人表皮生長因子受體(EGFR)突變基因檢測試劑(PCR法)注冊技術(shù)審查指導(dǎo)原則(2018年)

1、人表皮生長因子受體（EGFR）突變基因檢測試劑（PCR法）注冊技術(shù)審查指導(dǎo)原則（2018年）附件1人表皮生長因子受體（EGFR）突變基因檢測試劑（PCR法）注冊技術(shù)審查指導(dǎo)原則本指導(dǎo)原則旨在指導(dǎo)注冊申請人對人表皮生長因子受體（EpidermalGrowthFactorReceptor,以下簡稱為EGFR）突變基因檢測期U注冊申報資料的準(zhǔn)備及撰寫，同時也為技術(shù)審評部門對注冊申報資料的技術(shù)審評提供參考。本指導(dǎo)原則是針對EGFR突變基因檢測試劑的一般要求，申請人應(yīng)依據(jù)產(chǎn)品的具體特性確定其中內(nèi)容是否適用，若不適用，需具體闡述理由及相應(yīng)的科學(xué)依據(jù)，并依據(jù)產(chǎn)品的具體特性對注冊申報資料的內(nèi)容進(jìn)行充實(shí)和細(xì)化。

2、本指導(dǎo)原則是對申請人和審查人員的指導(dǎo)性文件，但不包括注冊審批所涉及的行政事項(xiàng)，亦不作為法規(guī)強(qiáng)制執(zhí)行，如果有能夠滿足相關(guān)法規(guī)要求的其他方法，也可以采用，但需要詳細(xì)闡明理由，并對其科學(xué)合理性進(jìn)行驗(yàn)證，提供詳細(xì)的研究資料和驗(yàn)證資料，相關(guān)人員應(yīng)在遵循相關(guān)法規(guī)的前提下使用本指導(dǎo)原則。本指導(dǎo)原則是在現(xiàn)行法規(guī)和標(biāo)準(zhǔn)體系以及當(dāng)前認(rèn)知水平下制定的，隨看法潁口標(biāo)準(zhǔn)的不斷完善，以及科學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展，本指導(dǎo)原則相關(guān)內(nèi)容也將適時進(jìn)行調(diào)整。一、范圍本指導(dǎo)原則所述EGFR突變基因檢測試劑主要是指基于核酸聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（PCR法），以EGFR突變基因?yàn)闄z測目標(biāo)，體外定性檢測細(xì)胞學(xué)樣本、病理組織學(xué)樣本、外周血樣本或其他體液樣

3、本提取的核酸組分中的目標(biāo)基因序列。EGFR是原痙基因c-erbBl的表達(dá)產(chǎn)物，是表皮生長因子受體（HER）家族成員之一。HER家族由EGFR/HERl/erbBl、HER2/neu/erbB2xHER3/erbB3及HER4/erbB4四個分子構(gòu)成，在細(xì)胞的生長、增殖和分化等生理過程中發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用。EGFR是一種跨膜酪氨酸激酶受體，該受體激酶域激活與痙細(xì)胞增殖、轉(zhuǎn)移和凋亡等多種信號傳導(dǎo)通路有關(guān)。肺腺癟患者EGFR基因敏感突變的亞裔人群陽性率要高于高加索人群。EGFR突變主要發(fā)生在胞內(nèi)酪氨酸;”TK)區(qū)域的前四個外顯子上(18-21),目前發(fā)現(xiàn)的TK區(qū)域突變有30多種。缺失突變主要發(fā)生在外

4、顯子19上最常見的是delE746-A750,替代突變最常見的是發(fā)生在外顯子21上的L858R,復(fù)制或插入突變發(fā)生在外顯子20上。其中外顯子20上的T790M替代突變?yōu)橐淮鶨GFR酪氨酸激酶抑制劑(TyrosineKinaseInhibitor,TKI)的耐藥突變。此外,還有許多類型的突變臨床意義尚不明確。EGFR作為癟癥治療的分子靶標(biāo)受到普遍關(guān)注，并已陸續(xù)開發(fā)出了吉非替尼(Gefitinib厄洛替尼(Erlotinib)和?？颂婺?Icotinib)等TKI。腫瘤組織樣本仍是獲取腫瘤基因相關(guān)信息的主要來源，但大部分晚期肺痙患者已失去手術(shù)機(jī)會或由于種種原因不能獲聊中瘤組織樣本。研究結(jié)果表明，實(shí)

5、體腫瘤患者的外周血中存在來源于凋亡、壞死的腫瘤細(xì)胞的游離DNA0對晚期肺痙患者，在不能獲取肺瘞組織樣本時，可以選擇外周血樣本進(jìn)行EGFR突變基因檢測；如可以獲得病理組織時，建議以病理組織提取檢測結(jié)果為優(yōu)先考慮。當(dāng)腫瘤組織難以獲取時,外周血樣本可以是EGFR突變基因檢測方式的重要補(bǔ)充手段之一。本指導(dǎo)原則相關(guān)技術(shù)要求主要基于熒光探針PCR方法的EGFR突變基因試劑進(jìn)行評價，如基于熒光睇十PCR原理的同類試劑不適用本指導(dǎo)原則部分相關(guān)技術(shù)要求,申請人應(yīng)闡述不適用的理由并結(jié)合自身產(chǎn)品特性提出科學(xué)合理的評價方法，申請人可根據(jù)實(shí)際產(chǎn)品特性選擇適合的方法或結(jié)合本指導(dǎo)原則補(bǔ)充需要的評價和驗(yàn)證。對于其他分子生物學(xué)

6、檢測技術(shù)，如適用，申請人可參考本指導(dǎo)原則部分相關(guān)技術(shù)要求進(jìn)行性能評價。本指導(dǎo)原則適用于進(jìn)行首次注冊申報和相關(guān)許可事項(xiàng)變更的產(chǎn)品。本指導(dǎo)原則不適用于EGFR基因拷貝數(shù)變化檢測、核酸序列測定、免疫組化技術(shù)、熒光原位雜交法。EGFR病理組織學(xué)樣本和外周血樣本檢測中存在較大差異，在參考品及質(zhì)控品設(shè)置、分析性能評估、臨床評價要求、產(chǎn)品技術(shù)要求、產(chǎn)品說明書等多個方面均存在不同要求，為便于申請人對指導(dǎo)原則進(jìn)行理解，故將產(chǎn)品預(yù)期用途用于組織學(xué)樣本檢測和預(yù)期用途用于外周血樣本檢測試劑申報要求進(jìn)行分開說明。需要說明的是，申請人申報產(chǎn)品如同時包括外周血樣本和組織學(xué)樣本,對于相同部分,申請人可合并提交注冊申報資料。如

7、原注冊產(chǎn)品預(yù)期用途中僅為組織樣本類型，需增加外周血樣本類型，考慮到外周血樣本類型與組織樣本類型中EGFR片段長度，樣本中突變比例等差異,申請人除完成許可事項(xiàng)變更申報資料要求，還應(yīng)提交擴(kuò)增反應(yīng)體系性能評價、外周血分析性能評價、外周血樣本保存及處理、臨床評價等研究資料。申報試劑作為腫瘤個體化伴隨檢測試劑，主要用于人非小細(xì)胞肺癌（NSCLC）個體化治療。如申請人將EGFR申報試劑運(yùn)用于其他癟癥類型的研究，申請人可參照本指導(dǎo)原則適用的研究體系，但應(yīng)強(qiáng)調(diào)的是，腫瘤藥物個體化檢測試劑與治療藥物具有關(guān)聯(lián)性，申請人需結(jié)合EGFR突變基因檢測與治療藥物預(yù)期用途所限定的癟癥類型進(jìn)行聯(lián)合評價研究。二、注冊申報資料要

8、求（一）綜述資料1.產(chǎn)品預(yù)期用途。描述產(chǎn)品的預(yù)期用途，與預(yù)期用途相關(guān)的臨床背景情況。EGFR突變基因與不同人群之間的關(guān)聯(lián),不同藥物對不同EGFR突變類型的患者治療效果描述。如適應(yīng)癥的發(fā)生率、易感人群等，相關(guān)的臨床或?qū)嶒?yàn)室診斷方法等。2 .產(chǎn)品描述。描述產(chǎn)品所采用的技術(shù)原理，主要原材料的來源及制備方法,主要生產(chǎn)工藝過程，質(zhì)控品、校準(zhǔn)品的制備方法情況。3 .有關(guān)生物安全性方面說明。由于體外診斷試劑中的主要原材料可能是由各種動物、病原體、人源的組織和體液等生物材料經(jīng)處理或者添加某些物質(zhì)制備而成，人源性材料須對有關(guān)傳染?。℉IV、HBV、HCV等）病原體檢測予以說明，并提供相關(guān)的證明文件。其他動物源及

9、微生物來源的材料，應(yīng)當(dāng)提供相應(yīng)的說明文件，證明其在產(chǎn)品運(yùn)輸、使用過程中對使用者和環(huán)境是安全的，并對上述原材料所采用的滅活等試驗(yàn)方法予以說明。4 .有關(guān)產(chǎn)品主要研究結(jié)果的總結(jié)和評價。5 .其他。包括同類產(chǎn)品在國內(nèi)外批準(zhǔn)上市的情況。相關(guān)產(chǎn)品所采用的技術(shù)方法及臨床應(yīng)用情況，申請注冊產(chǎn)品與國內(nèi)外同類產(chǎn)品的異同等。對于新研制的體外診斷試劑產(chǎn)品，需要提供被測物與預(yù)期適用的臨床適應(yīng)癥之間關(guān)系的文獻(xiàn)資料。（二）主要原材料的研究資料此類產(chǎn)品的主要原材料應(yīng)包括EGFR突變基因檢測期II的所有主要組成成分，如引物、探針、酶、反應(yīng)緩沖液、提取成分（如包含）等。如為申請人自行研制的主要原材料，申請人應(yīng)對EGFR目的基因

10、序列確定、引物和探針選擇、酶的選擇和驗(yàn)證等實(shí)驗(yàn)過程予以詳述；并提供對各主要原材料的性能研究資料，如：外觀、純度、蛋白濃度、功能性研究等。制備完成的原料成品應(yīng)進(jìn)行質(zhì)量檢驗(yàn)以確認(rèn)其符合標(biāo)準(zhǔn)要求，整個生產(chǎn)工藝應(yīng)穩(wěn)定可控。如為申請人外購主要原材料，應(yīng)詳述每一原材料外購方來源，提交外購方出具的原材料性育綢標(biāo)及質(zhì)量控制資料，并詳述申請人對外購主要原材料的各指標(biāo)質(zhì)量要求以及確定該原材料作為本產(chǎn)品主要原材料的詳細(xì)依據(jù)。1 .核酸分離/純化組分（如有）的主要組成、原理介紹及相關(guān)的驗(yàn)證資料。2 .PCR組分的主要原料（包括引物、探針、各種酶及其他主要原料）的選擇、制備、質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)及實(shí)驗(yàn)研究資料，主要包括以下內(nèi)容：2

11、.1 脫氧三磷酸核苛（dNTP）核酸的組成成分，包括：dATP、dUTP、dGTP、dCTP和dTTP;應(yīng)提交對其純度、濃度、保存穩(wěn)定性等的驗(yàn)證資料。2.2 引物應(yīng)優(yōu)化每一單一突變基因?qū)Ｓ靡锏南鄬舛?避免多個核酸靶序列同時擴(kuò)增時出現(xiàn)相互影響和競爭。引物設(shè)計時，應(yīng)對反應(yīng)體系中所有引物進(jìn)行篩選，避免引物二聚體形成。為保證每一靶序列檢測準(zhǔn)確性，EGFR檢測試劑中每一突變基因引物的濃度必須進(jìn)行優(yōu)化，應(yīng)根據(jù)靶序列突變性質(zhì)、C+G含量等確定每一突變基因引物的長度和濃度,且單一引物最適濃度還應(yīng)考慮所有引物濃度之間的相互影響。由一定數(shù)量的堿基構(gòu)成的特定序列，通常采用DNA合成儀人工合成，合成后經(jīng)聚丙烯酰胺

12、凝膠電泳（PAGE）或其他適宜方法純化。需提供對引物的分子量、純度、穩(wěn)定性、功能性實(shí)驗(yàn)等的驗(yàn)證資料。如為外購，還應(yīng)提供合成機(jī)構(gòu)出具的合成產(chǎn)物的質(zhì)檢證明，如PAGE結(jié)果或高效液相色譜法（HPLC）分析圖譜。應(yīng)對引物結(jié)構(gòu)進(jìn)行對比，引物擴(kuò)增區(qū)段不應(yīng)有重復(fù)序列。2.3 探針特定的帶有示蹤物（標(biāo)記物）的已知核酸片段（寡聚核甘酸片段），能與互補(bǔ)核酸序列退火雜交,用于特定核酸序列的探測。合成后經(jīng)PAGE或其他適宜方法純化，在5'-端（和/或3'-端）進(jìn)行標(biāo)記，并經(jīng)HPLC或其他適宜方法純化，純度應(yīng)達(dá)到HPLC純。應(yīng)提供合成機(jī)構(gòu)出具的合成產(chǎn)物質(zhì)檢證明，如HPLC分析圖譜，應(yīng)對探針的分子量、純度

13、及標(biāo)記的熒光基團(tuán)進(jìn)行核實(shí)，并進(jìn)行功能性試驗(yàn)驗(yàn)證。2.4 酶DNA聚合酶，應(yīng)具有DNA聚合酶活性，無核酸內(nèi)切酶活性,具熱穩(wěn)定性，如：94保溫1小時后仍保持50%活性。尿嚏唾DNA糖基化酶（UDG/UNG）,具有水解尿喳噓糖首鍵的活性，無核酸外切酶及核酸內(nèi)切酶活性。逆轉(zhuǎn)錄酶，具逆轉(zhuǎn)錄酶活性,無核酸內(nèi)切酶活性。應(yīng)對酶活性進(jìn)行合理驗(yàn)證。3 .核酸類檢測試劑的包裝材料和耗材應(yīng)無脫氧核糖核酸酶（DNase）和核糖核酸酶（RNase）污染。4 .企業(yè)內(nèi)部參考品企業(yè)內(nèi)部參考品是保證產(chǎn)品性能穩(wěn)定性以及檢測值可溯源的重要構(gòu)成之-o參考品研究應(yīng)包括原料選擇、制備過程、定值研究、評價指標(biāo)、統(tǒng)計學(xué)分析等。申請人應(yīng)對內(nèi)部

14、參考品的來源、基因序列設(shè)置等信息進(jìn)行精確的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證，并提供參考品溯源過程的測量程序或參考方法的相關(guān)信息及詳細(xì)的驗(yàn)證資料。申請人應(yīng)根據(jù)產(chǎn)品性能驗(yàn)證實(shí)際情況自行設(shè)定內(nèi)部參考品，陽性參考品應(yīng)著重考慮EGFR突變基因型別要求，明性參考品則主要涉及對分析特異性（交叉反應(yīng)）的驗(yàn)證情況。如該類產(chǎn)品有國家標(biāo)準(zhǔn)品，在不低于國家參考品要求前提下，申請人可以結(jié)合實(shí)際情況設(shè)置合理的內(nèi)部參考品。具體要求如下：4.1 組織樣本參考品設(shè)置要求4.1.1陽性參考品陽性參考品中常見基因突變位點(diǎn)建議采用臨床樣本提取的DNA儲備液能田胞系作為原料。其他突變位點(diǎn)可采用DNA儲備液、細(xì)胞系或EGFR突變擴(kuò)增產(chǎn)物模擬樣本作為原料。如采用

15、EGFR突變擴(kuò)增產(chǎn)物作為陽性參考品，應(yīng)盡可能模擬真實(shí)樣本，需要對樣本基質(zhì)進(jìn)行基質(zhì)效應(yīng)研究。試劑盒（分型或不分型）所能覆蓋的所有突變位點(diǎn)均應(yīng)設(shè)置相應(yīng)的陽性參考品，每個突變位點(diǎn)設(shè)置不同突變百分率梯度，其中至少應(yīng)包括高濃度和低濃度陽性參考品。陽性參考品的突變形式及拷貝數(shù)需采用有效方法（如測序方法或數(shù)字化PCR等）進(jìn)行確認(rèn)，并明確接受標(biāo)準(zhǔn)。4.1.2 陰性參考品可采用經(jīng)確認(rèn)無相應(yīng)靶突變序列的DNA儲存液。如野生型人基因組DNA,HER家族DNA等。4.1.3 檢測限參考品檢測限參考品的原料要求參考陽性參考品，需包括所有的突變類型。在進(jìn)行最既僉測限性能評估時，應(yīng)設(shè)置多個梯度，主要從擴(kuò)增反應(yīng)終體系總核酸濃

16、度和突變序列所占百分率兩個方面進(jìn)行評價，建議采用95%（n>20）的陽性檢出率作為最低檢測限確定的標(biāo)準(zhǔn)。4.1.4 精密度參考品精密度參考品原料要求參考陽性參考品，需至少包括弱陽性、中或強(qiáng)陽性水平的精密度驗(yàn)證，中/強(qiáng)陽性精密度參考品以常見突變類型或理論上較難測得的突變序列為主；同時設(shè)置陽性參考品精密度驗(yàn)證。4.2外周血樣本參考品設(shè)置要求4.2.1陽性參考品陽性參考品中常見突變基因位點(diǎn)建議采用臨床樣本提取的DNA儲備液或細(xì)胞系作為原料?？紤]外周血中EGFR突變基因DNA含量較低其他突變位點(diǎn)可以采用DNA儲備液或細(xì)胞系或EGFR突變基因擴(kuò)增產(chǎn)物模擬樣本,樣本基質(zhì)應(yīng)為人血漿或人工模擬樣本，使用

17、人血漿時，應(yīng)提前確認(rèn)人血漿中DNA背景濃度；使用人工模擬樣本時，應(yīng)盡可能模擬真實(shí)樣本，并對模擬樣本進(jìn)行基質(zhì)效應(yīng)研究。試劑盒（分型或不分型）所能覆蓋的所有突變位點(diǎn)均應(yīng)設(shè)置相應(yīng)的陽性參考品，每個突變位點(diǎn)設(shè)置不同突變百分率梯度，其中需至少包括弱陽性參考品。陽性參考品的突變形式及拷貝數(shù)需采用有效方法（如測序方法或數(shù)字PCR等）進(jìn)行確認(rèn)，并明確接受標(biāo)準(zhǔn)。4.2.2陰性參考品可采用經(jīng)確認(rèn)無相應(yīng)靶突變序列的DNA儲存液。如野生型人基因組DNA,HER家族其他DNA等。423檢測限參考品檢測限參考品的原料要求參考陽性參考品，需包括所有的突變類型。在進(jìn)行最低檢測限性能評估時，應(yīng)設(shè)置多個梯度，建議采用95%（n&

18、gt;20）的陽性檢出率作為局氐檢測限確定的標(biāo)準(zhǔn)。424精密度參考品精密度參考品原料要求參考陽性參考品，需至少包括弱陽性、中或強(qiáng)陽性水平的精密度驗(yàn)證，中/強(qiáng)陽性精密度參考品以常見突變類型或理論上較難測得的突變序列為主，同時設(shè)置陽性參考品精密度驗(yàn)證。5.試劑盒內(nèi)對照品（質(zhì)控品）試劑盒的質(zhì)控體系通過設(shè)置各種試劑盒對照品來實(shí)現(xiàn)，質(zhì)控體系需考慮對樣本核酸分離/純化、配液及加樣、試劑及儀器性能、擴(kuò)增反應(yīng)抑制物（管內(nèi)抑制、交叉污染、靶核酸降解等因素可能造成的假陰性或假陽性結(jié)果進(jìn)行合理的質(zhì)量控制。對照品可采用質(zhì)粒、假病毒或臨床樣本的核酸提取液等進(jìn)行配置。申報資料應(yīng)對試劑盒對照品有關(guān)原料選擇、制備、定值過程等

19、試驗(yàn)資料詳細(xì)說明。申請人應(yīng)視申報產(chǎn)品具體情況設(shè)置合理的試劑盒對照品（質(zhì)控品），試劑盒質(zhì)控體系主要考慮以下幾方面要求:5.1 陽忸寸照品（質(zhì)控品）申請人應(yīng)對各陽性對照品（質(zhì)控品）的Ct值提出明確的范圍要求。如樣本反應(yīng)管內(nèi)可以覆蓋多種突變序列的檢測（分型或不分型），相應(yīng)的陽性對照管應(yīng)選擇較常見突變序列或理論上較難測得的突變序列作為陽性對照。5.2 陰性對照陰性對照可以是含有野生型核酸序列的核酸溶液，也可以是空白對照,對交叉污染導(dǎo)致的假陽性結(jié)果進(jìn)行質(zhì)控。阻性對照品應(yīng)參與樣本核酸的平行提取。5.3 內(nèi)對照（內(nèi)標(biāo)）內(nèi)對照（內(nèi)標(biāo)）可以對管內(nèi)抑制導(dǎo)致的假陰性結(jié)果進(jìn)行質(zhì)量控制，申請人應(yīng)對內(nèi)對照（內(nèi)標(biāo)）的引物、

20、探針和模板濃度做精確驗(yàn)證，既要保證內(nèi)標(biāo)熒光通道呈明顯的陽性曲線又要盡量降低對靶基因檢測造成的抑制。（三）主要生產(chǎn)工藝及反應(yīng)體系的研究資料生產(chǎn)工藝及反應(yīng)體系的研究資料應(yīng)能對反應(yīng)體系涉及到的基本內(nèi)容，如：臨床樣本用量、試劑用量、反應(yīng)條件、質(zhì)控體系設(shè)置、閾值循環(huán)數(shù)（Ct）值或臨界值確定等，提供確切的依據(jù)，配制工作液的各種原材料及其配比應(yīng)符合要求，原材料應(yīng)混合均勻，配制過程應(yīng)對pH、電導(dǎo)率、離子濃度等關(guān)鍵參數(shù)進(jìn)行有效控制。主要包括以下內(nèi)容：1 .主要生產(chǎn)工藝介紹，可以圖表方式表示。2 .反應(yīng)原理介紹。3 .基因位點(diǎn)選擇、方法學(xué)特性介紹。4 .確定最佳PCR反應(yīng)體系的研究資料，包括酶濃度、引物/探針濃度

21、、dNTP濃度、陽離子濃度等。5 .確定PCR反應(yīng)各階段溫度、時間及循環(huán)數(shù)的研究資料。如反應(yīng)體系相同，多個突變基因在相同反應(yīng)條件下核酸擴(kuò)增效率是否存在差別。6 .對于基線閾值（threshold）和閾值循環(huán)數(shù)（Ct）確定的研究資料。應(yīng)明確相同反應(yīng)條件下，多個基因類型Ct是否相同。7 .不同適用機(jī)型的反應(yīng)條件如果有差異應(yīng)分別詳述。8 .如申報產(chǎn)品包含核酸分離/純化試劑，應(yīng)提交對核酸分離/純化過程進(jìn)行工藝優(yōu)化的研究資料。(四)分析性能評估資料分析性能評估是反映產(chǎn)品主要原材料選擇、生產(chǎn)工藝及反應(yīng)體系等多方面因素設(shè)置是否合理的客觀評價指標(biāo)。檢測試劑性能的研究方案應(yīng)結(jié)合產(chǎn)品的反應(yīng)原理、臨床用途、使用條件

22、等綜合因素進(jìn)行設(shè)計。性能研究應(yīng)涵蓋產(chǎn)品研制階段對試劑盒進(jìn)行的所有性能驗(yàn)證的研究資料，包括具體研究方法、內(nèi)控標(biāo)準(zhǔn)、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)、統(tǒng)計分析等詳細(xì)資料。1.病理組織學(xué)樣本類型評價要求1.1最倒僉測限病理組織學(xué)樣本類型最低檢測限研究應(yīng)包括擴(kuò)增反應(yīng)終體系中的突變序列百分朝口申報產(chǎn)品反應(yīng)體系中總核酸濃度兩個因素。對于常見突變基因類型建議采用EGFR突變型的非小細(xì)胞肺痙(NSCLC)福爾馬林固定石蠟包埋組織(FFPE)和EGFR野生型的NSCLCFFPE樣本或細(xì)胞系制備DNA存儲液,對于罕見突變基因類型，建議采用DNA儲備液、細(xì)胞系或質(zhì)粒與EGFR野生型NSCLCFFPE樣本制備DNA存儲液。EGFR突變基因類

23、型不同比例混合應(yīng)注意的事項(xiàng)：每種突變基因類型樣本儲存液按照不同突變序列所占比例進(jìn)行混合，結(jié)合PCR方法檢測靈敏度及病理組織學(xué)樣本類型,此處主要針對EGFR突變基因類型低比例情況進(jìn)行配比，如從10%或8%起始按不同比例混合。至少應(yīng)包括目標(biāo)檢測限和檢測限上下至少各2個梯度比例范圍的研究資料，對于按不同比例混合后的不同樣本，建議采用數(shù)字化PCR或高通量測序法等方法檢測不同樣本的實(shí)際混合比例,并以實(shí)際混合比例作為EGFR突變基因的最(時僉測限進(jìn)行后續(xù)研究。同時，在EGFR突變基因不同比例研究過程中應(yīng)設(shè)置EGFR野生型樣本作為空白對照。確定反應(yīng)體系總樣本加樣量以及反應(yīng)體系中需要的DNA總量，申請人需說明

24、每UL的DNA加樣量和總DNA濃度確定方法。在進(jìn)行混合稀釋時，使用的FFPE樣本應(yīng)與原混合配置樣本類型相同。建議申請人設(shè)計一個顯著高于反應(yīng)體系最高DNA加樣量的DNA存儲濃度。在實(shí)際的EGFR不同突變比例下，進(jìn)行不同梯度DNA濃度的檢測，不同DNA濃度各檢測至少3次，不同梯度DNA濃度范圍應(yīng)涵蓋申報產(chǎn)品反應(yīng)體系中設(shè)定的最高DNA濃度和最低DNA濃度。待確定組織中最倒僉測限后，在組織樣本晶氐檢測限水平附近再額外檢測部分接近最低I僉測限的樣本，確認(rèn)最低檢測限D(zhuǎn)NA濃度。1.1.1如申報產(chǎn)品適用不同的核酸提取方法，每種核酸提取方法應(yīng)配套檢測試劑進(jìn)行各突變基因類型身氐檢測限驗(yàn)證。1.1.2如申報產(chǎn)品適

25、用不同適用機(jī)型，每種適用機(jī)型應(yīng)配套檢測試劑進(jìn)行各突變基因類型最低檢測限驗(yàn)證。1.13病理組織切片的提取方法應(yīng)與說明書一致，如申報產(chǎn)品適用于多種病理組織切片制作方法，最低I僉測限應(yīng)對每種病理組織切片制作方法進(jìn)行驗(yàn)證。1.2分析特異性121交叉反應(yīng)該類產(chǎn)品主要與月赭B腫瘤存在較強(qiáng)關(guān)聯(lián)性，申請人在設(shè)計交叉反應(yīng)研究時應(yīng)將此點(diǎn)納入考慮。1.2.1.1 申請人應(yīng)考慮與靶序列的核酸序列相近或具有同源性、易引起交叉反應(yīng)的野生型或其他突變類型序列的交叉反應(yīng)。建議交叉反應(yīng)驗(yàn)證考慮以下因素：EGFR基因不同序列；HER家族不同基因；不同濃度的野生型人DNA樣本、非人類基因組基因、肺部相關(guān)感染微生物等。1.2.1.2

26、 對于可能產(chǎn)生交叉反應(yīng)的病原體，需在有臨床意義相關(guān)濃度下進(jìn)行檢測,細(xì)菌濃度水平建議至少106cfu/mL,病毒濃度水平建議至少105pfu/mL。需明確進(jìn)行交叉反應(yīng)的病原體類型及滴度。人野生型DNA至少包含lOOng/pL里件型核酸樣本，應(yīng)提供所有用于交叉反應(yīng)驗(yàn)證的突變或野生型序列來源、序列確認(rèn)和濃度選擇等試驗(yàn)資料。1.2.2 干擾物質(zhì)122.1申請人應(yīng)根據(jù)試劑盒所采用的樣本類型確定潛在的干擾物質(zhì)，如：常見治療藥物，病理組織處理過程及樣本穿刺過程的緩沖液、處理液等。1.2.2.2用于干擾試驗(yàn)的樣本，建議選擇醫(yī)學(xué)相關(guān)水平的干擾物質(zhì)濃度，至少對EGFR突變基因弱陽性樣本進(jìn)行驗(yàn)證。1.2.3 有關(guān)分

27、析特異性的信息應(yīng)在產(chǎn)品說明書的【產(chǎn)品性能指標(biāo)】項(xiàng)中有所體現(xiàn)。13精空度申請人應(yīng)對每項(xiàng)精密度指標(biāo)的評價標(biāo)準(zhǔn)做出合理要求。具體實(shí)驗(yàn)方法可以參考國際或國內(nèi)有關(guān)體外診斷產(chǎn)品性能評估的文件進(jìn)行。針對本類產(chǎn)品的精密度評價主要包括以下要求：13.1 對可能影響檢測精密度的主要變量進(jìn)行驗(yàn)證，除申報試劑（包括核酸分離/純化組分）本身的影響外，還應(yīng)對PCR分析儀、操作者、地點(diǎn)等要素進(jìn)行相關(guān)的驗(yàn)證。13.2 合理的精密度評價周期，對批內(nèi)/批間、日內(nèi)/日間以及不同操作者之間的精密度進(jìn)行綜合評價。如有條件，申請人應(yīng)選擇不同的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行重復(fù)實(shí)驗(yàn)以對室間精密度進(jìn)行評價。13.3 用于精密度評價的樣本應(yīng)考慮部分EGFR常見突

28、變基因類型的臨床樣本、陽性精密度參考品、陽性精密度參考品等。1.4 陽性/陰性參考品符合率各水平、各突變位點(diǎn)的陽性參考品均應(yīng)按要求檢出陽性，考慮到濃度梯度的不同，應(yīng)對各水平陽性參考品設(shè)置相應(yīng)Ct值的限制；陽性參考品在各個引物探針組合的檢測條件下均應(yīng)檢出為陰性；如有野生型參考品的設(shè)置，在其相應(yīng)的引物探針組合下檢測應(yīng)為陽性。1.5 樣本的穩(wěn)定性1.5.1樣本提取前核酸序列的穩(wěn)定性對于經(jīng)福爾馬林固定石蠟包埋組織切片樣本，申請人應(yīng)對組織樣本保存溫度，保存年限進(jìn)行限定。建議明確組織切片樣本的規(guī)范采集標(biāo)準(zhǔn)，驗(yàn)證不同時間段保存的組織樣本對檢測結(jié)果的影響。對于新鮮冰凍切片樣本，應(yīng)限定新鮮冰凍切片樣本檢測時限明

29、確新鮮冰凍切片的切片要求。1.5.2 樣本核酸提取評價要求申請人需設(shè)置評價方案（如：對同一NSCLCFFPE組織樣本中段部分平行切去10份切片樣本等）和評價指標(biāo)，評價樣本核酸提取過程的重復(fù)性。樣本核酸的分離/純化主要有以下目的：富集靶核酸濃度、保證靶核酸序列的完整性、增加PCR模板溶液均T生、去除PCR抑制物，樣本核酸分離/純化是決定后續(xù)核酸擴(kuò)增過程成敗的要素之一。石蠟包埋組織樣本在福爾馬林固定過程中，會使樣品中的核酸與核酸之間、核酸與蛋白之間發(fā)生交聯(lián)。由于不同組織的蛋白種類和含量存在差異，不同組織核酸提取試劑的效率可能也有所不同。因此，無論申報產(chǎn)品是否含有核酸分離/純化的組分，申請人都應(yīng)對核

30、酸分離/純化環(huán)節(jié)做充分的驗(yàn)證。除最大量分離出目的核酸外，還應(yīng)有相應(yīng)的純化步驟，盡可能去除PCR抑制物。常見的核酸分離純化方法均有其優(yōu)勢和不足，申請人應(yīng)結(jié)合申報產(chǎn)品的特性，合理選擇核酸分離/純化試劑，并提供詳細(xì)的驗(yàn)證資料。1.5.3 樣本提取后核酸序列的穩(wěn)定性應(yīng)檢測核酸的含量，設(shè)置反應(yīng)體系需要的核酸含量上限和下限。如反應(yīng)體系中起始DNA濃度過高,可能導(dǎo)致反應(yīng)體系發(fā)生非特異性擴(kuò)增，產(chǎn)生假陽性結(jié)果。如反應(yīng)體系中起始DNA濃度過低，可能導(dǎo)致反應(yīng)體系無靶序列擴(kuò)增反應(yīng)，產(chǎn)生假陰性結(jié)果。采用紫外-可見分光光度計對DNA濃度進(jìn)行定量，通過260nm/280nm處的吸光度比值（OD260/OD280）或其他方法

31、評價其純度。設(shè)置反應(yīng)體系所需初始DNA含量范圍，如單位體積DNA濃度超過所需濃度上限或下限,應(yīng)提供相應(yīng)的改進(jìn)措施。同時，應(yīng)對核酸提取物的保存時間，保存溫度進(jìn)行驗(yàn)證。并評價凍融次數(shù)、儲存條件等對樣本提取后核酸序列穩(wěn)定性的影響。1.5.4 樣本完整性在樣本提取前、提取過程、提取后以及在儲存期間，核酸會發(fā)生不同程度地降解。為使降解降低到最彳即呈度（提取前或提取后），應(yīng)避免樣品的多次冷凍/融化。必要時，申請人應(yīng)評價提取前、提取后的凍融次數(shù)、儲存條件等因素。在長時間儲存后，應(yīng)在使用前評價核酸的完整性。比較檢測結(jié)果與儲存前檢測結(jié)果的一致性，如采用瓊脂糖凝膠電泳或者內(nèi)參基因PCR檢測等方法。2.外周血類型評

32、價要求2.1蜀氐檢測限EGFR在外周血中含量較低且片段較短，易于降解。在評價該部分最低檢測限時，建議將擬定量的DNA儲備液、細(xì)胞系或EGFR突變擴(kuò)增產(chǎn)物放入確定體積的血漿中,然后逐步稀釋，每個稀釋濃度重復(fù)檢測3次，待確定外周血中最低檢測限后，在外周血身氐檢測限水平附近再額外檢測部分接近最低檢測限的樣本，確認(rèn)最低檢測限D(zhuǎn)NA濃度。申請人可設(shè)置一個基礎(chǔ)濃度范圍，如從50pg/L濃度進(jìn)行稀釋,至少包括目標(biāo)檢測限和檢測限上下至少各2個梯度比例范圍的研究資料，應(yīng)對本試劑可檢測的所有基因型別按照上述方法驗(yàn)證最低檢測限。申請人同時需說明總DNA濃度的確定方法。2.1.1 如申報產(chǎn)品適用不同的核酸提取方法，每

33、種核酸提取方法應(yīng)配套檢測試劑進(jìn)行各突變基因類型身氐檢測限驗(yàn)證。2.1.2 如申報產(chǎn)品適用不同適用機(jī)型，每種適用機(jī)型應(yīng)配套檢測試劑進(jìn)行各突變基因類型最低檢測限驗(yàn)證。2.1.3 如申報產(chǎn)品適用不同外周血采血管、采集方法或保存方法，每種外周血采集方法或保存方法應(yīng)配套檢測試劑進(jìn)行各突變基因類型最低檢測限驗(yàn)證。2.2分析特異性2.2.1交叉反應(yīng)該類產(chǎn)品主要與月市部腫瘤存在較強(qiáng)關(guān)聯(lián)性，申請人在設(shè)計交叉反應(yīng)研究時應(yīng)將此點(diǎn)納入考慮。2.2.1.1申請人應(yīng)考慮與靶序列的核酸序列相近或具有同源性、易引起交叉反應(yīng)的野生型或其他突變類型序列的交叉反應(yīng)。建議交叉反應(yīng)驗(yàn)證考慮以下因素：EGFR基因不同序列；HER家族不同

34、基因等；不同濃度的野生型人DNA樣本、非人類基因組基因等。2.2.1.2對于可能產(chǎn)生交叉反應(yīng)的病原體，需在有臨床意義相關(guān)濃度下進(jìn)行檢測，細(xì)菌濃度水平建議至少106cfu/mL,病毒濃度水平建議至少105pfu/mL0需明確進(jìn)行交叉反應(yīng)的病原體類型及滴度。人野生型DNA至少包含lOOng/pL里件型核酸樣本，應(yīng)提供所有用于交叉反應(yīng)驗(yàn)證的突變或野生型序列來源、序列確認(rèn)和濃度選擇等試驗(yàn)資料。1.1.2 干擾物質(zhì)2.2.2.1申請人應(yīng)根據(jù)試劑盒所采用的樣本類型,確定潛在的干擾物質(zhì)，如：外周血中干擾成分、人類DNA、樣本采集管及保存管中活性成分、常見治療藥物等。2.2.2.2用于干擾試驗(yàn)的樣本，建議選擇

35、醫(yī)學(xué)相關(guān)水平的干擾物質(zhì)濃度，至少對EGFR突變基因弱陽性樣本進(jìn)行驗(yàn)證。1.1.3 有關(guān)分析特異性的信息應(yīng)在產(chǎn)品說明書的【產(chǎn)品性能指標(biāo)】項(xiàng)中有所體現(xiàn)。2.3 精密度申請人應(yīng)對每項(xiàng)精容度指標(biāo)的評價標(biāo)準(zhǔn)做出合理要求。具體實(shí)驗(yàn)方法可以參考國際或國內(nèi)有關(guān)體外診斷產(chǎn)品性能評估的文件進(jìn)行。針對本類產(chǎn)品的精密度評價主要包括以下要求：2.3.1 對可能影響檢測精密度的主要變量進(jìn)行驗(yàn)證，除申報試劑（包括核酸分離/純化組分）本身的影響外，還應(yīng)對PCR分析儀、操作者、地點(diǎn)等要素進(jìn)行相關(guān)的驗(yàn)證。2.3.2 合理的精密度評價周期，對批內(nèi)/批間、日內(nèi)/日間以及不同操作者之間的精密度進(jìn)行綜合評價。如有條件，申請人應(yīng)選擇不同的

36、實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行重復(fù)實(shí)驗(yàn)以對室間精密度進(jìn)行評價。2.3.3 用于精密度評價的樣本應(yīng)考慮血漿基質(zhì)的部分EGFR常見突變基因類型的樣本、陽性精密度參考品、陰性精密度參考品等。2.4 陽性/陰性參考品符合率各水平、各突變位點(diǎn)的陽性參考品均應(yīng)按要求檢出陽性，考慮到濃度梯度的不同，應(yīng)對各水平陽性參考品設(shè)置相應(yīng)Ct值的限制；陽性參考品在各個引物探針組合的檢測條件下均應(yīng)檢出為陰性；在其相應(yīng)的引物探針組合下檢測應(yīng)為陽性。2.5 樣本的穩(wěn)定性2.5.1樣本提取前核酸序列的穩(wěn)定性外周血采集后，應(yīng)對外周血存放條件、存放時限及溫度設(shè)置等進(jìn)行驗(yàn)證，包括采用抗核酸降解或防細(xì)胞裂解采血管的要求。采樣所用的防腐劑、抗凝劑、保護(hù)劑及

37、相關(guān)試劑材料不應(yīng)對核酸擴(kuò)增及檢測過程造成干擾。申請人還需對抗凝劑、防腐劑、保護(hù)劑等成分進(jìn)行驗(yàn)證。對于外周血樣本,因晚期肺癟患者外周血樣本中EGFR含量相對較少，基因片段較短，半衰期短。建議明確最少的外周血提取總量，必要時可以增加外周血提取總量，從而增大外周血中EGFR基因片段被提取的機(jī)率。同時，在核酸提取過程中應(yīng)盡量減少核酸損耗和降解。申請人應(yīng)對外周血樣本保存時間及溫度，離心參數(shù)設(shè)置等進(jìn)行驗(yàn)證。外周血樣本除滿足上述要求外，還應(yīng)注意全血中血漿和血清中均能分離出循環(huán)游離DNA(cfDNA,cellfreeDNA),但通過和同源性的血清樣本比較，血漿中cfDNA有更高的檢出率。血漿cfDNA通常片段

38、較短，且在血液中濃度非常低。抽血后延遲血漿分離會導(dǎo)致血細(xì)胞裂解，釋放出基因組DNA(gDNA)至血漿中，大量增加的gDNA會稀釋腫瘤來源的cfDNA,使得突變難以檢出。因此在標(biāo)本的采集、運(yùn)輸及儲存過程中,防止游離DNA的降解是首要考慮的因素。其次，也應(yīng)防止血液中白細(xì)胞的裂解，避免因野生型DNA的增加導(dǎo)致cfDNA中的EGFR突變基因無法檢測。因cfDNA含量低，為提高EGFR突變基因檢出率，在臨床允許的情況下推薦增加血漿用量,為采集到最佳血漿標(biāo)本用于后續(xù)提取游離DNA進(jìn)行EGFR突變基因檢測，推薦在采血管中加入保護(hù)劑，如：游離DNA保護(hù)劑及防細(xì)胞裂解保護(hù)劑等。全血采集后建議盡快離心，分離出不含

39、細(xì)胞成分的血漿。2.5.1 核酸提取評價要求樣本核酸的分離/純化主要有以下目的：富集靶核酸濃度、保證靶核酸序列的完整性、增加PCR模板溶液均一1性、去除PCR抑制物。樣本核酸分離/純化是決定后續(xù)核酸擴(kuò)增過程成敗的要素之一。一般而言，相對于單一靶序列的檢測，多基因序列檢測對樣本核酸的濃度和質(zhì)量更為敏感，核酸提取步驟對于成功獲得結(jié)果至關(guān)重要。應(yīng)確保具有滿足檢測反應(yīng)體系數(shù)量和質(zhì)量的核酸用于檢測。不同提取方法產(chǎn)出的核酸的濃度和質(zhì)量不同（如：分子量、純度、單鏈/雙鏈、pH值變化1如有多種不同的提取方法和樣品基質(zhì)被推薦用于檢測，應(yīng)確保同一反應(yīng)體系中不同基因片段和對照品的提取效率相近。因此，無論申報產(chǎn)品是否

40、含有核酸分離/純化的組分，申請人都應(yīng)對核酸分離/純化環(huán)節(jié)做充分的驗(yàn)證。除最大量分離出目的核酸外，還應(yīng)有相應(yīng)的純化步驟，盡可能去除PCR抑制物。常見的核酸分離純化均有其優(yōu)勢和不足，申請人應(yīng)結(jié)合申報產(chǎn)品的特性,合理選擇核酸分離/純化試劑，并提供詳細(xì)的驗(yàn)證資料。2.5.2 樣本提取后核酸序列的穩(wěn)定性應(yīng)檢測核酸的含量，設(shè)置反應(yīng)體系所需初始DNA含量范圍，如單位體積DNA濃度低于所需濃度，應(yīng)提供相應(yīng)的改進(jìn)措施。通過熒光染料法或其他方法評價其純度。同時，應(yīng)對核酸提取物的保存時間和保存溫度進(jìn)行驗(yàn)證。2.5.3 樣本完整性在樣本提取前、提取過程、提取后以及在儲存期間，核酸會發(fā)生不同程度地降解。為使降解降低到最

41、彳用呈度（提取前或提取后），應(yīng)避免樣品的多次冷凍/融化。必要時，申請人應(yīng)評價提取前、提取后凍融次數(shù)、儲存條件等因素。在長時間儲存后，應(yīng)在使用前評價核酸的完整性。比較檢測結(jié)果與儲存前檢測結(jié)果的一致性，如采用刷旨糖凝膠電泳或者內(nèi)參基因PCR檢測等方法。（五陽性判斷值確定資料在設(shè)定申報試劑檢測結(jié)果cut-off值確定依據(jù)時應(yīng)包括cut-off值研究方案、設(shè)定評價標(biāo)準(zhǔn)、研究過程以及研究原始數(shù)據(jù)等。方案應(yīng)考慮不同影響檢測結(jié)果的因素，如人群流行病學(xué)信息、疾病類型等。應(yīng)列舉cut-off值計算過程中采用的所有統(tǒng)計學(xué)方法。如果試劑存在灰區(qū)，應(yīng)解釋說明如何確定灰區(qū)范圍。明確臨界值在不同的樣本類型是否有差異。應(yīng)在

42、獨(dú)立樣本人群中對研究擬確定的cut-off值進(jìn)行充分驗(yàn)證。（六）穩(wěn)定性研究資料穩(wěn)定性研究資料主要涉及申報試劑的穩(wěn)定性。主要包括效期穩(wěn)定性（有效期開瓶穩(wěn)定性、復(fù)溶穩(wěn)定性、機(jī)載穩(wěn)定性（如適用1運(yùn)輸穩(wěn)定性及凍融次數(shù)限制等研究，申請人可根據(jù)實(shí)際需要選擇合理的穩(wěn)定性研究方案。穩(wěn)定性研究資料應(yīng)包括研究方法的確定依據(jù)、具體的實(shí)施方案、詳細(xì)的研究數(shù)據(jù)以及結(jié)論。對于效期穩(wěn)定性研究，應(yīng)提供至少三批樣品在實(shí)際儲存條件下保存至成品有5后的研究資料。（七）臨床評價資料申請人應(yīng)在符合要求的臨床機(jī)構(gòu)，在滿足臨床試驗(yàn)圖氐樣本量要求的前提下，根據(jù)產(chǎn)品臨床預(yù)期用途、相關(guān)疾病的流行率和統(tǒng)計學(xué)要求，制定能夠證明其臨床性能的臨床試驗(yàn)方

43、案，同時最大限度地控制試驗(yàn)誤差，提高試驗(yàn)質(zhì)量并對試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行科學(xué)合理的分析。1 .臨床試驗(yàn)方案臨床試驗(yàn)實(shí)施前，研究人員應(yīng)從流行病學(xué)、統(tǒng)計學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)等多方面考慮,設(shè)計科學(xué)合理的臨床研究方案。各臨床研究機(jī)構(gòu)的方案設(shè)置應(yīng)基本一致，且保證在整個臨床試驗(yàn)過程中遵循預(yù)定的方案實(shí)施，不可隨意改動。整個試驗(yàn)過程應(yīng)在臨床研究機(jī)構(gòu)的實(shí)驗(yàn)室內(nèi)并由本實(shí)驗(yàn)室的技術(shù)人員操作完成，申報機(jī)構(gòu)的技術(shù)人員除進(jìn)行必要的技術(shù)指導(dǎo)外，不得隨意干涉實(shí)驗(yàn)進(jìn)程,尤其是數(shù)據(jù)收集過程。方案中臨床樣本信息應(yīng)明確以下信息：采集時間要求、標(biāo)本類型要求、采樣質(zhì)量的要求,該類要求應(yīng)與產(chǎn)品說明書中規(guī)定的要求一致，如產(chǎn)品說明書中未列明，應(yīng)在臨床方

44、案中進(jìn)行列明。試驗(yàn)方案中應(yīng)確定嚴(yán)格的病例納入/排除標(biāo)準(zhǔn)，任何已經(jīng)入選的病例在被排除出臨床研究時都應(yīng)記錄在案并明確說明原因。在試驗(yàn)操作過程中和判定試驗(yàn)結(jié)果時應(yīng)采用盲法以保證試驗(yàn)結(jié)果的客觀性。各研究機(jī)構(gòu)選用的參比試劑應(yīng)完全一致，以便進(jìn)行合理的統(tǒng)計學(xué)分析。臨床方案中還應(yīng)明確復(fù)核試劑及方法。另外，考核試劑適用的樣本類型、可檢測的突變基因類型不應(yīng)超越參比試劑的相應(yīng)檢測范圍，若此種情況發(fā)生，則應(yīng)選擇其他合理參比方法對額外的樣本類型和突變基因類型進(jìn)行驗(yàn)證。2 .臨床試驗(yàn)必須符合赫爾辛基宣言的倫理學(xué)準(zhǔn)則，必須獲得臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)倫理委員會的同意。研究者應(yīng)考慮臨床試驗(yàn)用樣本的獲得或試驗(yàn)結(jié)果對受試者的風(fēng)險性，應(yīng)提交倫

45、理委員會的審查意見及受試者的知情同意書。對于例外情況，如客觀上不可能獲得受試者的知情同意或該臨床試驗(yàn)對受試者幾乎沒有風(fēng)險，可經(jīng)倫理委員會審查和批準(zhǔn)后免于受試者的知情同3 .臨床研究機(jī)構(gòu)的選擇建議申請人在選擇臨床機(jī)構(gòu)時，應(yīng)在國內(nèi)不同區(qū)域選擇臨床機(jī)構(gòu)，盡量使各機(jī)構(gòu)的臨床樣本有一定的區(qū)域代表性；臨床研究機(jī)構(gòu)進(jìn)行EGFR突變基因檢測應(yīng)建立PCR標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室，并建立實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量管理體系以確保檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性。PCR實(shí)驗(yàn)室技術(shù)人員應(yīng)接受過PCR上崗培訓(xùn)，且技能熟練。操作人員必須是接受過良好培訓(xùn)的技術(shù)人員，實(shí)驗(yàn)操作人員應(yīng)有足夠的時間熟悉檢測系統(tǒng)的各環(huán)節(jié)（儀器、試劑、質(zhì)控及操作程序等），熟悉評價方案。在整個實(shí)驗(yàn)中

46、，考核試劑和參的準(zhǔn)確性及可重復(fù)性。比方法都應(yīng)處于有效的質(zhì)量控制下，最大限度保證試驗(yàn):4 .考核試劑適用樣本類型設(shè)置要求科學(xué)研究表明，NSCLC病理組織樣本與外周血樣本EGFR突變基因陽性檢出率存在差異，且在EGFR-TKIs藥物臨床研究中兩類樣本類型的EGFR-TKIs藥效學(xué)評價方式也存在差異。因此，本部分對病理組織樣本類型臨床研究要求與外周血樣本類型臨床研究要求分別進(jìn)行說明，其中病理組織樣本總臨床樣本例數(shù)不少于1000例，包含4.1項(xiàng)中一致性評價臨床例數(shù)要求與5項(xiàng)中EGFR突變基因個體化治療相關(guān)臨床例數(shù)要求。外周血樣本總臨床樣本例數(shù)不少于1000例，包含4.2項(xiàng)中一致性評價臨床例數(shù)要求與5項(xiàng)

47、中EGFR突變基因個體化治療相關(guān)臨床例數(shù)要求。4.1NSCLC病理組織樣本類型具體要求4.1.1對比方法選擇4.1.1.1如申報試劑已有同類上市產(chǎn)品，具臨床研究可以選擇已批準(zhǔn)上市、臨床普遍認(rèn)為質(zhì)量較好的同類產(chǎn)品作為對比試劑，同時應(yīng)充分了解產(chǎn)品方法學(xué)、臨床預(yù)期用途、主要性能指標(biāo)、陽性判斷值、突變基因位點(diǎn)選擇等，以便對試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行科學(xué)分析。采用擬申報產(chǎn)品（以下稱考核試劑）與之進(jìn)行對比試驗(yàn)研究，至少證明本品與已上市產(chǎn)品等效。對比已上市同類期應(yīng)具有相同的突變位點(diǎn)且對比試劑檢測結(jié)果應(yīng)可以區(qū)分每個突變型別，以確?？己嗽噭┡c對比試劑具有明確可比性。4.1.1.2如選擇核酸序列測定方法作為此類試劑臨床試驗(yàn)研究

48、的對比方法，驗(yàn)證考核試劑檢測結(jié)果與核酸序列測定（測序）結(jié)果之間的一致性情況，臨床研究報告中應(yīng)對選用的測序方法作詳細(xì)介紹。申請人應(yīng)提供以下關(guān)于測序部分的詳細(xì)試驗(yàn)資料，并經(jīng)臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)簽章確認(rèn)。4.1.1.2.1測序方法原理、測序儀型號、測序試劑及消耗品的相關(guān)信息。4.1.1.2.2測序方法所用引物相關(guān)信息，如基因區(qū)段選擇、分子量、純度、功能性實(shí)驗(yàn)等資料。引物設(shè)計應(yīng)能區(qū)分所有基因型但需避開考核試劑擴(kuò)增的靶核酸區(qū)段。4.1.1.23應(yīng)對所選測序方法的分析性能進(jìn)行合理驗(yàn)證，尤其是最低檢測限的確認(rèn)，建議將所選測序方法與申報試劑的相關(guān)性能進(jìn)行適當(dāng)比對分析。4.1.1.2.4測序方法應(yīng)建立合理的陽性質(zhì)控品和

49、陰性質(zhì)控品對臨床樣本的檢測結(jié)果進(jìn)行質(zhì)量控制。4.1.125應(yīng)選擇有代表性的樣本測序圖譜及結(jié)果分析資料。4.1.2病例選擇臨床試驗(yàn)應(yīng)以非小細(xì)胞肺癌腫瘤患者為主要研究又慘，其中應(yīng)涵蓋考核試劑所聲稱的所有基因型且每種突變型別應(yīng)有一定量的陽性病例。對于陰性病例的選擇，也應(yīng)考慮到交叉反應(yīng)驗(yàn)證的需要，從臨床角度考察其分析特異性。若產(chǎn)品適用于多種樣本類型，則應(yīng)對所有樣本類型均進(jìn)行臨床驗(yàn)證。具體要求如下：4.121臨床樣本類型以肺腺痙為主，還應(yīng)包括一定數(shù)量的其他類戮市癟及肺部腫瘤初治/復(fù)發(fā)人群等。4.1.2.2如申報試劑樣本類型適用于冰凍新鮮樣本，應(yīng)完成不少于200例冰凍新鮮樣本。4.2外周血樣本類型具體要求

50、4.2.1對比方法學(xué)圉至4.2.1.1如申報試劑已有同類上市產(chǎn)品，其臨床研究可以選擇已批準(zhǔn)上市、臨床普遍認(rèn)為質(zhì)量較好的同類產(chǎn)品作為對比試劑，同時應(yīng)充分了解產(chǎn)品方法學(xué)、臨床預(yù)期用途、主要性能指標(biāo)、陽性判斷值、突變基因位點(diǎn)選擇等，以便對試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行科學(xué)分析。采用考核試劑與之進(jìn)行對比試驗(yàn)研究，證明本品與已上市產(chǎn)品等效。對比已上市同類試劑應(yīng)具有相同的突變位點(diǎn)且對比試劑檢測結(jié)果應(yīng)可以區(qū)分不同突變型別，以確?？己嗽噭┡c對比試劑具有明確可比性。4.2.1.2 如選擇核酸序列測定方法作為此類試劑臨床試驗(yàn)研究的對比方法，驗(yàn)證考核試劑檢測結(jié)果與核酸序列測定（測序）結(jié)果之間的一致性情況，臨床研究報告中應(yīng)對選用的測序

51、方法作詳細(xì)介紹。4.2.1.3 因外周血中EGFR突變基因片段較短、含量較低，在外周血檢測EGFR突變基因片段中可選擇高通量核酸序列測定方法或其他靈敏度較高的檢測方法作為此類試劑臨床試驗(yàn)研究的對比方法，驗(yàn)證考核試劑檢測結(jié)果與核酸序列測定（測序）結(jié)果之間的一致性情況,臨床研究報告中應(yīng)對選用的測序方法作詳細(xì)介紹。申請人應(yīng)提供以下關(guān)于測序部分的詳細(xì)試驗(yàn)資料，并經(jīng)臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)簽章確認(rèn)。4.2.13.1 測序方法原理、測序儀型號、測序試劑及消耗品的相關(guān)信息。4.2.13.2 2測序文庫構(gòu)建組分的主要組成、原理介紹。4.2.13.3 物信息學(xué)分析軟件、數(shù)據(jù)存儲中心、異常情況處置方案等信息。4.2.13.5

52、 測序方法所用引物、探針、接頭、連接酶、聚合酶、逆轉(zhuǎn)錄酶及限制性內(nèi)切酶相關(guān)信息，如序列選擇，分子量、純度、保存穩(wěn)定性、功能性實(shí)驗(yàn)及所有酶的酶活性等資料。引物設(shè)計應(yīng)能區(qū)分所有基因型但需避開考核試劑擴(kuò)增的靶核酸區(qū)段。4.2.13.6 應(yīng)對所選測序方法的分析性能進(jìn)行合理驗(yàn)證,尤其是最低檢測限的確認(rèn),建議將所選測序方法與申報試劑的相關(guān)性能進(jìn)行適當(dāng)比對分析。4.2.13.7 測序方法應(yīng)建立合理的陽性質(zhì)控品和陰性質(zhì)控品對臨床樣本的檢測結(jié)果進(jìn)行質(zhì)量控制。4.2.13.8應(yīng)選擇有代表性的樣本測序和注釋文件資料。4.2.13.8 擇臨床試驗(yàn)應(yīng)以非小細(xì)胞肺痙腫瘤患者為主要研究又陵，其中應(yīng)涵蓋考核試劑所聲稱的所有基

53、因型且每種突變型別均應(yīng)有一定量的陽性病例。對于陰性病例的選擇，也應(yīng)考慮到交叉反應(yīng)驗(yàn)證的需要，從臨床角度考察其分析特異性。具體要求如下：4.2.2.1 臨床樣本類型以肺腺癟為主，還應(yīng)包括一定數(shù)量的其他類勖市癟及肺部腫瘤初治/復(fù)發(fā)人群等。4.2.2.2 臨床樣本類型比對方式應(yīng)包括至少200例腫瘤患者同源性外周血樣本和組織學(xué)樣本對比臨床研究資料。4.2.2.3 如考核試劑檢測系統(tǒng)適用不同類型外周血保存方法，建議每種外周血保存方法應(yīng)配合申報檢測系統(tǒng)，完成不少于200例同源性臨床對比研究。5.EGFR突變基因個體化治療相關(guān)臨床研究要求依據(jù)EGFR-TKI靶向治療臨床需求，申請人除在完成與同類產(chǎn)品一致性臨

54、床研究外，還需提供EGFR突變基因檢測試劑盒與相關(guān)腫瘤藥物關(guān)聯(lián)臨床研究資料，表明考核試劑與特定腫瘤藥物伴隨使用可以使患者臨床獲益的客觀證據(jù)。主要考慮以下幾種情況：5.1 考核試劑應(yīng)滿足臨床需求，申請人可采用基于特定藥物研究觀察終點(diǎn)的前瞧性隊列或回顧性隊列臨床研究，或其他臨床研究方法。采用其他臨床研究方法時，臨床研究方案應(yīng)考慮包括該產(chǎn)品預(yù)期目標(biāo)人群，如經(jīng)過特定腫瘤藥物治療的患者人群。同時，為保證其他臨床研究效能，應(yīng)考慮選用已聯(lián)合特定腫瘤藥物臨床研究的體外診斷試劑作為全部或部分考核試劑檢測結(jié)果的對比方法。隨著腫瘤個體化藥物研究持續(xù)深入，基于腫瘤患者直接臨床獲益證據(jù)，EGFR部分突變基因位點(diǎn)（如耐藥

55、突變基因位點(diǎn)）可能被賦予新的臨床意義。申請人可采用基于新上市藥物研究觀察終點(diǎn)的前瞻性隊列或回顧性隊列臨床研究，或其他臨床研究方法。采用其他臨床研究方法時，臨床研究方案應(yīng)考慮包括該產(chǎn)品預(yù)期目標(biāo)人群，如經(jīng)過新上市腫瘤藥物治療的患者人群。同時,為保證其他臨床研究效能，應(yīng)考慮選用已聯(lián)合新上市腫瘤藥物臨床研究的體外診斷試劑作為全部或部分考核試劑檢測結(jié)果的對比方法。5.2 考核試劑部分突變基因類型在中國境內(nèi)若屬于首次申報,因EGFR突變基因在不同種族中人群易感性不同，申請人應(yīng)考慮EGFR突變基因可能在不同人群中的差異。在注冊申報時，應(yīng)提供突變類別在中國人群中的突變比例等臨床評價資料。5.3 EGFR突變基

56、因個體化治療相關(guān)臨床研究的臨床樣本量受研究疾病、研究目的和研究終點(diǎn)的影響。樣本量大小的估計應(yīng)根據(jù)治療作用大小的預(yù)期、變異程度的預(yù)估、統(tǒng)計分析方法等來確定。5.EGFR突變基因個體化治療相關(guān)臨床研究要求中樣本量統(tǒng)計方法如與（七）臨床評價資料其他部分臨床樣本量統(tǒng)計方法存在區(qū)別，申請人需合理選擇該項(xiàng)樣本量的計算方法。因與EGFR突變基因檢測試劑盒聯(lián)合使用的不同藥物臨床研究療效存在差異,該部分EGFR突變基因檢測試劑臨床評價指標(biāo)設(shè)置需主要依據(jù)藥物臨床部分評價指標(biāo)進(jìn)行聯(lián)合設(shè)置。應(yīng)明確抗腫瘤藥物臨床試驗(yàn)終點(diǎn)。如：總生存期（OverallSurvival,OS基于腫瘤測量的終點(diǎn)如無病生存期（DFS客觀緩解率

57、（ORR1疾病進(jìn)展時間（TTP）無進(jìn)展生存期（PFS）和治療失敗時間（TTF）等，或基于癥狀評價的終點(diǎn)等。在該部分研究中，申請人應(yīng)提交患者相關(guān)臨床診療信息如治療前/后的腫瘤生物學(xué)標(biāo)志物、CT或PET-CT等影像檢查結(jié)果，并匯總分析相關(guān)藥物治療非小細(xì)胞肺痙患者前后的臨床效果。5.4 考核試劑適用樣本類型如包括組織學(xué)樣本或/和外周血樣本。組織學(xué)樣本與外周血樣本需分別進(jìn)行相關(guān)臨床研究，依據(jù)考核試劑不同樣本類型預(yù)期用途，該部分臨床試驗(yàn)要求原則可參照5.1項(xiàng)要求執(zhí)行。6.統(tǒng)計學(xué)分析在采用對比實(shí)驗(yàn)進(jìn)行一致性研究時，臨床試驗(yàn)結(jié)果的統(tǒng)計應(yīng)選擇合適的統(tǒng)計方法，如檢測結(jié)果一致性分析、阻性/陽性符合率、陽性預(yù)測值、

58、陰性預(yù)測值、k叩pa檢驗(yàn)等，統(tǒng)計分析應(yīng)可以證明不同方法的檢測結(jié)果有無明顯統(tǒng)計學(xué)差異。在臨床研究方案中應(yīng)明確統(tǒng)計檢驗(yàn)假設(shè)，設(shè)置a值及P值假設(shè)條件，即評價考核試劑與參比試劑是否等效的標(biāo)準(zhǔn)。建議采用四格表對考核試劑和對比方法學(xué)統(tǒng)計分析。統(tǒng)計每個突變類別陽性符合朝口在所有陽性病例中所占比例。對本次臨床研究中人群基本特征進(jìn)行分析，例如：年齡，性別，疾病類型等建議進(jìn)行統(tǒng)計分析，如表1表1人群基本特征統(tǒng)計表因素所占總數(shù)比例考核試劑對比方法性別年齡疾病類型癟癥分期7.臨床試驗(yàn)總結(jié)報告撰寫根據(jù)體外診斷試劑臨床試驗(yàn)技術(shù)指導(dǎo)原則（國家食品藥品監(jiān)督管理總局通告2014年第16號）的要求，臨床試驗(yàn)報告應(yīng)該對試驗(yàn)的整體設(shè)計及各個關(guān)鍵點(diǎn)給予清晰、完整的闡述，應(yīng)該對整個臨床試驗(yàn)實(shí)施過程、結(jié)果分析、結(jié)論等進(jìn)行條理分明的描述，并應(yīng)包括必要的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和統(tǒng)計分析方法。建議在臨床總結(jié)報告中對以下內(nèi)容進(jìn)行詳述。7.1 臨床試驗(yàn)總體設(shè)計及方案描述7.1.1臨床試驗(yàn)的整體管理情況、臨床研究機(jī)構(gòu)選擇、臨床主要研究人員簡介等基本情況介紹。7.1.2 病例納入/排除標(biāo)準(zhǔn)、不同年齡段人群的預(yù)期選擇例數(shù)及標(biāo)準(zhǔn)。7.1.3 樣本類型，樣本的收集、處理及保存等。7.1