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文檔簡介

ICS11.220

B41

團體標準

T/CVMAXXXXX—XXXX

貓細小病毒實時熒光RAA檢測方法

Real-timeRAAmethodfordetectionoffelineparvovirus

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XXXX-XX-XX發(fā)布XXXX-XX-XX實施

中國獸醫(yī)協(xié)會發(fā)布

XX/TXXXXX—XXXX

貓細小病毒實時熒光RAA檢測方法

1范圍

本文件規(guī)定了貓細小病毒實時熒光RAA檢測方法的要求。

本文件適用于貓細小病毒核酸檢測。

2規(guī)范性引用文件

下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,

僅該日期對應的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本

文件。

GB/T6682分析實驗室用水規(guī)格和試驗方法

GB19489實驗室生物安全通用要求

GB/T27401—2008實驗室質(zhì)量控制規(guī)范動物檢疫

3術(shù)語和定義

下列術(shù)語和定義適用于本文件。

3.1

實時熒光RAAReal-timeRAA

一種重組酶介導的等溫核酸快速擴增技術(shù)(簡稱RAA技術(shù))。利用從細菌或真菌中獲得的重組酶,

在恒溫下(一般37℃~42℃),該重組酶可與引物緊密結(jié)合,形成酶和引物的聚合體,在單鏈DNA結(jié)

合蛋白的幫助下,打開模板DNA的雙鏈結(jié)構(gòu),當引物在模板DNA上搜索到與之完全匹配的互補序列時,

在DNA聚合酶的作用下,形成新的DNA互補鏈,擴增產(chǎn)物以指數(shù)級增長。利用熒光探針的標記,隨著

RAA反應的進行,RAA產(chǎn)物與熒光信號的增長呈現(xiàn)對應關(guān)系。

3.2

Ct值cyclethreshold

每個反應管內(nèi)的熒光信號量達到設(shè)定的閾值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。

4符號和縮略語

下列縮略語適用于本文件。

RAA:重組酶介導的核酸擴增(recombinase-aidednucleicacidamplification)

DNA:脫氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid)

1

DB11/XXXXX—XXXX

PBS:磷酸鹽緩沖液(phosphatebufferedsaline)

FPV:貓細小病毒(felineparvovirus)

5試劑和材料

5.1試劑

5.1.1總則:除非另有說明,所用試劑均為分析純,試驗用水符合GB/T6682的要求。

5.1.2PBS緩沖液(0.01mol/LPBS,pH7.4):用800mL蒸餾水溶解8gNaCl,0.2gKCl,1.44gNa2HPO4

和0.24gKH2PO4,用HCl調(diào)節(jié)溶液的pH值至7.4,加水定容至1L,121℃高壓滅菌15min。

5.1.3DNA提取試劑盒。

5.1.4RAA反應預混液。

5.1.5引物和探針,其序列見附錄A。

5.1.6RAA熒光基礎(chǔ)反應單元:包含重組酶,單鏈結(jié)合蛋白,DNA聚合酶的凍干粉。

5.1.7280mmol/L乙酸鎂。

5.2耗材

5.2.1帶濾芯移液器吸頭(規(guī)格:10μL、20μL、200μL和1000μL)。

5.2.21.5mL滅菌離心管。

5.2.30.2mLPCR光學反應管。

5.2.4冰盒(?20℃以下預冷)。

6儀器設(shè)備

6.1微量移液器(量程:0.5μL~10μL、2μL~20μL、20μL~200μL和200μL~1000μL)。

6.2冰箱(2℃~8℃和?20℃以下)。

6.3高速冷凍離心機。

6.4實時熒光PCR儀或恒溫熒光基因檢測儀。

7樣品的采集與處理

7.1總則

實驗室生物安全要求按照GB19489的規(guī)定。

7.2采樣工具

非抗凝真空采血管、無菌棉拭子、5mL滅菌離心管、滅菌剪刀、組織研磨器。

7.3樣品采集

7.3.1血清樣品采集

用非抗凝真空采血管采集全血。

7.3.2糞便或肛拭子樣品采集

2

XX/TXXXXX—XXXX

用無菌棉拭子采集貓新鮮糞便,或插入肛門轉(zhuǎn)圈3~4次采集肛拭子,將拭子放入5mL滅菌離心管

中,加入2mLPBS緩沖液,浸泡20min~30min。

7.3.3腸道等組織樣品采集

無菌采集貓腸道等組織樣品,放入5mL滅菌離心管中。

7.4樣品保存和運輸

采集的樣品可立即用于檢測。不能立即檢測的樣品,在2℃~8℃下保存應不超過24h,-18℃及以

下可以穩(wěn)定保存3個月,-70℃及以下可長期保存。樣品運送采用低溫保存進行運輸,并在規(guī)定溫度下

的保存期內(nèi)送達實驗室。

7.5樣品處理

7.5.1血清樣品處理

采集的樣品室溫靜置30min~60min,全血采用4000r/min離心5min,吸取1mL上清液至1.5mL滅

菌離心管內(nèi)備用。

7.5.2糞便或肛拭子樣品處理

采集的樣品振蕩、擠干拭子,浸泡液采用5000r/min離心10min,吸取1mL上清液至1.5mL滅

菌離心管內(nèi)備用。

7.5.3腸道等組織樣品處理

取1g組織樣品,剪碎,加入2mLPBS緩沖液,勻漿研磨制成懸液,反復凍融3次,5000r/min

離心10min,吸取1mL上清液至1.5mL滅菌離心管內(nèi)備用。

7.5.4細胞培養(yǎng)上清液處理

細胞培養(yǎng)上清液2000r/min離心5min,吸取1mL上清液至1.5mL滅菌離心管內(nèi)備用。

8實時熒光RAA操作程序

8.1DNA提取

8.1.1采用DNA提取試劑盒提取各類樣本中的病毒核酸,或用自動化核酸提取儀提取各類樣本中的

病毒核酸。如在2h內(nèi)檢測可將提取的核酸置于冰上保存,否則應置于-20℃冰箱保存。

8.1.2每次抽提核酸,應至少包括一個陽性對照和一個陰性對照。陽性對照樣品應為FPV核酸陽性樣

本(血清、糞便、肛拭子、腸道等組織或細胞培養(yǎng)上清液);陰性對照樣品應為去離子水或者FPV核

酸陰性樣本(血清、糞便、肛拭子、腸道等組織或細胞培養(yǎng)上清液)。

8.2實時熒光RAA檢測

8.2.1反應體系的配制

在試劑配制區(qū)進行。每個樣品配制43μL熒光RAA反應混合液,包括:RAA預混液25μL、正向引物

FPV-F(10μmol/L)2.1μL、反向引物FPV-R(10μmol/L)2.1μL、探針FPV-P(10μmol/L)0.6μL、去

3

DB11/XXXXX—XXXX

離子水13.2μL。將熒光RAA反應混合液加入RAA熒光基礎(chǔ)反應單元中;將2μLDNA模板加入每個反應

管中,將5μL乙酸鎂加在反應單元管蓋上。每次進行熒光RAA擴增時均應設(shè)立陽性、陰性及空白對照。

陽性對照應用陽性對照樣品所提取核酸作為模板,陰性對照應用陰性對照樣品所提取核酸作為模板,空

白對照應用去離子水作為模板。配制反應液在冰盒中進行。

8.2.2實時熒光RAA反應程序

8.2.2.1熒光通道設(shè)置

在檢測區(qū)進行。將配制好的反應液短暫離心后放入熒光PCR檢測儀或恒溫熒光基因檢測儀中。設(shè)置

報告熒光為FAM,采用其他報告熒光應按儀器說明設(shè)定對應通道;淬滅熒光設(shè)定為None,校準熒光設(shè)

定為None??筛鶕?jù)不同品牌儀器說明等效設(shè)置參數(shù)。

8.2.2.2循環(huán)條件設(shè)置與檢測

39℃,60s,1個循環(huán);39℃,30s,40個循環(huán),每次循環(huán)時收集熒光信號。

8.2.3試驗成立條件

8.2.3.1熒光PCR檢測儀陽性對照有熒光對數(shù)增長,且熒光通道出現(xiàn)典型的擴增曲線,相應的Ct值

≤30.0;陰性對照無熒光對數(shù)增長,相應的無報告Ct值,試驗結(jié)果有效;否則應重新進行試驗。

8.2.3.2恒溫熒光基因檢測儀陽性對照起峰時間≤5min且出現(xiàn)特異性起峰曲線,陰性對照無起峰時間

或陰性對照起峰時間>10min且無特異性起峰曲線,試驗結(jié)果有效;否則應重新進行試驗。

8.2.4結(jié)果判定

8.2.4.1符合8.2.3.1的條件,被檢樣品對數(shù)增長,且熒光通道出現(xiàn)典型的擴增曲線,相應的Ct值≤30.0,

則判為FPV核酸陽性;被檢樣品無熒光對數(shù)增長,相應的無報告Ct值,或者Ct值>30.0,或者無典型

的擴增曲線,則判定為FPV核酸陰性。

8.2.4.2符合8.2.3.2的條件,被檢樣品起峰時間≤10min,且出現(xiàn)特異性起峰曲線,則判為FPV核酸陽

性;被檢樣品無起峰時間或被檢樣品起峰時間>10min且無特異性起峰曲線,則判定為FPV核酸陰性。

9檢測過程中防止交叉污染的措施

檢測過程中防止交叉污染的措施按照GB/T27401—2008中5.3.13的規(guī)定執(zhí)行。

4

XX/TXXXXX—XXXX

AA

附錄A

(規(guī)范性附錄)

引物和探針

引物、探針的名稱和序列見表A.1

表A.

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