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DNA多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增DNA片斷課題2一、知識(shí)回顧1.DNA的基本單位-①②③④⑤脫氧核苷酸(脫氧核糖核酸)五碳糖磷酸基團(tuán)羥基3,端5,端ATGCATGC5,端(含磷酸基團(tuán))3,端(含羥基)3,端5,端2.脫氧核苷酸鏈的形成3.DNA分子的雙螺旋結(jié)構(gòu)⑴DNA分子是由
的脫氧核苷酸長(zhǎng)鏈盤(pán)旋而成的規(guī)則
結(jié)構(gòu)。⑵
與
交替連結(jié),排列在外側(cè),構(gòu)成基本骨架;
排列在鏈的內(nèi)側(cè)。⑶兩條鏈上的堿基通過(guò)
連結(jié)起來(lái),形成堿基對(duì)。堿基對(duì)的組成有特定的規(guī)律:即腺嘌呤一定與
配對(duì),
一定同胞嘧啶配對(duì)。雙螺旋兩條反向平行脫氧核糖磷酸堿基氫鍵胸腺嘧啶鳥(niǎo)嘌呤4.復(fù)制過(guò)程生物體內(nèi)DNA分子復(fù)制的條件參與的組分在DNA復(fù)制中的作用解旋酶打開(kāi)DNA雙鏈DNA母鏈提供DNA復(fù)制的模板4種脫氧核苷酸合成子鏈的原料DNA聚合酶引物使DNA聚合酶能夠從引物的3’端開(kāi)始連接脫氧核苷酸催化合成DNA子鏈DNA聚合酶的特性DNA聚合酶不能從頭開(kāi)始合成DNA,而只能從3’端延伸DNA鏈。因此,DNA復(fù)制需要引物。小資料:引物是一小段DNA或RNA,它能與DNA母鏈的一段堿基序列互補(bǔ)配對(duì)。用于PCR的引物長(zhǎng)度通常為20~30個(gè)核苷酸。DNA的復(fù)制方向3’5’5’3’因此,DNA的合成方向總是從子鏈的5,端向3,端延伸。4.復(fù)制過(guò)程(一)PCR技術(shù)的概念
是一種體外迅速擴(kuò)增DNA片段的技術(shù),它能以極少量的DNA為模板,在幾小時(shí)內(nèi)復(fù)制出上百萬(wàn)份的DNA拷貝。(二)PCR技術(shù)的應(yīng)用
遺傳疾病的診斷、刑偵破案、古生物學(xué)、基因克隆和DNA序列測(cè)定。三、基礎(chǔ)知識(shí)解旋酶(打開(kāi)DNA雙鏈)DNA母鏈(模板)4種脫氧核苷酸(合成子鏈原料)DNA聚合酶(催化子鏈合成)引物(RNA)(使DNA聚合酶能從引物3′端開(kāi)始連接脫氧核苷酸)自主閱讀P59,并思考:體外擴(kuò)增DNA,需要怎樣環(huán)境?變性(80-100℃
)Taq聚合酶(耐高溫)20—30個(gè)核苷酸構(gòu)成DNADNA母鏈4種脫氧核苷酸緩沖溶液,控制溫度體內(nèi)復(fù)制DNA體外擴(kuò)增DNA1.DNA
分子的熱變性原理DNA雙鏈單鏈變性(加熱80-100℃)復(fù)性(緩慢冷卻)變性的目的:復(fù)性的目的:解開(kāi)雙鏈有利于引物與兩條單鏈結(jié)合
在80~100℃的溫度范圍內(nèi),DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)將解體,雙鏈分開(kāi),這個(gè)過(guò)程稱(chēng)為變性(三)PCR原理PCR技術(shù)總結(jié)利用DNA分子的熱變性原理,通過(guò)控制溫度來(lái)控制雙鏈的解旋與結(jié)合,從而完成體外DNA分子的擴(kuò)增。
四種脫氧核苷酸、耐熱的DNA聚合酶、引物、DNA模板、緩沖溶液和控制溫度的溫控設(shè)備。子鏈的5’端向3’端延伸
具有特異、敏感、產(chǎn)率高、快速、簡(jiǎn)便、重復(fù)性好、易自動(dòng)化等突出。原理?xiàng)l件方向特點(diǎn)5/3/3/5/5/3/引物Ⅰ5/3/引物Ⅱ變性95oC復(fù)性55oC延伸72oC5/3/3/5/(四)PCR的反應(yīng)過(guò)程5
引物15
引物2第二次復(fù)制第一次復(fù)制5
5
5
5
5
5
模板DNA5
5
5
5
5
5
5
5
經(jīng)n次循環(huán)(復(fù)制)后,DNA的含量理論上可以擴(kuò)大到
倍。2n每次循環(huán)分為:PCR的反應(yīng)過(guò)程總結(jié)變性——復(fù)性——延伸②DNA聚合酶只能特異性地復(fù)制處于兩個(gè)引物之間的DNA序列,使這段固定長(zhǎng)度的序列呈指數(shù)擴(kuò)增。①?gòu)牡诙喲h(huán)開(kāi)始,上一次循環(huán)的產(chǎn)物也作為模板參與反應(yīng),并且由引物Ⅰ延伸而成的DNA單鏈會(huì)與引物Ⅱ結(jié)合,進(jìn)行DNA的延伸PCR的反應(yīng)結(jié)果模擬PCR擴(kuò)增DNA二、PCR反應(yīng)的實(shí)驗(yàn)操作1、PCR儀(一)設(shè)備及用具2、微量離心管一種薄壁塑料管,總?cè)莘e為0.5ml3、微量移液器用于定量轉(zhuǎn)移PCR配方中的液體,其上的一次性吸液槍頭用一次更換一次。能夠自動(dòng)調(diào)控溫度的儀器(二)PCR的操作步驟(1)按配方將所需試劑擺放在實(shí)驗(yàn)桌上(準(zhǔn)備)(2)用微量移液器按配方在微量離心管中依次加入各組分(移液)(3)蓋嚴(yán)離心管口的蓋子,用手指輕輕彈擊管壁(混合)(4)將微量離心管放在離心機(jī)上離心約10s
(離心)(5)將離心管放入PCR儀上,設(shè)置好PCR儀的循環(huán)程序(反應(yīng))循環(huán)數(shù)變性復(fù)性延伸第一次94°C,10min--30次94℃,30s55℃,30s72℃,1min最后一次94℃,1min55℃,30s72℃,1min(一)理論上DNA擴(kuò)增數(shù)目的計(jì)算1.一條DNA,復(fù)制n次,DNA為
。2.a條DNA,復(fù)制n次,DNA為
。三、結(jié)果分析與評(píng)價(jià)2nax2n(二)實(shí)驗(yàn)中DNA含量的測(cè)定可以通過(guò)測(cè)量DNA含量來(lái)評(píng)價(jià)擴(kuò)增的效果,DNA在260nm的紫外線波段有一強(qiáng)烈的吸收峰,峰值的大小與DNA的含量有關(guān)
具體方法如下:(1)稀釋?zhuān)喝?μLPCR反應(yīng)液,加入98μL蒸餾水,即將樣品進(jìn)行50倍稀釋。(2)對(duì)照調(diào)零:以蒸餾水作為空白對(duì)照,在波長(zhǎng)260nm處,將紫外分光光度計(jì)的讀數(shù)調(diào)節(jié)至零。(3)測(cè)定:取DNA稀釋液100μL至比色杯中,測(cè)定260nm處的光吸收值。(4)計(jì)算:檢測(cè)DNA片段的擴(kuò)增情況,可以通過(guò)計(jì)算DNA含量來(lái)評(píng)價(jià)擴(kuò)增的效果,計(jì)算公式為:DNA含量(μg/mL)=50×(260nm的讀數(shù))×稀釋倍數(shù)。[特別提醒]
公式中的50代表在波長(zhǎng)260nm紫外波段照射下,吸收峰為1時(shí),DNA含量為50μg/mL。練習(xí)鞏固1、關(guān)于PCR技術(shù)的應(yīng)用,錯(cuò)誤的一項(xiàng)是A古生物學(xué)、刑偵破案、DNA序列測(cè)定B診斷遺傳疾病、基因克隆、古生物學(xué)CDNA序列測(cè)定、基因克隆、刑偵破案D診斷遺傳疾病、合成核苷酸、DNA序列測(cè)定2、DNA的合成方向總是從子鏈的哪一端向哪一端延伸?3、PCR技術(shù)最突出的優(yōu)點(diǎn)是A原理簡(jiǎn)單B原料易找CTaqDNA聚合酶有耐熱性D快速、高效、靈活、易于操作從子鏈的5’端向3’端延伸體內(nèi)DNA復(fù)制與PCR的技術(shù)區(qū)別:體內(nèi)復(fù)制PCR技術(shù)解旋在解旋酶作用下,細(xì)胞提供ATP,部分解開(kāi)加熱到94oC,雙鏈全部解開(kāi),不需解旋酶引物一小段RNA一般用DNA片段DNA聚合酶細(xì)胞自身的DNA聚合酶(不耐高溫)TaqDNA聚合酶復(fù)制特點(diǎn)半保留復(fù)制,邊解旋邊復(fù)制,多起點(diǎn)復(fù)制。半保留復(fù)制,完全解旋后復(fù)制,從模板鏈的一端開(kāi)始復(fù)制。復(fù)制的方向子鏈的5’端向3’端延伸
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