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DB21DB21/T2589—2016東部白松種源相關(guān)序列多態(tài)性(SRAP)分子鑒定實驗方法TechnicalregulationsofmolecularidentificationmethodfordifferentprovenancesofPinusstrobuswithSRAP遼寧省質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督局發(fā)布I 1 1 1 1 1 2 2 2 5 6 7 9 本標準依據(jù)GB/T1.1-2009的本標準的附錄A、附錄B、附錄C和附錄D為規(guī)范性附錄,附錄E為資1本標準適用于利用相關(guān)序列多態(tài)性(SRAP)法對東部白松種源件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用3.1相關(guān)序列多態(tài)性sequence-relatedamplifiedpolymorph利用一對引物對開放閱讀框(openreadingframes,ORFs)進行擴增,因個體不同以及物種的內(nèi)在耐熱DNA聚合酶作用下,于體外快速大量特異擴增待定DNA一對引物在兩個或兩個以上不同材料基因組DNA之間擴增,得到數(shù)目不同或2選用東部白松新鮮針葉為材料提取基因組DNA。選取適量樣品,裝入凍存管,液氮速凍,置于超低),3凝膠上電泳,穩(wěn)壓90V,電泳緩沖液為1×TBE,325nm紫外燈下觀察,),),4認邊條與兩玻璃板均對齊后,將其放入封膠框中并用夾子固定在配制1%的瓊脂糖凝膠,徹底煮沸后用膠頭滴管吸取,沿底邊從左至右緩緩灌注入封膠框中,避免在50mL8%非變性聚丙烯酰胺儲備液中加入100μL10%將固定有封好玻璃板的制膠板向后傾斜放置,配好的8%非變性聚丙烯酰胺工作液沿玻璃板壁緩慢5將膠小心取出,用雙蒸水沖洗一次后迅速放入10%冰乙酸中,水平搖床輕搖3min~5min,放凈固選取電泳圖上清晰、易于辨認的多態(tài)性條帶進行記錄和統(tǒng)計,根據(jù)DNA分子量標準(將待測種源的電泳結(jié)果與原種源的標準譜帶相比較,從而鑒定出該種源的6me1me2me3me4me5me6me7me8me9me107B.10.5mol/LEDTA-二鈉(pH8.0)8.0,用超純水定容至100mL,高壓滅將24.22g三羥甲基氨基甲烷(Tris)溶解于160mL水中,用濃鹽酸(HCl)調(diào)劑pH至8.0,用超純將58.44g氯化鈉(NaCl)溶于160mL水中,定容至200mL,高壓滅菌,4CTAB-free緩沖液的成分為250mmol/LNaCl、200mmol/LTris-HClEDTA(0.5mol/LpH8.0)。在6(pH8.0)、100mL50mmol/LEDTA(pH8.0),定容至1004×CTAB提取緩沖液的成分為4%(質(zhì)量濃度)溴代十六烷基三甲胺(CTAB)、10(1mol/LpH8.0)、20mmol/LEDTA(0.5mol/LpH8.0)和1.4mol/LNaCl(5mol/L)。在500mLEDTA(pH8.0)和280mL5mol/LNaCl,定容至1000mL,高壓滅菌,4),溶液透明(確保所有瓊脂糖顆粒均完全熔化),冷卻至50℃~60℃,加入EB(1mg/mL)溶液使其終濃度為0.5μg/mL,混勻后倒入放完全凝固后放入電泳槽中,然后向槽內(nèi)加入1×TBE稀釋緩沖液至液面剛好沒過8B.106×DNA上樣緩沖液電泳(DN6×DNALordingBuffer,其中含0.05%(質(zhì)量分數(shù))溴酚藍、0.05%(質(zhì)量分數(shù))二甲苯青、30的比例,混合DNA樣品和DNA上樣緩沖液,直接加到點樣孔即可。9表C.210%過硫酸銨(ammoniump過硫酸銨(ammoniumpersu表C.310倍三羥甲基氨基甲烷-硼酸-冰乙酸(glacialaceticDB21/T
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