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蛋白質(zhì)分選的基本途徑與類(lèi)型,劉媛媛,蛋白質(zhì)的分選大體可分為兩條途徑: (1)后轉(zhuǎn)運(yùn):游離核糖體上合成的蛋白質(zhì)如用于催化代謝的酶類(lèi)、核蛋白、線粒體和葉綠體蛋白質(zhì)等。 (2)共轉(zhuǎn)運(yùn):在粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(ER)合成的蛋白質(zhì)如膜的整合蛋白、胞外分泌蛋白、構(gòu)成細(xì)胞器中的可溶性駐留蛋白等。,蛋白質(zhì)分選的類(lèi)型或機(jī)制的角度,可以分為四類(lèi):,(1)蛋白質(zhì)的跨膜轉(zhuǎn)運(yùn) (transmembrane transport) (2)膜泡運(yùn)輸(vesicular transport ) (3)選擇性的門(mén)控轉(zhuǎn)運(yùn)(gated transport ) (4)細(xì)胞質(zhì)機(jī)制中的蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn),一 蛋白質(zhì)的跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)(transmembrane transport) 主要是指細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)中合成的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、線粒體、質(zhì)體(包括葉綠體)和過(guò)氧化物酶體等細(xì)胞器的一種分選方式。,線粒體和葉綠體蛋白質(zhì)的運(yùn)轉(zhuǎn)與裝配,1)線粒體蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)與裝配 導(dǎo)肽(leader peptide):N端引導(dǎo)蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)的一段氨基酸序列。2080個(gè)氨基酸序列。特點(diǎn): (1)含有豐富的堿性氨基酸,特別是Arg; (2)羥基氨基酸如ser的含量很高; (3)幾乎不含酸性氨基酸; (4)可形成親水性和疏水性的螺旋結(jié)構(gòu);,分子伴侶(molecular chaperones):細(xì)胞中的一類(lèi)蛋白質(zhì),可以識(shí)別正在合成的多肽或部分折疊的多肽并與多肽的某些部位相結(jié)合,從而幫助這些多肽轉(zhuǎn)運(yùn)、折疊或裝配,但是其本身并不參與最終產(chǎn)物的形成。 大部分屬于熱休克蛋白(hsp)進(jìn)化上很保守,無(wú)專(zhuān)一性。,跨膜蛋白運(yùn)輸機(jī)制 布朗棘輪模型(Brownian rachet model):Simon 線粒體基質(zhì)Hsp70(mHsp70):轉(zhuǎn)運(yùn)發(fā)動(dòng)機(jī),2)葉綠體蛋白質(zhì)的運(yùn)送及裝配 轉(zhuǎn)運(yùn)肽(transit peptides):細(xì)胞質(zhì)中合成的葉綠體前體蛋白,在N端也含有一個(gè)額外的氨基酸序列。 目前研究的較多的是類(lèi)囊體膜和內(nèi)囊體腔中蛋白質(zhì)的運(yùn)送過(guò)程。如補(bǔ)光色素蛋白或稱(chēng)葉綠素a/b結(jié)合蛋白前體,其轉(zhuǎn)運(yùn)肽含有35個(gè)氨基酸殘基,引導(dǎo)其穿過(guò)葉綠體進(jìn)入基質(zhì),在基質(zhì)中由特異的蛋白酶加工切去轉(zhuǎn)運(yùn)肽成為成熟的蛋白質(zhì)。,A,B,二 膜泡運(yùn)輸(vesicular transport) 蛋白質(zhì)通過(guò)不同類(lèi)型的轉(zhuǎn)運(yùn)小泡從其粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)合成部位轉(zhuǎn)運(yùn)至高爾基體進(jìn)而分選至細(xì)胞的不同部位,其中涉及各種不同的定向轉(zhuǎn)運(yùn),及膜泡出芽與融合的過(guò)程。 目前發(fā)現(xiàn)三種不同類(lèi)型的有被小泡具有不同的物質(zhì)運(yùn)輸作用:網(wǎng)格蛋白有被小泡,COP有被小泡,COP有被小泡。,三 選擇性的門(mén)控轉(zhuǎn)運(yùn)(gated transport) 指在細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)中合成的蛋白質(zhì)通過(guò)核孔復(fù)合體選擇性的完成核輸入或從細(xì)胞核返回細(xì)胞質(zhì)基質(zhì); 核孔復(fù)合體主要由蛋白質(zhì)構(gòu)成,其總相對(duì)分子質(zhì)量約為125106,推測(cè)可能含有100余種不同的多肽,共1 000多個(gè)蛋白質(zhì)分子。,gp210:結(jié)構(gòu)性跨膜蛋白 p62:功能性的核孔復(fù)合體蛋白,具有兩個(gè)功能結(jié)構(gòu)域; 疏水性N端區(qū):可能在核孔復(fù)合體功能活動(dòng)中直接參與核質(zhì)交換; C端區(qū):可能通過(guò)與其它核孔復(fù)合體蛋白相互作用,從而將p62分子穩(wěn)定到核孔復(fù)合體上,為其N(xiāo)端進(jìn)行核質(zhì)交換活動(dòng)提供支持;,1)核孔復(fù)合體成分,2)核孔復(fù)合體功能 一種特殊的跨膜運(yùn)輸?shù)鞍讖?fù)合體,是一個(gè)雙功能、雙向性的親水性核質(zhì)交換通道。 雙功能:有兩種運(yùn)輸方式被動(dòng)運(yùn)輸與主動(dòng)運(yùn)輸; 雙向性:介導(dǎo)蛋白質(zhì)的入核轉(zhuǎn)運(yùn),介導(dǎo)RNA 、核糖核蛋白顆粒(RNP)的出核轉(zhuǎn)運(yùn)。,(1)親核蛋白(karyophilic protein) 在細(xì)胞質(zhì)內(nèi)合成后,需要或能夠進(jìn)入細(xì)胞核內(nèi)發(fā)揮功能的 一類(lèi)蛋白質(zhì); (2)核定位信號(hào) (nuclear localization signal, NLS) 親和蛋白的含有的特殊的氨基酸序列,具有定向定位作用的一段序列; (3)胞質(zhì)蛋白因子:importin/、Ran等。,3)親和蛋白質(zhì)入核轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制,核定位信號(hào) (nuclear localization signal)特點(diǎn), NLS是存在于親核蛋白內(nèi)的一些短的氨基酸序列片段,富含堿性氨基酸殘基,如Lys、Arg,此外還常含有Pro; NLS的氨基酸殘基片段可以是一段連續(xù)的序列(T抗原),也可以分成兩段,兩段之間間隔約10個(gè)氨基酸殘基(核質(zhì)蛋白); NLS序列可存在于親核蛋白的不同部位,在指導(dǎo)完成核輸入后并不被切除; NLS只是親核蛋白入核的一個(gè)必要條件而非充分條件 。,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA的核輸出,真核細(xì)胞中轉(zhuǎn)錄后的RNA通常需加工、修飾成為成熟的RNA分子后才能被轉(zhuǎn)運(yùn)出核。 (1)RNA聚合酶I轉(zhuǎn)錄的rRNA分子:以RNP的形式離開(kāi)細(xì)胞核,需要能量; (2)RNA聚合酶III轉(zhuǎn)錄的5s rRNA與 tRNA的核輸出由蛋白質(zhì)介導(dǎo);,(3)RNA 聚合酶II轉(zhuǎn)錄的hn RNA,在核內(nèi)進(jìn)行5端加帽和3端附加多聚A序列以及剪接等加工過(guò)程,然后形成成熟的mRNA出核,5端的m7GpppG“帽子”結(jié)構(gòu)對(duì)mRNA的出核轉(zhuǎn)運(yùn)是必要的;,細(xì)胞核中既有正調(diào)控信號(hào)保證mRNA的出核轉(zhuǎn)運(yùn),也有負(fù)調(diào)控信號(hào)防止mRNA的前體被錯(cuò)誤地運(yùn)輸,后者與剪接體(spliceosome)有關(guān)。 mRNA的出核轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程是有極性的,其5端在
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