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文檔簡介
2023/12/251發(fā)酵學(xué)第一假說:
代謝能支撐假說
第一節(jié)微生物細(xì)胞過程的熱力學(xué)第二節(jié)微生物細(xì)胞內(nèi)外的物質(zhì)交換第三節(jié)化能異養(yǎng)型微生物的生物氧化第四節(jié)化能異養(yǎng)型微生物的能量形式轉(zhuǎn)換
第五節(jié)質(zhì)子運(yùn)動(dòng)勢和活細(xì)胞的質(zhì)子回路
第六節(jié)代謝能對(duì)微生物生長和維持的支撐2023/12/252請(qǐng)帶著以下問題學(xué)習(xí):
1.怎么給代謝能下定義?為什么代謝能支撐是細(xì)
胞生物的基本性質(zhì)?
2.代謝能如何支撐微生物細(xì)胞的生命活動(dòng)?
3.為什么化能異養(yǎng)型微生物細(xì)胞屬于開放體系?
4.怎樣認(rèn)識(shí)生物氧化的氧化還原本質(zhì)?在生物氧
化過程中,脫氫酶(或氧化酶)的輔酶有什么
不可替代的作用?
5.為什么說微生物細(xì)胞的質(zhì)子回路是代謝能支撐
生命活動(dòng)的一種重要表現(xiàn)形式?
6.發(fā)酵學(xué)的三個(gè)基本假說是針對(duì)典型的工業(yè)發(fā)酵
提出的,所謂典型的工業(yè)發(fā)酵是什么樣的發(fā)酵?
2023/12/253發(fā)酵學(xué)第一假說·代謝能支撐假說
能直接推動(dòng)生命活動(dòng)(做細(xì)胞功)的能量形式叫做代謝能。微生物細(xì)胞依靠其自備的能量轉(zhuǎn)換機(jī)構(gòu),把化學(xué)能或光能持續(xù)地轉(zhuǎn)化成代謝能,并直接用來支撐其自身的生命活動(dòng)。2023/12/254以上假說試圖說明三個(gè)問題:
①什么叫代謝能?
②微生物細(xì)胞怎樣獲得代謝能?
③代謝能與微生物的生命活動(dòng)有什么
關(guān)系?2023/12/255生命活動(dòng)是生物體高度有序的序列反應(yīng)的總和,是耗能的、不可逆的過程。盡管不同的生物可以使用不同的能源;然而,實(shí)際上吸能的生物化學(xué)反應(yīng)只能接受代謝能(metabolicenergy),即可供細(xì)胞新陳代謝直接利用的能量形式。因此所有的生物體內(nèi)都存在把其他形式的能量轉(zhuǎn)化成代謝能的過程,以及代謝能支撐的問題。2023/12/256
工業(yè)發(fā)酵過程主要是微生物細(xì)胞群體的生命活動(dòng)過程。微生物細(xì)胞的生命活動(dòng)當(dāng)然也是耗能的,微生物細(xì)胞的大量的生物化學(xué)反應(yīng)和細(xì)胞過程也只能接受代謝能。但是——2023/12/257微生物細(xì)胞直接面向環(huán)境而獨(dú)立存在的處境,以及微生物細(xì)胞自主應(yīng)對(duì)環(huán)境變化的生存方式,要求微生物細(xì)胞必須自己解決能量形式轉(zhuǎn)換等生死攸關(guān)的問題。2023/12/258也就是說微生物細(xì)胞必須自備與能源相對(duì)應(yīng)的能量形式轉(zhuǎn)換機(jī)構(gòu),并具備把能源提供的能量形式持續(xù)不斷地轉(zhuǎn)化成代謝能的能力,最終實(shí)現(xiàn)代謝能對(duì)微生物細(xì)胞生命活動(dòng)的支撐。2023/12/259
能量經(jīng)典地定義為物體做功的能力。能量是物質(zhì)運(yùn)動(dòng)的一種度量,對(duì)應(yīng)于物質(zhì)不同的運(yùn)動(dòng)形式,能量也有不同的形式。代謝能是對(duì)應(yīng)于生命運(yùn)動(dòng)的能量形式,是生物體直接用來建設(shè)自身或維持生命活動(dòng)的能量形式。
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代謝能以高能磷酸鍵或電場的方式儲(chǔ)存在代謝能的載體中,腺苷酸和可以被能量化的生物膜是最常見的代謝能載體,ATP(能量貨幣)和Δp(質(zhì)子運(yùn)動(dòng)勢,能庫)是代謝能最常見的供體。2023/12/2511代謝能支撐假說是發(fā)酵學(xué)最基本的假說,它規(guī)定了工業(yè)發(fā)酵的生物學(xué)屬性。本章將以代謝能支撐假說為中心,闡述微生物細(xì)胞內(nèi)外的物質(zhì)交換、化能異養(yǎng)型微生物生物氧化的氧化還原本質(zhì),進(jìn)而認(rèn)識(shí):2023/12/2512
微生物細(xì)胞進(jìn)行持續(xù)的能量代謝是微生物細(xì)胞的生命線,也是工業(yè)發(fā)酵成立的最起碼的條件。2023/12/2513第一節(jié)微生物細(xì)胞過程的熱力學(xué)
2.1.1生命系統(tǒng)是開放系統(tǒng)2.1.2經(jīng)典熱力學(xué)與微生物代謝2.1.3吉布斯自由能和代謝能2023/12/2514細(xì)胞過程的熱力學(xué)研究細(xì)胞的單個(gè)反應(yīng)和以代謝網(wǎng)絡(luò)為基礎(chǔ)的代謝的可行性。
2.1.1生命系統(tǒng)是開放系統(tǒng)
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熱力學(xué)分為平衡態(tài)熱力學(xué)(或經(jīng)典熱力學(xué))和非平衡熱力學(xué)。經(jīng)典熱力學(xué)只考慮平衡狀態(tài),因此,對(duì)于細(xì)胞通過代謝途徑而實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)化的特性的深入研究,幾乎沒有幫助。熱力學(xué)第二定律加上吉布斯相平衡原理,能夠確定某一反應(yīng)或轉(zhuǎn)化過程是否可行等(是否可沿某一方向進(jìn)行),但卻不能給出反應(yīng)速率。它們主要應(yīng)用于封閉系統(tǒng)中的可逆反應(yīng),在封閉系統(tǒng)中,這些反應(yīng)最終幾乎總是達(dá)到平衡態(tài)。2023/12/2516
然而,生命系統(tǒng)是開放系統(tǒng),不會(huì)達(dá)到平衡。它們通過將高焓低熵的基質(zhì)轉(zhuǎn)化成低焓高熵的代謝產(chǎn)物,不斷地獲得自由能(其中一部分轉(zhuǎn)化為代謝能,用來推動(dòng)有序化進(jìn)程)。吉布斯自由能:
G=H-TS
G,吉布斯自由能
H,物系的焓(描述恒壓熱效應(yīng))
T,絕對(duì)溫度
S,物系的熵(描述混亂程度)2023/12/25172.1.2經(jīng)典熱力學(xué)與微生物代謝2023/12/2518熱力學(xué)把宇宙中我們感興趣的部分定義為系統(tǒng),諸如一個(gè)生物反應(yīng)器或一個(gè)細(xì)胞,而把其他部分叫做它的環(huán)境。系統(tǒng)是開放的還是封閉的、隔離的,取決于其是否可與環(huán)境交換物質(zhì)和能量。因?yàn)榛罴?xì)胞吸收營養(yǎng)物質(zhì)、釋放代謝產(chǎn)物,并做功和放熱。因此它們是開放系統(tǒng)。2023/12/2519系統(tǒng)狀態(tài)由一組狀態(tài)函數(shù)來定義。這些狀態(tài)函數(shù)包括內(nèi)能(U,系統(tǒng)固有的全部能量的度量,描寫恒容熱效應(yīng)的狀態(tài)函數(shù))、焓(H,描寫恒壓熱效應(yīng)的狀態(tài)函數(shù))、熵(S,系統(tǒng)混亂程度的度量)。這些狀態(tài)函數(shù)可用來表示和解釋這兩個(gè)熱力學(xué)定律,經(jīng)典熱力學(xué)就是建立在這兩個(gè)定律的基礎(chǔ)上的。2023/12/2520這兩個(gè)定律是:
①熱力學(xué)第一定律:能量既不能創(chuàng)生也不能消滅。用數(shù)學(xué)方式表達(dá)為:ΔU=0,其含義是,在任何隔離系統(tǒng)中系統(tǒng)儲(chǔ)藏的能量不變。
②熱力學(xué)第二定律:自發(fā)過程向熵值(宇宙的總的混亂程度)增加的方向進(jìn)行。用數(shù)學(xué)方式表達(dá)為:ΔS>0,其含義是,在任何隔離系統(tǒng)中,不違背第一定律的過程得以進(jìn)行的最起碼的條件是該系統(tǒng)的熵值增加。2023/12/2521
如果把我們研究的系統(tǒng)與它所處的環(huán)境加在一起,看作一個(gè)隔離系統(tǒng),這個(gè)重新劃定的隔離系統(tǒng)服從經(jīng)典熱力學(xué)。熱力學(xué)第一定律闡明了任何過程都是能量守恒的,也就是說系統(tǒng)產(chǎn)生的能量必須由它的環(huán)境吸收。第二定律闡明了過程的自發(fā)性取決于總的熵變,在這個(gè)重新劃定的隔離系統(tǒng)中,系統(tǒng)有序程度的增加,必須由它的環(huán)境混亂程度的更多的增加來彌補(bǔ)。
2023/12/2522
在研究細(xì)胞過程時(shí),自發(fā)性確實(shí)是一個(gè)非常重要的問題。然而,要確定整個(gè)宇宙的熵變化是不可能的,所以把自發(fā)過程引起的宇宙的混亂程度作為評(píng)估自發(fā)性的標(biāo)準(zhǔn),是難以操作的。2023/12/2523而且,過程的自發(fā)性不能單獨(dú)由所研究的系統(tǒng)的熵變來決定,因?yàn)榧词乖谙到y(tǒng)的熵減少(即ΔS系統(tǒng)<0的情況下),放熱過程(即ΔH系統(tǒng)<0,也就是熱量從系統(tǒng)放出)也可能自發(fā)進(jìn)行。譬如,變性的蛋白質(zhì)自發(fā)折疊成高度有序的天然構(gòu)象(系統(tǒng)的熵減少,ΔS系統(tǒng)<0),就是一例。當(dāng)然在這種情況下,宇宙的總熵還是增加的,因?yàn)榄h(huán)境的熵的增加足以抵消系統(tǒng)的熵的減少。那么用什么量來判斷自發(fā)過程好呢?2023/12/25242.1.3吉布斯自由能和代謝能2023/12/2525
由于熵在使用上的這些困難,自發(fā)性可由另一狀態(tài)函數(shù)吉布斯自由能來確定:
G=H-TS
這個(gè)狀態(tài)函數(shù)是由J.WillardGibbs于1878年提出的。系統(tǒng)自由能的減少等于系統(tǒng)在恒溫、恒壓可逆過程中所做的最大有用功(不包括位移功)。在不可逆過程中系統(tǒng)所做的功必然小于體系自由能的減少。2023/12/2526由于活細(xì)胞中的所有生物化學(xué)過程幾乎都是在恒溫、恒壓條件下進(jìn)行的,在研究微生物的能量代謝時(shí)自然會(huì)對(duì)自由能的變化ΔG發(fā)生興趣。2023/12/2527在恒溫恒壓條件下,各類化學(xué)反應(yīng)能否自發(fā)進(jìn)行,取決于自由能的變化ΔG的值,但反應(yīng)的ΔG與變化的途徑無關(guān)。
當(dāng)ΔG<0時(shí),自發(fā)過程,被稱為是放能的(exoergic)過程,它們可以用來做功;
當(dāng)ΔG=0時(shí),反應(yīng)已達(dá)到平衡,即其正向過程和逆向過程正好處于平衡;
當(dāng)ΔG>0時(shí),非自發(fā)過程,被稱為吸能的(endergonic)過程,必須注入自由能才能驅(qū)動(dòng)此類過程。2023/12/2528在細(xì)胞中,能直接驅(qū)動(dòng)吸能過程的自由能有兩類供體:在細(xì)胞內(nèi)流通的能量貨幣(以ATP為代表)和能化了的生物膜(以Δp為代表)。它們一般在代謝過程中形成,在代謝過程中使用,特別是它們作為細(xì)胞的組成成分,在細(xì)胞的代謝中再生和周轉(zhuǎn)。我們把這兩類特殊能量形式叫做代謝能。2023/12/2529特別提請(qǐng)注意:
①雖然酶對(duì)于加速反應(yīng)非常重要,但它們并不改變反應(yīng)的ΔG,作為催化劑它們只能加快熱力學(xué)平衡的達(dá)到,卻不能使ΔG>
0
的反應(yīng)進(jìn)行。
②反應(yīng)或過程的吉布斯自由能隨溫度等變化,其值可以推算。2023/12/2530第二節(jié)微生物細(xì)胞內(nèi)外的
物質(zhì)交換2.2.1微生物細(xì)胞與其所處的環(huán)境的關(guān)系
2.2.2化學(xué)物質(zhì)的跨膜過程2023/12/2531微生物細(xì)胞要活下去就必須進(jìn)行能量代謝,能量代謝必須依賴于微生物細(xì)胞內(nèi)外的交流,包括微生物細(xì)胞與環(huán)境之間和微生物細(xì)胞之間的物質(zhì)、能量和信息的交流,也包括微生物細(xì)胞內(nèi)被生物膜分隔的細(xì)胞空間之間的物質(zhì)、能量和信息的交流。2023/12/2532本節(jié)主要討論物質(zhì)交換問題。微生物細(xì)胞內(nèi)外的物質(zhì)交換對(duì)工業(yè)發(fā)酵至關(guān)重要。沒有這種交換微生物就不能生長和繁殖,就不能形成用于發(fā)酵生產(chǎn)的微生物細(xì)胞群體;沒有這種交換工業(yè)微生物細(xì)胞(工業(yè)發(fā)酵的細(xì)胞機(jī)器)就不能將目的產(chǎn)物送出細(xì)胞,我們就不能從發(fā)酵液獲得產(chǎn)品。2023/12/25332.2.1微生物細(xì)胞與其
所處環(huán)境的關(guān)系
2023/12/2534微生物的營養(yǎng)
微生物的營養(yǎng)類型
微生物的生理狀態(tài)
與環(huán)境的關(guān)系2023/12/2535存在于環(huán)境中的微生物(包括工業(yè)發(fā)酵環(huán)境中的微生物)活細(xì)胞必須不斷地從環(huán)境攝取元素營養(yǎng)和能源營養(yǎng)。并將這些來自環(huán)境的營養(yǎng)有效地轉(zhuǎn)換為可被其自身直接利用的代謝能,在代謝能的直接支撐下進(jìn)行持續(xù)的生命活動(dòng)。2023/12/2536
可把微生物細(xì)胞這個(gè)開放系統(tǒng)與其所處環(huán)境加在一起,看作一個(gè)隔離系統(tǒng),這個(gè)重新劃定的系統(tǒng)必須服從熵值增加原理。細(xì)胞的新陳代謝及生長造成細(xì)胞熵值下降和其環(huán)境熵值增加的總效果是:此隔離系統(tǒng)的總的熵值是增加的。2023/12/2537微生物細(xì)胞是個(gè)遠(yuǎn)離平衡狀態(tài)的不平衡的開放系統(tǒng),其運(yùn)轉(zhuǎn)過程是在代謝能支持下進(jìn)行的高度有序的過程,運(yùn)轉(zhuǎn)的結(jié)果是微生物細(xì)胞生命的持續(xù)和環(huán)境混亂程度的增加。2023/12/2538研究微生物的生命活動(dòng)不能離開環(huán)境,也不能離開微生物的生理狀態(tài)。環(huán)境影響微生物細(xì)胞的生理狀態(tài)和生命活動(dòng),而微生物細(xì)胞生命活動(dòng)又不斷改變環(huán)境。人可以通過改變環(huán)境條件來改變或調(diào)節(jié)微生物的生理狀態(tài)和生命活動(dòng),其改變或調(diào)節(jié)的有效性與人對(duì)環(huán)境影響微生物生命活動(dòng)的規(guī)律的了解程度密切相關(guān)。2023/12/2539微生物生命活動(dòng)影響和改變環(huán)境,人也可以主動(dòng)地改變環(huán)境條件,在可能范圍內(nèi)調(diào)節(jié)微生物的生理狀態(tài)和生命活動(dòng),以促進(jìn)微生物生長或工業(yè)發(fā)酵目的產(chǎn)物的生產(chǎn)。2023/12/2540微生物的營養(yǎng)2023/12/2541這里說的營養(yǎng)既可指營養(yǎng)物質(zhì)(nutrients),也可指提供營養(yǎng)的過程(nutrition)。作為營養(yǎng)物質(zhì)必須能直接地或者經(jīng)過降解后可以跨膜進(jìn)入微生物細(xì)胞,并至少能為正常生命活動(dòng)提供以下三者之一:①能量;②細(xì)胞結(jié)構(gòu)的原材料;③代謝調(diào)節(jié)物質(zhì)。2023/12/2542可把營養(yǎng)物質(zhì)大致分為元素營養(yǎng)和能源營養(yǎng)。元素營養(yǎng)中研究得最透徹的是碳源,能源營養(yǎng)可以是化學(xué)物質(zhì),也可以是非化學(xué)物質(zhì)如光能。為模塊分子(buildingblock)生物合成提供碳骨架(carbonskeletons)的基質(zhì),通常被稱為碳源;而為生命活動(dòng)提供吉布斯自由能(其中只有一部分能被微生物細(xì)胞轉(zhuǎn)化成代謝能)和還原力的基質(zhì)稱為能源。關(guān)于微生物的營養(yǎng),微生物學(xué)已有介紹,這里僅根據(jù)本課程教學(xué)需要,簡單地談?wù)凮、C、H、N、S、P,特別是含C和含P的營養(yǎng)物質(zhì)。
2023/12/2543元素營養(yǎng)以O(shè)、C、H、N含量最多,這4種元素具有共同的化學(xué)性質(zhì)是,可通過共享電子(共有電子對(duì))而迅速形成共價(jià)鍵,由于共價(jià)鍵強(qiáng)度與成鍵原子的原子量成反比,它們形成的共價(jià)鍵都很穩(wěn)定。單純由C和H組成的生物分子呈非極性,與水親和力低,使生物體與水環(huán)境之間形成一定的界面,這是生命誕生和存在的必要條件。2023/12/2544O、N、S等的參與引起有機(jī)分子電荷分布不均勻,同時(shí),因這些元素而形成的官能團(tuán)發(fā)生酸式或堿式解離,或使分子出現(xiàn)極性,能與水分子形成氫鍵而表現(xiàn)親水性,使生物分子與水環(huán)境間增強(qiáng)相互作用。N參加主鏈結(jié)構(gòu)可改善大分子的機(jī)械性能。O、S、P等可在有機(jī)分子間或分子內(nèi)形成橋式連接,影響分子的形狀及性能。2023/12/2545
碳是有機(jī)物的必有元素,是生物分子的結(jié)構(gòu)中心。碳原子可彼此反應(yīng)并形成穩(wěn)定的“C-C”共價(jià)結(jié)合的化合物,可形成鏈?zhǔn)交颦h(huán)式的結(jié)構(gòu),其長度和大小幾乎是無限度的,成為各種有機(jī)分子的骨架。
2023/12/2546碳原子可與許多元素如H、O、N、S、P等形成穩(wěn)定的共價(jià)鍵。碳原子的四面體構(gòu)型產(chǎn)生了大量的同分異構(gòu)體。碳原子如此多樣而穩(wěn)定的結(jié)合方式,是導(dǎo)致生物分子種類繁多的原因之一。2023/12/2547微生物細(xì)胞及其代謝產(chǎn)物中包含了無數(shù)有機(jī)化合物,所有機(jī)化合物都有碳架。本課程現(xiàn)階段主要研究有機(jī)化合物的代謝。有的有機(jī)化合物既屬元素營養(yǎng)又屬能源營養(yǎng),比如對(duì)化能異養(yǎng)型微生物來說,葡萄糖既可作為的碳元素營養(yǎng),又作為化學(xué)能源營養(yǎng)。凡可構(gòu)成微生物細(xì)胞及其代謝產(chǎn)物的碳架來源的營養(yǎng)物質(zhì),均稱為碳源。2023/12/2548微生物對(duì)碳源的需要極其廣泛,從簡單的無機(jī)碳化合物,如CO2、CO32-(自養(yǎng)型微生物的主要碳源),到復(fù)雜的天然有機(jī)含碳化合物,如糖、醇、有機(jī)酸、脂肪、烴類等(異養(yǎng)型微生物的主要碳源)都可被不同種類的微生物利用。對(duì)化能異養(yǎng)型微生物來說,碳源的生理功能可總括為兩點(diǎn):一是構(gòu)成細(xì)胞物質(zhì)和各種代謝產(chǎn)物的碳架;二是提供細(xì)胞活動(dòng)所需的能量。2023/12/2549
有機(jī)(碳)化合物經(jīng)分解代謝,轉(zhuǎn)化生成代謝能(生物可以直接利用的能量形式)、還原力和一系列重要的中間代謝物。2023/12/2550代謝能對(duì)細(xì)胞生命活動(dòng)的支撐與含磷化合物的關(guān)系密切。磷酸在細(xì)胞中并非呈游離態(tài)存在,而主要是通過酯鍵與各種有機(jī)化合物分子連接,一起成為細(xì)胞中的有機(jī)組分。2023/12/2551例如與脂類分子以磷酯鍵連接,形成各種磷脂化合物(參與膜的結(jié)構(gòu));與糖類分子形成酯鍵,使其成為活化態(tài)的代謝物,如糖核苷酸、糖磷酸酯,它們能活躍地參與合成、分解代謝,還能活躍地參與輸送;與蛋白質(zhì)(酶)的結(jié)合或解離,實(shí)現(xiàn)酶或載體蛋白的活性的共價(jià)調(diào)節(jié)。2023/12/2552磷酸的一個(gè)重要生物學(xué)作用是架橋,除上述磷脂類化合物外,最重要的是借磷酸的架橋作用將各種核苷酸連成長鏈,組成DNA和RNA。磷酸可自我架橋成為多聚體,如焦磷酸、三磷酸和多聚偏磷酸等。多磷酸化合物對(duì)細(xì)胞的生命活動(dòng)非常重要,是細(xì)胞能量代謝中一個(gè)主要的調(diào)節(jié)物。2023/12/2553所有生物都依靠核苷三磷酸及二磷酸化合物,如ATP和ADP作為代謝能(生物可以直接利用的能量形式)周轉(zhuǎn)的分子形式,細(xì)胞直接利用這些多磷酸化合物所含的能量做各式各樣的細(xì)胞功(包括機(jī)械功、化學(xué)功和輸送功等)。
2023/12/2554幾乎所有微生物都可利用無機(jī)磷酸鹽。有機(jī)磷化合物經(jīng)磷酸酶作用后也可作為磷源。幾乎所有生物體都有磷酸酶(按其作用最適pH值分為酸性磷酸酶和堿性磷酸酶),通常位于周質(zhì)區(qū)域,處于這一位置使它們更易與外界含磷化合物發(fā)生反應(yīng)。2023/12/2555微生物的營養(yǎng)類型微生物的營養(yǎng)類型2023/12/2556微生物在長期進(jìn)化過程中,逐漸地形成了不同的代謝類型。在考慮微生物代謝類型時(shí),既要考慮同化作用類型,又必須考慮異化作用的類型。微生物新陳代謝的類型是根據(jù)同化作用和異化作用方式的不同劃分的。2023/12/2557
按同化作用(生物合成)方式的不同,可以把微生物分為自養(yǎng)型和異養(yǎng)型;按異化作用(生物氧化)方式的不同,可把微生物分為需氧型和厭氧型。2023/12/2558
微生物的營養(yǎng)類型,是按微生物對(duì)其從環(huán)境中吸收的營養(yǎng)進(jìn)行不同方式的代謝而劃分的代謝類型。根據(jù)微生物代謝中使用的能源和碳源可將微生物原則地劃為4個(gè)營養(yǎng)類型。
2023/12/2559微生物按能源分化學(xué)能源光能源化能營養(yǎng)型光能營養(yǎng)型化能有機(jī)異養(yǎng)型化能無機(jī)自養(yǎng)型光能無機(jī)自養(yǎng)型光能有機(jī)異養(yǎng)型按主要碳源分按主要碳源分有機(jī)物有機(jī)物CO2CO22023/12/2560
所謂自養(yǎng)與異養(yǎng),是從生物細(xì)胞中的碳架物質(zhì)的來源而定義的。
細(xì)胞的碳架物質(zhì)由細(xì)胞自己從CO2還原而生成的微生物,被稱自養(yǎng)型微生物。CO2經(jīng)代謝進(jìn)入有機(jī)體的碳架的過程被稱為二氧化碳的固定。2023/12/2561細(xì)胞的碳架物質(zhì)由其他有機(jī)體供給的微生物,被稱為異養(yǎng)型微生物。外源的(泛指其他有機(jī)體供給的、未經(jīng)本細(xì)胞代謝的)或內(nèi)源的(泛指已經(jīng)本細(xì)胞代謝的)碳架物質(zhì),可被有機(jī)體氧化而產(chǎn)能,或經(jīng)必要的代謝參與有機(jī)體細(xì)胞組成。2023/12/2562化能有機(jī)異養(yǎng)型微生物簡稱化能異養(yǎng)型微生物(chemoorganoheterotroph,COH),目前已被廣泛地用作工業(yè)發(fā)酵的生產(chǎn)菌種,其它營養(yǎng)類型的微生物也正在環(huán)保、食品、化工等領(lǐng)域得到開發(fā)和應(yīng)用。“化能異養(yǎng)型微生物作為目的產(chǎn)物的生產(chǎn)者”,這是本課程定義典型的工業(yè)發(fā)酵的第一個(gè)條件。2023/12/2563微生物的生理狀態(tài)
與環(huán)境的關(guān)系
2023/12/2564在工業(yè)發(fā)酵中,微生物的生理狀態(tài)與環(huán)境的關(guān)系具體指的是工業(yè)發(fā)酵環(huán)境(微生物培養(yǎng)器內(nèi))中的微生物細(xì)胞的生理狀態(tài)與細(xì)胞所處的環(huán)境條件(培養(yǎng)基的化學(xué)成分、溫度、pH值等)之間的關(guān)系。2023/12/2565微生物細(xì)胞與高等生物細(xì)胞所處的環(huán)境條件不同,后者處于相當(dāng)穩(wěn)定的組織環(huán)境條件下,而前者則完全暴露在環(huán)境的影響之中。因此微生物必須對(duì)環(huán)境條件在較寬范圍內(nèi)的變化具有耐受和抵抗能力,能對(duì)這些變化做出積極的響應(yīng)。2023/12/2566這里之所以要討論環(huán)境因素對(duì)微生物細(xì)胞的生理學(xué)影響的問題,目的在于強(qiáng)調(diào)微生物細(xì)胞與其所處的環(huán)境是一個(gè)不可分割的整體。把微生物作為研究工作的“載體”,來研究生物體系與它們所處的環(huán)境的關(guān)系的研究,將是十分有利的。2023/12/2567微生物的生理狀態(tài)與環(huán)境的關(guān)系或許可以從以下幾個(gè)方面得到反映:
①初級(jí)響應(yīng):微生物細(xì)胞對(duì)化學(xué)或物理化學(xué)條件變化的直接響應(yīng),包括酶的抑制和激活、蛋白質(zhì)合成的誘導(dǎo)和阻遏、細(xì)胞形態(tài)的改變,迅速生長的群體中不同基因型(genotype)細(xì)胞的比例的變化等。2023/12/2568②溶解氧濃度與細(xì)胞的相互作用:
需氧微生物進(jìn)行有氧呼吸時(shí)的最終電子受體是氧,氧接受電子而被還原成水。氧經(jīng)由加氧酶(oxygenase)或二加氧酶(dioxygenase)催化,也可被固定在微生物代謝過程中產(chǎn)生的有機(jī)分子中。此外,氧還可作為生長或代謝的抑制劑(在一定程度上對(duì)細(xì)胞有毒性)、酶的調(diào)節(jié)劑等。2023/12/2569
對(duì)生長中的微生物,溶解氧的濃度會(huì)影響微生物的生長速率、改變細(xì)胞的組成、改變代謝產(chǎn)物(包括代謝產(chǎn)物的種類和數(shù)量等)。以上細(xì)胞對(duì)氧的響應(yīng)反過來又會(huì)影響細(xì)胞所處環(huán)境中的溶解氧濃度。2023/12/2570
③對(duì)CO2的響應(yīng):CO2可自由進(jìn)出細(xì)胞,影響新陳代謝。化能自養(yǎng)型微生物以為CO2主要碳源。化能異養(yǎng)型微生物在以葡萄糖或其他糖作為唯一碳源的培養(yǎng)基中生長時(shí),對(duì)CO2有需求,它們必須固定CO2,也就是讓CO2進(jìn)入細(xì)胞有機(jī)物的碳架,從而回補(bǔ)TCA環(huán)的中間產(chǎn)物,維持TCA環(huán)的運(yùn)行,以支持生長(后面將詳細(xì)討論)。2023/12/2571CO2分壓較高時(shí),不但會(huì)影響培養(yǎng)基的pH值,導(dǎo)致生長所需礦物質(zhì)的沉淀析出;更嚴(yán)重的是會(huì)導(dǎo)致質(zhì)子的無效循環(huán),使微生物生長速度下降。2023/12/2572這主要是因?yàn)榧?xì)胞外pH值一般低于細(xì)胞內(nèi),分子態(tài)的CO2大量進(jìn)入細(xì)胞,并在細(xì)胞內(nèi)與水分子作用生成大量的H+和HCO3-,為維持細(xì)胞內(nèi)中性的pH值和細(xì)胞內(nèi)外的離子平衡,必須調(diào)用原本應(yīng)該用于支持生長的代謝能將H+泵出細(xì)胞,代謝能的額外開支導(dǎo)致微生物生長速度的下降。2023/12/2573通氧(通風(fēng))過度會(huì)影響對(duì)細(xì)胞的CO2供應(yīng)。以葡萄糖為主要碳源的培養(yǎng)基中培養(yǎng)微生物,剛接種細(xì)胞濃度很低,這時(shí)不宜大量通氧(通風(fēng)),因?yàn)槿绻芙庋跆邥?huì)影響生長。2023/12/2574④對(duì)環(huán)境水活度的響應(yīng):當(dāng)環(huán)境的水活度低于微生物細(xì)胞內(nèi)水活度時(shí),微生物細(xì)胞要承受“水應(yīng)力”(waterstress)。真細(xì)菌和真核微生物對(duì)水應(yīng)力的響應(yīng)是一種生理性適應(yīng),即會(huì)在細(xì)胞內(nèi)累積有機(jī)兼容溶質(zhì)(compatiblesolutes),如多元醇、多元醇衍生物、某些糖和少數(shù)幾種氨基酸、氨基酸衍生物等。2023/12/2575⑤環(huán)境的氫離子濃度與細(xì)胞的相互作用:雖然大多數(shù)微生物都能耐受外部環(huán)境pH值在一定的范圍內(nèi)的變化,但事實(shí)上微生物(包括極端嗜酸菌和極端嗜堿菌)細(xì)胞內(nèi)部pH值均接近于7。細(xì)胞內(nèi)外pH值的差值是靠消耗代謝能來維持的。
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培養(yǎng)基pH值與細(xì)胞的相互作用可從下面幾方面來認(rèn)識(shí):首先每種微生物細(xì)胞一般都有生長的最適pH值;其次微生物會(huì)對(duì)細(xì)胞外pH值變化做出細(xì)胞水平的響應(yīng),可能影響發(fā)酵產(chǎn)物的形成和細(xì)胞的膜輸送功能等;最后是細(xì)胞反作用于環(huán)境,引起培養(yǎng)液(發(fā)酵液)pH值的改變。這可以是因?yàn)楫a(chǎn)物的形成、營養(yǎng)物的吸收、氧化還原反應(yīng)或培養(yǎng)液(pH)緩沖能力的改變。
2023/12/2577當(dāng)然也可以通過配入pH緩沖劑、添加酸或堿,或用設(shè)計(jì)合適的培養(yǎng)基或培養(yǎng)工藝來平衡代謝中產(chǎn)生的氫離子等方法,來調(diào)節(jié)培養(yǎng)液(發(fā)酵液)的pH值。
2023/12/2578⑥環(huán)境溫度與細(xì)胞的相互作用:與pH值、水活度的情況不同,微生物與它所處環(huán)境的溫度是一致的,而且就任何化學(xué)反應(yīng)而論,微生物的生命活動(dòng)對(duì)環(huán)境溫度都是敏感的。細(xì)胞對(duì)溫度的響應(yīng)包括:在生長溫度范圍內(nèi),不同溫度下有不同的生長速率;在不同溫度下,膜、DNA、RNA、蛋白質(zhì)等細(xì)胞成分會(huì)有相應(yīng)變化。2023/12/2579當(dāng)溫度發(fā)生變動(dòng)時(shí),細(xì)胞內(nèi)部會(huì)發(fā)生全局性(細(xì)胞水平)的調(diào)整,從而在基質(zhì)利用、產(chǎn)物形成、熱量放出等方面對(duì)環(huán)境溫度變動(dòng)做出響應(yīng)。當(dāng)微生物代謝旺盛、迅速生長時(shí),其他形式的能量大量地轉(zhuǎn)化成代謝能,同時(shí)放出大量熱能,使環(huán)境溫度迅速上升。2023/12/2580此外,培養(yǎng)物中解偶聯(lián)劑的加入,將破壞膜對(duì)氫離子的絕緣性,使氧化與磷酸化脫鉤,氧化作用(電子傳遞)釋放出來的能量全部以熱量的形式釋放;在大量供氧的情況下,培養(yǎng)物的溫度急劇上升。
2023/12/25812.2.2化學(xué)物質(zhì)的跨膜過程
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化學(xué)物質(zhì)跨過細(xì)胞質(zhì)膜的機(jī)制真核微生物細(xì)胞內(nèi)化學(xué)物質(zhì)的跨膜傳遞
代謝中間產(chǎn)物排出細(xì)胞的機(jī)制跨膜過程中代謝能的消耗2023/12/2583所有的活細(xì)胞都要與環(huán)境進(jìn)行物質(zhì)交換。在工業(yè)發(fā)酵中微生物細(xì)胞要將進(jìn)入細(xì)胞的營養(yǎng)物質(zhì)經(jīng)代謝轉(zhuǎn)化為目的產(chǎn)物,一般還要將代謝產(chǎn)物排放出細(xì)胞。諸如:以代謝產(chǎn)物(包括能量代謝副產(chǎn)物、初級(jí)代謝產(chǎn)物和次生代謝產(chǎn)物)為目的產(chǎn)物的生產(chǎn);以細(xì)胞大分子(包括酶制劑、微生物多糖)為目的產(chǎn)物的生產(chǎn);以細(xì)胞為目的產(chǎn)物(包括單細(xì)胞蛋白和胞內(nèi)酶等細(xì)胞提取物)的生產(chǎn)。
2023/12/2584工業(yè)發(fā)酵生產(chǎn)大多均兼有營養(yǎng)物質(zhì)進(jìn)入和發(fā)酵目的產(chǎn)物排放出細(xì)胞的過程。即使在以細(xì)胞為目的產(chǎn)物的情況下,也有營養(yǎng)物質(zhì)進(jìn)入和代謝中間產(chǎn)物(代謝“廢物”)排放出細(xì)胞。
“目的產(chǎn)物在細(xì)胞內(nèi)生成,然后排放出細(xì)胞”,這是本課程定義典型的工業(yè)發(fā)酵的第二個(gè)條件。2023/12/2585雖然細(xì)胞壁對(duì)物質(zhì)進(jìn)入細(xì)胞有一定妨礙,例如G+細(xì)菌細(xì)胞壁不允許相對(duì)分子質(zhì)量為10000Da的葡聚糖通過,真菌細(xì)胞壁也只允許分子質(zhì)量相對(duì)較小的物質(zhì)通過,然而水相中的可溶性化合物進(jìn)出細(xì)胞的主要屏障(barrier)是細(xì)胞膜。位于生物膜上的輸送系統(tǒng)可識(shí)別底物,只允許被認(rèn)可的化合物物進(jìn)入,并可控制其通過的量,同時(shí)不斷排出無用或多余的化學(xué)物質(zhì),以控制和維持細(xì)胞(或細(xì)胞器)的內(nèi)部環(huán)境。2023/12/2586這一小節(jié)主要研究營養(yǎng)物質(zhì)跨過膜進(jìn)入細(xì)胞和工業(yè)發(fā)酵目的產(chǎn)物跨過膜排放出細(xì)胞的問題。細(xì)菌、放線菌、酵母菌、霉菌沒有專門的攝食和排泄“器官”,各種化學(xué)物質(zhì)進(jìn)出細(xì)胞主要依賴于細(xì)胞質(zhì)膜的功能,這就必然涉及到兩個(gè)難題:
①存在于水相中的化學(xué)物質(zhì)如何跨過疏水的膜;
②這些化學(xué)物質(zhì)如何克服濃度梯度從低濃度處向高濃度處輸送。2023/12/2587化學(xué)物質(zhì)跨過細(xì)胞
質(zhì)膜的機(jī)制2023/12/2588從電子傳遞磷酸化的抑制劑(包括作用于膜的解偶聯(lián)劑、作用于電子傳遞鏈成員的呼吸抑制劑、作用于ATP酶的磷酸化酶抑制劑等3類抑制劑)對(duì)輸送的抑制作用,從輸送過程中出現(xiàn)的飽和效應(yīng)、競爭效應(yīng),以及從微生物的輸送性能缺失突變的發(fā)生,推測并得到證實(shí),前述兩個(gè)難題是依靠代謝能及載體蛋白而得以解決的,從而揭示了細(xì)胞質(zhì)膜不同于一般半透膜的生物學(xué)本質(zhì)。
2023/12/2589弄清化學(xué)物質(zhì)跨過膜的物質(zhì)基礎(chǔ)是:①流動(dòng)性的、可穿透的膜;②有選擇性的、可識(shí)別跨膜物質(zhì)并攜帶它們過膜的載體(包括催化共價(jià)反應(yīng)的酶);③直接用于輸送的代謝能。
2023/12/2590從而確定對(duì)化學(xué)物質(zhì)跨過膜的機(jī)制進(jìn)行分類的依據(jù):
①根據(jù)營養(yǎng)物質(zhì)進(jìn)入細(xì)胞是否要依靠輸送系統(tǒng)而分為擴(kuò)散(不需要輸送系統(tǒng))和輸送(依靠輸送系統(tǒng))。這里所謂的“輸送系統(tǒng)”是一種泛稱,在不同的輸送系統(tǒng)中,參與輸送的載體蛋白、酶的種類和組合不一定相同,輸送機(jī)制也不一定相同;2023/12/2591②根據(jù)營養(yǎng)物質(zhì)進(jìn)入細(xì)胞是否需要代謝能,把輸送再分為主動(dòng)輸送(需要代謝能)和被動(dòng)輸送(不需要代謝能);
③根據(jù)主動(dòng)輸送過程中是否需要酶(形成共價(jià)鍵)把主動(dòng)輸送分成簡單主動(dòng)輸送和基團(tuán)轉(zhuǎn)移。2023/12/2592
跨膜機(jī)制分成以下兩類四種:
第一類:細(xì)胞不提供幫助
⑴簡單擴(kuò)散
第二類:細(xì)胞提供幫助
⑵促進(jìn)擴(kuò)散:提供載體蛋白
⑶簡單主動(dòng)輸送:提供載體蛋白
和代謝能
⑷基團(tuán)轉(zhuǎn)移:提供載體蛋白、代
謝能和酶(蛋白質(zhì)因子)2023/12/2593⑴簡單擴(kuò)散(simplediffusion):
不需要細(xì)胞提供幫助的跨膜過程只能稱作為擴(kuò)散;需要細(xì)胞提供幫助的跨膜過程才堪稱細(xì)胞發(fā)動(dòng)的輸送。簡單擴(kuò)散是順濃度梯度方向的擴(kuò)散,不消耗代謝能,也不需專一的載體或酶,僅僅是非專一性的膜透過現(xiàn)象,因此僅僅是擴(kuò)散。有些親脂性化合物接觸膜的一側(cè)時(shí)即溶于脂質(zhì)的膜,并經(jīng)擴(kuò)散至膜的另一側(cè)釋放,有些小分子或離子通過膜上存在的非專一性通道,從高濃度側(cè)向低濃度側(cè)擴(kuò)散,都屬簡單擴(kuò)散。2023/12/2594化合物以自由擴(kuò)散的方式跨過脂質(zhì)膜包括3個(gè)步驟:
①化合物從胞外介質(zhì)到膜相的傳遞;
②化合物擴(kuò)散通過脂雙層;
③化合物從膜相到細(xì)胞質(zhì)的傳遞。2023/12/2595物質(zhì)擴(kuò)散的難易程度,除了與組成膜的分子本身的極性有關(guān)外,與跨膜物質(zhì)的性質(zhì)(如相對(duì)分子質(zhì)量、極性、脂溶性等)有關(guān)。一些非極性小分子如氧、氮、苯等可以以簡單擴(kuò)散的方式穿過膜脂雙分子層中無蛋白質(zhì)區(qū)進(jìn)出細(xì)胞。一些雖不帶電荷但顯極性的小分子如水、尿素、NH3、甘油、二氧化碳和脂肪酸和某些醇(乙醇等),由于分子很小,也可簡單擴(kuò)散,穿過類脂極性頭部區(qū)而透過膜。
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在解離狀態(tài)時(shí),有機(jī)酸在脂質(zhì)膜中實(shí)際上是不溶的;但許多有機(jī)酸的未解離形式卻是可溶解的,如未解離的乳酸和乙酸,它們穿越質(zhì)膜擴(kuò)散得很迅速,主要是因?yàn)槲唇怆x形式可以自由擴(kuò)散。乳酸和乙酸這樣的化合物的整個(gè)輸送過程,對(duì)其自身的解離程度都非常敏感,因而對(duì)細(xì)胞質(zhì)和胞外介質(zhì)兩者的pH值也很敏感。2023/12/2597對(duì)于許多微生物來說,細(xì)胞質(zhì)膜有一個(gè)跨膜的pH梯度(細(xì)胞內(nèi)的pH值高),這可能導(dǎo)致質(zhì)子向細(xì)胞的凈流入。為了維持胞內(nèi)較低的質(zhì)子濃度,必須消耗ATP,由ATP酶(已在真核微生物細(xì)胞膜發(fā)現(xiàn)質(zhì)膜ATP酶)將這些質(zhì)子泵出細(xì)胞外。同樣道理,培養(yǎng)基中有機(jī)酸的存在可能會(huì)導(dǎo)致ATP的凈消耗。2023/12/2598
在研究苯甲酸對(duì)釀酒酵母呼吸的影響時(shí)發(fā)現(xiàn),菌體量對(duì)葡萄糖的得率隨苯甲酸濃度的增加而下降,同時(shí)葡萄糖和氧氣的比吸收速率增加。因此對(duì)菌體合成來說,在加入苯甲酸的情況下,葡萄糖并沒有得到有效的利用。2023/12/2599這種現(xiàn)象被解釋為:苯甲酸的質(zhì)子解耦聯(lián)效應(yīng)導(dǎo)致ATP的額外消耗。對(duì)厭氧條件下苯甲酸對(duì)釀酒酵母菌體合成的ATP消耗的影響進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)菌體合成時(shí)消耗的ATP的量隨著苯甲酸濃度的增加而呈線性增加。這是苯甲酸的質(zhì)子解耦聯(lián)效應(yīng)的又一實(shí)驗(yàn)根據(jù)。2023/12/25100⑵促進(jìn)擴(kuò)散(facilitateddiffusion):
需要細(xì)胞提供輸送系統(tǒng),不消耗代謝能。許多化合物以極低的速率通過自由擴(kuò)散而跨膜,因?yàn)樗鼈冊(cè)谫|(zhì)膜中的溶解度很低。這類化合物借助于細(xì)胞質(zhì)膜中的載體蛋白,其跨膜過程可顯著增強(qiáng)。這種跨膜過程不需要消耗代謝能,但要求細(xì)胞提供載體蛋白來促進(jìn)跨膜過程,因此被稱為促進(jìn)擴(kuò)散。2023/12/25101促進(jìn)擴(kuò)散普遍存在于真核生物,在原核生物中僅有的幾例。如甘油在大腸桿菌中的運(yùn)輸,以及葡萄糖在運(yùn)動(dòng)發(fā)酵單胞菌(Zymomonasmobilis)中的輸送。與自由擴(kuò)散一樣,促進(jìn)擴(kuò)散只能順著濃度梯度而下的方向進(jìn)行。有游離的載體蛋白可供使用時(shí),某些化合物才能進(jìn)入膜相,并且促進(jìn)擴(kuò)散的速率服從飽和型動(dòng)力學(xué),就如酶催化反應(yīng)服從米氏動(dòng)力學(xué)一樣。
2023/12/25102在真菌中,許多糖類物質(zhì)通過促進(jìn)擴(kuò)散跨膜。據(jù)報(bào)道,在釀酒酵母中,葡萄糖通過促進(jìn)擴(kuò)散跨膜輸送,而且存在著一個(gè)受葡萄糖阻遏的高親和體系和一個(gè)組成型的低親和體系。對(duì)于絲狀真菌,也已經(jīng)報(bào)道了用于糖的促進(jìn)擴(kuò)散的不同的載體蛋白。2023/12/25103
載體主要是一些跨膜蛋白,又稱透性酶。它們各自具有專一的結(jié)合部位,現(xiàn)已從不同類型的細(xì)菌中提取出這類蛋白質(zhì)。一種細(xì)菌通常有不同的載體蛋白分別來完成氨基酸、糖、維生素和無機(jī)鹽等物質(zhì)的輸送,同一化合物也可能有一種以上的載體來完成輸送。2023/12/25104例如,啤酒酵母有3種對(duì)葡萄糖具有不同親合力的葡萄糖輸送載體;鼠傷寒沙門氏菌有4種不同的載體負(fù)責(zé)組氨酸的輸送。相反,也有一種載體負(fù)責(zé)幾種物質(zhì)輸送的,如大腸桿菌用同一種載體蛋白輸送亮氨酸、異亮氨酸和纈氨酸。2023/12/25105以往對(duì)離子載體的研究提供了關(guān)于離子通過膜的載體傳遞的分子基礎(chǔ)?,F(xiàn)已知,天然離子載體都是抗生素,它們可以誘導(dǎo)離子通過模型膜,可以提高生物膜對(duì)離子的輸送能力。按作用方式不同,可把它們分成活動(dòng)載體與通道載體兩類,前者與被輸送離子形成絡(luò)合物(類似于渡船),使其易于擴(kuò)散通過脂雙分子層,后者在膜上誘導(dǎo)形成暫時(shí)性孔道(類似于架橋),使離子得以通過。2023/12/25106活動(dòng)載體有環(huán)狀和鏈狀的,它們都能與金屬離子配位,然后把后者包在一個(gè)空腔中,形成外部親脂的絡(luò)合物。例如纈氨霉素(Valinomycin)就是由“-[D-纈氨酸-L-乳酐-L-纈氨酸-D-α-羥基異戊酰]3-”構(gòu)成的環(huán)狀12酯肽,酯鍵與酰胺鍵交替出現(xiàn),環(huán)內(nèi)部由構(gòu)成酯鍵的羰基氧原子提供具有靜電束縛陽離子位置的極性環(huán)境,呈親水性,而側(cè)鏈烷基向外,構(gòu)成疏水的外環(huán)。它能將堿金屬、堿土金屬等配位,并將其輸送過膜。載體可在輸送過程中反復(fù)使用。
2023/12/25107通道載體與活動(dòng)載體不同,它不能穿膜移動(dòng),而是相對(duì)地固定在膜上,形成貫穿膜兩側(cè)的離子通道。目前已知能形成通道的載體有兩類,一類是兩性霉素(Amphotericin)型大環(huán)多羥基多烯內(nèi)酯化合物,它們可通過與膜磷脂分子中的固醇的結(jié)合而形成穿膜的孔,孔可被水充填。2023/12/25108
另一類是低分子量的肽,如短桿菌肽A(GramicidinA),是由15個(gè)氨基酸組成的多肽。短桿菌肽形成穩(wěn)定的螺旋狀二聚體,其疏水氨基酸殘基朝外側(cè),親水的羰基分布在內(nèi)側(cè),螺旋內(nèi)孔構(gòu)成離子通道,離子可在其中移動(dòng)而跨過膜。2023/12/25109借助于活動(dòng)載體的促進(jìn)擴(kuò)散,是把被輸送離子變成外部親脂的載體復(fù)合物,膜的性質(zhì)沒有改變,靠載體復(fù)合物在膜內(nèi)運(yùn)動(dòng)實(shí)現(xiàn)輸送。通道輸送則相反,是建立了膜上的親水性通道,離子沒有發(fā)生變化,以原有形式通過。由于活動(dòng)載體復(fù)合物體積遠(yuǎn)比離子要大,所以它所促進(jìn)的離子跨膜輸送比通道輸送要慢。所有促進(jìn)擴(kuò)散都是通過降低位壘而實(shí)現(xiàn)加速輸送的。在主動(dòng)輸送中也確有載體和通道促進(jìn)離子的輸送,但同時(shí)需要提供代謝能。2023/12/25110⑶簡單主動(dòng)輸送(simpleactivetransport):
需細(xì)胞提供載體和代謝能的跨膜過程,因此屬于“輸送”。營養(yǎng)物質(zhì)或代謝物經(jīng)這種類型的輸送,其跨膜前后的化學(xué)狀態(tài)并不發(fā)生變化,從濃度較低的一側(cè)送入其濃較高的另一側(cè),這種逆濃度梯度的輸送,除了要借助于載體蛋白,還要消耗細(xì)胞的代謝能Δp。因此有化學(xué)滲透驅(qū)動(dòng)的輸送之說。2023/12/25111簡單主動(dòng)輸送可用其工作模型來描繪。工作模型由初級(jí)系統(tǒng)與次級(jí)系統(tǒng)組成。
對(duì)于化能營養(yǎng)型微生物,初級(jí)系統(tǒng)是指把化學(xué)能轉(zhuǎn)變成電滲透能的機(jī)構(gòu)。Mitchell的化學(xué)滲透假設(shè)是這種初級(jí)系統(tǒng)的最好解釋。2023/12/25112電子傳遞鏈的成員按其對(duì)應(yīng)的氧化還原對(duì)的還原電位的高低順序(從低到高)排列在膜上,氧化或脫氫反應(yīng)所形成的還原型輔酶NADH和輔基FADH2在電子傳遞鏈的適當(dāng)部位向電子傳遞鏈釋放電子,電子沿電子傳遞鏈傳到最終電子受體(如分子氧),在此過程中將質(zhì)子泵出細(xì)胞質(zhì)膜,在膜兩邊形成質(zhì)子運(yùn)動(dòng)勢(protonmotiveforce),它能用來驅(qū)動(dòng)營養(yǎng)物質(zhì)的吸收或ATP的合成。
2023/12/25113質(zhì)子運(yùn)動(dòng)勢(也可記作ΔP)由兩個(gè)量組成:濃度因子ΔpH,即膜兩邊的pH值(即氫離子濃度的負(fù)對(duì)數(shù)值)之差,和電荷量因子ΔΨ,即膜電位差。下列方程對(duì)質(zhì)子運(yùn)動(dòng)勢做出了熱動(dòng)力學(xué)的描述:
Δp=ΔΨ-ZΔpH
式中Δp和ΔΨ均以mV為單位,在25℃條件下,Z為常數(shù)(Z=59),用以把pH值轉(zhuǎn)換成mV值。2023/12/25114
次級(jí)系統(tǒng)實(shí)際上是在初級(jí)系統(tǒng)產(chǎn)生的質(zhì)子運(yùn)動(dòng)勢(Δp)的驅(qū)動(dòng)下,直接進(jìn)行營養(yǎng)物質(zhì)輸送的機(jī)構(gòu)(輸送系統(tǒng))。2023/12/25115已區(qū)分出3種次級(jí)系統(tǒng):
①化學(xué)物質(zhì)分子或離子與初級(jí)系統(tǒng)的離子(指H+)被同一個(gè)載體以同樣的方向同時(shí)被輸送叫做同向輸送(symport),能起這樣的作用的載體叫做同向載體(symporter);2023/12/25116
②化學(xué)物質(zhì)分子或離子與初級(jí)系統(tǒng)的離子(指H+或其他陽離子)被同一個(gè)載體以相反方向同時(shí)被輸送叫做反向輸送(antiport),能起這樣作用的載體叫反向載體(antiporter);
③化學(xué)物質(zhì)離子或分子借助載體,在消耗或不消耗Δp的情況下單獨(dú)進(jìn)入細(xì)胞叫做單向輸送(uniport),能起這樣的作用的載體叫單向載體(uniporter)。2023/12/25117金黃色葡萄球菌對(duì)Lys、Ile和Glu等氨基酸的主動(dòng)輸送內(nèi)外內(nèi)內(nèi)外外Lys+Lys+H+H+H+H+IleIleGlu--Glu-pI=9.24單一輸送受膜電位Δψ驅(qū)動(dòng)pI=6.02同向輸送受能庫Δp驅(qū)動(dòng)pI=3.22同向輸送受膜兩側(cè)的-ZΔpH的驅(qū)動(dòng)+++++++++---------Δp=Δψ-ZΔpH2023/12/25118以金黃色葡萄球菌的靜止細(xì)胞為實(shí)驗(yàn)對(duì)象進(jìn)行了研究。如圖所示,在實(shí)驗(yàn)條件(pH7)下,Lys帶正電(Lys的等電點(diǎn)是pH9.74),Lys+按單向輸送機(jī)制被送入細(xì)胞,這種吸收是靠Δp中的電荷因子ΔΨ(即膜電位)部分來驅(qū)動(dòng)的。Lys+和載體所形成的復(fù)合物帶正電,它在膜電位所構(gòu)成的靜電場中由外向里運(yùn)動(dòng)(外面帶正電施推力,里面帶負(fù)電施拉力),同時(shí)消耗膜電位。
2023/12/25119在實(shí)驗(yàn)條件(pH7)下,Ile不帶電(Ile的等電點(diǎn)為pH6.02),Ile分子按同向輸送機(jī)制與H+一起被送入細(xì)胞,Ile、H+和載體形成的復(fù)合物帶正電,輸送同時(shí)受Δp的兩個(gè)部分的推動(dòng),即受ΔΨ(膜兩側(cè)之電位差)和膜內(nèi)外pH值之差(即H+濃度差)的推動(dòng)。Ile就像是搭了為H+開的船而過膜的。2023/12/25120在實(shí)驗(yàn)條件(pH7)下,Glu帶負(fù)電(Glu的等電點(diǎn)為pH3.22),Glu-離子按同向輸送機(jī)制與H+離子一起被送入細(xì)胞。Glu-、H+和載體形成的復(fù)合物是電中性的,因此ΔΨ對(duì)此復(fù)合物不能施加影響,輸送僅僅依賴于ΔpH,即依賴于細(xì)胞內(nèi)外的H+濃度之差。2023/12/25121與質(zhì)子共同輸送相耦合的簡單主動(dòng)輸送機(jī)制已為許多實(shí)驗(yàn)所證實(shí)。初級(jí)系統(tǒng)的質(zhì)子梯度也可以借助載體而轉(zhuǎn)換成其他離子的梯度,如可以借助能進(jìn)行Na+/H+反向輸送的載體將質(zhì)子梯度轉(zhuǎn)換成Na+梯度,后者可用于另一種簡單主動(dòng)輸送。因此簡單主動(dòng)輸送又可以進(jìn)一步分為:①與質(zhì)子共同輸送相耦合的簡單主動(dòng)輸送,②與其他離子(無機(jī)離子)共同輸送相耦合的簡單主動(dòng)輸送。2023/12/25122
與其他離子共同輸送相偶合的簡單主動(dòng)輸送機(jī)制在微生物中也已有發(fā)現(xiàn)。用于輸送的其他離子的梯度(iongradient)是由質(zhì)子梯度(protongradient)經(jīng)前述反向傳送機(jī)制轉(zhuǎn)換過來的。如果將質(zhì)子梯度視為“初級(jí)”或“一級(jí)”梯度,那么其他離子的梯度就稱“次級(jí)”或“二級(jí)”梯度,這種類型的簡單主動(dòng)輸送在這個(gè)意義上又可稱為次級(jí)輸送或二級(jí)輸送。在大腸桿菌中,Glu的輸送需要Na+和K+??莶菅挎邨U菌的檸檬酸的輸送則需要Mg2+。2023/12/25123主動(dòng)輸送與促進(jìn)擴(kuò)散相比較,相類似的是,主動(dòng)輸送也是借助于膜內(nèi)專用的載體蛋白(透性酶);不同的是,主動(dòng)輸送可以逆著濃度梯度的方向進(jìn)行,是一個(gè)消耗代謝能的過程。2023/12/25124
被動(dòng)輸送與主動(dòng)輸送的根本區(qū)別在于輸送過程自由能變化ΔG。只有當(dāng)ΔG<0時(shí),才能自發(fā)地進(jìn)行被動(dòng)輸送。當(dāng)ΔG>0時(shí),需要注入代謝能以推動(dòng)輸送,即進(jìn)行主動(dòng)輸送。微生物細(xì)胞的主動(dòng)輸送是逆著被輸送化合物的濃度梯度進(jìn)行的,這樣,細(xì)胞能吸收并濃縮以極稀的濃度存在于環(huán)境中的某些養(yǎng)分。這個(gè)過程與微生物細(xì)胞的能量代謝緊密相關(guān)。2023/12/25125初級(jí)主動(dòng)輸送系統(tǒng)中的一個(gè)重要的成員是ATP酶,它們涉及到需要消耗ATP的質(zhì)子被泵出過程。某些ATP酶可在兩個(gè)方向上起作用,當(dāng)有質(zhì)子流入時(shí)就會(huì)生成ATP,這些ATP酶是原核生物的氧化磷酸化的重要組成部分。2023/12/25126其他初級(jí)主動(dòng)輸送系統(tǒng)還有借助于“交通-ATP酶”的輸送系統(tǒng)。該系統(tǒng)包括專用的結(jié)合蛋白,它們與被傳送的化合物結(jié)合并將其傳遞到相應(yīng)的結(jié)合在膜上的復(fù)合物。這種傳遞觸發(fā)ATP水解,進(jìn)而使小孔打開,允許被傳送的化合物單向擴(kuò)散入細(xì)胞質(zhì)。在大腸桿菌中,通過這些所謂“交通-ATP酶”所輸送的物質(zhì)有組氨酸、麥芽糖、阿拉伯糖和半乳糖。2023/12/25127⑷
基團(tuán)轉(zhuǎn)移(grouptranslocation):
需提供載體、代謝能和酶,屬于“輸送”機(jī)制。
在基團(tuán)轉(zhuǎn)移中,輸送過程都伴隨著被輸送物質(zhì)進(jìn)一步的共價(jià)轉(zhuǎn)變,所輸送的化合物被轉(zhuǎn)化成為一個(gè)衍生物(被磷酸化的衍生物),這個(gè)衍生物是不能反向跨膜的。2023/12/25128基團(tuán)轉(zhuǎn)移系統(tǒng)典型的實(shí)例是磷酸轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)(PTS)。借助于這個(gè)系統(tǒng),某些糖以糖的磷酸酯的形式被送進(jìn)細(xì)菌細(xì)胞。PTS主要存在于兼性和專性厭氧細(xì)菌中。對(duì)厭氧菌來說PTS尤為重要,因?yàn)橛盟梢怨?jié)省ATP。
2023/12/251292023/12/25130PTS相當(dāng)復(fù)雜,至少涉及4種不同蛋白,這些蛋白質(zhì)作為高能磷酸基團(tuán)的磷酸載體,先后參與把磷酸烯醇丙酮酸(PEP)上的磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移給正在被引入的糖的過程。這些蛋白中有兩種是可溶的細(xì)胞質(zhì)蛋白,大腸桿菌中它們是分別由ptsI和ptsH所編碼的酶Ⅰ(EⅠ)和組氨酸蛋白(HPr)。這兩種蛋白對(duì)所有的PTS糖類來說是通用的(沒有特異性),因此被稱為通用的PTS蛋白。2023/12/25131而對(duì)糖是具有特異性的酶Ⅱ(EⅡ
),它們都由3個(gè)功能區(qū)(A、B和C)組成。這3個(gè)功能區(qū)可以結(jié)合成1個(gè)單一的與膜結(jié)合的蛋白(如圖示甘露糖醇的PTS),也可以分成2個(gè)或更多個(gè)蛋白,分別叫做EⅡA、EⅡB、EⅡC。在PTS系統(tǒng)中PEP的磷酸基團(tuán)通過EⅠ、HPr、EⅡA和EⅡB的磷酸化中間物傳遞給正在被引入的糖。EⅡ的C功能區(qū)(也就是EⅡC蛋白)形成轉(zhuǎn)移的通道,并且至少其一部分成為特定的糖結(jié)合位點(diǎn)。
2023/12/25132同樣已證明嘌呤堿基也是依靠基團(tuán)轉(zhuǎn)位輸送的,由磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)(PTS)催化,在細(xì)胞內(nèi)出現(xiàn)相應(yīng)的嘌呤核苷單磷酸酯。
Ade+PRPP→AMP+PPi2023/12/25133真核微生物細(xì)胞內(nèi)化學(xué)
物質(zhì)的跨膜輸送
2023/12/25134真核微生物內(nèi)有多種被生物膜包圍的細(xì)胞器,因此器細(xì)胞內(nèi)部也會(huì)發(fā)生跨膜輸送。
因?yàn)镋MP和HMP途徑發(fā)生在細(xì)胞質(zhì),而丙酮酸的氧化(TCA環(huán))發(fā)生在線粒體基質(zhì),所以代謝中間產(chǎn)物在細(xì)胞質(zhì)和線粒體基質(zhì)之間的傳遞對(duì)微生物的代謝來說是非常重要的。2023/12/25135不帶電的分子,包括極性和非極性的小分子常常容易透過線粒體內(nèi)膜,如水、氧、二氧化碳、氨、甲酸、乙酸、丙酸和丁酸等分子都不必借助載體系統(tǒng)就能自由地透過線粒體內(nèi)膜;而帶電的分子和離子則需要借助載體才能跨過線粒體內(nèi)膜,并且已檢出磷酸鹽、硫酸鹽、亞硫酸鹽、ADP、ATP、丙酮酸(PYR)、TCA環(huán)的有機(jī)酸、Glu、Asp、Orn(鳥氨酸)、Cit(瓜氨酸)、酰基肉堿(acy1carnitines)和PEP(磷酸烯醇式丙酮酸)等化合物的輸送系統(tǒng)。2023/12/25136NAD(P)+、NAD(P)H、CoA和?;鵆oA不能跨過線粒體內(nèi)膜。有些離子和代謝產(chǎn)物不易(有的需借助于載體)跨過線粒體內(nèi)膜,包括AMP、GMP、GDP、GTP、C1-、NO3-、Br-和NH4+等。2023/12/25137
與電子傳遞相偶聯(lián)的磷酸化作用要求將ADP和Pi(一般是H2PO4-
)送入線粒體,在線粒體內(nèi)膜基質(zhì)一側(cè)形成ATP。在線粒體形成的ATP的一部分又要被送出線粒體參與細(xì)胞質(zhì)中的生物合成反應(yīng)。2023/12/25138已經(jīng)得知磷酸根(H2PO4-)輸送的兩種機(jī)制,即“OH-/H2PO4-”交換和“H2PO4-/DCA2-”交換的機(jī)制。前者代表電中性的反向輸送(antiport),即用于H2PO4-和OH-交換的載體系統(tǒng);后者代表H2PO4-與二羧酸進(jìn)行交換的載體系統(tǒng),這個(gè)載體系統(tǒng)用于H2PO4-與二羧酸,如SCA(琥珀酸)或MLA(蘋果酸)的交換,然后,二羧酸又與三羧酸交換,從而使MLA與檸檬酸(CTA)的跨膜輸送發(fā)生關(guān)聯(lián)。2023/12/25139膜外側(cè)膜膜內(nèi)側(cè)膜外側(cè)膜膜內(nèi)側(cè)
二羧酸2-二羧酸2-三羧酸·
H3-+ATP4-ADP3-Asp2-Glu·H2-+OH-PYR2OH-2H2PO4-
2H2PO4-2023/12/25140
線粒體內(nèi)膜對(duì)于AcCoA(乙酰輔酶A)是不透的,但可以通過下述途徑將AcCoA“送出”線粒體:在線粒體基質(zhì)中,AcCoA與OAA(草酰乙酸)在檸檬酸合成酶的催化下合成CTA,后者借助載體系統(tǒng)透過線粒體內(nèi)膜進(jìn)入細(xì)胞質(zhì),然后被細(xì)胞質(zhì)中的檸檬酸裂解酶(以細(xì)胞質(zhì)中的CoA為輔酶)裂解成OAA和AcCoA,從而完成AcCoA的“送出”過程,實(shí)際上是乙酰基的送出過程。2023/12/25141AcCoAAcCoACTACTA(CS)(CL)CoAOAAOAA內(nèi)外CoA線粒體內(nèi)膜乙?;鶑木€粒體送出的過程2023/12/25142
真核微生物在線粒體基質(zhì)中形成乙?;?,在細(xì)胞質(zhì)中合成脂肪酸、磷脂等參與膜的組成。這種將乙酰基的送出的機(jī)制在某些微生物(如油脂酵母)中是很重要的,這些微生物能大量合成脂肪,因此需要將乙酰基團(tuán)從線?;|(zhì)轉(zhuǎn)移到細(xì)胞質(zhì)中。2023/12/25143嘌呤核苷酸的傳送依賴于對(duì)ADP和ATP有特異性的載體蛋白(見前圖),借助這種載體蛋白,ADP和ATP作1∶1的跨膜交換。當(dāng)這兩個(gè)核苷酸帶不同的電荷量(ADP3-,ATP4-)時(shí),它們能借助載體蛋白在膜電位的推動(dòng)下進(jìn)行致電反向輸送(electrogenicantiport)。這種反向輸送與非能化(deenergized)狀態(tài)下的輸送相比,有較大的交換速率。2023/12/25144影響腺嘌呤核苷酸傳送的因素:
①細(xì)胞質(zhì)中的生物合成反應(yīng)對(duì)腺嘌呤核苷酸的需要,要求〔ATP〕/〔ADP〕比率高;
②線粒體基質(zhì)中的氧化磷酸化的需要,要求〔ATP〕/〔ADP〕比率低。2023/12/25145煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)不能穿過線粒體內(nèi)膜。線粒體內(nèi)生成的NADH固然可以在線粒體內(nèi)膜內(nèi)側(cè)再生,那么在有氧狀態(tài)下,細(xì)胞質(zhì)中的酵解所產(chǎn)生的NADH怎么再生(怎樣把電子交給電子傳遞鏈)呢?2023/12/25146來自細(xì)胞質(zhì)中的NADH的電子交給電子傳遞鏈的機(jī)制是借助所謂的穿梭往返系統(tǒng)。真核微生物細(xì)胞可以借助于代謝物的穿梭往返(shuttle),間接地將還原當(dāng)量送入線粒體。穿梭往返有跨線粒體外膜的和跨線粒體內(nèi)膜的。分述如下:2023/12/25147
借助于跨線粒體內(nèi)膜的“蘋果酸/天冬氨酸”穿梭往返,間接地將還原當(dāng)量送入線粒體。這種“穿梭往返”的效果相當(dāng)于NADH跨過線粒體內(nèi)膜,最終把電子在線粒體內(nèi)膜內(nèi)側(cè)交給電子傳遞鏈。此過程靠NADH在細(xì)胞質(zhì)與線粒體中濃度之差來驅(qū)動(dòng),不消耗ATP。2023/12/25148+哺乳動(dòng)物細(xì)胞的蘋果酸/天門冬氨酸穿梭體系圖中:AAT為Asp氨基轉(zhuǎn)移酶,GAT、MOT為載體。線粒體內(nèi)膜AspAspNADH+H+NADH+HNAD
+
NAD
+GluGluOAAOAAα-KGα-KGMLAMLA(MD)(MD)(AAT)(AAT)GATMOT還原力胞質(zhì)中的基質(zhì)中的2023/12/25149
跨線粒體外膜的“3-磷酸甘油/磷酸二羥丙酮”穿梭往返,它涉及到分別位于細(xì)胞質(zhì)中和線粒體內(nèi)膜上的2個(gè)3-磷酸甘油脫氫酶。細(xì)胞質(zhì)中的3-磷酸甘油脫氫酶以細(xì)胞質(zhì)中的NADH為輔酶,而線粒體內(nèi)膜中的3-磷酸甘油脫氫酶是以FAD為輔基的黃素蛋白?!?-磷酸甘油/磷酸二羥丙酮”穿梭往返使細(xì)胞質(zhì)中的NADH“轉(zhuǎn)變”成了線粒體內(nèi)膜的FADH2,因此失去了合成1個(gè)ATP分子的機(jī)會(huì)。這種還原力跨膜的機(jī)制主要見于昆蟲細(xì)胞,也存在于某些酵母(如Candidatropicalis)細(xì)胞中。
2023/12/25150線粒體基質(zhì)線粒體的3-磷酸甘油脫氫酶(黃素蛋白)Glyc-3-PGlyc-3-PDHAPDHAPNAD+NADH+H+細(xì)胞質(zhì)的3-磷酸甘油脫氫酶細(xì)胞質(zhì)線粒體外膜間腔線粒體內(nèi)膜FADHCoA跨線粒體外膜的“3-磷酸甘油/磷酸二羥丙酮”穿梭往返2023/12/25151這種穿梭過程分4步進(jìn)行:
①細(xì)胞質(zhì)中:在細(xì)胞質(zhì)的3-磷酸甘油脫氫酶的催化下,磷酸二羥丙酮被還原為3-磷酸甘油DHAP+NADH+H+→G3P+NAD+
②細(xì)胞質(zhì)中的3-磷酸甘油穿過線粒體外膜進(jìn)入線粒體的內(nèi)膜和外膜之間的間腔
③在線粒體內(nèi)膜上的3-磷酸甘油脫氫酶的催化下,3-磷酸甘油重新氧化成磷酸二羥丙酮④磷酸二羥丙酮穿過線粒體外膜回到細(xì)胞質(zhì)。2023/12/25152線粒體的3-磷酸甘油脫氫酶的催化位點(diǎn)位于線粒體內(nèi)膜的外表面,因此為了3-磷酸甘油的重新氧化并沒有必要跨過線粒體內(nèi)膜。線粒體3-磷酸甘油脫氫酶是一個(gè)含有FAD的黃素蛋白,它在CoQ位點(diǎn)向電子傳遞鏈提交電子。當(dāng)電子通過這個(gè)穿梭系統(tǒng)進(jìn)行傳送時(shí),NADH氧化的P/O比率將類似于琥珀酸氧化的P/O比率。2023/12/25153代謝中間產(chǎn)物排出細(xì)胞的機(jī)制
⑴氨基酸的釋出(略)⑵核苷酸的“釋出”(略)⑶胞外酶的分泌(略)2023/12/25154從化學(xué)平衡的觀點(diǎn)來看,分泌可以促進(jìn)合成;從生物學(xué)的角度來看,分泌又是對(duì)過量合成的代謝中間產(chǎn)物的解毒機(jī)制,是微生物細(xì)胞生存策略的一個(gè)方面。代謝產(chǎn)物的釋放也是跨膜輸送的過程,但強(qiáng)調(diào)的是從細(xì)胞釋放或排出。2023/12/25155必須指出,由于微生物具有高度嚴(yán)密的自我調(diào)節(jié)能力,正常代謝的細(xì)胞的中間代謝產(chǎn)物既不會(huì)在胞內(nèi)大量積累,也不會(huì)大量排出體外而流失。發(fā)酵工程的任務(wù)之一是人為地改變微生物的代謝調(diào)節(jié)機(jī)制,其中包括改變化學(xué)物質(zhì)輸送的調(diào)節(jié)機(jī)制,使目的代謝產(chǎn)物大量合成并及時(shí)釋出或排出細(xì)胞。2023/12/25156跨膜過程中代謝能的消耗
2023/12/25157細(xì)胞消耗在主動(dòng)輸送過程中的ATP,在其ATP的總消耗中占相當(dāng)大的比例。在質(zhì)子同向輸送中,ATP消耗取決于運(yùn)輸過程的化學(xué)計(jì)量和質(zhì)子重新輸出的化學(xué)計(jì)量。這種輸送系統(tǒng)中研究得最透徹的是大腸桿菌的乳糖透性酶,其同時(shí)輸送一個(gè)質(zhì)子和一個(gè)乳糖分子。許多其他物質(zhì)的輸送占有相似的化學(xué)計(jì)量比率,例如原核生物和真核生物中許多氨基酸的輸送,以及絲狀真菌中通過高度親和系統(tǒng)對(duì)糖(諸如葡萄糖、果糖和半乳糖等)的輸送。2023/12/251582023/12/25159對(duì)于質(zhì)子的重新輸出,在原核細(xì)胞和真核細(xì)胞之間存在一些差別。在需氧細(xì)菌中,電子傳遞鏈位于細(xì)胞質(zhì)膜,質(zhì)子可通過電子傳遞鏈從細(xì)胞質(zhì)中重新輸送出去;質(zhì)子還可借助于ATP酶重新輸送至胞外。ATP酶在原核細(xì)胞中位于細(xì)胞質(zhì)膜,它主要涉及氧化磷酸化過程中ATP的合成,但它是可逆的,也可以在消耗ATP的情況下,將質(zhì)子泵出細(xì)胞外。目前還不能準(zhǔn)確知道ATP酶的化學(xué)計(jì)量比率,但在大腸桿菌中,2H+/ATP是通常使用的化學(xué)計(jì)量比。
2023/12/25160在真核細(xì)胞中,ATP酶位于線粒體的內(nèi)膜,但真核細(xì)胞也具有屬于另一類型的ATP酶——質(zhì)膜ATP酶。這種ATP酶可能只在ATP水解方向起作用,通常其化學(xué)計(jì)量比為1H+/ATP。利用化學(xué)計(jì)量方法,有可能計(jì)算出通過以主動(dòng)輸送機(jī)制輸送不同的化合物時(shí)ATP的消耗量。2023/12/25161化能異養(yǎng)型微生物
的生物氧化
2023/12/251622.3.1氧化還原反應(yīng)
2.3.2微生物進(jìn)行生物氧化的細(xì)胞器
及ATP合成酶
2.3.3生物氧化過程中輔酶的關(guān)鍵作
用
2.3.4化能異養(yǎng)型微生物生物氧化的
方式2023/12/25163化能異養(yǎng)型微生物將有機(jī)營養(yǎng)物質(zhì)儲(chǔ)存的化學(xué)能,轉(zhuǎn)化成可以被自身直接利用的能量形式(ATP或質(zhì)子運(yùn)動(dòng)勢Δp等)的代謝過程,叫做化能異養(yǎng)型微生物的產(chǎn)代謝能的代謝,一般稱產(chǎn)能代謝。2023/12/25164
化能異養(yǎng)型微生物產(chǎn)能代謝,始于能源化合物(還原性有機(jī)化合物)的生物氧化(即能源化合物釋放電子)。生物氧化歸根到底屬于氧化還原反應(yīng)。2023/12/251652.3.1氧化還原反應(yīng)
2023/12/25166反應(yīng)物之間有電子得失的反應(yīng),總稱為氧化還原反應(yīng)。在這類反應(yīng)中必有一種原子失去電子而被氧化,同時(shí)另一種原子得到電子而被還原,它們分別作為氧化還原反應(yīng)的兩個(gè)半反應(yīng),合在一起就是一個(gè)氧化還原反應(yīng)。2023/12/25167通常把在氧化還原反應(yīng)中失去電子而被氧化的物質(zhì)稱為還原劑,把得到電子而被還原的物質(zhì)稱為氧化劑。在一個(gè)氧化還原反應(yīng)中,氧化劑獲得的電子總數(shù)必然等于還原劑失去的電子總數(shù)。2023/12/25168對(duì)于組成和結(jié)構(gòu)比較復(fù)雜的化合物,特別是有機(jī)化合物,可以采用“氧化數(shù)
”這個(gè)概念來討論氧化還原反應(yīng)。用氧化數(shù)來表示物質(zhì)中元素的表觀電荷數(shù),這樣就可以把氧化和還原分別定義為反應(yīng)物質(zhì)中元素的氧化數(shù)的升高和下降。元素的氧化數(shù)升高,說明它已被氧化了;元素的氧化數(shù)下降,說明它已被還原了。2023/12/25169在有機(jī)體生命活動(dòng)中,參與氧化還原反應(yīng)的往往是有機(jī)化合物,或者反應(yīng)的一方是有機(jī)化合物,采用氧化數(shù)這個(gè)概念來討論氧化還原反應(yīng)比較方便。在有機(jī)體生命活動(dòng)中,氫元素不論是以氫離子的形式存在于細(xì)胞內(nèi)外的溶液中,還是與其他原子共價(jià)相連的形式,存在于組成細(xì)胞的有機(jī)化合物分子中,其氧化數(shù)均規(guī)定為+1。2023/12/25170在活細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行的涉及電子從一個(gè)分子到另一個(gè)分子轉(zhuǎn)移的產(chǎn)能反應(yīng),總稱為生物氧化。在一般的氧化還原反應(yīng)中,還原劑將電子直接交給氧化劑并放出能量;在生物氧化過程中,還原劑首先將電子交給一級(jí)電子載體,再由一級(jí)電子載體將電子轉(zhuǎn)交給氧化劑,并把化學(xué)能轉(zhuǎn)化成生物可以直接利用的能量形式——代謝能。
2023/12/25171
在生物氧化過程中,盡管還原劑釋放的電子并不直接交給氧化劑,但是最終還是轉(zhuǎn)交給氧化劑,同樣完成了氧化和還原這兩個(gè)“半反應(yīng)”。因此生物氧化本質(zhì)上還是氧化還原反應(yīng)。因?yàn)榧?xì)胞內(nèi)的這些氧化還原反應(yīng)向著能源化合物氧化降解和放能的方向進(jìn)行,因而有生物氧化之稱。2023/12/25172生物氧化與一般的氧化還原反應(yīng)相比較,氧化還原的本質(zhì)是一樣的,但進(jìn)行的過程和結(jié)果大不一樣。生物氧化是按一定順序進(jìn)行的、酶催化的、受到嚴(yán)密控制的逐級(jí)釋放能量的過程,以這種方式釋放的能量中的一部分可直接用來支撐生命活動(dòng)。因此,沒有生物氧化就沒有代謝能,沒有代謝能的支撐就沒有生命活動(dòng)。2023/12/251732.3.2微生物進(jìn)行生物氧化的
細(xì)胞器及ATP合成酶
2023/12/25174線粒體的膜與原核細(xì)胞的質(zhì)膜
ATP合成酶2023/12/25175
微生物細(xì)胞可直接利用的能量供體(以ATP為代表)的生成依賴于微生物細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行的生物氧化(呼吸和發(fā)酵)。而經(jīng)生物氧化生成的ATP又為一切生物學(xué)過程及時(shí)、準(zhǔn)確地提供代謝能。2023/12/25176微生物的呼吸和發(fā)酵作用在細(xì)胞特定部位或特定的細(xì)胞器里進(jìn)行。在這些細(xì)胞部位和細(xì)胞器里包含著各種氧化還原酶(包括它們的輔酶和輔基)、電子傳遞鏈、輸送蛋白和ATP合成酶。2023/12/25177線粒體的膜與原核細(xì)胞的質(zhì)膜2023/12/25178與呼吸關(guān)系最密切的細(xì)胞器是線粒體,對(duì)于原核細(xì)胞則是細(xì)胞質(zhì)膜。線粒體內(nèi)膜和原核細(xì)胞的質(zhì)膜包含電子傳遞鏈、ATP酶,以及與呼吸有關(guān)的輸送蛋白。2023/12/25179根據(jù)NeilACampbell&JaneBReece,EssentialBiology,2001改制2023/12/25180根據(jù)NeilACampbell&JaneBReece,EssentialBiology,2001改制2023/12/251812023/12/25182真核微生物才有線粒體,前圖大致描繪了其結(jié)構(gòu)和功能。線粒體的外膜上鑲嵌著一些起非特異性孔道作用的蛋白質(zhì),它們?cè)试S相對(duì)分子質(zhì)量小于10000道爾頓的溶質(zhì)通過,但像細(xì)胞色素那樣大的分子是不能通過的。2023/12/25183
線粒體內(nèi)膜含有較多的蛋白質(zhì),它不但對(duì)溶質(zhì)的通過具有選擇性,而且具有不同形式的能量之間的轉(zhuǎn)換功能。它實(shí)際上依靠載體讓離子和分子通過,是控制各種生理物質(zhì)進(jìn)出線粒體的屏障。2023/12/25184
內(nèi)膜中的蛋白質(zhì)包括電子傳遞鏈的多肽成員、各種輸送蛋白質(zhì)和ATP合成酶等。還有一些酶(如以FAD為輔基的琥珀酸脫氫酶)與內(nèi)膜內(nèi)側(cè)相連,而已經(jīng)觀察到的內(nèi)膜內(nèi)側(cè)的球狀突起物則是ATP合成酶的具催化功能的亞單位。2023/12/25185線粒體基質(zhì)中包含線粒體的DNA和核糖體,以及與蛋白質(zhì)合成、氨基酸分解代謝、脂肪酸β-氧化有關(guān)的酶和TCA環(huán)的酶(其中琥珀酸脫氫酶與內(nèi)膜相聯(lián))。線粒體內(nèi)外膜之間的膜間腔內(nèi)也含有特殊的酶,如腺苷酸激酶。
2023/12/25186與代謝有關(guān)的底物、產(chǎn)物以及還原力在細(xì)胞質(zhì)和線粒體基質(zhì)之間的傳遞,對(duì)真核微生物的代謝是非常重要的。這主要是因?yàn)榻徒夂蚉P環(huán)(磷酸戊糖循環(huán))發(fā)生在細(xì)胞質(zhì),而脂肪酸的β-氧化(脂肪酸的降解)以及乙?;慕到猓═CA環(huán)的氧化過程)發(fā)生在線粒體的基質(zhì)中。2023/12
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