基因符號、蛋白質符號在科技期刊中的使用

基因符號、蛋白質符號在科技期刊中的使用

不同的版本的基因符號和土壤符號的表達，同一出版物也不完整。如何才是規(guī)范的,未見深入系統(tǒng)的研究;在科技期刊日趨國際化的今天,很有討論的必要。1entalrert1基因編碼TIG遺傳命名指南規(guī)定,人類基因的全名不用斜體,其基因符號由斜體大寫的羅馬字母與阿拉伯數(shù)字組成,中間不加點號,也不用上下角標。例如脆性X智力低下基因1,全名fragileXmentalretardation1,不用斜體,基因符號為FMR1,由斜體大寫的羅馬字母和阿拉伯數(shù)字組成。論文中一般不寫基因全名,只寫基因符號,如KPT1、KPT12、KPT13、TP53、CDKN2A、RB1。等位基因的命名與基因命名相似,由斜體大寫字母與阿拉伯數(shù)字組成,但要用星號將基因符號與特異的等位基因符號分開,如HBB*S、D3S22*AI(星號不是上角標)。蛋白質的名稱用相同的大寫基因符號表示,但不用斜體,如KPT1、KPT12、KPT13、TP53、CDKN2A、RB1。實驗中常用細菌及動物基因和蛋白質的命名規(guī)則如下。1等位基因的編碼基因符號由3個小寫斜體字母組成。具有相同表型的不同基因座突變用斜體大寫字母后綴相區(qū)別,如uvrA、uvrB;等位基因用緊隨基因座名稱后的一系列特定的數(shù)字表示,如lacY1、araA1、araA2;如果發(fā)生突變的精確基因座不能確定,并且等位基因的名稱只有3個字母,則基因座字母由連字符代替,如lac-23、eda-1。蛋白質產(chǎn)物的名稱與對應的基因或等位基因相同,但不用斜體,且首字母大寫,如UvrA、UvrB。2等位基因的命名基因符號由斜體字母和阿拉伯數(shù)字組成,字符總數(shù)不超過6個,且首字母大寫,如Tyrp、Tyr、Pepc、Prm1、Fa;等位基因的命名是在基因符號的右上角加一上標,如ESIb;蛋白質用相同的基因符號命名,不用斜體,但要大寫,如TYRP、TYR、PEPC、PRM1。3其他命名規(guī)則基因符號通常用2~4個斜體字母和阿拉伯數(shù)字表示,首字母大寫,但不用連字符,如Es1、Es2、B2m、Mc1r、Myc、Tyr、Gus;等位基因的命名是在基因符號后加小寫的上標,如Es1b、Gpila;蛋白質用基因的相同符號命名,但要正體大寫,如ES1、ES2、MC1R、MYC、TYR、GUS。除上述TIG遺傳命名規(guī)則之外,還有其他命名系統(tǒng)。國外研究者曾先后提出了大腸桿菌、曲霉和啤酒酵母基因符號的建議命名系統(tǒng)。這些系統(tǒng)不是正式的標準,但已為大多數(shù)研究者認可?；蜃姆栍?個小寫斜體字母表示。這3個字母是說明這一基因特性的英文單詞或詞組的縮寫。如組氨酸基因his(histidine的前3個字母)、與核糖體中較大的蛋白質亞基有關的基因rpl(由ribosomalproteinlarge這3個詞的首字母組成)等。2科技時代基因符號和蛋白質符號的顯示筆者調查了分子生物學和醫(yī)學2類期刊12種30期,基因和蛋白質符號的使用大致有以下3種情況。1基因和蛋白質符號的表示方法及規(guī)則有采用TIG命名系統(tǒng)的,如BMRF1基因,在同一篇文章中都采用大寫斜體,P54蛋白采用大寫正體,整篇文章中前后一致;但在同一本期刊不同的文章中基因、蛋白質符號又都采用大寫正體,如VPZ基因、HA基因、VPZ抗體、B19殼蛋白、TAT蛋白;同一本期刊基因蛋白質又成了斜體,并且基因還是小寫斜體,如Taq酶,p21基因。國外期刊也存在同樣問題,如p53protein是小寫斜體,p53genes也是小寫斜體,同一篇文章p53protein又用小寫正體?；蚝偷鞍踪|符號的表示方法采用TIG遺傳命名指南的規(guī)則比較科學,因為該指南詳細規(guī)定了各種基因和蛋白質的表示方法,正確使用這一命名方法,能夠提高論文的科學性。責任編輯必須嚴格把關,使每一篇文章中的符號要統(tǒng)一,主編應整體把關,使整本期刊的符號統(tǒng)一。2ha基因的基因文化如VEGF基因、G6Pase基因、BMRF1基因、VP2基因、HA基因,P54蛋白、VEGF蛋白、B1g殼蛋白、PCNA蛋白、G6Pase蛋白、VP2抗體、TAT蛋白等。這種表示方法不科學,一旦符號后不寫基因或蛋白質字樣,讀者就難以區(qū)分它們所表達的內容。3定期閱讀基因符號小，蛋白質符號大絕大多數(shù)醫(yī)學期刊采用小寫正體字母表示基因,大寫正體字母表示蛋白質,但存在如下混亂現(xiàn)象。相同的符號在所有出版物中都不同有的文章基因小寫,蛋白質大寫,如p21基因、p53基因,P21蛋白;另一篇文章p21基因有時大寫有時小寫?；蚓幋a及表達如某大學學報(醫(yī)學版)前后4篇文章的表達4個樣:《低溫對腦外傷后細胞凋亡的影響》一文,基因符號小寫,蛋白質符號大寫,如bax及bcl-2基因、Bcl-2蛋白、Bax-蛋白;《基因芯片技術在cox10等無精癥患者相關基因的分析》一文,題名中的基因用了正體小寫字母,而正文中基因符號又用大寫,如COX10基因、CT基因;《莫索尼定對自發(fā)性高血壓大鼠左室肥厚及c-myc基因表達的影響》一文,基因用小寫字母,如c-myc基因;《IS導管血管壁內局部導入c-myc反義寡核苷酸預防PTCA術后再狹窄的實驗研究》一文,基因和蛋白質又都用小寫字母,如c-myc蛋白、c-myc基因。基因符號法如“cyclinD蛋白表達”“c-myc單克隆抗體”有時大寫,有時小寫。基因符號用小寫字母表示,蛋白質符號用大寫正體字母表示,這種方法也比較科學。如果同一基因在人類和動物中都存在,人類中的基因用大寫正體字母表示,以示區(qū)別。3基因、蛋白質符號的規(guī)范表達上述基因及蛋白質符號不規(guī)范的表達,往往是由下述原因引起的。1)作者對基因符號、蛋白質符號的表示方法不清楚,往往從網(wǎng)上查一些資料,這些資料中符號本來就不規(guī)范,作者也就將錯就錯。2)期刊出版編輯部門對基因、蛋白質符號沒有統(tǒng)一規(guī)定。3)編輯不重視。由于分子生物學發(fā)展得越來越快,尤其是目前滲透到醫(yī)學各個領域,醫(yī)學論文幾乎都涉及到分子生物學的內容,它的規(guī)范使用直接關系到文章內容的表達,但這并未引起編輯的重視,往往是對作者寫的未加以修改和規(guī)范。針對這些問題,為了保證科技期刊中基因符號和蛋白質符號的規(guī)范表達,建議有關方面做好以下幾項工作:1)有關部門應制定有關基因、蛋白質符號的編排格式;2)編輯應注意基因、蛋白質符號的規(guī)范化