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文檔簡介
1、蛋白質1.等電點(pI):當氨基酸溶液在某一定pH值時,使某特定氨基酸分子上所帶正負電荷相等,成為兩性離子,在電場中既不向陽極也不向陰極移動,此時溶液的pH值即為該氨基酸的等電點(isoelectric point,pI)。 2.肽鍵和肽鏈:肽是由一個氨基酸的羧基和另一個氨基酸的氨基脫水縮合而形成的化合物,氨基酸之間脫水縮合后形成的共價鍵成為肽鍵。 3.肽平面及二面角:兩相鄰酰胺平面之間,能以共同的C為定點而旋轉,繞C-N鍵旋轉的角度稱角,繞C-C鍵旋轉的角度稱角。和稱作二面角,亦稱構象角。 4.一級結構:多肽鏈中氨基酸的排列順序,包括二硫鍵的位置稱為蛋白質的一級結構(primary stru
2、cture)。這是蛋白質最基本的結構,它內寓著決定蛋白質高級結構和生物功能的信息。 5.二級結構:蛋白質的二級結構(secondary structure)指肽鏈主鏈不同區(qū)段通過自身的相互作用,形成氫鍵,沿某一主軸盤旋折疊而形成的局部空間結構,是蛋白質結構的構象單元主要有以下類型:() 螺旋(helix)() 折疊(-pleated sheet)() 轉角(-turn)() 無規(guī)則卷曲(nonregular coil) 6.三級結構:多肽鍵在二級結構的基礎上,通過側鏈基團的相互作用進一步卷曲折疊,借助次級鍵維系使螺旋、折疊片、轉角等二級結構相互配置而形成特定的構象。 7.四級結構:四級結構是指
3、由相同或不同的稱作亞基(subunit)的亞單位按照一定排布方式聚合而成的蛋白質結構,維持四級結構穩(wěn)定的作用力是疏水鍵、離子鍵、氫鍵、范得華力。亞基本身都具有球狀三級結構,一般只包含一條多肽鏈,也有的由二條或二條以上由二硫鍵連接的肽鏈組成。 8.超二級結構:蛋白質中相鄰的二級結構單位(即單個螺旋或折疊或轉角)組合在一起,形成有規(guī)則的、在空間上能辯認的二級結構組合體稱為蛋白質的超二級結構 9.結構域:在二級結構的基礎上,多肽進一步卷曲折疊成幾個相對獨立、近似球形的三維實體,再由兩個或兩個以上這樣的三維實體締合成三級結構,這種相對獨立的三維實體稱為結構域。 10.蛋白質變性與復性:蛋白質各自所特有
4、的高級結構,是表現其物理性質和化學特性以及生物學功能的基礎。當天然蛋白質受到某些物理因素和化學因素的影響,使其分子內部原有的高級構象發(fā)生變化時,蛋白質的理化性質和生物學功能都隨之改變或喪失,但并未導致其一級結構的變化,這種現象稱為變性作用(denaturation) 蛋白質的變性作用如果不過于劇烈,則是一種可逆過程,變性蛋白質通常在除去變性因素后,可緩慢地重新自發(fā)折疊成原來的構象,恢復原有的理化性質和生物活性,這種現象成為復性(renaturation)。 11.分子?。褐赣捎谶z傳基因突變導致蛋白質分子中某些氨基酸序列的改變,從而造成蛋白質功能發(fā)生變化的一種遺傳病。 12.肽:肽是由一個氨基酸
5、的羧基和另一個氨基酸的氨基脫水縮合而形成的化合物 13.3.613螺旋:蛋白質的螺旋,每圈螺旋包括3.6個氨基酸殘基,螺距為0.54nm,相當于每個氨基酸殘基繞螺旋軸旋轉100°,沿軸上升0.15nm,其中3.6指每圈螺旋包括3.6個氨基酸殘基,3.6的右下角13表示氫鍵密閉的環(huán)內含有13個原子。 1、試比較核酸、蛋白質一級結構的異同,寫出各自基本結構單位的通式 相同:雖然二者在組成上差異很大,但在構成方式上卻很相似,主要表現在都是由基本結構單位通過特定的共價鍵連接而成的大分子,各自的主鏈都是不變成分,可變成分在側鏈上。2、簡述研究核酸、蛋白質一級結構的意義。生物的遺傳信息儲存于DN
6、A的核苷酸序列中,蛋白質的一級結構是由相應的DNA序列決定的,每一種蛋白質分子所具有的特定的一級結構又決定了其高級結構和生物學功能,也就表現出特定的生命現象。因此,研究核酸、蛋白質的一級結構可破譯生命的密碼,是在分子水平認識生命的突破口。核酸1.變性和復姓:變性:在物理、化學因素影響下, DNA堿基對間的氫鍵斷裂,雙螺旋解開,這是一個是躍變過程,伴有A260增加(增色效應),DNA的功能喪失。 復性:在一定條件下,變性DNA 單鏈間堿基重新配對恢復雙螺旋結構,伴有A260減?。p色效應),DNA的功能恢復。2.分子雜交:不同來源的DNA單鏈間或單鏈DNA與RNA之間只要有堿基配對的區(qū)域,在復性
7、時可形成局部雙螺旋區(qū),稱核酸分子雜交(hybridization) 3.增色效應和減色效應:由于DNA在260nm處的最大吸收值與其堿基有關,當DNA處于雙螺旋結構時其堿基藏于內側,但它變性時由于雙螺旋解開,堿基外露,導致260nm紫外吸收值增加,這一現象成為增色效應。 減色效應:通常指變性的DNA在重新形成雙螺旋結構時,其在260nm處的吸收值不斷降低的現象。4.回文結構:雙鏈DNA中含有的兩個結構相同、方向相反的序列稱為反向重復序列,也稱為回文結構。 5.Tm:DNA的變性發(fā)生在一個很窄的溫度范圍內,通常把熱變性過程中A260達到最大值一半時的溫度稱為該DNA的熔解溫度,用Tm表示。 6.
8、cAMP:3',5'-環(huán)腺苷酸,其結構為: 7.Chargaff定律:1.以摩爾含量表示,不同來源的DNA都存在著這種關系,即A=T和C=G;2.不同生物的DNA的堿基組成有很大的差異,可用不對稱比率:(A+T)/(C+G)表示。親緣關系相近的生物,其DNA的堿基組成相近,即不對稱比率相近;3.嘌呤堿基的總和與嘧啶堿基的總和相等。酶1.活性中心:酶分子中直接與底物結合,并和酶催化作用直接有關的區(qū)域叫酶的活性中心(active center)或活性部位(active site),參與構成酶的活性中心和維持酶的特定構象所必需的基團為酶分子的必需基團。2.全酶:由蛋白質和非蛋白質分子
9、組成,其中蛋白質部分稱為脫輔基酶蛋白,簡稱酶蛋白;非蛋白質部分稱為輔(助)因子,二者結合稱為全酶。即全酶=脫輔基酶蛋白+輔助因子。3.酶原:在體內處于無活性狀態(tài)的酶前身物4.活力單位:酶的活力是指酶催化一定化學反應的能力。通常用最適條件下酶所催化的某一化學反應的速率來衡量酶活力的大小。酶單位一umit(U)或katal(Kat)來表示。U的定義是一定時間內將一定量的底物轉化為產物的量(IU: 1moL變化量 / 分鐘);Kat表示在最適反應條件(25,最適離子強度和pH,最適底物濃度等),每秒鐘催化1mol底物轉化為產物的量。5.比活力:酶的比活力為每毫克總蛋白質所含有的酶活力單位數。以酶的活
10、力單位/mg蛋白質表示。6.米氏方程:7.Km:Km是米氏常數,Km是當酶促反應達到最大反應速率一半是所對應的底物濃度。單位一般用mol/L或mmol/L表示。Km可以近似地反應酶對底物的親和力,Km越小,則對底物的親和力越大;Km值是酶的特征性常數之一。8.誘導契合:1.酶的構象和底物的分子構象并不匹配。2.當底物分子和酶分子相靠近時,酶分子會誘導底物分子發(fā)生改變使其成為與酶分子相適應的構象,同時底物分子也會誘導酶分子改變?yōu)檫m合底物分子的構象。3.當產生產物后產物脫落,酶分子構象又恢復原樣。9.變構效應:有些酶分子表面除了具有活性中心外,還存在被稱為調節(jié)位點(或變構位點)的調節(jié)物特異結合位點
11、,調節(jié)物結合到調節(jié)位點上引起酶的構象發(fā)生變化,導致酶的活性提高或下降,這種現象稱為別構效應(allosteric effect),具有上述特點的酶稱別構酶(allosteric enzyme)。10.ribozyme:即核酶,酶是由生物體產生的、具有高度催化效率和高度特異性的生物催化劑,其中有核酸(RNA)組成的稱為核酶。11.輔酶和輔基:輔酶是輔助因子與酶蛋白以非共價鍵方式結合的復合酶。輔基是輔助因子與酶蛋白以共價鍵的方式結合的復合酶。12.固定化酶:將水溶性酶用物理或化學方法處理,固定于高分子支持物(或載體)上而成為不溶于水,但仍有酶活性的一種酶制劑形式,稱固定化酶(immobilized
12、 enzyme)。13.同工酶:存在于同一種屬或不同種屬,同一個體的不同組織或同一組織、同一細胞,具有不同分子形式但卻能催化相同的化學反應的一組酶,稱之為同工酶(isoenzyme)生物氧化1.生物氧化:糖類、脂肪、蛋白質等有機物質在細胞中進行氧化分解生成CO2和H2O并釋放出能量的過程稱為生物氧化(biological oxidation),其實質是需氧細胞在呼吸代謝過程中所進行的一系列氧化還原反應過程。2.氧化磷酸化:代謝物在生物氧化過程中釋放出的自由能用于合成ATP(即ADP+PiATP),這種氧化放能和ATP生成(磷酸化)相偶聯的過程稱氧化磷酸化。3.底物水平磷酸化:高能化合物直接傳遞
13、和提供Pi使GDP或ADP生成GTP或ATP的過程。4.呼吸鏈:線粒體基質是呼吸底物氧化的場所,底物在這里氧化所產生的NADH和FADH2將質子和電子轉移到內膜的載體上,經過一系列氫載體和電子載體的傳遞,最后傳遞給O2生成H2O。這種由載體組成的電子傳遞系統(tǒng)稱電子傳遞鏈(eclctron transfer chain),因為其功能和呼吸作用直接相關,亦稱為呼吸鏈。5.磷氧比(P0):呼吸過程中無機磷酸(Pi)消耗量和分子氧(O2)消耗量的比值稱為磷氧比。由于在氧化磷酸化過程中,每傳遞一對電子消耗一個氧原子,而每生成一分子ATP消耗一分子Pi ,因此P/O的數值相當于一對電子經呼吸鏈傳遞至分子氧
14、所產生的ATP分子數。NADH呼吸鏈: P/O 3,FADH2呼吸鏈: P/O 26.能荷:是指在腺苷酸庫(由ATP、ADP和AMP三種腺苷酸總濃度構成)中所所負荷的高能磷酸基的數量。意義: 能荷由ATP 、 ADP和AMP的相對數量決定,數值在01之間,反映細胞能量水平。 能荷對代謝的調節(jié)可通過ATP 、 ADP和AMP作為代謝中某些酶分子的別構效應物進行變構調節(jié)來實現。7.a-磷酸甘油穿梭:由于NADH和NAD+都不能自由穿過線粒體內膜,因此胞液中由糖酵解途徑產生的NADH必須通過特殊的穿梭系統(tǒng)才能進入線粒體內。這類穿梭系統(tǒng)是由一對-磷酸甘油脫氫酶同工酶完成的。胞液中的-磷酸甘油脫氫酶先將
15、NADH中的氫原子轉移至磷酸二羥丙酮上,形成-磷酸甘油,后者擴散至線粒體外膜與內膜的間隙中,并且在內膜表面的-磷酸甘油脫氫酶的作用下,將氫原子轉移至內膜中的FAD上,并經FADH2呼吸鏈氧化。同時,脫氫產生的磷酸二羥丙酮又返回到胞液中,參與下一輪穿梭。通過此循環(huán)可以將胞液中2個ATP交給線粒體內的FAD。8.蘋果酸/天冬氨酸穿梭系統(tǒng):當胞液中的NADH濃度升高時,由于胞液中的蘋果酸脫氫酶對NADH有很強的親和力,所以此酶將以NADH作為還原劑,迅速催化草酰乙酸還原成蘋果酸。蘋果酸通過線粒體內膜上的蘋果酸/-酮戊二酸載體進入到線粒體基質,然后在線粒體基質中的蘋果酸脫氫酶的催化下,又重新生成草酰乙
16、酸和NADH。所生成的NADH隨即進入NADH呼吸鏈進行氧化磷酸化,而草酰乙酸則在線粒體基質中的谷草轉氨酶催化下行成天冬氨酸,同時將谷氨酸變成-酮戊二酸并穿過線粒體內膜進入胞液,再由胞液中的谷草轉氨酶催化,將其轉變成為草酰乙酸參與下一輪穿梭。通過此循環(huán)可以將胞液中3個ATP交給線粒體內的NAD+。糖1.糖酵解:糖酵解是將葡萄糖降解為丙酮酸并伴隨著ATP生成的一系列反應,是生物體內普遍存在的葡萄糖降解的途徑。該途徑也稱作Embden-Meyethof-Parnas途徑,簡稱途徑。生物學意義 是葡萄糖在生物體內進行有氧或無氧分解的共同途徑,通過糖酵解,生物體獲得生命活動所需要的能量; 形成多種重要
17、的中間產物,為氨基酸、脂類合成提供碳骨架; 為糖異生提供基本途徑。2.三羧酸循環(huán):在線粒體中,乙酰CoA首先與草酰乙酸縮合生成檸檬酸,然后經過一系列的代謝反應,乙?;谎趸纸猓蒗R宜嵩偕难h(huán)反應過程。由于該循環(huán)的第一個產物是檸檬酸,故稱檸檬酸循環(huán);再循環(huán)過程中產生了含3個羧基的中間產物(檸檬酸、順烏頭酸、異檸檬酸),因此又叫三羧酸循環(huán),簡稱TCA循環(huán);又由于提出該循環(huán)的主要貢獻者是英國生化學家Krebs,所以又稱Krebs循環(huán),該循環(huán)可分為8大步反應。TCA循環(huán)式糖、脂肪、蛋白質三大物質徹底氧化分解的共同通道,具有重要的生物學意義。·意義:1.是有機體獲得生命活動所需能量的主
18、要途徑2.是糖、脂、蛋白質等物質代謝和轉化的中心樞紐3.形成多種重要的中間產物3.是發(fā)酵產物重新氧化的途徑3.磷酸戊糖途徑:在細胞溶質中,該途徑包括氧化和非氧化兩個階段,首先6-磷酸葡萄糖(G-6-P)直接氧化脫氫,產生NADPH+H+,然后經過一些列代謝反應生成磷酸戊糖等中間代謝物,再重新進入糖氧化分解途徑的一條葡萄糖旁路代謝途徑。此途徑從G-6-P開始,又稱為磷酸己糖之路。其生物學意義:1.產生大量NADPH,主要用于還原(加氫)反應,為細胞提供還原力2.產生大量的磷酸核糖和其它重要中間產物3.與光合作用聯系,實現某些單糖間的轉變4.糖異生作用:非糖物質轉化成糖代謝的中間產物后,在相應的酶催化下,繞過糖酵解途徑的三個不可逆反應,利用糖酵解途徑其它酶生成葡萄糖的途徑稱為糖異生。5.糖的有氧氧化脂1.氧化:脂肪酸氧化作用發(fā)生在-碳原子上,分解出CO2,生成比原來少一個碳原子的脂肪酸,這種氧化作用稱為-氧化作用。2.氧化:脂肪酸在體內氧化時在羧基端的-碳原子上進行氧化,碳鏈逐次斷裂,每次斷下一個二碳單位,既乙酰CoA,該過程稱作-氧化。3.氧化:脂肪酸的-氧化指脂肪酸的末端甲基(-端)經氧化轉變成羥基,繼而再氧化成羧基,從而形成,-二羧酸的過程。4.ACP:酰基載體蛋白。飽和脂肪
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