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文檔簡介

1、biochemistry總結(jié)串講總結(jié)串講 biochemistryv生物化學(xué):研究生物分子和生命的化生物化學(xué):研究生物分子和生命的化學(xué)反應(yīng)的科學(xué),運用化學(xué)的原理在分學(xué)反應(yīng)的科學(xué),運用化學(xué)的原理在分子水平上解釋生命現(xiàn)象的科學(xué)。子水平上解釋生命現(xiàn)象的科學(xué)。biochemistry氨基酸與蛋白質(zhì)氨基酸與蛋白質(zhì) biochemistryv1.結(jié)構(gòu)特點:結(jié)構(gòu)特點: 氨基酸氨基酸(amino acid)是蛋白質(zhì)分子的基本是蛋白質(zhì)分子的基本組成單位。構(gòu)成天然蛋白質(zhì)分子的氨基組成單位。構(gòu)成天然蛋白質(zhì)分子的氨基酸約有酸約有20種,除種,除pro為為-亞氨基酸、亞氨基酸、gly不含手性碳原子外,其余氨基酸均為不含

2、手性碳原子外,其余氨基酸均為l-氨基酸。氨基酸。一、氨基酸:一、氨基酸: biochemistryv2.分類:分類: 根據(jù)氨基酸的根據(jù)氨基酸的r基團的極性大小可將氨基基團的極性大小可將氨基酸分為四類:酸分為四類: 非極性中性氨基酸非極性中性氨基酸(9種種); 極性中性氨基酸極性中性氨基酸(6種種); 極性帶電氨極性帶電氨基酸,包括:酸性氨基酸基酸,包括:酸性氨基酸(glu和和asp)和堿和堿性氨基酸性氨基酸(lys、arg和和his)。 具有特殊性質(zhì)的氨基酸:具有特殊性質(zhì)的氨基酸:pro、trp、tyr、phe、cys、met、his等等 biochemistryv3.等電點(等電點(pi)

3、等電點的計算等電點的計算 氨基酸在等電點狀態(tài)下,溶解度最小氨基酸在等電點狀態(tài)下,溶解度最小 不同不同ph時的電泳行為時的電泳行為 ph pi時,帶負(fù)電荷,向正極移動時,帶負(fù)電荷,向正極移動 ph = pi時,凈電荷為零時,凈電荷為零 ph pi時,帶正電荷,向負(fù)極移動時,帶正電荷,向負(fù)極移動 222333nhrnhcoohrcoohnhcoohpkpkpipkpkpipkpkpi堿性氨基酸酸性氨基酸中性氨基酸 biochemistryv4、氨基酸的化學(xué)性質(zhì)、氨基酸的化學(xué)性質(zhì)v 茚三酮反應(yīng):藍(lán)紫色茚三酮反應(yīng):藍(lán)紫色-水合茚三酮試劑水合茚三酮試劑 vsanger反應(yīng):黃色反應(yīng):黃色 -dnfb (

4、2,4-二硝基氟苯二硝基氟苯)v與丹磺酰氯反應(yīng):具有強烈熒光與丹磺酰氯反應(yīng):具有強烈熒光 -dns-cl(5-二甲基氨基萘二甲基氨基萘-1-磺酰氯)磺酰氯)vedman反應(yīng):反應(yīng): pitc (苯異硫氰酸苯異硫氰酸) biochemistryv肽肽 氨基酸和氨基酸之間通過氨基酸和氨基酸之間通過羧基和羧基和氨氨基脫水縮合而成的化合物,其中的氨基酸單基脫水縮合而成的化合物,其中的氨基酸單位稱氨基酸殘基。位稱氨基酸殘基。v每條多肽鏈都有兩端:即自由氨基端每條多肽鏈都有兩端:即自由氨基端(n端端)與自由羧基端與自由羧基端(c端端),肽鏈的方向是,肽鏈的方向是n端端c端。端。v 肽鍵肽鍵 氨基酸間脫水后

5、形成的酰氨鍵氨基酸間脫水后形成的酰氨鍵v肽鍵中的四個原子和與之相鄰的兩個碳原子肽鍵中的四個原子和與之相鄰的兩個碳原子幾乎處在同一平面內(nèi)稱為酰氨平面或肽平面。幾乎處在同一平面內(nèi)稱為酰氨平面或肽平面。二、二、 肽肽 biochemistry三、蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)三、蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)v蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)可人為分為一級、二級、蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)可人為分為一級、二級、三級和四級結(jié)構(gòu)等層次。一級結(jié)構(gòu)為線狀結(jié)三級和四級結(jié)構(gòu)等層次。一級結(jié)構(gòu)為線狀結(jié)構(gòu),二、三、四級結(jié)構(gòu)為空間結(jié)構(gòu)。構(gòu),二、三、四級結(jié)構(gòu)為空間結(jié)構(gòu)。v一級結(jié)構(gòu):指多肽鏈中氨基酸的排列順序一級結(jié)構(gòu):指多肽鏈中氨基酸的排列順序(含二硫鍵),其維系鍵是肽鍵。蛋

6、白質(zhì)的(含二硫鍵),其維系鍵是肽鍵。蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)決定其空間結(jié)構(gòu)(理解牛胰一級結(jié)構(gòu)決定其空間結(jié)構(gòu)(理解牛胰rnase變性、復(fù)性實驗)。變性、復(fù)性實驗)。v二級結(jié)構(gòu):指多肽鏈主鏈骨架盤繞折疊而形二級結(jié)構(gòu):指多肽鏈主鏈骨架盤繞折疊而形成的構(gòu)象,借氫鍵維系。成的構(gòu)象,借氫鍵維系。 biochemistryv超二級結(jié)構(gòu):由兩個以上二級結(jié)構(gòu)聚集形成超二級結(jié)構(gòu):由兩個以上二級結(jié)構(gòu)聚集形成規(guī)則的二級結(jié)構(gòu)的組合體,如規(guī)則的二級結(jié)構(gòu)的組合體,如和和。 模體(模體(motif)屬于蛋白質(zhì)的超二級結(jié)構(gòu),)屬于蛋白質(zhì)的超二級結(jié)構(gòu),由由2個或個或2個以上具有二級結(jié)構(gòu)的的肽段,個以上具有二級結(jié)構(gòu)的的肽段,在空間上相互接

7、近,形成一個特殊的空間在空間上相互接近,形成一個特殊的空間構(gòu)象,并發(fā)揮專一的功能。構(gòu)象,并發(fā)揮專一的功能。 biochemistryv3三級結(jié)構(gòu):多肽鏈通過盤旋、折疊,形成三級結(jié)構(gòu):多肽鏈通過盤旋、折疊,形成緊密的借各種次級鍵維持的球狀構(gòu)象。指多緊密的借各種次級鍵維持的球狀構(gòu)象。指多肽鏈所有原子的空間排布。其維系鍵主要是肽鏈所有原子的空間排布。其維系鍵主要是非共價鍵(次級鍵):氫鍵、疏水鍵、范德非共價鍵(次級鍵):氫鍵、疏水鍵、范德華力、離子鍵等,也可涉及二硫鍵。華力、離子鍵等,也可涉及二硫鍵。 結(jié)構(gòu)域(結(jié)構(gòu)域(domain):):在二級結(jié)構(gòu)及超二級在二級結(jié)構(gòu)及超二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,多肽鏈進一步

8、卷曲折疊,組結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,多肽鏈進一步卷曲折疊,組裝成幾個相對獨立的、近似球形的三維實體。裝成幾個相對獨立的、近似球形的三維實體。 biochemistryv4四級結(jié)構(gòu):寡聚蛋白中亞基種類、數(shù)目、四級結(jié)構(gòu):寡聚蛋白中亞基種類、數(shù)目、空間排布及亞基間相互作用力。其維系鍵空間排布及亞基間相互作用力。其維系鍵為非共價鍵。為非共價鍵。 亞基是指參與構(gòu)成蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)的而亞基是指參與構(gòu)成蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)的而又具有獨立三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈。又具有獨立三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈。 biochemistry四、蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)四、蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)v1兩性解離與等電點:兩性解離與等電點: v2蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì):蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì)

9、: v3蛋白質(zhì)的紫外吸收:蛋白質(zhì)的紫外吸收: v4蛋白質(zhì)的變性:蛋白質(zhì)的變性: 變性本質(zhì):破壞非共價鍵和二硫鍵,即破變性本質(zhì):破壞非共價鍵和二硫鍵,即破壞空間結(jié)構(gòu),但不改變蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)。壞空間結(jié)構(gòu),但不改變蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)。 biochemistry五、蛋白質(zhì)的分離與純化:五、蛋白質(zhì)的分離與純化:v1鹽析(與鹽溶區(qū)分)與有機溶劑沉淀:鹽析(與鹽溶區(qū)分)與有機溶劑沉淀: v2電泳:電泳: v3透析與超濾:透析與超濾: v4層析:離子交換層析、凝膠過濾層析、層析:離子交換層析、凝膠過濾層析、親和層析親和層析 biochemistry六、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的測定六、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的測定v二硫鍵的處理

10、二硫鍵的處理 巰基化合物還原法和過甲酸氧化法巰基化合物還原法和過甲酸氧化法v常用的水解酶等常用的水解酶等vn端氨基酸的測定等端氨基酸的測定等 胰蛋白酶胰蛋白酶 lysx (x pro),argx 胰凝乳蛋白酶胰凝乳蛋白酶 tyrx (x pro) trpx,phex溴化氰(溴化氰(cnbr) metx 只斷裂由甲硫氨酸的羧基所形成的肽鍵只斷裂由甲硫氨酸的羧基所形成的肽鍵 cnbr裂解產(chǎn)生的片段較大裂解產(chǎn)生的片段較大biochemistry酶與輔酶酶與輔酶 biochemistryv酶是一類由活細(xì)胞產(chǎn)生的對其特異底物具有酶是一類由活細(xì)胞產(chǎn)生的對其特異底物具有高效催化作用的生物大分子,包括蛋白質(zhì)、

11、高效催化作用的生物大分子,包括蛋白質(zhì)、核酸。核酸。v全酶的組成:酶蛋白和輔因子(輔酶、輔基)全酶的組成:酶蛋白和輔因子(輔酶、輔基)v酶分子上只有少數(shù)氨基酸殘基與催化活性直酶分子上只有少數(shù)氨基酸殘基與催化活性直接相關(guān),這些與酶活性相關(guān)的區(qū)域稱為酶的接相關(guān),這些與酶活性相關(guān)的區(qū)域稱為酶的活性中心,又稱活性部位?;钚灾行?,又稱活性部位。 biochemistryv理解底物濃度對反應(yīng)速度的影響理解底物濃度對反應(yīng)速度的影響 v米氏方程米氏方程vvm的意義的意義vkm的意義的意義maxsksvvm biochemistry v三種可逆抑制的特點三種可逆抑制的特點: 競爭性抑制競爭性抑制 反競爭性抑制反競

12、爭性抑制 非競爭性抑制非競爭性抑制 biochemistry輔酶輔酶v1.tpp:即焦磷酸硫胺素,由硫胺素(即焦磷酸硫胺素,由硫胺素(vit b1)焦磷酸化而生成,是脫羧酶的輔酶,)焦磷酸化而生成,是脫羧酶的輔酶,在體內(nèi)參與糖代謝過程中在體內(nèi)參與糖代謝過程中-酮酸的氧化脫羧酮酸的氧化脫羧反應(yīng)。反應(yīng)。v2.fmn和和fad:即黃素單核苷酸(即黃素單核苷酸(fmn)和黃素腺嘌呤二核苷酸(和黃素腺嘌呤二核苷酸(fad),是核黃素),是核黃素(vitb2)的衍生物。)的衍生物。fmn或或fad通常作為通常作為脫氫酶的輔基,在酶促反應(yīng)中作為遞氫體脫氫酶的輔基,在酶促反應(yīng)中作為遞氫體(雙遞氫體)。(雙遞氫

13、體)。 biochemistryv3.nad+和和nadp+:即尼克酰胺腺嘌呤二核:即尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸(苷酸(nad+,輔酶,輔酶)和尼克酰胺腺嘌呤)和尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(二核苷酸磷酸(nadp+,輔酶,輔酶),是),是vit pp (vitb3)的衍生物。)的衍生物。nad+和和nadp+主要作為脫氫酶的輔酶,在酶促反應(yīng)中起主要作為脫氫酶的輔酶,在酶促反應(yīng)中起遞氫體的作用,為單遞氫體。遞氫體的作用,為單遞氫體。v4.磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺:是:是vit b6的衍的衍生物。磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺可作為氨生物。磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺可作為氨基轉(zhuǎn)移酶,氨基酸脫羧

14、酶,半胱氨酸脫硫基轉(zhuǎn)移酶,氨基酸脫羧酶,半胱氨酸脫硫酶等的輔酶。酶等的輔酶。 biochemistryv5.coa:泛酸(遍多酸)在體內(nèi)參與構(gòu)成輔:泛酸(遍多酸)在體內(nèi)參與構(gòu)成輔酶酶a(coa)。)。coa中的巰基可與羧基以高中的巰基可與羧基以高能硫酯鍵結(jié)合,在糖、脂、蛋白質(zhì)代謝中起能硫酯鍵結(jié)合,在糖、脂、蛋白質(zhì)代謝中起傳遞?;淖饔?,是?;傅妮o酶。傳遞?;淖饔?,是酰化酶的輔酶。v6.生物素生物素:是羧化酶的輔基,在體內(nèi)參與:是羧化酶的輔基,在體內(nèi)參與co2的固定和羧化反應(yīng)。的固定和羧化反應(yīng)。 biochemistryv7. fh4:由葉酸衍生而來。四氫葉酸是體:由葉酸衍生而來。四氫葉酸是

15、體內(nèi)一碳單位基團轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)中的輔酶。內(nèi)一碳單位基團轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)中的輔酶。v8. vit b12衍生物衍生物:vit b12分子中含金屬元分子中含金屬元素鈷,故又稱為鈷胺素。素鈷,故又稱為鈷胺素。vit b12在體內(nèi)有在體內(nèi)有多種活性形式,如多種活性形式,如5-脫氧腺苷鈷胺素、甲脫氧腺苷鈷胺素、甲基鈷胺素等。其中,基鈷胺素等。其中,5-脫氧腺苷鈷胺素參脫氧腺苷鈷胺素參與構(gòu)成變位酶的輔酶,甲基鈷胺素則是甲與構(gòu)成變位酶的輔酶,甲基鈷胺素則是甲基轉(zhuǎn)移酶的輔酶?;D(zhuǎn)移酶的輔酶。biochemistry核酸核酸 biochemistryv一、核酸的化學(xué)組成與結(jié)構(gòu):一、核酸的化學(xué)組成與結(jié)構(gòu): 1含氮堿基:含氮

16、堿基: 2戊糖:戊糖: 3核苷:核苷:v二、二、dna的二級結(jié)構(gòu)的二級結(jié)構(gòu) a、b、z型型 biochemistryv三、核酸的紫外吸收特性三、核酸的紫外吸收特性 純純dna,a260/a280 1.8(1.651.85) 若大于若大于1.8,表示污染了,表示污染了rna或或dna降解降解 純純rna,a260/a280 2.0 若有雜蛋白或苯酚,則若有雜蛋白或苯酚,則a260/a280明顯降低明顯降低 biochemistryv四、四、dna的變性與復(fù)性的變性與復(fù)性 dna變性的本質(zhì)是雙鏈間氫鍵的斷裂,并變性的本質(zhì)是雙鏈間氫鍵的斷裂,并不涉及共價鍵斷裂。不涉及共價鍵斷裂。 tm 增色效應(yīng)增色

17、效應(yīng) 復(fù)性與分子雜交復(fù)性與分子雜交v五、限制性核酸內(nèi)切酶:是識別五、限制性核酸內(nèi)切酶:是識別dna的特異的特異序列序列, 并在識別位點或其周圍切割雙鏈并在識別位點或其周圍切割雙鏈dna的一類內(nèi)切酶的一類內(nèi)切酶biochemistry糖代謝糖代謝 biochemistryv糖酵解糖酵解(glycolysis,又稱,又稱em或或emp途徑):途徑): 一分子葡萄糖裂解為兩分子丙酮酸,并釋放一分子葡萄糖裂解為兩分子丙酮酸,并釋放出少量出少量atp的過程。的過程。v糖酵解的調(diào)節(jié):主要是對三個關(guān)鍵酶,即己糖酵解的調(diào)節(jié):主要是對三個關(guān)鍵酶,即己糖激酶(葡萄糖激酶)、糖激酶(葡萄糖激酶)、6-磷酸果糖激酶磷

18、酸果糖激酶-1、丙酮酸激酶進行調(diào)節(jié)。丙酮酸激酶進行調(diào)節(jié)。 部位:胞液部位:胞液v糖酵解與糖異生對照記憶糖酵解與糖異生對照記憶 丙酮酸羧化酶、磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶、丙酮酸羧化酶、磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶、果糖二磷酸酶、葡萄糖果糖二磷酸酶、葡萄糖-6-磷酸酶磷酸酶 biochemistryv糖的有氧酵解:糖的有氧酵解:tca循環(huán)循環(huán)vtca循環(huán)途徑、關(guān)鍵酶、循環(huán)途徑、關(guān)鍵酶、atp的生成等的生成等v磷酸戊糖途徑(磷酸戊糖途徑(hms)生理意義)生理意義biochemistry生物能學(xué)與生物氧化生物能學(xué)與生物氧化 biochemistryv物質(zhì)在生物體內(nèi)進行氧化稱生物氧化,主物質(zhì)在生物體內(nèi)進行氧化稱

19、生物氧化,主要指糖、脂肪、蛋白質(zhì)等在體內(nèi)分解時逐要指糖、脂肪、蛋白質(zhì)等在體內(nèi)分解時逐步釋放能量,最終生成步釋放能量,最終生成co2 和和 h2o的過程。的過程。v底物水平磷酸化:在底物氧化的基礎(chǔ)上釋底物水平磷酸化:在底物氧化的基礎(chǔ)上釋放出的能量推動放出的能量推動adp或其他核苷二磷酸的或其他核苷二磷酸的磷酸化反應(yīng)。磷酸化反應(yīng)。v氧化磷酸化:是氧化磷酸化:是nadh、fadh2上的電子上的電子通過一系列的電子傳遞體傳遞給通過一系列的電子傳遞體傳遞給o2生成水,生成水,并將釋放的能量使并將釋放的能量使adp磷酸化形成磷酸化形成atp的的過程。過程。 biochemistryv氧化呼吸鏈氧化呼吸鏈

20、:定位于線粒體內(nèi)膜上的一組:定位于線粒體內(nèi)膜上的一組排列有序的具有電子傳遞功能的酶復(fù)合體,排列有序的具有電子傳遞功能的酶復(fù)合體,可將代謝物脫下的成對氫原子通過連鎖的可將代謝物脫下的成對氫原子通過連鎖的氧化還原反應(yīng)最終傳遞給氧生成水。這一氧化還原反應(yīng)最終傳遞給氧生成水。這一系列酶與輔酶構(gòu)成的鏈狀傳遞體系,也稱系列酶與輔酶構(gòu)成的鏈狀傳遞體系,也稱電子傳遞鏈電子傳遞鏈(electron transport chain)。 biochemistryv呼吸鏈的組成呼吸鏈的組成* * 泛醌(泛醌(coqcoq)和)和 cyt c 均不包含在上述四種復(fù)合體中均不包含在上述四種復(fù)合體中 biochemistr

21、yv電子傳遞順序:電子傳遞順序:v電子傳遞鏈中氧化電子傳遞鏈中氧化-還原電勢:從低向高傳遞。還原電勢:從低向高傳遞。 biochemistryv胞液中的胞液中的nadh的氧化的氧化1. 甘油甘油-3-磷酸穿梭作用(神經(jīng)組織和骨骼?。┝姿岽┧笞饔茫ㄉ窠?jīng)組織和骨骼肌)2. 蘋果酸蘋果酸-天冬氨酸穿梭作用(肝和心?。┨於彼岽┧笞饔茫ǜ魏托募。﹏adh+h+3-磷酸甘油穿梭磷酸甘油穿梭1.5 atpfadh2nadh+h+蘋果酸蘋果酸-天冬氨酸穿梭天冬氨酸穿梭 nadh+h+ 2.5atp biochemistryv氧化磷酸化機制氧化磷酸化機制v化學(xué)滲透學(xué)說化學(xué)滲透學(xué)說vp/o比:每消耗比:每消耗1

22、mol原子氧時原子氧時adp磷酸化攝磷酸化攝取無機磷酸的摩爾數(shù)(即合成的取無機磷酸的摩爾數(shù)(即合成的atp的摩的摩爾數(shù)),爾數(shù)),p/o的數(shù)值相當(dāng)于一對電子經(jīng)呼吸的數(shù)值相當(dāng)于一對電子經(jīng)呼吸鏈傳遞至分子氧所產(chǎn)生的鏈傳遞至分子氧所產(chǎn)生的atp分子數(shù)。分子數(shù)。實測得實測得nadh呼吸鏈:呼吸鏈: p/o 2.5實測得實測得fadh2呼吸鏈:呼吸鏈: p/o 1.5 biochemistry魚藤酮魚藤酮安密妥安密妥 抗霉素抗霉素a aco、cn-、n3-及及h2s各種呼吸鏈抑制劑的阻斷位點各種呼吸鏈抑制劑的阻斷位點阻止電子從阻止電子從nadh向向coq傳遞傳遞抑制電子從抑制電子從cyt b向向cyt

23、c1傳遞傳遞阻斷電子從阻斷電子從cyt aa3 向向o2傳遞傳遞粘噻唑粘噻唑 biochemistryv解偶聯(lián)劑解偶聯(lián)劑 解偶聯(lián)劑的作用機制在于它們能夠快速地解偶聯(lián)劑的作用機制在于它們能夠快速地 消耗跨膜的質(zhì)子梯度,使得質(zhì)子難以通過消耗跨膜的質(zhì)子梯度,使得質(zhì)子難以通過f1f0-atp合酶上的質(zhì)子通道來合成合酶上的質(zhì)子通道來合成atp,從,從而使氧化與磷酸化偶聯(lián)過程脫離。而使氧化與磷酸化偶聯(lián)過程脫離。 解偶聯(lián)劑只抑制解偶聯(lián)劑只抑制atp的形成過程,不抑制電的形成過程,不抑制電子傳遞過程,使電子傳遞產(chǎn)生的自由能都變子傳遞過程,使電子傳遞產(chǎn)生的自由能都變成為熱能成為熱能. 2,4-二硝基酚等二硝基酚

24、等 f1f0-atp合酶抑制劑合酶抑制劑:寡霉素和寡霉素和dccdbiochemistry脂代謝脂代謝 biochemistry脂肪酸脂肪酸- 氧化氧化v脂肪酸的脂肪酸的- 氧化可以劃分為活化氧化可以劃分為活化-轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)移-氧化三氧化三個階段個階段v脂酸的活化脂酸的活化 脂酰脂酰 coa 的生成(胞液)的生成(胞液)v轉(zhuǎn)移:肉堿轉(zhuǎn)移:肉堿 biochemistry線粒體內(nèi)脂肪酸的線粒體內(nèi)脂肪酸的氧化氧化v包括脫氫、加包括脫氫、加水、再脫氫、水、再脫氫、硫解四個過程。硫解四個過程。 biochemistryv脂酸氧化的能量脂酸氧化的能量生成生成 biochemistry脂肪酸的合成脂肪酸的合成v合

25、成原料:乙酰合成原料:乙酰coa、atp、hco3、nadph、mn2+ v乙酰乙酰coa的主要來源:的主要來源: 乙酰乙酰coa全部在線粒體內(nèi)產(chǎn)生,通過檸全部在線粒體內(nèi)產(chǎn)生,通過檸檬酸檬酸-丙酮酸循環(huán)丙酮酸循環(huán) (citrate pyruvate cycle)出線粒體。出線粒體。nadph的來源的來源 磷酸戊糖途徑(主要來源)磷酸戊糖途徑(主要來源) 胞液中蘋果酸酶催化的反應(yīng)胞液中蘋果酸酶催化的反應(yīng) biochemistryv丙二酸單酰丙二酸單酰coa的合成的合成乙酰乙酰coa羧化酶羧化酶生物素生物素hooc-ch2-co scoa + adp + pich3-co scoa + hco3-

26、 + atp乙酰乙酰coa羧化酶是脂酸合成的羧化酶是脂酸合成的限速酶限速酶,存在于胞,存在于胞液中,其輔基是液中,其輔基是生物素生物素,mn2+是其激活劑。是其激活劑。乙酰乙酰coa羧化酶包括生物素羧基載體(羧化酶包括生物素羧基載體(bccp)、)、生物素羧化酶、羧基轉(zhuǎn)移酶。生物素羧化酶、羧基轉(zhuǎn)移酶。biochemistry氨基酸代謝氨基酸代謝 biochemistryv脫氨基方式:脫氨基方式:v氧化脫氨基:氧化脫氨基:指氨基酸在酶的作用下伴有氧化的指氨基酸在酶的作用下伴有氧化的脫氨基反應(yīng)。脫氨基反應(yīng)。 催化反應(yīng)的酶有催化反應(yīng)的酶有l(wèi)-氨基酸氧化酶、氨基酸氧化酶、d-氨基酸氧化酶和氨基酸氧化酶

27、和l-谷氨酸脫氫酶。谷氨酸脫氫酶。v轉(zhuǎn)氨基作用:轉(zhuǎn)氨基作用:氨基酸在轉(zhuǎn)氨酶氨基酸在轉(zhuǎn)氨酶(transaminase)的作的作用下,可逆的將其氨基轉(zhuǎn)移給用下,可逆的將其氨基轉(zhuǎn)移給-酮酸,結(jié)果氨基酮酸,結(jié)果氨基酸轉(zhuǎn)變成酸轉(zhuǎn)變成-酮酸,而原來的酮酸,而原來的-酮酸接受氨基轉(zhuǎn)變酮酸接受氨基轉(zhuǎn)變成另一種氨基酸,此反應(yīng)稱為轉(zhuǎn)氨基作用。成另一種氨基酸,此反應(yīng)稱為轉(zhuǎn)氨基作用。 biochemistryv聯(lián)合脫氨基:聯(lián)合脫氨基:兩種脫氨基方式的聯(lián)合作用,兩種脫氨基方式的聯(lián)合作用,使氨基酸脫下使氨基酸脫下-氨基生成氨基生成-酮酸的過程。酮酸的過程。v類型:類型: 轉(zhuǎn)氨酶與轉(zhuǎn)氨酶與l-谷氨酸脫氫酶的聯(lián)合脫氨基作用谷

28、氨酸脫氫酶的聯(lián)合脫氨基作用 轉(zhuǎn)氨酶與腺苷酸脫氫酶的聯(lián)合脫氨基作用轉(zhuǎn)氨酶與腺苷酸脫氫酶的聯(lián)合脫氨基作用此種方式既是氨基酸脫氨基的主要方式,此種方式既是氨基酸脫氨基的主要方式,也是體內(nèi)合成某些氨基酸的主要方式。也是體內(nèi)合成某些氨基酸的主要方式。 biochemistryv氨的去路:氨的去路: 合成非必需氨基酸及其它含氮化合物合成非必需氨基酸及其它含氮化合物 合成谷氨酰胺(氨基氮的儲存形式)合成谷氨酰胺(氨基氮的儲存形式) 排出體外排出體外 排氨動物:水生、海洋動物,以排氨動物:水生、海洋動物,以氨氨的形式排出的形式排出 排尿酸動物:鳥類、爬蟲類,以排尿酸動物:鳥類、爬蟲類,以尿酸尿酸形式排出形式排

29、出 排尿動物:以排尿動物:以尿素尿素形式排出形式排出 谷氨酸谷氨酸 + nh3谷氨酰胺谷氨酰胺 谷氨酰胺合成酶谷氨酰胺合成酶atpadp+pi鳥鳥氨氨酸酸循循環(huán)環(huán)2adp+pico2 + nh3 + h2o氨基甲酰磷酸氨基甲酰磷酸2atpn-乙酰谷氨酸乙酰谷氨酸pi鳥氨酸鳥氨酸瓜氨酸瓜氨酸精氨酸精氨酸延胡索酸延胡索酸氨基酸氨基酸草酰乙酸草酰乙酸蘋果酸蘋果酸-酮戊酮戊 二酸二酸谷氨酸谷氨酸-酮酸酮酸精氨琥珀酸精氨琥珀酸瓜氨酸瓜氨酸天冬氨酸天冬氨酸atpamp + ppi鳥氨酸鳥氨酸尿素尿素線粒體線粒體胞胞 液液 biochemistryv原料:原料:2 分子氨,一個來自于游離氨,另一分子氨,一個

30、來自于游離氨,另一個來自天冬氨酸。個來自天冬氨酸。v過程:先在線粒體中進行,再在胞液中進過程:先在線粒體中進行,再在胞液中進行。行。v耗能:耗能:3 個個atp,4 個高能磷酸鍵。個高能磷酸鍵。v氨的轉(zhuǎn)運:主要以無毒的氨的轉(zhuǎn)運:主要以無毒的丙氨酸丙氨酸和和谷氨酰谷氨酰胺胺兩種形式在血液中運輸。兩種形式在血液中運輸。 biochemistryv20種氨基酸的碳骨架可以降解轉(zhuǎn)變?yōu)榉N氨基酸的碳骨架可以降解轉(zhuǎn)變?yōu)?種不種不同的分子:丙酮酸、乙酰輔酶同的分子:丙酮酸、乙酰輔酶a、乙酰乙酸、乙酰乙酸、-酮戊二酸、琥珀酰輔酶酮戊二酸、琥珀酰輔酶a、延胡索酸和草、延胡索酸和草酰乙酸。酰乙酸。 biochemi

31、stry生糖氨基酸:降解為丙酮酸、生糖氨基酸:降解為丙酮酸、-酮戊二酸、酮戊二酸、琥珀酰琥珀酰coa、延胡索酸、和草酰乙酸的氨基、延胡索酸、和草酰乙酸的氨基酸酸(13種氨基酸)種氨基酸)生酮氨基酸生酮氨基酸: 降解為乙酰降解為乙酰coa和乙酰乙酰和乙酰乙酰coa的氨基酸,包括的氨基酸,包括leu & lys生酮兼生糖氨基酸生酮兼生糖氨基酸:trp, thr, tyr, ile, phe (tttip) biochemistryv尿黑酸氧化酶缺陷會導(dǎo)致先天性尿黑尿黑酸氧化酶缺陷會導(dǎo)致先天性尿黑酸尿癥酸尿癥vphe的主要代謝途徑是合成的主要代謝途徑是合成tyr。v先天性苯丙氨酸羥化酶缺陷會導(dǎo)致苯酮

32、酸先天性苯丙氨酸羥化酶缺陷會導(dǎo)致苯酮酸尿癥。尿癥。 biochemistryv幾種生物活性物質(zhì):幾種生物活性物質(zhì): 兒茶酚胺類兒茶酚胺類: 多巴胺是腦中的神經(jīng)遞質(zhì)。多巴胺是腦中的神經(jīng)遞質(zhì)。 酪氨酸代謝另一途徑是合成黑色素。酪酪氨酸代謝另一途徑是合成黑色素。酪氨酸酶缺失會導(dǎo)致白化病。氨酸酶缺失會導(dǎo)致白化病。 組胺組胺是強烈的血管舒張劑是強烈的血管舒張劑 5-羥色胺羥色胺 -氨基丁酸氨基丁酸 biochemistryv一碳單位:一碳單位:某些氨基酸代謝過程中所產(chǎn)生某些氨基酸代謝過程中所產(chǎn)生的含有一個碳原子基團的總稱的含有一個碳原子基團的總稱.包括:甲基包括:甲基(-ch3),甲烯基甲烯基(-ch2

33、-),甲炔基甲炔基(-ch=),甲酰甲?;?-cho),亞氨甲基亞氨甲基(-ch=nh)等。等。v一碳單位的來源:一碳單位的來源:ser、gly、his、trp 氨基酸與一碳單位氨基酸與一碳單位 biochemistryv必需氨基酸:體內(nèi)需要自己又不能合成,必需必需氨基酸:體內(nèi)需要自己又不能合成,必需由食物供給的氨基酸。包括:由食物供給的氨基酸。包括:v ile、leu、trp、thr、phe、lys、met、valv (“一兩色素本來淡些一兩色素本來淡些”)v非必需氨基酸:機體能自己合成,不一定需要非必需氨基酸:機體能自己合成,不一定需要從食物供給的氨基酸。從食物供給的氨基酸。 bioch

34、emistry作為合成嘌呤和嘧啶的原料作為合成嘌呤和嘧啶的原料合成核酸合成核酸 把氨基酸代謝和核酸代謝聯(lián)系起來把氨基酸代謝和核酸代謝聯(lián)系起來通過通過s-腺苷甲硫氨酸向其它化合物提供甲基腺苷甲硫氨酸向其它化合物提供甲基 應(yīng)用(抗癌應(yīng)用(抗癌抗菌)抗菌)一碳單位的生理功能一碳單位的生理功能biochemistry核苷酸代謝核苷酸代謝 biochemistryv利用磷酸核糖、氨基酸、一碳單位、利用磷酸核糖、氨基酸、一碳單位、co2等簡單物質(zhì)為原料,經(jīng)過一系列酶促反應(yīng),等簡單物質(zhì)為原料,經(jīng)過一系列酶促反應(yīng),合成核苷酸的過程稱為合成核苷酸的過程稱為從頭合成途徑從頭合成途徑。 肝組織中的合成途徑肝組織中的

35、合成途徑v利用體內(nèi)的游離堿基或核苷,經(jīng)過比較簡利用體內(nèi)的游離堿基或核苷,經(jīng)過比較簡單的反應(yīng)過程合成核苷酸,稱為單的反應(yīng)過程合成核苷酸,稱為補救合成補救合成途徑途徑。 腦、骨髓等組織中只能進行補救途徑腦、骨髓等組織中只能進行補救途徑 biochemistry嘌呤核苷酸的從頭合成嘌呤核苷酸的從頭合成v由由5-磷酸核糖磷酸核糖-1-焦磷酸(焦磷酸(prpp)開始,)開始,先合成次黃嘌呤核苷酸(先合成次黃嘌呤核苷酸(imp) ,然后由,然后由次黃嘌呤核苷酸轉(zhuǎn)化為腺嘌呤核苷酸和鳥次黃嘌呤核苷酸轉(zhuǎn)化為腺嘌呤核苷酸和鳥嘌呤核苷酸。嘌呤核苷酸。v 嘌呤環(huán)合成的前體:嘌呤環(huán)合成的前體: co2 、一碳單位、一碳

36、單位、gln、asp、glyv 起始物:起始物:prpp biochemistry 4765甲?;劝滨0?3892ncncccccncn)(一碳單位)甲酰基一碳單位)(co2甘氨酸天冬氨酸酰胺基( biochemistryvprpp的生成:的生成:prpp合成酶合成酶 可被產(chǎn)物可被產(chǎn)物imp、amp、gmp、adp、gdp反饋抑制,而反饋抑制,而atp可提高可提高prpp合成酶的活性。合成酶的活性。v5-磷酸核糖胺的生成磷酸核糖胺的生成:prpp酰胺轉(zhuǎn)移酶酰胺轉(zhuǎn)移酶 prpp酰胺轉(zhuǎn)移酶是從頭合成過程中的限速酶,酰胺轉(zhuǎn)移酶是從頭合成過程中的限速酶,可被產(chǎn)物可被產(chǎn)物amp、adp、atp及及gm

37、p、gdp、gtp等反饋抑制,其中對等反饋抑制,其中對amp和和gmp尤為尤為敏感。敏感。prpp濃度的增加可以增強此酶的活性。濃度的增加可以增強此酶的活性。 biochemistry嘌呤核苷酸的補救合成嘌呤核苷酸的補救合成v核苷激酶途徑核苷激酶途徑(在生物體內(nèi)只發(fā)現(xiàn)有腺苷激酶(在生物體內(nèi)只發(fā)現(xiàn)有腺苷激酶)腺嘌呤腺嘌呤+prppamp + ppi 腺嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶腺嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶 (aprt)次黃嘌呤次黃嘌呤鳥嘌呤鳥嘌呤imp / gmp + ppi 次黃嘌呤次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶鳥嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶 (hgprt)+prpp 腺苷腺苷 + atp 腺苷激酶腺苷激酶腺苷酸腺苷酸

38、 + adpv磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶途徑(重要途徑)磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶途徑(重要途徑) biochemistry嘧啶核苷酸的生物合成嘧啶核苷酸的生物合成.嘧啶核苷酸的從頭合成嘧啶核苷酸的從頭合成首先合成嘧啶環(huán),然后再與首先合成嘧啶環(huán),然后再與prpp中的磷酸中的磷酸核糖連接起來形成嘧啶核苷酸。核糖連接起來形成嘧啶核苷酸。從頭合成首先合成尿嘧啶核苷酸(從頭合成首先合成尿嘧啶核苷酸(ump),),然后再轉(zhuǎn)變成其他嘧啶核苷酸。然后再轉(zhuǎn)變成其他嘧啶核苷酸。 biochemistryv嘧啶環(huán)從頭合成的元素來源嘧啶環(huán)從頭合成的元素來源aspco2glnncnccc123456氨基甲氨基甲酰磷酸酰磷酸 biochemistry嘧啶核苷酸生物合成的調(diào)節(jié)嘧啶核苷酸生物合成的調(diào)節(jié)v細(xì)菌中,天冬氨酸氨基甲酰轉(zhuǎn)移酶細(xì)菌中,天冬氨酸氨基甲酰轉(zhuǎn)移酶使嘧啶核苷酸使嘧啶核苷酸從頭合成的主要調(diào)節(jié)酶,從頭合成的主要調(diào)節(jié)酶,ctp是其別構(gòu)抑制劑是

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