛋白質(zhì)電泳凝膠拍攝方法 134 藍(lán)光樣品的拍攝方法 165 化學(xué)發(fā)光樣品的拍攝方法 196 RGB熒光樣品的拍攝方法 24二 軟件分析指南 1 系統(tǒng)進(jìn)入 282 功能介紹 293 圖像分析 293.1 1D凝膠分析3.1.1 打開圖像 333.1.2 旋轉(zhuǎn) 333.1.3 圖像調(diào)整 343.1.4 圖像增強(qiáng) 353.1.5 分析設(shè)置 363.1.6 泳道識(shí)別 363.1.7 初始井 373.1.8 條帶識(shí)別 373.1.9 背景校準(zhǔn) 383.1.10 標(biāo)準(zhǔn)分子量選擇 393.1.11 傾斜 403.1.12 結(jié)果 4

2、13.1.13 遺傳樹分析 423.1.14 VNTRs分析 433.1.15 視圖選擇 443.1.16 報(bào)告 453.1.17 保存實(shí)驗(yàn) 46 3.2 ECL Western Blot分析3.2.1 打開圖像 473.2.2 圖像旋轉(zhuǎn) 473.2.3 圖像調(diào)整 473.2.4 圖像增強(qiáng) 473.2.5 噪點(diǎn)去除 473.2.6 合并MAKER泳道 473.2.7 分析設(shè)置 483.2.8 泳道識(shí)別 483.2.9 條帶識(shí)別 483.2.10 背景校準(zhǔn) 483.2.11 標(biāo)準(zhǔn)分子量選擇 483.2.12 傾斜 493.2.13 結(jié)果 493.2.14 視圖選擇 49 3.2.15 報(bào)告的生成

3、 493.3 圖像合并 493.4 染料數(shù)據(jù)庫(kù)和偽彩 503.5 PCR密度分析3.5.1 打開圖像 523.5.2 圖像旋轉(zhuǎn) 523.5.3 圖像調(diào)整 523.5.4 圖像增強(qiáng) 523.5.5 分析設(shè)置 523.5.6 強(qiáng)度校準(zhǔn) 533.5.7 保存實(shí)驗(yàn) 543.6 菌落/克隆計(jì)數(shù)分析3.6.1 打開圖像 553.6.2 圖像旋轉(zhuǎn) 553.6.3 圖像調(diào)整 553.6.4 圖像增強(qiáng) 553.6.5 分析設(shè)置 553.7 斑點(diǎn)雜交分析3.7.1 打開圖像 583.7.2 圖像旋轉(zhuǎn) 583.7.3 圖像調(diào)整 583.7.4 圖像增強(qiáng) 583.7.5 分析設(shè)置 583.7.6 強(qiáng)度校準(zhǔn) 593.7

4、.7 保存實(shí)驗(yàn) 593.8 距離測(cè)量分析3.8.1 打開圖像 603.8.2 分析設(shè)置 613.8.3 標(biāo)準(zhǔn)線更改 62三 附錄3.1 儀器的保養(yǎng)要求 633.2 售后服務(wù) 63樣 品 拍 攝 指 南1 拍攝界面簡(jiǎn)介：主頁(yè)面 模式選擇部分根據(jù)不同樣品的需要，軟件包含兩種不同的拍攝模式：普通模式和ECL模式。普通模式：用于DNA/RNA、蛋白質(zhì)凝膠電泳、微孔板、雜交膜、瓶皿、菌落、切片、熒光二抗Western Blot等樣品的拍攝。（在本模式下，開啟不同的燈光，濾光輪會(huì)自動(dòng)轉(zhuǎn)到對(duì)應(yīng)的濾光鏡位）ECL模式：用于ECL等化學(xué)發(fā)光底物樣品的拍攝。本模式下，分辨率自動(dòng)進(jìn)行像素合并從而提高靈敏度。（在本模

5、式下，濾光輪會(huì)自動(dòng)轉(zhuǎn)至空位，并且在選擇自動(dòng)曝光、規(guī)則積分和不規(guī)則積分拍攝功能時(shí)均會(huì)自動(dòng)關(guān)閉所有燈光并將鏡頭光圈值放到最大，從而減少操作步驟） 鏡頭控制部分鏡頭的控制功能包括：光圈、焦距、聚焦的調(diào)整。 圖像區(qū)域可顯示圖像預(yù)覽和拍攝的效果。 燈光控制部分燈光控制包括：反射白光、紫外光、紅綠藍(lán)三色光源；透射紫外、白光等。（在普通模式下，濾光輪聯(lián)動(dòng)。當(dāng)選擇紫外、紅綠藍(lán)反射光時(shí)，濾光輪將自動(dòng)轉(zhuǎn)到對(duì)應(yīng)的濾鏡位置。） 濾光輪調(diào)整部分濾光輪孔位的調(diào)整控制，通過自動(dòng)旋轉(zhuǎn)來(lái)切換不同的濾光鏡復(fù)位按鈕用來(lái)修正基準(zhǔn)位（5位濾光輪校準(zhǔn)位：5號(hào)位； 7位濾光輪校準(zhǔn)位：7號(hào)位）。 分辨率選擇與相機(jī)啟動(dòng)部分分辨率選擇功能僅部分

6、型號(hào)支持。 參數(shù)選擇與自動(dòng)曝光部分參數(shù)選擇：可設(shè)置和保存相機(jī)各種參數(shù)，便于今后調(diào)用。自動(dòng)曝光：程序?qū)⒆詣?dòng)計(jì)算出當(dāng)前狀態(tài)下的最佳曝光值。 曝光時(shí)間設(shè)置部分100毫秒：將相機(jī)轉(zhuǎn)為預(yù)覽狀態(tài)的快捷鍵。自由設(shè)置：可自己設(shè)置任意的曝光時(shí)間。 拍攝方法選擇部分單禎拍攝：適用于普通模式和ECL模式自動(dòng)曝光后的圖像捕獲。規(guī)則積分：指ECL模式下等分時(shí)間間隔的積分圖像拍攝。不規(guī)則積分：指 ECL模式下不等分時(shí)間間隔的積分圖像拍攝?？扇我庠O(shè)置每禎圖像的間隔時(shí)間。 圖片拍攝按鈕及分析快捷鍵拍攝：進(jìn)行圖像的捕獲。圖像管理：每次拍攝完后，圖像將自動(dòng)保存至Lane 1D文件夾下的“拍照”子文件夾中。分析：可直接將拍攝后圖像

7、導(dǎo)入分析界面,進(jìn)行分析。子頁(yè)面參數(shù)設(shè)置子頁(yè)面： 相機(jī)類型和控制類型設(shè)置設(shè)置相機(jī)的類型與控制的類型（相機(jī)類型請(qǐng)參照儀器型號(hào)進(jìn)行選擇） RGB和濾光輪RGB三原色激發(fā)光源和濾光輪僅部分機(jī)型配置，請(qǐng)根據(jù)儀器配置清單進(jìn)行選擇 存放路徑設(shè)置設(shè)置拍攝圖片存放路徑，點(diǎn)擊功能按鈕 進(jìn)行設(shè)置 參數(shù)設(shè)置調(diào)整調(diào)整相機(jī)的增益，對(duì)比度及伽瑪值 參數(shù)保存名稱可對(duì)當(dāng)前設(shè)置進(jìn)行保存，方便下次實(shí)驗(yàn)直接調(diào)用自動(dòng)曝光設(shè)置出廠時(shí)均設(shè)置有默認(rèn)值明 場(chǎng)：指白光或自然光環(huán)境UV場(chǎng)：紫外光和熒光環(huán)境暗 場(chǎng)：ECL等無(wú)激發(fā)光源的密閉環(huán)境自動(dòng)曝光積分單位：用于暗場(chǎng)模式自動(dòng)曝光的時(shí)間單位。 鏡頭設(shè)置電動(dòng)鏡頭的光圈、焦距和聚焦三個(gè)值的數(shù)值化顯示設(shè)置

8、?？騼?nèi)時(shí)間是三可變對(duì)應(yīng)的全程可調(diào)整范圍的時(shí)間，精確到毫秒，自動(dòng)對(duì)應(yīng)到1-100的調(diào)整范圍。 規(guī)則積分用于等分時(shí)間間隔的積分拍攝，可設(shè)定拍攝張數(shù)和間隔的時(shí)間。 不規(guī)則積分用于不規(guī)則時(shí)間間隔的積分拍攝，可任意設(shè)定每張圖片的間隔時(shí)間，利于對(duì)未知特性發(fā)光底物樣品的拍攝條件的摸索。拍攝數(shù)量最多10張。 濾光輪設(shè)置可進(jìn)行濾光輪每個(gè)孔位的信息輸入。 2 瓊脂糖電泳凝膠拍攝方法：提 示：本指南所例舉為：EB或GoldView染色的DNA凝膠。其它染料的樣品請(qǐng)根據(jù)激發(fā)和吸收波長(zhǎng)選擇光源和濾光鏡。2.1 打開拍攝界面，軟件將自動(dòng)開啟白光反射燈。單擊功能按鈕相機(jī)啟動(dòng)，在圖像預(yù)覽區(qū)域顯示圖片效果。將樣品放置紫外臺(tái)中央

9、，關(guān)閉暗箱門。 白光反射燈2.2 單擊功能按鈕 ，軟件自動(dòng)計(jì)算曝光值，使預(yù)覽圖片達(dá)到最佳效果。2.3 調(diào)整焦距，直至樣品達(dá)到屏幕的滿幅面。 焦距調(diào)整 2.4 調(diào)整聚焦，直至加樣孔清晰。聚焦調(diào)整2.5 關(guān)閉白光反射燈，開啟紫外透射光源。注 意：如果您購(gòu)買的為多波長(zhǎng)紫外臺(tái)，請(qǐng)選擇302nm波長(zhǎng).（波長(zhǎng)切換開關(guān)）紫外透射燈 2.6 單擊功能按鈕 ，軟件自動(dòng)計(jì)算曝光值，使預(yù)覽圖片達(dá)到最佳效果。注 意：通常情況下，只要在白光下將加樣孔調(diào)整清楚，切換到紫外時(shí)條帶就能清晰的看到。但是，如果膠非常厚，加樣孔和條帶將不在同一景深，所以白光時(shí)加樣孔雖然能聚清晰，但是紫外時(shí)條帶仍會(huì)有些模糊，這時(shí)，可以再微調(diào)一下“聚

10、焦”，讓條帶變清晰。點(diǎn)擊“拍攝”按鈕： 2.7 單擊功能按鈕，進(jìn)入圖像管理界面（該界面里能直接對(duì)圖片進(jìn)行打印、保存、刪除或分析）。如需進(jìn)行下一次拍攝，單擊功能按鈕返回至拍攝界面3 蛋白質(zhì)電泳凝膠拍攝方法： 3.1 ChampGel,ChampChemi：將折疊白光透射板從機(jī)箱內(nèi)折下.SmartGel,SmartChemi: 將白光透射板放入機(jī)箱內(nèi)，并與12V電源連接. 3.2 打開拍攝界面，軟件將自動(dòng)開啟白光反射燈。單擊功能按鈕相機(jī)啟動(dòng)，在圖像預(yù)覽區(qū)域顯示圖片效果。將樣品放置白光透射板中央，關(guān)閉暗箱門。關(guān)閉白光反射燈，打開白光透射燈 白光透射燈3.3 單擊功能按鈕 ，軟件自動(dòng)計(jì)算曝光值，使預(yù)覽

11、圖片達(dá)到最佳效果。3.4 調(diào)整焦距，直至樣品達(dá)到屏幕的滿幅面。焦距調(diào)整3.5 調(diào)整聚焦，直至條帶清晰。聚焦調(diào)整單擊“拍攝”按鈕： 3.6 單擊功能按鈕，進(jìn)入圖像管理界面（該界面里能直接對(duì)圖片進(jìn)行打印、保存、刪除或分析）如需進(jìn)行下一次實(shí)驗(yàn)，單擊功能按鈕返回至拍攝界面注 意：同樣的操作方法可拍攝其它類型的樣品，如下圖所示：菌落斑點(diǎn)雜交膜X光膠片抑菌圈4 藍(lán)光樣品的拍攝方法： 提 示：請(qǐng)按照樣品中染料的吸收波長(zhǎng)選擇合適的濾光鏡。4.1 將藍(lán)光透射臺(tái)放入機(jī)箱內(nèi)，并與12V電源連接。打開拍攝界面，自動(dòng)開啟白光反射燈。單擊功能按鈕相機(jī)啟動(dòng)，在圖像預(yù)覽區(qū)域顯示圖片效果。將樣品放置藍(lán)光透射臺(tái)中央，關(guān)閉白光反射

12、燈，開啟透射白光（藍(lán)光透射臺(tái)與白光透射共用一個(gè)開關(guān)按鈕），關(guān)閉暗箱門。藍(lán)光透射燈4.2 單擊功能按鈕 ，軟件自動(dòng)計(jì)算曝光值，使預(yù)覽圖片達(dá)到最佳效果。 4.3 調(diào)整焦距，直至樣品達(dá)到屏幕的滿幅面。焦距調(diào)整4.4 調(diào)整聚焦，直至條帶清晰。聚焦調(diào)整單擊“拍攝”按鈕： 4.5 單擊功能按鈕，進(jìn)入圖像管理界面（在該界面里能直接對(duì)圖片進(jìn)行打印、保存、刪除或分析），如需進(jìn)行下一次拍攝，單擊功能按鈕返回至拍攝界面提 示：藍(lán)光樣品主要用藍(lán)光臺(tái)或反射藍(lán)光作為激發(fā)光源。藍(lán)光臺(tái)跟白光板共用一根電源線，均為12V。5 化學(xué)發(fā)光樣品的拍攝方法：5.1 打開拍攝界面，自動(dòng)開啟白光反射燈。選擇ECL模式，濾光輪自動(dòng)轉(zhuǎn)到5號(hào)空

13、位，負(fù)片功能自動(dòng)啟動(dòng)。單擊功能按鈕相機(jī)啟動(dòng)，在圖像預(yù)覽區(qū)域顯示圖片效果。將未加入發(fā)光液的樣品放置化學(xué)發(fā)光樣品板中央，關(guān)閉暗箱門。白光反射燈5.2 單擊功能按鈕 ，軟件自動(dòng)計(jì)算曝光值，使預(yù)覽圖片達(dá)到最佳效果。5.3 調(diào)整焦距，直至樣品達(dá)到屏幕的滿幅面。焦距調(diào)整5.4 根據(jù)樣品上的MAKER或標(biāo)記的數(shù)字調(diào)整聚焦，直至樣品清晰。聚焦調(diào)整5.5 選擇拍攝方法，靈活的更改拍攝時(shí)間和張數(shù)。(一般濃度高的樣品使用單幀拍攝方法，即自動(dòng)曝光后的圖像捕獲；濃度低的樣品使用規(guī)則積分拍攝或不規(guī)則積分拍攝方法，即長(zhǎng)時(shí)間積分曝光拍攝)5.6 將發(fā)光液加在樣品上,關(guān)閉暗箱門，點(diǎn)擊功能按鈕5.7 軟件自動(dòng)拍攝，直至完成所設(shè)置

14、的拍攝張數(shù)。5.8 單擊功能按鈕，進(jìn)入圖象管理界面（該界面里能直接對(duì)圖片進(jìn)行打印、保存、刪除或分析），如需進(jìn)行下一次拍攝，單擊功能按鈕返回至拍攝界面。積分拍攝模式下保存的圖像格式為多頁(yè)式TIFF文件，一個(gè)文件中可保存多張圖像，您可以使用對(duì)多頁(yè)式TIFF文件進(jìn)行查看。6 RGB反射光源激發(fā)樣品拍攝方法6.1 打開拍攝界面，自動(dòng)開啟白光反射燈。單擊功能按鈕相機(jī)啟動(dòng)，在圖像預(yù)覽區(qū)域顯示圖片效果。將樣品放置紫外透射臺(tái)中央，關(guān)閉暗箱門。白光反射燈6.2 單擊功能按鈕 ，軟件自動(dòng)計(jì)算曝光值，使預(yù)覽圖片達(dá)到最佳效果。6.3 調(diào)整焦距，直至樣品達(dá)到屏幕的滿幅面。焦距調(diào)整6.4 調(diào)整聚焦，直至樣品清晰。焦距調(diào)整

15、關(guān)閉白光反射燈，打開相對(duì)應(yīng)的RGB熒光燈，這時(shí)濾光輪自動(dòng)轉(zhuǎn)到相對(duì)應(yīng)的濾鏡孔位。（圖例中樣品的激發(fā)光源是藍(lán)色熒光光源）藍(lán)色熒光光源6.6 單擊功能按鈕 ，軟件自動(dòng)計(jì)算曝光值，使預(yù)覽圖片達(dá)到最佳效果。單擊“拍攝”按鈕： 6.6 單擊功能按鈕，進(jìn)入圖像管理界面（該界面里能直接對(duì)圖片進(jìn)行打印、保存、刪除或分析），如需進(jìn)行下一次拍攝，單擊功能按鈕返回至拍攝界面軟 件 分 析 指 南 1 系統(tǒng)進(jìn)入雙擊桌面圖標(biāo)出現(xiàn)新的對(duì)話框在對(duì)話框內(nèi)輸入用戶名和密碼，進(jìn)入系統(tǒng)。管理員初始密碼：123456。請(qǐng)盡快設(shè)置和更改此密碼。管理員為最高級(jí)用戶，擁有最高權(quán)限，可以修改其他用戶的密碼，請(qǐng)注意保管好密碼。2 功能介紹打開圖

16、像后，所有應(yīng)用程序窗口便處于激活狀態(tài)。應(yīng)用程序窗口包括菜單欄、工具欄、圖像窗口、工作區(qū)以及狀態(tài)欄。下圖顯示了LANE 1D應(yīng)用程序窗口的上述及其它特征。菜單欄工具欄圖像窗口菜單欄: 菜單欄包含了所有LANE 1D命令，這些命令可從菜單欄上的菜單列表來(lái)選擇。同大多數(shù)應(yīng)用程序一樣，在選擇命令之前，您必須確定命令的應(yīng)用對(duì)象（例如，在選擇命令之前，應(yīng)確定已選擇了此命令將要應(yīng)用的圖像數(shù)據(jù)）。工具欄： 工具欄是位于屏幕頂端的按鈕條。應(yīng)用程序窗口的此位置包含了LANE 1D最常用到的基本強(qiáng)度控制和成像工具當(dāng)光標(biāo)移到按鈕上時(shí)，將出現(xiàn)淺黃色簡(jiǎn)短的描述該按鈕功能的提示信息。如果未出現(xiàn)提示信息，則表面該按鈕/功能不

17、可應(yīng)用于當(dāng)前圖像。本指南對(duì)工具欄上的26個(gè)按鈕進(jìn)行了解述。這些按鈕的說明及其用途見下：在默認(rèn)狀態(tài)下，下面的工具欄應(yīng)緊位于菜單欄之下。 圖標(biāo)位圖名稱打開文件保存圖像數(shù)據(jù)庫(kù)圖像多幀管理掃描圖像打印撤消旋轉(zhuǎn)清除興趣區(qū)域矩形興趣區(qū)域橢圓興趣區(qū)域任意興趣區(qū)域或魔棒注釋放大圖像拖動(dòng)圖像對(duì)比度調(diào)整圖像優(yōu)化圖像重置自定義染色噪點(diǎn)消除泳道分析斑點(diǎn)分析菌落分析密度分析距離測(cè)量對(duì)比度增強(qiáng)工具：對(duì)比度增強(qiáng)工具按鈕可顯示或隱藏對(duì)比度增強(qiáng)控制面板。 可通過該面板方便地調(diào)整當(dāng)前活動(dòng)圖像的亮度、對(duì)比度和伽瑪值(BCG)。每個(gè)特征由單獨(dú)的滑塊控制。可使用亮度控制來(lái)改變圖像的整體亮度?？墒褂脤?duì)比度控制來(lái)改變圖像中明暗部分的亮度差

18、異程度。可使用伽瑪控制來(lái)增強(qiáng)圖像中很暗或很亮區(qū)域的對(duì)比度，而對(duì)圖像中間區(qū)域的對(duì)比度不會(huì)有明顯的影響。向右移動(dòng)滑塊按鈕將增強(qiáng)該屬性。向左移動(dòng)則降低該屬性。 點(diǎn)擊反相按鈕，圖片會(huì)發(fā)生相應(yīng)的變化。比如：亮條帶暗背景會(huì)變成暗條帶亮背景。暗條帶亮背景會(huì)變成亮條帶暗背景。點(diǎn)擊此按鈕將把BCG滑塊重置至默認(rèn)值。點(diǎn)擊此按鈕，圖片會(huì)自動(dòng)進(jìn)行設(shè)置3 圖像分析3.1 1D凝膠分析（適用于DNA/RNA和蛋白質(zhì)凝膠電泳）：3.1.1打開圖像：點(diǎn)擊功能按鈕 或者 出現(xiàn)對(duì)話框，在對(duì)話框內(nèi)打開需要分析的圖片3.1.2 圖像旋轉(zhuǎn)：點(diǎn)擊對(duì)話框中的功能按鈕 ，可對(duì)傾斜的圖像進(jìn)行校正進(jìn)行校正。方法如圖：快捷調(diào)整方法：直接將鼠標(biāo)移至

19、圖像上，將出現(xiàn)旋轉(zhuǎn)符號(hào)，旋轉(zhuǎn)網(wǎng)格，讓網(wǎng)格橫軸與樣品條帶呈水平即可。提 示:在拍攝前，最好將凝膠在紫外臺(tái)或白光透射板中放正，從而可省去旋轉(zhuǎn)這一步驟直接進(jìn)行下一步分析操作。3.1.3 圖像調(diào)整： 點(diǎn)擊功能按鈕 對(duì)圖片的有效分析區(qū)域進(jìn)行矩形裁剪。 然后在工具欄中點(diǎn)擊編輯中的復(fù)制、粘貼并新建或者直接生成新圖像。出現(xiàn)裁剪的圖片后，可關(guān)閉原始圖片。提 示：拍攝圖片之前，最好把樣品盡量放大到整個(gè)屏幕，以確保剪切后的圖片有足夠多的像素。 3.1.4 圖像增強(qiáng)：點(diǎn)擊功能按鈕 ，將出現(xiàn)對(duì)比增強(qiáng)對(duì)話框：可手動(dòng)對(duì)圖像進(jìn)行后期增強(qiáng)或者點(diǎn)擊自動(dòng)對(duì)圖像進(jìn)行增強(qiáng)。另可點(diǎn)擊取消增強(qiáng)。3.1.5 分析設(shè)置： 點(diǎn)擊功能按鈕 將出現(xiàn)

20、右側(cè)對(duì)話框3.1.6 泳道識(shí)別：點(diǎn)擊對(duì)話框中的泳道，程序?qū)⒆詣?dòng)識(shí)別泳道，并生成泳道輪廓圖。 如果有的泳道未能識(shí)別，或者識(shí)別錯(cuò)誤，可以在對(duì)話框中進(jìn)行刪除或者添加。另外，可統(tǒng)一修改泳道寬度，可直接在圖像上調(diào)整單一泳道的寬度，也在圖像上直接調(diào)整泳道識(shí)別區(qū)域的上下沿。3.1.7 初始井設(shè)置： 通過初始井可自行定義每個(gè)泳道的起點(diǎn)。3.1.8 條帶識(shí)別：點(diǎn)擊對(duì)話框中的條帶進(jìn)行條帶自動(dòng)識(shí)別。點(diǎn)擊尋找條帶，軟件將進(jìn)行自動(dòng)查找。通過最小條帶高度可自動(dòng)添加和刪除條帶；也可通過添加條帶和刪除條帶的功能進(jìn)行手動(dòng)操作。對(duì)于微笑條帶，可通過彎曲條帶的功能進(jìn)行調(diào)整?？捎檬髽?biāo)直接在圖像上調(diào)整條帶的識(shí)別范圍可用鼠標(biāo)在泳道輪廓上

21、調(diào)整條帶的識(shí)別范圍，準(zhǔn)確度高于在圖像上調(diào)整的方法。3.1.9 背景校準(zhǔn)：點(diǎn)擊對(duì)話框中的背景進(jìn)行背景校準(zhǔn)?？蛇x擇不同的背景扣除方法生成新圖像，新圖像的質(zhì)量將有所提高。選擇扣背景方法后，請(qǐng)點(diǎn)擊對(duì)話框中的顯示校準(zhǔn)圖像，程序?qū)⑸梢粡埧鄢尘暗男聢D像 。3.1.10 標(biāo)準(zhǔn)分子量選擇：點(diǎn)擊對(duì)話框中的標(biāo)準(zhǔn)分子量進(jìn)行MAKER泳道的選擇與分子量標(biāo)準(zhǔn)的選擇。程序默認(rèn)的MAKER泳道為1號(hào)泳道，如果樣品的MAKER不是1號(hào)泳道，可在對(duì)話框中點(diǎn)擊重置，再點(diǎn)擊選擇/取消選擇，然后在圖片單擊MAKER泳道。對(duì)話框中將顯示正確為MARKER泳道。另外，如果樣品中有兩個(gè)或兩個(gè)以上的MARKER泳道，請(qǐng)?jiān)谶x擇時(shí)進(jìn)行多選?？?/p>

22、在分子量標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫(kù)中調(diào)用已存有的MARKER.如果數(shù)據(jù)庫(kù)中沒有所需的分子量標(biāo)準(zhǔn)，就點(diǎn)擊新建對(duì)話框。輸入當(dāng)前使用的MARKER分子量標(biāo)準(zhǔn)，包括名稱、單位的選擇、遺傳物質(zhì)的選擇、擴(kuò)散的選擇、分子量的數(shù)據(jù)的輸入。最后：必須點(diǎn)擊自動(dòng)定位。注意：敏感度的數(shù)值調(diào)整將影響AFLP/RFLP及遺傳樹分析的結(jié)果。3.1.11 傾斜（雙MAKER或多MARKER校準(zhǔn)）：如果樣品中有兩個(gè)以上MARKER的：請(qǐng)點(diǎn)擊傾斜來(lái)進(jìn)行MAKER校正，可在對(duì)話框中選擇自動(dòng)傾斜校準(zhǔn)，也可通過手動(dòng)方式添加傾斜線。如果樣品是單MARKER的話：無(wú)需使用傾斜功能，可直接進(jìn)入結(jié)果分析。3.1.12 結(jié)果：程序?qū)⒆詣?dòng)計(jì)算出所有條帶的分子量、

23、IOD、最大OD值、百分比等數(shù)據(jù)?？勺孕羞x擇顯示的方式。在文件中有多種數(shù)據(jù)導(dǎo)出方式供選擇。如需計(jì)算條帶含量，請(qǐng)?jiān)诮Y(jié)果中點(diǎn)擊校準(zhǔn)，選擇校準(zhǔn)質(zhì)量， 用鼠標(biāo)選擇MARKER泳道上的條帶進(jìn)行點(diǎn)擊。然后在對(duì)話框中質(zhì)量一欄中輸入該條帶的質(zhì)量，在單位一欄中輸入單位，如：ug、mg、ng、pg等。（最少輸入3個(gè)已知質(zhì)量才能畫出標(biāo)準(zhǔn)曲線），最后點(diǎn)擊確定?？杀４婧壳€，今后只需點(diǎn)擊載入調(diào)用。在結(jié)果中選擇把條帶含量，表格中將顯示所有條帶的含量。3.1.13 遺傳樹分析：點(diǎn)擊對(duì)話框中遺傳樹分析,可選擇遺傳樹分析方法?？稍趫?bào)告中輸入實(shí)驗(yàn)信息直接生成實(shí)驗(yàn)報(bào)告，并可打印3.1.14 VNTRs分析：VNTRs多態(tài)性分析是

24、一種常用的遺傳分析方法，可用于群體間遺傳關(guān)系的研究親緣相關(guān)程度的分析，群體近交程度的分析等等。本軟件中VNTRs功能用于對(duì)數(shù)目可變串聯(lián)重復(fù)位點(diǎn)（Variable number of tandem repeats，VNTRs）進(jìn)行分析和計(jì)算，此功能可以根據(jù)電泳軟件分析PCR產(chǎn)物各條帶的分子量大小,再根據(jù)每一個(gè)特異位點(diǎn)重復(fù)單元的大小以及特異引物擴(kuò)增產(chǎn)物邊緣序列的長(zhǎng)短,進(jìn)一步確定每個(gè)實(shí)驗(yàn)樣品VNTR特異位點(diǎn)重復(fù)單元的重復(fù)次數(shù)。點(diǎn)擊對(duì)話框中的VNTRs，調(diào)整重復(fù)單元大小和側(cè)翼序列大小，可直接計(jì)算出遺傳基因的頻率?？稍趫?bào)告中輸入實(shí)驗(yàn)信息直接生成實(shí)驗(yàn)報(bào)告，并可打印3.1.15 視圖選擇：點(diǎn)擊對(duì)話框中的選擇

25、視圖可對(duì)泳道、條帶、輪廓圖等顯示、指示的方式進(jìn)行選擇。比如：泳道顏色、條帶顏色、字體顏色和大小、數(shù)據(jù)顯示等。3.1.16 報(bào)告的生成：點(diǎn)擊對(duì)話框中的報(bào)告，選擇報(bào)告輸出的方式，并輸入實(shí)驗(yàn)信息。泳道圖像報(bào)告輪廓圖報(bào)告結(jié)果報(bào)告泳道-條帶報(bào)告3.1.17 保存實(shí)驗(yàn)：點(diǎn)擊保存，對(duì)當(dāng)前的實(shí)驗(yàn)及數(shù)據(jù)進(jìn)行存儲(chǔ)3.2 Western Blot分析3.2.1 打開圖像： 請(qǐng)查看3.1.13.2.2 圖像旋轉(zhuǎn)： 請(qǐng)查看 3.1.23.2.3 圖像調(diào)整： 請(qǐng)查看 3.1.33.2.4 圖像增強(qiáng)： 請(qǐng)查看3.1.43.2.5 噪點(diǎn)去除： ECL Western Blot拍攝是積分拍攝，拍攝出的圖片會(huì)有噪點(diǎn)，這時(shí)需要去除

26、噪點(diǎn)之后進(jìn)行分析才不會(huì)影響最后的結(jié)果，方法如下：點(diǎn)擊功能按鈕 彈出新對(duì)話框，直接點(diǎn)擊確定。原始圖像消除噪點(diǎn)后圖像3.2.6合并MARKER泳道：拍攝ECL樣品時(shí)，肉眼可見的MARKER泳道是無(wú)法和其它泳道拍攝在同一張圖像中，所以，在分析前，我們需要將MARKER與其它泳道進(jìn)行圖像合成的操作。 第一步：點(diǎn)擊文件中的新建，建立一幅與原圖像素相當(dāng)?shù)膱D像。第二步：將其它泳道用選擇后復(fù)制，再粘貼到新圖像中。 第三步：將MARKER用選擇后復(fù)制，粘貼到新圖像中。合并完成。3.2.7 分析設(shè)置：請(qǐng)查看3.1.53.2.8 泳道識(shí)別：請(qǐng)查看3.1.63.2.9 條帶識(shí)別：請(qǐng)查看3.1.83.2.10 背景校準(zhǔn)

27、 請(qǐng)查看 3.1.93.2.11 標(biāo)準(zhǔn)分子量選擇 請(qǐng)查看 3.1.103.2.12 傾斜 請(qǐng)查看 3.1.113.2.13 結(jié)果 請(qǐng)查看 3.1.123.2.14 視圖選擇請(qǐng)查看3.1.153.2.15 報(bào)告的生成請(qǐng)查看 3.1.163.3 圖片合并 請(qǐng)查看3.2.53.4 染料數(shù)據(jù)庫(kù)和偽彩對(duì)于各種染料染色的凝膠，軟件自帶數(shù)據(jù)庫(kù)及其它染色功能可使圖像恢復(fù)自身顏色。首先，在圖像上點(diǎn)擊鼠標(biāo)右鍵，選擇“染料數(shù)據(jù)庫(kù)”。在數(shù)據(jù)庫(kù)中查找所需要的染料名稱。如沒有，可輸入新染料名稱的數(shù)據(jù)，并進(jìn)行保存。最后，將生成染色后的新圖像提 示：也可通過“偽彩色” 的方法進(jìn)行染色。3.5 PCR密度分析3.5.1 打開圖

28、像：請(qǐng)查看 3.1.13.5.2 圖像旋轉(zhuǎn)： 請(qǐng)查看 3.1.23.5.3 圖像調(diào)整：請(qǐng)查看 3.1.33.5.4 圖像增強(qiáng)： 請(qǐng)查看 3.1.43.5.5 分析設(shè)置：點(diǎn)擊功能按鈕 出現(xiàn)新的對(duì)話框： 在對(duì)話框中點(diǎn)擊定義區(qū)域會(huì)出現(xiàn)區(qū)域選取對(duì)話框，有不規(guī)則、魔術(shù)棒、偽彩三種選取方式，可通過顏色范圍調(diào)整區(qū)域大小。操作通過鼠標(biāo)左鍵來(lái)實(shí)現(xiàn)。點(diǎn)擊確定后，表格中會(huì)顯示出當(dāng)前選擇區(qū)域的數(shù)據(jù)。3.5.6 強(qiáng)度校準(zhǔn)：點(diǎn)擊對(duì)話框中的強(qiáng)度校準(zhǔn)，在已知MARKER的條帶上用鼠標(biāo)點(diǎn)擊,然后在質(zhì)量欄中輸入該條帶的質(zhì)量，在單位一欄中輸入單位,比如：ug、mg、ng、pg等。可輸入單個(gè)或多個(gè)已知質(zhì)量。最后在對(duì)話框中點(diǎn)擊確定。也

29、可保存含量曲線，今后可點(diǎn)擊載入調(diào)用。顯示校準(zhǔn)值3.5.7 保存實(shí)驗(yàn)：3.6 菌落/克隆計(jì)數(shù)分析3.6.1 打開圖像： 請(qǐng)查看 3.1.13.6.2 圖像旋轉(zhuǎn)： 請(qǐng)查看 3.1.23.6.3 圖像調(diào)整： 請(qǐng)查看 3.1.33.6.4 圖像增強(qiáng)： 請(qǐng)查看 3.1.43.6.5 分析設(shè)置：點(diǎn)擊功能按鈕 出現(xiàn)新的對(duì)話框。對(duì)于質(zhì)量高的菌落圖像，可直接點(diǎn)擊全自動(dòng)計(jì)數(shù)，進(jìn)行分析。對(duì)于有干擾的圖像，可通過選擇區(qū)域，然后進(jìn)行全自動(dòng)計(jì)數(shù)?？稍跒V鏡中設(shè)置參數(shù)，調(diào)整菌落的識(shí)別率，可在編輯中用添加菌落、刪除菌落、分割菌落、自動(dòng)分離的方法提高識(shí)別準(zhǔn)確率。點(diǎn)擊數(shù)據(jù)表、統(tǒng)計(jì)表、分布圖可獲得各種所需數(shù)據(jù)。3.7 斑點(diǎn)雜交分析3.7.1 打開圖像： 請(qǐng)查看 3.1.13.7.2 圖像旋轉(zhuǎn)：請(qǐng)查看 3.1.23.7.3 圖像調(diào)整： 請(qǐng)查看 3.1.33.7.4 圖像增強(qiáng)： 請(qǐng)查看 3.1.43.7.5 分析設(shè)置： 點(diǎn)擊功能按鈕，再點(diǎn)擊點(diǎn)，將出現(xiàn)參數(shù)設(shè)置對(duì)話框?？蛇x擇需分析點(diǎn)的形狀、大小