如何使用好PubMed課件

認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研主要內(nèi)容一、

認(rèn)識PubMed二、PubMed

檢索入門三、PubMed高級檢索四、PubMed醫(yī)學(xué)主題詞表檢索五、PubMed其他功能六、PubMed個(gè)性化服務(wù)WebofScience您的選擇？GoogleScholarPubMedScopusgoogle一、認(rèn)識PubMed/guide/一、認(rèn)識PubMedPubMed與NCBI數(shù)據(jù)庫的關(guān)系圖一、認(rèn)識PubMed標(biāo)引質(zhì)量高更新速度快信息量大使用方便選擇PubMed的n個(gè)理由一、認(rèn)識PubMedPubMedABDCMedlineOldMedlineIn

Process

CitationsRecordsuppliedbypublisher一、認(rèn)識PubMedOLDMEDLINE:

收錄了1950－1965年間的美國醫(yī)學(xué)索引（IM）中的題錄。InProcess

Citations

:是臨時(shí)性的數(shù)據(jù)庫，收錄準(zhǔn)備進(jìn)行標(biāo)引的題錄和文摘信息，每天都在接受新的數(shù)據(jù)，進(jìn)行文獻(xiàn)的標(biāo)引和加工，每周把加工好的數(shù)據(jù)加入到Medline中，同時(shí)從InProcessCitations庫中刪除。InProcessCitations中的記錄標(biāo)有[PubMed-inprocess]。Recordsuppliedbypublisher：出版商將期刊文獻(xiàn)信息電子版提供給PubMed后，每條記錄都標(biāo)有[PubMed-assuppliedbypublisher]，這些記錄每天都在不停地向InProcessCitations庫中傳送，加入到InProcessCitations后，原有的標(biāo)記將改為[PubMed-inprocess]。Medline：是美國國立醫(yī)學(xué)圖書館（U.S.NationalLibraryofMedicine）最重要的書目文摘數(shù)據(jù)庫。收錄了全世界70多個(gè)國家和地區(qū)的5000余種生物醫(yī)學(xué)期刊，書目文摘條目1500萬余條，時(shí)間起自1966年。標(biāo)有[PubMed-indexedforMEDLINE]的標(biāo)記一、認(rèn)識PubMed一、認(rèn)識PubMed/pubmed/檢索提問區(qū)文獻(xiàn)匹配臨床研究特定主題咨詢期刊檢索主題檢索高級檢索一、認(rèn)識PubMed2.1單著者檢索2.1.1

鍵入著者姓氏全稱和名字的首字母全寫或縮寫如: MichaelHeuser Heuser,Michael Heuser

M

MichaelHeuser[au]2.1.2利用高級檢索中的“Author”檢索,選下拉選項(xiàng)定位二、PubMed檢索入門2.3.1直接輸入您所要檢索的關(guān)鍵詞或主題詞,英文單詞或短語（大寫或小寫均可）,詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能進(jìn)行檢索，并將檢索結(jié)果直接顯示在主頁下方。

如:acutemyeloidleukemia.2.2著者與主題聯(lián)合檢索2.2.1直接輸入作者姓名與主題詞,不用AND如:

MichaelHeuserIDH2.3

單主題檢索二、PubMed檢索入門2.4期刊檢索2.4.1輸入期刊名，ISSN，Medlinejounaltitleabbreviation

如:naturemedicine[TA]ORnatmed[TA]

1078-8956

2.4.2用singlecitationmatcher中的期刊名稱檢索2.4.3用journaldatabase檢索二、PubMed檢索入門2.5.1布爾邏輯運(yùn)算符(AND,OR,NOT)

如：OncologyAND(treatmentORresearch)2.5.2

截詞符(*)用于相同詞根的詞

如:

bacter*2.5.3

詞組檢索(“”)（必須是英文字符）

如:

“Singlecell”2.5.4

通配符(?)如:

“cell?”2.5組配/截詞/短語檢索二、PubMed檢索入門2.9PubMed檢索字段標(biāo)識二、PubMed檢索入門字段名稱字段標(biāo)積字段含義Affiliation[AD]第一著者單位、地址AllFields[ALL]所有字段Author[AU]著者CorporateAuthor[CN]團(tuán)體著者FirstAuthorName[1AU]第一著者FullAuthorName[FAU]著者全名ISBN[ISBN]ISBNIssue[IP]期刊期號Journal[TA]期刊名稱（含全稱、縮寫、ISSN號）Language[LA]語種LastAuthor[LASTAU]排名最后的著者M(jìn)eSHMajorTopic[MAJR]主要MeSH主題詞，用*表示MeSHSubheadings[SH]MeSH副主題詞MeSHTerms[MH]MeSH主題詞OtherTerm[OT]款目詞（非MeSH主題詞）Pagination[PG]文獻(xiàn)起止頁碼PersonalNameasSubject[PS]作為文獻(xiàn)主題的人名PharmacologicalAction[PA]藥理作用概念PlaceofPublication[PL]期刊出版國別PublicationDate[DP]出版日期PublicationType[PT]文獻(xiàn)類型Subset[SB]數(shù)據(jù)子集TextWords[TW]文本詞，來自TI、AB、MH、SH、PT等字段Title[TI]題名Title/Abstract[TIAB]題名/摘要UID[PMID]PubMed文獻(xiàn)唯一識別碼Volume[VI]期刊卷號1默認(rèn)SUMMARY（簡要格式）顯示2可標(biāo)記后點(diǎn)擊DisplaySettings鍵3默認(rèn)每頁顯示20條4最多一次可保存10000條記錄5可用瀏覽器的打印功能2.10PubMed檢索結(jié)果顯示及處理

二、PubMed檢索入門二、PubMed檢索入門二、PubMed檢索入門2.11PubMed基本檢索舉例維生素C對于普通感冒的防治作用“VITAMINC”ANDCOMMONCOLD二、PubMed檢索入門檢索2000-2005年以后有關(guān)Crohn病藥物治療研究的文獻(xiàn)"CrohnDisease"[mh]AND"drugtherapy"[Subheading]AND2000[EDAT]:2005[EDAT]檢索事半功倍Clipboard

HistoryFilterDetails檢索框三、PubMed高級檢索3.1Filter在這里可以進(jìn)行以下設(shè)定：

?

將搜索范圍設(shè)定在一個(gè)特定的域。

?

將搜索范圍設(shè)定在特定的年齡組、性別組、人類或動(dòng)物學(xué)范圍。

?

也可以將搜索限定在某一語種出版的或某一特定的文章類型,如綜述?

設(shè)定只搜索包含摘要的文獻(xiàn)。

?

設(shè)定搜索Entrez數(shù)據(jù)庫或Publication數(shù)據(jù)庫。

?

設(shè)定搜索范圍為PubMed數(shù)據(jù)庫的某一子數(shù)據(jù)庫（如AbridgedIndexMedicus或AIDS相關(guān)的條目）。……需要注意的是：限制了出版物類型、年齡、人或動(dòng)物、性別中的任何一項(xiàng)，檢索將只在Medline中進(jìn)行檢索（因?yàn)檫@些特征限制只有Medline中才有）。三、PubMed高級檢索三、PubMed高級檢索人或動(dòng)物實(shí)驗(yàn)選擇性別選擇語種選擇期刊分類選擇：核心臨床醫(yī)學(xué)牙科期刊護(hù)理期刊Medline期刊年齡選擇出版物類型選擇三、PubMed高級檢索看到最近100次的查詢結(jié)果。如果兩次查詢內(nèi)容相同，PubMed會將頭一次的去除。當(dāng)點(diǎn)擊ClearHistory可以將History中的所有內(nèi)容清除3.2

History三、PubMed高級檢索3.3Clipboard

貼板可以幫助你保存或查看在一個(gè)或多個(gè)查詢中選擇的條目。可以打印、保存、訂購剪貼板中的內(nèi)容。條目復(fù)選框選中，單擊“sendtoclipboard”就可以將其加入剪貼板中。剪貼板中最大的儲存數(shù)是500條。剪貼板中的內(nèi)容在8小時(shí)內(nèi)沒有任何操作，將會自動(dòng)消失。三、PubMed高級檢索

3.4Details

即在提問框中鍵入的檢索詞被PubMed自動(dòng)地轉(zhuǎn)換成了哪些詞，并使用了什么樣的檢索規(guī)則和檢索語法。三、PubMed高級檢索Result區(qū)顯示檢索結(jié)果的記錄總數(shù)，點(diǎn)擊這個(gè)數(shù)字，可回到檢索結(jié)果顯示屏Translation區(qū)顯示檢索詞轉(zhuǎn)換的詳細(xì)情況Database區(qū)顯示檢索的數(shù)據(jù)庫UserQuery區(qū)顯示用戶鍵入的檢索詞或檢索式對檢索策略進(jìn)行編輯

三、PubMed高級檢索文獻(xiàn)太多，如何保證查全和查準(zhǔn)？四、PubMed醫(yī)學(xué)主題詞表檢索何為MeSH？MeSH是MedicalSubjectHeadings的縮略詞，即醫(yī)學(xué)主題詞，是用規(guī)范化的醫(yī)學(xué)術(shù)語來描述生物醫(yī)學(xué)概念。論述文獻(xiàn)中心的主題詞稱主要主題詞論述主題某一方面的內(nèi)容的詞稱為副主題詞

Mesh詞表幫助您！4.1MeSHDatabase的運(yùn)用詞義解釋四、PubMed醫(yī)學(xué)主題詞表檢索檢出結(jié)果限定在主要主題詞可提高查準(zhǔn)率限制擴(kuò)展檢索，只需檢索單個(gè)主題詞副主題詞4.2MeSH檢索實(shí)例演示miRNA在腫瘤治療方面的應(yīng)用四、PubMed醫(yī)學(xué)主題詞表檢索五、PubMed其他功能實(shí)現(xiàn)單篇文章的一對一檢索實(shí)現(xiàn)多篇文章的一次性檢索一次最多可檢索PubMed中100條文獻(xiàn)紀(jì)錄,獲得文獻(xiàn)的PMID

檢索結(jié)果更加貼近臨床的需要五、PubMed其他功能五、PubMed其他功能臨床研究系統(tǒng)回顧醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)限定于各類不同的醫(yī)學(xué)臨床主題進(jìn)行檢索五、PubMed其他功能實(shí)現(xiàn)PubMed與核酸和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫、基因組數(shù)據(jù)庫、分類學(xué)數(shù)據(jù)、圖書等數(shù)據(jù)庫之間的多向鏈接,多向查詢五、PubMed其他功能與PubMed建立聯(lián)系的網(wǎng)站，如某篇文獻(xiàn)所對應(yīng)期刊的出版商，文獻(xiàn)全文、相關(guān)數(shù)據(jù)庫及網(wǎng)站等。五、PubMed其他功能認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研五、PubMed其他功能免費(fèi)期刊的獲取PubMed提供了免費(fèi)全文期刊網(wǎng)址

PubmedCentral

/pmc/journals/向作者索要作者主頁

五、PubMed其他功能六、PubMed的個(gè)性化服務(wù)保存檢索式(生成URL或HTML實(shí)現(xiàn)共享)檢索結(jié)果的分類過濾特定功能的參數(shù)設(shè)置六、PubMed的個(gè)性化服務(wù)書目管理設(shè)置經(jīng)由2000多位專家學(xué)者的評價(jià)推薦，提供目前世界上最重要的生物學(xué)論文資訊及研究趨勢。特色是收錄每篇具有科學(xué)價(jià)值的文獻(xiàn)，而不考慮這些文獻(xiàn)在哪在些期刊里發(fā)表PubMed里檢索出最核心的文獻(xiàn)——Facultyof1000與pubmed的完美結(jié)合六、PubMed的個(gè)性化服務(wù)目的:用PubmedFilters功能實(shí)現(xiàn)對高影響因子文章的篩選舉例:檢索出關(guān)于“HepatitisC”并且所有影響因子大于10的文章用PubmedFilters功能實(shí)現(xiàn)對高影響因子文章的篩選輸入檢索式，登陸MyNCBI（如果沒有的話請注冊）用PubmedFilters功能實(shí)現(xiàn)對高影響因子文章的篩選臨時(shí)注冊的Testdxy，點(diǎn)擊ManageFilters用PubmedFilters功能實(shí)現(xiàn)對高影響因子文章的篩選點(diǎn)擊Createcustomfilter用PubmedFilters功能實(shí)現(xiàn)對高影響因子文章的篩選在彈出的對話框中輸入包含所有影響因子大于10的期刊名的檢索式用PubmedFilters功能實(shí)現(xiàn)對高影響因子文章的篩選問題：檢索式哪里來？自己輸入豈不是要累死？答案：用EXCEL和WORD強(qiáng)大功能自動(dòng)生成。首先，下載2011影響因子EXCEL文件。（丁香園中有，免叮當(dāng)，鏈接：/search?keyword=2011%E5%BD%B1%E5%93%8D%E5%9B%A0%E5%AD%90&ext=3）或/detail/5089076或使用百度檢索式（2013

影響因子xls）自行下載用PubmedFilters功能實(shí)現(xiàn)對高影響因子文章的篩選文件打開后如下。按影響因子排列，

選擇所有影響因子大于10的期刊名用PubmedFilters功能實(shí)現(xiàn)對高影響因子文章的篩選新建WORD文檔，開始菜單中選擇性粘貼無格式的文本用PubmedFilters功能實(shí)現(xiàn)對高影響因子文章的篩選Ctrl+H啟用替換功能，在查找內(nèi)容中輸入^p（其含義是段落標(biāo)記，也就是回車符），替換為中輸入”[journal]or”（注意包括引號，引號必須是英文字符）。替換所有后，刪除最后的or”，在段首如入一個(gè)英文引號”。到此包括所有影響因子大于10的期刊名的檢索式輸入完畢用PubmedFilters功能實(shí)現(xiàn)對高影響因子文章的篩選輸入前文提到的檢索式輸入框，將本Filter起名為IF>10，然后Save用PubmedFilters功能實(shí)現(xiàn)對高影響因子文章的篩選重新回到pubmed主頁面，輸入檢索式HepatitisC，選擇剛才創(chuàng)建的IF>10Filter用PubmedFilters功能實(shí)現(xiàn)對高影響因子文章的篩選56344篇文獻(xiàn)精簡為4662篇大于10分的文章。

大功告成！用PubmedFilters功能實(shí)現(xiàn)對高影響因子文章的篩選其他另外，還可以自己創(chuàng)立影響因子大于5的Filter，以及包含自己專業(yè)主要期刊的Filter。用PubmedFilters功能實(shí)現(xiàn)對高影響因子文章的篩選(“JAMSOCNEPHROL”[TA]or“KIDNEYINT”[TA]or“AMJKIDNEYDIS”[TA]or“NephrolDialTransplant”[TA])用PUBMED的SaveSearch功能實(shí)現(xiàn)關(guān)注最新文章membranousnephropathyand(“JAMSOCNEPHROL”[TA]or“KIDNEYINT”[TA]or“AMJKIDNEYDIS”[TA]or“NephrolDialTransplant”[TA])PubMed其實(shí)還有更加豐富多彩的內(nèi)容等著你去挖掘/medlineplus/

查閱各種健康疾病相關(guān)的主題，醫(yī)藥信息。還有一部非常完善的在線醫(yī)學(xué)詞典。此外，你還可以瀏覽到很多有用的健康新聞。

六、PubMed的個(gè)性化服務(wù)認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研GoPubMed是德國Transinsight公司和德國德累斯頓大學(xué)合作，利用生物信息學(xué)相關(guān)知識開發(fā)的一個(gè)可以對PubMed檢索結(jié)果進(jìn)行探索、分析的工具。六、PubMed的個(gè)性化服務(wù)認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研四個(gè)“W”分析功能六、PubMed的個(gè)性化服務(wù)認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研時(shí)間分析國家分析六、PubMed的個(gè)性化服務(wù)認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研城市分析刊物分析六、PubMed的個(gè)性化服務(wù)認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研作者分析主題分析六、PubMed的個(gè)性化服務(wù)認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研研究態(tài)勢地區(qū)分布圖六、PubMed的個(gè)性化服務(wù)認(rèn)識PubMed——讓它融入您的科研研究人員關(guān)系網(wǎng)線條越多，線形越多，地位越重要六、PubMed的個(gè)性化服務(wù)附：文獻(xiàn)檢索經(jīng)驗(yàn)談查準(zhǔn)找高水平論文-閱讀introduction和discussion。找高水平綜述-了解整體情況。查新：查找引用重要綜述或重要論文的最新文章（webofscience）。查找大牛課題組發(fā)表達(dá)最新文章。利用PUBMED的SaveSearch功能了解常見雜志的影響因子

選擇閱讀最重要的文獻(xiàn)NATMED 22.864JAMSOCNEPHROL ·

8.987NATREVNEPHROL 7.943KIDNEYINT 7.916CLINJAMSOCNEPHRO 5.068AMJKIDNEYDIS 5.294CURROPINNEPHROLHY 3.964AMJPHYSIOL-RENAL 3.612NEPHROLDIALTRANSPL 3.371/sci/如何查影響因子文獻(xiàn)檢索舉例檢索目的：miRNA21在腎臟纖維化中的作用。(microRNA-21ormiR-21)and(renalork