基因組序列詮釋課件-002

基因組序列詮釋（精選）51、山氣日夕佳，飛鳥相與還。52、木欣欣以向榮，泉涓涓而始流。53、富貴非吾愿，帝鄉(xiāng)不可期。54、雄發(fā)指危冠，猛氣沖長纓。55、土地平曠，屋舍儼然，有良田美池桑竹之屬，阡陌交通，雞犬相聞。基因組序列詮釋（精選）基因組序列詮釋（精選）51、山氣日夕佳，飛鳥相與還。52、木欣欣以向榮，泉涓涓而始流。53、富貴非吾愿，帝鄉(xiāng)不可期。54、雄發(fā)指危冠，猛氣沖長纓。55、土地平曠，屋舍儼然，有良田美池桑竹之屬，阡陌交通，雞犬相聞。第二講基因組序列詮釋5.轉(zhuǎn)錄物組6.蛋白質(zhì)組問題細胞周期的不同時期個體發(fā)育不同階段不同的器官和組織不同的外界環(huán)境下各種基因的表達與否、量的差異、表達部位如何創(chuàng)造性教學(xué)關(guān)注學(xué)生的發(fā)展,尤其是個性心理品質(zhì)和創(chuàng)新能力的發(fā)展,為學(xué)生的未來發(fā)展奠定基礎(chǔ)。實施創(chuàng)造性教學(xué)是以創(chuàng)造教育理論、現(xiàn)代教育學(xué)、心理學(xué)理論為指導(dǎo),引導(dǎo)和幫助學(xué)生在接受、理解知識的基礎(chǔ)上領(lǐng)悟前人獲取知識的方法,經(jīng)歷創(chuàng)造性解決問題的過程,從而培養(yǎng)學(xué)生的創(chuàng)造性思維,塑造創(chuàng)造性人格,促使學(xué)生整體素質(zhì)得到全面發(fā)展的一種教學(xué)模式。英語課是一門實踐性很強的課程,應(yīng)著重培養(yǎng)學(xué)生運用語言進行交際的能力。人的語言能力以他的思維為基礎(chǔ)。因此,培養(yǎng)學(xué)生的語言能力應(yīng)該從他們的思維能力入手。而初中生正好處在十一至十五歲之間,已具備了直覺思維和抽象思維的能力,這正是發(fā)展、培養(yǎng)創(chuàng)造思維能力的最佳時期。創(chuàng)造性教學(xué)要求教師教會學(xué)生獲取、處理和加工信息,培養(yǎng)學(xué)生的實踐能力和自我評價能力。培養(yǎng)學(xué)生的英語創(chuàng)造性思維可以通過比較法、聯(lián)想法、創(chuàng)設(shè)情境、自由會話法、看圖說話法、現(xiàn)行字、詞造句法等發(fā)展。一、比較法它是就某詞或談話要點作為求異點,引導(dǎo)學(xué)生求異思維,如學(xué)生學(xué)了短語infrontof,引導(dǎo)學(xué)生比較它與inthefrontof之間的異同點,通過比較發(fā)展了學(xué)生的發(fā)散思維,加強鑒別力,提高了思維能力。二、聯(lián)想法一詞聯(lián)想,群體記憶,以已學(xué)的詞匯為基礎(chǔ),橫向聯(lián)系、擴展,引導(dǎo)學(xué)生進行求異思維,使之在一詞聯(lián)想中展開。如:學(xué)動詞時就要由動詞原形聯(lián)想到一般現(xiàn)在時第三人稱單數(shù)形式,聯(lián)想到現(xiàn)在分詞和過去式,過去分詞;在學(xué)習國家、語言名稱時就要將人民、首都、貨幣等聯(lián)系在一起,豐富學(xué)生的知識,開闊視野,符合中學(xué)生求新求異的心理特點。三、創(chuàng)設(shè)情境,自由會話法在學(xué)習初中第二冊Lesson21后,要求兩位同學(xué)假設(shè)相互碰面,某A向某B提出某種活動的建議(說明活動的時間、地點)A:××,areyoufreetomorrow?B:Ithinkso,why?A:Wouldyouliketoplaybasketball?B:Oh,thankyou.I’dloveto.WhattimeshallIcome?A:Abouthalfpastthreetomorrowafternoon,OK?B:OK.Whereshallwemeet?A:Let’smeetoutsidetheschoolgate.B:Allright.Atthreethirtytomorrowafternoon,outsidetheschoolgate,seeyoulater.A:seeyou.通過這種訓(xùn)練學(xué)生會逐漸從單純的方法模仿,發(fā)展到思維模仿,從而激發(fā)了學(xué)生的創(chuàng)造性思維。在教學(xué)中每學(xué)完一個對話除了讓學(xué)生扮演外,還讓學(xué)生根據(jù)所學(xué)對話和舊的知識創(chuàng)設(shè)情景,自編一個新對話,激發(fā)他們的學(xué)習興趣和創(chuàng)造激情。四、看圖說話法它不僅能鞏固所學(xué)的語言知識,還能訓(xùn)練學(xué)生的想象力和語言表達能力,開發(fā)學(xué)生的發(fā)散思維能力。如初中第二冊Lesson35課文中的圖讓學(xué)生看,根據(jù)所學(xué)問答的知識編一段對話。A:Excuseme,whereisNo.16MiddleSchool?B:Sorry,Idon’tknow.Askhim,hemayknow.A:Excuseme,whereisNo.16MiddleSchool?C:It’soverthere.Walkalongtheroad,andtakethesecondturningontheright.Thentakethefirstturningontheleft.It’sabout15kilometresaway.Youhadbettertakeabus.A:WhichnumberdoIneed,please?C:Ithinkyouneedanumber12.A:Thanksalot.C:Notatall.五、現(xiàn)行字、詞造句法就是從某一詞、詞組或句型為求異點檢查學(xué)生的理解和運用,引導(dǎo)學(xué)生進行求異思維,訓(xùn)練思維的變通性。如:ondutyWho’sondutytoday?I’m/She’sondutyAreyou/IsLiLei/Aren’tyouondutytoday?I’mnotondutyandyou’reondutytoday.經(jīng)過實踐與探索,學(xué)生在課堂上思路開闊,思維活躍,學(xué)習成績明顯提高。培養(yǎng)學(xué)生創(chuàng)造性思維的方法還有游戲法、競賽法。做游戲能活躍課堂氣氛,深受同學(xué)的歡迎。輕松、自由的氣氛使學(xué)生消除了緊張,讓學(xué)生在玩中學(xué)到知識由被動接受知識轉(zhuǎn)化為開動腦筋主動探索知識,發(fā)展創(chuàng)造思維。通過競賽,迅速聯(lián)想來訓(xùn)練學(xué)生快速的發(fā)散思維和求同思維,同時激發(fā)學(xué)生學(xué)習英語的興趣。創(chuàng)造性教學(xué)的重要任務(wù)是開發(fā)學(xué)生的潛能,教師不能獨占整個教學(xué)活動時間,教師要結(jié)合學(xué)科教材內(nèi)容的特點和學(xué)生已有知識儲備和能力水平有效開展形式多樣的課堂教學(xué)活動,對學(xué)生進行有效的思維方式訓(xùn)練,教師要創(chuàng)設(shè)問題情景、啟發(fā)學(xué)習思路,鼓勵學(xué)生獨立思考相互討論,大膽得出有獨創(chuàng)性見解,培養(yǎng)學(xué)生的想象能力、發(fā)現(xiàn)能力、探索能力和知識遷移能力,使學(xué)生的思維有獨創(chuàng)性、發(fā)散性、廣闊性、變通性品質(zhì)得到有效的訓(xùn)練,使學(xué)生了解知識發(fā)生、發(fā)展、變化的全過程,從而為學(xué)生能創(chuàng)造性解決問題奠定基礎(chǔ)?；ヂ?lián)網(wǎng)經(jīng)濟迅速發(fā)展，讓信息技術(shù)教學(xué)本身所承擔的責任逐漸加重，而受限于當前的教學(xué)體系和政策，初中信息技術(shù)教學(xué)又陷入了困境。如何有效地擺脫困境，探索出符合中學(xué)生性格特征的教學(xué)體系，是關(guān)系我國未來信息技術(shù)教育發(fā)展的重要因素。一、初中信息技術(shù)教育改革之困境從時間上來講，我國和世界其他國家一樣，是最早進行信息技術(shù)教育改革的國家之一，從重視程度上來說，在15年前在我國的大部分中學(xué)都獲得國家教育資金扶持，建立了屬于自己的計算機教育硬件系統(tǒng)。從政策上來講，我國對于計算機教育的政策與文件系統(tǒng)比英國、蘇聯(lián)以及其他一些國家都更加主動與積極。但計算機教育開展20年來，國家計算機教育不僅沒有取得實質(zhì)性的成果，反而遭遇了嚴重的中學(xué)生網(wǎng)癮問題和世界上最大的網(wǎng)絡(luò)游戲玩家群。國家對于互聯(lián)網(wǎng)教育改革的重視背后，卻爆發(fā)了意想不到的危機。這不得不讓人重新反思我國的信息技術(shù)教育改革的道路究竟出了什么問題。1985年美國提出了將計算機教育“工具化”的主張，但是局限于當時世界各國的計算機發(fā)展水平，這個主張并沒有獲得較大回響。進入21世紀之后，各國教育機構(gòu)在國內(nèi)普及計算機硬件，使得信息化教學(xué)體系的實踐成為可能。而這種教學(xué)模式在我國的發(fā)展結(jié)果卻相當單一，在中學(xué)教學(xué)系統(tǒng)中得到廣泛普及的也只有技術(shù)層次很低的PPT教學(xué)。而在這個階段，日本、俄羅斯、英國、美國等國家則開始系統(tǒng)地研究基于信息技術(shù)的教學(xué)方法，并將信息技術(shù)作為一種現(xiàn)代工具在教學(xué)中進行應(yīng)用。當前世界信息技術(shù)教學(xué)系統(tǒng)建設(shè)已經(jīng)相當完備，網(wǎng)絡(luò)遠程教學(xué)、計算機模擬課堂等多種新的教學(xué)模式也漸漸從發(fā)達國家流入我國，對我國的傳統(tǒng)信息技術(shù)教學(xué)系統(tǒng)產(chǎn)生影響。而面對過去留下來的“爛攤子”，初中信息技術(shù)教學(xué)改革究竟何去何從，卻仍然成為了一個大難題。二、造成當前初中信息技術(shù)教學(xué)困境的原因（一）重視程度不足世界各國從20世紀80年代起陸續(xù)將計算機教育引入到初中教育體系中，我國也早在1982年就在全國設(shè)立了計算機教育實驗學(xué)校，并在1984年頒布了《中學(xué)電子計算機選修課教學(xué)綱要（試行）》，但是30年過去了，卻沒有出臺相應(yīng)的關(guān)于信息技術(shù)教學(xué)的考核與評價體系，使得初中信息技術(shù)發(fā)展至今仍然停留在一個輔助性專業(yè)層次。與中國不同，美國在1983年試行計算機教育之初，就將英語、數(shù)學(xué)、科學(xué)、社會研究和計算機科學(xué)定義為基礎(chǔ)學(xué)科，制定了嚴格的教育技術(shù)和教育目標要求。（二）初中生好玩多動，控制力差初中生的價值觀尚未成形，本身好玩多動，約束能力差，對于游戲、電影等娛樂性項目的興趣濃厚程度要遠遠高于一些與計算機相關(guān)的實用知識。很多地區(qū)開設(shè)計算機課之后，學(xué)生進入教室打開電腦就開始玩游戲，教師下命令讓游戲關(guān)掉，有些學(xué)生還在下面偷著玩。更為嚴重的是，有的學(xué)生因為在課堂上沒有過完游戲癮，下課之后偷偷溜去網(wǎng)吧，沉溺于電子游戲世界，并因此荒廢學(xué)業(yè)，造成計算機教育上的一塊“傷疤”。（三）教與學(xué)無系統(tǒng)與不同專業(yè)學(xué)生的信息技術(shù)教育專業(yè)的教師溝通交流時發(fā)現(xiàn)，因為國家統(tǒng)一監(jiān)管體制不嚴格和應(yīng)試教育壓力的雙重作用，學(xué)校和教師不愿意將時間放在一門沒有要求、不知道教什么、學(xué)生不愿意學(xué)的課程上面。雖然學(xué)校按照國家規(guī)定每周會開設(shè)1～2節(jié)的信息技術(shù)課程，但課堂上隨心所欲的現(xiàn)象還是居多。三、我國初中信息技術(shù)教學(xué)改革的對策（一）要提前打開互聯(lián)網(wǎng)視野中學(xué)信息技術(shù)教學(xué)出于對中學(xué)生學(xué)習能力的考慮，所提供的教材和講授的知識都是最基本的理論知識。例如關(guān)于桌面的一些認識，這些知識在學(xué)生未來的計算機生涯中是最基本的，但放在課堂上講，卻顯得枯燥乏味，所以初中信息技術(shù)教學(xué)課堂的趣味性就十分重要?；ヂ?lián)網(wǎng)所呈現(xiàn)的是一個大世界，在不接觸網(wǎng)絡(luò)游戲這個不安全因素的基礎(chǔ)上，我們依然有很多東西可以導(dǎo)入，例如GIF動畫設(shè)計、藝術(shù)字設(shè)計、電腦繪畫等。這些東西既能夠發(fā)散學(xué)生思維，又有助于學(xué)習，而更重要的是能夠引起學(xué)生的興趣。在指導(dǎo)大家學(xué)習計算機硬件基礎(chǔ)知識的時候，筆者給每個小組分配了制作電子板報的任務(wù)，學(xué)生完成得很好，現(xiàn)在，班上仍然有一些學(xué)生在使用這些基本的畫圖工具，甚至還有一個學(xué)生學(xué)會了PS軟件。所以說，對于互聯(lián)網(wǎng)教學(xué)來說，教學(xué)思維要開闊，教學(xué)模式要多樣。（二）建立考核機制美國、日本、英國是最早將計算機教學(xué)列入必修課程的國家，隨著計算機技術(shù)在世界經(jīng)濟發(fā)展中的地位不斷上升，丹麥、比利時、盧森堡、希臘、印度、澳大利亞等國家紛紛將計算機列入必修課程。列為必修課程的一個重要的標志就是畢業(yè)要考試，因為會影響學(xué)生的成績，所以學(xué)校和教師就不得不重視，并竭盡全力來對待。近幾年，我國互聯(lián)網(wǎng)發(fā)展迅速，而國內(nèi)以智能手機行業(yè)為主導(dǎo)的信息產(chǎn)業(yè)的持續(xù)發(fā)展，也助推了市場對信息技術(shù)人才的持續(xù)需求。這也標志著信息技術(shù)已經(jīng)成為影響我國經(jīng)濟未來發(fā)展的決定性因素。如果說美國、日本重視信息技術(shù)教育是一種經(jīng)濟發(fā)展的剛性需要的話，那么中國如今也到了這個時間點。將信息技術(shù)列為必修課程是趨勢也是需要。（三）建立游戲激勵機制中國不是最早遭受網(wǎng)絡(luò)游戲傷害的國家，在美國推行信息技術(shù)教育之初也經(jīng)歷了嚴重的青少年網(wǎng)游上癮問題。但在如今的美國信息技術(shù)意識中，更多的人只是將計算機當成為一種工具。從進入21世紀開始，美國的Game2Train、微軟等公司巨頭響應(yīng)國家關(guān)于信息技術(shù)教育游戲結(jié)合的呼喚，開始教學(xué)游戲模型的設(shè)計開發(fā)。2002年美國麻省理工學(xué)院與微軟公司開發(fā)的“games-to-teach”項目，建立了10個優(yōu)秀的教學(xué)模型，而像Game2Train公司則是長期專注于游戲教育模式的開發(fā)，另外還有德克薩斯大學(xué)的IC2學(xué)院的學(xué)子媒體實驗室開發(fā)的EnterTeach項目等，英國、韓國、日本等也都有類似的項目開展。而在這個領(lǐng)域的設(shè)計中，我國的游戲教學(xué)工具開發(fā)卻仍然較為空白，在近些年的兒童教育中才有了初步的發(fā)展。游戲教學(xué)工具的好處在于通過游戲能夠讓學(xué)生學(xué)習到相應(yīng)的知識，緩解其對游戲的癡迷，減少網(wǎng)癮的幾率，對于初中信息教學(xué)改革來說都可謂意義重大。在未來的信息技術(shù)改革中，我們應(yīng)該積極打開視野，以學(xué)生興趣為導(dǎo)向，通過考核機制對學(xué)生形成約束，并積極借鑒發(fā)達國家的游戲與教學(xué)系統(tǒng)的開發(fā)，推進我國的初中信息技術(shù)教育改革。第二講基因組序列詮釋5.轉(zhuǎn)錄物組6.蛋白質(zhì)組問題細胞周期的不同時期個體發(fā)育不同階段不同的器官和組織不同的外界環(huán)境下各種基因的表達與否、量的差異、表達部位如何5.轉(zhuǎn)錄物組5.1Northern雜交雜交主要步驟提取總RNA(不同組織、不同器官)變性電泳制備目的基因探針轉(zhuǎn)移尼龍膜(放射性或化學(xué)標記法)雜交掃描或放射自顯影依據(jù)雜交信號的強弱、有無判斷基因的表達部位、表達量、表達時期等5.2SAGESAGE(serialsanalysisofgeneexpression基因表達系列分析1995Ve|culescu及其同事年創(chuàng)立SAGE特點:進行轉(zhuǎn)錄物組研究,也就是轉(zhuǎn)錄水平的研究通過快速和詳細分析成千上萬個EST來尋找出表達豐度不同的SAG標簽序列,從而接近完整地獲得基因組的表達信SAGE區(qū)別于差異顯示、消減雜交等其它技術(shù)的主要特點是可用于尋找那些較低豐度的轉(zhuǎn)錄物,最大限度地收集基因組的基因表達信息,這使之成為從總體上全面研究基因表達、構(gòu)建基因表達圖譜的首選策略SAGE可用于在不同環(huán)境、不同生理狀態(tài)及不同生長階段的細胞和組織表達圖譜構(gòu)建,對不同狀態(tài)下基因表達水平的定量或定性比較,特別是對疾病組織與正常組織的比較發(fā)展迅速;SAGE技術(shù)的主要理論依據(jù)◆來自轉(zhuǎn)錄物內(nèi)特定位置的一小段寡核苷酸序列(911bp)含有鑒定一個轉(zhuǎn)錄物特異性的足夠信息,可作為區(qū)別轉(zhuǎn)錄物的標簽(tag)令通過簡單的方法將這些標簽串聯(lián)在一起,形成大量多聯(lián)體(concatemer),對每個克隆到載體的多聯(lián)體進行測序,并應(yīng)用SAG軟件分析,可確定表達的基因種類,并可根據(jù)標簽出現(xiàn)的頻率確定基因的表達風度(abundance)。SAGE步驟疊O1.將5g含有ogd(引物)的磁珠與疊學(xué)O2.合成雙鏈CDNA3.用NaI酶消化形成一條鏈末端有標簽的產(chǎn)物4.將樣品分成兩份,連接成含有識別序cTG仝疊列的產(chǎn)物,以備用BsmF1消化5.用MmeI切割每一個樣品形