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文檔簡介
1、名詞解釋:1.蛋白質(zhì)的一級、二級結(jié)構(gòu) P87、89蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)是指蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸殘基的排列順序,也稱化學結(jié)構(gòu);蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)是指多肽主鏈骨架有規(guī)則的盤曲折疊形成的構(gòu)象,不涉及側(cè)鏈基團的空間排布。2.蛋白質(zhì)的變(別)構(gòu)效應 別構(gòu)效應又稱為變構(gòu)效應,是寡聚蛋白與配基結(jié)合改變蛋白質(zhì)的構(gòu)象,導致蛋白質(zhì)生物活性改變的現(xiàn)象。 別構(gòu)效應(allosteric effect)某種不直接涉及蛋白質(zhì)活性的物質(zhì),結(jié)合于蛋白質(zhì)活性部位以外的其他部位(別構(gòu)部位),引起蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象變化,而導致蛋白質(zhì)活性改變的現(xiàn)象。(底物或效應物和酶分子上的相應部位結(jié)合后,會引起酶分子構(gòu)象改變從而影響酶的催化活性的效應。)3.
2、等電點 P102 對某一蛋白質(zhì)來說,在某一PH溶液中,它所帶的正電荷與負電荷數(shù)恰好相等,即凈電荷為0時,在電場中它既不向陽極也不向陰極移動,這時溶液的PH就稱為蛋白質(zhì)的等電點(pI)4.酶的活性中心 P153通過肽鏈的折疊、螺旋或纏繞形成了多種活性空間酶的活性部位(或稱活性中心)5.酶的比活力P163比活力是指每毫克酶蛋白所含的酶活力單位數(shù),即 比活力=活力單位數(shù)/每毫克酶蛋白6.核酸的增色效應核酸的光吸收值比各核苷酸光吸收值的和少30-40%,當核酸變性或降解時光吸收值顯著增加。(將DNA的稀鹽溶液加熱到80100時,雙螺旋結(jié)構(gòu)解體,兩條鏈分開形成單鏈,由于雙螺旋分子內(nèi)部的堿基暴露,260n
3、m紫外吸收值升高的現(xiàn)象。)7.核酸的變復性P133-134核酸的變性指DNA分子中的雙螺旋結(jié)構(gòu)解鏈為無規(guī)則線性結(jié)構(gòu)的現(xiàn)象。變性DNA在適當條件下,又可使兩條彼此分開的鏈重新締合稱為雙螺旋結(jié)構(gòu),此過程稱復性。8.生物氧化 P175有機物質(zhì)在生物體內(nèi)的氧化作用(伴隨著還原作用)統(tǒng)稱為生物氧化。9.呼吸鏈 P177一系列具有氧化還原特性的酶與輔酶作為氫和電子的傳遞體。遞氫體和遞電子體按一定順序排列在線粒體內(nèi)膜上所形成的連鎖氧化還原體系稱為電子傳遞鏈。由于其與細胞攝取氧的呼吸過程有關,通常又稱為呼吸鏈。10.氧化磷酸化 P182氧化磷酸化是指伴隨著代謝物的脫氫以及氫和電子在呼吸鏈上傳遞最后交給氧生成水
4、的氧化途徑,所釋放的能量使ADP磷酸化形成ATP的過程。11.底物水平磷酸化 P182底物由于脫氫、脫水等作用,使分子重排,分子內(nèi)部能量重新分布而形成的高能磷酸鍵(或高能硫酯鍵)直接將能量轉(zhuǎn)移給ADP(或GDP)形成ATP(或GTP)的過程。12.脂肪酸的-氧化 P221-223 氧化過程:(1)脫氫反應(2)水化反應(3)再脫氫反應(4)硫解反應糖酵解途徑 P200糖酵解是一切有機體中普遍存在的葡萄糖降解途徑,也是葡萄糖分解代謝的共同途徑,也稱EMP途徑。糖酵解是在細胞質(zhì)中進行的,不論有無氧氣均可發(fā)生。13.三羧酸循環(huán) P202三羧酸循環(huán)可分為3個階段:第一階段為乙酰CoA和草酰乙酸生成六碳
5、三羧酸階段;第二階段為連續(xù)兩步氧化、脫羧生成四碳二羧酸階段;第三階段為草酰乙酸的再生階段。14.糖異生P207,208由非糖物質(zhì)轉(zhuǎn)化成糖(由丙酮酸轉(zhuǎn)化為葡萄糖)15.半保留復制P270由1條母代DNA鏈和1條子代DNA鏈配對產(chǎn)生子代雙螺旋DNA。16.岡崎片段P274在E.coli DNA復制中,前導鏈的連續(xù)合成比較簡單,而滯后鏈的不連續(xù)合成較復雜。滯后鏈合成分段進行,需要合成若干RNA引物,DNA聚合酶可以在引物的3端開始合成DNA,這樣產(chǎn)生的片段含有RNA(約15個核苷酸)和DNA,被稱為岡崎片段。 (由DNA聚合酶切除小片段上的RNA引物,填補片段之間的空缺,最后由連接酶把它們連接成一條
6、完整的子代鏈,由子代鏈合成的這些較小的DNA片段。)17.中心法則 是指遺傳信息從DNA傳遞給RNA,再從RNA傳遞給蛋白質(zhì),即完成遺傳信息的轉(zhuǎn)錄和翻譯的過程。也可以從DNA傳遞給DNA,即完成DNA的復制過程。這是所有有細胞結(jié)構(gòu)的生物所遵循的法則。在某些病毒中的RNA自我復制(如煙草花葉病毒等)和在某些病毒中能以RNA為模板逆轉(zhuǎn)錄成DNA的過程(某些致癌病毒)是對中心法則的補充。簡答題:1.生物化學的發(fā)展分哪三個階段?簡述每個階段的主要內(nèi)容。 靜態(tài)生物化學時期(1920年以前)研究內(nèi)容以分析生物體內(nèi)物質(zhì)的化學組成、性質(zhì)和含量為主;動態(tài)生物化學時期(1950年以前)這是一個飛速發(fā)展的輝煌時期;
7、機能生物化學時期(1950年以后)真正意義上的現(xiàn)代的生命化學,蛋白質(zhì)化學和和核酸化學成為研究重點。2.簡述米氏常數(shù)(Km)的意義Km等于酶促反應速度為最大反應速度一半時的底物濃度,即當V=Vm/2時,S=Km,單位為mol/L。Km值是酶的特征常數(shù),它只與酶的性質(zhì)有關,而與酶的濃度無關。Km值反映酶與底物親和力的大小。Km指小,表明酶與底物的親和力大,酶促反應易于進行。Km指作為常數(shù)只是對固定的底物、一定的pH指、一定的溫度條件而言的。3.什么是蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)?蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)與其生物功能有何關系? 蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)具體包括: 一級結(jié)構(gòu):組成蛋白質(zhì)多肽鏈的線性氨基酸序列。二級結(jié)構(gòu):依靠不同氨
8、基酸之間的C=O和N-H基團間的氫鍵形成的穩(wěn)定結(jié)構(gòu),主要為螺旋和折疊。三級結(jié)構(gòu):通過多個二級結(jié)構(gòu)元素在三維空間的排列所形成的一個蛋白質(zhì)分子的三維結(jié)構(gòu)。四級結(jié)構(gòu):用于描述由不同多肽鏈(亞基)間相互作用形成具有功能的蛋白質(zhì)復合物分子。蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)決定高級結(jié)構(gòu),高級結(jié)構(gòu)決定了蛋白質(zhì)功能。(例:RNASE是 一種水解RNA的酶,由124個氨基酸殘基組成的單肽鏈蛋白質(zhì),其中含有4個鏈內(nèi)二硫鍵。整個分子折疊成球形的天然構(gòu)象。高濃度脲會破壞肽鏈中的次級鍵。巰基乙醇可還原二硫鍵。因此用脲和巰基乙醇處理RNaSe;蛋白質(zhì)三維構(gòu)象破壞,肽鏈去折疊成松散肽鏈,活性喪失。淡一級結(jié)構(gòu)并未變化。除去脲和巰基乙醇,并經(jīng)
9、氧化形成二硫鍵。RNaSe重新折疊,活性逐漸恢復。由此看來,在一級結(jié)構(gòu)未改變的狀況下,其生物功能仍舊發(fā)生變化,說明是蛋白質(zhì)的高級結(jié)構(gòu)決定了蛋白質(zhì)的功能。 (1)一級結(jié)構(gòu)的變異與分子病 蛋白質(zhì)中的氨基酸序列與生物功能密切相關,一級結(jié)構(gòu)的變化往往導致蛋白質(zhì)生物功能的變化。如鐮刀型細胞貧血癥,其病因是血紅蛋白基因中的一個核苷酸的突變導致該蛋白分子中-鏈第6位谷氨酸被纈氨酸取代。這個一級結(jié)構(gòu)上的細微差別使患者的血紅蛋白分子容易發(fā)生凝聚,導致紅細胞變成鐮刀狀,容易破裂引起貧血,即血紅蛋白的功能發(fā)生了變化。 (2)一級結(jié)構(gòu)與生物進化同源蛋白質(zhì)中有許多位置的氨基酸是相同的,而其它氨基酸差異較大。如比較不同生
10、物的細胞色素C的一級結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)與人類親緣關系接近,其氨基酸組成的差異越小,親緣關系越遠差異越大)4.蛋白質(zhì)的螺旋結(jié)構(gòu)有何特點? (1)多肽鏈主鏈繞中心軸旋轉(zhuǎn),形成棒狀螺旋結(jié)構(gòu),每個螺旋含有3.6個氨基酸殘基,螺距為0.54nm,氨基酸之間的軸心距為0.15nm。(2)每一個角等于-57,每一個角等于-47 (3)-螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定主要靠鏈內(nèi)氫鍵,每個氨基酸的NH與前面第4個氨基酸的C=O形成氫鍵。 (4)-碳原子相連的R基團側(cè)鏈位于-螺旋的外側(cè)。天然蛋白質(zhì)的-螺旋結(jié)構(gòu)大都為右手螺旋。5.什么是蛋白質(zhì)的變性作用和復性作用?蛋白質(zhì)變性后哪些性質(zhì)會發(fā)生改變? 某些物理或化學因素的作用可以破壞蛋白質(zhì)分子
11、中的次級鍵,從而破壞蛋白質(zhì)的螺旋或折疊狀態(tài),使其構(gòu)象發(fā)生變化,引起蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)改變和生物功能喪失,這種現(xiàn)象稱為蛋白質(zhì)變性。 變性的蛋白質(zhì)分子恢復其天然形式的現(xiàn)象稱之為復性。 蛋白質(zhì)變性后,二級、三級以上的高級結(jié)構(gòu)發(fā)生改變或破壞,但共價鍵不變,一級結(jié)構(gòu)沒有破壞。變性蛋白質(zhì)與天然蛋白質(zhì)最明顯的區(qū)別是生物活性喪失,如酶失去催化能力、血紅蛋白失去運輸氧的功能、抗體蛋白失去免疫作用等。此外還表現(xiàn)出各種理化性質(zhì)的改變,如結(jié)晶能力喪失、溶解度降低、分子不對稱性及黏度增加、容易被蛋白水解酶水解等。6.什么是必需氨基酸和非必需氨基酸? 根據(jù)生物體的需要可將氨基酸分為必需氨基酸、半必需氨基酸和非必需氨基酸三類
12、。 必需氨基酸:指人體內(nèi)不能合成,或合成速度不能滿足機體需要,必須從膳食中攝入的氨基酸,有8種,分別是Thr、Val、Leu、Ile、Lys、Trp、Phe、Met。 非必需氨基酸:人體能夠自身合成或由其他氨基酸轉(zhuǎn)化而來的氨基酸。7.寫出三種常見的分離純化蛋白質(zhì)的方法及其原理?常見的分離提純蛋白質(zhì)的方法有:1、鹽析與有機溶劑沉淀:在蛋白質(zhì)溶液中加入大量中性鹽,以破壞蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì),使蛋白質(zhì)從溶液中沉淀析出,稱為鹽析.常用的中性鹽有:硫酸銨、氯化鈉、硫酸鈉等.鹽析時,溶液的pH在蛋白質(zhì)的等電點處效果最好.凡能與水以任意比例混合的有機溶劑,如乙醇、甲醇、丙酮等,均可引起蛋白質(zhì)沉淀.2、電泳法:蛋
13、白質(zhì)分子在高于或低于其pI的溶液中帶凈的負或正電荷,因此在電場中可以移動.電泳遷移率的大小主要取決于蛋白質(zhì)分子所帶電荷量以及分子大小.3、透析法:利用透析袋膜的超濾性質(zhì),可將大分子物質(zhì)與小分子物質(zhì)分離開.4、層析法:利用混合物中各組分理化性質(zhì)的差異,在相互接觸的兩相(固定相與流動相)之間的分布不同而進行分離.主要有離子交換層析,凝膠層析,吸附層析及親和層析等,其中凝膠層析可用于測定蛋白質(zhì)的分子量.5、分子篩:又稱凝膠過濾法,蛋白質(zhì)溶液加于柱之頂部,任其往下滲漏,小分子蛋白質(zhì)進入孔內(nèi),因而在柱中滯留時間較長,大分子蛋白質(zhì)不能進入孔內(nèi)而徑直流出,因此不同大小的蛋白質(zhì)得以分離.6、超速離心:利用物質(zhì)
14、密度的不同,經(jīng)超速離心后,分布于不同的液層而分離.超速離心也可用來測定蛋白質(zhì)的分子量,蛋白質(zhì)的分子量與其沉降系數(shù)S成正比.8.什么是尿素循環(huán),有何生物學意義? 尿素循環(huán):又稱為鳥氨酸循環(huán),肝臟中2分子氨(1分子氨是游離的,1分子氨來自天冬氨酸)和1分子CO2生成1分子尿素的環(huán)式代謝途徑.尿素循環(huán)是第一個被發(fā)現(xiàn)的環(huán)式代謝途徑.生物學意義:(1)尿素循環(huán)不僅將氨和CO2合成為尿素,而且生成一分子延胡索酸,使尿素循環(huán)與檸檬酸循環(huán)聯(lián)系起來.(2)肝臟中尿素的合成是除去氨毒害作用的主要途徑,尿素循環(huán)的任何一個步驟出問題都有可能產(chǎn)生疾病.如果完全缺乏尿素循環(huán)中的某一個酶,嬰兒在出生不久就昏迷或死亡;如果是
15、部分缺乏,引起智力發(fā)育遲滯、嗜睡和經(jīng)常嘔吐.在臨床實踐中,常通過減少蛋白質(zhì)攝入量使輕微的高氨血遺傳性疾病患者癥狀緩解,原因就是減少了游離氨的來源.(3)植物體內(nèi)也存在尿素循環(huán),但轉(zhuǎn)運活性低,其意義在于合成精氨酸.個別植物也可產(chǎn)生尿素,在脲酶作用下分解產(chǎn)生氨,用以合成其他含氮化合物,包括核酸、激素、葉綠體、血紅素、胺、生物堿等.9.簡述糖的酵解途徑和糖異生途徑的不同點。糖酵解(1)葡萄糖(Glucose)磷酸化形成6磷酸葡萄糖-G6P(2)6磷酸果糖磷酸化形成1,6磷酸果糖-FBP(3)磷酸烯醇式丙酮酸將磷酰基轉(zhuǎn)移給ADP形成ATP和丙酮酸糖異生(1)丙酮酸草酰乙酸磷酸烯醇式丙酮酸, 丙酮酸羧化
16、酶和磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶催化(2)1,6-二磷酸果糖6-磷酸果糖,果糖二磷酸酶催化(3)6-磷酸葡萄糖葡萄糖,葡萄糖6磷酸酶催化10.為什么說轉(zhuǎn)氨基反應在氨基酸合成和降解過程中都起重要作用(1)在氨基酸合成過程中,轉(zhuǎn)氨基反應是非必需氨基酸合成的主要方式,許多氨基酸的合成可以通過轉(zhuǎn)氨酶的催化作用,接受來自谷氨酸的氨基而形成。(2)在氨基酸的分解過程中,氨基酸也可以先經(jīng)轉(zhuǎn)氨基作用把氨基酸上的氨基轉(zhuǎn)移到-酮戊二酸上形成谷氨酸,谷氨酸在谷氨酸脫羥酶的作用上脫去氨基。11.比較脂肪酸氧化和合成的差異氧化在線粒體,合成在胞液;氧化的?;d體是輔酶A,合成的?;d體是?;d體蛋白;氧化是FAD和NAD+,
17、合成是NADPH;氧化是L型,合成是D型。氧化不需要CO2,合成需要CO2;氧化為高ADP水平,合成為高ATP水平。氧化是羧基端向甲基端,合成是甲基端向羧基端;脂肪酸合成酶系為多酶復合體,而不是氧化酶。12.簡述分子雜交的原理與應用。 原理: 應用:酵母雙雜交技術(shù) 13.DNA熱變性有何特點?Tm值表示什么?將DNA的稀鹽溶液加熱到70100幾分鐘后,雙螺旋結(jié)構(gòu)即發(fā)生破壞,氫鍵斷裂,兩條鏈彼此分開,形成無規(guī)則線團狀,此過程為DNA的熱變性,有以下特點:變性溫度范圍很窄,260nm處的紫外吸收增加;粘度下降;生物活性喪失;比旋度下降;酸堿滴定曲線改變。Tm值代表核酸的變性溫度(熔解溫度、熔點)。
18、在數(shù)值上等于DNA變性時摩爾磷消光值(紫外吸收)達到最大變化值半數(shù)時所對應的溫度。計算Tm(G +C)% = (Tm69.3)2.44 %14.為什么說TCA循環(huán)是聯(lián)系糖代謝、脂代謝和氨基酸代謝的樞紐?在人體內(nèi)糖的主要形式是葡萄糖及糖原。葡萄糖是糖在血液中的運輸形式,在機體糖代謝中占據(jù)主要地位;而糖原是葡萄糖的多聚體,包括肝糖原、肌糖原和腎糖原等,是糖在體內(nèi)的儲存形式。葡萄糖與糖原都能在體內(nèi)氧化提供能量。機體內(nèi)糖的代謝途徑主要有葡萄糖的無氧酵解、有氧氧化、磷酸戊糖途徑、糖原合成與糖原分解、糖異生以及其他己糖代謝等。 糖代謝之所以說是其他代謝的樞紐,原因是丙酮酸和葡糖糖-6-磷酸(后面簡稱PA和G-6-P)這個關鍵分支點:(1)G-6-P可轉(zhuǎn)化為葡萄糖(雙向)或參與磷酸戊
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