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文檔簡介
?DNA甲基化與精神類疾病研究解螺旋
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知識金牌解
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醫(yī)
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牌010203精神障礙分類PubMed檢索基于Illumina甲基化芯片的精神疾病相關(guān)文獻及國自然檢索文獻解讀CONTENTS課
程
目
錄04精神障礙分類01知
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牌什么是“精神疾病”解
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長精神疾病更準(zhǔn)確的說法是精神障礙軀體疾病稱為“疾病”,精神疾病稱為“障礙”病因復(fù)雜,未知較多知
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牌精神障礙分類系統(tǒng)解
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長ICD系統(tǒng):國際疾病分類系統(tǒng)DSM系統(tǒng):美國精神障礙診斷與統(tǒng)計手冊系統(tǒng)知
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牌ICD-10
(v2016)WHO編制精神疾病占1大章分11小類分類依據(jù):病因?qū)W+癥狀學(xué)解
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長知
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牌DMS-5
(2013)由美國精神醫(yī)學(xué)協(xié)會(APA)編撰分類依據(jù):基于癥狀學(xué)主要分類:神經(jīng)發(fā)育障礙、精神分裂癥譜系障礙與其他精神病性障礙、雙相障礙與其他相關(guān)障礙、抑郁障礙、焦慮障礙、強迫障礙與其他相關(guān)障礙、創(chuàng)傷和應(yīng)激相關(guān)障礙、分離性障礙、軀體癥狀障礙及相關(guān)障礙、喂養(yǎng)和進食障礙、排泄障礙、睡眠覺醒障礙、性功能障礙、性別焦慮、破壞性、沖動控制和品行障礙、物質(zhì)相關(guān)障礙與成癮障礙、認知神經(jīng)障礙、人格障礙、性欲倒錯障礙、其他精神障礙、藥物所致的運動障礙及其他藥物的不良反應(yīng);另外包括其他可能成為臨床關(guān)注焦點的問題解
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長PubMed檢索02知
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牌檢索條件解
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長檢索條件:選定若干大類、細分類關(guān)鍵詞“DNA
Methylation”
AND
“關(guān)鍵詞”只檢索≤10年內(nèi)的文獻其中關(guān)鍵詞整理了47項,有檢索結(jié)果的16項知
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牌節(jié)標(biāo)題解
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長中文名英文名論文數(shù)量精神病學(xué)psychiatry1149精神分裂癥schizophrenia361自閉癥/孤獨癥autism232精神障礙mental
disorders183精神發(fā)育遲滯/智力缺陷mental
retardation152抑郁障礙/抑郁癥depressive
disorder138孤獨譜系障礙autism
spectrumdisorder61精神疾病mental
illness41注意缺陷多動障礙/多動癥attention
deficit
hyperactivity
disorder30厭食癥anorexia21神經(jīng)性厭食癥anorexianervosa13撤藥綜合征withdrawal
syndrome13兒童學(xué)習(xí)障礙learning
disabilities6癲癇epilepsia6躁狂癥Mania4社交焦慮癥social
anxiety
disorder2基于Illumina甲基化芯片的精神疾病相關(guān)文獻及國自然檢索03知
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牌基于Illumina甲基化芯片的文獻檢索查找GEO內(nèi)Illumina甲基化芯片平臺條目平臺AccessionTitleSeriesSamplesPubDateGPL23976IlluminaInfinium
HumanMethylation850
BeadChip4672017850kGPL21145Infinium
MethylationEPIC397122015450kGPL13534Illumina
HumanMethylation450
BeadChip
(HumanMethylation450_15017482)105976702201127kGPL8490IlluminaHumanMethylation27
BeadChip
(HumanMethylation27_270596_v.1.2)335187852009解
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牌節(jié)標(biāo)題解
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牌后續(xù)工作補充完整文章信息雜志、發(fā)表年份、IF……選擇代表性文章進一步閱讀重要疾病套路:機制、發(fā)育、EWAS……多組學(xué)數(shù)據(jù)的文章解
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牌近三年國自然相關(guān)項目檢索解
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長文獻解讀04知
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牌文獻介紹胎兒酒精譜系障礙的DNA甲基化模式研究2016年發(fā)表,IF=5.19樣本類型:口腔上皮細胞檢測平臺:450k、SNP芯片、焦磷酸測序樣本數(shù)量:206(110+96)解
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牌樣本及芯片分析概覽解
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牌樣本及數(shù)據(jù)的過濾與校正解
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長Discard
outlier
samplesDiscard
probes
(sex
chr、SNPs、baddata……)Compared
withblood
samples
(GSE42861)Ethnic
background
correction
(via
SNP
genotyping)知
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牌結(jié)果PCALeft:
blood
samples
Right:
BECs解
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長Ethnic
samples
SNP
genotyping136
samples解
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牌節(jié)標(biāo)題658
diff
CpG
site5
CpG
site
comparison知
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牌Diff-methylation
loci
enrichment解
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長差異甲基化位點與印記基因、原鈣粘連素編碼基因的關(guān)系
知
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牌解
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長解
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牌節(jié)標(biāo)題GO&DiseaseEnrichmentUp-methylatedGenes
Co-expression
Network解
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