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文檔簡(jiǎn)介
熒光定量PCR技術(shù)
原理與結(jié)果
分析羅喜鵬一、含義二、優(yōu)越性三、應(yīng)用四、定量方法五、熒光材料六、結(jié)果分析一、含義實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)(Real-TimeQuantitativePCR)是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,最后通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法。二、優(yōu)越性特異性熒光定量PCR具有引物和探針的雙重特異性,故與傳統(tǒng)的PCR相比,特異性大為提高。敏感性熒光定量PCR的敏感度通常達(dá)E2拷貝/ml,對(duì)數(shù)期分析,線性范圍很寬,為0-E11拷貝/ml。一般來(lái)講臨床標(biāo)本中病原體的數(shù)目為0-E10/拷貝,在此范圍內(nèi)熒光定量PCR定量較為準(zhǔn)確,標(biāo)本不需稀釋。重復(fù)性熒光定量PCR結(jié)果相當(dāng)穩(wěn)定,因?yàn)橛蛑翟O(shè)置在指數(shù)擴(kuò)增期.在此階段,各反應(yīng)組分濃度相對(duì)穩(wěn)定,沒(méi)有副作用,CT與熒光信號(hào)的對(duì)數(shù)呈線性關(guān)系。與終點(diǎn)法相比CT值能更穩(wěn)定,更精確地反映起始模板的拷貝數(shù)。自動(dòng)化無(wú)PCR后續(xù)操作步驟,降低產(chǎn)物污染的風(fēng)險(xiǎn)性。三、應(yīng)用用于核酸的定量如RNA、DNA的定量用于核酸定性分析如SNP分析,基因型分析,RNA變異分析,溶解曲線分析等。四、定量方法1.
標(biāo)準(zhǔn)曲線法的絕對(duì)定量2.
標(biāo)準(zhǔn)曲線法的相對(duì)定量
3.
比較CT法的相對(duì)定量
五、熒光材料熒光探針和熒光染料
SYBRgreenI
水解探針TaqMan
分子信標(biāo)
雜交探針SYBRgreenI未結(jié)合的SYBRgreenI水解探針TaqMan熒光素淬滅劑
與目標(biāo)序列互補(bǔ)FAMTETJOEHEXVIC
TAMRADABCYL探針與目標(biāo)序列配對(duì)時(shí),發(fā)生熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)光能量轉(zhuǎn)移Taq游離的探針熒光基團(tuán)
淬滅劑
延伸時(shí),Taq酶水解探針,使報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離而發(fā)出熒光,形成熒光信號(hào)
Taq發(fā)出熒光光另一波長(zhǎng)的熒光分子信標(biāo)熒光基團(tuán)莖由互補(bǔ)配對(duì)的序列組成環(huán)與目標(biāo)序列互補(bǔ)
淬滅劑
莖(5-7bp)
環(huán)(15-30bp)FAMTexas
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