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1、基因工程大題2基因工程操作的基本步驟是什么? 施工材料的準(zhǔn)備,即目的基因、載體、工具酶和受體細(xì)胞(宿主)的準(zhǔn)備。用限制性內(nèi)切酶分別將外源dna 和載體分子切開。(切) 目的基因與載體 dna 的體外重組,形成重組dna 分子。(接) 把重組的 dna 分子引入受體細(xì)胞,并建立起無(wú)性繁殖系。(轉(zhuǎn)和擴(kuò) 篩選出所需要的無(wú)性繁殖系,并保證外源基因在受體細(xì)胞中穩(wěn)定遺傳、正確表達(dá)。(檢)3如何理解基因工程的兩個(gè)特點(diǎn)?答:基因工程的兩個(gè)基本特點(diǎn)是分子水平的操作和細(xì)胞水平的表達(dá)。分子水平的操作包括dna 分離、切割和連接(還有其他一些dna 的修飾等)。由于體外重組dna 的最終目的是要改變生物的遺傳性,所以

2、分子水平的操作和細(xì)胞水平的表達(dá)是基因工程的兩個(gè)最基本的特點(diǎn)。4基因克隆是如何使含有單個(gè)基因的dna 片段得到純化的?答:大分子質(zhì)量的dna 會(huì)含有許多特殊限制性內(nèi)切核酸酶的限制位點(diǎn),因此用一種限制 酶處理一完整染色體或整個(gè)基因組會(huì)產(chǎn)生許多不同的dna 片段,每一個(gè)片段帶有基因組的一個(gè)不同的基因或一個(gè)不同的小片段。當(dāng)全部片段與用同種限制酶處理過的載體分子混合時(shí)(如圖所示),每個(gè)片段將插入一個(gè)不同的載體分子(如一個(gè)質(zhì)粒)。同樣地,當(dāng)用這些質(zhì)粒轉(zhuǎn)化宿主細(xì)胞時(shí),每個(gè)宿主細(xì)胞將只接收一個(gè)質(zhì)粒dna 分子,而篩選出的含重組質(zhì)粒的每個(gè)菌落實(shí)際上會(huì)含有某一特異的供體dna 片段的多個(gè)拷貝。一旦帶有待研究的特定

3、基因的克隆被確認(rèn)了,此重組dna 分子可從宿主細(xì)胞中提取出來(lái)進(jìn)行純化。5比較遺傳工程、基因工程和生物技術(shù)。答:遺傳工程是遺傳學(xué)和工程學(xué)相結(jié)合的一門技術(shù)科學(xué)。借用工程技術(shù)上的設(shè)計(jì)思想,在離體條件下,對(duì)生物細(xì)胞、細(xì)胞器、染色體或dna 分子進(jìn)行按圖施工的遺傳操作,以求定向地改造生物的遺傳性。遺傳工程的概念有廣義和狹義之分。狹義的遺傳工程就是指基因工程?;蚬こ蹋╣ene engineering)又稱基因操作(gene manipulation)、重組dna(recombinant dna)?;蚬こ淌且苑肿舆z傳學(xué)理論為基礎(chǔ),以分子生物學(xué)和微生物學(xué)的現(xiàn)代方法手段,將不同來(lái)源的基因(dna 分子),按

4、預(yù)先設(shè)計(jì)的藍(lán)圖,在體外構(gòu)建雜種dna 分子,然后導(dǎo)入活細(xì)胞,以改變生物原有的遺傳特性,獲得新品種,生產(chǎn)新產(chǎn)品,或是研究基因的結(jié)構(gòu)和功能。生物技術(shù)又稱生物工藝學(xué),生物工程學(xué)。是根據(jù)生物學(xué)、化學(xué)和工程學(xué)的原理進(jìn)行工業(yè)規(guī)模的經(jīng)營(yíng)和開發(fā)微生物、動(dòng)植物細(xì)胞及其亞細(xì)胞組分,進(jìn)而利用生物體所具有的功能元件(如基因、蛋白質(zhì))等來(lái)提供商品或社會(huì)服務(wù)的一門綜合性科學(xué)技術(shù)。它包括基因工程、細(xì)胞工程、酶工程和發(fā)酵工程等。6說(shuō)明sanger dna 測(cè)序法的原理。答:sanger dna 測(cè)序法建立在兩個(gè)基本原理之上:核酸是依賴于模板在聚合酶的作用下由5端向3端聚合;可延伸的引物必須能提供游離的3羥基末端,雙脫氧核苷酸

5、由于缺少游離的3羥基末端,因此會(huì)終止聚合反應(yīng)的進(jìn)行。如果分別用四種雙脫氧核苷酸終止反應(yīng),則會(huì)獲得四組長(zhǎng)度不同的dna 片段。通過比較所有dna 片段的長(zhǎng)度可以得知核苷酸的序列。11當(dāng)兩種限制性內(nèi)切核酸酶的作用條件不同時(shí),若要進(jìn)行雙酶切,應(yīng)采取什么措施 為什么答:注意星號(hào)活性;先低鹽,后高鹽;先低溫酶,后高溫酶;并且可以直接在換酶前將第一種酶失活,再加第二種酶,否則,易產(chǎn)生星號(hào)活性,或使用通用緩沖液。12何謂限制性物理圖譜?答:限制性物理圖譜即限制性內(nèi)切核酸酶作圖(restriction mapping)。簡(jiǎn)單地說(shuō)就是dna 分子中限制性內(nèi)切核酸酶切割位點(diǎn)的定位,即dna 分子中各種不同限制性內(nèi)

6、切核酸酶的酶切位點(diǎn)的線性排列圖。標(biāo)明限制酶在dna 分子上的限制性位點(diǎn)的數(shù)目、限制性片段大小及其線性排列的順序。13什么是細(xì)菌的限制修飾系統(tǒng) (restriction modificationsystem,r-m system)答:細(xì)菌中有作用于同一dna 的兩種酶,即分解dna 的限制酶和改變dna 堿基結(jié)構(gòu)使其免遭限制酶分解的修飾酶。而且,這兩種酶作用于同一dna 的相同部位,把這兩種酶所組成的系統(tǒng)稱為限制與修飾系統(tǒng)。14細(xì)菌的限制修飾系統(tǒng)有什么意義?答:不同種的細(xì)菌或不同的細(xì)菌菌株具有不同的限制酶和修飾酶組成的限制與修飾系統(tǒng)。修飾的本質(zhì)是通過甲基化酶將dna 中某些堿基進(jìn)行甲基化修飾,由

7、于宿主自身dna 上的這些位點(diǎn)進(jìn)行了修飾,限制酶就不能進(jìn)行切割。而外來(lái)的dna 在相應(yīng)的堿基上沒有被甲基化,宿主的限制酶通過對(duì)該位點(diǎn)的識(shí)別來(lái)分辨敵我,并將入侵的外來(lái)dna 分子降解掉。所以dna 限制作用和修飾作用為細(xì)胞提供了保護(hù)。15說(shuō)明限制性內(nèi)切核酸酶的命名原則要點(diǎn)。答:基本原則:屬名+種名+株名十序號(hào)。首字母:取屬名的第一個(gè)字母,且斜體大寫。第二個(gè)字母:取種名的第一個(gè)字母,斜體小寫。第三個(gè)字母:取種名的第二個(gè)字母,斜體小寫。第四個(gè)字母:若有株名,株名則作為第四個(gè)字母,用正體。順序號(hào):若在同一菌株中分離了幾種限制酶,則按先后順序冠以i、ii、iii 等,用正體。所有的限制酶,前面還應(yīng)帶有系

8、統(tǒng)的名稱,如限制性核酸內(nèi)切酶 r. hind iii。修飾酶則在前面加上甲基轉(zhuǎn)移酶m,如甲基轉(zhuǎn)移酶m. hind iii。在上下文已清楚只涉及限制酶的地方,r 可被省去。16何謂限制性內(nèi)切核酸酶的切割頻率?答:切割頻率是指限制性內(nèi)切核酸酶在某dna 分子中預(yù)測(cè)的切點(diǎn)數(shù)。由于dna 是由四種類型的單核苷酸組成,假定dna 的堿基組成是均一的,而限制性內(nèi)切核酸酶的識(shí)別位點(diǎn)是隨機(jī)分布的,那么對(duì)于任何一種限制酶的切割頻率,理論上應(yīng)為14n,n 表示該限制酶識(shí)別的堿基數(shù)。如識(shí)別4 個(gè)堿基的限制酶,其切割頻率應(yīng)為每256 個(gè)堿基有一個(gè)識(shí)別序列和切點(diǎn)(144 = 1256),識(shí)別5 個(gè)堿基的限制性內(nèi)切核酸酶

9、,其切割頻率應(yīng)為每1024 個(gè)堿基有一個(gè)識(shí)別序列和切點(diǎn),余類推。18雙酶消化法(double digest)繪制限制性內(nèi)切核酸酶酶譜的原理是什么?答:雙酶消化法是繪制dna 中兩個(gè)或兩個(gè)以上限制性內(nèi)切核酸酶圖譜所采用的方法。做法是在兩個(gè)限制性內(nèi)切核酸酶分別單獨(dú)消化dna 分子的基礎(chǔ)上,再用這兩個(gè)酶同時(shí)或先后消化dna,根據(jù)它們的結(jié)果構(gòu)建物理圖譜。17什么是限制性內(nèi)切核酸酶的星號(hào)活性受哪些因素的影響答:ii 類限制酶雖然識(shí)別和切割的序列都具有特異性,但是這種特異性受特定條件的限制,即在一定環(huán)境條件下表現(xiàn)出來(lái)的特異性。條件發(fā)生改變,限制酶的特異性就會(huì)松動(dòng),識(shí)別的序列和切割都有一些改變。改變后的活性

10、通常稱第二活性,而將這種因條件的改變會(huì)出現(xiàn)第二活性的酶的右上角加一個(gè)星號(hào)表示,因此第二活性又稱為星號(hào)活性。誘發(fā)星號(hào)活性的因素有如下幾種:高甘油含量(5,vv);限制性內(nèi)切核酸酶用量過高(100ugdna);低離子強(qiáng)度(25mmoll);高ph(80 以上);含有有機(jī)溶劑,如dmso、乙醇等;有非mg2+的二價(jià)陽(yáng)離子存在(如mn2+、cu2+、co2+、zn2+等)。19什么是dna 多態(tài)性 (dna polymorphism)答:在正常人群中,各個(gè)體dna 分子的某些位點(diǎn)可以發(fā)生中性改變,這些改變雖然會(huì)使dna 一級(jí)結(jié)構(gòu)產(chǎn)生一定變化,但不影響基因的表達(dá),如果這種中性突變?cè)谌巳褐械念l率不低于1,

11、這一現(xiàn)象被稱為多態(tài)性。dna 多態(tài)性本質(zhì)上是染色體dna 中核苷酸數(shù)目或排列順序的個(gè)體差異,這些差異多數(shù)為中性突變,不引起表型改變。20什么是限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性 (restriction fragment lengt hpolymorphism,rflp)答:當(dāng)dna 序列的差異發(fā)生在限制性內(nèi)切核酸酶的識(shí)別位點(diǎn)時(shí),或當(dāng)dna 片段的插入、缺失或重復(fù)導(dǎo)致基因組dna 經(jīng)限制性內(nèi)切核酸酶酶解后,其片段長(zhǎng)度的改變可以經(jīng)凝膠電泳區(qū)分時(shí),dna多態(tài)性就可應(yīng)用限制性內(nèi)切核酸酶進(jìn)行分析,這種多態(tài)性稱為限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(rflp)。22何為回文序列?答:回文序列(palindromic sequence

12、)是一段自我互補(bǔ)的序列,即同其互補(bǔ)鏈一樣的序列(兩者的閱讀方向都是從53,)。根據(jù)回文序列的結(jié)構(gòu)可分為:完全的回文序列、不完全的回文序列和間斷的回文序列。完全回文序列(如gaattc),通常是限制性內(nèi)切核酸酶的識(shí)別序列;不完全的回文序(tacctccat,cgtgata),常是其他蛋白質(zhì)的結(jié)合位點(diǎn)(如阻抑蛋白),在基因表達(dá)調(diào)控中有重要作用;間斷的回文序列(如ggttxxxaacc,有一段是顛倒的重復(fù)),它可使單鏈的核苷酸有可能在trna 中所見到的一樣,形成發(fā)夾環(huán)的結(jié)構(gòu)。23dna 連接酶的連接機(jī)理是什么?答:dna 連接酶是利用atp 或nad+煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(氧化型)提供的能量催化d

13、na 雙鏈間的缺口形成磷酸二酯鍵。在連接反應(yīng)中,首先atp (nad+)與dna 連接酶反應(yīng),同連接酶生成一種共價(jià)結(jié)合的酶-amp 復(fù)合物。其中amp(腺苷一磷酸)通過一種磷酸酰胺鍵同dna 連接酶的賴氨酸殘基的-氨基相連。同時(shí)釋放出焦磷酸或煙酰胺單核苷酸(nmn)。amp 激活dna 一條鏈的5-末端磷酸基團(tuán), 并轉(zhuǎn)移到磷酸基團(tuán)上,形成dna-腺苷一磷酸復(fù)合物。最后,3-oh 對(duì)激活的磷原子作親核攻擊,形成磷酸二酯鍵,同時(shí)釋放出amp。連接反應(yīng)是由在形成酶-腺苷酸復(fù)合體時(shí),焦磷酸水解和釋放提供的能量驅(qū)動(dòng)下進(jìn)行的。在以atp作為能源的連接酶中,一個(gè)磷酸二酯鍵的形成消耗掉兩個(gè)高能磷酸鍵。29列舉

14、質(zhì)粒載體必須具有的基本條件。答:(1)能獨(dú)立復(fù)制;(2)具有選擇標(biāo)記;(3)有獨(dú)特的酶切位點(diǎn);(4)能轉(zhuǎn)化但不擴(kuò)散。24dna 連接酶的作用特點(diǎn)有哪些? 連接反應(yīng)需要在一條dna 鏈的3末端具有一個(gè)游離的-oh, 而另一條dna 鏈的5 末端具有一個(gè)磷酸基團(tuán)(-p)的情況下,才能發(fā)揮其連接dna 分子的功能作用,而在末端帶有5-羥基和3-羥基;5-磷酸和3-二脫氧核苷基團(tuán)的兩個(gè)dna 片段之間不起連接作用。 連接反應(yīng)中需要 atp 或nad+ 和mg2+ 為輔助因子和激活因子; dna 連接酶不能夠連接兩條單鏈的dna 分子,被連接的dna 鏈必須是雙螺旋的一部分。 dna 連接酶只封閉雙螺旋

15、dna 骨架上的缺口 (nick),即在雙鏈dna 的某一條鏈上兩個(gè)相鄰核苷酸之間失去一個(gè)磷酸二酯鍵所出現(xiàn)的單鏈斷裂,而不能封閉雙鏈dna 的某一條鏈上失去一個(gè)或數(shù)個(gè)核苷酸所形成的裂口25影響dna 連接酶連接反應(yīng)的因素主要有哪些?答:1) 反應(yīng)溫度:最佳反應(yīng)溫度37,但黏性末端之間退火形成的氫鍵結(jié)合不穩(wěn)定,連接黏性末端的最佳溫度,一般認(rèn)為420比較合適。2) dna 片段末端:不僅要考慮反應(yīng)體系中dna 末端的總濃度,還要考慮載體與插入片段的末端濃度的比例。原則上應(yīng)保證一個(gè)dna 分子的末端有較高的幾率與另一 dna 分子連接,減少同一個(gè)分子兩個(gè)末端之間的自身連接。載體與插入片段 3:1 1

16、:3。3) 連接酶濃度:平末端dna 分子的連接反應(yīng),最適酶量大約是12 單位;而黏末端dna 片段間的連接,在同樣的條件下,僅為 單位時(shí),便能得到最佳連接效率。28切口平移法制備dna 探針的原理是什么?答:在mg 離子存在時(shí),用低濃度的dna 酶i(dnase i)處理雙鏈dna,使之隨機(jī)產(chǎn)生單鏈斷裂。然后用dna 聚合酶i 的 5' 3'外切酶活性可以從斷裂處的 5' 端除去一個(gè)核苷酸,而其聚合酶活性則將一個(gè)單核苷酸添加到斷裂處的 3' 端。隨著反應(yīng)的進(jìn)行,即5' 端核苷酸不斷去除,而 3' 端核苷酸同時(shí)摻入,導(dǎo)致斷裂形成的切口沿著dna

17、鏈按合成的方向移動(dòng),這種現(xiàn)象稱為切口平移。如果在反應(yīng)體系中加入放射性同位素標(biāo)記的核苷酸,則這些標(biāo)記的核苷酸將取代原來(lái)的核苷酸殘基,產(chǎn)生帶標(biāo)記的dna 分子,用作dna 分子雜交探針。27堿性磷酸酯酶主要有兩種,細(xì)菌堿性磷酸酯酶(bip)和小牛腸堿性磷酸酯酶(cip),二者有什么不同在基因工程中有什么用途答:主要差別是cip 在68時(shí)失活,而bap 在68穩(wěn)定,且耐酚抽提。應(yīng)用:dsdna 的5端脫磷酸,防止dna 的自身連接。但是用cip 處理后,最好將cip 除去,再進(jìn)行連接反應(yīng)。dna 和rna 脫磷酸,然后用于多核苷酸激酶進(jìn)行末端標(biāo)記。30舉例說(shuō)明什么是穿梭載體?答:穿梭載體是含有細(xì)菌質(zhì)

18、粒和克隆的真核生物dna 片段的雜種質(zhì)粒,有兩個(gè)復(fù)制起點(diǎn)和能在兩種不同細(xì)胞中進(jìn)行選擇的選擇標(biāo)記,所以,很容易從一宿主轉(zhuǎn)到另一個(gè)宿主 (來(lái)回穿梭)。38質(zhì)粒制備的基本原理?答:帶有質(zhì)粒的細(xì)菌細(xì)胞在sds 作用下裂解,并在堿性條件下使dna 變性。調(diào)節(jié)ph 值至中性時(shí),質(zhì)粒dna 首先復(fù)性,而細(xì)菌基因組dna 不能復(fù)性而與sds-蛋白質(zhì)形成復(fù)合體,可以被離心沉淀除去。上清液中的質(zhì)粒dna 分子可被酒精沉淀或其他方法沉淀純化出來(lái)。1226什么是klenow 酶有哪些活性在基因工程中有什么作用答:klenow 酶是1974 年klenow 用枯草桿菌蛋白酶水解dna 聚合酶i,得到的兩個(gè)片段。其中大片

19、段的分子質(zhì)量為75kda,它具有53聚合酶和3 5外切核酸酶的活性,小片段具有53外切核酸酶活性。由于大片段失去了dna 聚合酶i 中會(huì)降解5引物的53外切核酸酶活性,所以在基因工程中更有用。klenow 酶主要有下列用途:(1) 修復(fù)反應(yīng),制備平末端??捎胟lenow 酶修復(fù)限制性內(nèi)切核酸酶或其他方法產(chǎn)生的5或3突出端,制備平末端,這樣可以使原來(lái)具有不相容的黏性末端的dna 片段通過平末端重組。如在反應(yīng)系統(tǒng)中加入放射性同位素標(biāo)記的脫氧核苷酸,用這種末端填補(bǔ)的方法可以制備3端標(biāo)記的探針。用klenow 酶修復(fù)5突出端的反應(yīng)主要是利用了klenow 酶的dna 聚合酶活性,是填補(bǔ)反應(yīng);而修復(fù)3突

20、出端則是用klenow 酶的3 5外切核酸酶的活性,是切割反應(yīng)。用klenow 酶的切割反應(yīng)來(lái)修復(fù)3突出端是不理想的,改用t4 dna聚合酶或其他的酶是更好的選擇。(2) 標(biāo)記dna 3突出端 (protruding end)。該反應(yīng)分兩步進(jìn)行:先用3 5的外切核酸酶活性除去3突出端,產(chǎn)生3隱含末端,然后在高濃度的標(biāo)記底物 (32p-dntp) 存在下,使降解3 5) 作用與聚合 (53) 作用達(dá)到平衡。這種反應(yīng)也叫交換或取代反應(yīng) (exchangereplacement reaction)。不過這一反應(yīng)用t4 dna 聚合酶的效果更好,因它的3 5的外切核酸酶活性較強(qiáng)。(3)其他的一些用途。

21、包括用雙脫氧末端終止法進(jìn)行dna 序列分析、用于cdna 第二鏈的合成、在定點(diǎn)突變中用于合成第二鏈、用引物延伸法 (primer extension) 制備單鏈dna 探針等。31yac 載體具有什么樣的為什么在克隆大片段時(shí),yac 具有優(yōu)越性答:(1)功能性dna 序列:來(lái)自于酵母的125bp dna 片段的著絲點(diǎn)序列 (cen4)。來(lái)自酵母的自主復(fù)制序列 (ars1),起始在酵母中的dna 復(fù)制。來(lái)自酵母的端粒序列,它是 (5-tgtgggtgtggtg-3) 的多拷貝重復(fù),它對(duì)染色體的復(fù)制和維持是必需的。在酵母中進(jìn)行選擇的標(biāo)記基因,ura3(尿嘧啶生物合成基因)和trp1(色氨酸合成基因

22、)。寄主是這些基因的營(yíng)養(yǎng)缺陷性,只有帶有這些基因的轉(zhuǎn)化體才能在選擇培養(yǎng)基上生活具有細(xì)菌的復(fù)制起始點(diǎn)和選擇標(biāo)記基因。yac 載體通常含有cole1 的ori 和氨芐青霉素抗性標(biāo)記基因,可以在大腸桿菌中復(fù)制和繁殖,所以它也是一種穿梭載體。(2)優(yōu)越性:yac 能夠容納長(zhǎng)達(dá)上千kb 的外源dna,這是質(zhì)粒和黏粒辦不到的。大片段的插入更有可能包含完整的基因,在染色體步移中每次允許更大的步移距離,同時(shí)能夠減少完整基因組文庫(kù)所需的克隆數(shù)目。40為什么野生型的噬菌體dna 不宜作為基因工程載體?答:(1) 噬菌體dna 沒有容載能力,因?yàn)槭删w的頭部對(duì)dna 包裝的量是有限制的,不能大于基因組的105,所以

23、要將噬菌體改造成載體,必須削減本身的分子大?。?2) 野生型的dna 對(duì)于一些常用的酶都有多個(gè)識(shí)別和切割位點(diǎn),不便于克隆;(3) 沒有可供選擇的標(biāo)記;(4) 野生型的噬菌體具有感染性,因此不夠安全。33什么是yacyac 克隆載體常出現(xiàn)哪些問題答:yac 即酵母人工染色體(yeast artificial chromosome)的縮寫,是人工構(gòu)建的染色體樣大容量克隆載體,基本組成有著絲點(diǎn)、能在細(xì)菌和酵母中進(jìn)行復(fù)制的復(fù)制起始點(diǎn)和選擇標(biāo)記及端粒。最大dna 克隆片段可達(dá)到2000kb。問題有:(1) yac 有嵌合現(xiàn)象,一個(gè)yac 中克隆的dna 片段可能來(lái)自兩個(gè)或多個(gè)不同的染色體。在基因組文庫(kù)中

24、,嵌合體占克隆總數(shù)的1060。(2) yac 內(nèi)部有重組現(xiàn)象,插入的dna 較大,序列發(fā)生重排,導(dǎo)致和原來(lái)染色體的序列不一致,重組很難檢出。(3) yac 還有缺失現(xiàn)象,影響yac 文庫(kù)的代表性。(4) yac 結(jié)構(gòu)和酵母天然染色體結(jié)構(gòu)相似,使用常規(guī)方法不易將yac 和酵母天然染色體分開。(5) 構(gòu)建好的yac 轉(zhuǎn)化原生質(zhì)化的酵母菌,轉(zhuǎn)化效率低。(6) 建好庫(kù)后保存方便,但要篩選某個(gè)基因時(shí)工作量大32由于基因工程是人為改變遺傳信息的操作,因此必須注意被操作基因的安全。進(jìn)行嚴(yán)格地監(jiān)控對(duì)質(zhì)粒載體的安全是十分重要的。請(qǐng)問質(zhì)粒載體的安全條件包括哪幾個(gè)方面?答:(1) 非傳遞性和不被帶動(dòng)轉(zhuǎn)移。對(duì)于多數(shù)基

25、因克隆操作來(lái)說(shuō),都不希望載體能夠進(jìn)行自主傳遞,也不希望被帶動(dòng)轉(zhuǎn)移。(2) 具有條件致死突變,如溫度敏感質(zhì)粒pjc307 (cole1 的衍生質(zhì)粒) 在哺乳動(dòng)物正常體溫下就喪失復(fù)制能力,可防止克隆基因擴(kuò)散,只存在于限定的宿主細(xì)胞中。(3) 一般情況下不希望與宿主染色體發(fā)生重組,因?yàn)橹亟M后有可能給宿主帶來(lái)突變。(4) 有較小的宿主范圍。34什么是 bacbac 載體的組成與優(yōu)缺點(diǎn)有哪些 細(xì)菌人工染色體(bac)是從大腸桿菌f 因子改造構(gòu)建而來(lái)的,能夠攜帶大約300kb 的dna 插入片段。 載體具有 f 因子的復(fù)制起始點(diǎn)(oris),可使載體維持每個(gè)細(xì)胞一個(gè)拷貝的水平。 載體包括有 4 個(gè)維持dn

26、a 復(fù)制和拷貝數(shù)目的基因,repe, para, parb and parc。 具有一個(gè)抗生素選擇標(biāo)記基因,和 lacz基因。在lacz基因中組裝有一多克隆位點(diǎn),便于外源片段的插入和藍(lán)白反應(yīng)篩選克隆子。 插入的 dna 片段非常穩(wěn)定,可以在大腸桿菌細(xì)胞中維持?jǐn)?shù)百代,而且不易發(fā)生重組和從寄主細(xì)胞中丟失。 主要缺點(diǎn)是每個(gè)細(xì)胞中的拷貝數(shù)少(12 個(gè)),使得分離和篩選較為困難。35利用pbr322 質(zhì)粒插入失活分離帶有外源dna 片段的重組克隆的原理是什么? 外源 dna 片段插入在pbr322 質(zhì)粒tetr 基因的編碼序列內(nèi)(bamhi)位點(diǎn),使該基因失活; 體外重組反應(yīng)混合物轉(zhuǎn)化大腸桿菌 amps

27、tets 菌株,并涂布在amp 瓊脂平板上,凡獲得了pbr322質(zhì)粒和重組質(zhì)粒(amprtets)的寄主細(xì)胞都可長(zhǎng)成菌落; 將 amp 瓊脂上的菌落原位影印在tet 瓊脂平板上生長(zhǎng),對(duì)比這兩個(gè)平板的菌落生長(zhǎng)情況,凡在amp平板上能夠生長(zhǎng)而在tet 平板上不能生長(zhǎng)的菌落,便是屬于帶有重組體質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化子克??;挑出這樣的陽(yáng)性克隆,擴(kuò)增分離帶有外源dna 插入片段的重組體質(zhì)粒。46分離dna 時(shí),為什么要在緩沖液中加入一定濃度的edta 和蔗糖?答: edta 是螯合劑,可同mg2+螯合,使核酸酶失去了作用的輔助因子,而被抑制活性。 蔗糖增加緩沖液的黏度,保護(hù)dna 不易斷裂。36puc 質(zhì)粒利用-互

28、補(bǔ)作用篩選重組子原理是什么?答:puc 系列質(zhì)粒載體是在pbr322 質(zhì)粒載體基礎(chǔ)上改造來(lái)的,它用lacz 基因取代了pbr322質(zhì)粒載體上的tetr 基因。lacz 基因編碼-半乳糖苷酶的n 末端1-63 個(gè)氨基酸(-肽鏈)的dna 片段, 在lacz 基因內(nèi)組入了一個(gè)多克隆位點(diǎn)(mcs),但不影響lacz基因的功能。 puc 載體的宿主(e. coli)攜帶一個(gè)編碼-半乳糖苷酶c 端序列的基因片段, 它們本身用這個(gè)基因片段產(chǎn)生的-半乳糖苷酶片段是無(wú)活性的, 但它們可以通過-互補(bǔ)作用在體內(nèi)相互彌補(bǔ), 即兩部分產(chǎn)物可以結(jié)合形成有活性的-半乳糖苷酶。當(dāng)puc 質(zhì)粒引入大腸桿菌中,在含有指示劑x-

29、gal 和 iptg 的誘導(dǎo)培養(yǎng)基上培養(yǎng)時(shí),菌落成藍(lán)色。如果在mcs 插入外源dna 片段(基因),破壞了lacz 基因的功能(插入失活),不再產(chǎn)生-肽鏈,不能和宿主細(xì)胞產(chǎn)生的多肽片段形成有活性的-半乳糖苷酶,形成的菌落是無(wú)(白)色的。因此,根據(jù)這種-半乳糖苷酶的顯色反應(yīng),便可以檢測(cè)出含有外源dna 插入序列的重組體克隆。37自然界中具備理想條件的質(zhì)粒載體為數(shù)不多,即使是cole1 和pscl01 這兩個(gè)自然質(zhì)粒也不盡如人意,通常需要進(jìn)行改造。請(qǐng)問質(zhì)粒改造包括哪些基本內(nèi)容答:基本內(nèi)容包括:(1) 刪除一些非必要的區(qū)段及對(duì)宿主有不良影響的區(qū)段;削減載體的分子質(zhì)量,使載體具有更大的容納外源片段的能

30、力。(2) 加上易于選擇或檢測(cè)的標(biāo)記。(3) 限制性內(nèi)切核酸酶的酶切位點(diǎn)的改造,便于外源基因插入到載體中的特定位置。(4) 加上一些調(diào)控元件,有利于克隆基因的表達(dá)。(5) 安全性改造,限定載體的宿主范圍。42噬菌體載體具有哪些優(yōu)點(diǎn)與不足?答:優(yōu)點(diǎn):(1) 基因組中有13 的非必需區(qū)可以被置換。改造成載體后,克隆的片段較大(可 達(dá)20kb),而質(zhì)粒載體的克隆片段只有幾個(gè)kb;(2) 用噬菌體dna 作為載體,即使不進(jìn)行體外包裝,轉(zhuǎn)染的頻率也比質(zhì)粒轉(zhuǎn)化的效率高,包裝后的效率就更高了;(3) 可通過溶原化反應(yīng)整合到寄主染色體上,當(dāng)不需要外源基因大量表達(dá)時(shí),可讓 它以溶原性存在,若要表達(dá),可通過誘導(dǎo)即

31、可進(jìn)入裂解途徑,釋放出大量的噬菌體,得到的重組dna 的拷貝數(shù)就會(huì)很多。缺點(diǎn):(1) 包裝比較麻煩,包裝率不穩(wěn)定,購(gòu)買包裝蛋白的費(fèi)用高;(2) 沒有質(zhì)粒的用途廣泛。43以置換型噬菌體作為載體進(jìn)行克隆時(shí),為什么說(shuō)能夠形成噬菌斑的就一定是重組體?答:改造的置換型噬菌體載體,重組入外源片段之后,總體積不能超過入基因組的105,不能小于又基因組的75。以置換型噬菌體dna 作為載體,首先要分離左、右兩臂同外源dna 重組。如果沒有外源片段,僅是兩臂連接,長(zhǎng)度短于久基因組的75,不能被包噬菌體顆粒,就不能感染寄主,也就不能形成噬菌斑。如果插入了外源片段后,總長(zhǎng)度超過基因組105后,也不能包入噬菌體顆粒,

32、自然也不能形成噬菌斑。44m13 系列載體具有哪些優(yōu)缺點(diǎn)?答:m13 克隆系統(tǒng)具有很多優(yōu)點(diǎn):(1) 克隆的片段大:m13 噬菌體的dna 在包裝時(shí)不受體積的限制,所以容載能力大。有報(bào)道,有些噬菌體顆??梢园b比野生型絲狀噬菌體dna 長(zhǎng)67 倍的 dna(插入片段可達(dá)40kb)。(2)可直接產(chǎn)生單鏈dna,這對(duì)于dna 測(cè)序、dna 誘變、制備特異的單鏈dna 探針都是十分有用的。(3) 單鏈dna 和雙鏈dna 都可以轉(zhuǎn)染宿主,并可根據(jù)人工加上的選擇標(biāo)記進(jìn)行篩選。m13 克隆系列的不足:(1) 較大的外源片段插入后,在擴(kuò)增過程中往往不夠穩(wěn)定。一般說(shuō),克隆的片段越大,發(fā)生丟失的概率越大。(2)

33、 單鏈載體分子感染的細(xì)胞中,往往是單鏈和雙鏈混雜,分離雙鏈比較麻煩。45黏粒載體具有哪些特點(diǎn)與不足?答:主要特點(diǎn)有: 柯斯質(zhì)粒是含有噬菌體 cos 位點(diǎn)的質(zhì)粒載體??滤官|(zhì)粒具有質(zhì)粒的復(fù)制子,進(jìn)入寄主細(xì)胞后能夠像質(zhì)粒一樣進(jìn)行復(fù)制,并且能夠被氯霉素?cái)U(kuò)增。 具有質(zhì)粒載體的抗生素抗性基因的選擇標(biāo)記和克隆位點(diǎn)。 插入片段的消化、連接及后來(lái)重組克隆的純化與質(zhì)粒載體相同。 具有噬菌體的包裝和轉(zhuǎn)導(dǎo)特性。與質(zhì)粒載體轉(zhuǎn)化細(xì)菌細(xì)胞不同,重組體像 載體一樣,需體外包裝后轉(zhuǎn)染細(xì)菌。 包裝后形成的 顆粒用來(lái)感染大腸桿菌,重組dna 像 dna 一樣注入細(xì)菌細(xì)胞,并以cos位點(diǎn)環(huán)化。由于缺乏 的其他dna 序列,環(huán)化dna

34、 在細(xì)菌體內(nèi)以質(zhì)粒一樣維持。 簡(jiǎn)化了篩選。載體體積小,承載外源 dna 片段大。如果載體的分子質(zhì)量在5kb 的話,得到的轉(zhuǎn)導(dǎo)子幾乎排除由載體自連的可能性,因?yàn)橐怀晒Πb,至少要7 個(gè)分子的載體自連。盡管如此,也是不能被包裝的,因?yàn)閏os 位點(diǎn)太多了。重組體只有達(dá)到32-45kb 才能有效包裝體外包裝,這就提供了對(duì)重組體的正向選擇。 對(duì)轉(zhuǎn)化體的選擇是基于載體上的抗生素標(biāo)記。 感染后形成菌落,而不是噬菌斑。黏粒載體也有如下不足: 如果兩個(gè)黏粒之間有同源序列,可能會(huì)發(fā)生重組,結(jié)果會(huì)使被克隆的片段重排或丟失。 含不同重組 dna 片段的菌落生長(zhǎng)速度不同,會(huì)造成同一個(gè)平板上菌落大小不一。另外由于不同大

35、小的插入片段對(duì)宿主細(xì)胞的作用不同,會(huì)造成文庫(kù)擴(kuò)增量的比例失調(diào)。 包裝過程復(fù)雜,包裝效率不穩(wěn)定,代價(jià)高。47分離dna 用酚抽提蛋白質(zhì)時(shí),離心后,為什么蛋白質(zhì)總是停留在水相和酚相之間?答:酚使蛋白質(zhì)分子間脫水而變性,變性蛋白的密度比水大,但比酚小,因此停留在中間層。39噬菌體dna 被包裝到噬菌體的頭部需要哪些基本條件為什么答:兩個(gè)cos 位點(diǎn);線性dna;分子大小在噬菌體基因組的75%105%。48為什么從細(xì)胞中分離dna 時(shí)往往會(huì)斷裂?答:(1) 胞內(nèi)存在很高的核酸酶活性,dna 裸露后,很容易遭到核酸酶的降解。(2) 在分離dna 的過程中,要用到一些酸堿等化學(xué)試劑,也會(huì)使dna 斷裂。(

36、3) 在dna 的分離過程中要經(jīng)過多次離心、吸取、轉(zhuǎn)移等,產(chǎn)生的機(jī)械張力剪切會(huì)使dna 斷裂。49在dna 分離過程中,酚通常與氯仿聯(lián)合使用,即使不聯(lián)合使用也要在苯酚抽提后用氯仿再抽提一次,為什么?答:原因是酚和水有一定程度的互溶,所以單獨(dú)使用酚抽提dna,最終不能除去酚,殘留的酚會(huì)使起切割和連接作用的限制性內(nèi)切核酸酶和連接酶變性。氯仿也是蛋白質(zhì)變性劑,它不與水互溶,但是能夠同苯酚互溶。這樣,酚和氯仿聯(lián)合使用,就可以帶走殘留的酚。50何謂簡(jiǎn)并引物 (degenerate primer)答:所謂簡(jiǎn)并引物是指根據(jù)肽鏈的氨基酸序列(或部分序列),并充分考慮密碼子的簡(jiǎn)并性而設(shè)計(jì)的、用于pcr 擴(kuò)增的混

37、合引物群體,這種混合引物之間具有不同的堿基組成,但堿基的數(shù)量是相同的。由于充分考慮了密碼的簡(jiǎn)并性,在這種混合引物中必定有一種引物是可以和該基因的dna 序列精確互補(bǔ)。51簡(jiǎn)并引物設(shè)計(jì)的一般原則是什么答:(1) 選擇保守區(qū)設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物。(2) 選擇簡(jiǎn)并性低的氨基酸密碼區(qū)設(shè)計(jì)引物。(3) 注意密碼的偏愛性。(4) 使用盡可能短的引物,以降低簡(jiǎn)并性,最短可用1520 個(gè)堿基。(5) 由于taq dna 聚合酶在pcr 擴(kuò)增時(shí)容易摻入錯(cuò)誤堿基,所以設(shè)計(jì)的引物,其3端盡量使用具有簡(jiǎn)并密碼的氨基酸。52如何用pcr 制備突變dna 分子?答:可用pcr 進(jìn)行定點(diǎn)突變 (site directed muta

38、genesis),即在特定位點(diǎn)引入點(diǎn)突變。該突變可以是堿基替代、插入或者缺失。為了在靶基因特定位點(diǎn)導(dǎo)入突變,在pcr 引物設(shè)計(jì)時(shí),將一條引物設(shè)計(jì)成與靶序列互補(bǔ)但在預(yù)期位點(diǎn)作堿基替換或缺失。在引物中的誘發(fā)突變序列應(yīng)該位于引物的5端或在引物中間部位,但絕不能位于3端。誘變引物的3區(qū)域(至少610 個(gè)堿基)必須與靶dna 完全互補(bǔ)以使引物與模板的退火完全而且taq 酶能延伸引物。pcr 反應(yīng)先在低特異性環(huán)境下反應(yīng)510 個(gè)循環(huán)以使錯(cuò)配得以發(fā)生(即在松弛的溫度下),一旦少量的突變模板產(chǎn)生,就可以作為靶序列與引物完全互補(bǔ)。擴(kuò)增反應(yīng)的終產(chǎn)物即是所需的含有突變的擴(kuò)增dna 分子,然后通過克隆和序列分析進(jìn)行確

39、證。53 用pcr 技術(shù)擴(kuò)增目的dna 片段時(shí),需要一對(duì)特意合成的引物來(lái)限定目的片段的擴(kuò)增區(qū)域,試說(shuō)明引物序列合成應(yīng)遵循什么樣原則。答:1)引物長(zhǎng)度一般為1530 個(gè)核苷酸。2)引物的堿基盡可能隨機(jī), g+c 含量一般占4555。tm4(g+c)+ 2(a+t)3)引物自身不應(yīng)存在互補(bǔ)序列以避免折疊成發(fā)夾結(jié)構(gòu)。4)兩個(gè)引物之間不應(yīng)存在互補(bǔ)序列,尤其應(yīng)避免3端的互補(bǔ)重疊。5)引物與非特異擴(kuò)增區(qū)的序列的同源性不超過70,引物3末端連續(xù)8 個(gè)堿基在待擴(kuò)增區(qū)以外不能有完全互補(bǔ)序列,否則易導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增。6)引物3端堿基是引發(fā)延伸的起點(diǎn),因此一定要與模板dna 配對(duì)。7)引物與模板結(jié)合時(shí),引物的5端最

40、多可以游離十幾個(gè)堿基而不影響pcr 反應(yīng)的進(jìn)行。8)引物的5端可以修飾,如附加限制酶位點(diǎn),引入突變位點(diǎn)等。56怎樣將一個(gè)平末端的dna 片段插入到ecor i 的限制位點(diǎn)中去?答:可以化學(xué)合成一個(gè)連接子(linker),即一段長(zhǎng)為lobp 含有ecor i 識(shí)別位點(diǎn)的短的dna 片段,然后與待克隆片段兩端連接起來(lái),如果用ecor i 切割這種連接片段,就會(huì)產(chǎn)生ecor i 的單鏈末端。這種片段就可以插入到任何ecor i 的限制性核酸內(nèi)切酶位55taqman 定量 pcr 擴(kuò)增的原理是什么?答:taqman 定量 pcr 使用3 個(gè)引物,或兩個(gè)引物和一個(gè)特異性探針。兩個(gè)引物接合到目的dna上下

41、游,以進(jìn)行目的dna 的合成。第三個(gè)引物,或稱探針,是特異合成的一段短的dna 片段,可特異性第接合到一條dna 鏈中間。探針帶有兩個(gè)修飾基團(tuán),5端熒光報(bào)告基團(tuán)(r)和3端的熒光淬滅基團(tuán)(q),這兩個(gè)基團(tuán)由于距離靠近會(huì)發(fā)生熒光淬滅而檢測(cè)不到熒光。隨著pcr 的進(jìn)行, taqman探針接合到目的dna 序列上,并且被具有外切酶活性的taq dna 酶逐個(gè)切除而降解。被切下來(lái)的熒光基團(tuán)(r)解除了熒光淬滅的束縛,會(huì)在激發(fā)光下發(fā)出熒光,因此所產(chǎn)生的熒光強(qiáng)度直接反應(yīng)了擴(kuò)增靶dna 的總量。54pcr 技術(shù)體外擴(kuò)增dna 分子的基本原理是什么?答:pcr 是在試管中進(jìn)行的dna 復(fù)制反應(yīng),基本原理是依據(jù)

42、細(xì)胞內(nèi)dna 半保留復(fù)制的機(jī)理,以及體外dna 分子于不同溫度下雙鏈和單鏈可以互相轉(zhuǎn)變的性質(zhì),人為地控制體外合成系統(tǒng)的溫度,以促使雙鏈dna 變成單鏈,單鏈dna 與人工合成的引物退火,然后耐熱dna 聚合酶以dntp 為原料使引物沿著單鏈模板延伸為雙鏈dna。pcr 全過程每一步的轉(zhuǎn)換是通過溫度的改變來(lái)控制的。需要重復(fù)進(jìn)行dna 模板解鏈、引物與模板dna 結(jié)合、dna 聚合酶催化新生dna 的合成,即高溫變性、低溫退火、中溫延伸個(gè)步驟構(gòu)成pcr 反應(yīng)的一個(gè)循環(huán),此循環(huán)的反復(fù)進(jìn)行,就可使目的dna 得以迅速擴(kuò)增。dna 模板變性:模板雙鏈dna®單鏈dna,94。退火:引物單鏈dn

43、a®雜交鏈,引物的tm 值。引物的延伸:溫度至70 左右, taq dna 聚合酶以種dntp 為原料,以目的dna 為模板,催化以引物末端為起點(diǎn)的53dna 鏈延伸反應(yīng),形成新生dna 鏈。新合成的引物延伸鏈經(jīng)過變性后又可作為下一輪循環(huán)反應(yīng)的模板pcr,就是如此反復(fù)循環(huán),使目的dna 得到高效快速擴(kuò)增。57構(gòu)建基因組文庫(kù)時(shí)為什么要對(duì)基因組dna 進(jìn)行部分酶切(列舉至少兩條理由)答:部分酶切可獲得長(zhǎng)度適宜的片段(如獲得中等長(zhǎng)度的酶切片段);部分酶切可保證切出的dna 片段內(nèi)部依然保留了部分限制酶位點(diǎn),便于后續(xù)的克隆分析。58什么是基因組文庫(kù)(genomic library)它同遺傳學(xué)

44、上的基因庫(kù)有什么不同答:基因組文庫(kù)是用基因工程的方法,人工構(gòu)建的含有某一生物基因組dna 的各種片段的克隆群。包括下列過程:高分子質(zhì)量染色體dna 的制備;體外重組連接;將重組dna 導(dǎo)入寄主細(xì)胞并擴(kuò)增;篩選。基因組文庫(kù)同遺傳學(xué)上所講的基因庫(kù)是完全不同的概念。基因庫(kù)(gene poo1)是指在進(jìn)行有性生殖的某一群體中,能進(jìn)行生殖的個(gè)體所含總的遺傳信息。在基因組文庫(kù)的構(gòu)建中,由于使用的載體不同,分為噬菌體載體和黏粒載體構(gòu)建的基因組文庫(kù)、yac 文庫(kù)、bac 文庫(kù)等。61如何使用甲基化酶對(duì)克隆dna 進(jìn)行保護(hù)有什么意義答:在構(gòu)建基因文庫(kù)時(shí),可用與接頭中限制性內(nèi)切核酸酶相應(yīng)的甲基化酶對(duì)克隆dna 先

45、進(jìn)行甲基化修飾,將插入片段上該酶可能的識(shí)別序列先行保護(hù)起來(lái)。意義:用這種方法,不僅保護(hù)了插入片段的大小不會(huì)改變,又有利于插入片段的回收,因?yàn)椴迦肫沃刑囟ㄏ拗菩詢?nèi)切核酸酶的識(shí)別位點(diǎn)被保護(hù)起來(lái),重組后可以用特定的限制性內(nèi)切核酸酶將插入片段回收。59什么是cdna 文庫(kù)同基因組文庫(kù)有何差別答:同mrna 互補(bǔ)的dna 稱為cdna。cdna 文庫(kù)是以某一生物的總mrna 為模板,在無(wú)細(xì)胞系統(tǒng)中,在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,首先合成一互補(bǔ)的dna,即第一鏈,破壞rna 模板后,再以第一鏈為模板合成第二鏈,得到的雙鏈dna 稱為cdna。選用適合的載體,將合成的cdna 重組導(dǎo)入寄主細(xì)胞,經(jīng)篩選得到的cdna

46、 克隆群稱為cdna 文庫(kù)。由于cdna 技術(shù)合成的是不含內(nèi)含子的功能基因,因此是克隆真核生物基因的一種通用方法。由于細(xì)胞內(nèi)的基因在表達(dá)的時(shí)間上并非是統(tǒng)一的,具有發(fā)育的階段性和時(shí)間性,有些則需要特殊的環(huán)境條件。所以,cdna 文庫(kù)是不可能構(gòu)建得十分完全的,也就是說(shuō),任何一個(gè)cdna 文庫(kù)都不可能包含某一生物的全部編碼基因。cdna 文庫(kù)與基因組文庫(kù)的主要差別是:(1) 基因組文庫(kù)克隆的是任何基因,包括未知功能的dna 序列;cdna 文庫(kù)克隆的是具有蛋白質(zhì)產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)基因,包括調(diào)節(jié)基因。(2) 基因組文庫(kù)克隆的是全部遺傳信息,不受時(shí)空影響;cdna 文庫(kù)克隆的是不完全 的編碼dna 序列,因它受

47、發(fā)育和調(diào)控因子的影響。(3) 基因組文庫(kù)中的編碼基因是真實(shí)基因,含有內(nèi)含子和外顯子;而cdna 克隆的是不含內(nèi)含子的基因。62何為稀有酶(舉例說(shuō)明)答:所謂稀有酶是指那些識(shí)別序列在基因組dna 中不常見的酶,因此它們的切割頻率較低。如not i 就是最常用的稀有酶,它的識(shí)別序列為gcggccgc。另外有些酶的識(shí)別序列雖然不長(zhǎng),但它的識(shí)別序列很特別,在基因組出現(xiàn)的頻率較低。如nru i (tcgcga)和bssh ii (gcgcgc),它們的靶序列在哺乳動(dòng)物基因組中出現(xiàn)的頻率極低。60什么是同聚物加尾連接法 (homopolymer tails joining) 用何種方法加尾具有哪些優(yōu)缺點(diǎn)答

48、:所謂同聚物加尾法就是利用末端轉(zhuǎn)移酶在載體及外源雙鏈dna 的3端各加上一段寡聚核苷酸,制成人工黏性末端,外源dna 和載體dna 分子要分別加上不同的寡聚核苷酸,如da(dg)和dt(dc),然后在dna 連接酶的作用下,連接成為重組的dna。這種方法的核心是利用末端轉(zhuǎn)移酶的功能,將核苷酸轉(zhuǎn)移到雙鏈dna 分子的突出或隱蔽的3'-oh上。以mg2+作為輔助因子,該酶可以在突出的3'-oh 端逐個(gè)添加單核苷酸,如果用co2+作輔助因子,則可在隱蔽的或平末端的3'-oh 端逐個(gè)添加單個(gè)核苷酸。同聚物加尾法實(shí)際上是一種人工黏性末端連接法,具有很多優(yōu)點(diǎn):首先不易自身環(huán)化,這是

49、因?yàn)橥环Ndna 兩端添加的序列是相同的,所以不存在自身環(huán)化;因?yàn)檩d體和外源片段的末端是互補(bǔ)的黏性末端,所以連接效率較高;用任何一種方法制備的dna 都可以用這種方法進(jìn)行連接。同聚物加尾法也有一些不便之處:方法繁瑣;外源片段難以回收。由于添加了許多同聚物的序列,可能會(huì)影響外源基因的表達(dá)。另外要注意的是,同聚物加尾法同平末端連接法一樣,重組連接后往往會(huì)產(chǎn)生某種限制性內(nèi)切核酸酶的切點(diǎn)。 ,68插入失活法和插入表達(dá)法篩選重組體的主要差別是什么?答:主要差別是:(1) 插入失活法是直接根據(jù)失活基因的表型變化來(lái)篩選重組體。(2) 插入表達(dá)法是根據(jù)一個(gè)基因的失活引起另一個(gè)基因的表達(dá)表型來(lái)選擇。66構(gòu)建表達(dá)

50、載體應(yīng)注意些什么?答:(1) 構(gòu)建表達(dá)載體的關(guān)鍵是用于表達(dá)克隆序列的啟動(dòng)子類型,如果目的是基因的高效表達(dá),就要選用強(qiáng)的啟動(dòng)子;如果表達(dá)產(chǎn)物對(duì)寄主細(xì)胞有毒性,可選擇弱的啟動(dòng)子,最好使用可誘導(dǎo)型啟動(dòng)子,使在一定的條件下表達(dá)。(2)表達(dá)載體還應(yīng)具有以下組成元件: 攜帶能在寄主細(xì)胞中維持的復(fù)制的起始點(diǎn)。 具有抗生素選擇標(biāo)記或其他選擇機(jī)制。 在緊接啟動(dòng)子的下游安排限制性位點(diǎn),用于插入需表達(dá)的基因。 具有單一的酶切位點(diǎn)來(lái)克隆基因,克隆位點(diǎn)應(yīng)位于準(zhǔn)確的位置,以使克隆基因有效表達(dá)。67你在做southern 印跡分析,并且剛完成了凝膠電泳這一步。根據(jù)方案,下面一個(gè)步驟是用naoh 溶液浸泡凝膠,使dna 變性

51、為單鏈。為了節(jié)省時(shí)間,你略過了這一步,直接將dna 從凝膠轉(zhuǎn)至硝酸纖維素膜上。然后用標(biāo)記探針雜交,最后發(fā)現(xiàn)放射自顯影片是空白。錯(cuò)在哪里?提示:轉(zhuǎn)移到膜上的dna 未變性成單鏈dna,不能與單鏈的探針雜交。如果你的雜交探針是雙鏈的,可能因?yàn)樵诩尤腚s交混合物之前忘記將探針變性而得到空白的放射自顯影結(jié)果。69一個(gè)攜帶有氨芐和卡那霉素抗性基因的質(zhì)粒被僅在卡那霉素基因中有識(shí)別位點(diǎn)的ecor i 消化。消化物與酵母dna連接后轉(zhuǎn)化對(duì)兩種抗生素都敏感的e. coli 菌株。(1) 利用哪一種抗生素抗性選擇接受了質(zhì)粒的細(xì)胞?(2) 怎樣區(qū)分接受了插入酵母dna 的質(zhì)粒的克?。刻崾荆?1) 選擇ampr 的轉(zhuǎn)化

52、子;(2) 所需的克隆是ampr 和kans。任何能夠抗這兩種藥物的克隆都是自連的非重組質(zhì)粒。70用ecor i 和hind iii 分別切割同一來(lái)源的染色體dna,并進(jìn)行克隆。在前者的克隆中篩選到a 基因,但在后者的克隆中未篩選到a 基因,請(qǐng)說(shuō)明原因。提示:因?yàn)閔indh i 的切點(diǎn)位于a 基因內(nèi)。71什么是western 印跡 它與southern 印跡有什么不同提示:western 印跡是將蛋白質(zhì)經(jīng)電泳分離后從凝膠中轉(zhuǎn)移到固相支持物上,然后用特異性的抗體進(jìn)行檢測(cè)。它與southern 印跡的不同在于探針的性質(zhì)不同,在western 印跡中使用的探針是抗體(蛋白質(zhì)),而southern 印

53、跡中使用的探針是dna。72用一限制性內(nèi)切核酸酶切割lac+ tetr 的質(zhì)粒載體,已知該酶識(shí)別的是4 個(gè)堿基序列,并產(chǎn)生有兩個(gè)堿基突出的單鏈末端,該酶在lac 基因內(nèi)有切割位點(diǎn),并在第二個(gè)氨基酸密碼子內(nèi),該位點(diǎn)可以被任何氨基酸所取代而不影響酶活性。用該酶切割后,用dna 聚合酶將單鏈末端補(bǔ)齊為雙鏈的平末端,然后重新連接成環(huán),轉(zhuǎn)化lac- tet- 受體菌,篩選tetr 轉(zhuǎn)化子,問:lac 的基因型是什么?并說(shuō)明原因。提示:基因型是lac,原因是在該密碼子中插入了兩個(gè)堿基,造成了移碼突變,所以lac 的基因是缺陷的。嚴(yán)謹(jǐn)雜交實(shí)驗(yàn)是如何控制的?答:雜交反應(yīng)的嚴(yán)謹(jǐn)程度由下面兩個(gè)因素所決定:溫度和鹽

54、濃度。強(qiáng)的堿基對(duì)能耐受高的溫度,而高的鹽濃度使弱的堿基對(duì)間的配對(duì)變得穩(wěn)定。因此,高度嚴(yán)謹(jǐn)?shù)碾s交在高溫和低鹽濃度下進(jìn)行,而低嚴(yán)謹(jǐn)型雜交在低溫和高鹽濃度下進(jìn)行。73rna 與基因組dna 復(fù)性已被廣泛用于檢測(cè)不同類dna 的轉(zhuǎn)錄。dna 驅(qū)動(dòng)的復(fù)性實(shí)驗(yàn)與rna 驅(qū)動(dòng)的復(fù)性實(shí)驗(yàn)有何不同?答:在過量dna 雜交(dna 驅(qū)動(dòng)雜交)實(shí)驗(yàn)中,基因組dna 的復(fù)性過程中加入少量的放射性標(biāo)記rna。因?yàn)閐na 的量大大超過rna,所以全部rna 能夠與dna 雜交。同樣道理,rna 驅(qū)動(dòng)的雜交反應(yīng)中rna 過量而dna 的量受到限制,所以所有的互補(bǔ)dna 鏈都能與rna 雜交。74在基因工程中,為了在細(xì)菌細(xì)胞

55、中表達(dá)真核生物的基因產(chǎn)物,為什么通常要用cdna 而不用基因組dna 為什么要在cdna 前加上細(xì)菌的啟動(dòng)子答:這是因?yàn)榧?xì)菌沒有內(nèi)含子剪接系統(tǒng),并且不能識(shí)別真核生物的啟動(dòng)子的原因。75如何根據(jù)下面的應(yīng)用設(shè)計(jì)探針(1) 假定你分離純化了一未知功能的蛋白質(zhì),需要確定是何種組織和細(xì)胞表達(dá)這種蛋白質(zhì)。(2) 假定你獲得了綿羊的胰島素mrna,如何進(jìn)一步從人的cdna 文庫(kù)中獲得含人胰島素的克隆并使之在e. coli 中表達(dá)?提示:(1) 首先對(duì)該蛋白質(zhì)進(jìn)行部分測(cè)序,然后根據(jù)測(cè)得的氨基酸序列設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物。(2) 以該mrna 為模板反轉(zhuǎn)錄,得到cdna,即可進(jìn)行標(biāo)記用作探針。76什么是遺傳學(xué)選擇法?答:

56、所謂遺傳學(xué)選擇法(genetic selection)主要是根據(jù)受體細(xì)胞接受了重組dna 分子后所發(fā)生的遺傳表型的變化直接選擇重組體的方法。遺傳表型的變化包括抗藥性、缺陷基因的功能互補(bǔ)表型及噬菌斑的變化等。選擇的方法主要是根據(jù)平板上可見的表型變化,用于選擇的平板包括普通抗生素平板、插入失活抗生素平板、插入表達(dá)抗生素平板、顯色平板等,由于這些方法都是直接從平板上篩選,所以又稱為平板篩選法。77單鏈rna 作為探針,具有哪些單鏈dna 探針?biāo)鶝]有的優(yōu)點(diǎn)?答:?jiǎn)捂渞na 探針的下列優(yōu)點(diǎn)是單鏈dna 探針?biāo)鶝]有的:(1) rnarna 和rnadna 比dnadna 雜交體具有更高的穩(wěn)定性。因此,雜交

57、可以在更嚴(yán)格的各件下講行雜交后的信號(hào)也比較強(qiáng)。(2) 單鏈rna 由于不存在互補(bǔ)雙鏈的競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合,所以雜交效率比較高。3) rna 中不存在重復(fù)序列,所以特異性比較高。(4) 雜交后可用rnase 消化掉未雜交的rna,因此降低了本底。78良好的固相支持物 (如硝酸纖維素濾膜、尼龍膜) 必須具備哪些優(yōu)良特性?答:(1) 同核酸分子具有較強(qiáng)的結(jié)合能力,一般要求每平方厘米結(jié)合核酸分子的量在10g 以上。(2) 與核酸分子結(jié)合后,不影響其同探針分子雜交的反應(yīng)。(3) 與核酸分子的結(jié)合牢固,能經(jīng)受得住雜交、洗滌等過程而極少脫落。(4) 非特異性吸附少,在洗膜條件下,能將非特異性吸附在其表面的探針分子洗脫。(5) 具有良好的機(jī)械性能,不宜破碎。16 簡(jiǎn)述以黏粒為載體構(gòu)建基因文庫(kù)的原理。(1)cos位點(diǎn)可以自身環(huán)化(2)可以利用cos位點(diǎn)包裝l噬菌體顆粒;(3)可以感染寄主細(xì)胞;(4)利用質(zhì)粒復(fù)制子復(fù)制,不整合、不裂解。79以硝酸纖維素濾膜 (nitrocellulose filter membrane) 作為雜交的固相支持物具有哪些優(yōu)、缺點(diǎn)?答:優(yōu)點(diǎn):(1) 硝酸纖維素濾膜具有較強(qiáng)的吸附單鏈dna 和rna 的能力,特別在高鹽溶液中,結(jié)合能力達(dá)到80100gcm2。(2) 雜交信號(hào)本底較低。由于硝酸纖維素濾膜非特異性吸附蛋白質(zhì)的能力較弱,因此特別適合于那些涉及蛋白質(zhì)

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