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文檔簡介
蛋白質(zhì)化學(xué)ProteinChemistry
蛋白質(zhì)(Protein)是由多種(20種)不同的氨基酸,按照一定的順序,通過肽鍵連接形成的
一條或多條肽鏈組成的生物大分子。蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的重要物質(zhì)基礎(chǔ),沒有蛋白質(zhì)就沒有
生命。
蛋白質(zhì)的形式及功能多樣
蛋白質(zhì)是最豐富的生物大分子,存在于所有的細(xì)胞及細(xì)胞的所有部分。一個(gè)簡單的細(xì)胞
中,蛋白質(zhì)的差異極大、種類有成千上萬種、分子量從小肽到數(shù)百萬的巨大分子。蛋白質(zhì)的
生物功能還表現(xiàn)出極大的多樣性,是生物信息最重要的終產(chǎn)物,是遺傳信息表達(dá)的元件。
從低等的古細(xì)菌到復(fù)雜的生命體,蛋白質(zhì)都是由相同的20種氨基酸共價(jià)連接而成的分
子。細(xì)胞能夠通過不同的組合和順序,用20種氨基酸合成性質(zhì)和功能截然不同的蛋白質(zhì),
如酶、激素、抗體、運(yùn)載體、肌肉、眼睛的晶狀體蛋白質(zhì)、羽毛、蜘蛛網(wǎng)、犀牛角、乳蛋白、
抗生素、蘑菇毒素及各種不同的生物活性的蛋白質(zhì)。
蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)復(fù)雜、種類繁多、功能各異,是生物體內(nèi)構(gòu)建生命、行使生命活動(dòng)的最主要
的功能分子,在幾乎所有的生命活動(dòng)中起著關(guān)鍵的作用。如果說基因是生命的指導(dǎo)者和生命
藍(lán)圖的構(gòu)建者,蛋白質(zhì)就是組成生命的主要材料,是生命的實(shí)踐者和執(zhí)行者。蛋白質(zhì)將生物
體的遺傳信息表達(dá)成生物的性狀,指導(dǎo)生命活動(dòng),控制生物的代謝、生長、發(fā)育及繁殖。
蛋白質(zhì)化學(xué)研究史I
1838年Mulder研究了血清、蛋清、蠶絲等物質(zhì)的元素組成后,發(fā)現(xiàn)了組成生物體的復(fù)雜
含氮物。
19世紀(jì)末從蛋白質(zhì)水解產(chǎn)物分離得到了13種氨基酸。
1902年Fischer,Hofmeister同時(shí)提出肽鍵理論。
1924年Svedberg發(fā)明超速離心機(jī)(100000rpm,700000g)
1930年代Bergmann合成出只含L型氨基酸的多肽。
1950年P(guān)auling提出蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)的基本單位:a-螺旋和折疊。
1953年Sanger確定了牛胰島素的一級結(jié)構(gòu)。
1958年P(guān)erutz&Kendrew用X光衍射法確定了肌紅蛋白的立體結(jié)構(gòu)。
1961年Anfinsen證明蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)決定其高級結(jié)構(gòu)。
1980年代蛋白質(zhì)工程的興起。
1994年Williams和Wilkins首次提出Proteome(Protein+genome)
1997年第一屆國際蛋白質(zhì)組學(xué)會議,確定蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)的興起。
1999年蛋白質(zhì)芯片技術(shù)出現(xiàn)。
蛋白質(zhì)的經(jīng)典分類
I.按理化性質(zhì)分:(英國PhysiologicalSociety,1907)
1.單純蛋白(simpleprotein)
1).Albumin(白/清蛋白)溶于水、鹽、酸、堿溶液,加熱凝固(血清)
2).Globulin(球蛋白)溶于鹽、酸、堿溶液,加熱凝固(血清)
3).Glutelin(谷蛋白)溶于酸、堿溶液(谷種,不溶于水和稀鹽)
4).Prolamine(醇溶谷蛋白)溶于70-90%酒精、酸、堿溶液(谷種)
5).Scleroprotein(硬蛋白)不溶(毛、發(fā)、爪、皮膚)
6).Histone(組蛋白)溶于水、酸溶液(細(xì)胞核)
7).Protamine(魚精蛋白)溶于水、酸溶液(精子)
2.復(fù)合蛋白(conjugatedprotein)
1).Nucleoprotein(核蛋白)含戊糖或脫氧戊糖(細(xì)胞核)
2).Phosphoprotein(磷蛋白)含有磷酸(以酯的形式)(動(dòng)物細(xì)胞、體液)
3).Lipoprotein(脂蛋白)含脂質(zhì)(動(dòng)植物細(xì)胞)
4).Chromoprotein(色蛋白)含帶Fe、Cu等的有機(jī)色素(動(dòng)植物細(xì)胞)
5).Glycoprotein(糖蛋白)含糖及其衍生物(動(dòng)植物細(xì)胞)
3.衍生蛋白質(zhì)(derivedprotein)
i).Primaryproteinderivatives天然蛋白質(zhì)經(jīng)少量變性后的產(chǎn)物
1).Gelatin(明膠)膠原蛋白(collagen)加酸水解產(chǎn)物
2).Protean水溶性蛋白質(zhì)經(jīng)水、酶、稀酸作用而不溶化
3).Metaprotein(變性蛋白質(zhì))經(jīng)稀酸、稀堿變性后的蛋白質(zhì)
4).Coagulatedprotein(凝固蛋白質(zhì))機(jī)械攪拌,加酒精后形成的不溶物
ii).Secondaryproteinderivatives進(jìn)一步分解后的變性蛋白質(zhì)
1).primaryproteose(初生蛋白膚)溶于水,加熱不凝固,易鹽析
2).secondaryproteose溶于水,加熱不凝固,難鹽析
3).peptone(蛋白陳)溶于水,加熱不凝固,不能鹽析
4).peptide氨基酸的組成和序列一定的小分子
按功能的蛋白質(zhì)分類
1.酶類,占細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)種類的絕大部分
2.運(yùn)輸?shù)鞍?,如albumin,hemoglobin,transferrin等
3.收縮運(yùn)動(dòng)蛋白,如actin,myosin,tubulin等
4.激素蛋白,如insulin,growthhormone等
5.細(xì)胞激動(dòng)素(cytokinin),如EGF,PDGF,IL-2等
6.受體蛋白,如insulinreceptor,rhodopsin等
7.毒素蛋白,如choleratoxin,ricin,pertussis等
8.營養(yǎng)貯藏蛋白,如protamine,glutelin等
9.防御蛋白,如IgG等
10.結(jié)構(gòu)蛋白,如keratin,collagen等
對蛋白質(zhì)化學(xué)有突出貢獻(xiàn)的Nobel獎(jiǎng)獲得者
1902年H.E.Fischer(德,化)肽鍵理論,多肽合成
1910年A.Kossel(德,醫(yī))組氨酸、組蛋白的發(fā)現(xiàn),堿基的發(fā)現(xiàn)
1915年W.H.Bragg/W.LBragg(德,物)用X射線測定晶體物質(zhì)結(jié)構(gòu)
1926年T.Svedbe瑤(瑞,化)用超離心手段決定蛋白質(zhì)的分子量
1946年J.B.Summer(美,化)蛋白質(zhì)酶的結(jié)晶,證明醐的本質(zhì)為蛋白質(zhì)
1948年A.WKTiselius(瑞,化)電泳裝置的開發(fā),血清蛋白的研究
1952年A.J.P.Martin/R.L.M.Synge(英,化)分配層析發(fā)明,氨基酸的分離
1954年L.Pauling(美,化)蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu),抗原抗體反應(yīng)理論
1958年F.Sanger(英,化)胰島素一級結(jié)構(gòu)的測定
1962年M.F.Perutz/J.C.Kendrew(英,化)X射線確定蛋白質(zhì)的立體結(jié)構(gòu)
1972年GM.Edelman/R.R.Porter(美,醫(yī))抗體的化學(xué)構(gòu)造與功能的解明
1972年W.H.Stein/S.More(美,化)RNase的一級結(jié)構(gòu)和活性中心的解明
1972年C.B.Anfinsen(美,化)蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)決定其立體結(jié)構(gòu)
1998年S.B.Prusiner(美,醫(yī))Prion:蛋白立體結(jié)構(gòu)的變化導(dǎo)致疾病
蛋白質(zhì)的化學(xué)組成
元素組成碳(C)50%-55%氫(H)6%-7%氧(0)19%-24%氮(N)13%-19%
硫(S)0%-4%N:平均16%
各種蛋白質(zhì)的含氮量很接近,平均為16%。由于體內(nèi)組織的主要含氮物是蛋白質(zhì),因此,
只要測定生物樣品中的氮含量,就可以按下式推算出蛋白質(zhì)大致含量。
每克樣品中含氮克數(shù)X6.25X100=100克樣品中蛋白質(zhì)含量(克%)
有些含P、I,少量的還含有Fe、Cu、Zn、Mn、Co、Mo等
蛋白質(zhì)系數(shù)不同的蛋白質(zhì)其氨基酸構(gòu)成比例及方式不同,故各種不同的蛋白質(zhì)其含氮
量也不同,一般蛋白質(zhì)含氮量為16%,即一份氮素相當(dāng)于6.25份蛋白質(zhì),此數(shù)值(6.25)
稱為蛋白質(zhì)系數(shù)。蛋白質(zhì)含量=N含量x6.25.
不同種類食品的蛋白質(zhì)系數(shù)有所不同,如玉米,養(yǎng)麥,青豆,雞蛋等為6.25,花生為5.46,
大米為5.95,大豆及其制品為5.71,小麥粉為5.70,牛乳及其制品為6.38。
三聚寮胺(英文名Melamine),是一種三嗪類含氮雜環(huán)有機(jī)化合物,重要的氮雜環(huán)有機(jī)化
工原料。簡稱三胺,又叫2,4,6-三氨基-1,3,5-三嗪、蜜胺、鼠尿酰胺、三聚鼠酰胺,分子
式C3N6H6、C3N3(NH2)3,分子量126.12,含氮量66.7%。
蛋白質(zhì)用強(qiáng)酸、強(qiáng)堿處理后,可以得到各種各樣的氨基酸。在動(dòng)植物組織中可以分離
得到26-30種不同的氨基酸。第一個(gè)氨基酸早在兩個(gè)世紀(jì)前就已經(jīng)被發(fā)現(xiàn),而最后一個(gè)氨基
酸在1935年才發(fā)現(xiàn)。直到1965年才搞清楚,只有20種氨基酸才是生命體中合成蛋白質(zhì)的
原材料(稱為一級氨基酸,Primaryaminoacid)?
#最近的報(bào)道又多了兩種一級氨基酸?
氨基酸的名稱及三字、單字符號
Alanine丙氨酸AlaAArginine精氨酸ArgR
Asparagine天冬酰胺Asn/AsxNAsparticacid天冬氨酸Asp/AsxD
Cysteine半胱氨酸CysCGlutamine谷氨酰胺Gln/GlxQ
Glutamicacid谷氨酸Glu/GlxEGlycine甘氨酸GlyG
Histidine組氨酸HisHIsoleucine異亮氨酸HeI
Leucine亮氨酸LeuLLysine賴氨酸LysK
Methionine甲硫氨酸MetMPhenylalanine苯丙氨酸PheF
Proline脯氨酸ProPSerine絲氨酸SerS
Threonine蘇氨酸ThrTTryptophan色氨酸TrpW
Tyrosine酪氨酸TyrYValine綴氨酸VaiV
不用的字母JUZBOX要求:能熟背
一級氨基酸的結(jié)構(gòu)及旋光性
L-氨基酸的基本結(jié)構(gòu)
二十種氨基酸除Gly外全是L-型。Pro呢?
殘基:肽鏈中,氨基酸之間縮合時(shí)都脫去一
個(gè)水分子,脫水后的殘余部分叫殘基(residue),
因此蛋白質(zhì)肽鏈中的氨基酸統(tǒng)統(tǒng)是殘基形式。
氨基酸可以通過R基團(tuán)分類
標(biāo)準(zhǔn)氨基酸的化學(xué)特性對于理解它們的生物化學(xué)是關(guān)鍵的,依據(jù)側(cè)鏈R基團(tuán)的特性,可以
將氨基酸分成5類以簡單化,特別是在生理pH條件下(pH7.0附近),它們的極性或與水
發(fā)生作用的趨勢。氨基酸側(cè)鏈的極性差異極大,從完全非極性或疏水性(水不溶性)到高極
性或親水性(水溶性)。
非極性(脂肪族)R側(cè)鏈,Ala、Val、Leu及He的側(cè)鏈在蛋白質(zhì)分子中易于聚攏在一起,
通過疏水作用穩(wěn)定蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)。Gly是最簡單的氨基酸,雖然疏水,但最小的側(cè)鏈對于疏
水作用沒有貢獻(xiàn)。M電的側(cè)鏈有硫酯基團(tuán)。
芳香族氨基酸,具有芳香環(huán)側(cè)鏈,相對非極性,都能參與疏水作用,Tyr的羥基能夠形成氫
鍵,是一些酶的重要的功能基團(tuán)。Tyr和Trp比Phe是明顯更加極性的氨基酸(羥基及口引臊
環(huán)上的N)。
芳香氨基酸的紫外吸收曲線
比較:pH6.0時(shí)Trp和Tyr的紫外吸收光譜,相同條件下,等摩爾數(shù)(10-3M)的Trp的光吸
收是Tyr的4倍,兩者最大光吸收的波長在280nm附近。第三個(gè)紫外光吸收的氨基酸-Phe,
對蛋白質(zhì)光吸收的貢獻(xiàn)很?。ㄎ达@示)。
極性不帶電的R基團(tuán),與非極性氨基酸相比,這些氨基酸的R基團(tuán)在水中溶解度較大或更
加親水,它們的側(cè)鏈基團(tuán)可以與水形成氫鍵。Asn和Gin是蛋白質(zhì)中的兩個(gè)酰胺氨基酸,
易于被酸或堿水解。Cys的筑基易氧化形成二硫鍵,對蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)的形成重要。
(2009年大題)植物常受到逆境條件的危害,其中由干旱和鹽漬引起的滲透脅迫對植物的生
長和產(chǎn)量影響最大。但植物通過長期的進(jìn)化已形成了許多機(jī)制抵抗外界的逆境條件。在滲透
脅迫下,植物可通過積累一定量的溶質(zhì)降低水勢,維持植物體內(nèi)的水分平衡,保證植物的正
常生長。這類物質(zhì)包括一系列的含氮化合物(如脯氨酸、多胺等),分布最廣的是脯氨酸(Pro)。
Pro主要以游離狀態(tài)廣泛存在于植物中,它是水溶性最大的氨基酸(1620mg/ml),具有較強(qiáng)
的水合能力。在植物細(xì)胞生理干旱時(shí),它的增加有助于細(xì)胞或組織持水。植物中游離脯氨酸
含量(干重)甚微(020.69mg/g),約占游離氨基酸總量的百分之幾,但受到干旱、鹽漬等滲透
脅迫時(shí),脯氨酸會大量積累,其含量甚至高達(dá)百倍以上。所有的植物在鹽漬條件下會發(fā)生
游離Pro的積累。如以桿裂絲藻為材料的研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)培養(yǎng)基鹽度從0提高到40%時(shí),Pro
以外的其余15種氨基酸總量從95mM上升到120mM,而Pro則由2mM增加到278mM?
帶正電荷的三個(gè)堿性氨基酸,最為親水的R基團(tuán),pH7.0時(shí)帶正電荷,側(cè)鏈上有第二個(gè)氨
基,Arg有帶正電的服基,His有可帶電的咪喋基(唯一),在許多酶促反應(yīng)中作為質(zhì)子供
體/受體。
L型和D型的由來甘油醛的旋光性
按原子排列次序法確定了L型和D型氨基酸,但現(xiàn)在L和D已經(jīng)不代表氨基酸的旋光性,
只代表氨基酸的絕對構(gòu)型。
現(xiàn)在為了正確表示左旋和右旋,采用(+)和(一)的符號,(+)代表右旋,(一)代表左
旋。從右旋的D型甘油醛出發(fā),可以合成出左旋的D型乳酸。從這點(diǎn)我們也可以看出物質(zhì)
的旋光性與手性原子上的構(gòu)型沒有確定的關(guān)系。
“黃氏”判斷法(看CAR的走向)
將H原子靠近自己,觀察CAR的走向,逆時(shí)針(左轉(zhuǎn))為L型,順時(shí)針(右轉(zhuǎn))為D型。
D:dextro(右)C:carboxylgroup
L:levo(左)A:aminogroup
R:residue
蘇氨酸Thr有四種異構(gòu)體
其他氨基酸的結(jié)構(gòu)
出現(xiàn)在蛋白質(zhì)上的氨基酸修飾
4-Hydroxyproline在膠原蛋白上
5-Hydroxylysine,6-N-methyllysine,desmosine在結(jié)締組織中
hospho-Ser,-Thr,-Tyr信號轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白y-Carboxyglutamicacid凝血酶中
Pyroglutamicacid神經(jīng)肽的N端
均為氨基酸參入肽鏈后經(jīng)修飾而來!
蛋白質(zhì)中的氨基酸修飾-羥基化從各種生物分離到的氨基酸已達(dá)250種以上
蛋白質(zhì)中的氨基酸修飾-甲基化鎖鏈素,毗咤環(huán)由4個(gè)Lys分子的側(cè)鏈組成,存在于彈
性蛋白(elastin)中
蛋白質(zhì)上的氨基酸修飾
凝血酶Y-竣基谷氨酸信號傳導(dǎo)O-磷酸絲氨酸
游離型氨基酸衍生物Pyroglutamicacid(焦谷氨酸),神經(jīng)肽的N端多數(shù)為焦谷氨酸
能夠增加細(xì)胞合成乙酰膽堿、增加乙酰膽堿受體的數(shù)量、加強(qiáng)大腦左右半球之間的信息交流
幫助提高記憶力和頭腦敏銳度。
21號和22號primaryaminoacid???Ornithine(鳥氨酸);Citrulline(瓜氨酸)
5'-Hydroxytryptamine(5-羥色胺)Homoaminoacids(同型氨基酸)
3,4-Dihydroxyphenylalanine(DOPA)(多巴)y-Aminobutyricacid(GABA)
Mono,di,tri-iodotyrosine;thyroxine3-Alanine,.......etc
SeC(selenocysteine,硒半胱氨酸)第21個(gè)一級氨基酸?
第21個(gè)基本氨基酸的密碼(E.coli):硒代半胱氨酸。密碼子為UGA,有特殊的tRNA-Ser
與其識別,Ser結(jié)合入肽鏈,則立即修飾為硒代半胱氨酸
遺傳密碼字典的破譯,通用性作為遺傳密碼的基本特點(diǎn)之一被人們認(rèn)可。近年來研究發(fā)現(xiàn)了
一些例外,除線粒體使用一組密碼子其含義有別于核基因之外,原先被認(rèn)為僅用作終止信號
的無義密碼子在某些情況下可重新詮釋,編碼特定的氨基酸。硒代半胱氨酸就是由UGA無
義編碼。
PyL(Pyrrolysine,哦咯賴氨酸)第22個(gè)一級氨基酸?
Hao,B.,etal.AnovelUAGencodedresidueinthestructureofamethanogenmelhyltransferase.
Science296:1462-1466,2002.
是目前已知的第22種參與蛋白質(zhì)生物合成的氨基酸,與標(biāo)準(zhǔn)氨基酸不同的是,由終止密碼
子UAG的有義編碼形成。與之對應(yīng)的在產(chǎn)甲烷菌中也含有特異的毗咯賴氨酰-tRNA合成酶
(PylRS)和毗咯賴氨酸t(yī)RNA(tRNAPyl),tRNAPyl具有不同于經(jīng)典tRNA的特殊結(jié)構(gòu)。
游離型氨基酸衍生物-參與尿素循環(huán)
鳥氨酸(存在于尿素循環(huán),與氨甲酰磷酸合成瓜氨酸)
瓜氨酸(存在于尿素循環(huán),從西瓜汁分離到),與Asp作用生成精胺琥珀酸,再轉(zhuǎn)變?yōu)锳rg而
裂解生成尿素
游離型氨基酸衍生物5羥色胺5-hydroxytryptamine
"Thetasteoflove”是松果體素(褪黑素.melatonin,5-甲氧基-N-乙酰色胺)和血清素
(serotonin)的前體。
5-HT作為神經(jīng)遞質(zhì),主要分布于松果體和下丘腦,可能參與痛覺、睡眠和體溫等生理功能
的調(diào)節(jié)。
游離型氨基酸衍生物-同型氨基酸
比通常的氨基酸多一個(gè)亞甲基,如:
Homoserine微生物、植物的代謝中間產(chǎn)物
HomocysteineMet的分解產(chǎn)物,存在于S-adenosylhomo-cysteine和葉酸中.
Homocitrulline攝取高Lys含量的食物時(shí)從尿中排出
Homomethionine*Epinephrine,腎上腺素
游離型氨基酸衍生物-酪氨酸代謝物TyrosineS-adenosylhomocysteine
從Tyr衍生出來的重要生理物質(zhì),S-adenosylmethionine
其中多巴是一種氨基酸。
3,4-dihydroxyphenylalanineDOPA,多巴norepinephrine去甲腎上腺素
3,4-dihydroxyphenylethylalanine兒茶酚乙胺
Dopamine,多巴胺
游離型氨基酸衍生物-谷氨酸衍生物
鎮(zhèn)靜神經(jīng),抗焦慮,降低血壓,提高腦活力等
glutarmicacidGABA,y-aminobutyricacid
S-adenosylmethionine過量促進(jìn)食欲,促肥胖
S-adenosylhomocysteine
carnitine,肉毒堿(可用來減肥)
游離型氨基酸衍生物-甲狀腺素甲狀腺內(nèi)貯存碘的氨基酸
氨基酸的理化性質(zhì)
無色晶體,熔點(diǎn)較高(200~300℃),水中溶解度各不同,取決于側(cè)鏈。
在紫外有特征吸收的僅三個(gè)芳香族的氨基酸Te、Tyr.Phe,利用這一特點(diǎn),可以通過測定
280nm處的紫外吸收值的方法對蛋白質(zhì)溶液進(jìn)行定量。
構(gòu)成蛋白質(zhì)的20種氨基酸在可見光區(qū)都沒有光吸收,但在遠(yuǎn)紫外區(qū)(<220nm)均有光吸收。
在近紫外區(qū)(220-300nm)只有色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸有吸收光的能力??梢酝ㄟ^測定280
nm處的紫外吸收值的方法對蛋白溶液進(jìn)行定量。
苯丙氨酸的max=257nm,257=2.0x102
酪氨酸的max=275nm,275=1.4x103
色氨酸的max=280nm,280=5.6x103
紫外光吸收的測定裝置
Lambert-Beerlaw:A=loglo/I=eclA:absorbanceIo:intensityoftheincidentlight
I:intensityofthetransmittedlight£:molarextinctioncoefficient(摩爾消光系數(shù))
兩性電解質(zhì)同一個(gè)氨基酸分子上可以同時(shí)解離攜帶正電荷和負(fù)電荷,被稱為兩性電解質(zhì)
(ampholyte)?
在水溶液中,氨基和竣基在不同的pH條件下表現(xiàn)出不同的解離狀態(tài);當(dāng)氨基酸分子上的電
荷總量為零時(shí)(凈電荷為零),該溶液的pH稱為該物質(zhì)的等電點(diǎn)(isoelectricpoint),以符
號pl來表示。
等電點(diǎn)(isoelectricpoint,pl)氨基酸、多肽等兩(兼)性電解質(zhì)[ampholyte]在溶液中所
攜帶的凈電荷[netelectriccharge]為零時(shí)的溶液的pH值。因此也叫isoelectricpH.
比較常見的錯(cuò)誤說法
氨基酸溶液的凈電荷為零;
物質(zhì)所帶凈電荷為零時(shí)溶液的pH值;
氨基酸的凈電荷為零時(shí)的pH值;
氨基酸分子達(dá)到中性時(shí)溶液的pH值;
當(dāng)氨基酸、蛋白質(zhì)以離子存在時(shí),環(huán)境的pH值;
解離基團(tuán)的pK值受到鄰近基團(tuán)的影響
蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)計(jì)算只是參考值,因?yàn)樵S多基團(tuán)的pK受微環(huán)境的影響而發(fā)生較大變化。
氨基酸的酸堿滴定曲線1molGly溶于水時(shí),溶液的pH約為6,用標(biāo)準(zhǔn)NaOH進(jìn)行滴定的
滴定曲線。
氨基酸等電點(diǎn)及解離百分?jǐn)?shù)的計(jì)算
公式:pH=pK+lg([質(zhì)子受體-質(zhì)子供體J),可定量計(jì)算氨基酸在某一pH條件下的解離百分
數(shù)。氨基酸等電點(diǎn)pl值是由兼性離子兩側(cè)基團(tuán)的pK值所決定的。
eg:GlyK1=[+H3NCH2COO-][H+]/[+H3NCH2COOH]
K2=[H2NCH2COO-][H+]/[+H3NCH2COO-]
pH=pI時(shí),+H3NCH2COOH=H2NCH2COO-
KlK2=[H+]22pH=pK1+pK2
pH=(pK1+pK2)/2pl=(pKl+pK2)/2
同理對含三個(gè)可解離基團(tuán)的氨基酸來說,只要寫出它的電離式,然后取兼性離子兩邊的
pK值的平均值,即得其pl值。
側(cè)鏈不含離解基團(tuán)的中性氨基酸,其等電點(diǎn)是它的pKl和pK2的算術(shù)平均值:
pI=(pKl+pK2)/2
pH<pI,帶正電;pH=pI,不帶凈電;pH>pI,帶負(fù)電。
同樣,對于側(cè)鏈含有可解離基團(tuán)的氨基酸,其pl值也決定于兩性離子兩邊的pK值的算
術(shù)平均值。酸性氨基酸:pl=(pKl+pKR-COO-)/2
堿性氨基酸:pl=(pK2+pKR-NH2)/2
二十種基本氨基酸,除His外,在生理pH(pH7左右)下都沒有明顯的緩沖容量,因?yàn)檫@
些氨基酸的表觀解離常數(shù)都不在pH7附近,緩沖容量只有在接近表觀解離常數(shù)值時(shí)才表現(xiàn)
出來。His咪哇基的解離常數(shù)為6.0,在pH7附近有明顯的緩沖作用。血紅蛋白含有較多的
His殘基,在pH7左右的血液中具有明顯的緩沖能力,對運(yùn)輸氧和二氧化碳重要。
氨基酸的主要化學(xué)反應(yīng)
?850'C左右分解成?
?氨基的化學(xué)反應(yīng):
?與茴三酮(ninhydrin)的反應(yīng)定量反應(yīng)
?與亞硝酸的反應(yīng)anSlyke定氮
?與2,4-二硝基氟苯(FDNB)的反應(yīng)測序
?與甲醛的反應(yīng)氨基滴定
?與?;姆磻?yīng)氨基保護(hù)基
?與二甲基氨基蔡磺酰氯(DNS-C1)的反應(yīng)測序
?與熒光胺的反應(yīng)微量檢測
?與Edman試劑(苯異硫氧酸)和有色Edman試劑的反應(yīng)測序
a-氨基參與的反應(yīng)-與亞硝酸反應(yīng)(VanSlyke定氮)’
用途:范斯萊克法定量測定氨基酸的基本反應(yīng),標(biāo)準(zhǔn)條件下測定生成氮?dú)獾捏w積,可計(jì)算
氨基酸的量,用于氨基酸定量和蛋白質(zhì)水解程度的測定。
注意:生成的N2只有一半來自氨基酸?!?/p>
a-氨基參與的反應(yīng)與甲醛發(fā)生羥甲基化反應(yīng)
二羥甲基氨基酸羥甲基氨基酸’
用途:可以用來直接測定氨基酸的濃度。
a-氨基參與的反應(yīng)-炫基化反應(yīng)(DNFB法)(桑格反應(yīng),Sangerreaction)
用途:是鑒定多肽N-端氨基酸的重要方法
a-氨基參與的反應(yīng)說-煌基化反應(yīng)(Sanger法)
Sanger法N端測序。2,4-二硝基氟苯在堿性條件下,能夠與肽鏈N-端的游離氨基作用,生
成二硝基苯衍生物(DNP)。
在酸性條件下水解,得到黃色DNP-氨基酸。該產(chǎn)物能夠用乙醛抽提分離。不同的DNP-氨
基酸可以用色譜法進(jìn)行鑒定.
用途:是鑒定多肽N-端氨基酸的重要方法
a-氨基參與的反應(yīng)-燃基化反應(yīng)(PITC法)
Edman氨基酸順序分析法(異硫鼠酸苯酯PITC法),實(shí)際上也是一種N-端分析法。此法的
特點(diǎn)是能夠不斷重復(fù)循環(huán),將肽鏈N-端氨基酸殘基逐一進(jìn)行標(biāo)記和解離。
用途:是鑒定多肽N-端aa和aa順序的重要方法
a-氨基參與的反應(yīng)-酰基化反應(yīng)(丹磺酰氯法)用途:是鑒定多肽N-端氨基酸的重要方法。
在堿性條件下,丹磺酰氯(二甲氨基蔡磺酰氯DNS-C1)可以與N-端氨基酸的游離氨基作用,
得到丹磺酰-氨基酸(DNS-AA)。
此方法的優(yōu)點(diǎn)是丹磺酰-氨基酸有很強(qiáng)的熒光性質(zhì),檢測靈敏度可以達(dá)到1x10-9mol。
a-氨基參與的反應(yīng)-酰基化反應(yīng)(氨基保護(hù)反應(yīng))用途:用于保護(hù)氨基以及肽鏈的合成。
a-氨基參與的反應(yīng)-生成西佛堿用途:是多種酶促反應(yīng)的中間過程。
氨基酸的化學(xué)性質(zhì)(H)
?竣基的化學(xué)反應(yīng)
▲Strecker降解:弱氧化劑(次氯酸鈉,N-bromosuccinimide)作用下生成NH3和醛(RCHO)
▲特殊條件下,還原成氨基醇、氨基醛▲與駢(hydrazine)的反應(yīng)C端氨基酸分析
?側(cè)鏈的化學(xué)反應(yīng)▲羥基:酯化(生物體內(nèi)的磷酸化)▲貧基:氧化還原
Strecker降解反應(yīng):a一氨基酸與a一二城基化合物反應(yīng)時(shí),a一氨基酸氧化脫竣生成比原
來氨基酸少一個(gè)碳原子的醛,氨基與二城基化合物結(jié)合并縮合成瞰嗪;止匕外,還可降解生
成較小分子的雙乙酰、乙酸、丙酮醛等。
1862年Strecker發(fā)現(xiàn)四氧喀臉能將Ala(丙氨酸)分解為乙醛和C02。,此反應(yīng)稱Strecker降解。
不同a-氨基酸與還原糖加熱能按Strecker降解生成各種特殊醛類,不僅與褐變有關(guān),還與
香氣的產(chǎn)生有關(guān)。
a-竣基參與的反應(yīng)-成鹽、成酯反應(yīng)
a.AA+NaOH--?氨基酸鈉鹽(氨基酸的堿金屬鹽能溶于水,重金屬鹽不溶于水)
b.HC1AA+EtOH--?氨基酸乙酯的鹽酸鹽
當(dāng)AA的-COOH變成甲酯、乙酯或鈉鹽后,-COOH的化學(xué)反應(yīng)性能被掩蔽或者說COOH
被保護(hù),-NH2的化學(xué)性能得到了加強(qiáng)或活化,易與酰基結(jié)合。
為什么AA的酰基化和炫基化在堿性溶液中進(jìn)行?
a-竣基參與的反應(yīng)-形成酰鹵的反應(yīng)
a-竣基參與的反應(yīng)-疊氮化反應(yīng)用途:常作為多肽合成活性中間體,活化竣基。
a-竣基參與的反應(yīng)-脫竣(基)反應(yīng)用途:脫竣酶催化的反應(yīng)
氨基酸的化學(xué)性質(zhì)(HI)根據(jù)氨基酸側(cè)鏈的結(jié)構(gòu),歷史上曾研究出了每種氨基酸側(cè)鏈的特
異性反應(yīng),可以用來定性和定量分析,但現(xiàn)在已經(jīng)基本棄用。
a-氨基和峻基共同參與的反應(yīng)-與芮三酮反應(yīng)(氨基酸定性、定量分析)
紫色產(chǎn)物Pro、Hypro?
a-氨基和-竣基共同參與的反應(yīng)-成肽反應(yīng)用途:是多肽和蛋白質(zhì)合成的基本反應(yīng)
筑基(-SH)的反應(yīng)-側(cè)鏈基團(tuán)的反應(yīng)(與重金屬反應(yīng))作用:與金屬離子的螯合性質(zhì)可用
于體內(nèi)解毒
筑基(-SH)的反應(yīng)-側(cè)鏈基團(tuán)的反應(yīng)航基的氧化及二硫鍵的還原
作用:氧化還原反應(yīng)可使蛋白質(zhì)分子中二硫鍵斷裂。二硫蘇糖醇(DTT)也可以用來打開
胱氨酸上的二硫鍵。
羥基的反應(yīng)-側(cè)鏈基團(tuán)的化學(xué)性質(zhì)二異丙基氟磷酸酯,DFP、DIPF、DIFP作用:可用
于修飾蛋白質(zhì)
氨基酸的應(yīng)用醫(yī)藥工業(yè)
氨基酸輸液必需氨基酸:甲硫氨酸、色氨酸、賴氨酸、綴氨酸、異亮氨酸、亮氨酸、苯丙
氨酸、蘇氨酸(假設(shè)來寫一兩本書)半必需氨基酸:精氨酸、組氨酸是幼兒所必需的。
治療藥劑
Arg:對治療高氨血癥、肝機(jī)能障礙等疾病頗有效果;
Asp:鉀、鎂鹽可用于恢復(fù)疲勞;治療低鉀癥心臟病、肝病、糖尿病等。
Cys:能促進(jìn)毛發(fā)的生長,可用于治療禿發(fā)癥;甲酯鹽酸鹽可用于治療支氣管炎等;
His:可擴(kuò)張血管,降低血壓,用于心絞痛,心功能不全等疾病的治療。
食品工業(yè)
營養(yǎng)強(qiáng)化劑;
谷氨酸單鈉鹽一味精;
天冬氨酸鈉:可用于清涼飲料,能增加清涼感并使香味濃厚爽口;
天冬氨酰苯丙氨酸甲酯:甜味素(APM)
農(nóng)業(yè)
殺蟲劑:刀豆氨酸、5-羥色氨酸可使南方毛蟲拒食而死;半胱氨酸可殺死黃瓜蠅;甘氨酸乙
酯衍生的二硫代磷酸鹽具有較強(qiáng)的殺蜥蟲和殺螭效果;
殺菌劑:N-月桂酰綴氨酸可用作治療稻瘟??;-1,4環(huán)己二烯丙氨酸能抑制黑穗病毒、稻
瘟病等;
除草劑:如N-3,4-二氮丙氨酸,硫代氨基酸酯等。
化妝品
氨基酸能調(diào)節(jié)皮膚pH的變化,對細(xì)菌有抑制作用,也可作為皮膚、毛發(fā)的營養(yǎng)成分,增加
皮膚、毛發(fā)的光澤。
防止皮膚干燥的天然保濕因子(NMF)的主要成分是甘氨酸、羥基丁氨酸、丙氨酸、天冬
氨酸、絲氨酸等游離氨基酸。
在化妝品中添加天冬氨酸或其衍生物以及一些維生素,可防止皮膚老化。
化學(xué)工業(yè)
維生素B6:可采用丙氨酸或天冬氨酸為原料合成。
葉酸:需要用谷氨酸為原料合成。
氨基酸表面活性劑:?;劝彼徕c、十六烷基-L-賴氨酰-L-賴氨酸甲酯二鹽酸、月桂酰-L-
精氨酸乙酯鹽酸等具有較強(qiáng)的抗菌殺菌活性,且無刺激性。
聚合氨基酸:聚谷氨酸甲酯可用于作為合成皮革的表面處理劑;聚天冬氨酸或聚谷氨酸的二
烷基酯與磷酸高級烷基酯結(jié)合得到的化合物可作為可塑劑,穩(wěn)定劑等。
氨基酸的鑒定、分離純化
凡是具有游離氨基的氨基酸(。-氨基酸)能與前三酮試劑反應(yīng),生成紫色化合物。這種反
應(yīng)非常靈敏,是鑒定a-氨基酸(除脯氨酸為淡黃色外)的最簡便、最迅速的方法,可用于
a-氨基酸的比色測定和紙層析的顯色。
的三酮試劑:0.2%的前三酮酒精(95%酒精)溶液。
分配柱層析:支持劑是一些具有親水性的不溶性物質(zhì),如纖維素、淀粉、硅膠等。
濾紙層析(分配層析)
薄層層析(吸附層析、分配層析)
離子交換層析:陰離子交換樹脂-N(CH3)3OH,陽離子交換樹脂-SO3H
電泳(紙電泳)
色譜法(Chromatography):一種分離技術(shù)1.由俄國植物學(xué)家Tsweett創(chuàng)立
2.原理使混合物中各組分在兩相間進(jìn)行分配,其中一相是不動(dòng)的(固定相),另一相(流
動(dòng)相)攜帶混合物流過此固定相,與固定相發(fā)生作用,在同一推動(dòng)力下,不同組分在固定相
中滯留的時(shí)間不同,依次從固定相中流出,乂稱色層法,層析法。
3.分類(1)根據(jù)流動(dòng)相分:氣相色譜和液相色譜(流動(dòng)相)
(2)根據(jù)固定相分:柱色譜、紙(PC)色譜、薄層色譜(TLC)(固定相)
(3)根據(jù)層析性質(zhì)分:吸附色譜、分配色譜、離子交換色譜、排阻色譜(物理化學(xué)原理)
分配層析的一般原理
1941年Martin與Synge(英)提出分配層析。所有的層析系統(tǒng)都有兩個(gè)相組成,一個(gè)為固
定相或靜相(stationaryphase),一個(gè)為流動(dòng)相或動(dòng)相(mobilephase),混合物在層析系統(tǒng)中的
分離決定于混合物在兩相中的分配情況。
分配定律:當(dāng)一種溶質(zhì)在兩種一定的互不相溶的溶劑中分配時(shí),在一定的溫度下達(dá)到平衡后,
溶質(zhì)在兩相中的濃度比值為--常數(shù)。即分配系數(shù)(partitionordistributioncoefficient)(kd)。
Kd=CA/CB(1891,Nernst)
CA:在A相(動(dòng)相)中的濃度CB:在B相(靜相)中的濃度
物質(zhì)分配:液一液固一液氣一液,層析系統(tǒng)的靜相可以是固相、液相或固液
混合相,動(dòng)相可以是液相或氣相,它們充滿于靜相的空隙中并能流過靜相。
有效分配系數(shù):Keff=某一物質(zhì)在A相中的總量/某一物質(zhì)在B相中的總量。
對液-液層析系統(tǒng):Keff=CAXVA/CBXVB=KdXRv
VA:A相的體積VB:B相的體積RV=A、B兩相的體積比
Keff是RV的函數(shù),溶質(zhì)的有效分配系數(shù)可以調(diào)節(jié)兩相的體積比而加以改變。
分離的先決條件:各種氨基酸成分的分配系數(shù)有差異,差異越大,越容易分開。
分配層析的原理:逆流分配IGsunlg虞uucmNisttibutioiQ
濾紙層析(Filter-paperchromatography)
分配層析的一利i,濾紙纖維素上吸附的水是固定相,展層(development)用的溶劑是流動(dòng)相,
層析使混合氨基酸在兩相中不斷被分配,使它們分配在濾紙的不同位置。
濾紙層析是分離及鑒定簡單氨基酸混合物的常用技術(shù),可用于蛋白質(zhì)氨基酸組成的定性鑒定
及定量測定。
還可以通過雙向?qū)游?two-dimensionalpaperchromatography),利用不同的展層劑系統(tǒng)使
在兩向系統(tǒng)中不同Rf值的氨基酸分開。
離子交換柱層析(Ion-exchangecolumnchromatography)此法是利用離子交換樹脂作為柱
層析支持物,將帶有不同電荷及電量的AA進(jìn)行分離的方法。
離子交換樹脂可以分為陽離子交換樹脂(如竣甲基纖維素等)和陰離子交換樹脂(如二乙
基氨基乙基纖維素等)。
陽離子交換層析中,帶正電荷多的AA與樹脂結(jié)合較強(qiáng),而帶正電荷少的AA與樹脂結(jié)合則
較弱。用不同濃度的陽離子洗脫液,如NaCl溶液進(jìn)行梯度洗脫,通過Na+的離子交換作用,
可以將帶有不同正電荷的AA進(jìn)行分離。也可以用不同pH值的緩沖液洗脫。
董電荷量少、…親和力小的先被洗脫I來,…帶電荷量多親和力大的后被洗脫下來一
?在惰性載體上引入帶有電荷的活性基團(tuán)即離子交換劑。
(一)按活性功能基團(tuán)帶電荷性質(zhì)不同
陽離子交換劑一帶負(fù)電荷,與陽離子交換
陰離子交換劑一帶正電荷,與陰離子交換
(-)按載體種類不同
I.離子交換樹脂:主要有聚苯乙烯樹脂
苯乙烯+二乙烯苯-聚苯乙烯
(單體)(交聯(lián)劑)
二乙烯苯
交聯(lián)度=----------------X100%
苯乙烯+二乙烯苯
樹脂resin(據(jù)所含交換基團(tuán)的性質(zhì)分)
陽離子交換樹脂強(qiáng)酸型含磺酸基團(tuán)(R-SO3H)
中等酸型含磷酸基團(tuán)(-O-PO2H4)
弱酸型含酚基、竣基
陰離子交換樹脂強(qiáng)堿含季胺基團(tuán)[-N+(CH3)3J
弱堿含叔胺、伯胺基團(tuán)[-N(CH3)2
陰離子交換樹脂對化學(xué)試劑及熱都不如陽離子交換樹脂穩(wěn)定。
2.離子交換纖維素
陰離子交換纖維素一如:DEAE-纖維素,pH8.6以下分離中性或酸性物質(zhì),具二乙胺乙基。
陽離子交換纖維素一如:CM-纖維素,一般pH>4條件下使用,具有竣甲基。
3.離子交換凝膠一分離大分子物質(zhì)
如:葡聚糖(Sephadex)、聚丙烯酰胺(PAG)、瓊脂糖(Sepharose)
氣相色譜(Gasliquidchromatography,GLC)
當(dāng)層析系統(tǒng)的流動(dòng)相為氣體,固定相為涂漬在固體表面的液體時(shí),這類層析技術(shù)被稱為氣-
液色譜或氣相色譜“原理也是分配過程,利用樣品組分在流動(dòng)的氣相和固定在顆粒表面的
液相的分配系數(shù)不同以達(dá)到分離組分的目的。涂有薄層液體的惰性顆粒被裝在一根長的不銹
鋼管或玻璃管中(色譜柱,column),在適當(dāng)溫度下,令高壓氣體連續(xù)通過色譜柱,待分離樣
品在進(jìn)樣室被氣化后流經(jīng)固定相,氣化的樣品在流動(dòng)的氣相和固定相的液相之間發(fā)生分配,
將組分分離開來。
氨基酸由于含有各種極性基團(tuán),氣化十分困難,必須將它們轉(zhuǎn)變?yōu)槿菀讚]發(fā)的衍生物才能
進(jìn)行氣相色譜。氨基酸與PITC反應(yīng)生成PTH-氨基酸,再經(jīng)三甲基硅烷基(trimethylsilylation),
可得到很好氣化的氨基酸衍生物。
高效液相色譜(Highperformanceliquidchromatography,HPLC)
曾稱高壓液相色譜,以液相色譜為基礎(chǔ),在經(jīng)典液相色譜實(shí)驗(yàn)和技術(shù)基礎(chǔ)上建立的一種液相
色譜法??焖?、靈敏、高效的分離和分析技術(shù)。
固相支持物的顆粒很細(xì),表面積很大;溶劑系統(tǒng)采取高壓,洗脫速度快。多種類型的柱層
析都可以用HPLC代替,如分配層析、離子交換層析、吸附層析、凝膠過濾等。
蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)及其分析
氨基酸的多聚物,分子量大小差異極大,可以是2或3個(gè)到成千上萬個(gè)氨基酸殘基連接而成。
兩個(gè)氨基酸殘基之間通過共價(jià)的酰胺鍵(肽鍵)連接形成一個(gè)二肽;三個(gè)氨基酸殘基連接成
三肽;…;有限數(shù)量的數(shù)十個(gè)氨基酸殘基連接成寡肽;多個(gè)氨基酸殘基則連接成多肽;蛋白
質(zhì)可以是成千上萬個(gè)氨基酸殘基連接而成。
多肽與蛋白質(zhì)有時(shí)混用,但一般將分子量在10000以下的稱為多肽。
肽或蛋白質(zhì)的水解是耗能的,由于高的活化能,水解很慢,蛋白質(zhì)的肽鍵非常穩(wěn)定,多數(shù)胞
內(nèi)條件下的半衰期為7年。
肽鍵就是一個(gè)氨基酸的a-竣基與另一個(gè)氨基酸的a-氨基脫水縮合形成的鍵
氨基酸連接成肽鏈后,由于氨基酸之間通過一個(gè)氨基酸的氨基與另一個(gè)氨基酸的竣基縮合脫
水,肽鏈上的一個(gè)氨基酸單位被稱為殘基(residue),帶有游離-氨基的一端被稱為氨基(末)
端(或N端),帶有游離-竣基的一端被稱為竣基(末)端(或C端)。
肽鏈上的解離特性
氨基酸形成肽鏈后,整個(gè)肽鏈上留下N端可解離的氨基、竣基端可解離的竣基、側(cè)鏈上能
夠解離的R基團(tuán),中間氨基酸的a-氨基和a-峻基由于形成肽鍵而不再對整個(gè)肽鏈的解離有
貢獻(xiàn)。肽也有特征滴定曲線及特征ph
R基團(tuán)的解離常數(shù)由于氨基酸的氨基和竣基被用于形成肽鍵成為了殘基,其解離在一定程度
上會發(fā)生改變,這種變化受到a-氨基及a-竣基失去電荷、與其他R基團(tuán)的作用、其他能夠
影響解離常數(shù)的環(huán)境因子有關(guān)。
生物活性的肽及多肽的大小差異極大
不能對生物活性肽及蛋白質(zhì)的分子量與功能之間作出相關(guān)性結(jié)論。自然存在的肽的大小從2
個(gè)到數(shù)千個(gè)氨基酸殘基,甚至最小的肽也能表現(xiàn)出重要的生物學(xué)作用,如商業(yè)化合成的二肽
L-天冬氨酰-L-苯丙氨酸甲酯[人工甜味劑-阿斯巴甜(aspartame)或紐特健康糖(NutraSweet),
比蔗糖甜200倍]。
谷胱甘肽Glutathion(e)(GSH)(GSSG)
GSH可被氧化成GSSGGSH作用:在紅細(xì)胞中作為筑基緩沖劑存在:維持血紅蛋白
和其它紅細(xì)胞蛋白質(zhì)的半胱氨酸殘基處于還原狀態(tài)。例如,它可防止H2O2將紅細(xì)胞中血色
素的二價(jià)鐵氧化成三價(jià)鐵形成高鐵血紅蛋白。
一些小肽在極低濃度下發(fā)揮作用
一些脊椎動(dòng)物的激素是小肽,包括催產(chǎn)素(oxytocin)(9個(gè)氨基酸殘基),由垂體后葉制造,
能刺激子宮收縮;舒緩激肽(bradykinin)(9肽)能使呼吸道平滑肌收縮,抑制組織炎癥;
甲狀腺激素釋放因子(3肽),下丘腦分泌,能刺激垂體前葉促甲狀腺素的釋放,它們發(fā)揮
作用的濃度極低。
與許多抗生素一樣,一些極毒的毒蘑菇毒素,如鵝膏蕈堿(毒素)(雙環(huán)的8肽毒素)
(amanitin),對動(dòng)物有致死作用,與真核生物RNA勿聚合酶作用抑制轉(zhuǎn)錄。
蛋白質(zhì)可以有不同的多肽亞基
一些蛋白質(zhì)只含有一條簡單的多肽鏈,而另一些蛋白質(zhì)成為多亞基蛋白質(zhì),含有兩條或更
多條非共價(jià)結(jié)合的多肽鏈。多亞基蛋白質(zhì)的獨(dú)立的多肽鏈可以是同一多肽鏈,也可以是不同
的多肽鏈。
有時(shí),不同的亞基形成小的寡聚體(oligomeric),并以此進(jìn)一步裝配。這種小的寡聚體被稱
為原體(protomers),原體再裝配成更大的聚集體。如血紅蛋白,四條非共價(jià)結(jié)合的多肽鏈,
兩條一致的鏈和兩條相同的鏈,可以稱為四條多肽亞基的四聚體或者原體的二聚體;
天冬氨酸氨甲酰磷酸轉(zhuǎn)移酶由6個(gè)調(diào)節(jié)亞基(R)和6個(gè)催化亞基(C)組成,裝配時(shí)先由
1個(gè)C亞基和1個(gè)R亞基組成一個(gè)原體CR,再由6個(gè)原體裝配成一個(gè)有活性的酶。
一些蛋白質(zhì)的兩條或多條多肽鏈?zhǔn)枪矁r(jià)連接的
胰島素的兩條多肽鏈通過二硫鍵共價(jià)連接,這種情況下,單條多肽鏈不是亞基,通常被簡單
地認(rèn)為是肽鏈。因此一條多肽鏈及共價(jià)連接的多肽鏈不是四級結(jié)構(gòu)。
從蛋白質(zhì)的大小估算氨基酸殘基數(shù)
可以從一個(gè)不含有其他化學(xué)基團(tuán)的蛋白質(zhì)分子估算其中的氨基酸殘基的大概數(shù)目,用蛋白質(zhì)
的分子量除以no,即為組成氨基酸的數(shù)目。
20種氨基酸的平均分子量為138,較小的氨基酸在多數(shù)蛋白質(zhì)中的豐度高,如果考慮不同氨
基酸在蛋白質(zhì)中出現(xiàn)的比例,平均分子量只有128,形成肽鍵時(shí)失去一分子水(18),因此,
蛋白質(zhì)分子中氨基酸殘基的平均分子量為128-18=110。
多肽具有特征性的氨基酸組成,多肽或蛋白質(zhì)以酸水解產(chǎn)生游離-氨基酸的混合物。當(dāng)完
全水解時(shí),每一種類型的蛋白質(zhì)產(chǎn)生一種特征性的氨基酸比例或混合物。20種氨基酸幾乎
從不以相同的比例出現(xiàn)在一個(gè)蛋白質(zhì)中,有高有低,甚至有的只出現(xiàn)一次或根本不出現(xiàn)。
有些蛋白質(zhì)含有非氨基酸的化學(xué)基團(tuán)
很多蛋白質(zhì),如核糖核甘酸酶、胰凝乳蛋白酶,僅含有氨基酸殘基,沒有其他化學(xué)基團(tuán)-單
純蛋白質(zhì).但有些蛋白質(zhì),除氨基酸殘基外,還含有永久連接的化學(xué)組成,被稱為復(fù)合蛋白
質(zhì),非氨基酸連接的化學(xué)基團(tuán)被稱為輔基(prostheticgroup)。復(fù)合蛋白質(zhì)的分類根據(jù)輔基的
化學(xué)特性,如脂蛋白含有脂、糖蛋白含有糖、金屬蛋白含有特異的金屬。有些蛋白質(zhì)甚至
含有不止一種輔基,輔基通常對蛋白質(zhì)的功能起重要作用。
肽的物理化學(xué)性質(zhì)
1、肽末端a-竣基pKa值比游離AA中的大,而肽末端a-氨基pKa值比游離AA中的小,
側(cè)鏈R基的差別不大。2、等電點(diǎn)(兩性)。3、酸堿性質(zhì)取決于:*竣基、a-氨基、
側(cè)鏈基團(tuán)的解離4、具有雙縮版(biuret)反應(yīng)(H2N-CO-NH-CO-NH2)-Pr特有的反應(yīng)
(與硫酸銅-氫氧化鈉溶液產(chǎn)生紫紅色或藍(lán)紫色顏色反應(yīng),可用于肽和蛋白質(zhì)定量測定)
蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次
1952年丹麥人Linderstrom-Lang最早提出蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)可以分成四個(gè)層次:
primarystructur一級結(jié)構(gòu):氨基酸序列
secondarystructure二級結(jié)構(gòu):a螺旋,B折疊
tertiarystructure三級結(jié)構(gòu):所有原子空間位置
quarternarystructure四級結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)多聚體
1969年正式將一級結(jié)構(gòu)定義為氨基酸序列和二硫鍵的位置.
介于二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)之間還存在超二級結(jié)構(gòu)(二級結(jié)構(gòu)的組合)和結(jié)構(gòu)域(在空間
上相對獨(dú)立的三維結(jié)構(gòu)的實(shí)體)這兩個(gè)層次。
肽鍵將氨基酸與氨基酸頭尾相連’
肽鍵的特點(diǎn)是氮原子上的孤對電子與叛基具有明顯的共趣作用;組成肽鍵的原子
處于同一平面:肽鍵中的C-N鍵具有部分雙鍵性質(zhì),不能自由旋轉(zhuǎn);在大多數(shù)情況下,以
反式結(jié)構(gòu)存在。
肽鍵平面一般C=N雙鍵(0.128nm)肽鍵的C及N周圍三個(gè)鍵角之和均為360°
6個(gè)原子處于同一肽鍵平面上
兩個(gè)肽平面以一個(gè)C。為中心發(fā)生旋轉(zhuǎn)兩個(gè)肽鍵平面之間的a-碳原子,可以作為一個(gè)旋
轉(zhuǎn)點(diǎn)形成二面角(dihedralangle)?二面角的變化,決定著多肽主鍵在三維空間的排布方式,
是形成不同蛋白質(zhì)構(gòu)象的基礎(chǔ)。
二面角(DihedralAngle)繞C「N鍵軸旋轉(zhuǎn)的二面角(C-N-C-C)稱為?,繞C.-C鍵軸旋
轉(zhuǎn)的二面角(NCCN)稱為巾,原則上4)和巾可以取-180°~+180°之間的任一值,這樣
多肽鏈主鏈的各種可能構(gòu)象都可用力和由這兩個(gè)二面角或扭角來描述。
研究蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu),就是要將氨基酸的排列順序搞清楚。
二十世紀(jì)四十年代起,許多人不遺余力地從事蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)研究,Sanger第一個(gè)將一
個(gè)蛋白質(zhì)(胰島素)的所有氨基酸的排列順序通過高度的實(shí)驗(yàn)技巧加以確定。
蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的測定
歷史上第一個(gè)被確定氨基酸序列的肽(蛋白質(zhì))胰島素Insulin,51AAs
最小的蛋白質(zhì),由A鏈(21AA)和B鏈(30AA)組成;胰腺B細(xì)胞分泌的一種激素,告訴細(xì)胞
往里面運(yùn)輸糖、氨基酸、K+:
1921年Banting&Best從胰腺中抽提出了有活性的胰島素,1923年Banting&Macleod獲
Nobel醫(yī)學(xué)獎(jiǎng);
1943—53年,Sanger確定了牛胰島素的一級結(jié)構(gòu),1958年獲得Nobel化學(xué)獎(jiǎng);兩獲諾貝爾
獎(jiǎng)(僅4人),唯一兩獲諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。
1981年,Berg(因DNA重組技術(shù)得獎(jiǎng))在大腸桿菌中表達(dá)了人胰島素。
Sanger試劑(FDNB)標(biāo)記N末端
ABCDE
I
*ABCDE
I
*A,*AB,*ABC,*ABCD,*ABCDE
I
次A,*A+B,.........*A+B+C+D+E
I
*A,*A+*B,.........*A+*B+*C+*D+*E
12345
結(jié)論:ABCDE
紙層析、薄層層析幫助確定氨基酸種類
最終靠重疊法確定整個(gè)肽鏈
------------------多肽
氨基酸序列
歷史上第一個(gè)被確定氨基酸序列的酶(I960年)核酸酶Ribonuclease,124AAs
Moore&Stein氨基酸自動(dòng)分析儀=£<10^111降解法+Sanger法獲1972年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)
全自動(dòng)氨基酸分析儀氨基酸分析儀是進(jìn)行氨基酸分離、衍生和檢測的自動(dòng)化分析系統(tǒng),
廣泛用于制藥、食品、飼料、農(nóng)業(yè)、育種、醫(yī)學(xué)研究、臨床診斷和地質(zhì)考察等領(lǐng)域。
原理:陽離子交換分離、柱后即三酮衍生、可見光光度法測定。
蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的經(jīng)典分析方法
測定蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的要求
1.樣品必需純(>97%以上);
2.測定蛋白質(zhì)的分子量;
3.測定蛋白質(zhì)由幾個(gè)亞基組成;
4.測定蛋白質(zhì)的氨基酸組成;并根據(jù)分子量計(jì)算每種氨基酸的個(gè)數(shù)。
5.測定水解液中的氨量,計(jì)算酰胺的含量。
蛋白質(zhì)和多肽氨基酸順序的測定
(1)、肽鏈的拆開和分離(2)、測定蛋白質(zhì)分子中多肽鏈的數(shù)目(3)、二硫鍵的斷裂(4)、測
定每條多肽鏈的氨基酸組成,并計(jì)算出氨基酸成分的分子比(5)、N端、C端的測定(6)、
多肽鏈斷裂(7)、測定每個(gè)肽段的氨基酸順序(8)、確定肽段在多肽鏈中的次序(9)、確定原多
肽鏈中二硫鍵的位置
多肽鏈的拆分由多條多肽鏈組成的蛋白質(zhì)分子,必須先進(jìn)行拆分。
幾條多肽鏈借助非共價(jià)鍵連接在一起,稱為寡聚蛋白質(zhì),如血紅蛋白為四聚體,烯醇化酶為
二聚體??捎?moi/L尿素或6moi/L鹽酸胭處理,即可分開多肽鏈(亞基)。
測定蛋白質(zhì)分子中多肽鏈的數(shù)目
通過測定末端氨基酸殘基的摩爾數(shù)與蛋白質(zhì)分子量之間的
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