
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文檔簡介
載體類型
基因工程所用的載體都經(jīng)過人工重新構(gòu)建細菌質(zhì)粒載體噬菌體衍生載體Cosmid載體(粘粒)噬菌體M13衍生載體Phagemid載體酵母質(zhì)粒載體真核病毒載體1當(dāng)前第1頁\共有70頁\編于星期五\22點克隆載體與表達載體克隆載體:攜帶外源DNA進入受體細胞并使外源DNA大量擴增。表達載體:表達外源基因編碼的蛋白質(zhì),載體克隆位點的上游應(yīng)含有啟動子,下游含有轉(zhuǎn)錄終止序列。2當(dāng)前第2頁\共有70頁\編于星期五\22點第一節(jié).質(zhì)粒Plasmid質(zhì)粒是存在于細菌細胞染色體外、能自主復(fù)制的小分子環(huán)狀雙鏈DNA分子。又稱為cccDNA(CovalentlyClosedCircularDNA)。3當(dāng)前第3頁\共有70頁\編于星期五\22點野生型質(zhì)粒的大小一般在2-200Kb
基因工程常用質(zhì)粒在2-4Kb之間質(zhì)粒并不是細菌生長所必須的,但可為宿主執(zhí)行一定的遺傳功能,如抗生素的抗性、重金屬離子的抗性、細菌毒素的分泌等。4當(dāng)前第4頁\共有70頁\編于星期五\22點質(zhì)粒
(plasmid)5當(dāng)前第5頁\共有70頁\編于星期五\22點1.質(zhì)粒類型:
嚴(yán)緊型質(zhì)粒(stringentplasmid) 1-5個拷貝/細胞
松弛型質(zhì)粒(relaxedplasmid):
數(shù)十個/細胞 質(zhì)粒在細胞中的拷貝數(shù)有時與寄主的種類有關(guān)。6當(dāng)前第6頁\共有70頁\編于星期五\22點2.質(zhì)粒載體必須具備的條件(1)分子量相對較小,能在細菌內(nèi)穩(wěn)定存在,有較高的拷貝數(shù)。(2)具有一個以上的遺傳標(biāo)志,便于對宿主細胞進行選擇,如抗生素的抗性基因,β-半乳糖苷酶基因(LacZ)等。7當(dāng)前第7頁\共有70頁\編于星期五\22點(3)具有多個限制性內(nèi)切酶的單一切點,便于外源基因的插入。如果在這些位點有外源基因的插入,會導(dǎo)致某種標(biāo)志基因的失活,而便于篩選。8當(dāng)前第8頁\共有70頁\編于星期五\22點質(zhì)粒性質(zhì)不相容性(不親和性)具有相同或相似復(fù)制子結(jié)構(gòu)及特征的兩種不同質(zhì)粒,不能穩(wěn)定的存在于同一受體細胞內(nèi),這種現(xiàn)象稱作質(zhì)粒的不相容性。
9當(dāng)前第9頁\共有70頁\編于星期五\22點3.質(zhì)粒載體的選擇性標(biāo)記抗菌素抗性新陳代謝特性10當(dāng)前第10頁\共有70頁\編于星期五\22點
抗菌素名稱抗菌素作用方式宿主菌抗性機理氨芐青霉素(Amp)干擾細菌細胞壁合成
編碼-內(nèi)酰胺酶,切割A(yù)mp
-內(nèi)酰胺環(huán)氯霉素(Cml)抑菌劑,與50S結(jié)合,干擾編碼乙酰轉(zhuǎn)移酶,使氯霉素
蛋白質(zhì)合成乙?;Щ羁敲顾兀↘an)殺菌劑,與70S結(jié)合,mRNA編碼氨基糖苷磷酸轉(zhuǎn)移酶,
發(fā)生錯讀修飾Kan失活鏈霉素(Sm)殺菌劑,與30S結(jié)合,mRNA編碼特異修飾酶
發(fā)生錯讀四環(huán)素(Tet)抑菌劑,與30S結(jié)合,阻止編碼特異蛋白,修飾細菌膜蛋白合成結(jié)構(gòu),阻止Tet通過細胞膜11當(dāng)前第11頁\共有70頁\編于星期五\22點復(fù)制起點氨芐青霉素抗性基因12當(dāng)前第12頁\共有70頁\編于星期五\22點常用的質(zhì)粒載體
1.
pBR322
2.pBV220載體是我國預(yù)防醫(yī)學(xué)科學(xué)院病毒研究所自行構(gòu)建的大腸桿菌溫控表達載體。
3.
pUC系列:如pUC118、pUC119,兩者之間的差別在于多克隆位點不同。13當(dāng)前第13頁\共有70頁\編于星期五\22點14當(dāng)前第14頁\共有70頁\編于星期五\22點15當(dāng)前第15頁\共有70頁\編于星期五\22點16當(dāng)前第16頁\共有70頁\編于星期五\22點4.融合表達載體如GST融合表達系統(tǒng)。載體中含有細菌的谷胱甘肽巰基轉(zhuǎn)移酶(GST)基因,外源基因克隆在GST基因的下游。當(dāng)基因表達時,表達產(chǎn)物為GST與目的蛋白的融合體。17當(dāng)前第17頁\共有70頁\編于星期五\22點融合表達載體的優(yōu)點表達效率高融合蛋白易純化:抗GST的蛋白質(zhì)作為特異性抗體,用親和層析法從細胞裂解液中純化出融合蛋白;可從融合蛋白中分離出單一的外源蛋白質(zhì)GST與外源蛋白之間克隆上蛋白酶的切割位點,可用適當(dāng)?shù)拿盖懈睢?/p>
18當(dāng)前第18頁\共有70頁\編于星期五\22點例如加裝一段編碼Ile-Glu-Gly-Arg寡肽序列的人工接頭片斷,該片斷可被具有蛋白酶活性的凝血因子Ⅹa切割,從Arg后切開。目的蛋白中出現(xiàn)此種序列的可能性極小,因此該方法用途廣泛。19當(dāng)前第19頁\共有70頁\編于星期五\22點QIAexpress6His表達系統(tǒng)重組蛋白質(zhì)的末端帶有6個組氨酸殘基,對帶有Ni離子的層析介質(zhì)有高度的親和力,易于純化。6個組氨酸殘基質(zhì)量小,不影響蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,無需切除。6個組氨酸殘基免疫原性差,重組蛋白可以直接用做抗原。20當(dāng)前第20頁\共有70頁\編于星期五\22點
第二節(jié)噬菌體類
噬菌體是一類細菌病毒的總稱,英文名為Bacteriophage,簡稱phage。噬菌體可以在脫離寄主細胞的狀態(tài)下保持自己的生命,但必須依賴寄主細胞才能復(fù)制生長。21當(dāng)前第21頁\共有70頁\編于星期五\22點噬菌體(bacteriophage,phage)噬菌體是感染細菌、真菌、放線菌或螺旋體等微生物的病毒。病毒的特性:個體微小,可以通過細菌濾器沒有完整的細胞結(jié)構(gòu),由蛋白質(zhì)和核酸組成專性細胞內(nèi)寄生的微生物可分為12個科22當(dāng)前第22頁\共有70頁\編于星期五\22點噬菌體的生物學(xué)性狀23當(dāng)前第23頁\共有70頁\編于星期五\22點噬菌體的生物學(xué)性狀形態(tài)個體小,需用電子顯微鏡觀察蝌蚪形、微球形和絲形Theblackbarsaresizebarsrepresenting100nm.24當(dāng)前第24頁\共有70頁\編于星期五\22點25當(dāng)前第25頁\共有70頁\編于星期五\22點26當(dāng)前第26頁\共有70頁\編于星期五\22點
用作克隆載體的噬菌體有兩類:一類是λ噬菌體,另一類是M13噬菌體。野生型λ噬菌體經(jīng)過改造,已衍生出100多種克隆載體。λ噬菌體載體分為插入型和替換型(置換型)兩類。目前應(yīng)用較廣的是EMBL系列、λgt系列和Charon系列等。
27當(dāng)前第27頁\共有70頁\編于星期五\22點λ噬菌體(lambdaphage)
λ噬菌體是可以感染細菌的病毒,是大腸桿菌的溫和型噬菌體。由外殼蛋白與一個48.5kb的雙鏈線狀DNA分子組成。經(jīng)過改造形成的λ噬菌體載體有較高的轉(zhuǎn)化效率。28當(dāng)前第28頁\共有70頁\編于星期五\22點
在λ噬菌體DNA分子雙鏈的5’端,各有一段由12個核苷酸組成的互補的單鏈凸出序列,即通常所說的黏性末端。在寄主細胞內(nèi),會通過黏性末端的互補作用,形成環(huán)型雙鏈DNA分子。這種由黏性末端結(jié)合形成的雙鏈區(qū)段稱為cos位點。(cos:cohensiveendsite)29當(dāng)前第29頁\共有70頁\編于星期五\22點3‘CCCGCCGCTGGAGGGCGGCGACCT3’
在黏性末端的12個堿基中,有10個是GC。通過堿基配對線性分子環(huán)化起來,由此形成的雙鏈區(qū),叫做cos位點。30當(dāng)前第30頁\共有70頁\編于星期五\22點
λ噬菌體基因組含50余個基因,功能相近的基因聚集成簇。有些基因?qū)Ζ耸删w的生長不是必須的,可以被外源DNA片段取代。
λ噬菌體上有56種限制性內(nèi)切酶的識別位點,約300余切點。比如BamHI分別在第5505、22346、27972、34499和41732處有識別位點。
31當(dāng)前第31頁\共有70頁\編于星期五\22點λ噬菌體的生長途徑
λ噬菌體有溶原和溶菌兩種生長途徑。溶原生長途徑是指λ噬菌體的DNA整合在宿主染色體上,隨宿主染色體的復(fù)制而復(fù)制。以原噬菌體的形式潛伏起來。一旦宿主細胞處于某種條件下時,λ噬菌體的DNA脫離染色體,重新進入溶菌生長途徑。32當(dāng)前第32頁\共有70頁\編于星期五\22點溶菌生長是指λ噬菌體在宿主細胞中黏性末端連接,成為環(huán)形DNA分子,借用宿主細胞的體系,合成病毒包裝所需的外殼蛋白,新復(fù)制的λDNA與外殼蛋白包裝成新的病毒顆粒。宿主細胞膜在R蛋白和S蛋白的作用下破裂,釋放出大量子代λ噬菌體顆粒,感染新的細胞。33當(dāng)前第33頁\共有70頁\編于星期五\22點λ噬菌體的生活史溶菌生長途徑(lysispathway)溶源菌生長途徑(lysogenicpathway)34當(dāng)前第34頁\共有70頁\編于星期五\22點M13噬菌體單鏈DNA,基因組含6407個堿基.經(jīng)過基因改造后,形成M13mp系列??扇菁{遠大于自身基因組的外源DNA,(7倍).M13噬菌體感染細胞后,不裂解宿主細胞,但妨礙宿主細胞的生長,因此可見培養(yǎng)平板上的混濁噬菌斑.35當(dāng)前第35頁\共有70頁\編于星期五\22點噬斑36當(dāng)前第36頁\共有70頁\編于星期五\22點單鏈的M13噬菌體(+)進入受體菌后,以自身為模板,復(fù)制出互補鏈(-),成為雙鏈的結(jié)構(gòu),稱為復(fù)制型DNA。復(fù)制型DNA在細胞內(nèi)可達200個拷貝。此時,(+)鏈被特異的蛋白質(zhì)阻斷,不再生成新的(-)鏈。只能生成新的(+)鏈。(+)鏈DNA被殼蛋白包裝組成病毒顆粒,擠出宿主細胞。37當(dāng)前第37頁\共有70頁\編于星期五\22點科斯質(zhì)粒載體(cosmid)
又稱粘粒載體,簡稱粘粒。環(huán)形雙鏈DNA分子,一般為4~6Kb。 該載體含有λDNA的cos序列(不少于280個bp)和pBR322質(zhì)粒的序列。該載體轉(zhuǎn)化效率高??扇菁{高達45kb的外源DNA。以感染方式進入宿主細胞,在宿主體內(nèi)象質(zhì)粒那樣復(fù)制.38當(dāng)前第38頁\共有70頁\編于星期五\22點粘粒載體可像質(zhì)粒一樣在細菌中繁殖,有的(pWE15/16)可以在哺乳動物中繁殖。又能像λDNA一樣體外包裝,并高效導(dǎo)入受體細胞。屬松弛型質(zhì)粒,拷貝數(shù)較多。39當(dāng)前第39頁\共有70頁\編于星期五\22點40當(dāng)前第40頁\共有70頁\編于星期五\22點農(nóng)桿菌Ti質(zhì)粒根癌農(nóng)桿菌含有一種內(nèi)源質(zhì)粒,當(dāng)農(nóng)桿菌與植物接觸時,這種質(zhì)粒會引發(fā)植物產(chǎn)生腫瘤,故名Ti質(zhì)粒(tumorinducingplasmid)。Ti質(zhì)粒為雙鏈環(huán)狀DNA分子,200~250Kb之間。Ti質(zhì)粒進入植物細胞的只是一小部分,約25kb,稱為T-DNA(transferDNA)。41當(dāng)前第41頁\共有70頁\編于星期五\22點T-DNA兩端各有一個25bp的正向重復(fù)序列,在不同的Ti質(zhì)粒中是高度保守的,該序列對于T-DNA的轉(zhuǎn)移和整合是不可缺少的。利用大腸桿菌質(zhì)粒與T-DNA的部分序列重組,構(gòu)建Ti質(zhì)??寺≥d體,可用于植物細胞的基因轉(zhuǎn)移。42當(dāng)前第42頁\共有70頁\編于星期五\22點
第三節(jié)酵母細胞基因工程載體酵母是最簡單的單細胞真核生物。酵母可對表達的多肽鏈進行加工和修飾,如二硫鍵的正確形成、糖基化、除去N-端的甲硫氨酸等。43當(dāng)前第43頁\共有70頁\編于星期五\22點酵母菌的克隆載體YIP酵母整合型質(zhì)粒YRP酵母復(fù)制型質(zhì)粒YEP酵母附加子型載體CIP酵母菌著絲粒型質(zhì)粒44當(dāng)前第44頁\共有70頁\編于星期五\22點上述質(zhì)粒均可在大腸桿菌和酵母菌中穩(wěn)定存在,即所謂的穿梭質(zhì)粒。這些質(zhì)粒含有兩種可供篩選的選擇性標(biāo)記。45當(dāng)前第45頁\共有70頁\編于星期五\22點YIp載體URA3乳清苷酸脫羧酶46當(dāng)前第46頁\共有70頁\編于星期五\22點
酵母菌表達載體
1.選擇性標(biāo)志
當(dāng)使用大腸桿菌做為宿主細胞時,多使用抗生素抗性作為篩選標(biāo)志。由于酵母菌對許多抗生素不敏感,故需要其他的篩選標(biāo)志。
野生型基因:URA3(尿嘧啶)、LEU2、HIS3、TRP1(色氨酸)
這些基因可補償酵母菌細胞中某一種特定的代謝缺陷(營養(yǎng)缺陷)
47當(dāng)前第47頁\共有70頁\編于星期五\22點2.啟動子含有可被RNA聚合酶II識別的酵母啟動子
GAL、GAL10(半乳糖激酶)
PHO5(堿性磷酸酶)
ADH(醇脫氫酶)
TP1(丙糖磷酸異構(gòu)酶)
PGK(磷酸甘油酸激酶)
GAP(磷酸甘油醛脫氫酶)
SUC(蔗糖酶)48當(dāng)前第48頁\共有70頁\編于星期五\22點注釋:細胞內(nèi)某些蛋白質(zhì)豐度較高,如PGK(磷酸甘油酸激酶)、GAP(磷酸甘油醛脫氫酶),各占細胞總蛋白的5%,屬于高含量的蛋白質(zhì),它們的啟動子為強啟動子。49當(dāng)前第49頁\共有70頁\編于星期五\22點酵母分泌型表達載體這類載體可以使目的蛋白分泌到細胞外。載體內(nèi)除含有一般表達質(zhì)粒的必要成分外,還需有一個控制蛋白質(zhì)分泌的信號序列。其編碼的多肽鏈叫做信號肽。信號肽內(nèi)多含疏水性氨基酸。50當(dāng)前第50頁\共有70頁\編于星期五\22點第四節(jié)哺乳動物細胞表達載體51當(dāng)前第51頁\共有70頁\編于星期五\22點病毒侵入動物細胞后,有兩種生長狀態(tài)
①溶細胞感染病毒在宿主細胞內(nèi)合成自身的核酸和結(jié)構(gòu)蛋白,裝配成完整的子代病毒顆粒,釋放到細胞外,擴大感染,宿主細胞因為代謝障礙而死亡。②整合性感染病毒核酸整合到宿主細胞的染色體中,隨細胞DNA的復(fù)制而擴增。52當(dāng)前第52頁\共有70頁\編于星期五\22點病毒載體:(1)含有能夠被真核細胞識別的有效啟動子(2)在感染周期中能夠持續(xù)復(fù)制,達到很高的拷貝數(shù)。(3)控制自己復(fù)制的元件(4)有些載體可高效穩(wěn)定地整合到寄主基 因組上(5)外殼蛋白識別細胞受體,可將外源基 因高效導(dǎo)入受體細胞。53當(dāng)前第53頁\共有70頁\編于星期五\22點1.SV40病毒載體SV40:猿猴空泡病毒(Simianvacuolating virus40)
環(huán)型雙鏈DNA分子,含5243bp。優(yōu)點:1.感染率高;2.拷貝數(shù)高;3.轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物 高;缺點:1.宿主范圍窄;2.最終導(dǎo)致感染細胞死 亡; 3.制備耗時,成本較高。54當(dāng)前第54頁\共有70頁\編于星期五\22點SV40病毒載體的改建病毒的部分序列+質(zhì)粒的部分序列如PSV2包括病毒的復(fù)制起始區(qū)、早期啟動子、 增強子序列、部分t抗原基因
pBR322的復(fù)制起始區(qū)、氨芐青霉素 抗性基因55當(dāng)前第55頁\共有70頁\編于星期五\22點
病毒-質(zhì)粒載體病毒的早期區(qū)段和復(fù)制起點+大腸桿菌的質(zhì)粒分子重組而成。例如:pC10=早期區(qū)段和復(fù)制起點(多瘤病毒)+質(zhì)粒pBR322的部分區(qū)段這種載體既可在大腸桿菌中復(fù)制,也可在哺乳動物細胞中復(fù)制,稱之為穿梭載體。56當(dāng)前第56頁\共有70頁\編于星期五\22點改造后的病毒優(yōu)缺點
優(yōu)點:1.不需病毒顆粒的包裝過程,故可插入較大長度的DNA片段。2.不引起宿主細胞的裂解,可建立穩(wěn)定傳代的細胞株。3.整合到宿主細胞的染色體中,重組基因不會丟失。缺點:轉(zhuǎn)染效率低于萬分之一。57當(dāng)前第57頁\共有70頁\編于星期五\22點受納細胞:SV40感染CV-1或AGMK猿猴細胞后,產(chǎn)生感染性病毒顆粒,并使宿主細胞裂解,這種感染稱為裂解感染,而猿猴細胞則稱為受納細胞。58當(dāng)前第58頁\共有70頁\編于星期五\22點非受納細胞:SV40感染倉鼠細胞后,不產(chǎn)生感染顆粒,病毒基因組整合到宿主細胞染色體上,細胞被轉(zhuǎn)化(癌變),這種嚙齒類動物細胞為SV40病毒的非受納細胞。59當(dāng)前第59頁\共有70頁\編于星期五\22點逆轉(zhuǎn)錄病毒載體逆轉(zhuǎn)錄病毒是一類單鏈RNA病毒。宿主范圍廣,感染動物或人的細胞。感染效率高,理論上可達100%。具有強啟動子。不引起宿主細胞的死亡,可以維持許多代存在問題:1.容量小,低于10kb。
2.可能引起細胞癌變。60當(dāng)前第60頁\共有70頁\編于星期五\22點腺病毒載體(AV)
線性雙鏈DNA病毒,經(jīng)過改造的腺病毒載體,缺失了大部分的病毒基因,更加安全。
61當(dāng)前第61頁\共有70頁\編于星期五\22點優(yōu)點:①基因組大,可插入大片段的外源基因,最多可達35kb;②可高效的感染不同類型的人體組織細胞;③進入細胞內(nèi)不整合進宿主的基因組,僅瞬間表達。缺點①免疫原性強,可刺激機體產(chǎn)生免疫反應(yīng);
②幾乎可感染所有的細胞,缺乏特異性。62當(dāng)前第62頁\共有70頁\編于星期五\22點腺相關(guān)病毒載體(AAV):屬于非致病的微小病毒科家族的成員,只有依賴于輔助病毒才能繁殖。特點:基因組小,只有幾個kb;無致病性;免疫原性弱;裝載外源基因容量小,不超過5kb;制備過程復(fù)雜;63當(dāng)前第63頁\共有70頁\編于星期五\22點痘苗病毒載體:痘苗病毒是動物病毒中最大的一種,與天花病毒有密切的親緣關(guān)系。長期被用作預(yù)防天花的疫苗。病毒基因組中有很大的非必需區(qū)(28kb),可以切除,代之以較大的外源基因,或者同時插入幾個外源基因,構(gòu)成多價疫苗。64當(dāng)前第64頁\共有70頁\編于星期五
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