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文檔簡介
演示文稿真核基因表達(dá)系統(tǒng)本文檔共96頁;當(dāng)前第1頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分(優(yōu)選)真核基因表達(dá)系統(tǒng)本文檔共96頁;當(dāng)前第2頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分概述(introduction)真核基因結(jié)構(gòu)及表達(dá)調(diào)控特點(diǎn)(Featuresofeukaryoticgenestructureandregulation)真核表達(dá)系統(tǒng)(eukaryoticgeneexpressionsystem)
酵母表達(dá)系統(tǒng)(yeastexpressionsystem)
哺乳動物細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)(mammaliancellexpression)
昆蟲細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)(insectcellexpression)
內(nèi)容本文檔共96頁;當(dāng)前第3頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分第一節(jié)概述一、真核基因組的復(fù)雜性二、原核表達(dá)系統(tǒng)的局限性三、真核表達(dá)系統(tǒng)的必要性及優(yōu)勢本文檔共96頁;當(dāng)前第4頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分一、真核基因組的復(fù)雜性
1.真核基因組巨大大腸桿菌基因組約4×106bp,哺乳類基因組在109bp數(shù)量級大腸桿菌約有4000個基因,人則約有10萬個基因2.真核生物遺傳信息復(fù)雜
原核生物的基因組基本上是單倍體,而真核基因組是二倍體真核生物主要的遺傳物質(zhì)與組蛋白等構(gòu)成染色質(zhì),被包裹在核膜內(nèi),核外還有遺傳成分(如線粒體DNA等),這就增加了基因表達(dá)調(diào)控的層次和復(fù)雜性。本文檔共96頁;當(dāng)前第5頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分
細(xì)菌多數(shù)基因按功能相關(guān)成串排列,組成操縱子,共同開啟或關(guān)閉,轉(zhuǎn)錄出多順反子(polycistron)的mRNA;真核生物則是一個結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄生成一條mRNA,即mRNA是單順反子(monocistron),基本上沒有操縱子的結(jié)構(gòu)。真核細(xì)胞的許多活性蛋白是由相同和不同的多肽形成的亞基構(gòu)成的,這就涉及到多個基因協(xié)調(diào)表達(dá)的問題,真核生物基因協(xié)調(diào)表達(dá)要比原核生物復(fù)雜得多。
3.真核生物基因協(xié)調(diào)表達(dá)本文檔共96頁;當(dāng)前第6頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分4.真核生物基因編碼復(fù)雜原核基因組的大部分序列都為基因編碼,而核酸雜交等實(shí)驗表明:哺乳類基因組中僅約10%的序列為蛋白質(zhì)、rRNA、tRNA等編碼,其余約90%的序列功能至今還不清楚。原核生物的基因為蛋白質(zhì)編碼的序列絕大多數(shù)是連續(xù)的,而真核生物為蛋白質(zhì)編碼的基因絕大多數(shù)是不連續(xù)的,即有外顯子(exon)和內(nèi)含子(intron),轉(zhuǎn)錄后需經(jīng)剪接(splicing)去除內(nèi)含子,才能翻譯獲得完整的蛋白質(zhì),這就增加了基因表達(dá)調(diào)控的環(huán)節(jié)。原核基因組中除rRNA、tRNA基因有多個拷貝外,重復(fù)序列不多。哺乳動物基因組中則存在大量重復(fù)序列(repetitivesequences)。真核生物mRNA5’有帽狀結(jié)構(gòu),3’末端有PolyA尾巴
本文檔共96頁;當(dāng)前第7頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分1、沒有轉(zhuǎn)錄后的剪接和加工系統(tǒng)
2、缺乏翻譯后加工修飾系統(tǒng):不能進(jìn)行糖基化、磷酸化、甲基化的修飾,影響某些蛋白的活性。二、原核表達(dá)系統(tǒng)的局限性本文檔共96頁;當(dāng)前第8頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分3、在原核細(xì)胞中表達(dá)的真核蛋白不穩(wěn)定
易被細(xì)菌蛋白酶降解;難實(shí)現(xiàn)真正的分泌出胞,其產(chǎn)量很低;而且容易出現(xiàn)信號肽不被切割,或不在特異位置上切割。表達(dá)產(chǎn)物常以包涵體的形式存在,后期變性、復(fù)性的效率低4、內(nèi)毒素的污染
(contaminationofendotoxin)本文檔共96頁;當(dāng)前第9頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分1.具轉(zhuǎn)錄后加工系統(tǒng):2.具翻譯后修飾系統(tǒng)3.可實(shí)現(xiàn)真正的分泌表達(dá)三、真核表達(dá)系統(tǒng)的必要性及優(yōu)勢
(advantagesofeukaryoticexpressionsystem)本文檔共96頁;當(dāng)前第10頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分
(一)真核基因表達(dá)調(diào)控特點(diǎn)
---多層次、多方面(二)真核基因表達(dá)的調(diào)控模式
第二節(jié)真核基因表達(dá)調(diào)控特點(diǎn)
FeaturesofEukaryoticgenestructureandexpression本文檔共96頁;當(dāng)前第11頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分真核基因表達(dá)的調(diào)控模式
(Theregulatingmodelof
eukaryoticgeneexpression)
1、轉(zhuǎn)錄前水平(基因組水平):genelevel2、轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控:transcriptionlevel3、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控:post-transcriptionlevel4、翻譯水平的調(diào)控:translationlevel5、翻譯后修飾:post-translationmodification本文檔共96頁;當(dāng)前第12頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分1、轉(zhuǎn)錄前水平(基因組水平):genelevel
基因結(jié)構(gòu)的改變、穩(wěn)定持久、不可逆,組蛋白修飾,DNA甲基化等本文檔共96頁;當(dāng)前第13頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分2.轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控順式調(diào)控元件(cis-actingelement)
反式作用因子(trans-actingfactor)本文檔共96頁;當(dāng)前第14頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分(1)順式調(diào)控元件(cis-actingelement)
結(jié)構(gòu)基因周圍能與特異轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合而啟動轉(zhuǎn)錄的DNA序列,主要包括:起正性調(diào)節(jié)作用:啟動子、增強(qiáng)子起負(fù)性調(diào)節(jié)作用:沉寂子,終止子,加尾信號本文檔共96頁;當(dāng)前第15頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分
啟動子位于基因5’末端與轉(zhuǎn)錄起始有關(guān)的核苷酸序列。作用特點(diǎn)是近距離作用、具有方向性、空間位置較恒定。一般包括核心啟動子元件(corepromoterelements)
:指RNA聚合酶起始轉(zhuǎn)錄所必需的最小的DNA序列,決定基因轉(zhuǎn)錄的精確起始位點(diǎn)產(chǎn)生基礎(chǔ)水平的轉(zhuǎn)錄,包括:轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)及-30區(qū)的TATA-box上游啟動子元件(upstreampromoterelements)
包括-70到-80bp區(qū)域的CAAT盒及其兩側(cè)的GC盒,協(xié)同決定轉(zhuǎn)錄的基礎(chǔ)效率組織特異性元件誘導(dǎo)性啟動子元件本文檔共96頁;當(dāng)前第16頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分真核啟動子結(jié)構(gòu)模式圖核心啟動子元件上游啟動子元件本文檔共96頁;當(dāng)前第17頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分
哺乳類RNA聚合酶Ⅱ啟動子中常見的元件元件名稱共同序列結(jié)合的蛋白因子名稱分子量結(jié)合DNA長度TATAboxTATAAAATBP30,000~10bpGCboxGGGCGGSP-1105,000~20bpCAATboxGGCCAATCTCTF/NF160,000~22bpOctamerATTTGCATOct-176,000~20bp
Oct-253,000~23bpkBGGGACTTTCCNFkB44,000~10bpATFGTGACGTAFT?20bp本文檔共96頁;當(dāng)前第18頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分
增強(qiáng)子(enhancer)是一種能夠提高轉(zhuǎn)錄效率的順式調(diào)控元件增強(qiáng)子要有啟動子才能發(fā)揮作用,但增強(qiáng)子對啟動子沒有嚴(yán)格的專一性
無方向性(序列、位置)遠(yuǎn)距離作用(1-4kB)無基因特異性具組織特異性構(gòu)建載體本文檔共96頁;當(dāng)前第19頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分沉寂子(silencer)或衰減子(dehancer)
是一類抑制基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控因子,作用方式與增強(qiáng)子相同轉(zhuǎn)錄終止信號:
控制基因轉(zhuǎn)錄的終止,由polyA上游的10-20bp處的加尾信號(AATAA)和polyA下游的G/T簇構(gòu)成
本文檔共96頁;當(dāng)前第20頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分(2)反式作用因子(trans-actingfactor)
由位于不同或相同染色體上相距較遠(yuǎn)的基因所編碼的蛋白質(zhì)因子,通過與順式調(diào)控元件和RNA聚合酶的相互作用而調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄活性。本文檔共96頁;當(dāng)前第21頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分轉(zhuǎn)錄信號1PTrans-actingfactorTrans-actingfactor(DNA結(jié)合蛋白)Cis-actingfactorAgenemRNAofAProteinABgenemRNAofBProteinBDNA本文檔共96頁;當(dāng)前第22頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分3、轉(zhuǎn)錄后的修飾內(nèi)含子的剪接外顯子的拼接mRNA的加尾和加帽mRNA的穩(wěn)定性本文檔共96頁;當(dāng)前第23頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分
4、翻譯水平的調(diào)控主要是microRNA對mRNA、tRNA和rRNA的調(diào)控本文檔共96頁;當(dāng)前第24頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分5、翻譯后的調(diào)控
切除信號肽糖基化乙?;姿峄谆鞍踪|(zhì)的降解本文檔共96頁;當(dāng)前第25頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分第三節(jié)真核表達(dá)系統(tǒng)組成:真核表達(dá)載體受體細(xì)胞本文檔共96頁;當(dāng)前第26頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分真核表達(dá)載體
適用于在真核細(xì)胞中表達(dá)外源基因的載體。真核載體根據(jù)受體不同,又可分為幾種:酵母表達(dá)載體哺乳動物細(xì)胞表達(dá)載體昆蟲桿狀病毒表達(dá)載體本文檔共96頁;當(dāng)前第27頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分受體細(xì)胞據(jù)受體細(xì)胞及表達(dá)載體的不同分為3種:酵母表達(dá)系統(tǒng)哺乳動物細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)昆蟲細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)本文檔共96頁;當(dāng)前第28頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分發(fā)酵簡單、快速、便宜真核生物,有翻譯后修飾功能可分泌表達(dá),簡化了純化工藝受體細(xì)胞安全一、酵母表達(dá)系統(tǒng)本文檔共96頁;當(dāng)前第29頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分(一)酵母載體:
1、概念:
攜帶外源基因在酵母細(xì)胞中復(fù)制、擴(kuò)增和表達(dá)的載體,包括克隆載體和表達(dá)載體。
2、組成元件:遺傳標(biāo)記調(diào)控序列本文檔共96頁;當(dāng)前第30頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分1)遺傳標(biāo)記:用于重組子的篩選和鑒定
營養(yǎng)標(biāo)記基因:亮氨酸(Leu)
抗生素選擇標(biāo)記基因:Zeocin本文檔共96頁;當(dāng)前第31頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分
2)調(diào)控序列ARS:酵母復(fù)制起始區(qū)(點(diǎn))酵母啟動子:常用的有:
PGK(磷酸甘油激酶)
GAP(3-磷酸甘油醛脫氫酶)
ADH1(醇脫氫酶)
SUC(蔗糖酶)
Apase(堿性磷酸酶)
酵母著絲粒區(qū)段(CEN):增加轉(zhuǎn)化子穩(wěn)定性本文檔共96頁;當(dāng)前第32頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分
3、類型(types)酵母克隆載體(yeastclonevector)
:不含酵母啟動子,不能在酵母中表達(dá)外源基因,如YIP、YRP、YEP
酵母表達(dá)載體(yeastexpression
vector):酵母克隆載體+酵母啟動子,若引入信號肽序列,則成為分泌型載體
酵母人工染色體(yeastartificialchromosome,YAC)
克隆大片段DNA,2μM質(zhì)粒:酵母核質(zhì)中的小的環(huán)狀DNA,可以獨(dú)立復(fù)制并轉(zhuǎn)錄。本文檔共96頁;當(dāng)前第33頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分(1)酵母克隆載體的構(gòu)建酵母整合型質(zhì)粒(yeastintegratedplasmid.Yip)
細(xì)菌質(zhì)粒DNA+酵母遺傳標(biāo)記,通過同源重組整合入酵母染色體,轉(zhuǎn)化子穩(wěn)定,但轉(zhuǎn)化率極低。酵母復(fù)制型質(zhì)粒(Yeastreplicableplasmid,YRp)
細(xì)菌質(zhì)粒DNA+酵母遺傳標(biāo)記(YIp)+酵母復(fù)制序列(ARS),可自主復(fù)制,但穩(wěn)定性差酵母附加子型質(zhì)粒,YEp:細(xì)菌質(zhì)粒DNA+酵母標(biāo)記基因(YIp)+酵母2μM質(zhì)粒,游離于核外存在并自主復(fù)制本文檔共96頁;當(dāng)前第34頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分酵母復(fù)制序列酵母2μM質(zhì)粒本文檔共96頁;當(dāng)前第35頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分(2)酵母表達(dá)載體特點(diǎn):含酵母啟動子
穿梭載體(shuttlevector):既可以攜帶外源基因在原核細(xì)胞中復(fù)制,又可以使其在真核細(xì)胞中表達(dá)的載體。種類:啤酒酵母表達(dá)載體畢赤酵母表達(dá)載體:
分泌型表達(dá)載體非分泌型表達(dá)本文檔共96頁;當(dāng)前第36頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分啤酒酵母表達(dá)載體本文檔共96頁;當(dāng)前第37頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分畢赤酵母表達(dá)載體------整合型本文檔共96頁;當(dāng)前第38頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分(3)酵母人工染色體(yeastartificial
chromosome,YAC)----克隆大片段DNA
由下列元件組成
酵母染色體
2umDNA的復(fù)制起始區(qū)
著絲粒序列(CEN)
四膜蟲端粒DNA(TEL)本文檔共96頁;當(dāng)前第39頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分YAC:利用酵母的著絲粒區(qū)段(CEN)、自動復(fù)制序列(ARS)及四膜蟲端粒DNA(TEL)構(gòu)建的人工染色體結(jié)構(gòu):左臂:TEL、選擇標(biāo)記、ARS、CEN
右臂:TEL、選擇標(biāo)記特點(diǎn):容量大(50-1000kb),穩(wěn)定性差作用:構(gòu)建基因組文庫本文檔共96頁;當(dāng)前第40頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分本文檔共96頁;當(dāng)前第41頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分
二)受體細(xì)胞
1.啤酒酵母:較早使用,了解清楚安全性高,被FDA確認(rèn)為安全生物表達(dá)量較低過量糖基化轉(zhuǎn)化子不穩(wěn)定,易發(fā)生質(zhì)粒丟失本文檔共96頁;當(dāng)前第42頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分2.畢赤酵母:新發(fā)展的酵母受體細(xì)胞高表達(dá)(12g/L)高穩(wěn)定-----載體為整合型高分泌(10g/L)本文檔共96頁;當(dāng)前第43頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分三)轉(zhuǎn)化
1.原生質(zhì)體法:去除厚壁
2.電穿孔法:效率較高,整合型載體轉(zhuǎn)化前要酶切線性化3.LiCl法:做成感受態(tài)細(xì)胞本文檔共96頁;當(dāng)前第44頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分四)外源基因在酵母菌中的表達(dá)1、胞內(nèi)表達(dá):直接表達(dá)外源基因,如:HBsAg的酵母重組疫苗2、分泌表達(dá):在MCS前加入信號肽序列,
pGAPZ,利用因子分泌表達(dá)本文檔共96頁;當(dāng)前第45頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分
五)高表達(dá)的策略(1)利用誘導(dǎo)型強(qiáng)啟動子:畢赤酵母表達(dá)載體中常用啟動能力強(qiáng)的GAP啟動子(2)提高整合拷貝數(shù):可利用載體中提供的抗生素遺傳標(biāo)記,以抗生素加壓篩選含有多拷貝的轉(zhuǎn)化子。(3)控制蛋白酶降解活性:采用蛋白酶缺陷型宿主菌,改變發(fā)酵培養(yǎng)基的PH值,或在培養(yǎng)基中補(bǔ)加氨基酸或多肽,均可避免產(chǎn)物被降解。(4)分泌表達(dá):也是一種避免產(chǎn)物被降解的良好策略。本文檔共96頁;當(dāng)前第46頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分酵母雙雜交系統(tǒng)YeastTwo-HybridSystem本文檔共96頁;當(dāng)前第47頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分
酵母雙雜交系統(tǒng)是在真核模式生物酵母中進(jìn)行的,研究活細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)相互作用,對蛋白質(zhì)之間微弱的、瞬間的作用也能通過報告基因的表達(dá)產(chǎn)物敏感地檢測得到。
1989年美國紐約州立大學(xué)的Fields和Song首先描述了酵母雙雜交系統(tǒng)(yeasttwo-hybridsystem)。蛋白的酵母雙雜交實(shí)驗是以酵母的遺傳分析為基礎(chǔ),研究反式作用因子之間的相互作用對真核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控影響的實(shí)驗。
本文檔共96頁;當(dāng)前第48頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分很早就已知道,轉(zhuǎn)錄活化蛋白可以和DNA上特異的序列結(jié)合而啟動相應(yīng)基因的轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。這種DNA結(jié)合與轉(zhuǎn)錄激活的功能是由轉(zhuǎn)錄活化蛋白上兩個相互獨(dú)立的結(jié)構(gòu)域即DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(BindingDomain,BD)和轉(zhuǎn)錄活化結(jié)構(gòu)域(ActivationDomain,AD)分別來完成的,并且這兩個結(jié)構(gòu)域?qū)τ诨虻霓D(zhuǎn)錄活化都是必須的轉(zhuǎn)錄激活因子DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(BD)(DNAbindingdomain)轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域(AD)(activationdomain)本文檔共96頁;當(dāng)前第49頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分
這兩個結(jié)構(gòu)域各具功能,互不影響,單獨(dú)存在時沒有轉(zhuǎn)錄激活的功能,只有兩者通過共價或非共價鍵連接建立起來的空間結(jié)構(gòu)方可表現(xiàn)出一個完整的激活特定基因表達(dá)的激活因子的功能。本文檔共96頁;當(dāng)前第50頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分基本原理
在利用GAL4系統(tǒng)篩選cDNA文庫或研究蛋白間的相互作用時,DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域與靶蛋白即“誘餌”相結(jié)合,轉(zhuǎn)錄活化結(jié)構(gòu)域與文庫蛋白或要驗證的蛋白相結(jié)合。一般情況下,單獨(dú)的BD可以與GAL4上游活化序列(GALUAS)結(jié)合但不能引起轉(zhuǎn)錄,單獨(dú)的AD則不能與GALUAS結(jié)合,只有當(dāng)BD與AD分別表達(dá)的融合蛋白由于相互作用而導(dǎo)致兩者在空間上相互靠近時,BD與AD才能與GALUAS結(jié)合并且引起報道基因的轉(zhuǎn)錄。本文檔共96頁;當(dāng)前第51頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分ADYADYXDNA-BDGAL4UASPromoterlacZ(orHIS)reportergenetranscriptionGAL4UASPromoterlacZ(orHIS)reportergeneGAL4UASPromoterlacZ(orHIS)reportergeneXDNA-BDtranscriptiontranscription已知蛋白X與BD-fusion
---誘餌(bait)未知蛋白Y與AD-fusion
---獵物或靶蛋白(preyortargetprotein)報告基因(reportergene)
---LacZ(編碼β-半乳糖苷酶)本文檔共96頁;當(dāng)前第52頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分本文檔共96頁;當(dāng)前第53頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分本文檔共96頁;當(dāng)前第54頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分本文檔共96頁;當(dāng)前第55頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分LacZreporter
-Blue/WhiteScreeningHIS3reporter-ScreenonHis+media(usuallyneedtoadd3ATtoincreaseselectivity)LEU2reporter-ScreenonLeu+mediaADE2reporter-ScreenonAde+mediaURA3reporter-ScreenonUra+media(candonegativeselectionbyaddingFOA)報告基因本文檔共96頁;當(dāng)前第56頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分已知蛋白的cDNA序列為誘餌(bait),將其與DNA結(jié)合域(BD)融合,構(gòu)建成誘餌質(zhì)粒將待篩選蛋白的cDNA序列與轉(zhuǎn)錄激活域(AD)融合,構(gòu)建成文庫質(zhì)粒將這兩個質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化于酵母細(xì)胞中酵母細(xì)胞中,已分離的DNA結(jié)合域和轉(zhuǎn)錄激活域不會相互作用,但誘餌蛋白若能與待篩選的未知蛋白特異性地相互作用,則可激活報告基因的轉(zhuǎn)錄本文檔共96頁;當(dāng)前第57頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分本文檔共96頁;當(dāng)前第58頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分酵母雙雜交系統(tǒng)的優(yōu)點(diǎn)
高敏感性。真實(shí)性。檢測在活細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行,作用條件與作用力無需模擬,在一定程度上代表細(xì)胞內(nèi)的真實(shí)情況。簡潔性。融合蛋白相互作用后,減少了制備抗體和純化蛋白質(zhì)的繁瑣步驟。廣泛性。采用不同組織器官細(xì)胞類型和分化時期的材料構(gòu)建cDNA文庫,能分析不同亞細(xì)胞部位和功能的蛋白質(zhì),適用于部分細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核及膜結(jié)合蛋白。本文檔共96頁;當(dāng)前第59頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分
分析已知蛋白之間的相互作用對蛋白質(zhì)功能域的分析,如可將待測蛋白質(zhì)進(jìn)行點(diǎn)突變或缺失突變再進(jìn)行雙雜交。用已知功能蛋白質(zhì)篩選雙雜交cDNA文庫,研究蛋白質(zhì)之間相互作用的傳遞途徑,發(fā)現(xiàn)新基因。分析新基因的生物學(xué)功能。即以功能未知的新基因去篩選文庫,再根據(jù)篩的已知基因推測新基因功能。繪制蛋白質(zhì)相互作用系統(tǒng)圖譜在藥物設(shè)計中的應(yīng)用酵母雙雜交系統(tǒng)的應(yīng)用現(xiàn)狀本文檔共96頁;當(dāng)前第60頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分進(jìn)行完全的翻譯后修飾可表達(dá)產(chǎn)生有功能的膜蛋白用途:表達(dá)大量的外源蛋白研究基因的功能基因治療兩部分:哺乳動物表達(dá)載體受體:哺乳動物細(xì)胞二、哺乳動物細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)本文檔共96頁;當(dāng)前第61頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分1、主要元件2、載體的類型
非病毒性載體
病毒性載體
一)哺乳動物細(xì)胞表達(dá)載體本文檔共96頁;當(dāng)前第62頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分(一)主要元件1)啟動子
病毒來源的:
SV40:綠猴空泡病毒(Simianvacuolatingvirus-40)
CMV:巨細(xì)胞病毒(Cytomegalovirus)
RSV:肉瘤病毒(Roussarcomavirus)
ADV:adenovirus(腺病毒)
LTR:逆轉(zhuǎn)錄病毒長末端重復(fù)序列(Longterminalrepeatfromretrovirus)
細(xì)胞來源的:
HSP:heatshockprotein(熱休克蛋白)本文檔共96頁;當(dāng)前第63頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分(Promoter+ori)
(PolyA)ori本文檔共96頁;當(dāng)前第64頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分2)增強(qiáng)子許多來源于病毒的增強(qiáng)子在不同種屬細(xì)胞中都有極強(qiáng)的促進(jìn)轉(zhuǎn)錄能力
SV40enhancer
RSVenhancer
CMVenhancer
LTRenhancer本文檔共96頁;當(dāng)前第65頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分3)篩選標(biāo)記胸苷激酶(tk)基因
Thymidinekinasegene二氫葉酸還原酶(dhfr)基因
Dihydrofolatereductase,dhfr新霉素抗性基因
neomycinresistancegene本文檔共96頁;當(dāng)前第66頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分胸苷激酶(tk)基因tk+細(xì)胞中:胸苷(T)→胸苷一磷酸二氫葉酸二氫葉酸還原酶
四氫葉酸
dCTPdATP
dTTP氨基喋呤(Aminopterin)
tk阻斷補(bǔ)加次黃嘌呤(Hypoxanthine)死亡存活DihydrofolateThymidine(1)(2)(3)HAT本文檔共96頁;當(dāng)前第67頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分二氫葉酸還原酶基因篩選法原理攜帶外源基因的載體連接有dhfr基因,可以表達(dá)二氫葉酸還原酶以dhfr-細(xì)胞為受體
:CHO細(xì)胞dhfr-細(xì)胞無法在普通培養(yǎng)基中存活,而轉(zhuǎn)化入dhfr基因后可以存活,并表達(dá)外源基因。若在培養(yǎng)基內(nèi)加入甲氨蝶呤,進(jìn)行加壓篩選,可以提高外源基因表達(dá)量本文檔共96頁;當(dāng)前第68頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分新霉素的類似物G418對原核、真核均有毒neo編碼的酶可使G418滅活此種篩選方法對受體細(xì)胞無要求,應(yīng)用更簡便新霉素抗性基因(neo)本文檔共96頁;當(dāng)前第69頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分4)轉(zhuǎn)錄終止信號和多聚腺苷酸信號
使轉(zhuǎn)錄后的mRNA能有效進(jìn)行切割和多聚腺苷酸化本文檔共96頁;當(dāng)前第70頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分多聚腺苷酸信號本文檔共96頁;當(dāng)前第71頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分5)復(fù)制元件:
使載體在受體細(xì)胞中復(fù)制,提高外源基因的表達(dá)水平6)原核細(xì)胞的部分序列在原核細(xì)胞復(fù)制的復(fù)制起始為點(diǎn)(ori)
在原核細(xì)胞復(fù)制篩選的抗生素抗性基因(AMPr)本文檔共96頁;當(dāng)前第72頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分復(fù)制元件復(fù)制元件本文檔共96頁;當(dāng)前第73頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分
1)非病毒性載體
2)病毒性載體:腺病毒,慢病毒等2、載體的類型本文檔共96頁;當(dāng)前第74頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分1)非病毒型(復(fù)制子型,質(zhì)粒型)由真核復(fù)制信號、啟動子,轉(zhuǎn)錄單位及質(zhì)粒片段組成,不需要包裝細(xì)胞。如:pSV系列、pCDNA3等(二)載體的類型本文檔共96頁;當(dāng)前第75頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分本文檔共96頁;當(dāng)前第76頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分2)病毒型載體
外源DNA插入病毒DNA或取代病毒基因某一片段,重組DNA隨病毒顆粒而復(fù)制(多需輔助病毒或包裝細(xì)胞的存在)。如:逆轉(zhuǎn)錄病毒載體、腺病毒載體等本文檔共96頁;當(dāng)前第77頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分病毒型載體的類型整合型整合入宿主染色體,隨染色體復(fù)制而復(fù)制可持續(xù)表達(dá)外援基因安全性低:插入誘變
SV40載體、逆轉(zhuǎn)錄病毒載體、慢病毒載體游離型不整合生物安全性高瞬時表達(dá)
腺病毒載體、痘苗病毒載體本文檔共96頁;當(dāng)前第78頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分1、CHO細(xì)胞(中國倉鼠卵巢癌細(xì)胞)
----------可大規(guī)模培養(yǎng)2、COS細(xì)胞(猴腎細(xì)胞系):可合成SV40復(fù)制的大T抗原,可使每個細(xì)胞中的SV40載體拷貝數(shù)多達(dá)10萬個,適合于大量表達(dá)SV40載體上的基因3、其他動物的細(xì)胞:如Hela細(xì)胞(人宮頸癌細(xì)胞)、HEK293細(xì)胞二)受體細(xì)胞------哺乳動物細(xì)胞本文檔共96頁;當(dāng)前第79頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分三)基因轉(zhuǎn)移技術(shù)轉(zhuǎn)化:將質(zhì)粒或以質(zhì)粒為載體構(gòu)建的重組DNA導(dǎo)入細(xì)胞的方法。
1.磷酸鈣共沉淀法
2.DEAE-Dextran
3.脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染法:
4.電穿孔法5.顯微注射法6.受體介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)移方法轉(zhuǎn)染:將病毒或以病毒為載體構(gòu)建的重組DNA導(dǎo)入細(xì)胞的方法本文檔共96頁;當(dāng)前第80頁;編輯于星期日\18點(diǎn)33分脂質(zhì)體
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