NCBI序列提交方法

1、NCBI序列提交方法NCBI提交序列有兩大類(lèi)方式，一個(gè)是批量提交一個(gè)是單個(gè)序列提交。下面說(shuō)的就是單個(gè)序列提交方式，這是最新的提交方式，由于NCBI更新很快，也許過(guò)段時(shí)間又不一樣了，主要是按鈕位置可能會(huì)變。首先要注冊(cè)一個(gè)自己的NCBI賬號(hào)：點(diǎn)擊此處注冊(cè)然后登陸賬號(hào)：在已登陸狀態(tài)下點(diǎn)擊Submit：點(diǎn)擊圖中標(biāo)記處選擇GengBank：點(diǎn)擊GO：選擇：Banklt：建議認(rèn)真閱讀填寫(xiě)要求等：點(diǎn)擊Sign in to use Banklt點(diǎn)擊New Sub,下面是你提交的記錄，即使你提交過(guò)程中中斷了，也可以Continue!以下是具體提交過(guò)程：一.填寫(xiě)基本信息二1. 圖中1是作者名字，可以添加作者名，F(xiàn)

2、irst和Last Name，填了就可以，其他可以不填。2. 圖中2是填是否出版，有三個(gè)選項(xiàng)：未出版，正在出版，已經(jīng)出版。需要注意的是，如果選則未出版，需要在Title中注明，否則無(wú)法提交。3. 可以添加作者，然后Continue即可。三.這是選擇是用生么測(cè)序方法后的的序列1. 現(xiàn)在我們用的一次只能測(cè)一條序列的都是Sanger測(cè)序，下面的454等都代表儀器型號(hào)，是我們現(xiàn)在說(shuō)的高通量測(cè)序，簡(jiǎn)單的書(shū)不同型號(hào)靈敏度不同。2. 這是選擇你測(cè)序是一個(gè)反應(yīng)還是幾個(gè)反應(yīng)，就是你這條序列是一個(gè)測(cè)序結(jié)果就出來(lái)了，還是幾個(gè)測(cè)序結(jié)果拼在一起得到的結(jié)果，一代測(cè)序一個(gè)反應(yīng)最可信的測(cè)序范圍是50-750bp,根據(jù)實(shí)際選擇

3、，然后繼續(xù)。四 填寫(xiě)序列信息：1.選擇什么時(shí)候公布你的序列信息，你可以選怎立刻，也可以選擇在以后的某一時(shí)間，如果你選擇了時(shí)間，那么即使你已經(jīng)上傳序列，有了序列號(hào)，在時(shí)間未到的時(shí)候你也是找不到的。2.選擇你的序列是不是16SrRNA基因是細(xì)菌上編碼rRNA相對(duì)應(yīng)的DNA序列,可能有一個(gè)專(zhuān)門(mén)的庫(kù)，所以一般選擇NO3.選擇你的序列類(lèi)型，1.我選了cDNA ,然后選擇是什么類(lèi)型：是線性，我們一般的都是線狀的，還是環(huán)狀一般想線粒體，葉綠體或者各種質(zhì)粒都是現(xiàn)狀的。4.然后填寫(xiě)你上傳了多少個(gè)序列，黏貼序列，注意序列一定要是FASTA格式。你也可以選擇上傳文檔，這個(gè)自己學(xué)。然后繼續(xù)兩次繼續(xù)。五填寫(xiě)你上傳序列所

4、屬物種。然后即使繼續(xù)。六選擇你要你的序列式原始序列，就是你自己測(cè)序的序列，還是為已有序列做注釋。然后繼續(xù)。七序列信息1. 填寫(xiě)你基因所屬細(xì)胞器2. 填寫(xiě)你對(duì)基因的注釋?zhuān)梢蕴砑舆x項(xiàng)，根據(jù)自己實(shí)際情況添加。3. 最下面可以添加你的PCR引物，然后繼續(xù)，會(huì)讓你檢查，你檢查后繼續(xù)即可。八信息補(bǔ)充1. 填加序列信息，可以上傳文件，也可以選項(xiàng)填寫(xiě)，建議用選項(xiàng)。2. 選擇你的信息，可以添加，然后繼續(xù)在上圖中選擇添加選項(xiàng)，會(huì)讓你填寫(xiě)模板是正鏈還是負(fù)鏈，如果是部分序列，是哪一端，產(chǎn)物是指你把序列通過(guò)BlastP比對(duì)后的到的序列號(hào)（qualifiers）和相似度(Value),然后Accept。跳轉(zhuǎn)后然后繼續(xù)。九最后會(huì)讓你最終檢