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關(guān)于實(shí)驗(yàn)五轉(zhuǎn)基因植物的檢測(cè)1、檢測(cè)外源基因在植物細(xì)胞中的轉(zhuǎn)錄,對(duì)外源基因表達(dá)調(diào)控進(jìn)行研究,掌握引物的選擇、cDNA的合成、RT-PCR檢測(cè)的原理與方法。。實(shí)驗(yàn)?zāi)康牡?頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天第3頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天第4頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天第5頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天第6頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天第7頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天第8頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天第9頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天第10頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天第11頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天第12頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天第13頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天第14頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天第15頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天1、材料:轉(zhuǎn)基因植物的RNA或mRNA制備物。非轉(zhuǎn)化的植株材料總RNA或mRNA制備物2、設(shè)備:PCR儀、移液器、PCR管等。3、試劑:10×RT緩沖液、dNTP、逆轉(zhuǎn)錄酶、引物(隨機(jī)引物,OligodT;特異引物)、10×OneStepRNAPCRBuffer、25mMMgCl2、10mMdNTP、RNaseInhibitor(40U/μl)、AMV-OptimizedTaq1μl、AMVRTaseXL(5U/μl)、上游特異Primer(20μM)*1、下游特異Primer(20μM)*2、RNaseFreeH2O。實(shí)驗(yàn)材料、設(shè)備及試劑第16頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天實(shí)驗(yàn)操作步驟:1)RNA提?。?/p>
關(guān)鍵防止RNA降解RNA提取的成功與否是RT-PCR檢測(cè)中最重要的步驟。第17頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天2、cDNA第一鏈的合成:取1個(gè)0.2ml的PCR管,依次加入下列試劑:10×PCRBuffer1μlRNaseFreedH2O5.75μldNTP1μlRNaseInhibitor0.25μlAMVRTaseTranscriptase0.5μloligodT-Adaptorprimer0.5μlRNA1μlTotal10μl實(shí)驗(yàn)步驟第18頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天反應(yīng)條件:
42℃30min99℃5min5℃5min第19頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天3、PCR反應(yīng)取一個(gè)0.2ml的PCR管,依次加入下列試劑:
10×PCRBuffer
4μl
滅菌蒸餾水9μl
10mMdNTP2.5μl
Taq酶0.1μl
上游特異Primer(20μM)*1
0.2μl
下游特異Primer(20μM)*2
0.2μl
Total16μl
將(1)的反應(yīng)結(jié)果稀釋20倍,取10μl加入到(2)管中,輕輕搖勻。第20頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天反應(yīng)條件:94℃2min94℃30s55℃30s72℃1min72℃7min30Cycles第21頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天目前研究轉(zhuǎn)基因植物外源基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)的常用方法1、RT-PCR(RNA)
2、Northernblot(RNA)
3、real-timePCR(RNA
)
第22頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天結(jié)果與分析利用凝膠成像分析儀對(duì)電泳結(jié)果進(jìn)行拍照和結(jié)果記錄;觀察膠上是否有預(yù)擴(kuò)增的主要產(chǎn)物帶。對(duì)比目的基因產(chǎn)物的電泳譜帶分子量和譜帶的特異性,確定和描述譜帶特征。
RT-PCR擴(kuò)增得到的810bp的目的基因產(chǎn)物的電泳結(jié)果第23頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天1、將實(shí)驗(yàn)結(jié)果粘到實(shí)驗(yàn)報(bào)告上。2、如何選擇RT-PCR的反轉(zhuǎn)錄引物。3、結(jié)合實(shí)驗(yàn)結(jié)果,試論應(yīng)用RT-PCR研究外源基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)的優(yōu)缺點(diǎn)。實(shí)驗(yàn)報(bào)告第24頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天實(shí)驗(yàn)一、質(zhì)粒三種提取方法的比較為什么要用對(duì)數(shù)期的菌液提取質(zhì)粒?因?yàn)閷?duì)數(shù)期菌的生長(zhǎng)狀況和數(shù)量最佳,有利于提取質(zhì)粒
溶液Ⅱ、溶液Ⅲ的作用?溶液Ⅰ50mM葡萄糖/10mMEDTA/25mMTris-HCl,pH=8.0葡萄糖增稠,使懸浮后的大腸桿菌不會(huì)快速沉積到管子的底部;EDTA抑制DNase的活性。這一步溶液中還可以加入RNase,不受EDTA影響,并且可以在后續(xù)步驟中被除去溶液Ⅱ0.2MNaOH/1%SDS破細(xì)胞的主要是堿,而不是SDS,所以才叫堿法抽提。溶液Ⅲ3M醋酸鉀/2M醋酸這一步的K置換了SDS(十二烷基磺酸鈉)中的Na,得到PDS(十二烷基磺酸鉀)沉淀;SDS易與蛋白質(zhì)結(jié)合,平均兩個(gè)氨基酸上結(jié)合一個(gè)SDS分子,鉀鈉離子置換所產(chǎn)生的大量沉淀自然就將絕大部分蛋白質(zhì)也沉淀了,同時(shí)基因組DNA也被PDS共沉淀第25頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天溶菌酶的作用作用?沸水加熱的作用?利用溶菌酶和TritonX-100破壞細(xì)胞壁,加熱可使蛋白質(zhì)和染色體DNA變性.將實(shí)驗(yàn)電泳結(jié)果粘到實(shí)驗(yàn)報(bào)告上,并對(duì)結(jié)果分析。比較三種提取方法的區(qū)別?第26頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天實(shí)驗(yàn)二、醋酸鋰法轉(zhuǎn)化酵母細(xì)胞觀察并描述培養(yǎng)狀況,統(tǒng)計(jì)單菌落個(gè)數(shù)。比較酵母細(xì)胞轉(zhuǎn)化與大腸桿菌細(xì)胞轉(zhuǎn)化的區(qū)別。酵母菌屬于真核生物,大腸桿菌是細(xì)菌屬于原核生物.酵母轉(zhuǎn)化在室溫,大腸桿菌轉(zhuǎn)化在冰上酵母轉(zhuǎn)化用醋酸鋰,大腸桿菌轉(zhuǎn)化用氯化鈣酵母轉(zhuǎn)化用穿梭質(zhì)粒,大腸桿菌轉(zhuǎn)化用普通質(zhì)粒穿梭質(zhì)粒是指一類人工構(gòu)建的具有兩種不同復(fù)制起點(diǎn)和選擇標(biāo)記,因而可以在兩種不同類群宿主中存活和復(fù)制的質(zhì)粒載體。比如說(shuō)通常能夠在哺乳動(dòng)物,酵母或者其他細(xì)菌復(fù)制表達(dá)的質(zhì)粒,同時(shí)可以在大腸桿菌內(nèi)復(fù)制。這樣利于對(duì)質(zhì)粒的分子生物學(xué)操作和大量制備。第27頁(yè),共29頁(yè),2024年2月25日,星期天實(shí)驗(yàn)三、侵染菌種對(duì)除菌抗生素的敏感性頭孢酶素100200300400500600頭孢唑啉鈉------頭孢哌酮鈉------頭孢曲松鈉-++++++++++++++++頭孢噻肟鈉--+++++++++++++-:表示無(wú)抑制作用;
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