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外周血檢測指導(dǎo)下的個體化治療2013年07月26日08:19來源:中國醫(yī)學(xué)論壇報窗體頂端 窗體底端目前在實踐中,反復(fù)進行組織活檢無論在倫理還是實際操作上均有一定難度。故利用外周血建立分子檢測體系有重要的意義。目前大家不僅致力于外周血單一基因檢測,更探尋利用外周血進行全基因組或外顯子組分析以指導(dǎo)個體化治療的可行性。在本文中,北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院的王潔教授總結(jié)了今年美國臨床腫瘤學(xué)會(ASCO)會議及近期文獻(xiàn)上相關(guān)研究報道,以饗讀者。外周血基因檢測指導(dǎo)下的個體化治療 意義何在?靶向藥物的問世為逆轉(zhuǎn)腫瘤進程提供了可能。尤其是表皮生長因子受體酪氨酸激酶抑制劑(EGFR-TKI)治療為EGFR突變型晚期非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者帶來療效、無進展生存(PFS)時間及生活質(zhì)量的顯著改善,已成為肺癌靶向治療的經(jīng)典。但在實踐中,幾乎所有EGFR突變者均難逃因獲得性耐藥而治療失敗的命運,耐藥是限制靶向治療成為肺癌治愈性手段的瓶頸。現(xiàn)有證據(jù)表明多數(shù)腫瘤內(nèi)存在各種亞克隆即遺傳異質(zhì)性。所謂的臨床獲得性耐藥并非是在治療過程中細(xì)胞水平的耐藥產(chǎn)生,而是預(yù)先存在的腫瘤內(nèi)克隆異質(zhì)性對治療選擇性壓力的反應(yīng)。近期國內(nèi)外系列研究表明,應(yīng)用初治前的組織標(biāo)本行分子檢測試圖指導(dǎo)整個治療過程的策略對部分患者并不合適,重復(fù)活檢進行實時基因分析才能更精準(zhǔn)地反映治療過程中細(xì)胞內(nèi)各亞克隆的動態(tài)變化。然而在實踐中,反復(fù)進行組織活檢無論在倫理還是實際操作上均存在一定難度。因此,利用外周血(游離DNA、循環(huán)腫瘤細(xì)胞等)建立實時、動態(tài)、無創(chuàng)、定量的分子檢測體系有重要的意義。目前國際上有多個課題組不僅致力于外周血單一基因的檢測,更探尋利用外周血游離DNA或循環(huán)腫瘤細(xì)胞行全基因組/外顯子組分析以指導(dǎo)個體化治療的可行性。外周血游離DNA EGFR-TKI基因突變的定性、定量檢測腫瘤患者外周血中存在因瘤細(xì)胞凋亡、壞死而釋放的游離DNA,是非腫瘤患者的10倍。其遺傳學(xué)特征與腫瘤細(xì)胞相同。國內(nèi)外多項回顧性研究顯示,若以組織標(biāo)本檢測為金標(biāo)準(zhǔn),晚期患者外周血EGFR突變檢測的特異性為90%100%,敏感性為60%82%,二者的一致性為60%80%,且與TKI的療效和PFS相關(guān)。在今年ASCO會上報告的前瞻性隨機多中心臨床研究FASTACT 2的回顧性血漿DNA EGFR突變分析結(jié)果表明,以外周血為基礎(chǔ)的基因檢測指導(dǎo)個體化治療指日可待。在427例可用于分析的血漿標(biāo)本中,32%為EGFR突變陽性。其中224例有配對組織標(biāo)本,血漿檢測的敏感性為77%,特異性為96%,EGFR活化突變陽性、陰性預(yù)測價值分別為93%和86%。兩種標(biāo)本的一致性為88% 。此數(shù)據(jù)與筆者既往研究非常接近。尤其重要的是,該研究顯示血漿DNA EGFR突變對生存時間的預(yù)測與組織突變者高度一致。突變患者接受厄洛替尼與化療聯(lián)合治療的無病生存時間和中位生存時間長于單純化療組。而野生型患者無顯著差異。這些結(jié)果表明,外周血EGFR突變的假陽性率低,臨床上一旦檢測結(jié)果陽性,可指導(dǎo)EGFR-TKI的選擇;檢測結(jié)果陰性,則可能為假陰性。未來研究將致力于提高外周血EGFR突變檢測的敏感性和對治療預(yù)測的準(zhǔn)確性。同時,基于目前的研究均為回顧性多中心或單中心研究,開展前瞻性多中心研究迫在眉睫。只有如此,才能改寫我們的治療指南。除EGFR敏感性突變外,外周血耐藥基因,如T790M、KRAS突變的檢測研究亦風(fēng)生水起。雖然相較于EGFR突變,外周血耐藥基因檢測的研究尚需更多探索,但敏感及耐藥多基因平行檢測體系更能反映治療過程中異質(zhì)性肺癌各克隆間的動態(tài)改變規(guī)律。同時,腫瘤異質(zhì)性及治療壓力選擇下的動態(tài)改變特點亦表明,在個體化治療的時代,單純定性檢測T790M等單一基因突變遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠,實現(xiàn)定量、動態(tài)、尤其無創(chuàng)的耐藥基因檢測才能指導(dǎo)更為精準(zhǔn)的個體化治療。血漿游離DNA基因組分析的研究進展腫瘤是基因組疾病,故單一基因檢測難以滿足指導(dǎo)個體化治療的需要。近期多項研究利用二代測序技術(shù)分析了血漿游離DNA基因組、外顯子組改變與治療療效的關(guān)系。例如近期發(fā)表于自然(Nature)的英國劍橋大學(xué)癌癥中心研究,分析了治療過程中6例乳腺癌、卵巢癌、肺癌患者外周血游離DNA外顯子組、尤其相關(guān)基因深度測序變化與耐藥的關(guān)系。對每位患者在治療過程中行25次血標(biāo)本分析,結(jié)果定量分析血漿中等位基因片段有助于發(fā)現(xiàn)耐藥相關(guān)基因。例如紫杉醇治療過程中PI3KCA突變率增高,鉑類治療中的RB1突變,他莫昔芬、曲妥珠單抗治療中MED1的突變增加,隨后拉帕替尼治療后出現(xiàn)的剪切變異GAS6,肺癌患者TKI耐藥中出現(xiàn)的T790M突變。這些結(jié)果表明,外周血游離DNA外顯子組分析作為侵襲性活檢組織的替代,能發(fā)現(xiàn)耐藥相關(guān)基因改變,監(jiān)測治療過程。另一組發(fā)表于新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志(N Engl J Med)的研究對30例晚期乳腺癌治療過程中動態(tài)獲取的外周血游離DNA進行全基因組測序,發(fā)現(xiàn)游離DNA全基因組測序是更敏感的可預(yù)測療效的分子事件。而在ASCO會議上報告的一組大樣本研究則探討了利用外周血游離DNA染色體不穩(wěn)定與拷貝數(shù)變異(CNV)作為乳腺癌標(biāo)志物的可行性。循環(huán)腫瘤細(xì)胞深度測序分析的研究進展循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)是有關(guān)外周血分子標(biāo)志物研究的另一焦點。其作為完整的、無損傷的腫瘤細(xì)胞,能反映腫瘤的轉(zhuǎn)移、耐藥、進展等過程。既往的研究更多聚焦于乳腺癌、前列腺癌、腸癌治療前后CTC的數(shù)量或單一基因如HER2等的變化與療效、預(yù)后的關(guān)系。而肺癌CTC的研究滯后于上述幾種腫瘤,主要涉及數(shù)量變化的預(yù)測意義。近期美國哈佛大學(xué)有學(xué)者分析了CTC的上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)與乳腺癌化療或靶向治療的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)CTC中EMT比例升高者對治療的反應(yīng)劣于上皮標(biāo)志物表達(dá)高的患者。而對于大部分腫瘤,微量的CTC是進行基因組分析的最大挑戰(zhàn)。近期筆者課題組與哈佛大學(xué)和北京大學(xué)生命研究科學(xué)院的謝曉亮教授合作,進行了晚期肺癌CTC單細(xì)胞基因組和外顯子組分析,試圖探尋腫瘤靶向治療耐藥、轉(zhuǎn)移、甚至表型轉(zhuǎn)化的機制。初步結(jié)果顯示,CTC中外顯子組突變的異質(zhì)性雖然明顯,但與腫瘤耐藥或表型轉(zhuǎn)化相關(guān)的基因在CTC中富集。尤其是同一患者不同CTC間的拷貝數(shù)變異(CNV)有高度可重復(fù)性,不同患者CTC在某些特定染色體區(qū)域亦存在高度可重復(fù)性的CNV,因此認(rèn)為CNV可能是轉(zhuǎn)移的重要和必備的分子基礎(chǔ)。進一步的研究仍在繼續(xù)中。小結(jié)綜上,外周血EGFR突變檢測指導(dǎo)下的EGFR-TKI治療成為臨床常規(guī)已僅有一步之遙。我們需要前瞻性數(shù)據(jù)證實并提高檢測的敏感度。外周血游離DNA或CTC的全基因組
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