ChemDraw簡單使用說明.ppt

1 化學(xué)繪圖軟件 ChemDrawChemWindowISISDrawChemSketch主要功能 繪制二維和三維化學(xué)結(jié)構(gòu)式 化學(xué)反應(yīng)方程式 化工流程圖 實驗裝置圖以及相關(guān)文本的編輯 商業(yè)軟件 免費(fèi)軟件 一 概述 2 ChemDraw 當(dāng)前最常用的結(jié)構(gòu)式編輯軟件 除了以上所述的一般功能外 其ultra版本還可以預(yù)測分子的常見物理化學(xué)性質(zhì)如 熔點 生成熱等 對結(jié)構(gòu)按IUPAC原則命名 預(yù)測質(zhì)子及碳13化學(xué)位移等 ChemWindow 最突出的特點是與光譜結(jié)合 它的6 5Spectroscopy版本包括了一個約五萬張13CNMR的數(shù)據(jù)庫 達(dá)250兆 因而其預(yù)測更加精確 除了根據(jù)化合物的結(jié)構(gòu)預(yù)測13CNMR化學(xué)位移外 還能預(yù)測紅外圖譜 質(zhì)譜等 更可以讀入標(biāo)準(zhǔn)格式的NMR IR Raman UV及色譜圖 3 ChemSketch 功能沒有ChemDraw和ChemWindow強(qiáng)大 但操作方便 界面友善 ISISDraw 老牌繪圖軟件 界面簡單 操作方便 4 軟件選擇 簡單化學(xué)結(jié)構(gòu) 4個軟件都能滿足需要復(fù)雜化學(xué)結(jié)構(gòu) ChemDraw或ChemSketch處理光譜和色譜 DrawIt或ChemWindow3D模型 ChemDraw Chem3DChemOffice功能強(qiáng)大ChemSketch部分版本免費(fèi) 5 美國CambridgeSoft公司的重要產(chǎn)品之一專業(yè)的集成化學(xué)桌面辦公軟件標(biāo)準(zhǔn)界面的菜單簡明 易于操作 方便快捷具有化學(xué)計算 化學(xué)分析和化學(xué)建模等實用功能 二 ChemOffice 6 1 ChemDraw是一個化學(xué)結(jié)構(gòu)繪圖軟件 可繪制和編輯高質(zhì)量的化學(xué)結(jié)構(gòu)圖 識別和顯示立體結(jié)構(gòu) 部分物性 將結(jié)構(gòu)和名稱進(jìn)行轉(zhuǎn)換 2 chem3D是一個用于設(shè)計化學(xué)模型的應(yīng)用軟件 可將二維平面的有機(jī)分子結(jié)構(gòu)圖形轉(zhuǎn)化成三維的空間結(jié)構(gòu) 可輔助計算分子半徑的幾何構(gòu)象和單個點的能量以及相關(guān)的性質(zhì) 例如優(yōu)化模型 構(gòu)象搜索 分子動力學(xué)和計算分子的單點能量等 3 ChemInfo是基于國際互聯(lián)網(wǎng)絡(luò)技術(shù)開發(fā)的智能型數(shù)據(jù)管理系統(tǒng) 可以建立分子結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫 4 chemFinder是一個化學(xué)信息管理系統(tǒng) 可以用它來管理化學(xué)信息 組成 7 ChemOffiee的安裝 8 9 Chemdraw簡介 Chemdraw是一個方便快捷的化學(xué)繪圖工具 可以迅速畫出各種各樣的化學(xué)結(jié)構(gòu)及化學(xué)反應(yīng)式 以及與化學(xué)有關(guān)的其它圖形表示 具有多種輸入輸出功能 可以直接將所繪制的圖片等以常見的格式輸出 可由word等文字處理器識別的 便于一般的文檔處理 10 Chemdraw簡介 具有預(yù)測1HNMR和13CNMR 核磁共振 譜圖的功能 不僅可以生成圖譜 還可以直接計算出各個峰的位置和面積 高度 為化學(xué)研究帶來了極大的方便 CheroDraw已經(jīng)成為化學(xué)工作者撰稿和進(jìn)行學(xué)術(shù)交流公認(rèn)的化學(xué)結(jié)構(gòu)輸入軟件 化學(xué)軟件的泰斗 11 ChemDrawUltra8 0 超級版 ChemDrawPro8 0 標(biāo)準(zhǔn)版 ChemDrawStd8 0 專業(yè)版 ChemDrawLtd8 0 受限版 四種版本功能由強(qiáng)到弱 12 ChemDraw起始界面 13 圖形工具板 狀態(tài) 信息欄 編輯區(qū) 滾動欄 菜單欄 工具欄 14 15 套索實鍵雙鍵虛鍵切割鍵切割楔鍵黑體鍵黑體楔鍵空心楔鍵波浪鍵表格長鏈環(huán)丙烷環(huán)環(huán)戊烷環(huán)環(huán)庚烷環(huán)環(huán)己烷椅式環(huán)戊二烯環(huán) 蓬罩橡皮文本筆箭頭軌道繪圖元素基元化學(xué)符號弧形原子反應(yīng)模板環(huán)丁烷環(huán)環(huán)己烷環(huán)環(huán)辛烷環(huán)環(huán)己烷椅式苯環(huán) 16 鍵工具 模板工具 箭頭工具 軌道工具 畫圖工具 基元工具 符號工具 弧形工具 原子反應(yīng)工具 17 18 具體用法為 用鼠標(biāo)左鍵點中所選擇的工具箱中的工具 然后在右邊用鼠標(biāo)拖動 至到畫出你所需要的碳鏈 畫碳鏈 19 便捷地畫出各種各樣的環(huán)狀結(jié)構(gòu) 20 模板按鈕 氨基酸 AminoAcids 芳族 Aromatics 雙環(huán) Bicyclics 生物與膠體 Bioart 儀器1 Clipware part1 儀器2 Clipaware part2 構(gòu)型 Conformers 五元環(huán) CpRings 環(huán)烴 Cycloalkanes DNA Templates 功能團(tuán) FunctionalGroups 雜環(huán) Hexoses 苯環(huán) PhRings 多方體 Polyhedra RNA Templates 立體異構(gòu)體 Stereocenters 超分子 Supramolecules 21 模板工具 氨基酸模板工具 17類 22 模板工具 芳香化合物模板工具 23 模板工具 雙環(huán)模板工具 24 模板工具 生物模板工具 25 模板工具 玻璃儀器模板工具 I 26 模板工具 玻璃儀器模板工具 II 27 模板工具 構(gòu)象異構(gòu)體模板工具 28 模板工具 環(huán)戊二烯模板工具 29 模板工具 脂環(huán)模板工具 30 模板工具 DNA模板工具 31 模板工具 官能團(tuán)模板工具 32 模板工具 己糖模板工具 33 模板工具 苯環(huán)模板工具 34 模板工具 多面體模板工具 35 模板工具 RNA模板工具 36 模板工具 特殊符號模板工具 立體中心模板工具 37 38 39 40 41 42 43 44 快捷鍵 命令 灰色表示命令未激活 小三角表示子菜單 省略號表示新對話框 工具欄 45 文檔設(shè)置 頁面規(guī)劃 46 頁眉頁腳 47 繪圖 48 字體 49 原子格式 50 顏色 設(shè)置背景顏色 51 國外化學(xué)刊物默認(rèn)文檔格式 52 優(yōu)選項 53 優(yōu)選項 顯示設(shè)置 錯誤警告 54 優(yōu)選項 打開 存盤 默認(rèn)路徑 默認(rèn)打開文件格式 默認(rèn)存盤文件格式 55 元素周期表 56 57 符號窗口 58 符號窗口 59 打開文件 不同文件格式 60 文件格式介紹 1CDTemplate ctp ctr 用于保存模板文檔 2ChemDraw cdx ChemDraw原本格式 是一個公共標(biāo)記的文件格式 易被其它程序建立和解釋 常用格式 3ChemDrawSteylSheet cds 用于存儲文件設(shè)置和其它物體 4ConnectionTable ct 一種實例格式 存儲關(guān)于原子與元素 系列編號 X和Y軸 鍵序 鍵類型等的連接和聯(lián)系的列表 是用于多類應(yīng)用程序間互換信息的通用格式 61 5DARC F1 fld QuestelDARC系統(tǒng)中存儲結(jié)構(gòu)的原本文件格式 7ISISReaction rxn MDL開發(fā)的格式 用于存儲元素反應(yīng)信息 8ISISSketch skc 在Windows或Macintosh環(huán)境下 存儲并傳輸?shù)搅硗獾腎SIS應(yīng)用程序中 6DARC F1Query flq QuestelDARC系統(tǒng)中存儲查詢的原本文件格式 62 9MDLMolFile mol MDL 分子設(shè)計有限公司 MolFile文件格式用于其它一些在Windows Macintosh和Unix環(huán)境下的化學(xué)數(shù)據(jù)庫和繪畫應(yīng)用軟件 11JcampSpectra jdx dx 圖譜文件格式 可讀入紫外 質(zhì)譜 紅外 核磁等數(shù)據(jù)文件 12MSIChemNote msm 一種ASCII文本文件 可以用于像ChemNote一類的應(yīng)用程序 10GalacticSpectra spc 銀河圖譜文件格式 63 13SMD4 2 smd ASCII文本文件 一般用于檢索化學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫 14WindowsMetafile wmf 圖片文件格式 可以將ChemDraw圖片傳輸?shù)狡渌鼞?yīng)用程序中 如Word WMF文件格式含有中ChemDraw的結(jié)構(gòu)信息 可被ChemDraw早期版本編輯 64 點位 移動鼠標(biāo)直到鼠標(biāo)的光標(biāo)放到所要進(jìn)行操作的位置 如果選擇的位置在圖形結(jié)構(gòu)中的鍵 原子 線等的上面 一般出現(xiàn)黑方塊 稱之為光標(biāo)塊 選擇塊或操作塊 光標(biāo)塊 常用術(shù)語 65 單擊 快速按下鼠標(biāo)鍵 左或右鍵 然后快速抬起 雙擊 快速操作兩次單擊 拖動 由三部分動作組成 按下鼠標(biāo)左鍵選擇對象 移動鼠標(biāo) 將被選的對象移動到指定位置后抬起鼠標(biāo) 選擇 用鼠標(biāo)的光標(biāo)選中某種選擇 使對象產(chǎn)生光標(biāo) 選擇對象并不意味著動作 只是標(biāo)記要操作的對象和點位 66 鍵 單擊 按下特殊的鍵和單擊鼠標(biāo)鍵同時進(jìn)行 如 Shift 單擊 意思是按下 Shift 鍵和單擊鼠標(biāo)鍵 鍵 拖動 按下特殊的鍵和鼠標(biāo)鍵 移動鼠標(biāo) 如 Shift 拖動 意思是按下 Shift 鍵和拖動鼠標(biāo)光標(biāo) 67 示例1 阿司匹林的結(jié)構(gòu) 68 優(yōu)化結(jié)構(gòu) CleanUpStructure 旋轉(zhuǎn)和縮放 圖形存盤 粘貼至word或ppt 檢查結(jié)構(gòu)錯誤 CheckStructure 69 示例2 根據(jù)化合物名稱得到結(jié)構(gòu)式 Structure ConvertNametoStructure InsertStructure 輸入 阿司匹林可輸入2 acetoxybenzoicacid或aspirinEDTA 嗎啡morphine 70 示例3 根據(jù)結(jié)構(gòu)得出化合物命名 繪制腎上腺素的結(jié)構(gòu)式 選中結(jié)構(gòu) 執(zhí)行 sturucture convertstructuretoname 71 將名稱轉(zhuǎn)化成結(jié)構(gòu) 72 示例 三肽分子的繪制 73 示例4 預(yù)測核磁共振化學(xué)位移 心得安結(jié)構(gòu)式 74 1HNMR預(yù)測 1HNMR位移 75 1HNMR預(yù)測結(jié)果 76 預(yù)測結(jié)果 77 13CNMR預(yù)測 13CNMR位移 78 13CNMR預(yù)測結(jié)果 79 部分預(yù)測結(jié)果 80 H NMR C NMR 81 示例5 分析結(jié)構(gòu)估計性質(zhì) 82 83 分析結(jié)果窗口 分子式 精確質(zhì)量 分子量 質(zhì)譜分析 元素分析 結(jié)果粘貼 兩位小數(shù) 質(zhì)譜圖 84 示例6 顯示分子化學(xué)性質(zhì) 85 86 View ShowChemicalPropertiesWindow 菜單 87 示例6 反應(yīng)方程式 88 選擇 點位 拖動 定位 單擊 單擊 定位 單擊生成雙鍵 拖動生成雙鍵 反應(yīng)方程式 89 雙擊生成文本框 輸入字母 按Ctrl鍵 拖動復(fù)制 反應(yīng)方程式 90 反應(yīng)方程式 定位 單擊生成一單鍵 再定位 連續(xù)單擊生成三單鍵 定位 雙擊后輸入OH 91 反應(yīng)方程式 用套索或蓬罩進(jìn)行部分選擇 92 反應(yīng)方程式 按Ctrl鍵 拖動復(fù)制 生成獨(dú)立的兩個分子 93 反應(yīng)方程式 選擇反應(yīng)箭頭 在兩個分子中單擊生成一反應(yīng)箭頭 94 反應(yīng)方程式 箭頭上方建立文本框 輸入反應(yīng)條件 95 反應(yīng)方程式 選擇電荷 定位 添加負(fù)電荷 96 反應(yīng)方程式 選擇居中 分子下方建立文本框 97 反應(yīng)方程式 依次輸入文本信息 98 反應(yīng)方程式 選擇陰影框 將反應(yīng)方程式全部罩上 99 練習(xí) 繪制化學(xué)反應(yīng)式 100 示例7 繪制中間體結(jié)構(gòu) 101 繪制中間體結(jié)構(gòu) 選擇環(huán)己烷以建立六員環(huán)模型 選擇橡皮 擦去六員環(huán)一部 102 繪制中間體結(jié)構(gòu) 選擇單鍵定位 連續(xù)單擊生成新的單鍵 單擊單鍵中央 生成雙鍵 103 繪制中間體結(jié)構(gòu) 在原子上定位建立標(biāo)記 104 繪制中間體結(jié)構(gòu) 選擇筆工具 在曲線菜單中選擇箭頭位于末端 105 繪制中間體結(jié)構(gòu) 定位拖動鼠標(biāo)左鍵 定位單擊生成曲線箭 按Esc鍵退出繪制模式 106 單擊箭頭 繪制中間體結(jié)構(gòu) 用小手形光標(biāo)移動造另一虛線 107 小手形光標(biāo)選中虛線柄 繪制中間體結(jié)構(gòu) 拖動改變虛線箭形狀 按Esc鍵 108 示例8 復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu) 109 示例8 復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu) 選擇環(huán)己烷 并添加第一個環(huán) 添加第二個環(huán) 110 復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu) 橡皮擦去多余部分 111 復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu) 選擇鍵工具 單擊生成新的單雙鍵 112 復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu) 在原子上定位建立標(biāo)記 113 示例9 Fischer葡萄糖結(jié)構(gòu)圖 114 Fischer葡萄糖結(jié)構(gòu)圖 選擇鍵工具 連續(xù)單擊生成五連鍵 115 Fischer葡萄糖結(jié)構(gòu)圖 建立與五連鍵垂直的水平鍵 116 Fischer葡萄糖結(jié)構(gòu)圖 在原子上定位建立標(biāo)記 117 示例10 透視圖形 118 透視圖形 選擇環(huán)己烷 旋轉(zhuǎn)環(huán)己烷 在原子上定位建立標(biāo)記 旋轉(zhuǎn)指示箭頭 119 透視圖形 添加垂直鍵 按Alt鍵 任意鍵長 120 透視圖形 選擇套索工具 陰影右下腳按Shift鍵 向上按動 垂直壓縮50 121 透視圖形 在原子上定位建立標(biāo)記 122 透視圖形 選擇黑體楔鍵 單擊下部兩側(cè)鍵的中央 123 透視圖形 選擇黑體鍵 單擊底鍵的中央 124 六 Newman結(jié)構(gòu) 125 六 Newman結(jié)構(gòu) 選擇鍵工具 連續(xù)單擊生成三鍵對稱結(jié)構(gòu) 按Ctrl鍵 拖動復(fù)制 126 六 Newman結(jié)構(gòu) 選擇鍵工具 按住Alt鍵 連接兩個結(jié)構(gòu) 127 六 Newman結(jié)構(gòu) 選擇軌道工具 定位中心原子 按住Alt鍵 按下鼠標(biāo)鍵 向外按動建立軌道 128 六 Newman結(jié)構(gòu) 部分選擇上面分結(jié)構(gòu) 右上腳雙擊旋轉(zhuǎn)柄 對話框中輸入180 單擊旋轉(zhuǎn) 129 六 Newman結(jié)構(gòu) 從Object菜單選擇BringtoFront命令 130 六 Newman結(jié)構(gòu) 后面結(jié)構(gòu)移至前面 按Esc鍵 添加陰影框 131 七 立體化學(xué) 132 七 立體化學(xué) 133 七 立體化學(xué) 134 七 立體化學(xué) 135 七 立體化學(xué) 136 反應(yīng)裝置 示例11 實驗裝置 137 示例12 薄層色譜圖 薄層色譜圖 138 示例13 質(zhì)譜碎片 基團(tuán)分割工具 139 基團(tuán)分割鍵 140 繪制完結(jié)構(gòu)后 在ChemF網(wǎng)站查找相關(guān)信息 ChemDraw在線信息 141 該化合物的相關(guān)數(shù)據(jù) 壬二酸 142 該化合物的供應(yīng)商查詢 143 兩個查詢結(jié)果 144 化合物名稱 化合物其它名稱 145 索取詳細(xì)資料 146 詳細(xì)資料展示