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生物化學(xué)部分(一)細(xì)胞的化學(xué)成分 水、無(wú)機(jī)鹽、糖類、脂類、蛋白質(zhì)、核酸、酶、維生素和輔酶(一)水:結(jié)合水、自由水 ;自由水比例增加時(shí),代謝活躍;結(jié)合水含量增加,代謝下降,細(xì)胞和生物體的抗寒、抗熱、抗旱性則會(huì)提高。(二) 無(wú)機(jī)鹽1、構(gòu)成組織或生物體某些復(fù)雜化合物的重要組成成分2、對(duì)細(xì)胞的滲透壓和pH值起著重要的調(diào)節(jié)作用3、參與調(diào)節(jié)生物體的代謝活動(dòng) (三)糖類(單糖、寡糖、多糖、糖復(fù)合物) 1、單糖1) 單糖是最簡(jiǎn)單的糖,不能被水解為更小的單位。單糖通常含有3、4、5、6或7個(gè)碳原子,分別稱為丙糖、丁糖、戊糖、已糖和庚糖。天然存在的單糖一般都是D-構(gòu)型。單糖分子既可以開(kāi)連形式存在,也可以環(huán)式結(jié)構(gòu)形式存在,在環(huán)式結(jié)構(gòu)中如果第一位碳原子上的OH與第二位碳原子的-OH在環(huán)的同一面,稱為-型;如果-OH是在環(huán)的兩面,稱-型。(2)生物體中重要的單糖 丙糖 如甘油醛(醛糖)和二羥丙酮(酮糖) 戊糖 戊糖中最重要的有核糖(醛糖)、脫氧核糖(醛糖)和核酮糖(酮糖) 己糖 葡萄糖、果糖和半乳糖 2、寡糖:最多的寡糖是雙糖,如麥芽糖、蔗糖、纖維二糖、乳糖 3、多糖(1)淀粉 直鏈淀粉是-D-葡萄糖基以-1,4-苷連接的多糖鏈,其空間構(gòu)象卷曲成螺旋形,每一回轉(zhuǎn)為6個(gè)葡萄糖基。支鏈淀粉分子中除有-1.4-糖苷鍵的糖鏈外,還有-1,6-糖苷鍵連接的分支處,每個(gè)分支平均含2030個(gè)葡萄糖基。淀粉有呈色反應(yīng),直鏈淀粉遇碘呈為藍(lán)色,支鏈淀粉遇碘呈為紫紅色。 (2)糖原 -D-葡萄糖基以-1,4-糖苷鍵連接而成的,但糖原的分支比支鏈淀粉多,糖原遇碘變?yōu)榧t褐色(3)纖維素 由-D-葡萄糖基借-1,4-糖苷鍵連接的沒(méi)有分支的同多糖。 (4)幾丁質(zhì)(甲殼素) 昆蟲(chóng)和甲殼類外骨骼的主要成分為幾丁質(zhì),是N-乙酰-D-氨基葡萄糖以-1,4-糖苷鍵縮合成的同多糖。(5)糖胺聚糖(粘多糖) 是一種由重復(fù)的二糖單位組成的線狀多聚物。二糖重復(fù)單位中,一種為N-乙酰-D-葡糖胺或N-乙酰-D-半乳糖胺,而另一種是D-葡萄糖醛酸。一些糖胺聚糖中,一個(gè)或多個(gè)羥基被硫酸酯化。糖胺聚糖主要有透明質(zhì)酸、硫酸軟骨素、硫酸皮膚素、硫酸角質(zhì)素、肝素以及硫酸乙酰肝素。(四)脂類不溶于水,但能溶于非極性有機(jī)溶劑; O元素含量低,C、H元素含量高 ,徹底氧化后可以放出更多能量 1、三酰甘油(脂肪) 天然脂肪酸都是L-型 ;動(dòng)物脂肪大多富含飽和脂肪酸,在室溫下為固態(tài),植物油含大量油酸和亞油酸,在室溫下為液態(tài) ;哺乳動(dòng)物和人,亞油酸和亞麻酸為必需脂肪酸 (不飽和脂肪酸)2、磷脂(甘油磷脂) 磷脂酸是最簡(jiǎn)單的磷脂,分子中的H為膽堿、膽胺、絲氨酸所取代,則分別成為卵磷脂、腦磷脂,絲氨酸磷脂等。通常磷脂分子中的2個(gè)脂肪酸總有一個(gè)是不飽和的,因此2個(gè)脂肪酸鏈不是平行并列的,其中一個(gè)(不飽和脂肪酸)總是有折彎。 3、類固醇:基本結(jié)構(gòu)是環(huán)戊烷多氫菲。最熟知的是膽固醇,膽固醇是動(dòng)物膜和神經(jīng)髓鞘的主要成份。性激素、維生素D和腎上腺皮質(zhì)激素也都屬于類固醇。 4、萜類:由不同數(shù)目的異戊二烯連接而成的分子。維生素A(視黃醇)、維生素E、維生素K、類胡蘿卜素都是萜類。-類胡蘿卜素裂解就成2個(gè)維生素A,維生素A可氧化成視黃醛,對(duì)動(dòng)物感光活動(dòng)有重要作用。5、蠟:由高碳脂肪酸和高碳醇或固醇所形成的脂,它存在于皮膚、毛皮、羽毛、樹(shù)葉、昆蟲(chóng)外骨骼中,起保護(hù)作用。(五)蛋白質(zhì)1、蛋白質(zhì)的原元素組成:氮的含量在多種的蛋白質(zhì)比較接近,平均為16%,因此用凱氏(kjelahl)法定N,受檢物質(zhì)中含蛋白質(zhì)量為N含量的6。25倍 。 2、蛋白質(zhì)的氨基酸組成(1)氨基酸的結(jié)構(gòu)天然蛋白質(zhì)中存在的氨基酸都是L-a-氨基酸 (2)氨基酸的分類:根據(jù)R基因極性不同,氨基酸可分為:非極性氨基酸(9種);極性不帶電荷氨基酸(6種);極性帶負(fù)電荷氨基酸(2種);極性帶正電荷氨基酸(3種) 必需氨基酸和非必需氨基酸:必需氨基酸包括亮氨酸、異亮氨酸、纈氨酸、蘇氨酸、蛋氨酸、色氨酸、賴氨酸、苯丙氨酸等8種。精氨酸和組氨酸為半必需氨基酸(3)氨基酸的主要理化性質(zhì)一般的物理性質(zhì):-氨基酸呈無(wú)色結(jié)晶,熔點(diǎn)高,一般在2000C以上。易溶于酸、堿,但不溶于有機(jī)溶劑。 兩性解離和等電點(diǎn)等電點(diǎn)某一氨基酸處于凈電荷為零的兼性離子狀態(tài)時(shí)的介質(zhì)pH,用pl表示中性氨基酸的羧基解離程度大于氨基,故其pI偏酸,pI值略小于7.0;酸性氨基酸的羧基解離程度更大,pI明顯小于7.0;堿性氨基酸的氨基解離程度明顯大于羧基等,故其pI大于7.0;在一定的pH條件下,氨基與羧基的解離程度相等,靜電荷為零,此時(shí)溶液的pH即為其等電點(diǎn)。紫外吸收光譜:色氨酸最大吸收波長(zhǎng)為279nm,酪氨酸最大吸收波長(zhǎng)278nm,苯丙氨酸最大吸收波長(zhǎng)為259nm重要的化學(xué)反應(yīng):a-氨基能與茚三酮反應(yīng)產(chǎn)生藍(lán)紫色沉淀(脯氨酸和羥脯氨酸則產(chǎn)生黃色沉淀);a-氨基可與亞硝酸反應(yīng)產(chǎn)生氮?dú)猓?jì)算出氨基酸的量;a-氨基還很容易與2,4-二硝基氟苯(DNFB)生成2,4-二硝基氟苯氨基酸(DNP-氨基酸),a-氨基還可以與異硫氰酸苯脂(PITC)反應(yīng)最后產(chǎn)生苯硫乙內(nèi)酰硫脲衍生物(PTH)。一些氨基酸的R基團(tuán)能與特殊的試劑發(fā)生呈色反應(yīng)。3、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu) 3、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu) 1)一級(jí)結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)又稱為初級(jí)結(jié)構(gòu)或化學(xué)結(jié)構(gòu),是指蛋白質(zhì)分子內(nèi)氨基酸的排列順序 (2)二級(jí)結(jié)構(gòu):指多肽鏈本身繞曲折疊成有規(guī)律的結(jié)構(gòu)或構(gòu)象。這種結(jié)構(gòu)是以肽鏈內(nèi)或肽鏈間的氫鍵來(lái)維持的。-螺旋 :多肽鏈中氨基酸殘基以1000的角度圍繞螺旋軸心盤(pán)旋上升,每3.6個(gè)殘基就旋轉(zhuǎn)一圈,螺距為0.54nm;右手旋轉(zhuǎn);多肽鏈內(nèi)的氫鍵由肽鏈中一個(gè)肽鍵的-CO的氧原子與第四個(gè)肽鍵的-NH的氫原子組成,每個(gè)氫鍵所形成的環(huán)內(nèi)共有13個(gè)原子,這種螺旋稱為3.613(角、羊毛等成分都是此螺旋的 纖維蛋白)-折疊 :平行式、反平行式。鄰近兩鏈以相反或相同方向平行排列成片層狀。兩個(gè)氨基酸殘基之間的軸心距離為0.35nm,-折疊結(jié)構(gòu)的氫鍵是由兩條肽鏈中的一條的-CO基與另一條-NH基之間所形成。(蠶絲、蛛絲)-轉(zhuǎn)角 蛋白質(zhì)分子的多肽鏈上經(jīng)常出現(xiàn)1800的回折,在這種肽鏈的回折角上就是轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu),它是由第一個(gè)氨基酸殘基的-CO與第四個(gè)氨基酸殘基的-NH之間形成氫鍵。自由回轉(zhuǎn) 是指沒(méi)有一定規(guī)律的松散結(jié)構(gòu),酶的功能部位常常處于這種構(gòu)象區(qū)域里。(4)三級(jí)結(jié)構(gòu):維持三級(jí)結(jié)構(gòu)的作用力主要是一些次級(jí)鍵,包括氫鍵、鹽鍵、疏水鍵和范德華力等。 (5)四級(jí)結(jié)構(gòu):具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的亞單位通過(guò)氫鍵、鹽鍵、疏水鍵和范德華力等弱作用力聚合而成的特定構(gòu)象。 維系蛋白質(zhì)分子的一級(jí)結(jié)構(gòu):肽鍵、二硫鍵 維系蛋白質(zhì)分子的二級(jí)結(jié)構(gòu):氫鍵 維系蛋白質(zhì)分子的三級(jí)結(jié)構(gòu):疏水相互作用力、氫鍵、范德華力、鹽鍵 維系蛋白質(zhì)分子的四級(jí)結(jié)構(gòu):范德華力、鹽鍵a鹽鍵(離子鍵 ) b氫鍵 c疏水相互作用力 d 范德華力 e二硫鍵 f 酯鍵3、蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)(1)膠體性質(zhì) :布朗運(yùn)動(dòng)、丁達(dá)爾現(xiàn)象、不能通過(guò)半透膜;蛋白質(zhì)顆粒比較穩(wěn)定,不易沉淀 (2)兩性電解質(zhì) (3)沉淀反應(yīng):破壞蛋白質(zhì)的水膜及中和蛋白質(zhì)的電荷出現(xiàn)沉淀現(xiàn)象。高濃度鹽類(如硫酸銨、硫酸鈉、氯化鈉等,稱為鹽析),有機(jī)溶劑(如酒精、丙酮),重金屬鹽(如硝酸銀、醋酸鉛、三氯化鐵等),某些酸類(如苦味酸、單寧酸等)。(4)變性 :使其分子的空間結(jié)構(gòu)改變,導(dǎo)致其理化性質(zhì)、生物活性都發(fā)生改變。不發(fā)生一級(jí)結(jié)構(gòu)的破壞;而主要發(fā)生氫鍵、疏水鍵的破壞。生物活性喪失,溶解度降低。化學(xué)因素有強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、重金屬離子、尿素、酒精、丙酮等;物理因素有加熱震蕩或攪拌、超聲波、紫外線及X射線照射等。(5)紫外吸收: 280nm的紫外光下,有最大吸收峰。是由于肽鏈中酪氨酸和色氨酸的R-基團(tuán)引起的。 4、蛋白質(zhì)的分類 (1)蛋白質(zhì)的化學(xué)分類 : 簡(jiǎn)單蛋白質(zhì)和結(jié)合蛋白質(zhì) (1)色蛋白:由簡(jiǎn)單蛋白與色素物質(zhì)結(jié)合而成。如血紅蛋白、葉綠蛋白和細(xì)胞色素等。(2)糖蛋白:由簡(jiǎn)單蛋白與糖類物質(zhì)組成。如細(xì)胞膜中的糖蛋白等。(3)脂蛋白:由簡(jiǎn)單蛋白與脂類結(jié)合而成。 如血清a-,b-脂蛋白等。(4)核蛋白:由簡(jiǎn)單蛋白與核酸結(jié)合而成。如細(xì)胞核中的核糖核蛋白等。(5)色蛋白:由簡(jiǎn)單蛋白與色素結(jié)合而成。如血紅素、過(guò)氧化氫酶、細(xì)胞色素c等。(6)磷蛋白:由簡(jiǎn)單蛋白質(zhì)和磷酸組成。如胃蛋白酶、酪蛋白、角蛋白、彈性蛋白、絲心蛋白等(2)蛋白質(zhì)的功能分類 結(jié)構(gòu)蛋白、收縮蛋白、貯藏蛋白、防御蛋白、轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白、信號(hào)蛋白和酶 (五)核酸1、核酸的組成成分(1)戊糖:-D-核糖和 -D-2-脫氧核糖,都是-呋喃型的。(3)核苷:戊糖C-1的羥基與嘧啶堿N-1或嘌呤堿N-9上的氫縮合連接成共價(jià)的-N-糖苷鍵。5-核糖尿嘧啶,是C-1是與尿嘧啶的第5個(gè)碳原子相連,假尿苷,用符號(hào) 表示。(為C-C連接)4)核苷酸:核苷酸是核苷的磷酸酯。2-、3-和5-核苷酸。3-和5-脫氧核苷酸。生物體內(nèi)的游離核苷酸多為5-核苷酸5)體內(nèi)重要的游離核苷酸及其衍生物5-核苷二磷酸類及5-核苷三磷酸類:ATP供能,GTP是蛋白質(zhì)合成過(guò)程中所需要的,而dATP、dGTP、dTTP和dCTP則是DNA合成所需要的原材料 環(huán)狀核苷酸:5環(huán)狀腺苷酸(cAMP) 2、核酸的結(jié)構(gòu)(1)DNA的結(jié)構(gòu)一級(jí)結(jié)構(gòu):3,5-磷酸二酯鍵 二級(jí)結(jié)構(gòu) A、分子由兩條多脫氧核苷酸鏈反向平行(一條鏈?zhǔn)?,5,,另一條鏈為5,3,), 圍繞著同一個(gè)軸,右手盤(pán)旋成一個(gè)右平行螺旋結(jié)構(gòu),螺旋的直徑為2nm;B、磷酸和脫氧核糖在螺旋體的外側(cè),通過(guò)磷酸二酯鍵連結(jié)形成DNA分子的骨架;C、堿基對(duì)位于螺旋體內(nèi)側(cè),按A與T,C與G配對(duì),A-T對(duì)有2個(gè)氫鍵,C-G對(duì)有3個(gè)氫鍵,堿基平面與縱軸垂直,每個(gè)堿基對(duì)間相隔0.34nm旋轉(zhuǎn)方向相差360,因此繞中心軸每旋轉(zhuǎn)一圈有10個(gè)核苷酸,每隔3.4nm重復(fù)出現(xiàn)同一結(jié)構(gòu);D、螺旋表面有一條大溝和一條小溝,這兩條溝對(duì) DNA和蛋白質(zhì)的相互識(shí)別是很重要的。DAN雙螺旋結(jié)構(gòu)很穩(wěn)定,有3種化學(xué)鍵維持:互補(bǔ)堿基之間的氫鍵,堿基對(duì)之間的堿基堆集力,以及主鏈上帶負(fù)電的磷酸溶液陽(yáng)離子之間的離子鍵,其中堿基堆集力起主要作用。三級(jí)結(jié)構(gòu):DNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)是指雙螺旋DNA的扭曲或再螺旋。超螺旋是DNA三級(jí)結(jié)構(gòu)的基本形式(2)RNA的結(jié)構(gòu)一級(jí)結(jié)構(gòu)二級(jí)結(jié)構(gòu)三級(jí)結(jié)構(gòu) tRNA的三葉形的二級(jí)結(jié)構(gòu)變成三級(jí)結(jié)構(gòu)為倒L型,tRNA發(fā)揮生物功能以其倒L型三級(jí)結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ)。3、核酸的性質(zhì)1)一般理化性質(zhì):核酸既有磷酸基,又有堿性基團(tuán),是兩性電解質(zhì),因磷酸的酸性強(qiáng),通常表現(xiàn)為酸性。DNA為白色纖維狀固體,RNA為白色粉末,都微溶于水,不溶于一般有機(jī)溶劑,常用乙醇從溶液中沉淀核酸。D-核糖與濃鹽酸和苔黑酚(甲基間苯二酚)共熱產(chǎn)生綠色,D-2-脫氧核糖 與酸和二苯胺一同加熱產(chǎn)生藍(lán)紫色。(2)核酸的紫外吸收性質(zhì):核酸中的嘌呤和嘧啶環(huán)的共軛體系強(qiáng)烈吸收260290nm波段紫外光,最大吸收值在260nm處(3)核酸的變性和復(fù)性 分子雜交:在退火條件下,不同來(lái)源的DNA互補(bǔ)區(qū)形成氫鍵,或DNA單鏈和RNA鏈的互補(bǔ)區(qū)形成DNA-RNA雜合雙鏈的過(guò)程。探針:用放射性同位素或熒光標(biāo)記的DNA或RNA片段原位雜交技術(shù):直接用探針與菌落或組織細(xì)胞中的核酸雜交,未改變核酸所在的位置。點(diǎn)雜交:將核酸直接點(diǎn)在膜上,再與核酸雜交。Southern印跡法:將電泳分離后的DNA片段從凝膠轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上,再進(jìn)行雜交Northern印跡法:將電泳分離后的RNA吸印到纖維素膜上再進(jìn)行分子雜交。(六)酶1、酶促反應(yīng)的特點(diǎn) 2、酶的化學(xué)組成:?jiǎn)渭兠负徒Y(jié)合酶 3、酶的結(jié)構(gòu)特點(diǎn):必需基團(tuán) 、活性中心 (結(jié)合部位、催化部位 )(3)“鑰匙鎖”學(xué)說(shuō)和“誘導(dǎo)契合”學(xué)說(shuō)(4)使酶具有高催化效率的因素:鄰近定向效應(yīng)、 “張力”和“形變” 、酸堿催化 、共價(jià)催化 米氏方程 1913年,德國(guó)化學(xué)家Michaelis和Menten根據(jù)中間產(chǎn)物學(xué)說(shuō)對(duì)酶促反映的動(dòng)力學(xué)進(jìn)行研究,推導(dǎo)出了表示整個(gè)反應(yīng)中底物濃度和反應(yīng)速度關(guān)系的著名公式,稱為米氏方程。Km 米氏常數(shù)Vmax 最大反應(yīng)速度 米氏常數(shù)Km的意義: 由米氏方程可知,當(dāng)反應(yīng)速度等于最大反應(yīng)速度一半時(shí),即V = 1/2 Vmax, Km = S 上式表示,米氏常數(shù)是反應(yīng)速度為最大值的一半時(shí)的底物濃度。 因此,米氏常數(shù)的單位為mol/L。 不同的酶具有不同Km值,它是酶的一個(gè)重要的特征物理常數(shù)。 Km值只是在固定的底物,一定的溫度和pH條件下,一定的緩沖體系中測(cè)定的,不同條件下具有不同的Km值。 Km值表示酶與底物之間的親和程度:Km值大表示親和程度小,酶的催化活性低; Km值小表示親和程度大,酶的催化活性高。 2)六大酶類的特征 氧化還原酶:催化氧化還原反應(yīng)的酶。 反應(yīng)通式:AH2+B A+BH2 如琥珀酸脫氫酶、醇脫氫酶、多酚氧化酶

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