固相合成基礎(chǔ)SPPS

1、一 、多 肽 合 成 概 論1多肽化學(xué)合成概述： 1963年，1創(chuàng)立了將氨基酸的C末端固定在不溶性樹脂上，然后在此樹脂上依次縮合氨基酸，延長肽鏈、合成蛋白質(zhì)的固相合成法，在固相法中，每步反應(yīng)后只需簡單地洗滌樹脂，便可達到純化目的.克服了經(jīng)典液相合成法中的每一步產(chǎn)物都需純化的困難，為自動化合成肽奠定了基礎(chǔ).為此，Merrifield獲得1984年諾貝爾化學(xué)獎.今天，固相法得到了很大發(fā)展.除了Merrifield所建立的Boc法(Boc:叔丁氧羰基)之外，又發(fā)展了Fmoc固相法(Fmoc:9-芴甲氧羰基).以這兩種方法為基礎(chǔ)的各種肽自動合成儀也相繼出現(xiàn)和發(fā)展，并仍在不斷得到改造和完善.Merrif

2、ield所建立的Boc合成法2是采用TFA(三氟乙酸)可脫除的Boc為-氨基保護基，側(cè)鏈保護采用芐醇類.合成時將一個Boc氨基酸衍生物共價交聯(lián)到樹脂上，用TFA脫除Boc，用三乙胺中和游離的氨基末端，然后通過Dcc活化、耦聯(lián)下一個氨基酸，最終脫保護多采用HF法或TFMSA(三氟甲磺酸)法.用Boc法已成功地合成了許多生物大分子，如活性酶、生長因子、人工蛋白等. 多肽是涉及生物體內(nèi)各種細胞功能的生物活性物質(zhì)。它是分子結(jié)構(gòu)介于氨基酸和蛋白質(zhì)之間的一類化合物,由多種氨基酸按照一定的排列順序通過肽鍵結(jié)合而成。到現(xiàn)在，人們已發(fā)現(xiàn)和分離出一百多種存在于人體的肽，對于多肽的研究和利用，出現(xiàn)了一個空前的繁榮景

3、象。多肽的全合成不僅具有很重要的理論意義，而且具有重要的應(yīng)用價值。通過多肽全合成可以驗證一個新的多肽的結(jié)構(gòu)；設(shè)計新的多肽，用于研究結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系；為多肽生物合成反應(yīng)機制提供重要信息；建立模型酶以及合成新的多肽藥物等。 多肽的化學(xué)合成技術(shù)無論是液相法還是固相法都已成熟。近幾十年來，固相法合成多肽更以其省時、省力、省料、便于計算機控制、便于普及推廣的突出優(yōu)勢而成為肽合成的常規(guī)方法并擴展到核苷酸合成等其它有機物領(lǐng)域。本文概述了固相合成的基本原理、實驗過程，對其現(xiàn)狀進行分析并展望了今后的發(fā)展趨勢。從1963年Merrifield發(fā)展成功了固相多肽合成方法以來，經(jīng)過不斷的改進和完善，到今天固相法已成為

4、多肽和蛋白質(zhì)合成中的一個常用技術(shù)，表現(xiàn)出了經(jīng)典液相合成法無法比擬的優(yōu)點。其基本原理是：先將所要合成肽鏈的羥末端氨基酸的羥基以共價鍵的結(jié)構(gòu)同一個不溶性的高分子樹脂相連，然后以此結(jié)合在固相載體上的氨基酸作為氨基組份經(jīng)過脫去氨基保護基并同過量的活化羧基組分反應(yīng)，接長肽鏈。重復(fù)（縮合洗滌去保護中和及洗滌下一輪縮合）操作，達到所要合成的肽鏈長度，最后將肽鏈從樹脂上裂解下來，經(jīng)過純化等處理，即得所要的多肽。其中-氨基用BOC（叔丁氧羰基）保護的稱為BOC固相合成法，-氨基用FMOC（9-芴甲氧羰基）保護的稱為FMOC固相合成法， 2固相合成的基本原理 多肽合成是一個重復(fù)添加氨基酸的過程，固相合成順序一般從

5、C端（羧基端）向 N端（氨基端）合成。過去的多肽合成是在溶液中進行的稱為液相合成法?，F(xiàn)在多采用固相合成法，從而大大的減輕了每步產(chǎn)品提純的難度。為了防止副反應(yīng)的發(fā)生，參加反應(yīng)的氨基酸的側(cè)鏈都是保護的。羧基端是游離的，并且在反應(yīng)之前必須活化?；瘜W(xué)合成方法有兩種，即Fmoc和tBoc。由于Fmoc比tBoc存在很多優(yōu)勢，現(xiàn)在大多采用Fmoc法合成，如圖：具體合成由下列幾個循環(huán)組成：一、去保護：Fmoc保護的柱子和單體必須用一種堿性溶劑（piperidine）去 除氨基的保護基團。二、激活和交聯(lián)：下一個氨基酸的羧基被一種活化劑所活化?；罨膯误w與游離的氨基反應(yīng)交聯(lián)，形成肽鍵。在此步驟使用大量的超濃度試

6、劑驅(qū)使反應(yīng)完成。循環(huán)：這兩步反應(yīng)反復(fù)循環(huán)直到合成完成。三、洗脫和脫保護：多肽從柱上洗脫下來，其保護基團被一種脫保護劑（TFA） 洗脫和脫保護。2.1 樹脂的選擇及氨基酸的固定 將固相合成與其他技術(shù)分開來的最主要的特征是固相載體，能用于多肽合成的固相載體必須滿足如下要求：必須包含反應(yīng)位點（或反應(yīng)基團），以使肽鏈連在這些位點上，并在以后除去；必須對合成過程中的物理和化學(xué)條件穩(wěn)定；載體必須允許在不斷增長的肽鏈和試劑之間快速的、不受阻礙的接觸；另外，載體必須允許提供足夠的連接點，以使每單位體積的載體給出有用產(chǎn)量的肽，并且必須盡量減少被載體束縛的肽鏈之間的相互作用。用于固相法合成多肽的高分子載體主要有三

7、類：聚苯乙烯-苯二乙烯交聯(lián)樹脂、聚丙烯酰胺、聚乙烯-乙二醇類樹脂及衍生物，這些樹脂只有導(dǎo)入反應(yīng)基團，才能直接連上（第一個）氨基酸。根據(jù)所導(dǎo)入反應(yīng)基團的不同，又把這些樹脂及樹脂衍生物分為氯甲基樹脂、羧基樹脂、氨基樹脂或酰肼型樹脂。BOC合成法通常選擇氯甲基樹脂，如Merrifield樹脂；FMOC合成法通常選擇羧基樹脂如王氏樹脂。氨基酸的固定主要是通過保護氨基酸的羧基同樹脂的反應(yīng)基團之間形成的共價鍵來實現(xiàn)的，形成共價鍵的方法有多種：氯甲基樹脂，通常先制得保護氨基酸的四甲銨鹽或鈉鹽、鉀鹽、銫鹽，然后在適當溫度下，直接同樹脂反應(yīng)或在合適的有機溶劑如二氧六環(huán)、DMF或DMSO中反應(yīng)；羧基樹脂，則通常加

8、入適當?shù)目s合劑如DCC或羧基二咪唑，使被保護氨基酸與樹脂形成共酯以完成氨基酸的固定；氨基樹脂或酰肼型樹脂，卻是加入適當?shù)目s合劑如DCC后，通過保護氨基酸與樹脂之間形成的酰胺鍵來完成氨基酸的固定。氨基、羧基、側(cè)鏈的保護及脫除 要成功合成具有特定的氨基酸順序的多肽，需要對暫不參與形成酰胺鍵的氨基和羧基加以保護，同時對氨基酸側(cè)鏈上的活性基因也要保護，反應(yīng)完成后再將保護基因除去。同液相合成一樣，固相合成中多采用烷氧羰基類型作為氨基的保護基，因為這樣不易發(fā)生消旋。最早是用芐氧羰基，由于它需要較強的酸解條件才能脫除，所以后來改為叔丁氧羰基（BOC）保護，用TFA（三氟乙酸）脫保護，但不適用含有色氨酸等對酸

9、不穩(wěn)定的肽類的合成。1978年，chang Meienlofer和Atherton等人采用Carpino報道的Fmoc(9-芴甲氧羰基)作為氨基保護基，F(xiàn)moc基對酸很穩(wěn)定，但能用哌啶-CH2CL2或哌啶-DMF脫去，近年來，F(xiàn)moc合成法得到了廣泛的應(yīng)用。羧基通常用形成酯基的方法進行保護。甲酯和乙酯是逐步合成中保護羧基的常用方法，可通過皂化除去或轉(zhuǎn)變?yōu)殡乱员阌糜谄瑪嘟M合；叔丁酯在酸性條件下除去；芐酯常用催化氫化除去。對于合成含有半胱氨酸、組氨酸、精氨酸等帶側(cè)鏈功能基的氨基酸的肽來說，為了避免由于側(cè)鏈功能團所帶來的副反應(yīng)，一般也需要用適當?shù)谋Ｗo基將側(cè)鏈基團暫時保護起來。保護基的選擇既要保證側(cè)鏈

10、基團不參與形成酰胺的反應(yīng)，又要保證在肽合成過程中不受破壞，同時又要保證在最后肽鏈裂解時能被除去。如用三苯甲基保護半胱氨酸的S-，用酸或銀鹽、汞鹽除去；組氨酸的咪唑環(huán)用2,2,2-三氟-1-芐氧羰基和2,2,2-三氟-1-叔丁氧羰基乙基保護，可通過催化氫化或冷的三氟乙酸脫去。精氨酸用金剛烷氧羰基（Adoc）保護，用冷的三氟乙酸脫去。固相中的接肽反應(yīng)原理與液相中的基本一致，將兩個相應(yīng)的氨基被保護的及羧基被保護的氨基酸放在溶液內(nèi)并不形成肽鍵，要形成酰胺鍵，經(jīng)常用的手段是將羧基活化，變成混合酸酐、活潑酯、酰氯或用強的失去劑（如碳二亞氨）形成對稱酸酐等方法來形成酰胺鍵。其中選用DCC、HOBT或HOBT

11、/DCC的對稱酸酐法、活化酯法接肽應(yīng)用最廣。 裂解及合成肽鏈的純化 BOC法用TFA+HF裂解和脫側(cè)鏈保護基，F(xiàn)MOC法直接用TFA，有時根據(jù)條件不同，其它堿、光解、氟離子和氫解等脫保護方法也被采用。合成肽鏈進一步的精制、分離與純化通常采用高效液相色譜、親和層析、毛細管電泳等。 4固相合成的特點及存在的主要問題 固相合成法對于肽合成的顯著的優(yōu)點：簡化并加速了多步驟的合成；因反應(yīng)在一簡單反應(yīng)器皿中便可進行，可避免因手工操作和物料重復(fù)轉(zhuǎn)移而產(chǎn)生的損失；固相載體共價相聯(lián)的肽鏈處于適宜的物理狀態(tài)，可通過快速的抽濾、洗滌未完成中間的純化，避免了液相肽合成中冗長的重結(jié)晶或分柱步驟，可避免中間體分離純化時大

12、量的損失；使用過量反應(yīng)物，迫使個別反應(yīng)完全，以便最終產(chǎn)物得到高產(chǎn)率；增加溶劑化，減少中間的產(chǎn)物聚焦；固相載體上肽鏈和輕度交聯(lián)的聚合鏈緊密相混，彼此產(chǎn)生一種相互的溶劑效應(yīng)，這對肽自聚集熱力學(xué)不利而對反應(yīng)適宜。固相合成的主要存在問題是固相載體上中間體雜肽無法分離，這樣造成最終產(chǎn)物的純度不如液相合成物，必需通過可靠的分離手段純化。 5固相合成的研究發(fā)展前景固相多肽合成已經(jīng)有40年的歷史了，然而到現(xiàn)在，人們還只能合成一些較短的肽鏈，更談不上隨心所欲地合成蛋白質(zhì)了，同時合成中的試劑毒性，昂貴費用，副產(chǎn)物等一直都是令人頭痛的問題，而在生物體內(nèi)，核糖體上合成肽鏈的速度和產(chǎn)率都是驚人的，那么，是否能從生物體合

13、成蛋白質(zhì)的原理上得到一些啟發(fā)，應(yīng)用在固相多肽合成（樹脂）上，這是一個令人感興趣的問題，也許是今后多肽合成的發(fā)展。在Boc合成法中，反復(fù)地用酸來脫保護，這種處理帶來了一些問題：如在肽與樹脂的接頭處，當每次用50%TFA脫Boc基時，有約1.4%的肽從樹脂上脫落，合成的肽越大，這樣的丟失越嚴重；此外，酸催化會引起側(cè)鏈的一些副反應(yīng).Boc合成法尤其不適于合成含有色氨酸等對酸不穩(wěn)定的肽類.1978年，Chang、Meienlofer和Atherton等人采用Carpino3報道的Fmoc(9-芴甲氧羰基)基團作為-氨基保護基，成功地進行了多肽的Fmoc固相合成.Fmoc法與Boc法的根本區(qū)別在于采用了

14、堿可脫除的Fmoc為-氨基的保護基.側(cè)鏈的保護采用TFA可脫除的叔丁氧基等，樹脂采用90%TFA可切除的對烷氧芐醇型樹脂和1%TFA可切除的二烷氧芐醇型樹脂，最終的脫保護避免了強酸處理.6. Fmoc氨基酸的制備和側(cè)鏈保護Fmoc基團是在有NaHCO3或Na2CO3存在的二氧六環(huán)溶液中，通過以下反應(yīng)引入到氨基酸中的：理想的Fmoc-氨基酸的側(cè)鏈保護基應(yīng)在堿性條件下穩(wěn)定，在酸性條件下脫除.下面對其做一介紹.6.1Asp和GluAsp和Glu側(cè)鏈羧基常用t-Bu保護.可用TFA、TMSBr等脫除.但是用t-Bu保護仍有側(cè)鏈環(huán)化形成酰亞胺的副反應(yīng)發(fā)生.近年來，發(fā)展了一些新的保護基如環(huán)烷醇酯、金剛烷醇

15、酯等可減輕這一副反應(yīng)，這些保護基可用TMSOTf(三氟甲磺酸三甲硅烷酯)除去.6.2Ser、Thr和Tyrser、Thr的羥基及Tyr的酚羥基通常用t-Bu保護.叔丁基的引入比較麻煩，首先ser制成芐氧羰基酯，再在酸催化下與異丁烯反應(yīng).Ser和Thr還可用芐基保護，Ser用芐醇引入芐基、Thr用溴芐引入芐基.6.3Asn和GlnAsn和Gln側(cè)鏈的酰胺鍵在肽合成中一般不加以保護.但合成大肽時，Asn和Gln的-羧基活化時可能會發(fā)生分子內(nèi)脫氫反應(yīng)生成氰基化合物.堿性時Gln的側(cè)鏈可以環(huán)化生成酰胺.而且不保護的Fmoc-Gln和Fmoc-Asn在DCM中溶解度很差.為了避免這些問題，可以用9-咕噸

16、基，2，4，6-三甲氧芐基，4，4二甲氧二苯甲基或三苯甲基等保護，這四種基因均可用TFA脫除.6.4HisHis是最容易發(fā)生消旋化的氨基酸，必須加以保護.對咪唑環(huán)的非-N開始用芐基(Bzl)和甲基磺酰基(TOS)保護.但這兩種保護基均不太理想.TOS對親核試劑不穩(wěn)定，Bzl需要用氫解或Na/NHs除去，并且產(chǎn)生很大程度消旋.Boc基團是一個較理想的保護基，降低了咪唑環(huán)的堿性，抑制了消旋，成功地進行了一些合成.但是當反復(fù)地用堿處理時，也表現(xiàn)出一定的不穩(wěn)定性.哌啶羰基在堿中穩(wěn)定，但是沒能很好地抑制消旋，而且脫保護時要用很強的親核試劉如.對咪唑環(huán)-N保護，可以完全抑制消旋，-N可以用芐氧甲基(Bom

17、)和叔丁氧甲基(Bum)保護，(Bum)可以用TFA脫除，Bom更穩(wěn)定些，需用催化氫解或強酸脫保護，Bum是目前很有發(fā)展前途的His側(cè)鏈保護基，其不足之處在于Fmoc(His)Bum在DCM和DMF中的溶解度較差.6.5CysCys的SH具有強親核性，易被?；闪蛎?，也易被氧化為二硫鍵，必須加以保護.常用保護基有三類：一類用TFA可脫除，如對甲芐基、對甲氧芐基和三苯甲基等；第二類可用(CF3CO)3T1TFA脫除，對TFA穩(wěn)定.如t-Bu、Bom和乙酰胺甲基等.第三類對弱酸穩(wěn)定，如芐基和叔丁硫基(stBu)等，Cys(StBu)可用巰基試劑和磷試劑還原，Cys(Bzl)可用Na/NH3(1)脫

18、保護.6.6ArgArg的胍基具有強親核性和堿性，必須加以保護.理想的情況是三個氮都加以保護，實際上保護1或2個胍基氮原子.保護基分四類：(1)硝基(2)烷氧羰基(3)磺?；?4)三苯甲基.硝基在制備、?；呀庵挟a(chǎn)生很多副反應(yīng)，應(yīng)用不廣.烷氧羰基應(yīng)主要有Boc和二金剛烷氧羰基(Adoc)2、Fmoc(Arg)Boc的耦聯(lián)反效率不高，哌啶理時不處穩(wěn)定，會發(fā)生副反應(yīng)；Adoc保護了兩個非N，但有同樣的副反應(yīng)發(fā)生.對磺酰基保護，其中TOS應(yīng)用最廣，但它較難脫除.近年來2，3，6-三甲基-4-甲氧苯橫酰基(Mtr)較受歡迎，在TFA作用下，30分鐘即可脫除，但是它們都不能完全抑制側(cè)鏈的?；l(fā)生.三苯甲

19、基保護基可用TFA脫除.缺點是反應(yīng)較慢，側(cè)鏈仍有酰化反應(yīng)，且其在DCM、DMF中溶解度不好.6.7LysLys的-NH2必須加以保護.但與NH2的保護方式應(yīng)不同，該保護基要到肽鏈合成后除去.NH2的保護無消旋問題，可以采用酰基保護基，其它常用的保護基有芐氧碳基和Boc.6.8Fmoc基團的脫除Fmoc基團的芴環(huán)系的吸電子作用使9-H具有酸性，易被較弱堿除去，反應(yīng)條件很溫和.反應(yīng)過程可表示如下：哌啶進攻9-H,消除形成二苯芴烯，很容易被二級環(huán)胺進攻形成穩(wěn)定的加成物.Fmoc基團對不同的堿穩(wěn)定性不同，可根據(jù)實際條件選用.6.9耦聯(lián)反應(yīng)固相中的接肽反應(yīng)原理與液相中基本一致.將兩個相應(yīng)的氨基被保護的及

20、羧基被保護的氨基酸放在溶液內(nèi)，并不形成肽鍵.要形成酰胺鍵，經(jīng)常用的手段是將羧基活化，其方法是將它變成混合酸酐，或者將它變?yōu)榛顫婖?、酰氯，或者用強的失去?碳二亞胺)也可形成酰胺鍵，耦聯(lián)反應(yīng)可表示如下：(A：羰基活潑試劑)碳二亞胺是常用的活化試劑，其中Dcc使用范圍最廣，其缺點是形成了不溶于DCM的DCH，過濾時又難于除盡.其他一些如二異丙基碳二亞胺(DCI)、甲基叔丁基碳二亞胺也用于固相合成中，它們形成的脲溶于DCM中，經(jīng)洗滌可以除去.其他活化試劑，還有Bop(BopC1)、氯甲酸異丙酯、氯甲酸異丁酯、SOC12等.其中Dcc、Bop活化形成對稱酸酐、SOC12形成酰氯，其余三種形成不對稱酸酐

21、.6.10對稱酸酐法用Dcc形成對稱酸酐的方法使用較廣.其缺點是有些氨基酸在DCM中不易溶解，生成的Fmoc氨基酸酐溶解度更差.同時還有些副反應(yīng)，如形成二肽、消旋等.6.11混合酸酐法最常用試劑是氯甲酸的異丙基酯和異丁基酯.前者得到的酸酐穩(wěn)定性好.只產(chǎn)生很少消旋，在適當?shù)幕瘜W(xué)計量及溶劑條件下，耦聯(lián)反應(yīng)很快.而且，在此反應(yīng)中使用的N-甲基嗎啉和N-甲基哌啶對Fmoc基團無影響.6.12酰氯法在Boc法中不常用的酰氯，因為比較激烈，一些保護基如Boc不穩(wěn)定.但是，F(xiàn)moc基團可以耐受酰氯處理，生成的Fmoc氨基酰氯也很穩(wěn)定.在三甲基乙酸三胺或苯并三氮唑二異丙基乙二胺中，反應(yīng)速度很快，消旋很少.酰氯

22、法在固相合成中應(yīng)用還不多，但已表明，F(xiàn)moc氨基酰氯適用于合成有立體障礙的肽序列.6.13活化酯法活化酯法在固相合成中應(yīng)用最為廣泛.采用過的試劑也很多，近來最常用的有HOBt酯、ODhbt酯、OTDO酯等.HOBt酯反應(yīng)快，消旋少，用碳二亞胺很容易制得；ODhbt酯很穩(wěn)定，容易進行分離純化，與HOBt酯具有類似的反應(yīng)性和消旋性能，它還有一個優(yōu)越之處，在?；瘯r有亮黃色、耦聯(lián)結(jié)束時顏色消失，有利于監(jiān)測反應(yīng)；OTDO酯與ODhbt酯類似，消旋化極低，易分離，?；瘯r伴有顏色從桔紅色到黃色的變化等.6.14原位法將碳二亞胺和N保護氨基酸直接加到樹脂中進行反應(yīng)叫做原位法.用DIC代替Dcc效果更好.其他的

23、活化試劑還有Bop和Bop-C1等.原位法反應(yīng)快、副反應(yīng)少、易操作.其中DIC最有效，其次是Bop、Bop-C1等.遺憾的是Bop酰化時生成致癌的六甲基磷酰胺，限制了其應(yīng)用.6.15裂解及側(cè)鏈保護基脫除Fmoc法裂解和脫側(cè)鏈保護基時可采用弱酸.TFA為應(yīng)用最廣泛的弱酸試劑，它可以脫除t-Bu、Boc、Adoc、Mtr等；條件溫和、副反應(yīng)較少.不足之處：Arg側(cè)鏈的Mtr很難脫除，TFA用量較大；無法除掉Cys的t-Bu等基因.也有采用強酸脫保護的方法：如用HF來脫除一些對弱酸穩(wěn)定的保護基，如Asp、Glu、Ser、Thr的Bzl(芐基)保護基等，但是當脫除Asp 的吸電子保護基時，會引起環(huán)化副

24、反應(yīng).而TMSBr和TMSOTf在有苯甲硫醚存在時，脫保護速度很快.此外，根據(jù)條件不同，堿、光解、氟離子和氫解等脫保護方法也有應(yīng)用.Fmoc基團用于固相合成多肽已經(jīng)有了十多年的歷史，在合成一些含有在酸性條件下不穩(wěn)定的氨基的殘基的肽時，具有特別優(yōu)越之處.將Fmoc法和Boc法互相補充，定會在合成更多、更大的生物分子中發(fā)揮。 二、常用保護氨基酸數(shù)據(jù)縮寫名稱分子量殘基縮寫名稱分子量殘基A-AlaFmoc-Ala311.371.08M-MetFmoc-Met371.5131.20R-ArgFmoc-Arg(Pbf)648.77155.18F-PheFmoc-Phe387.4147.18N-AsnFmo

25、c-Asn(Trt)596.7114.11P-ProFmoc-Pro337.497.19D-AspFmoc-Asp(OtBu)411.46115.09S-SerFmoc-Ser(tBu)383.487.08C-CysFmoc-Cys(Trt)585.7103.15T-ThrFmoc-Thr(tBu)397.5101.11Q-GlnFmoc-Gln(Trt)610.7128.13W-TrpFmoc-Trp (Boc)526.59186.22E-GluFmoc-Glu(OtBu)425.48129.12(D)W-TrpFmoc-Tyr(tBu)459.5163.18G-GlyFmoc-Gly297

26、.357.05D-TyrFmoc-Val339.499.13H-HisFmoc-His(Trt)619.7137.14V-ValPyroGlu129.1I-IleFmoc-Ile353.4113.16pGluL-LeuFmoc-Leu353.4113.16K-LysFmoc-Lys (Boc)468.5128.18常用試劑種類及數(shù)據(jù)名稱分子量名稱分子量密度（g/ml）HOBt135.1DIPCDI(DIC)126.30.806TBTU321.1DIPEA(DIA)129.40.76HATU380.3Ac2O102.11.08DMAP122.1Pyridine79.10.983HOAT136.1

27、TFA114.21.44Cl-HOBt169.57TMP121.180.92HBTU379.3EDT94.241.123HMPA182.18TIS158.40.773PyBoc520.4NMM101.150.9168常見保護基團結(jié)構(gòu)及數(shù)據(jù)縮寫分子量縮寫分子量縮寫分子量Fmoc-222tBu-56Acm-57Pbf-253OtBu-72Mz-165.1Trt-242.3Ac-43Boc-101.1Z-134.1三、常用氨基酸結(jié)構(gòu)及性質(zhì)NameSymbolMWMW (-H2O)StructureThree Letter CodeOne Letter CodeAlanine AlaA89.0971.

28、08Arginine ArgR174.20156.19Asparagine AsnN132.12114.10Aspartic Acid AspD133.10115.09Cysteine CysC121.15103.15Glutamic Acid GluE147.13129.12Glutamine GlnQ146.15128.13Glycine GlyG75.0757.05Histidine HisH155.16137.14Isoleucine IleI131.17113.16Leucine LeuL131.17113.16Lysine LysK146.19128.17Methionine Me

29、tM149.21131.20Phenylalanine PheF165.19147.18Proline ProP115.1397.12Serine SerS105.0987.08Threonine ThrT119.12101.11Tryptophan TrpW204.23186.21Tyrosine TyrY181.19163.18Valine ValV117.1599.13四、常見保護基團結(jié)構(gòu)Name Structure Symbol Formula Residue WtAcetamidomethyl AcmC3H6NO 72.1Acetyl AcC2H3O 43.0Allyloxycarb

30、onyl AlocC4H5O2 85.16-Amidohexanoate LCC4H7NO 85.17-Amido-4-methylcoumaryl AMCC10H8NO2 174.27-Amido-4-trifluoromethyl-coumaryl AFCC10H5F3NO2 228.25-(2-Aminoethyl)amino-naphthalene-1-sulfonic acid EDANSC12H13N2O3S265.3Benzoyl BzC7H5O105.1Benzyl BzlC7H791.1Benzyloxycarbonyl Z (Cbz)C8H7O2135.1Benzyloxy

31、methyl BomC8H9O121.2(+)-Biotinyl BiotinC10H15N2O2S227.32-Bromobenzyloxycarbonyl 2-Br-ZC8H6BrO2 214.0tert-Butyl tBuC4H957.1tert-Butyloxycarbonyl BocC5H9O2101.1tert-Butylthio StBuC4H9S89.22-Chlorobenzyloxycarbonyl 2-Cl-ZC8H6ClO2169.6Cyclohexyl cHexC6H1183.12,6-Dichlorobenzyl 2,6-di-Cl-BzlC7H5Cl2160.04

32、-(4-Dimethylaminophenyl-azo)benzoyl DABCYLC15H14N3O252.32,4-Dinitrophenyl DnpC6H3N2O4167.19-Fluorenylmethyl FmC14H11179.19-Fluorenylmethyloxy-carbonyl FmocC15H11O2223.3Fluorescein Isothiocyanate FITCC21H12NO5S390.4Lissamine Rhodamine LRC31H38N2O6S2598.8Mesitylene-2-sulfonyl MtsC9H11O2S183.34-Methoxy

33、benzyl MobC8H9O121.2(7-Methoxycoumarin-4-yl)acetyl McaC12H9O4217.24-Methoxy-2,3,6-trimethyl-benzenesulfonyl MtrC10H13O3S213.34-Methoxytrityl MmtC20H17O273.44-Methylbenzyl MBzlC8H9105.24-Methyltrityl MttC20H17257.44-Morpholinecarbonyl MuC5H8NO2114.1p-Nitroanilide pNAC6H5N2O2137.12,2,4,6,7-Pentamethyl

34、dihydro-benzofuran-5-sulfonyl PbfC13H17O3S253.32,2,5,7,8-Pentamethyl-chroman-6-sulfonyl PmcC14H19O3S267.4Rhodamine 110 R110C20H13N2O3329.3Succinyl SucC4H5O3101.14-Toluenesulfonyl TosC7H7O2S155.2Trityl TrtC17H15243.3Xanthyl XanC13H9O181.2五、多肽常識Reconstitution and Storage of Peptides Peptides are usual

35、ly supplied as a fluffy, freeze-dried material in serum vials. Store peptides in a freezer after they have been received. In order to reconstitute the peptide, distilled water or a buffer solution should be utilized. Some peptides have low solubility in water and must be dissolved in other solvents

36、such as 10% acetic acid for a positively charged peptide or 10% ammonium bicarbonate solution for a negatively charged peptide. Other solvents that can be used for dissolving peptides are acetonitrile, DMSO, DMF, or isopropanol. Use the minimal amount of these non-aqueous solvents and add water or b

37、uffer to make up the desired volume. After peptides are reconstituted, they should be used as soon as possible to avoid degradation in solution. Unused peptide should be aliquoted into single-use portions, relyophilized if possible, and stored at -20C. Repeated thawing and refreezing should be avoid

38、ed. Methods to Dissolve Peptides The best way to dissolve a peptide is to use water. For peptides that are not soluble in water, use the following procedure: 1. For acidic peptides, use a small amount of base such as 10% ammonium bicarbonate to dissolve the peptide, dilute with water to the desired

39、concentration. Do not use base for cysteine-containing peptides. 2. For basic peptides, use a small amount of 30% acetic acid, dilute with water to the desired concentration. 3. For a very hydrophobic peptide, try dissolving the peptide in a very small amount of DMSO, dilute with water to the desire

40、d concentration. 4. For peptides that tend to aggregate (usually peptides containing cysteines), add 6 M urea, 6 M urea with 20% acetic acid, or 6 M guanidineHCl to the peptide, then proceed with the necessary dilutions. Preparation of HBTU/HOBt Solution for the Peptide Synthesizer 1. Preparation of

41、 0.5 M HOBt in DMF: o Weigh 13.5 g anhydrous HOBt (0.1 mol, MW 135.1) 100 g, AnaSpec Catalog # 21003; 500 g, AnaSpec Catalog # 21004 into a 250 mL graduated cylinder. o Add DMF until the 200 mL level is reached. 2. Preparation of 0.45 M HBTU/HOBt solution: o Add the solution prepared in step 1 to 37

42、.9 g HBTU (0.1 mol, MW 379.3) 100 g, AnaSpec Catalog # 21001; 500 g, AnaSpec Catalog # 21002 contained in a beaker or an Erlenmayer flask. 3. Stir for about 15 min with a magnetic stirring bar until HBTU is dissolved. 4. Filter the solution through a fine pore size sintered glass funnel. 5. Pour the

43、 filtered solution into an appropriate bottle for attachment to a peptide synthesizer. * This solution is stable at room temperature for at least six weeks. Biotinylation of Amino Group 1. Wash 0.1 mmol resin with DMF. 2. Dissolve 0.244 g (+)-biotin (1 mmol, MW 244.3) 1 g, AnaSpec Catalog # 21100; 5

44、 g, AnaSpec Catalog # 21101 in 5 mL DMF-DMSO (1:1) solution. A little warming is necessary. 3. Add 2.1 mL 0.45 M HBTU/HOBt solution and 0.3 mL DIEA to the solution prepared in step 2. 4. Add the activated biotin solution to the resin and let stir overnight. 5. Check resin to make sure coupling is co

45、mplete as evidenced by negative ninhydrin test (colorless). 6. Wash resin with DMF-DMSO (1:1) (2x) to remove excess (+)-biotin. 7. Wash resin with DMF (2x) and DCM (2x). 8. Let the resin dry before proceeding to cleavage. Procedure for Loading Fmoc-Amino Acid to 2-Chlorotrityl Chloride Resin 1. Weig

46、h 10 g 2-chlorotrityl chloride resin (15 mmol) 1 g, AnaSpec Catalog # 22229; 5 g, AnaSpec Catalog # 22230 in a reaction vessel, wash with DMF (2x), swell the resin in 50 mL DMF for 10 min, drain vessel. 2. Weigh 10 mmol Fmoc-amino acid in a test tube, dissolve Fmoc-amino acid in 40 mL DMF, transfer

47、the solution into the reaction vessel above, add 8.7 mL DIEA (50 mmol), swirl mixture for 30 min at room temperature. 3. Add 5 mL methanol into the reaction vessel and swirl for 5 min. 4. Drain and wash with DMF (5x). 5. Check substitution. 6. Add 50 mL 20% piperidine to remove the Fmoc group. Swirl

48、 mixture for 30 min. 7. Wash with DMF (5x), DCM (2x), put resin on tissue paper over a foam pad and let dry at room temperature overnight under the hood. Cover the resin with another piece of tissue paper, press lightly to break aggregates. 8. Weigh loaded resin. 9. Pack in appropriate container. Pr

49、ocedure for Checking Substitution of Fmoc-Amino Acid Loaded Resins 1. Weigh duplicate samples of 5 to 10 mg loaded resin in an eppendorf tube, add 1.00 mL 20% piperidine/DMF, shake for 20 min, centrifuge down the resin. 2. Transfer 100 L of the above solution into a tube containing 10 mL DMF, mix we

50、ll. 3. Pipette 2 mL DMF into each of the two cells (reference cell and sample cell), set spectrophotometer to zero. Empty the sample cell, transfer 2 mL of the solution from step 2 into the sample cell, check absorbance. 4. Subs = 101(A)/7.8(w)A = absorbancew = mg of resin5. Check absorbance three t

51、imes at 301 nm, calculate average substitution. Manual Fmoc Synthesis (0.25 mmol) 1. Wash resin with DMF (4x) and then drain completely. 2. Add approximately 10 mL 20% piperidine/DMF to resin. Shake for one min and drain. 3. Add another 10 mL 20% piperidine/DMF. Shake for 30 min. 4. Drain reaction v

52、essel and wash resin with DMF (4x). Make sure there is no piperidine remaining. Check beads using ninhydrin test, beads should be blue. 5. Coupling Step - Prepare the following solution:1 mmol Fmoc-amino acid2.1 mL 0.45 M HBTU/HOBT (1mmol)348 L DIEA (2 mmol)Add above solution to the resin and shake

53、for a minimum of 30 min. This coupling step can be longer if desired. 6. Drain reaction vessel and wash resin with DMF (4x). 7. Perform Ninhydrin test: o If negative (colorless), proceed to step 2 and continue synthesis. o If positive (blue), return to step 5 and re-couple the same Fmoc-amino acid. Increase the coupling time if necessary. Synthesis of Phosphotyrosine-Containing Peptides Using Fmoc-Phosphotyrosine Reagent: N-a-Fmoc-O-phosphotyrosine 1 g, AnaSpec Catalog # 20254; 5 g, AnaSpec Catalog # 20255 1. For 0.1 mmol or 0.25 mmol synthesis, use 0.483 g Fmoc-T