胚珠cDNA文庫的構(gòu)建、測(cè)序及EST分析的開題報(bào)告

海7124纖維/胚珠cDNA文庫的構(gòu)建、測(cè)序及EST分析的開題報(bào)告一、選題背景和意義生物學(xué)的研究對(duì)于人類的生存和發(fā)展具有重要意義。植物作為自然界的基礎(chǔ)，它們的繁衍、生長(zhǎng)和發(fā)育機(jī)制牽動(dòng)著人們的研究熱情。纖維素是植物細(xì)胞壁的主要組成部分，而纖維素合成對(duì)植物生長(zhǎng)發(fā)育以及纖維素在棉花生產(chǎn)中的質(zhì)量和產(chǎn)量具有非常重要的影響。海島棉是我國(guó)重要的纖維作物之一，其纖維細(xì)長(zhǎng)、強(qiáng)度高、柔軟度好、白度高，一直被業(yè)界所青睞。因此，對(duì)海島棉的分子生物學(xué)方面進(jìn)行研究，有助于了解其生長(zhǎng)和發(fā)育機(jī)制，提高纖維素合成的質(zhì)量和產(chǎn)量，從而推動(dòng)我國(guó)經(jīng)濟(jì)的發(fā)展。本選題主要是基于海島棉纖維和胚珠的cDNA文庫進(jìn)行構(gòu)建，使用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)其進(jìn)行測(cè)序分析，并對(duì)得到的EST序列進(jìn)行比對(duì)和分析，以期發(fā)現(xiàn)與纖維素合成相關(guān)的基因和調(diào)控機(jī)制。該研究對(duì)于深入探究海島棉的分子生物學(xué)特性、加快海島棉的育種及提高其生產(chǎn)效益具有重要意義。二、研究目標(biāo)1、構(gòu)建海島棉纖維和胚珠cDNA文庫；2、使用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)cDNA文庫進(jìn)行測(cè)序；3、對(duì)得到的EST序列進(jìn)行比對(duì)和功能注釋。三、研究?jī)?nèi)容和方法1、文庫構(gòu)建（1）收集海島棉成熟期纖維和胚珠材料；（2）提取纖維和胚珠中的總RNA；（3）使用Oligo(dT)寡聚核苷酸作為引物，合成cDNA文庫；（4）將文庫進(jìn)行擴(kuò)增、轉(zhuǎn)化、篩選，構(gòu)建纖維和胚珠cDNA文庫。2、高通量測(cè)序（1）文庫質(zhì)控：使用Agilent2100生物分析儀檢測(cè)文庫的質(zhì)量、濃度和大小分布；（2）測(cè)序：使用IlluminaHiSeq2500平臺(tái)對(duì)纖維和胚珠cDNA文庫進(jìn)行高通量測(cè)序。3、數(shù)據(jù)分析（1）數(shù)據(jù)質(zhì)控和預(yù)處理；（2）序列比對(duì)和注釋；（3）基于功能的注釋和分析。四、研究進(jìn)度安排本研究的進(jìn)度安排如下：月份|研究?jī)?nèi)容-|-1-3|收集樣本，提取總RNA4-6|構(gòu)建纖維和胚珠cDNA文庫7-9|文庫質(zhì)控和高通量測(cè)序10-12|對(duì)EST序列進(jìn)行分析和注釋五、預(yù)期結(jié)果和意義本研究通過構(gòu)建海島棉纖維和胚珠cDNA文庫，使用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)其進(jìn)行測(cè)序分析，目的是發(fā)現(xiàn)與纖維素合成相關(guān)的基因和調(diào)控機(jī)制。此項(xiàng)研究的預(yù)期結(jié)果包括：1、獲得纖維和胚珠的cDNA文庫；2、得到大量EST序列，并進(jìn)行比對(duì)和注釋；3、發(fā)現(xiàn)一些與纖維素合成相關(guān)的