醫(yī)學文獻檢索與利用

醫(yī)學文獻檢索與利用郭繼軍guo@主要內(nèi)容文獻基本知識文獻檢索基本知識Pubmed檢索中文文獻檢索全文數(shù)據(jù)庫檢索網(wǎng)絡(luò)資源檢索與利用論文寫作文獻檢索教學意識：信息應(yīng)用能力：信息檢索與評價技能：檢出效率、結(jié)果、技巧

知識更新速度半衰期：

18世紀為80～90年

19～20世紀初30年

20世紀60年代15年

20世紀80年代5年

21世紀初3年左右文獻數(shù)量全世界每天發(fā)表的論文達13000～14000篇，每年登記的新專利達70萬項，每年出版的圖書達50多萬種。Pubmed文獻：

1980年28萬

1990年40萬

2000年53萬

2010年93萬問題遼寧省所有高校名錄低密度脂蛋白膽固醇(LDL-C)正常值P53基因堿基序列結(jié)直腸癌循證醫(yī)學治療方案問題

最近科里有個比較棘手的病例，診斷為紫癜性腎炎(腎病型)，先后經(jīng)過甲強龍、環(huán)磷酰胺沖擊，口服雷公藤、驍悉等治療，但血尿和蛋白尿仍無好轉(zhuǎn)?？评锏睦蠋煕Q定組織病例討論會，研究下一步治療方案，也要求每位研究生針對患者的實際情況查找相關(guān)文獻，準備在會上發(fā)言。

。。。哪有時間查文獻?何況文獻的作者們也是百家爭鳴，各執(zhí)己見，很多觀點只是推測而已。。。摸索下班之后，去了圖書館的計算機室，進入維普期刊數(shù)據(jù)庫。在關(guān)鍵詞中輸入“紫癜性腎炎”，搜出了幾千條索引。再輸入“腎病綜合征激素耐藥”，又搜出了幾千條……當時就暈了，看來找到真正有價值的文獻也不那么容易?；貧w我趕緊到現(xiàn)刊閱覽室，把最新一期《中國實用兒科雜志》關(guān)于腎病綜合癥診療進展的專題仔細閱讀了幾遍，認真作了筆記。再回到電腦室有針對性地查找，這次終于找到了有價值的文獻。

回去之后，我認真學習了這些文獻，漸漸對這個患者的診治有了更深入的認識。。。體會我們的前輩和同行們，在工作中也同樣遇到過許多亟待解決卻又找不到現(xiàn)成答案的實際問題。他們把豐富的個人經(jīng)驗和最新的科研成果結(jié)合，針對具體患者的實際情況，提出了各種解決方案。研究生信息需求（開題）目的：了解國內(nèi)外研究動態(tài)與進展，掌握前人研究成果，尋找課題設(shè)計思路和依據(jù)方法：1、準確描述研究背景信息需求：機構(gòu)、人員、熱點與趨 勢、相似研究的材料與方法2、識別與選擇合適信息源：期刊、專著、會議、學位論 文、專利、專業(yè)數(shù)據(jù)庫、科研基金項目、學術(shù)論壇3、文獻檢索、獲取全文：專業(yè)工具、數(shù)據(jù)庫4、信息跟蹤：Alert(注冊，email);RSS(網(wǎng)絡(luò)訂閱）文獻基本知識文獻(documents，literature)：是記錄有知識的一切載體文獻組成四要素：記錄知識的具體內(nèi)容記錄知識的手段：如文字、圖像、符號、聲頻、視頻等記錄知識的物質(zhì)載體：紙張、光盤、錄像帶等記錄知識的表現(xiàn)形態(tài)：圖書、期刊、專利說明書等文獻的作用積累、繼承和交流作用科學研究的依據(jù)評價醫(yī)學科技人員造詣的依據(jù)評價一個國家、單位的醫(yī)學科技發(fā)展水平的依據(jù)領(lǐng)導(dǎo)決策的依據(jù)優(yōu)先權(quán)作用文獻信息特點數(shù)量龐大增長迅速分布分散內(nèi)容交叉重復(fù)類型多樣新陳代謝加快語種復(fù)雜性增加交流速度加快文獻基本知識文獻類型及其特點

1.按載體劃分:

印刷型:book,serials,proceedings,thesis, patent,tech.Reports…

非印刷型:microfilm,A-Vmaterials,e-j…2.按內(nèi)容加工深度:

一次文獻,二次文獻,三次文獻,零次文獻

3、按文獻獲取難以程度：

白色文獻、灰色文獻、黑色文獻圖書教材（textbook)

根據(jù)各專業(yè)的教學需要，闡述某一學科或?qū)I(yè)的基本知識的教學用書，基本按教學大綱編寫

只介紹基礎(chǔ)知識和公認的見解，內(nèi)容相對穩(wěn)定，闡述系統(tǒng)完整，表達概括清楚，能使人獲得有關(guān)學科領(lǐng)域的一般知識專著（monograph)

針對某一專門題目分章節(jié)做出系統(tǒng)深入全面敘述的一種著作

外文名著與著名出版社參考工具書（Referencebooks)

根據(jù)一定需要收集有關(guān)資料并按特定的方法編排起來供人查考的文獻

（查考性、概括性、易檢性）

參考工具書字典、詞典（dictionary)百科全書（encyclopedia)年鑒（yearbook,manual,almanac)手冊（handbook)

指南（directory)藥學工具書：藥典—Martindale:Extrapharmacopiea,手冊—MerckIndex,字典—中藥大辭典

期刊(Periodical，Journal，magazine)特點：

連續(xù)出版發(fā)行有固定的名稱（刊名）相對固定的版式、篇幅和內(nèi)容范圍按一定的卷期號或年月順序號連續(xù)出版內(nèi)容：

每期發(fā)表多個作者的多篇文章，內(nèi)容不重復(fù)作者眾多內(nèi)容新穎、出版周期短，通報速度快信息量大，約占整個信息量的70%

醫(yī)學期刊類型按出版周期劃分按內(nèi)容功能劃分：學術(shù)、檢索、綜述按學科類別劃分按出版機構(gòu)劃分按載體形態(tài)劃分期刊文獻類型論著(originalarticle,journalarticle)綜述(review)短篇報道(shortreport,briefcommunication)病例報告來信(letter)編者述評(editorial)更正(comment)摘要(abstract)消息(news)講座(lecture,guide)書評(bookreview)期刊論文質(zhì)量要求主要看其“三性”：創(chuàng)新性、科學性、規(guī)范性論文內(nèi)容上是否有創(chuàng)新性；科學性：目的明確、方法清楚、推導(dǎo)論證合理、結(jié)果真實、結(jié)論嚴謹、不夸大不延伸；規(guī)范性：論文的格式、語言文字、學術(shù)名詞、量與單位、圖表等論文評價標準：發(fā)表刊物、被引頻次、下載次數(shù)、參考文獻質(zhì)量及時間專家評議：F1000期刊(Periodical）核心期刊研究中文核心期刊要目總覽

4/evaluation/

中國科學引文數(shù)據(jù)庫（CSCD）中國科技論文引文數(shù)據(jù)庫（CSTPC）

/

中國社會科學引文數(shù)據(jù)庫（CSSCI）期刊評價影響因子（IF）、主辦單位、學會背景、檢索工具收錄期刊學術(shù)水平評價指標JCR出版機構(gòu)學術(shù)背景編輯部及編委組成作者組成基金論文比例出版頻率發(fā)行量期刊學術(shù)水平評價指標國內(nèi)外檢索工具收錄情況(Indexed)總被引頻次(citedtimes)影響因子(IF)載文量(sourceitem)文摘率閱覽利用率期刊評價方法文摘法引文法專家調(diào)查法流通統(tǒng)計法其它文獻組織與分類學科分類:《中國圖書館分類法》R1預(yù)防醫(yī)學、衛(wèi)生學R2中國醫(yī)學R3基礎(chǔ)醫(yī)學R4臨床醫(yī)學R5內(nèi)科學R6外科學R7婦產(chǎn)科學R72兒科學R73腫瘤學R74神經(jīng)病學與精神病學R75皮膚病學與性病學R76耳鼻咽喉科學R77眼科R78口腔科學

R8特種醫(yī)學 R9藥學R醫(yī)藥、衛(wèi)生.........（第一級類目）

R5內(nèi)科學.................（第二級類目）

R56呼吸系及胸部系統(tǒng)疾病..

（第三級類目）

R563肺疾病...............（第四級類目）

R563.1肺炎..................（第五級類目）

R563.1+1大葉性肺炎......（第六級類目）中國圖書館分類法5大部類，22大類，6個總論復(fù)分表，30多個專類復(fù)分表、55811條類目混合小數(shù)層累制：復(fù)分表：對于臨床各科（R5-R8），有專門復(fù)分表：01預(yù)防、控制和衛(wèi)生02病理學、病因?qū)W03微生物學、免疫學04診斷學05治療學06并發(fā)癥07預(yù)后08診療器械、用具09康復(fù)

例：R563.1-05肺炎治療學

文獻組織標識詞組織法

keyword:同義詞、近義詞

subjectheadings:唯一性

textword:checktags:animal,human…檢索語言描述文獻特征和表達檢索提問的專用語言類型：

組合方法：先組式（分類、標題詞）、后組式（單元詞、敘詞）

規(guī)范程度：規(guī)范（類目、主題詞）、非規(guī)范（關(guān)鍵詞、單元詞）

描述特征：內(nèi)容（分類、主題）、外部（書名、作者、序號）

本體語言（ontology)檢索步驟確定完整的題目：(綜述\原始研究)

aspirin的藥理學研究

肝纖維化患者血清或肝組織內(nèi)轉(zhuǎn)移生長因子的檢測及其臨床意義分析檢索目的、要求：了解背景、現(xiàn)狀、基本知識提煉名詞術(shù)語：選擇檢索工具：確定檢索途徑：制定檢索策略：檢索文獻：獲取全文：根據(jù)文獻修正檢索策略并重新檢索文獻：文獻檢索基本知識計算機檢索工具：非印刷型數(shù)據(jù)庫：數(shù)值型:CDC

事實型:PDQ

文獻型:全文(fulltext):Springer

檢索型：pubmed,CBM

文獻信息檢索效果的評價查全率:（recall）：指系統(tǒng)在進行某一檢索時，檢出的相關(guān)文獻量占系統(tǒng)文獻庫中相關(guān)文獻量的比率，反映該系統(tǒng)文獻庫中實有的相關(guān)文獻量在多大程度上被檢索出來。

R＝（檢出相關(guān)文獻量/系統(tǒng)中相關(guān)文獻總量）×100%查準率（precision):指系統(tǒng)在進行某一檢索時，檢出的相關(guān)文獻量占檢出的文獻總量的比率，反映每次從該系統(tǒng)文獻庫中實際檢出的全部文獻中有多少是相關(guān)的。

P=(檢出相關(guān)文獻量/檢出文獻總量)×100%查全率和查準率之間存在互逆關(guān)系。如果一檢索工具的查全率較高，則其查準率將相對下降；反之查準率高，則查全率低。查全率和查準率只能相對提高，二者永遠不可能同時達到100%。文獻信息檢索工具的類型及特點

目錄：bibliography題錄：title摘要：abstract索引：index全文：Full-text檢索方法

工具法：優(yōu)點：查全、查準缺點：收錄范圍、時差、檢索途徑瀏覽法：優(yōu)點：獲得最新文獻缺點：遺漏文獻追溯法：利用參考文獻查找資料優(yōu)點：擴大查找范圍缺點：片面、遺漏文獻檢索途徑Authorname:姓在前全稱，名首字母縮寫Title:Address:Keyword:Mesh（MedicalSubjectHeadings):Abstract:Grant:Publicationyear:Volume,issue:M:\yjs\文獻檢索\Qualifiers-2005.htm83個Source:計算機文獻檢索數(shù)據(jù)庫類型及其構(gòu)成

database—file—record—field計算機檢索技術(shù)邏輯運算：NOT,AND,OR,()

字符運算：通配符：?(colo?r,wom?n,rat?)

截詞符：＊(transplant*,pregnan*)

鄰近運算：near,with,same

字段限定：［］，IN

其它：詞組限定、擴展檢索、加權(quán)檢索、精確與模糊檢索、跨庫檢索檢索策略構(gòu)建分析檢索課題，明確檢索要求：內(nèi)容、信息類型、限定條件選擇檢索工具，確定檢索途徑：編制檢索表達式：檢索結(jié)果評價，調(diào)整檢索策略：獲取全文：檢索策略制定檢索詞提煉與轉(zhuǎn)換：懷孕－＞妊娠，子宮纖維瘤－＞活性、降解、吸收－＞普查、防治－＞邏輯組織：因果關(guān)系：阿司匹林致胃潰瘍眼結(jié)核致失明相關(guān)關(guān)系：眼弓形體病并發(fā)青光眼幽門螺旋桿菌與胃潰瘍應(yīng)用關(guān)系：維生素C對哮喘的治療作用

阿司匹林致胃潰瘍阿司匹林／副作用AND胃潰瘍／病因?qū)W，化學誘導(dǎo)眼結(jié)核致失明眼結(jié)核／并發(fā)癥AND盲／病因?qū)W眼弓形體病并發(fā)青光眼弓形體?。l(fā)癥AND青光眼／并發(fā)癥幽門螺旋桿菌與胃潰瘍幽門螺旋桿菌／微生物學AND胃潰瘍／病因?qū)W，病理學維生素C對哮喘的治療作用維生素C／治療應(yīng)用AND哮喘／藥物療法計算機檢索注意事項多個檢索詞逐個分步檢索，最后用邏輯運算組合

１．肺纖維化２．細胞因子３．肺泡灌洗液４．#1AND#2AND#3選擇檢索字段并利用二次檢索功能充分利