千種單基因病計劃

1、千種單基因病計劃計劃啟動背景隨著醫(yī)學、生物學等基礎學科的發(fā)展，以及相應科學技術的進步，尤其是人類基因組計劃、人類單 體型圖計劃的啟動，極大的推動了科學家對疾病在基因組學方向的研究。更多的疾病致病基因、易感基因 被人們發(fā)現(xiàn)，這些研究成果在臨床實踐中的應用，為部分疾病的治療及用藥提供了更多科學的個性化指導,讓患者對于疾病也有了更為積極的態(tài)度。但在患病群體中，有一群特殊的人，他們就是罕見病患者；由于 各種原因，至今只有少數(shù)罕見病有能夠醫(yī)治的藥物，更多的罕見病發(fā)病機理尚不明確，這些都呼喚我們給 予這個特殊的群體更多的愛和關心。自國際上將第二代測序技術運用于尋找罕見病致病基因以來，華大基 因就致力于利用

2、大規(guī)模的測序平臺和強大的信息分析團隊，與國內外科學家和醫(yī)療科研單位合作，力圖在 幾年內找出大量罕見遺傳病的致病基因，為罕見病研究提供理論基礎，推動罕見病的臨床診斷、治療與預 防。計劃進展：2010年5月，華大基因發(fā)起“千種單基因病研究計劃”。至2011年5月，國內外已有60多家科研醫(yī)療單位參與到該計劃中，啟動項目200多個，發(fā)表科研文章 3篇，另有多篇文章在投稿和撰寫中，有 50多個項目處于后期驗證階段。計劃新舉措：2011年，深圳華大基因研究院決定投入專項科研經費，邀請更多的合作伙伴參與到“千種單基因病 計劃”中，共同推動人類單基因遺傳病的基因組學研究，為人類的健康事業(yè)做出貢獻。人類孟德爾遺

3、傳學的在線版本( /sites/entrez?db=omim)記錄了不同遺傳模式下的孟德爾遺傳病、線粒體遺傳病、疑似孟德爾遺傳的疾病，給遺傳病研究者提供了資源平臺。 單基因遺傳病種類涉及全身多個系統(tǒng)，部分疾病會累及多個組織和器官，下表列舉了各個系統(tǒng)部分疾病。疾病系統(tǒng)疾病列舉OMIM ID英義名中文名(注：標有“*”的為疾病的中文癥狀描述。視覺系統(tǒng)%613626MYOPIA 18; MYP18近視#613756RETINITIS PIGMENTOSA 49; RP49視網(wǎng)膜色素變性口腔和牙齒#217080Jalili Syndrome錐桿營養(yǎng)不

4、良(CRD和牙釉質發(fā)育不 全%119530OROFACIAL CLEFT1; OFC1口面裂免疫系統(tǒng)#611943Riddle Syndrome主要特點是對電離輻射敏感，免疫缺 陷，學習困難和不尋常的臉部外觀 *#120100FAMILIAL COLD AUTOINFLAMMATORYSYNDROME 1家族性寒冷性尊麻疹呼吸系統(tǒng)%142340DIAPHRAGMATIC HERNIA, CONGENITAL先天性膈疝#267450Respiratory Distress Syndrome InPremature Infants早產兒呼吸窘迫綜合癥內分泌和代謝 系統(tǒng)#211180Bowen-Co

5、nradi Syndrome主要特點是低出生體重，小頭，面部 畸形和不能茁壯成長*#188400Digeorge SyndromeDiGeorge氏綜合癥多系統(tǒng)疾病#203800Alstrom SyndromeAlstrom綜合征常染色體隱性遺傳病#302060Barth Syndrome巴特綜合征X連鎖遺傳肌肉骨骼系統(tǒng)和結締組織%166300OSTEOLYSISHEREDITARYOFCARPAIBONESWITH OR WITHOUT NEPHROPATHY遺傳性的伴隨或不伴隨腎病腕骨骨質 溶解#610713Brachydactyly - Syndactyly Syndrome先天性并指短

6、指畸形精神健康和 行為#600795Frontotemporal Dementia, Chromosome3-Linked;Ftd33號染色體連鎖性額融癡呆#609056Amish Infantile Epilepsy SyndromeAmish嬰兒癲癇綜合癥大腦和神經 系統(tǒng)%601992FRIEDREICH ATAXIA2弗里德賴希共濟失調%114100BASAL GANGLIA CALCIFICATION, IDIOPATHIC, CHILDHOOD-ONSET基底核鈣化耳鼻喉%600674DEAFNESS, AUTOSOMAL RECESSIVE 5; DFIB5染色體隱性遺傳耳聾%60

7、0792MICROTIA-ANOTIA小耳畸形-無耳畸形皮膚毛發(fā)和 指甲#308100Ichthyosis,X-Linked;XliX連鎖型魚鱗病#613737ACNE INVERSA, FAMILIAL, 3家族性座瘡心血管系統(tǒng)#192600Cardiomyopathy,Familial Hypertrophic 1家族性肥厚型心肌病1型#613695LONG QT SYNDROME 5; LQT5QT延長綜合征消化系統(tǒng)#211600Cholestasis,Progressive FamilialIntrahepatic,1; Pfic1進行性家族性肝內膽汁瘀積1型%609919GALLBL

8、ADDER DISEASE 3膽囊疾病血液和淋巴 系統(tǒng)#602014Hypomagnesemia 1,Intestinal低鎂血癥#312060Properdin Deficiency, X-LinkedX連鎖備解素缺乏泌尿和生殖 系統(tǒng)#125800Diabetes Insipidus,Nephrogenic, Autosomal腎性尿崩癥%279000YOUNG SYNDROME揚氏綜合征先天性腫瘤#156530Metatropic Dysplasia變形性骨發(fā)育不良#155755Melanoma-Astrocytoma Syndrome黑色素瘤-星形細胞瘤綜合征單基因遺傳病的基因組學研究方

9、法:高通量測序技術的迅猛發(fā)展，給科學家?guī)砹艘粋€不容錯過的歷史機遇，尤其是單基因遺傳病致病 基因的研究。國際上應用高通量測序技術研究單基因遺傳病的報道近年來層出不窮，主要的研究策略為以 下三種：外顯子捕獲測序、目標區(qū)域捕獲測序、全基因組重測序。下表中列舉了利用以上三種策略尋找到單基因遺傳病致病基因的案例:文早名期刊名策略測序樣本Exome sequencing identifies the cause of a mendilian disorderNature Genetics全外顯子捕獲 測序三個獨立家系 的四名米勒綜 合癥患者Whole-GenomeSequencing in a Patient withCharcot-Marie-ToothNeuropathyThe NEW ENGLANDJOURNAL ofMEDICINE全基因組重測 序11先證者WDR62 is associated with the spindle pole and is