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第23章檸檬酸循環(huán)(Citricacidcycle)一、丙酮酸進(jìn)入檸檬酸循環(huán)的準(zhǔn)備階段
——形成乙酰CoA二、檸檬酸循環(huán)概貌三、檸檬酸循環(huán)的反應(yīng)機(jī)制四、檸檬酸循環(huán)的化學(xué)總結(jié)算五、檸檬酸循環(huán)的調(diào)控六、檸檬酸循環(huán)的雙重作用七、檸檬酸循環(huán)的發(fā)現(xiàn)歷史生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)檸檬酸循環(huán)
檸檬酸循環(huán)(citricacidcycle)也叫三羧酸循環(huán)(tricarboxylicacidcycle,TCA循環(huán)),
因?yàn)榈聡?guó)科學(xué)家HansKrebs在闡明檸檬酸循環(huán)中作出了突出貢獻(xiàn),又將此途徑稱(chēng)為Krebs循環(huán)。
在有氧條件下,糖酵解途徑產(chǎn)生的丙酮酸進(jìn)入線(xiàn)粒體,先轉(zhuǎn)變成乙酰CoA,乙酰CoA再進(jìn)入檸檬酸循環(huán)徹底氧化成CO2。在真核細(xì)胞中,檸檬酸循環(huán)是在線(xiàn)粒體中進(jìn)行的。生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)一、丙酮酸進(jìn)入檸檬酸循環(huán)的準(zhǔn)備階段——形成乙酰CoA
生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)丙酮酸到乙酰CoA的總反應(yīng)式OCH3CCOO-
+HS-CoA+NAD+
——————————→OCH3C-SCoA+CO2+NADH
丙酮酸脫氫酶復(fù)合體生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)丙酮酸脫氫酶復(fù)合體的組成組分縮寫(xiě)肽鏈數(shù)輔基催化的反應(yīng)丙酮酸脫氫酶組分E124TPP丙酮酸氧化脫羧二氫硫辛酰轉(zhuǎn)乙?;窫224硫辛酰胺將乙?;D(zhuǎn)移到CoA二氫硫辛酸脫氫酶E312FAD將還原型硫辛酰胺轉(zhuǎn)變?yōu)檠趸蜕锘瘜W(xué)第23章檸檬酸循環(huán)丙酮酸轉(zhuǎn)變?yōu)橐阴oA的反應(yīng)步驟
(丙酮酸脫羧反應(yīng))E1
丙酮酸TPP丙酮酸TPP加成化合物丙酮酸TPP加成化合物羥乙基-TPP共振形式生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)丙酮酸轉(zhuǎn)變?yōu)橐阴oA的反應(yīng)步驟(丙酮酸脫羧反應(yīng))E2的硫辛酰胺輔基羥乙基-TPP乙酰二氫硫辛酰胺TPP-E1E2生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)丙酮酸轉(zhuǎn)變?yōu)橐阴oA的反應(yīng)步驟乙酰二氫硫辛酰胺乙酰CoA二氫硫辛酰胺(乙?;D(zhuǎn)移到CoA分子上形成乙酰CoA)生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)丙酮酸轉(zhuǎn)變?yōu)橐阴oA的反應(yīng)步驟(還原型E2被氧化反應(yīng))
氧化型E3還原型E2還原型E3
氧化型E2
還原型E3還原型E3氧化型E3E3生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)丙酮酸脫氫酶復(fù)合體結(jié)構(gòu)
丙酮酸脫氫酶復(fù)合體由60條肽鏈組成,總分子量為50,000kD,直徑約30nm,在電子顯微鏡下可以看到。E2是復(fù)合體的核心,E1及E3結(jié)合在E2的外面。E2有一個(gè)由賴(lài)氨酸殘基與硫辛酰胺相連的長(zhǎng)鏈,這個(gè)長(zhǎng)臂伸長(zhǎng)后可達(dá)1.4nm,它具有極大的轉(zhuǎn)動(dòng)靈活性,可將底物從一個(gè)酶轉(zhuǎn)送到另一個(gè)酶。生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)丙酮酸脫氫酶復(fù)合體生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)硫辛酰賴(lài)氨酰臂生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)丙酮酸轉(zhuǎn)變?yōu)橐阴oA的總圖生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)砷化物對(duì)硫辛酰胺的毒害作用生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)丙酮酸脫氫酶復(fù)合體的調(diào)控
丙酮酸脫氫酶復(fù)合體催化的這個(gè)反應(yīng)是哺乳動(dòng)物體內(nèi)使丙酮酸轉(zhuǎn)變?yōu)橐阴oA的唯一途徑。乙酰CoA既是檸檬酸循環(huán)的入口,又是脂類(lèi)生物合成的起始物質(zhì)。1.產(chǎn)物控制
產(chǎn)物NADH抑制E3,乙酰CoA抑制E2。2.磷酸化和去磷酸化的調(diào)控
E2分子上結(jié)合著兩種特殊的酶,一種是激酶,另一種是磷酸酶,它們分別使E1磷酸化和去磷酸化,去磷酸化形式是E1的活性形式。Ca2+通過(guò)激活磷酸酶的作用,也能使E1活化。生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)二、檸檬酸循環(huán)概貌生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)檸檬酸循環(huán)總圖return生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)三、檸檬酸循環(huán)的反應(yīng)生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)草酰乙酸與乙酰CoA縮合形成檸檬酸
草酰乙酸乙酰CoA
檸檬酰CoA
檸檬酸CoA檸檬酸合酶①112212生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)檸檬酸異構(gòu)化形成異檸檬酸
檸檬酸順-烏頭酸異檸檬酸烏頭酸酶烏頭酸酶②222111生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)烏頭酸酶中的Fe-S聚簇(中心)含有這類(lèi)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)稱(chēng)為鐵硫蛋白生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)異檸檬酸氧化形成α∣酮戊二酸異檸檬酸脫氫酶
異檸檬酸草酰琥珀酸α-酮戊二酸③1212生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)從異檸檬酸的分支途徑異檸檬酸異檸檬酸裂解酶琥珀酸
乙醛酸(植物和有些細(xì)菌中發(fā)生)生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)α-酮戊二酸氧化脫羧形成琥珀酰CoA
α-酮戊二酸琥珀酰CoAα-酮戊二酸脫氫酶復(fù)合體
④1122生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)琥珀酰CoA轉(zhuǎn)化成琥珀酸
烯醇化酶
琥珀酰CoA琥珀酸琥珀酰CoA合成酶⑤1122生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)琥珀酸脫氫形成延胡索酸琥珀酸脫氫酶琥珀酸
延胡索酸⑥(反丁烯二酸)生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)FAD與琥珀酸脫氫酶的共價(jià)結(jié)合生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)線(xiàn)粒體結(jié)構(gòu)示意圖琥珀酸脫氫酶嵌合在線(xiàn)粒體的內(nèi)膜上。
生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)延胡索酸水合形成L-蘋(píng)果酸延胡索酸酶
延胡索酸
L-蘋(píng)果酸⑦生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)L-蘋(píng)果酸脫氫形成草酰乙酸蘋(píng)果酸脫氫酶
L-蘋(píng)果酸草酰乙酸⑧生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)四、檸檬酸循環(huán)的化學(xué)總結(jié)算乙酰CoA+3NAD++FAD+GDP+Pi+2H2O→2CO2+3NADH+3H++FADH2+GTP+CoA檸檬酸循環(huán)的總反應(yīng)式生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)ATP的產(chǎn)量
從丙酮酸開(kāi)始,檸檬酸循環(huán)中循環(huán)一圈,共產(chǎn)生4個(gè)NADH,1個(gè)FADH2,1個(gè)GTP(ATP),按每個(gè)NADH可以產(chǎn)生2.5個(gè)ATP、每個(gè)FADH2可以產(chǎn)生1.5個(gè)ATP計(jì)算,共產(chǎn)生2.5×4(NADH)+1.5×1(FADH2)+1(GTP)
=12.5
個(gè)ATP
每個(gè)葡萄糖分子(2個(gè)丙酮酸)在進(jìn)入檸檬酸循環(huán)后可以產(chǎn)生25個(gè)ATP。
每個(gè)葡萄糖分子在糖酵解中可以產(chǎn)生2個(gè)ATP和2個(gè)NADH,共產(chǎn)生
2(ATP)+2.5×2(NADH)=7個(gè)ATP
每個(gè)葡萄糖分子徹底氧化后共產(chǎn)生32個(gè)ATP。生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)五、檸檬酸循環(huán)的調(diào)控
在檸檬酸循環(huán)中,雖然有8種酶參加反應(yīng),但在調(diào)節(jié)循環(huán)速度中起關(guān)鍵作用的是3種酶:檸檬酸合酶、異檸檬酸脫氫酶和α-酮戊二酸脫氫酶復(fù)合體。其調(diào)控可以分為兩個(gè)方面:①檸檬酸循環(huán)本身各種物質(zhì)對(duì)酶活性的調(diào)控;②ADP、ATP和Ca2+的調(diào)控。生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)檸檬酸循環(huán)本身制約系統(tǒng)的調(diào)節(jié)1.乙酰CoA和草酰乙酸的供應(yīng)情況。乙酰CoA來(lái)源于丙酮酸,受到丙酮酸脫氫酶復(fù)合體活性的控制;草酰乙酸的供應(yīng)取決于循環(huán)是否運(yùn)行暢通,以及中間產(chǎn)物離開(kāi)循環(huán)的速率和補(bǔ)充的速率。2.[NADH]/[NAD+]的比值。檸檬酸合酶和異檸檬酸脫氫酶都受到NADH的抑制,但異檸檬酸脫氫酶對(duì)NADH更為敏感。α-酮戊二酸脫氫酶復(fù)合體也受NADH的抑制。3.產(chǎn)物的反饋抑制。檸檬酸合酶受高濃度檸檬酸的抑制;α-酮戊二酸脫氫酶復(fù)合體受琥珀酰CoA的抑制。go生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)ATP、ADP和Ca2+對(duì)檸檬酸循環(huán)的調(diào)節(jié)1.[ATP]/[ADP]的比值。
[ATP]/[ADP]的比值對(duì)檸檬酸循環(huán)中的酶有調(diào)節(jié)作用,ADP是異檸檬酸脫氫酶的別構(gòu)促進(jìn)劑,可降低該酶的Km值,促進(jìn)酶與底物的結(jié)合;而ATP抑制該酶。2.Ca2+濃度。
Ca2+可激活丙酮酸脫氫酶的磷酸酶,使丙酮酸脫氫酶去磷酸化而活化,從而增加乙酰CoA的供應(yīng)。同時(shí)Ca2+也能激活異檸檬酸脫氫酶和α-酮戊二酸脫氫酶。生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)乙酰CoA形成和檸檬酸循環(huán)中的激活和抑制部位示意圖激活×抑制
反饋抑制·生物化學(xué)第23章檸檬酸循環(huán)六、檸檬酸循環(huán)的雙重作用
許多合成代
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